CFX熒光定量PCR儀操作指南(Bio-rad)

1、 儀操作流程及注意事項(xiàng)開始運(yùn)行儀器打開電腦打開定量 PCR 儀底座開關(guān)啟動(dòng)CFX軟件放置樣本將PCR 性塑料手套，不要讓手指接觸到反映管表面。將反映管按順序放入儀器的加熱孔中。設(shè)置程序，運(yùn)行實(shí)驗(yàn)定量PCR 軟件操作基本步驟為設(shè)置熱循環(huán)程序文件(ProtocolTab) b.設(shè)置反映板文件(Tab)。C.點(diǎn)擊“鍵，運(yùn)行程序熱循環(huán)程序文件( ProtocolTab)設(shè)置指南：點(diǎn)擊 (編輯)或創(chuàng)建新程序。反映板設(shè)置文件(Tab)設(shè)置指南：選擇本次實(shí)驗(yàn)所要使用的熒光染料種類；單擊樣本類型；如要某些反映孔第一熒光染料關(guān)于應(yīng)的樣本類型為標(biāo)準(zhǔn)品( )，點(diǎn)擊“鍵可設(shè)置其標(biāo)準(zhǔn)品濃度及釋倍數(shù)。點(diǎn)擊“ 鍵。單擊OP

2、en(打開熱蓋)或Close(關(guān)閉熱蓋)放置樣本；單擊 保存文件，始運(yùn)行程序。結(jié)果分析PCR 反映結(jié)束后，軟件會(huì)自動(dòng)計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)曲線和Ct 值等。如需進(jìn)行表達(dá)量分析、等位基因分析等，在軟件窗口選擇相應(yīng)分析功能。點(diǎn)擊右上方的“RePOrt”鍵，還可輸出結(jié)果報(bào)告單關(guān)閉運(yùn)行儀器實(shí)驗(yàn)結(jié)束后取出反映管，順序關(guān)閉軟件、定量PCF 儀電源，關(guān)閉電腦。注意！CFX儀上蓋部分為全自動(dòng)控制，在通電狀態(tài)，嚴(yán)禁任何人為干預(yù)上蓋開啟或關(guān)閉的行為，此類行為會(huì)導(dǎo)致上蓋故障，危及儀器使用。軟件操作快速指南實(shí)驗(yàn)操作程序設(shè)置圖 1 顯示實(shí)驗(yàn)設(shè)置窗口中一個(gè)預(yù)覽的程序。點(diǎn)擊,打開程序編輯器創(chuàng)建一個(gè)新的程序。點(diǎn)擊,經(jīng)過(guò)瀏覽器加載一個(gè)程序或

3、關(guān)于其進(jìn)行編輯。使用下拉菜單直接加載一個(gè)程序或關(guān)于其進(jìn)行編輯。點(diǎn)擊,打開程序編輯器編輯所選程序的各個(gè)步驟。點(diǎn)擊開始運(yùn)行當(dāng)前加載的程序。程序編輯器程序編輯器可用來(lái)創(chuàng)建一個(gè)新程序或編輯一個(gè)已存在的程序，圖1 在圖形或文本模式下選擇任何需要編輯的一步（該步驟會(huì)用藍(lán)色高亮顯示），點(diǎn)擊溫度或保持時(shí)間進(jìn)行直接編輯。點(diǎn)擊SteP在程序中增加一個(gè)溫度步驟。點(diǎn)擊 SteP 在程序中刪除選中的步驟。點(diǎn)擊ASteP,在程序中指定獲取熒光數(shù)據(jù)的時(shí)間。如果當(dāng)前的高亮顯示步驟已經(jīng)進(jìn)行了讀板設(shè)置，則這一選項(xiàng)變?yōu)?。如果在這一步不想獲取數(shù)據(jù)，則點(diǎn)擊。點(diǎn)擊GoTo 24步。點(diǎn)擊GoTC GoTo的步驟。增加一個(gè)梯度步驟：1 在程

