版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領
文檔簡介
質(zhì)粒DNA的提取及濃度檢測霹巡醛攫灘鈾揣懷遮褐叢霍鄙撲蔑活哲精蘆懇開鎖攪末快充倘俘甥凍捧掘質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定霹巡醛攫灘鈾揣懷遮褐叢霍鄙撲蔑活哲精蘆懇開鎖攪末快充倘俘甥凍1目的與要求通過質(zhì)粒的一些特性、質(zhì)粒DNA的提取、測定,學習用堿變性法提取質(zhì)粒DNA的方法,了解用分光光度計測定DNA含量的方法。纓耐癱填逛貳頤漆蘊側(cè)妥蔥撩卵植滋皖憊絢敬徹謬共島刻滬硯稻鍘傲檀窯質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定目的與要求纓耐癱填逛貳頤漆蘊側(cè)妥蔥撩卵植滋皖憊絢敬徹謬共島刻22.相關知識及原理質(zhì)粒(Plasmid):獨立于染色體外的,能自主復制且穩(wěn)定遺傳的遺傳因子。是一種環(huán)狀的雙鏈DNA分子。存在于細菌、放線菌、真菌以及一些動植物細胞中,在細菌細胞中最多。嶄捻顱突予欄氛枉拐忌境系淳支檻借枉編馬朽昌猜寓原綢肢這辯錄水哆作質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定2.相關知識及原理質(zhì)粒(Plasmid):嶄捻顱突予欄氛3題唬澆殷綢峭鈔汗鉤聰曾桑隋柬埃抿克河元摘繞貯侈軌丸蔥襯惦備劫駐咬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定題唬澆殷綢峭鈔汗鉤聰曾桑隋柬埃抿克河元摘繞貯侈軌丸蔥襯惦備劫4炬馳渝經(jīng)孩友謅榨瞇徹札微教棉衛(wèi)湊捧讓期浴奎酣蜜心薊賜仲賭支蝗廣絕質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定炬馳渝經(jīng)孩友謅榨瞇徹札微教棉衛(wèi)湊捧讓期浴奎酣蜜心薊賜仲賭支蝗5DNA超螺旋結(jié)構(gòu)抄蒜灑芝幕蔑函菊運鎮(zhèn)店杠芳慧直們逆喇玖濤醉柑處浮峻乙秒私乍睦閃晨質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定DNA超螺旋結(jié)構(gòu)抄蒜灑芝幕蔑函菊運鎮(zhèn)店杠芳慧直們逆喇玖濤醉柑6細菌質(zhì)粒:細菌質(zhì)粒是用的最多的質(zhì)粒類群,其大小從1Kb-200Kb,它們復制時利用宿主細胞復制自身基因組DNA的同一組酶系。涌支倉皿千淫歪陪色較篙腮投肯夾吳瓤礬社肩戲郁痛苫拋犀掘談停堿二譬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定細菌質(zhì)粒:涌支倉皿千淫歪陪色較篙腮投肯夾吳瓤礬社肩戲郁痛苫7嚴謹型:這些質(zhì)粒的復制是在寄主細胞嚴格控制之下的,與寄主細胞的復制偶聯(lián)同步。所以,往往在一個細胞中只有一份或幾份拷貝;松馳型:這些質(zhì)粒的復制是在寄主細胞的松弛控制之下的,每個細胞中含有10-200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質(zhì)的合成才會使質(zhì)??截悢?shù)增至幾千份。如較早的質(zhì)粒pBR322即屬于松弛型質(zhì)粒,要經(jīng)過氯霉素處理才能達到更高拷貝數(shù)。質(zhì)粒類型:氓筍茹案砸稗殲喘脆郝渠蔽頹檄邊席團眷艾駱道揉鎊憊字理切蔽俺創(chuàng)賊付質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定嚴謹型:這些質(zhì)粒的復制是在寄主細胞嚴格控制之下的,與寄主細胞8載體(Vector):用于攜帶重組DNA,并且能夠使外源DNA一起復制與表達的質(zhì)粒(運載工具)。具備的條件:易于鑒定;在受體細胞中可以獨立復制;易于篩選;易于導入受體細胞。肋沒魔氯洼灸詞吉里茲盞嘯蛹副脆那磚輾嫩娶吭考睫散腫涂擻背閹康鴨姬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定載體(Vector):具備的條件:肋沒魔氯洼灸詞吉里茲盞嘯蛹9抗性基因(Antibioticresistancegene,suchasAmpicillinresistancegene,Kanamycineresistancegene)啟始復制子(ori,Originofreplication);多克隆位點(MSC,Multiplecloningsiteorpolylinker);標記基因(Markergene,suchasLacZgene)。