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文檔簡介
1、免疫共沉淀技術(shù)路線(CoIP)2007-05-07 09:14準(zhǔn)備工作:預(yù)冷PBS, RIPA Buffer,細(xì)胞刮子(用保鮮膜包好后,埋冰下),離心機(jī)用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞兩次,最后一次吸干PBS;加入預(yù)冷的RIPA Buffer(1ml/107個細(xì)胞、10cm培養(yǎng)皿或150cm2培養(yǎng)瓶, 0.5ml/5X106個細(xì)胞、6cm培養(yǎng)皿、75cm2培養(yǎng)瓶)用預(yù)冷的細(xì)胞刮子將細(xì)胞從培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶上刮下,把懸液轉(zhuǎn)到1.5EP管中, 4C,緩慢晃動15min (EP管插冰上,置水平搖床上)4C,14000g離心15min,立即將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中準(zhǔn)備Protein A agarose,用PBS
2、洗兩遍珠子,然后用PBS配制成50%濃度, 建議減掉槍尖部分,避免在涉及瓊脂糖珠的操作中破壞瓊脂糖珠每1ml總蛋白中加入100p l Protein A瓊脂糖珠(50%),4C搖晃10min (EP 管插冰上,置水平搖床上),以去除非特異性雜蛋白,降低背景4C,14000g離心15min,將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中,去除Protein A 珠子(Bradford法)做蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線,測定蛋白濃度,測前將總蛋白至少稀釋1: 10倍以上,以減少細(xì)胞裂解液中去垢劑的影響(定量,分裝后,可以在-20C保 存一個月)用PBS將總蛋白稀釋到約1 p g/p l,以降低裂解液中去垢劑的濃度,如果 興趣蛋白在
3、細(xì)胞中含量較低,則總蛋白濃度應(yīng)該稍高(如10 p g/p l)加入一定體積的兔抗到500p l總蛋白中,抗體的稀釋比例因興趣蛋白在不 同細(xì)胞系中的多少而異4C緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫2h,激酶或磷酸酯酶活性分析建議 用2 h室溫孵育加入100p l Protein A瓊脂糖珠來捕捉抗原抗體復(fù)合物,4C緩慢搖動抗原 抗體混合物過夜或室溫1h,如果所用抗體為鼠抗或雞抗,建議加2 p l“過渡抗 體”(兔抗鼠IgG,兔抗雞IgG)14000rpm瞬時離心5s,收集瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物,去上清,用預(yù)冷的 RIPA buffer洗3遍,800p l/遍,RIPA buffer有時候會破壞瓊脂
4、糖珠-抗原抗 體復(fù)合物內(nèi)部的結(jié)合,可以使用PBS用60p l 2X上樣緩沖液將瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物懸起,輕輕混勻,緩 沖液的量依據(jù)上樣多少的需要而定(60 p l足夠上三道)將上樣樣品煮5min,以游離抗原,抗體,珠子,離心,將上清電泳,收集 剩余瓊脂糖珠,上清也可以暫時凍-20C,留待以后電泳,電泳前應(yīng)再次煮5min 變性。RIPA Buffer 配制:基礎(chǔ)成分:Tris-HCl (緩沖液成分,防止蛋白變性)NaCl (鹽份,防止非特異蛋白聚集)NP-40 (非離子去污劑,提取蛋白;用H2O配制成10%儲存液)去氧膽酸鈉(離子去污劑,提取蛋白;用H2O配制成10%儲存液;避光保存) 注意
5、:準(zhǔn)備激酶(致活酶)實驗時,不要加去氧膽酸鈉,因為離子型去污劑能夠 使酶變性,導(dǎo)致活性喪失。RIPA蛋白酶抑制劑苯甲基磺酰氟(PMSF)(用異丙醇配制成200mM的儲存液,室溫保存)EDTA (鈣螯合劑;用H2O配制成100mM的儲存液,PH 7.4)亮抑酶肽(Leupeptin)(用H2O配制成1mg/ml的儲存液,分裝,-20C保存)抑蛋白酶肽(Aprotinin)(用H2O配制成1mg/ml的儲存液,分裝,-20C保存)胃蛋白酶抑制劑(Pepstatin)(用甲醇配制成1mg/ml的儲存液,分裝,-20C 保存)RIPA磷酸(酯)酶抑制劑激活的Na3VO4 (用H2O配制成200mM的儲
6、存液,見Sodium OrthovanadateActivation Protoco)NaF (200mM的儲存液,室溫保存)注意:在準(zhǔn)備做磷酸(酯)酶實驗的時候,不加磷酸酯酶抑制劑工作液配制:配制 100ml 的 modified RIPA buffe:稱取790mg的Tris-Base,加到75ml去離子水中,加入900mg的NaCl,攪拌,直到全部溶解,用HCl調(diào)節(jié)PH值到7.4加 10 ml 10%的 NP-40加2.5 ml 10%的去氧膽酸鈉,攪拌,直到溶液澄清加1 ml 100mM的EDTA,用量筒定容到100ml,2-8C保存理論上,蛋白酶和磷酸酯酶抑制劑應(yīng)該在使用當(dāng)天同時加入
7、(抑蛋白酶肽, 亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制劑各100閆;PMSF, Na3VO4, NaF各500閆),但是PMSF 在水溶液中很不穩(wěn)定,30分鐘就會降解一半,所以PMSF應(yīng)該在使用前現(xiàn)加,其 他抑制劑成分可以在水溶液中穩(wěn)定5天。各種成分在工作液中的終濃度:Tris-HCl: 50 mM, pH 7.4NP-40: 1%去氧膽酸鈉:0.25%NaCl: 150 mMEDTA: 1 mMPMSF: 1 mM抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制劑:各1四g/mlNa3VO4: 1 mMNaF: 1 mM通過免疫共沉淀確定結(jié)合蛋白用磷酸鹽緩沖液洗30塊10 cm培養(yǎng)板上的適宜細(xì)胞。刮去每塊板上的細(xì)胞到1 ml冰冷的EBC裂解緩沖液中。將每毫升細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到微量離心管中,在微量離心機(jī)上4C以最大速度離 心 15 min。收集上清(約30 ml)并加入30p g的適當(dāng)抗體,4C搖動免疫沉淀物1 h。加入0.9 ml的蛋白質(zhì)A-Sepharose懸液,4C搖動免疫沉淀物30 min。用含900 mmol/L NaCl的NETN洗蛋白A-Sepharose混合物,再重復(fù)洗5次。 最后,用NETN洗一次。吸出混合物的液體部分。加入800. l的1XSDS膠加樣緩沖液到球珠中,煮 沸 4 min。將樣品加入到大孔的不連續(xù)SDS梯度膠中,在10 mA的恒定電流下電泳 過夜。通過考馬斯
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