食品中轉(zhuǎn)基因成分檢測_第1頁
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文檔簡介

1、關(guān)于食品中轉(zhuǎn)基因成分的檢測第一張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月第一節(jié) 概述轉(zhuǎn)基因生物:利用基因工程技術(shù)改變基因組的構(gòu)成, 用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)或者農(nóng)產(chǎn)品加工動(dòng)植物、微生物及產(chǎn)品。主要是轉(zhuǎn)基因植物。轉(zhuǎn)基因食品:轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物、微生物產(chǎn)品,如轉(zhuǎn)基因大豆:轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物、微生物產(chǎn)品直接加工品,如轉(zhuǎn)基因大豆油:以 和為原料生產(chǎn)的食品和添加劑,如轉(zhuǎn)基因大豆油加工成的人造奶油。轉(zhuǎn)基因成分(外源基因成分):物種本身不具有的,而是來源于其他物種的功能基因序列。第二張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月轉(zhuǎn)基因食品的特征具有其原有基因表達(dá)的性狀和功能存在外源DNA的表達(dá)產(chǎn)物及其生物活性第三張,PPT共四十二頁,

2、創(chuàng)作于2022年6月基因重組體載體:自我復(fù)制,運(yùn)載工具 目的基因:轉(zhuǎn)基因生物性狀改變直接相關(guān)DNA調(diào)控元件:使目的基因表達(dá)精確開始和終止,表達(dá)增強(qiáng)標(biāo)記基因:進(jìn)行標(biāo)記以便篩選轉(zhuǎn)化細(xì)胞報(bào)告基因:編碼某種易于檢測蛋白質(zhì)或酶的基因基因組基因組啟動(dòng)子終止子外源目的基因基因重組體示意圖第四張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月外源基因表達(dá)的產(chǎn)物主要包括:目的基因、標(biāo)記基因和報(bào)告基因表達(dá)的蛋白,或意外表達(dá)的蛋白。使得其具有有傳統(tǒng)食物有不同的生物特性,由此產(chǎn)生安全性問題。第五張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月第二節(jié) 食品中轉(zhuǎn)基因成分檢驗(yàn)檢測方法概述主要針對(duì)外源DNA 及其表達(dá)產(chǎn)物DNA分析蛋白質(zhì)抗

3、原特性PCR法ELISA和蛋白印跡法第六張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月檢測流程采樣混樣樣品制備目標(biāo)物質(zhì)提取PCR或蛋白質(zhì)檢測結(jié)果判斷結(jié)果報(bào)告第七張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月采樣要求1 一般規(guī)定:所用器具清潔干燥無DNA和蛋白質(zhì)污染;避免樣品散落,防止污染生態(tài)環(huán)境;短時(shí)間內(nèi)完成,避免樣品組成發(fā)生變化2 抽樣方法:隨機(jī)原則;“三層五點(diǎn)”;若加工工程損壞DNA,則加大采樣量第八張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月采樣要求3 抽樣數(shù)量:根據(jù)轉(zhuǎn)基因限量水平確定每批中應(yīng)抽取的原始樣品最小數(shù)量4 樣品制備與保存:分三份,用于檢測,復(fù)檢和備查;及時(shí)加貼標(biāo)簽,注明編號(hào)、貨物名稱、

4、品種、抽樣時(shí)間、抽樣人及其他必要信息第九張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月外源基因檢測根據(jù)檢測目的和檢測結(jié)果特異性水平不同, 檢測方法可分為四類:初篩試驗(yàn):普遍存在的基因重組通用元件基因特異性試驗(yàn):基因重組體中含有的外源基因組成結(jié)構(gòu)特異性試驗(yàn):目的基因與調(diào)控基因連接處的核苷酸序列事件特異性試驗(yàn):插入的基因序列和植物基因組之間的連接區(qū)第十張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月DNA提取及純化為什么要提取純化?植物細(xì)胞中DNA主要存在于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中,細(xì)胞中各種DNA稱為總DNA,其中95%以上的DNA是與蛋白質(zhì)結(jié)合存在的。植物細(xì)胞中還存在大量多糖、蛋白質(zhì)、多糖、多酚類物質(zhì)和RNA等