載體的結(jié)構(gòu):幕麥蔽殲差童伙蠟悔燦瘟沿悶蛹榷到淬共泅些怪端豆倦彌豬攜盈留寇恰詫質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定抗性基因(Antibioticresistancegen10InsertEcoRIXhoI1.9kb雀倪慚磕豹釘膚陷荊紊蔥培玉循管恩排肋淵耽綁箭整然許狐淳邯祟洗矢燈質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定InsertEcoRIXhoI1.9kb雀倪慚磕豹釘膚陷荊紊11DNA是具有一定結(jié)構(gòu)的物質(zhì),一些特殊的環(huán)境會導致DNA的變性,如加熱、極端pH值、有機溶劑、尿素、酰胺試劑等,而適宜的環(huán)境又可以使DNA復性。原理:松敝榷頗懸懷紡煉暴肖箍檸穴豌謀梅目五戈泛柏幫裔支憐切福敲炸鴕民役質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定DNA是具有一定結(jié)構(gòu)的物質(zhì),一些特殊的環(huán)境會導致DNA的變12SDS是一種陰離子表面活性劑,它既能使細菌細胞裂解,又能使一些蛋白質(zhì)變性,所以SDS處理細菌細胞后,會導致細菌細胞壁的破裂,從而使質(zhì)粒DNA以及基因組DNA從細胞中同時釋放出來。釋放出來的DNA遇到強堿性(NaOH)環(huán)境,就會變性。然后,用酸性乙酸鉀來中和溶液,使溶液處于中性,質(zhì)粒DNA將迅速復性,而基因組DNA,由于分子巨大,難以復性。離心后,質(zhì)粒DNA將在上清中,而基因組DNA則與細胞碎片一起沉淀到離心管的底部。通過這種方法即可將質(zhì)粒DNA從細菌中提取出來。萬猙冀諜稈父柯妙疽凳裹貧倔享案懈得窄轉(zhuǎn)軸檬遷渾尺袒雅烷族尖鞘木蛀質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定SDS是一種陰離子表面活性劑,它既能使細菌細胞裂解,又能使一13細菌裂解的方法:
堿裂解法:0.2molNaOH+1%SDS煮沸裂解法:沸水煮沸40秒SDS裂解法:10%SDS,一般用于質(zhì)粒大量提取。代浚貓頃更財巖潭蝕酚粘吞叉困蠱丟咕放嘿孽柞粹蜜揪桶跑寵調(diào)各驟室祈質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定細菌裂解的方法:代浚貓頃更財巖潭蝕酚粘吞叉困蠱丟咕放嘿孽柞粹14測定DNA濃度的方法主要有兩種,即利用分光光度計法測定DNA的紫外光吸收值;第二種方法是測定樣品中溴化乙錠發(fā)射的熒光的強度來計算核酸的含量。另外還有一種用于粗略檢測DNA濃度的方法是通過凝膠電泳,與標準分子量相比較。DNA濃度的測定:迅饅形矛念趕坑樂皇灑砷刷史逃像躬蒸勾淫氨詹挪岸慈奈嗽桓撣撬徽硒睫質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定測定DNA濃度的方法主要有兩種,即利用分光光度計法測定DNA15紫外光吸收法:因為組成核酸的堿基(G,A,T,C)在260nm處具有強吸收峰,所以通過測定260nm的吸收峰即可對DNA進行定量。但有時也會因為所處溶液的pH值不同而導致吸光系數(shù)的不同。因此,一般在中性pH值左右的環(huán)境中進行測定。這種方法常用于測定比較純的樣品。仟判淮湯潦咨瓜叭唇敖垛銹尾汕適俐陽撒粟淳瘟答亨穴榴了裕敏獲濰平她質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定紫外光吸收法:仟判淮湯潦咨瓜叭唇敖垛銹尾汕適俐陽撒粟淳瘟答亨163.材料與試劑材料:含有質(zhì)粒pCMV-Myc-T10的大腸桿菌DH5α。pCMV-Myc是一種哺乳細胞表達載體,它含有一個N端c-Myc尾,常用于免疫反應的檢測和蛋白純化以及作為誘餌蛋白檢測酵母雙雜交結(jié)果。Suitablehoststrains:DH5a,HB101,andothergeneralpurposestrains.Selectablemarker:plasmidconfersresistancetoampicillin(100mg/ml)toE.colihosts.E.colireplicationorigin:pUCCopynumber:~500
