動(dòng)物基因組和的提取_第1頁(yè)
動(dòng)物基因組和的提取_第2頁(yè)
動(dòng)物基因組和的提取_第3頁(yè)
動(dòng)物基因組和的提取_第4頁(yè)
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1、動(dòng)物基因組和的提取第1頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一原理1、核酸的分類(lèi) DNA (脫氧核糖核酸) 主要存在于細(xì)胞核的染色體中。 核外也有少量DNA,如線(xiàn)粒體DNA(mtDNA),葉綠體DNA(cpDNA),質(zhì)粒DNA。 RNA(核糖核酸) 存在于細(xì)胞質(zhì)中,如mRNA, rRNA, tRNA等。 除上述DNA,RNA外,還有非細(xì)胞形式存在的病毒和噬菌體,其或只含DNA,或只含有RNA。第2頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一核酸的理化性質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)通常與蛋白質(zhì)結(jié)合,以復(fù)合物形式存在2、核酸制備的一般原則微溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有機(jī)溶劑在酸性溶液

2、中容易降解,在中性或弱堿性溶液中較穩(wěn)定。DNA溶液粘度很大,RNA的粘度較小在強(qiáng)大離心力的作用下,可以從溶液中沉降下來(lái)第3頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一分離純化核酸總的原則:2、核酸制備的一般原則核酸純化應(yīng)達(dá)到的要求: 核酸樣品中不應(yīng)存在對(duì)酶有抑制作用的有機(jī)溶劑和過(guò)高濃度的金屬離子; 其它生物大分子的污染應(yīng)降低到最低程度; 排除其它核酸分子的污染。 應(yīng)保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性; 排除其它分子(蛋白,脂類(lèi),多糖類(lèi))的污染。第4頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一核酸制備時(shí)應(yīng)注意的事項(xiàng): 盡量簡(jiǎn)化操作步驟,縮短提取過(guò)程。 減少化學(xué)因素對(duì)核酸的降解。

3、 減少物理因素對(duì)核酸的降解:機(jī)械剪切力和高溫 防止核酸的生物降解:排除核酸酶。 第5頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 降低溫度,改變pH及鹽的濃度,都利于對(duì)核酸酶活性的抑制,但均不如利用核酸酶抑制劑更有利,當(dāng)然,幾個(gè)條件并用更好。 對(duì)于DNA,抑制DNase活力很容易,但防止機(jī)械張力拉斷則更重要。 對(duì)于RNA,因分子較小,不易被機(jī)械張力拉斷,但抑制RNase活力較難,故在RNA提取中設(shè)法抑制RNase更重要。核酸酶的抑制和抑制劑 第6頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一DNase抑制 加入少量金屬離子螯合劑,如0.01 mol/L EDTA或檸檬

4、酸鈉,DNase基本可以全部失活。 去垢劑、蛋白變性劑及DNase抑制劑也可使DNase失活。第7頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一RNase抑制 操作要帶手套。 所有器皿要嚴(yán)格消毒, 試劑處理 低溫操作 在分離過(guò)程中要加入一定的RNase抑制劑。 第8頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 常用的RNA酶抑制劑 焦磷酸二乙酯(DEPC) 抑制強(qiáng)烈、不徹底 異硫氰酸胍 有效抑制、分解核蛋白 氧釩核糖核苷復(fù)合物 有效抑制 RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin) 有效抑制 其它:SDS、尿素、硅藻土等 有效抑制上述大部分試劑有致癌之嫌,應(yīng)謹(jǐn)慎操作!第9頁(yè),

5、共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一核酸制備中常用的去垢劑 核酸本身帶負(fù)電荷,結(jié)合帶正電荷的蛋白質(zhì)。用于核酸提取的去垢劑,一般都是陰離子去垢劑。 去垢劑的作用: 1溶解膜蛋白及脂肪,使細(xì)胞膜破裂; 2溶解核糖體上面的蛋白質(zhì),使其解聚,將核酸釋放出來(lái); 3對(duì)RNase、DNase有一定的抑制作用。如:SDS、脫氧膽酸鈉、4-氨基水楊酸鈉、萘-1.5-二磺酸鈉、三異丙基萘磺酸鈉第10頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 作用: 1.使蛋白質(zhì)變性、沉淀,從核酸提取液中分離除去,以防造成蛋白污染。 2.使蛋白質(zhì)變性,故可使核糖體解聚釋放出核酸。 3.某些蛋白質(zhì)變

