真核生物染色體作圖_第1頁
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文檔簡介

1、關(guān)于真核生物染色體作圖第一張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 一、真菌類的染色體作圖 二、有絲分裂分離與重組 三、分子標(biāo)記作圖 四、原們雜交作圖內(nèi) 容第二張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 第一節(jié) 真菌類的染色體作圖兩個連鎖基因的作圖三個連鎖基因的作圖紅色面包霉染色體的著絲粒作圖第三張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 兩個連鎖基因的作圖,用兩種不同類型鏈孢霉的雜交為例,即AbaB。 形成四分孢子類型可能有三種: 親二型(parental ditype,簡寫PD)非親二型(noparental ditype,簡寫NPD)四型(tetratype,簡寫T)一、兩個連鎖基因的作圖第

2、四張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月NCO a b ab SCO a b ab a b ab a b a+ + + + + + +b + + + + + + (PD) (TT) DCO a b ab DCO a b a+ 雙線 a b ab 三線 a b ab + + + + + +b + + + + + + (PD) (TT) DCO a b ab DCO a b ab 三線 a b a+ 四線 a b a+ + + + + + +b + + +b + + +b (TT) (NPD)兩個連鎖位點間不同交換類型產(chǎn)生的各種四分子第五張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月單交換頻率為: S

3、CO=TTDCO=TT2NPD 雙交換頻率為: DOC=4NPD 交換平均次數(shù) : m=SCO+2DCO=(TT 2NPD)+2(4NPD)=TT+6NPD 把m轉(zhuǎn)換成遺傳圖距單位: 圖距50X (TT+6NPD) a 與b 之間的遺傳距離為: 圖距50X(24/140+6X4/140)=17.1 那么 :Rf=1/2TT+NPD=1/2X24/140+4/140=0.114第六張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第七張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月二、三個連鎖基因的作圖第八張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月三、紅色面包霉染色體的著絲粒作圖 紅色面包霉的特點 紅色面包霉減數(shù)分

4、裂特點 四分子分析第九張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 易于繁殖、培養(yǎng)、管理; 可直接觀察基因表現(xiàn),無需測交; 可獲得、分析單次減數(shù)分裂的結(jié)果等1、紅色面包霉的特點第十張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月每次減數(shù)分裂結(jié)果(四個分生孢子,或其有絲分裂 產(chǎn)生的八個子囊孢子)都保存在一個子囊中;四分子或八分子在子囊中呈直線排列直列四 分子,直列八分子,具有嚴(yán)格的順序。2、紅色面包霉減數(shù)分裂特點第十一張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 紅色面包霉第十二張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月紅色面包霉的生活史第十三張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第十四張,PPT共六十頁,創(chuàng)作

5、于2022年6月3、四分子分析 紅色面包霉減數(shù)分裂的4個產(chǎn)物保留在一起,稱四分 子,對四分子表現(xiàn)進行的遺傳分析,稱為四分子分析第十五張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月四分子分析的優(yōu)越性:可把著絲??醋饕粋€座位2、子囊孢子的對稱性,證明減數(shù)分裂是一個交互過程。3、可以檢驗染色單體的交換是否有干涉,還可用于基因轉(zhuǎn)變的研究。4、證明雙交換可以包括4線中的兩線、3線或4線。染色體作圖(centromere mapping):利用四分子分析法,測定基因與著絲粒間的距離。染色體作圖的依據(jù):在非姐妹染色單體間沒有發(fā)生著絲粒和基因間交換的減數(shù)分裂,稱第一次分裂分離(first-division segr

6、egation)或叫M1模式分離。P79圖3-20,若發(fā)生了交換,稱第二次分裂分離(second-division segregation)或稱M2模式分離。第十六張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 A A A A A M A M A A a a A a a a a a a a (a) 第一次分裂分離 第十七張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第十八張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 A A A A A M a M a a A A a a A a a A a a (b) 第二次分裂分離 第十九張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月