5、成分。 這些物質(zhì)都會(huì)影響后續(xù)DNA的PCR檢測。第十一張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月DNA提取及純化轉(zhuǎn)基因成分檢測時(shí)需要先提取總DNA,利用去污劑或有機(jī)溶劑破壞細(xì)胞膜,裂解細(xì)胞,是DNA與蛋白質(zhì)分離并游離于提取液中,然后去除雜質(zhì)成分。DNA純化的原理是根據(jù)乙醇或異丙醇競爭結(jié)合水分子的能力遠(yuǎn)強(qiáng)于DNA,在DNA提取液中加入乙醇或異丙醇,DNA因溶解度降低而析出。 第十二張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月DNA提取方法 一類:改進(jìn)的傳統(tǒng)方法,如苯酚-氯仿法、溴化十六烷基三甲基胺法(簡稱CTAB法)、二氧化硅法等。第二類:試劑盒法,試劑盒法因?yàn)椴僮骱啽愣粡V泛應(yīng)用。 第十三張,P

6、PT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月CTAB法樣本準(zhǔn)備:固體樣本要研磨成大小在2mm以下的顆粒,也可以用液氮研磨至DNA充分釋放并滿足DNA提取的要求;液態(tài)樣本可以通過離心沉淀、加熱蒸發(fā)、冷凍干燥等方法得到干物質(zhì)用于DNA提取。 第十四張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月CTAB法原理CTAB能溶解細(xì)胞膜并能與DNA結(jié)合成CTAB-DNA復(fù)合物,該復(fù)合物可溶解于高鹽溶液中(如氯化鈉),蛋白質(zhì)、多糖等物質(zhì)在此溶解中因溶解度降低而生成沉淀,經(jīng)離心后與復(fù)合物分離;然后將該復(fù)合物置于低鹽溶液中,因其不溶性而沉淀析出;最后將復(fù)合物沉淀溶解于高鹽溶液中,加入乙醇使DNA沉淀,離心后獲得純化的DNA。

7、 第十五張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月CTAB法主要試劑按下表配置試劑,定容至200ml,高壓滅菌第十六張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月DNA質(zhì)量和純度檢測瓊脂糖凝膠電泳 在含溴化乙錠的瓊脂糖凝膠里進(jìn)行電泳,紫外燈下觀察DNA條帶判斷核酸定量檢測 紫外分光光度計(jì)測定基因組DNA溶液的OD值,OD260/OD280一般在1.7 1.9,高了表明有RNA污染,低了表明有蛋白質(zhì)或有機(jī)溶劑污染。 第十七張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月核酸PCR檢測PCR即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的最大特

8、點(diǎn),是能將微量的DNA大幅增加。 PCR反應(yīng)體系是由DNA模版、引物、dNTP 、DNA聚合酶、鎂離子和緩沖液等組成。 PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。 第十八張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月變性:94退火:56延伸:72第十九張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月我國標(biāo)準(zhǔn)檢測方法核酸PCR定性檢測:檢測目標(biāo)基因是否存在 (有沒有)核酸PCR定量檢測:檢測目標(biāo)基因存在的量(有多少)第二十張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月1 核酸PCR定性檢測檢測原理是定性PCR檢測對(duì)象包括轉(zhuǎn)基因食品目的基因、啟動(dòng)子、終止子、標(biāo)

9、記基因等外源基因和元件。根據(jù)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的特異性序列設(shè)計(jì)引物,對(duì)試樣中外源目的基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增。依據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物中是否存在預(yù)期特異性片段,判斷樣品中是否含有轉(zhuǎn)基因成分。第二十一張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月為了提高反應(yīng)準(zhǔn)確性,在試樣PCR反應(yīng)的同時(shí),應(yīng)設(shè)置陰性和陽性對(duì)照。在陽性對(duì)照PCR反應(yīng)時(shí),內(nèi)源基因和待測樣品的特異性序列都得到擴(kuò)增,陰性對(duì)照沒有任何擴(kuò)增,表明PCR體系正常工作。第二十二張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)時(shí)熒光定量PCR是在普通PCR反應(yīng)體系中,增加能與模版結(jié)合的兩端有熒光基團(tuán)標(biāo)記的寡聚核苷酸探針。 在PCR體系中加入一對(duì)引物的同時(shí)加入