6、性劑也有抑制 RNase活性和破裂細(xì)胞的作用。 如:苯酚、氯仿、鹽酸胍、DEPC核酸制備中常用的蛋白質(zhì)變性劑第11頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一核酸制備中常用的酶 DNase: 降解DNA RNase:降解RNA 蛋白酶K:降解蛋白質(zhì) 溶菌酶:破碎細(xì)胞 第12頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一3. 核酸制備的一般步驟:破碎組織細(xì)胞提取純化I.材料準(zhǔn)備II.破碎細(xì)胞或包膜內(nèi)容物釋放III.核酸分離、純化IV.沉淀或吸附核酸,并去除雜質(zhì)V.核酸溶解在適量緩沖液或水中第13頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一1)破碎細(xì)胞(防止

7、核酸酶的作用) 微生物:溶菌酶、SDS裂解。 高等植物:搗碎器破碎、液氮研磨。 酶法:蛋白酶,如胰蛋白酶, 冰凍法:反復(fù)凍融或液氮凍后組織搗碎。 動(dòng)物:液氮處理后用勻漿器或者研缽破碎。 細(xì)胞器DNA:首先純化細(xì)胞器。以上處理時(shí)均要同時(shí)加入核酸酶抑制劑第14頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一2)破碎抽提核酸除去雜質(zhì)首先使脫氧核糖核蛋白、核糖體、病毒的核蛋白與其它成分分離使核酸與蛋白質(zhì)分離除去脂類(lèi) 多糖的除去第15頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 3)核酸的純化 根據(jù)所需核酸的性質(zhì)和特點(diǎn)除去其它核酸污染,并除去提取過(guò)程中的系列試劑(鹽、有機(jī)溶劑等)

8、雜質(zhì),最后得到均一的核酸樣品。 第16頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一4)核酸樣品的保存 核酸保存的主要條件是溫度和介質(zhì) 溫度: 4 樣品經(jīng)常使用 -70是長(zhǎng)期保存的良好溫度,為一次性保存 -20保存,避免反復(fù)凍融 保存介質(zhì): 滅菌水 TE緩沖溶液(最常用): 10mmol/L Tris-Cl pH8.0 1mmol/L EDTA pH8.0第17頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一一、動(dòng)物基因組DNA的提取主要方法:(1)濃鹽法 利用RNP和DNP在電解溶液中溶解度不同,將二者分離。 1)用1M 氯化鈉提取,得到的DNP粘液 2) 與含有少量辛

9、醇的氯仿一起搖蕩,使乳化 3) 離心除去蛋白質(zhì),此時(shí)蛋白質(zhì)凝膠停留在水相及氯仿相中間,而DNA位于上層水相中 4) 用2倍體積95%乙醇可將DNA 鈉鹽沉淀出來(lái)第18頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一一、動(dòng)物基因組DNA的提?。?)陰離子去污劑法: 用SDS或二甲苯酸鈉等去污劑使蛋白質(zhì)變性, 可以直接從生物材料中提取DNA。 由于細(xì)胞中DNA與蛋白質(zhì)之間常借靜電引力或配位鍵結(jié)合, 而陰離子去污劑能夠破壞這種價(jià)鍵,所以常用陰離子去污劑提取DNA。第19頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一一、動(dòng)物基因組DNA的提取(3)苯酚抽提法: 苯酚作為蛋白變性劑

10、,同時(shí)抑制了DNase的降解作用。 用苯酚處理勻漿液時(shí), 由于蛋白與DNA 連接鍵已斷, 蛋白分子表面又含有很多極性基團(tuán)與苯酚相似相溶。 蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。離心分層后取出水層,多次重復(fù)操作,再合并含DNA 的水相。 利用核酸不溶于醇的性質(zhì),用乙醇沉淀DNA 。此法的特點(diǎn)是使提取的DNA保持天然狀態(tài) 。第20頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一DNA的提?。罕椒映樘岱?. 材料、設(shè)備及試劑材料:冷凍或新鮮抗凝全血,組織樣設(shè)備:EP管、微量取液器(20l, 200l, 1000l), 臺(tái)式高速離心機(jī), 渦旋振蕩器試劑:裂解液 lysis buffer(40m

11、MTris-醋酸,20mM醋酸鈉, 1mMEDTA, 1%SDS, pH8.0)、Tris-飽和酚、氯仿、異戊醇、 NaAC 、RNA酶、無(wú)水乙醇、滅菌水 第21頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一1)在500l抗凝血中加入lysis buffer 1000l,充分顛混至清亮。以4000rpm,離心5min。棄上清液。 2)沉淀中加入lysis buffer 1500l,充分勻漿。以6000rpm,離心5min 。3)徹底棄去上清,加入extraction buffer 500l(裂解細(xì)胞),混勻置于37,水溶1h 。4)加入8l的蛋白酶 K,顛混,37過(guò)夜(或55,3h