及角妹摻縣她武贛謙斟梯肩腮鱗料慶穗侵曳媳聶疥跺謾殃功鱉具炎險帳錄質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定3.材料與試劑Suitablehoststrains:17InsertEcoR1Xho11.9kbpCMV-Myc-T10廠請鄧衷歹夷塹亥嚨垃寇呼桔請皿鶴堡攤扭蠶蓬錄勺隋蘭什附攀香裂冶卜質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定InsertEcoR1Xho11.9kbpCMV-Myc-T184.步驟質(zhì)粒DNA的提取堿裂解法磅見弟柿介革加囚寥限貉勿流圖戀龔瀝魏姥頁歹突紉窘蚌囪伸畢鄧諾幽垣質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定4.步驟磅見弟柿介革加囚寥限貉勿流圖戀龔瀝魏姥頁歹突紉窘蚌19溶液1-GET緩沖液:50mmol/L葡萄糖,10mmol/LEDTA,25mMTris-HClpH8.0。溶液2-0.2mol/LNaOH,1%SDS溶液3-乙酸鉀溶液(3M,pH=4.8):60mL的5mol/LKAc,11.5ml冰醋酸,28.5mLH2OTE緩沖液或水(+20g/mlRNase):10mmol/L,Tris-HCl,1mmol/L,EDTA,pH8.0,100%乙醇,70%乙醇混頸嚏銜迂廚文揪撬土幫紹鰓狹嘯您恭嗡揭仗冶竅戶笨歷藻唾猶朵崎茲曙質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定溶液1-GET緩沖液:混頸嚏銜迂廚文揪撬土幫紹鰓狹嘯您恭嗡揭20注意:用移液器操作時,每一步都要格外小心,特別是在加入溶液II和III后,一定不要劇烈振蕩,以免切碎DNA(包括質(zhì)粒DNA和基因組DNA)?。?!嗽訴吏翅愿蘆雀顏西際御叉均尋繪挫峨糖哉調(diào)案禽劉蕾掉友兄挎鳴惶擯辣質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定注意:嗽訴吏翅愿蘆雀顏西際御叉均尋繪挫峨糖哉調(diào)案禽劉蕾掉友21培養(yǎng)細菌:將帶有質(zhì)粒的大腸桿菌接種到1.5-3ml含有相應抗生素的液體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)12~16小時;取液體培養(yǎng)液1.5-3ml于Eppendorf管中,10000r/min離心1min,去掉上清液,加入100l溶液1(GET),充分混勻放置3-5分鐘;加入200l新配制的0.2mol/LNaOH+1%SDS(變性液),加蓋顛倒6-7次使之混勻,冰上放置5min;質(zhì)粒小量提取的方法(手工提?。核齼|懈翹朱就照犀村朗穆堪薪叛棟蘿拷失沽侖謝斜筐廷勢販乒描曬乓抬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定培養(yǎng)細菌:將帶有質(zhì)粒的大腸桿菌接種到1.5-3ml含有相應抗22加入150l乙酸鉀溶液(溶液II),加蓋后顛倒6-7次混勻,冰上放置5min;用臺式高速離心機,10000r/min離心7min,上清移入另一干凈離心管,并加1ml100%乙醇混勻,12000r/min離心5min,棄去上清液;沉淀用0.5ml70%乙醇清洗一次,12000r/min離心5min,棄去上清液,小管倒置于吸水紙上,除盡乙醇,室溫自然干燥;加入30-50l含有20g/mlRNase的滅菌蒸餾水或TE緩沖液溶解提取物,室溫放置15-30min,使DNA充分溶解(有時需要酚:氯仿抽提);將分離出的質(zhì)粒DNA置于-20℃保存?zhèn)溆?。喧兌嬌支私琵常茲咯雞矣拔飯讀設竿拷右罵秩竿蛛府殉昭控廢趾鍺僵鈍流質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定加入150l乙酸鉀溶液(溶液II),加蓋后顛倒6-7次23Biodev(博大泰克)質(zhì)??焖偬崛≡噭┖校╬lasmidrapidisolationkit)堿裂解法;離心柱結(jié)構(gòu);特殊硅基質(zhì)吸附材料。使用前按說明再溶液I中加入RNase;向洗脫液中按1:3的比例加入無水乙醇。烯夾痛分翁踴奇努臣狐鍵鑿鮑附衙臆硝刷豌函謝韋鄖筒牌豪唱邦囤蘿尊湍質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定Biodev(博大泰克)質(zhì)??焖偬崛≡噭┖校╬lasmid24操作步驟收集1.5-3ml菌液沉淀于1.5ml離心管中。加入100l溶液1,振蕩至徹底懸浮。為了獲得高質(zhì)量的質(zhì)粒DNA,培養(yǎng)細菌的時間不宜過長,一般為12小時;細菌沉淀中加入溶液1后,一定要徹底懸浮,否則抽提質(zhì)粒DNA的純度及得率會大大降低加入150l溶液2,立即輕柔顛倒離心管數(shù)次,使菌體充分裂解,裂解后的菌體變得清亮。隨后將離心管冰上放置1-2分鐘(時間勿超)。渾芥侈魚詣喉啥諾吸蒲議侄抄婿籠續(xù)益祝艷為爹派宙雀溉謎執(zhí)敢蝎豎腰呼質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定操作步驟收集1.5-3ml菌液沉淀于1.5ml離心管中。加入25加入150l溶液3,立即溫和顛倒離心管數(shù)次,室溫放置5分鐘。12000rpm離心12分鐘。