7、 第一次分裂分離: 第二次分裂分離: 8個子囊孢子排列類型第二十一張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月4、著絲粒作圖 根據(jù)四分子標(biāo)記基因間的交換,計算著絲粒與標(biāo)記基因的重組值,被稱為:著絲粒作圖。 例如: Lys- X lys+ Lys- Lys- lys+ lys+ - - + + - + - + - - - - + + + + - - + + - - + + 第二十二張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月鏈孢霉 A a 子代子囊類型(1)(2)(3)(4)(5)(6)子囊類型子囊數(shù)分裂時間非交換型交換型AAaaaaAAAaAaaAaAAaaAaAAa105129951016M1M1M

8、2M2M2M2第二十三張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月+ an +PD+ a+ an +n +M1M1(1)+ an +NPD+ + +n an aM1M1(2)+ an +T+ + an +n aM1M2(3)第二十四張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月+ an +T+ an a+ +n +M2M1(4) + a n +PD+ an + an +M2M2(5)第二十五張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 + a n +NPD+ +n a+ +n aM2M2(6) + a n + T+ +n a+ an +M2M2(7)第二十六張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月著絲?;?/p>

9、: 重組值 交換型 X 1/2 交換型 非交換型 因為交換型子囊中,只有一半的子囊孢子發(fā)生了交換,所以,計算重組值時,要乘以 1/2 第二十七張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月表6-2 nic + + ad 得到不同子囊型的后代 (1) (2) (3) (4) (5) (6) (7) ad ad ad ad ad nic ad nic nic ad nic ad nic + nic ad nic ad ad nic + nic ad nic ad nic nic nic ad nic M 1 M 1 M 1 M 1 M 1 M 2 M 2 M 1 M 2 M 2 M 2 M 2 M 2

10、M 2 (PD) (NPD)(T) (T) (PD) (NPD) (T) 808 1 90 5 901 5第二十八張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十九張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月鏈孢霉 n + + a 的7種子囊型相應(yīng)的子囊數(shù)子囊型四分子基因型順序分離發(fā)生時間四分子類型實得子囊數(shù)(1)(2)(3)(4)(5)(6)(7)總計+ a+ an +n + + +n an a+ + an +n + an a+ +n + an + an + +n a+ +n a+ +n a+ an +M1M1M1M1M1M2M2M1M2M2M2M2M2M2PDNPDTTPDNPDT8081905

11、90151000第三十張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月PDM2M2NPDM2M2同一染色體上的標(biāo)記基因在異臂上在同臂上+an+二線雙交換+ an +單交換交換產(chǎn)物+ an + an +an+四線雙交換+na+四線三交換+ +n a+ +n a第三十一張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月按分離時間重新排列n/+/a子囊數(shù)M1M1M2M2M1M2M1M2809(808+1)90596(90+5+1)第三十二張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月著線粒與a間校正值的計算子囊型每一子囊內(nèi)被計算為交換的染色單體數(shù)子囊型在所有的子囊內(nèi)被計算為交換的染色單體數(shù)234567-n na -a002

12、222422042022222 190 590 1 5-n na -a 0 0 10180 2 10 4180 10 0 4 10 0180 0180 2 10合計100 202 208 372第三十三張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月RF(著絲粒-nic) =(4)(5)(6)(7) 1000 1/2 100% = (5+90+1+5) 10001/2 = 5.05 % = 5.05 (m.u)RF(著絲粒-ad) = (3) (5) (6) (7) 1000 1/2 100% = (90+90+1+5) 10001/2 = 9.30 % = 9.30 (m.u)nic 和ad 這兩個

13、基因是否連鎖 ?第三十四張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月nic 和 ad 分別位于著絲點的兩側(cè)還是同側(cè)? (1)若nic和ad不在同 nic ad 一條染色體上: 5.05 9.03 (2) 若nic和ad 連鎖, nic ad 但在著絲點兩側(cè): 5.05 9.03 (3) 若nic和ad 連鎖, nic ad 在著絲點同側(cè): 5.05 9.03nic,ad 座位著絲點作圖分析第三十五張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月因親組合(M1M1)約占80,表明是連鎖的;不同步: M2M15 M1M290 o 5.05 nic ad 9.03 o nic 之間發(fā)生交換的子囊為 101 o

