NCBI上下載基因序列

1、文案大全文案大全.打開的信息，找到自己需要的基因?？丈蛑斜硎镜氖俏锓N，和網(wǎng)站，第一個(gè)框選擇，第二個(gè)框輸入基因名稱，如基因，點(diǎn)擊上下載基因序列、序列的方法.打開的信息，找到自己需要的基因?？丈蛑斜硎镜氖俏锓N，和網(wǎng)站，第一個(gè)框選擇，第二個(gè)框輸入基因名稱，如基因，點(diǎn)擊進(jìn)入第二頁面后，會(huì)看到如下一系列跟基因相關(guān)的信息，根據(jù)我需要的是人類的基因，故選擇第一個(gè)。點(diǎn)擊進(jìn)入下一個(gè)頁面。Items:1to20of2G51SearchresultsItems:1to20of2G51Page|l|of133NextLastOSee3信口73dismntinuHd出口laced漁卬苜一Name/GeneIDDes

2、criptionLocationAliasesMIMALKwnmpEsticIvmphoFniareceptortyrosineChromosome2,NC_DDQ002.1I2CD246,NBLST3105590ID：23Skin召sjHome&ap電加(huimar)|(29192774.2992161kcomplementAikanaplasticlymphomiakinaseMumChromosome17:NC_OOD083.6CD246,TcrzID:11632fntfsculus(housemouse)(71B6898a.7260648,complennentAikArapIast

3、iclymphomakinaseChromosome2RNT_033778.4Dmel_CGS250:ALK,CG825C:DAIk.ID;53426Drasophiarneanogaster(fruitfly)(16625291.16640011complement)DAlk53:DmelCG8250,alk,dALK,mili進(jìn)入后，會(huì)看到以下關(guān)于基因的詳細(xì)信息:WNCEYResourcesHowitt叵GeneGenevSearchAdvancedSendlo.WNCEYResourcesHowitt叵GeneGenevSearchAdvancedSendlo.ALKanaplastic

4、lymphomareceptortyrosinekinaseHomosapiens(huinan)GeneID:238,updatedan6-EJec-2016上Summarys?OfficialSymbolOffkidFullNamePriniisiysourceSeerelatedOfficialSymbolOffkidFullNamePriniisiysourceSeerelatedGenetypeRefSeqstatusOrganismLineageA出口knowna服SummaiyanaplasliclymphiomareceptortyrosinekinasepovidedHGNC

5、UGNCHGNC.427匚口口口口口771094MIM:1Q559QYep30TTHUMG口口口001殳D34proteincodingREVIEWEDHmo3曰pie：n5Eukaryota;Metazoa;Chordata:Crianiata;Vertebrata;Euteleostomi;P/lammalia;Eutheria:Euarchortcglires;Priiinfiates;Haplorrhirii;Catarrhini:Hominidae:HomoC口246;NBLST3ThisgenesncodGaireceptortyrosinekinase,whichtslDings

6、totheinsulinreceptorsuperfamily.Thisproteincomprisesan白xirmcHlulardomain,anhydrophobicstrBtehcorrespondingtoasinglepasstransmembraneregion,andanintracelularkina&edomain.Itplar/s：2nimportailroleinthedlev&lnpmientofthebrainandexertsitseffectsrimcnariHrnoiimncinFhanorx/nai-c；-CictiOrnThicm口rt口卜口。Ke-onf

7、rimnlhnh口rsoarraninadmai+a+orlnramrilifiiorlincoricrtffiimmiremr-hirllinnainsrilociilarnordI這些信息可以略過，往下查看，點(diǎn)擊下圖紅色框中的,進(jìn)入下個(gè)頁面。4GenomiccontextExoncount:29Location:2p232-p2i.1qNCBIResourcesHowToAnnotatioorefeaseStatusAssemblyChrLocation避currentSRChJS.p?(GCF_OOQCO打3.33)2NC_0OOOO2.12(29192774.29921611,cdfi

8、pigment)105previousassemblyGiRCh37.pl33CF_0氮叫405.2NC_000002.11(29J1&plernemt)進(jìn)入后會(huì)看到如下頁面，：GenomeDataViewerSequentGLocatwNC_DEOQQ2.1229192.71-26,921,611竽*s明印MHptntrsjigeWtPkkAs&enrfetily|口CPJlilOMl*D6玷fQRChmg甲等7Lot級(jí)n用電GeflEALK/IdeciorannView-no三，二-Mnllnl15nrn-nrmrcl.-rrrm,-mrTTTTHG8B1a-sans7*HSUOs.mn-

9、n-SHHHUdmnnr將鼠標(biāo)箭頭放在圖中紅色框中的綠色線上2-秒5，不用點(diǎn)擊。會(huì)看到下面的界面：（有些基因會(huì)出現(xiàn)好幾個(gè)，根據(jù)自己的要求選擇）k空逑K即盛之咕.2H卅Download:NF尤429工工NM配書口.士Liniks&Tools|Vi/w8口工95兆1721髭wGsD:238(AIK)一ViewHGHC：4Z7ViewHIM:10.5590Titte:ansplasticlymplhomareceptartycsinekinaseLocdti口口：0301口后叩總門2959乙774,29221r611)Length:72_IP4IIIIIlliIINP,001274457.1IIII