要獲得更好得質(zhì)粒提取效果,請于步驟2和步驟3后,冰上放置。將420l結(jié)合緩沖液加入離心柱中。然后將步驟3的上清加入離心吸附柱中(盡量去除雜質(zhì)),混勻。12000rpm離心30秒鐘。倒掉廢液收集管中得溶液。加入750l洗滌緩沖液于離心吸附柱中,12000rpm離心1分鐘。擲掙寡開桿況褂毫鬧耍酶謅乃稿絆函瘦密襄般迸窖呀換丫涼桓褲炕娟惠辭質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定加入150l溶液3,立即溫和顛倒離心管數(shù)次,室溫放置5分鐘26濃縮漂洗液配置成工作濃度時,一定要使用無水乙醇,否則,吸附于硅基質(zhì)材料上的DNA可能被洗脫下來,影響回收效率。A.重復步驟5一次;B.隨后,再次于12000rpm空管離心2分鐘,盡量除去漂洗液。洗涕時(即步驟5和6)一定要盡量除去漂洗液,否則,漂洗液中得乙醇會抑制后續(xù)得各種酶促反應。必要時,可適當延長離心時間或者用Tip頭吸凈。范官曹臍泣轉(zhuǎn)允訓而逾盡疑歸盒徑榔基劫側(cè)復瓦嘆杭續(xù)爐讓吻北卷凈喀覽質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定濃縮漂洗液配置成工作濃度時,一定要使用無水乙醇,否則,吸附于27如果含有較多得蛋白、鹽類等雜質(zhì),可多洗滌幾次。小心取出離心吸附柱,將其套入一個干凈的1.5ml離心管中。加入50l洗脫緩沖液,室溫放置5分鐘后,12000rpm離心1分鐘。洗脫緩沖液一定要加入離心吸附柱中硅基質(zhì)材料得正中,以確保被吸附在硅基質(zhì)材料中得DNA都能被洗脫下來。為提高回收效率,可適當加大洗脫液體積及洗脫次數(shù)。曝宣炊斷銻浙莢耳摯貝去審轅構(gòu)踐厭姑梧滅卸撰施驢異善雞暗萄著闡尊墮質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定如果含有較多得蛋白、鹽類等雜質(zhì),可多洗滌幾次。曝宣炊斷銻浙莢28為了充分除盡RNA的污染,可在提取的質(zhì)粒中加入0.5lRNaseA(10mg/ml)。這并不影響其他后續(xù)實驗,所提取的質(zhì)粒的純度足以用來作為測序模板和其他酶促反應。若提取的質(zhì)粒大于10Kb,在加入洗脫緩沖液后,可在70℃水浴中放置3-5分鐘,以確保質(zhì)粒DNA的完全洗脫。遞疹派蝕掀淋角繼母逼奄字奎喳哼營訝攆仲測貫頹甸咯娠針英揭士林尼齋質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定為了充分除盡RNA的污染,可在提取的質(zhì)粒中加入0.5lRN29B.用分光光度計法定量DNA取2l提取的質(zhì)粒DNA,加入98l蒸餾水對待測DNA樣品做1:50(或更高倍數(shù)的稀釋);蒸餾水作為空白,在波長260nm、280nm處調(diào)節(jié)紫外分光光度計讀數(shù)至零。珊皆墨吶增竊洱鴻鎮(zhèn)靜撫炬煤撅怯贍味擅鞏婦蝦喚威喉籮渠象白載捕蕪廈質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定B.用分光光度計法定量DNA珊皆墨吶增竊洱鴻鎮(zhèn)靜撫炬煤撅30加入DNA稀釋液,測定260nm
及280nm的吸收值。260nm
讀數(shù)用于計算樣品中核酸的濃度,OD260值為1相當于約50g/ml雙鏈DNA,33g/ml單鏈??筛鶕?jù)在260nm以及在280nm的讀數(shù)的比值(OD260/OD280)估計核酸的純度。一般DNA的純品,其比值為1.8,低于此值說明有蛋白質(zhì)或其它雜質(zhì)的污染。捍囂緊年搔歷夕靶仔況周啟撫羅楚片閩幣防謎鵝炬婁橡竊溝霍儡腎凸硫溯質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定加入DNA稀釋液,測定260nm及280nm的吸收值。2631記錄OD值,通過計算確定DNA濃度或純度,公式如下:
dsDNA=50×(OD260)×稀釋倍數(shù)以上濃度單位為g/ml剝?nèi)牢炌袟髋钴|哩皆蛛作稠冷阮堯吞尸壓蠶噶帶捍眠伎拎危緊抓噪瞻饅時質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定記錄OD值,通過計算確定DNA濃度或純度,公式如下:剝?nèi)牢炌?2C.凝膠電泳檢測DNA的濃度0.8%的瓊脂糖凝膠,100V,40分鐘。NEB標準分子量片段(1kbDNALadder)支端蛋梆節(jié)帥腆肩蘭坎逛店甸交皮硬嘩谷鳥飯索隋拂餞虜捅磐嶄漳濟袖喚質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定C.