12、,但是37效果要好些)。 5)每管加入450l飽和酚(取溶液下層)緩慢搖晃10min,以5500rpm,離心15min。2. 操作步驟(血樣)第22頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一6)取上清,每管加入250l飽和酚和250l氯仿異戊醇(24:1),搖勻10min,以5500rpm,離心15min。7)取上清,每管加入500l氯仿異戊醇,搖勻10min,以5500rpm,離心15min。8)取上清,每管加50l的3M的NaAC,適量無(wú)水乙醇(預(yù)冷)至滿(mǎn),搖勻放入-20保存2h以上。 9)以12000rpm,離心20min。去上清,加入70乙醇500l,以12000rpm

13、,離心5min,去上清,5060干燥。10)加入50l滅菌去離子水,轉(zhuǎn)彈,混勻。 第23頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一3. 注意事項(xiàng)材料準(zhǔn)備最好使用新鮮材料,低溫保存的樣品材料不要反復(fù)凍融提取血液基因組DNA時(shí),要選擇有核細(xì)胞(白細(xì)胞)細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間不能過(guò)長(zhǎng),否則會(huì)造成DNA降解含病毒的液體材料DNA含量較少,提取前先富集第24頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一3. 注意事項(xiàng)細(xì)胞裂解材料應(yīng)適量,過(guò)多會(huì)影響裂解,導(dǎo)致DNA量少,純度低針對(duì)不同材料,選擇適當(dāng)?shù)牧呀忸A(yù)處理方式:植物材料液氮研磨動(dòng)物組織勻漿或液氮研磨組培細(xì)胞蛋白酶K細(xì)菌溶菌酶破壁高溫溫

14、浴時(shí),定時(shí)輕柔振蕩第25頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一3. 注意事項(xiàng)核酸分離、純化采用吸附材料吸附的方式分離DNA時(shí),應(yīng)提供相應(yīng)的緩沖體系采用有機(jī)(酚/氯仿)抽提時(shí)應(yīng)充分混勻,但動(dòng)作要輕柔離心分離兩相時(shí),應(yīng)保證一定的轉(zhuǎn)速和時(shí)間針對(duì)不同材料的特點(diǎn),在提取過(guò)程中輔以相應(yīng)的去雜質(zhì)的方法第26頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一3. 注意事項(xiàng)核酸沉淀、溶解當(dāng)沉淀時(shí)間有限時(shí),用預(yù)冷的乙醇或異丙醇沉淀,沉淀會(huì)更充分沉淀時(shí)加入1/10體積的NaAc(pH5.2,3M),有利于充分沉淀沉淀后應(yīng)用70的乙醇洗滌,以除去鹽離子等晾干DNA,讓乙醇充分揮發(fā)(不要過(guò)分

15、干燥)若長(zhǎng)期儲(chǔ)存建議使用TE緩沖液溶解TE中的EDTA能螯和Mg2+或Mn2+離子,抑制DNasepH值為8.0,可防止DNA發(fā)生酸解 第27頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一DNA中含有蛋白、多糖、多酚類(lèi)雜質(zhì)DNA在溶解前,有酒精殘留,酒精抑制后續(xù)酶解反應(yīng)DNA中殘留有金屬離子重新純化DNA,去除蛋白、多糖、多酚等雜質(zhì)重新沉淀DNA,讓酒精充分揮發(fā)增加70乙醇洗滌的次數(shù)(2-3次)4. DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題問(wèn)題一:DNA樣品不純,抑制后續(xù)酶解和PCR反應(yīng)。 原因?qū)Σ叩?8頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一材料不新鮮或反復(fù)凍融未很好抑制內(nèi)源核酸酶的

16、活性提取過(guò)程操作過(guò)于劇烈,DNA被機(jī)械打斷外源核酸酶污染DNA樣品反復(fù)凍融盡量取新鮮材料,低溫保存材料避免反復(fù)凍融液氮研磨或勻漿組織后,應(yīng)在解凍前加入裂解緩沖液在提取內(nèi)源核酸酶含量豐富的材料的DNA時(shí),可增加裂解液中螯合劑的含量細(xì)胞裂解后的后續(xù)操作應(yīng)盡量輕柔所有試劑用無(wú)菌水配制,耗材經(jīng)高溫滅菌將DNA分裝保存于緩沖液中,避免反復(fù)凍融問(wèn)題二:DNA降解對(duì)策 原因5. DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題第29頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一實(shí)驗(yàn)材料不佳或量少破壁或裂解不充分沉淀不完全洗滌時(shí)DNA丟失盡量選用新鮮(幼嫩)的材料動(dòng)植物要?jiǎng)驖{研磨充分;細(xì)菌、酵母裂解前先用生物酶或機(jī)械方式破壁高