10、II11IInIIIIII11IIIIIIIIH11IIIIIIIII11IIiiIII口1IIIllllllllllIIIIIIIUIIIIIIIII11IIIIIIIIIIIIXP_0052GG19.LXP_01153112.1XPfG8712167.：lWPj302eie201BLASTGenomic:1N60g0022(2丸15277429r92L611)FASTRViH：NC000002.工工f因.,為IGEnEankVievM：NCQQQCO2.12129：15乙774.29：9216后第一個(gè)紅色框中：表示蛋白質(zhì)序列，代表蛋白質(zhì)，是編號(hào)，后面的代表更新狀態(tài)，數(shù)值越大，版本越新。表示

11、序列，表示，是編號(hào)，后面的代表更新狀態(tài)，數(shù)值越大，版本越新。第二個(gè)紅色框中：表示序列，表示，命名規(guī)則同上。第三個(gè)紅色框中：表示7整的基因序列，表示基因組。括號(hào)中的數(shù)字表示這個(gè)基因的堿基長(zhǎng)度，從到要下載蛋白序列、序列、序列、基因序列，直接點(diǎn)擊紅色框中的鏈接即可。這里下載基因序列，點(diǎn)擊后出現(xiàn)如下界面：點(diǎn)擊右邊的d1e（有好幾種格式）常用的是格式和格式。格式保存的信息更全面。AdvancedSend:tComp|用eReuondOCodingSequences(./GeneSend:tComp|用eReuondOCodingSequences(./GeneFeaturesChooseDestinat

12、ionoard。CollectionsOAnalysisToolshownke(abbrn城29LOCUSDEFINITIONACCESSICNVERSIONDE二二KKK3_3D00D272Ez33bpDNAlinearCD：N06-JUN-2D16Hamosapiena3hromosone2fGRC?j38PrimaryAsserrbly.一匚口口。口OWREGION:291?277.29921611GZC_C-CDDOL294NC_000002.12BioProject:PRJNA16BAsaembly:GCF000001405.33KEYWORDSSOURCECRGAHISMRefSe

13、q.Home-sapiens(hrnian)HeangsapiinmEukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;1-ni-n，ThVertebrata;TTEliteLeoston!;Tl1-Download1items.ShowGlCreateFileGenBankHomosapienschromosome2,GRCh38.p7PrimaryAssemblyNCBIReferenceSequence:NC00000212FASTAGiwhicsGoto:至此就把基因的序列下載了。二幾種代號(hào)的意思ACCESSION是NCBI序列數(shù)據(jù)中我們常用到編號(hào)（另一個(gè)是Gl）0

14、ACCESSION形式為Cr其中CC為兩個(gè)字母r其不同組合又可以區(qū)分為蛋白序列、核酸序列或基因組序列,而題位數(shù)不等的數(shù)字；ACCESSION后面又會(huì)加版本號(hào)，以形式表示，最后的尾數(shù)遞增表示序列信息、較之前的版本有所修改,這樣ACCE%I。N+版本號(hào)就是一個(gè)唯一的表示,代表一個(gè)唯一的序列,而且這個(gè)驛號(hào)不會(huì)改變.ACCESSIONMOLECULEMETHODNOTE4C_123456GenomicMixed一些可供選擇的注釋白?；蚪M序列主要用來標(biāo)記病毒和原核生物。AP_123456ProteinMixed匚標(biāo)記序列西應(yīng)的蛋白產(chǎn)物NC_123456GenomicMixed完整的基因組分子序列，;標(biāo)

15、記的類別包話基因組、染色體、細(xì)胞器、質(zhì)粒。NG_123456GenomicMixed不完整的基因組區(qū)域一提供NCBI基因組注釋途徑。比較有代表性有不轉(zhuǎn)錄的假基因或者那些啜雅自行北注警的基因組簇。NM_123456mRNAMixed轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物序列；成熟mRN2轉(zhuǎn)錄本序列:NM_12345&7B9汨微信號(hào)：Hll/Llf-一般采說,mRNA和基因組序列是我們主要的尋找對(duì)如果想找標(biāo)準(zhǔn)序列的話rmRNA就采用NM_開頭的，基因組用NC_或者AC_開頭的口soeas/!NP_123456NP_123456789ProteinMixed將白聲煙；主要是生長(zhǎng)轉(zhuǎn)裝氫郵序列，但也有T只有部分蛋白質(zhì)的部分瓦基魄序列，NR.123456RNAMixed本編碼的轉(zhuǎn)錄子序列，包恁結(jié)構(gòu)knag班基因轉(zhuǎn)子等。NT_123456GenomicAutomate