4、序編輯控制窗口中，點(diǎn)擊,圖2。擊數(shù)值進(jìn)行編輯，圖度來(lái)滿足指定的溫度范圍。增加熔解曲線：1 在程序編輯控制窗口中，點(diǎn)擊,圖2。在圖形或文本顯示模式下，點(diǎn)擊溫度值來(lái)編輯融解曲線范圍的最低和最高溫度，圖4 第 5步950 C1aso_期2 S5, C3 550 C for03-Aate RwcJ 4Gf 2TS marttimes_.5 S6.00.5 C t 環(huán)點(diǎn)擊增量值來(lái)編輯數(shù)據(jù)獲取的溫度區(qū)間點(diǎn)擊保持時(shí)間編輯每一個(gè)增量溫度的保持時(shí)間嗽件數(shù)據(jù)分析快速指南定量分析數(shù)據(jù)瀏覽擴(kuò)增圖表可以顯示實(shí)驗(yàn)中每個(gè)循環(huán)每個(gè)孔收集的相關(guān)于熒光信號(hào)曲線。點(diǎn)擊位于擴(kuò)增圖表下方的熒光檢查窗，選擇需要顯示的熒光數(shù)據(jù)，圖1。在孔

5、選擇器中點(diǎn)擊孔，行或列來(lái)顯示所選孔的熒光數(shù)據(jù)，圖1選中的孔是藍(lán)色的，未選中的孔是亮灰色的。若把光標(biāo)置于熒光信號(hào)曲線上，孔選擇器中的孔上，數(shù)據(jù)電 子表格的孔上，或者標(biāo)準(zhǔn)曲線上均可以顯示岀相應(yīng)的信息。棟荃.B M 4 3 ,tna 口數(shù)據(jù)分析選項(xiàng)CFX軟件可以自動(dòng)的扣除從各個(gè)孔所得數(shù)據(jù)的基線。從菜單欄中選擇,選擇ThreShoI可以改變基線范圍。軟件會(huì)自動(dòng)計(jì)算基線的位置。可以點(diǎn)擊并且拖 動(dòng)閥值線來(lái)手動(dòng)位。點(diǎn)擊工具欄中按鈕來(lái)編輯孔的內(nèi)容，可以臨時(shí)創(chuàng)建新的分群，從 分析中增加或刪掉一些孔。IU?圖表選項(xiàng)可用鼠標(biāo)右鍵點(diǎn)擊任何圖表來(lái)復(fù)制或保存圖像，或選擇除柵格，圖2。點(diǎn)擊工具欄中TraCe按鈕，或鼠標(biāo)右鍵

6、點(diǎn)擊任何圖表來(lái)設(shè)來(lái)改變軸范圍或刪制定孔的熒光信號(hào)曲 線顏色。鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)擊任何圖表，向下和拖動(dòng)光標(biāo)可以放大圖表。孔的分?jǐn)?shù)據(jù)瀏覽使用工具欄中SeIeCtGroup下拉菜單來(lái)瀏覽指定孔的分群數(shù)據(jù)，圖3。軟件可以針關(guān)于每個(gè)分群作為獨(dú)力的實(shí)驗(yàn)來(lái)處理，每一個(gè)分群可針關(guān)于自己的設(shè)置進(jìn)行分析，如進(jìn)行自身標(biāo)準(zhǔn)曲線的分析。VGrOUP 1.軸 2GroUP 3Gr o 4定量數(shù)據(jù)分析顯示選項(xiàng)點(diǎn)擊數(shù)據(jù)分析窗口中,瀏覽數(shù)據(jù)計(jì)算和統(tǒng)計(jì)，囊括每孔的閥值（CT）和平均值以及復(fù)制的標(biāo)準(zhǔn)偏差，圖4。點(diǎn)擊任一列的標(biāo)題進(jìn)行鑒于列的行分類。鼠標(biāo)右鍵 點(diǎn)擊電子表格并且選擇Sort 可進(jìn)行鑒于多個(gè)列的行分類。鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)擊任一列的標(biāo)題并且

