論文格式規(guī)定及要求

1、編號(hào)：本科畢業(yè)論文題 目：學(xué) 院：專 業(yè)：年 級(jí)：姓 名：指導(dǎo)教師：完成日期：三號(hào)黑體、居中/目 錄小四號(hào)黑體小四號(hào)宋體 TOC o 1-5 h z 中文摘要與關(guān)鍵詞/二:二二.Abstract and Key Words 2.引言21生物信息學(xué)研究.2.2 22.1生物信息學(xué)的產(chǎn)生22.2序列分析方法/ 5結(jié)果分柝.73.1高豐度表達(dá)中已知序列功能的分析結(jié)果93.2山羊KRTAP8的生物信息學(xué)分析.20結(jié)論12參考文南犬25致謝16簡歷17三號(hào)黑體居中小四號(hào)宋體內(nèi)蒙古白絨山羊是一種優(yōu)良家品種，通過EST（表達(dá)序列標(biāo)簽）測序在分水平上 獲得大量數(shù)據(jù)，這些數(shù)挪供了內(nèi)蒙古白絨此的部分基因信息為進(jìn)一

2、步研究仙羊絨 生長相關(guān)基因奠定基礎(chǔ)。本實(shí)驗(yàn)選擇內(nèi)蒙古白絨山羊毛興盛期cDNA文庫為研究材料，其中15條HGT（高 甘氨酸酪氨酸角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白的cDNA序列已被國際公共數(shù)據(jù)庫GenBank數(shù)據(jù)庫接 受，其中KRTAP6角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白家族6）家族成員6個(gè)，KRTAP7家族成員1個(gè)，KRTAP8 家族成員2個(gè)，KRTAP16成員6個(gè)。通過對不同物種HGT氨基酸序列的比較分析發(fā)現(xiàn)山羊HGT的氨基酸序列與其它哺 乳動(dòng)物如人、小鼠和綿羊GT氨基酸序列有很多一致或保守的區(qū)域。分析其坦功能 位點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)在山羊的HGT中有許多豆蔻?；稽c(diǎn)。通過對白絨山羊日6丁蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測，發(fā)現(xiàn)絨山羊日6丁和其它物種HGT的

3、二 級(jí)結(jié)構(gòu)中無規(guī)則線性長鏈結(jié)構(gòu)所占比例最多伸展結(jié)構(gòu)占到了較少的部分幾乎沒有發(fā) 現(xiàn)a-螺旋的存在。小四號(hào)黑體/|小四號(hào)宋體 關(guān)鍵詞：絨山羊；生物信息學(xué);表達(dá)序列標(biāo)簽；高甘S酸酪氨酸角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白HGT）英文題目二號(hào)Times New Roman加粗、居中Research of Bioinformatics for InnerMongolianWhite Cashmere Goats三號(hào)Times NeWRoman加粗、居中Abstract小四號(hào) Times New RmanIn this study 15 HGT cDNAsequences were submitted to the inter

4、national public database (GenBank) which were chosen from the cDNA library of the Inner Mongolia white cashmere goat during anagen with skin as study material. Among them we find 6 members in KRTAP6, 1 members in KRTAP7, 2 members in KRTAP8 6rmembers of KRTAP16.Compared the amino acids sequence of H

5、GT of different species, the results showed that the HGT amino acids sequence of goat had many conservativeor identicaldomain with Human, Mouse and Sheep. Analyzing its Motif discovers that goat HGT have many N-myristoylation site. The secondary structure of HGT was predicted, the result indicated i

6、rregular long chain had a large proportion in the HGT secondary structure of goat and other species, there were a small quantity of 。-extended structures and- (helix were almost not found.四號(hào)Times Nw Roman 加粗/小四號(hào) Times Nw Roman/Key Words Cashmere Goat Bioinformatics EST(Express Sequenceags)；HGT(high

7、glycine/ tyrosine Keratin Associate Protein KRTAP) 引言小四號(hào)宋體我國絨山羊資源豐富，所產(chǎn)羊絨以其纖維細(xì)軟、保暖、潔白等特點(diǎn)，素有黃金” 之稱。在國際市場上享儒譽(yù)。內(nèi)蒙用絨山羊是一種對鸛環(huán)境適應(yīng)性極強(qiáng)而蘸為人 們提供優(yōu)質(zhì)紡織纖維的優(yōu)良家品種，無論從基礎(chǔ)理論還是應(yīng)用疏，絨山羊都副具研 究價(jià)值的重要家畜。根據(jù)美等西方發(fā)達(dá)國家政府利界糧農(nóng)組織FAO）的預(yù)測，21世 紀(jì)全球動(dòng)物農(nóng)業(yè)90%的品種都將通過分子育種6供，因此，建立內(nèi)蒙古白絨山羊種質(zhì)資源 庫，開展絨山羊產(chǎn)絨量和絨毛品質(zhì)等關(guān)的功能基因的研3對絨山羊的選育有重!的理論 和實(shí)際意義。隨著人類劇組計(jì)劃