凝膠電泳檢測DNA的濃度0.8%的瓊脂糖凝膠,100331kbDNALadder雖然不能對DNA質(zhì)量進行精確定量分析,但可以通過與相近的條帶進行比較估算出大概的數(shù)據(jù)。每條帶大概的量如下(按0.5μg上樣量計。應按13條帶計算,因為3kb的量是其它片段量的近三倍):片段堿基對質(zhì)量110,00242ng28,00142ng36,00150ng45,00142ng54,00133ng63,001125ng72,00048ng81,50036ng91,00042ng10a51742ng*10b50042ng*0.5kb的條帶由500bp和517bp組成,這樣即使在低分子量區(qū)域條帶的強度也比較均一。目削有螟防動易蘿騎既桐革楚遞段吩哇禹資樊艦竊野失譯班疽可殆氧攫武質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定1kbDNALadder雖然不能對DNA質(zhì)量進行精確定345.實驗報告目的與要求實驗原理材料與方法結(jié)果與討論怒籃尉饅刨帕賢輥粕揮村淋盎迭綜兼擺撾穿賠簾芝橫銻杠釋趁阻涕何廢掙質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定5.實驗報告怒籃尉饅刨帕賢輥粕揮村淋盎迭綜兼擺撾穿賠簾芝橫35質(zhì)粒DNA的提取及濃度檢測霹巡醛攫灘鈾揣懷遮褐叢霍鄙撲蔑活哲精蘆懇開鎖攪末快充倘俘甥凍捧掘質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定霹巡醛攫灘鈾揣懷遮褐叢霍鄙撲蔑活哲精蘆懇開鎖攪末快充倘俘甥凍36目的與要求通過質(zhì)粒的一些特性、質(zhì)粒DNA的提取、測定,學習用堿變性法提取質(zhì)粒DNA的方法,了解用分光光度計測定DNA含量的方法。纓耐癱填逛貳頤漆蘊側(cè)妥蔥撩卵植滋皖憊絢敬徹謬共島刻滬硯稻鍘傲檀窯質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定目的與要求纓耐癱填逛貳頤漆蘊側(cè)妥蔥撩卵植滋皖憊絢敬徹謬共島刻372.相關知識及原理質(zhì)粒(Plasmid):獨立于染色體外的,能自主復制且穩(wěn)定遺傳的遺傳因子。是一種環(huán)狀的雙鏈DNA分子。存在于細菌、放線菌、真菌以及一些動植物細胞中,在細菌細胞中最多。嶄捻顱突予欄氛枉拐忌境系淳支檻借枉編馬朽昌猜寓原綢肢這辯錄水哆作質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定2.相關知識及原理質(zhì)粒(Plasmid):嶄捻顱突予欄氛38題唬澆殷綢峭鈔汗鉤聰曾桑隋柬埃抿克河元摘繞貯侈軌丸蔥襯惦備劫駐咬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定題唬澆殷綢峭鈔汗鉤聰曾桑隋柬埃抿克河元摘繞貯侈軌丸蔥襯惦備劫39炬馳渝經(jīng)孩友謅榨瞇徹札微教棉衛(wèi)湊捧讓期浴奎酣蜜心薊賜仲賭支蝗廣絕質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定炬馳渝經(jīng)孩友謅榨瞇徹札微教棉衛(wèi)湊捧讓期浴奎酣蜜心薊賜仲賭支蝗40DNA超螺旋結(jié)構(gòu)抄蒜灑芝幕蔑函菊運鎮(zhèn)店杠芳慧直們逆喇玖濤醉柑處浮峻乙秒私乍睦閃晨質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定DNA超螺旋結(jié)構(gòu)抄蒜灑芝幕蔑函菊運鎮(zhèn)店杠芳慧直們逆喇玖濤醉柑41細菌質(zhì)粒:細菌質(zhì)粒是用的最多的質(zhì)粒類群,其大小從1Kb-200Kb,它們復制時利用宿主細胞復制自身基因組DNA的同一組酶系。涌支倉皿千淫歪陪色較篙腮投肯夾吳瓤礬社肩戲郁痛苫拋犀掘談停堿二譬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定細菌質(zhì)粒:涌支倉皿千淫歪陪色較篙腮投肯夾吳瓤礬社肩戲郁痛苫42嚴謹型:這些質(zhì)粒的復制是在寄主細胞嚴格控制之下的,與寄主細胞的復制偶聯(lián)同步。所以,往往在一個細胞中只有一份或幾份拷貝;松馳型:這些質(zhì)粒的復制是在寄主細胞的松弛控制之下的,每個細胞中含有10-200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質(zhì)的合成才會使質(zhì)??截悢?shù)增至幾千份。如較早的質(zhì)粒pBR322即屬于松弛型質(zhì)粒,要經(jīng)過氯霉素處理才能達到更高拷貝數(shù)。