14、ad 之間發(fā)生交換的子囊為186同步:M2M2= 90 + 1+ 5 = 96 o nic 之間發(fā)生交換的子囊為 101次交換中有96次 o ad 之間也發(fā)生了交換第三十六張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月RF(nicad) = ( NPD+1/2 T) 總子囊數(shù) = (2) + (6) + 0.5 (3) (4) (7) 1000 = (1+1) + 0.5 ( 90+5+5 ) 1000 = 5.2 % = 5.2 (m.u.)第三十七張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 第二節(jié) 有絲分裂分離和重組有絲分裂分離有絲分裂重組姊妹染色單體交換第三十八張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022

15、年6月一、 有絲分裂分離 在體細胞中,處于雜合狀態(tài)的一對等位基因有絲分裂時偶爾會分離。 第三十九張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月二、有絲分裂重組 1936 Curt Stern 在果蠅中發(fā)現(xiàn)有絲分裂時會發(fā)生與減數(shù)分裂交換類似的遺傳重組現(xiàn)象。孿生斑(twin spots)第四十張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十一張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十二張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十三張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十四張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 表6-4 用于曲霉實驗的單倍體和二倍體基因型 表型 基因型 單倍體 二倍體 綠色

16、w+y+ w +/w + y +/y + w +/w y +/y + w +/w + y +/y 黃色 w+y w +/w y/y w +/w + y/y 白色 wy+ w/w y+/y+ wy w/w y+/y w/w y/y第四十五張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月三、姊妹染色單體交換在有絲分裂的前期和中期、每條染色體由兩條相同的姊妹染色單體組成,有實驗揭示了在姊妹染色單體間能發(fā)生類似減數(shù)分裂中的交換,即姊妹染色單體交換(sister chromatid exchange,SCE)第四十六張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 第三節(jié) 分子標(biāo)記作圖分子標(biāo)記的特點 分子標(biāo)記的發(fā)展分子

17、標(biāo)記遺傳作圖方法分子標(biāo)記遺傳圖譜的應(yīng)用第四十七張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月一、分子標(biāo)記的特點不以表型為參照直接檢測個體基因型組成具有共顯性的特點第四十八張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月二、分子標(biāo)記的發(fā)展基因定位最早采用的方法就是連鎖分析。通過基因與DNA標(biāo)記之間的重組率來估計基因的位置??捎糜谶B鎖分析的DNA標(biāo)志是基因定位的基礎(chǔ),DNA標(biāo)記越多,雜合性越強,基因定位就越方便。DNA標(biāo)記的選擇經(jīng)歷了從RFLP-STRSNP等發(fā)展過程第四十九張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月 RFLPRFLP(restriction fragment length polymorphis

18、ms,限制性片段長度多態(tài)性)第五十張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月RFLP的特征: 處于染色體上的位置相對固定; 同一親本及其子代相同位點上的多態(tài)性片段特征不變;同一凝膠電泳可顯示不同多態(tài)性片段,具有共顯性特點;RFLP連鎖圖 RFLP 作圖的程序 與經(jīng)典遺傳作圖類似,只是統(tǒng)計性狀改為DNA 分子標(biāo)記; 程序:選擇已知基因型的親本 設(shè)計雜交方案 獲得交配的子代 分析其DNA分子標(biāo)記第五十一張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十二張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月SSR標(biāo)記 SSLPs(Simple sequence length polymorphisms,簡單序列長度多態(tài)性) SSLP 產(chǎn)生重復(fù)序列的可變排列,同一位點重復(fù)次數(shù) 不同,表現(xiàn)DNA序列長度變化; 與RFLP 不同,具有多等位性; 小衛(wèi)星(minisatellite)和微衛(wèi)星(microsatellite) 序列都可用于遺傳作圖,但微衛(wèi)星更普遍;第五十三張,PPT共六十頁,創(chuàng)作于2022年6月單核苷酸多態(tài)性(SNP) 1996年,Lander報道了SNP,制備第三代遺傳連鎖圖的遺傳標(biāo)記。 基因組中單個核苷酸的突變稱為點突變; 理論上每個單核苷酸位置最多只有4種形式,但某些群體 特定的單核苷酸位置只有2個或3個SNP,這些位點稱為雙 等位或三等位; 在基因組編碼順序中,SNP 大多位

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