17、溫裂解時(shí),時(shí)間適當(dāng)延長(zhǎng)(對(duì)于動(dòng)物細(xì)胞、細(xì)菌可增加PK的用量)低溫沉淀,延長(zhǎng)沉淀時(shí)間加輔助物,促進(jìn)沉淀洗滌時(shí),最好用槍頭將洗滌液吸出,勿傾倒問(wèn)題三:DNA提取量少對(duì)策 原因5. DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題第30頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一Plasmid DNA Extraction (Midiprep).flvmRNA Extraction from Total RNA.flv第31頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一1材料: 組織或者細(xì)胞2. 方法: TRIzol法,試劑盒二. 動(dòng)物基因組總RNA的提取第32頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15

18、點(diǎn)30分,星期一 總RNA提取試劑盒亞硫氫胍,巰基乙醇,n-月桂肌氨酸:變性細(xì)胞內(nèi)及核蛋 白復(fù)合物,釋放RNA;有效抑制核酸酶。苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)(pH4.7):酸平衡苯仿可抽提去除雜物。DNA及蛋白沉淀到有機(jī)相,RNA留在水相。酸性有機(jī)溶劑的抽提可免除用氯化鋰選擇沉淀RNA。用鋰沉淀導(dǎo)致小于5.8sRNA的丟失,并不利于下游操作。乙酸鈉(pH4.0):維持變性的細(xì)胞裂解液的pH值,及沉淀RNA。第33頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一1TRIzol試劑2氯仿3異丙醇475%乙醇(DEPC水配制)5DEPC水TRIzol法提取RNA試劑準(zhǔn)備:第34頁(yè),

19、共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一操作步驟 TRIzol法(組織)戴一次性手套將組織樣品從液氮中取出,用干滅過(guò)的剪刀將樣 品外包裹用紗布及表層的肉樣剪掉,然后放入干滅過(guò)的研缽中,往研缽中倒入液氮,快速研磨成細(xì)末狀;用1ml一次性塑料吸頭挑取細(xì)末裝入滅過(guò)菌的7mL一次性塑料離心管中用電子天平進(jìn)行稱(chēng)量,每管中稱(chēng)取0.2g樣品;往管中加入2 mL TRIZOL,用力振蕩后于15-30C溫育5min以裂解細(xì)胞,再加入0.4 mL三氯甲烷并劇烈振蕩15s后于15-30C溫育3min;第35頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一將離心管置于冷凍離心機(jī)2-4C 100

20、00rpm/min離心15min,小心吸取上清轉(zhuǎn)入另一離心管中,加入等體積異丙醇,混勻后于15-30C溫育15min以沉淀總RNA;將離心管置于冷凍離心機(jī)2-8C 10000rpm/min離心15min,棄上清;加入2mL用冰預(yù)冷的 75%乙醇漂洗,2-8C 7000 rpm/min離心 5min,棄上清,于室溫干燥10min;加入適量DEPC處理水并于55-60C水浴 溫育10min以溶解總RNA,取適量用于 DU640核酸蛋白測(cè)定儀測(cè)定濃度。 余下總RNA樣品的水溶液須保存在-80C。 第36頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 TRIzol法(細(xì)胞)將1mlTriz

21、ol加入1-5105細(xì)胞(6 孔板)中,室溫放置3min。 將全部溶液轉(zhuǎn)移到1.5ml離心管中,加入0.2ml氯仿,振蕩15s,靜置2min。4離心,12000g15min,取上清 液(約400ul)。 加入0.4ml異丙醇,將管中液體輕輕混勻,室溫靜置10min。 4離心,12000g10min,棄上清。 加入1ml75%乙醇,輕輕洗滌沉淀。4,7500g5min,棄上清。 晾干,加入適量的DEPCH2O溶解(65促溶10-15min)。 第37頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一提取RNA 過(guò)程中防止RNA酶的污染所采取的步驟處理RNA樣品時(shí)必需仔細(xì)小心,其程度取決于