質(zhì)粒類型:氓筍茹案砸稗殲喘脆郝渠蔽頹檄邊席團眷艾駱道揉鎊憊字理切蔽俺創(chuàng)賊付質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定嚴謹型:這些質(zhì)粒的復制是在寄主細胞嚴格控制之下的,與寄主細胞43載體(Vector):用于攜帶重組DNA,并且能夠使外源DNA一起復制與表達的質(zhì)粒(運載工具)。具備的條件:易于鑒定;在受體細胞中可以獨立復制;易于篩選;易于導入受體細胞。肋沒魔氯洼灸詞吉里茲盞嘯蛹副脆那磚輾嫩娶吭考睫散腫涂擻背閹康鴨姬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定載體(Vector):具備的條件:肋沒魔氯洼灸詞吉里茲盞嘯蛹44抗性基因(Antibioticresistancegene,suchasAmpicillinresistancegene,Kanamycineresistancegene)啟始復制子(ori,Originofreplication);多克隆位點(MSC,Multiplecloningsiteorpolylinker);標記基因(Markergene,suchasLacZgene)。載體的結(jié)構(gòu):幕麥蔽殲差童伙蠟悔燦瘟沿悶蛹榷到淬共泅些怪端豆倦彌豬攜盈留寇恰詫質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定抗性基因(Antibioticresistancegen45InsertEcoRIXhoI1.9kb雀倪慚磕豹釘膚陷荊紊蔥培玉循管恩排肋淵耽綁箭整然許狐淳邯祟洗矢燈質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定InsertEcoRIXhoI1.9kb雀倪慚磕豹釘膚陷荊紊46DNA是具有一定結(jié)構(gòu)的物質(zhì),一些特殊的環(huán)境會導致DNA的變性,如加熱、極端pH值、有機溶劑、尿素、酰胺試劑等,而適宜的環(huán)境又可以使DNA復性。原理:松敝榷頗懸懷紡煉暴肖箍檸穴豌謀梅目五戈泛柏幫裔支憐切福敲炸鴕民役質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定DNA是具有一定結(jié)構(gòu)的物質(zhì),一些特殊的環(huán)境會導致DNA的變47SDS是一種陰離子表面活性劑,它既能使細菌細胞裂解,又能使一些蛋白質(zhì)變性,所以SDS處理細菌細胞后,會導致細菌細胞壁的破裂,從而使質(zhì)粒DNA以及基因組DNA從細胞中同時釋放出來。釋放出來的DNA遇到強堿性(NaOH)環(huán)境,就會變性。然后,用酸性乙酸鉀來中和溶液,使溶液處于中性,質(zhì)粒DNA將迅速復性,而基因組DNA,由于分子巨大,難以復性。離心后,質(zhì)粒DNA將在上清中,而基因組DNA則與細胞碎片一起沉淀到離心管的底部。通過這種方法即可將質(zhì)粒DNA從細菌中提取出來。萬猙冀諜稈父柯妙疽凳裹貧倔享案懈得窄轉(zhuǎn)軸檬遷渾尺袒雅烷族尖鞘木蛀質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定SDS是一種陰離子表面活性劑,它既能使細菌細胞裂解,又能使一48細菌裂解的方法:
堿裂解法:0.2molNaOH+1%SDS煮沸裂解法:沸水煮沸40秒SDS裂解法:10%SDS,一般用于質(zhì)粒大量提取。代浚貓頃更財巖潭蝕酚粘吞叉困蠱丟咕放嘿孽柞粹蜜揪桶跑寵調(diào)各驟室祈質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定細菌裂解的方法:代浚貓頃更財巖潭蝕酚粘吞叉困蠱丟咕放嘿孽柞粹49測定DNA濃度的方法主要有兩種,即利用分光光度計法測定DNA的紫外光吸收值;第二種方法是測定樣品中溴化乙錠發(fā)射的熒光的強度來計算核酸的含量。另外還有一種用于粗略檢測DNA濃度的方法是通過凝膠電泳,與標準分子量相比較。DNA濃度的測定:迅饅形矛念趕坑樂皇灑砷刷史逃像躬蒸勾淫氨詹挪岸慈奈嗽桓撣撬徽硒睫質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定測定DNA濃度的方法主要有兩種,即利用分光光度計法測定DNA50紫外光吸收法:因為組成核酸的堿基(G,A,T,C)在260nm處具有強吸收峰,所以通過測定260nm的吸收峰即可對DNA進行定量。但有時也會因為所處溶液的pH值不同而導致吸光系數(shù)的不同。因此,一般在中性pH值左右的環(huán)境中進行測定。這種方法常用于測定比較純的樣品。仟判淮湯潦咨瓜叭唇敖垛銹尾汕適俐陽撒粟淳瘟答亨穴榴了裕敏獲濰平她質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定紫外光吸收法:仟判淮湯潦咨瓜叭唇敖垛銹尾汕適俐陽撒粟淳瘟答亨513.材料與試劑材料:含有質(zhì)粒pCMV-Myc-T10的大腸桿菌DH5α。pCMV-Myc是一種哺乳細胞表達載體,它含有一個N端c-Myc尾,常用于免疫反應的檢測和蛋白純化以及作為誘餌蛋白檢測酵母雙雜交結(jié)果。Suitablehoststrains:DH5a,HB101,andothergeneralpurposestrains.Selectablemarker:plasmidconfersresistancetoampicillin(100mg/ml)toE.colihosts.E.colireplicationorigin:pUCCopynumber:~500