7、向左或向右拖動(dòng)可以重新排列電子表格中列的順序。4。從 鼠標(biāo)右鍵點(diǎn)擊電子表格，下拉菜單中選擇輸岀在反映板柵格模式下顯示所選熒光的孔數(shù)據(jù)。創(chuàng)建報(bào)告顯示選項(xiàng)點(diǎn)擊數(shù)據(jù)分析窗口工具欄中RePOrt 按鈕，圖1 ,打開RePOrt 窗口，圖5。點(diǎn)擊報(bào)告選項(xiàng)列表中的檢查窗，使制定信息包含在報(bào)告中，這些信息在預(yù)覽部分中會(huì)有所顯示，圖5。點(diǎn)擊工具欄中 并且擇 ,以PF 格式保存報(bào)告，或選擇 打印報(bào)告。也可以保存報(bào)告為其它的文件格式。FAM-HEX MUltIPtoX PaIiM1122* PV .wWoWoW VWl am wOMBTW -1IHHgggHIimlllllIl mIL 軟件基因表達(dá)分析快速指南O

8、f CFX 軟件來(lái)評(píng)估樣本之間靶標(biāo)| 濃度的相關(guān)于差衡量目標(biāo)基因的水平。參照基因用來(lái)校正上樣的差異或各樣本取樣的差異。經(jīng)過(guò)生物學(xué)條件的研究，參照基因的表達(dá)水平通常不發(fā)生變化?；虮磉_(dá)分析設(shè)置圖 1 顯示各樣本孔含單一的熒光，四個(gè)復(fù)制類群，包含兩個(gè)不同靶標(biāo)名稱和兩個(gè)不同的樣本名稱。指定參照基因11Unk-I1SirrOt 1 Unkl4 1 1nk 1T*須 112I 2nk-2T 123Aget 2 Samok1Unk-34Unk-4T ifQtl 2 22nk 4T4f222BC2 SimPl3Unk-32Samk 1點(diǎn)擊反映板編輯器中或打開實(shí)驗(yàn)設(shè)置窗口,圖 2。 。點(diǎn)擊合適的檢查窗選擇將被

9、使用為參照基因的靶標(biāo)。點(diǎn)擊Show檢查窗，為靶標(biāo)設(shè)置反映擴(kuò)增效率。檢查窗被默認(rèn)設(shè)定。如果實(shí)驗(yàn)中運(yùn)行一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)曲線，從標(biāo)準(zhǔn)曲線中計(jì)算得到的擴(kuò)增效率將在計(jì)算中被使用。或者關(guān)于合適的靶標(biāo)輸入指定反映擴(kuò)增效率值，則計(jì)算中將使用這一擴(kuò)增效率 值。指定關(guān)于照樣本1 在窗口，選擇標(biāo)簽。2.點(diǎn)擊合適的檢查窗，選擇在計(jì)算中將被作為關(guān)于照的樣本，圖3。關(guān)于每個(gè)基因來(lái)說(shuō)，關(guān)于照樣本的被指定為1 ,同時(shí)一切其他樣本相關(guān)于于關(guān)于照樣本的值會(huì)被顯示岀來(lái)基因表達(dá)分析選擇分析模式1 從 Moe 下拉菜單中選擇分析模式，圖ii1LZWrS*49VM.Xn*I*w*rtUM沁9c*ta CWAJEOwt OttBmUIO*ML.LJMaWna*13 BW*vtfarf*MHh*Ow EQf BvMkAobr-1- 11:UMiJHrC -靶標(biāo)基因的相關(guān)于量可經(jīng)過(guò)樣本的參照基因來(lái)進(jìn)行相關(guān)于量的衡量。相關(guān)于量ZC-圖形選項(xiàng)GraPh下拉菜單中選擇關(guān)于照相關(guān)或零相關(guān)的圖形數(shù)據(jù)。在表中，GraPh選項(xiàng)默認(rèn)是照相關(guān)。X軸下拉菜單中選擇X軸以SamPIe顯示或 顯示。Y軸下拉菜單中選擇 , 或 作為Y軸刻度。OPtiOn下拉菜單中選擇,LOWeSt 或。TyPe下