8、、撤動(dòng)物基因組計(jì)劃糠養(yǎng)動(dòng)物基因組計(jì)劃嘛的深 入，已獲得了大量基因妹平的數(shù)據(jù)。這些工作為絨山羊功能基因組研究的開展狂了基 礎(chǔ)。利用EST表達(dá)序列標(biāo)簽的分析并獲得全長的CDNA序列，從而得到此基因鐐的蛋 白，對蛋白特征、結(jié)構(gòu)的分析對闡述山羊毛或絨郵性及表達(dá)有著重要皤義。生物信息學(xué)研究進(jìn)展2.1生物信息學(xué)的產(chǎn)生20世紀(jì)中葉以來，隨f DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的提出和蛋白質(zhì)空結(jié)構(gòu)的解析，開始時(shí) 子生物學(xué)時(shí)代。對遺傳彳息載體構(gòu)成和生命功能的體現(xiàn)者蛋白質(zhì)蒯究，成為生制學(xué)研 究的主要內(nèi)容。九十年偷隨著人類基因組i劃在世界范圍內(nèi)的開1，破解人類及多種模 式生物的遺傳密碼已成為生物領(lǐng)域的重要課題 同時(shí)產(chǎn)生了巨輔基因組信

9、息.面對如 此巨大且具有高度復(fù)雜性的生數(shù)據(jù)，如何有效地進(jìn)行管理口分析這些信息是人I基因組 研究必不可少的重要內(nèi)容，從而也促進(jìn)了生物信息（學(xué)ioinformatic這門生物學(xué)和信息科 學(xué)融合的新學(xué)科產(chǎn)生和發(fā)展（竺等，1998）。圖1復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(a)規(guī)則網(wǎng)(b)隨機(jī)網(wǎng)(c)小世界網(wǎng)絡(luò)(d)無標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)Fig. 1. The topobgical structures of complex networks(a) regular networks (b)random networks (c)small world networks (d) scale free networks生物信息學(xué)是內(nèi)涵非

10、常豐富的科，其核心是基因組信息學(xué)，包括基因組信息的獲取 處理、存儲(chǔ)、分配和解釋。基因組信息學(xué)的鍵是讀懂”基因組的核苷酸順序，即全部基 因在染色體上的確切位置以各DNA片段的功能；同時(shí)侈現(xiàn)了新基因信息之屈行蛋 白質(zhì)特征的分析及空間結(jié)構(gòu)的測。(郝柏林2000,陳潤生1999) z表1.實(shí)際網(wǎng)絡(luò)的Scale Free現(xiàn)象Table 1. Scale Free Phenomena of Actual NetworkNetworkSizeroutrinl /reall randWWW723,1087.52.722.1168.85Internet】8!, router3,8882.572.482.4812

11、.158.75Internet】8, domain3015-43893.42-3.762.1-2.22.1-2.246.3Phone call9533,10三號(hào)黑居中參考文獻(xiàn)小四號(hào)宋體加方括弧7小四號(hào)宋體施季森21世紀(jì)的生物信息學(xué)述評(píng)南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)2001-3 vol25,2吳昊.基因組學(xué)生物信息學(xué)及其對科學(xué)和社會(huì)的響.院士論壇，vol25,5施曉秋計(jì)算機(jī)科學(xué)在生物信息學(xué)中應(yīng)用.浙江工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)2001 vol29,2王發(fā)生生命科學(xué)時(shí)代的生物信息學(xué)中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志，2002 vol10,12郝柏林 生物信息學(xué).中國科學(xué)院院刊2000, 4期人名后和句號(hào)用英文實(shí)心句號(hào)陳潤

12、生.生物信息學(xué) 生物物理學(xué)報(bào)，1999 vol15,1期包家立生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫世界醫(yī)療器械，vol6, 1期李衍達(dá)生物信息學(xué)與21世紀(jì)的生物學(xué)科學(xué)前沿俞建新網(wǎng)絡(luò)上的生物信息資源生物學(xué)通報(bào)2000 vol35,8期陳竺等 人類基因組計(jì)劃的機(jī)遇和挑占生命的化學(xué)，1998年18卷，Kahn P. 1996.Coming to grips with genes and risk. Science； 274Lander E S. 1996. The new genomglobalviews of biologyScience, 274 536-539MarshalE. 1996.The genome p

13、rograms consnCe. Science, 274 488MarshalE. 1997. Whose DNA it, anyway? Science, 278564-567小四號(hào) Times Nw Roman三號(hào)黑體，居中致謝小四號(hào)宋知本論文是在導(dǎo)師李玉榮研究員尹俊副教授的悉心才導(dǎo)下完成的，導(dǎo)師嚴(yán)謹(jǐn)?shù)呐_(tái)學(xué)態(tài) 度、廣博的專業(yè)知識(shí)、開闊的思路和強(qiáng)烈的敬業(yè)精神將使我終生3益，三年的學(xué)習(xí)生涯中 導(dǎo)師在科研、學(xué)習(xí)、生活方面，都給予我許多的幫助和無微不全的關(guān)懷。并且感謝導(dǎo) 師為我提供了一個(gè)良好的實(shí)驗(yàn)與學(xué)習(xí)環(huán)境。特別感謝李金泉教授、張炎茹教授在對本論文給予了很多幫助和指導(dǎo)。論文實(shí)施過程中，生物工程學(xué)院的邢燕平漸及師弟張燕軍李長