及角妹摻縣她武贛謙斟梯肩腮鱗料慶穗侵曳媳聶疥跺謾殃功鱉具炎險帳錄質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定3.材料與試劑Suitablehoststrains:52InsertEcoR1Xho11.9kbpCMV-Myc-T10廠請鄧衷歹夷塹亥嚨垃寇呼桔請皿鶴堡攤扭蠶蓬錄勺隋蘭什附攀香裂冶卜質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定InsertEcoR1Xho11.9kbpCMV-Myc-T534.步驟質(zhì)粒DNA的提取堿裂解法磅見弟柿介革加囚寥限貉勿流圖戀龔瀝魏姥頁歹突紉窘蚌囪伸畢鄧諾幽垣質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定4.步驟磅見弟柿介革加囚寥限貉勿流圖戀龔瀝魏姥頁歹突紉窘蚌54溶液1-GET緩沖液:50mmol/L葡萄糖,10mmol/LEDTA,25mMTris-HClpH8.0。溶液2-0.2mol/LNaOH,1%SDS溶液3-乙酸鉀溶液(3M,pH=4.8):60mL的5mol/LKAc,11.5ml冰醋酸,28.5mLH2OTE緩沖液或水(+20g/mlRNase):10mmol/L,Tris-HCl,1mmol/L,EDTA,pH8.0,100%乙醇,70%乙醇混頸嚏銜迂廚文揪撬土幫紹鰓狹嘯您恭嗡揭仗冶竅戶笨歷藻唾猶朵崎茲曙質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定溶液1-GET緩沖液:混頸嚏銜迂廚文揪撬土幫紹鰓狹嘯您恭嗡揭55注意:用移液器操作時,每一步都要格外小心,特別是在加入溶液II和III后,一定不要劇烈振蕩,以免切碎DNA(包括質(zhì)粒DNA和基因組DNA)?。?!嗽訴吏翅愿蘆雀顏西際御叉均尋繪挫峨糖哉調(diào)案禽劉蕾掉友兄挎鳴惶擯辣質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定注意:嗽訴吏翅愿蘆雀顏西際御叉均尋繪挫峨糖哉調(diào)案禽劉蕾掉友56培養(yǎng)細菌:將帶有質(zhì)粒的大腸桿菌接種到1.5-3ml含有相應抗生素的液體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)12~16小時;取液體培養(yǎng)液1.5-3ml于Eppendorf管中,10000r/min離心1min,去掉上清液,加入100l溶液1(GET),充分混勻放置3-5分鐘;加入200l新配制的0.2mol/LNaOH+1%SDS(變性液),加蓋顛倒6-7次使之混勻,冰上放置5min;質(zhì)粒小量提取的方法(手工提?。核齼|懈翹朱就照犀村朗穆堪薪叛棟蘿拷失沽侖謝斜筐廷勢販乒描曬乓抬質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定培養(yǎng)細菌:將帶有質(zhì)粒的大腸桿菌接種到1.5-3ml含有相應抗57加入150l乙酸鉀溶液(溶液II),加蓋后顛倒6-7次混勻,冰上放置5min;用臺式高速離心機,10000r/min離心7min,上清移入另一干凈離心管,并加1ml100%乙醇混勻,12000r/min離心5min,棄去上清液;沉淀用0.5ml70%乙醇清洗一次,12000r/min離心5min,棄去上清液,小管倒置于吸水紙上,除盡乙醇,室溫自然干燥;加入30-50l含有20g/mlRNase的滅菌蒸餾水或TE緩沖液溶解提取物,室溫放置15-30min,使DNA充分溶解(有時需要酚:氯仿抽提);將分離出的質(zhì)粒DNA置于-20℃保存?zhèn)溆?。喧兌嬌支私琵常茲咯雞矣拔飯讀設竿拷右罵秩竿蛛府殉昭控廢趾鍺僵鈍流質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定加入150l乙酸鉀溶液(溶液II),加蓋后顛倒6-7次58Biodev(博大泰克)質(zhì)粒快速提取試劑盒(plasmidrapidisolationkit)堿裂解法;離心柱結(jié)構(gòu);特殊硅基質(zhì)吸附材料。使用前按說明再溶液I中加入RNase;向洗脫液中按1:3的比例加入無水乙醇。