22、樣品的用途和來(lái)源由于RNA酶存在于所有的生物中并且能夠抵抗諸如煮沸這樣的物理破壞,固此建立一個(gè)無(wú)RNA酶的環(huán)境對(duì)于制備優(yōu)質(zhì)RNA很重要對(duì)于制備mRNA來(lái)說(shuō)這些預(yù)防措施尤其重要。第38頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一提取RNA 過(guò)程中防止RNA酶的污染所采取的步驟方案:1) 工作區(qū)域應(yīng)與進(jìn)行普通微生物實(shí)驗(yàn)的區(qū)域分離好,特別是那些用于細(xì)菌接種、培養(yǎng)基和試劑配制的區(qū)域,那些培養(yǎng)基和試劑用于從細(xì)菌和動(dòng)物細(xì)胞中進(jìn)行DNA的制備和操作。通常認(rèn)為這些區(qū)域富含RNA酶。2) 如有可能,使用標(biāo)有“無(wú)RNA酶”的商品試管、吸頭、溶液和水。通常新的無(wú)菌處理過(guò)的塑料試管和吸管無(wú)RNA酶第39

23、頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一提取RNA 過(guò)程中防止RNA酶的污染所采取的步驟3) 雙蒸水(ddH2O)和溶液應(yīng)該用RNA酶的抑制劑DEPC(焦碳酸二乙酯)進(jìn)行處理:每100mL溶液或水中加入0.1mL DEPC原液,放在搖床上充分混勻并在37下作用數(shù)小時(shí)。然后將溶液高壓滅菌15min使DEPC失活。4) 用分子級(jí)的試劑和DEPC處理過(guò)的水配制的溶液通常沒(méi)有RNA酶。5) 分離RNA以前,將一些實(shí)驗(yàn)室玻璃制品置于烤箱在300 烘烤4h以滅活核酶。如有可能,將其他設(shè)備也滅菌處理。第40頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一提取RNA 過(guò)程中防止RN

24、A酶的污染所采取的步驟從組織中提取RNA則要注意: 動(dòng)物器官的解剖器械 存放組織塊的玻璃器皿 凍存組織塊所用的器皿 組織器官的沖洗液人汗含有RNA酶,故在所有步驟中均應(yīng)戴手套并經(jīng)常更換。 周?chē)h(huán)境含有大量的微生物和氣霧,它們來(lái)自吸液操作或來(lái)自我們自己的呼吸??赡茉斐蒖NA酶的污染一些組織像脾臟可能比其它組織含有更多的RNA酶。細(xì)菌比哺乳動(dòng)物細(xì)胞中有更多的RNA酶。因此從這些細(xì)胞中制備RNA應(yīng)采取更嚴(yán)格的預(yù)防措施。分離后的RNA通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳再經(jīng)溴化乙錠染色后便可檢查其是否完整。rRNA(18s和28s) 條帶模糊可能表明由RNA酶引起的RNA的降解。第41頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20

25、日,15點(diǎn)30分,星期一 注意事項(xiàng)1. 所有玻璃器皿均應(yīng)在使用前于180的高溫下干烤2hr或更長(zhǎng)時(shí)間;2. 塑料器皿用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿沖洗;3. 有機(jī)玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室溫10min,然后用0.1% DEPC水沖洗,晾干;第42頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一4.配制的溶液應(yīng)盡可能的用0.1% DEPC,在37處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應(yīng)當(dāng)用DEPC處理過(guò)的無(wú)菌雙蒸水配制,然后經(jīng)0.22m濾膜過(guò)濾除菌;5.操作人員戴一次性口罩、手套,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中手

26、套要勤換;6.設(shè)置RNA操作專(zhuān)用實(shí)驗(yàn)室,所有器械等應(yīng)為專(zhuān)用。第43頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一RNA電泳檢測(cè)和定量 RNA電泳檢測(cè) 核酸濃度儀檢測(cè)第44頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 RNA電泳檢測(cè)和定量 核酸濃度儀檢測(cè)純度: OD260/OD2801.8 濃度:稀釋倍數(shù)讀數(shù)比色皿需經(jīng)濃鹽酸:甲醇(1:1)溶液浸泡!第45頁(yè),共52頁(yè),2022年,5月20日,15點(diǎn)30分,星期一 RNA電泳檢測(cè)和定量 瓊脂糖電泳檢測(cè) 制備1.2%凝膠:將1.2g瓊脂糖溶于63mL DEPC處理水,冷卻至60C,加入20mL 5甲醛凝膠電泳緩沖液和17mL 37%甲醛,混勻后在通風(fēng)櫥內(nèi)灌制凝膠,于室溫放置30min,使凝膠凝固; 制備總RNA樣品:在一滅過(guò)菌的0.5mL的微量離心管中混合4.5L總RNA,2L 5甲醛凝膠電泳緩沖液,3.5L 37%的甲醛和10L去離子甲酰胺,于65C水浴溫育15min,冰浴冷卻,稍加離心使管內(nèi)液體集中于管底。往管中加入2L甲醛凝膠加樣緩沖液和1L 1mg/mL的

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