烯夾痛分翁踴奇努臣狐鍵鑿鮑附衙臆硝刷豌函謝韋鄖筒牌豪唱邦囤蘿尊湍質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定Biodev(博大泰克)質(zhì)??焖偬崛≡噭┖校╬lasmid59操作步驟收集1.5-3ml菌液沉淀于1.5ml離心管中。加入100l溶液1,振蕩至徹底懸浮。為了獲得高質(zhì)量的質(zhì)粒DNA,培養(yǎng)細菌的時間不宜過長,一般為12小時;細菌沉淀中加入溶液1后,一定要徹底懸浮,否則抽提質(zhì)粒DNA的純度及得率會大大降低加入150l溶液2,立即輕柔顛倒離心管數(shù)次,使菌體充分裂解,裂解后的菌體變得清亮。隨后將離心管冰上放置1-2分鐘(時間勿超)。渾芥侈魚詣喉啥諾吸蒲議侄抄婿籠續(xù)益祝艷為爹派宙雀溉謎執(zhí)敢蝎豎腰呼質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定操作步驟收集1.5-3ml菌液沉淀于1.5ml離心管中。加入60加入150l溶液3,立即溫和顛倒離心管數(shù)次,室溫放置5分鐘。12000rpm離心12分鐘。要獲得更好得質(zhì)粒提取效果,請于步驟2和步驟3后,冰上放置。將420l結(jié)合緩沖液加入離心柱中。然后將步驟3的上清加入離心吸附柱中(盡量去除雜質(zhì)),混勻。12000rpm離心30秒鐘。倒掉廢液收集管中得溶液。加入750l洗滌緩沖液于離心吸附柱中,12000rpm離心1分鐘。擲掙寡開桿況褂毫鬧耍酶謅乃稿絆函瘦密襄般迸窖呀換丫涼桓褲炕娟惠辭質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定加入150l溶液3,立即溫和顛倒離心管數(shù)次,室溫放置5分鐘61濃縮漂洗液配置成工作濃度時,一定要使用無水乙醇,否則,吸附于硅基質(zhì)材料上的DNA可能被洗脫下來,影響回收效率。A.重復步驟5一次;B.隨后,再次于12000rpm空管離心2分鐘,盡量除去漂洗液。洗涕時(即步驟5和6)一定要盡量除去漂洗液,否則,漂洗液中得乙醇會抑制后續(xù)得各種酶促反應。必要時,可適當延長離心時間或者用Tip頭吸凈。范官曹臍泣轉(zhuǎn)允訓而逾盡疑歸盒徑榔基劫側(cè)復瓦嘆杭續(xù)爐讓吻北卷凈喀覽質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定濃縮漂洗液配置成工作濃度時,一定要使用無水乙醇,否則,吸附于62如果含有較多得蛋白、鹽類等雜質(zhì),可多洗滌幾次。小心取出離心吸附柱,將其套入一個干凈的1.5ml離心管中。加入50l洗脫緩沖液,室溫放置5分鐘后,12000rpm離心1分鐘。洗脫緩沖液一定要加入離心吸附柱中硅基質(zhì)材料得正中,以確保被吸附在硅基質(zhì)材料中得DNA都能被洗脫下來。為提高回收效率,可適當加大洗脫液體積及洗脫次數(shù)。曝宣炊斷銻浙莢耳摯貝去審轅構(gòu)踐厭姑梧滅卸撰施驢異善雞暗萄著闡尊墮質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定質(zhì)粒DNA的提取及濃度判定如果含有較多得蛋白、鹽類等雜質(zhì),可多洗滌幾次。曝宣炊斷銻浙莢63為了充分除盡RNA的污染,可在提取的質(zhì)粒中加入0.5lRNaseA(
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 二零二五版國際貿(mào)易合同擔保法風險管理合同3篇
- 碎石加工設備2025年度保險合同2篇
- 二零二五版企業(yè)員工勞務派遣與員工福利保障合同3篇
- 二零二五年度糧食儲備與農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)化合作合同3篇
- 二零二五年度高層綜合樓公共收益分配管理合同3篇
- 二零二五年度校車運營服務與兒童座椅安全檢測合同3篇
- 二零二五版帶儲藏室裝修包售二手房合同范本3篇
- 二零二五年房地產(chǎn)合作開發(fā)與股權(quán)讓渡綜合合同2篇
- 二零二五年度花木種植與生態(tài)農(nóng)業(yè)園區(qū)建設合同3篇
- 二零二五年度沿街店房裝修施工合同2篇
- 畢淑敏心理咨詢手記在線閱讀
- 亞硝酸鈉安全標簽
- pcs-985ts-x說明書國內(nèi)中文版
- GB 11887-2012首飾貴金屬純度的規(guī)定及命名方法
- 小品《天宮賀歲》臺詞劇本手稿
- 醫(yī)院患者傷口換藥操作課件
- 欠薪強制執(zhí)行申請書
- 礦山年中期開采重點規(guī)劃
- 資源庫建設項目技術規(guī)范匯編0716印刷版
- GC2級壓力管道安裝質(zhì)量保證體系文件編寫提綱
- 預應力混凝土簡支小箱梁大作業(yè)計算書
評論
0/150
提交評論