10、一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。 探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收。PCR擴(kuò)增時(shí),兩條引物分別與待擴(kuò)增目的DNA片段的5端和3端互補(bǔ)結(jié)合;探針則與兩條引物之間的目的DNA片段互補(bǔ)結(jié)合。第二十三張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月Taq酶的53外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。 擴(kuò)增反應(yīng)所經(jīng)歷的PCR循環(huán)數(shù)稱為循環(huán)閾值Ct值。Ct值與模版起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)呈線性關(guān)系,只要

11、獲得測試樣品的Ct值就可以利用標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出該樣品中目標(biāo)核酸的絕對(duì)含量。 第二十四張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月3 LAMP檢測 LAMP即環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增,已經(jīng)被廣泛地應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域中各個(gè)角落的DNA或RNA的特異高效擴(kuò)增。擴(kuò)增目的片段時(shí)要依賴一種具有鏈置換特性的DNA聚合酶和四條能夠識(shí)別靶序列上六個(gè)特異區(qū)域的引物。 本方法特異性高,不需要熱循環(huán)設(shè)備,具有操作簡單、快速的優(yōu)點(diǎn)。第二十五張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十六張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月蛋白質(zhì)檢測(ELISA)原理:從測試樣品中按照一定的程序提取含有目標(biāo)蛋白的基質(zhì),利用抗體與目標(biāo)蛋白(為抗

12、原)特異性結(jié)合的特性,通過對(duì)偶聯(lián)抗原與抗體復(fù)合物的作用產(chǎn)生的信號(hào)進(jìn)行檢測,而實(shí)現(xiàn)對(duì)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品特異蛋白的檢測。 優(yōu)點(diǎn):具有快速、靈敏、簡便、載體易于標(biāo)準(zhǔn)化。缺點(diǎn):由于抗原抗體的專一性,每種轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品都需要開發(fā)專門的檢測試劑。另外加工容易破壞蛋白的抗原性,影響結(jié)果的準(zhǔn)確性。第二十七張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月ELISA吸附原理圖第二十八張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月將原料樣品粉碎后,加入緩沖液混勻,震蕩抽提蛋白質(zhì),離心后去上清液稀釋,加入偶聯(lián)抗體孵育,在一定條件下是特異性蛋白進(jìn)行顯色反應(yīng),測定其吸光值。同時(shí)使用與基質(zhì)一致的標(biāo)準(zhǔn)品制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算相應(yīng)外源蛋白的

13、濃度。 每一輪反應(yīng)都要包括空白、陰性標(biāo)準(zhǔn)品、陽性標(biāo)準(zhǔn)品和測試樣品。蛋白質(zhì)檢測操作第二十九張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月其他檢測方法1 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析 通過研究外源基因在同種或不同種作物中的蛋白質(zhì)差異性表達(dá)檢測轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品 目前主要采用雙向電泳-質(zhì)譜技術(shù)及基于同位素標(biāo)記的質(zhì)譜分析技術(shù)進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析 優(yōu)點(diǎn):不僅能夠鑒定差異表達(dá)的蛋白,還能對(duì)其進(jìn)行較為準(zhǔn)確的定量第三十張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月2 近紅外光譜分析法第三十一張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月3 變性高效液相色譜法基于異源雙鏈DNA與同源雙鏈DNA的解鏈特性不同,在部分變性條件下異源雙鏈因有錯(cuò)配區(qū)

14、的存在而更易變性,在色譜柱中保留時(shí)間比同源雙鏈短,故先被洗脫下來,在色譜圖中表現(xiàn)為雙峰或者多峰的洗脫曲線。只能鑒定是否存在轉(zhuǎn)基因成分,不能檢測轉(zhuǎn)基因具體發(fā)生的位置及該區(qū)域的基因序列等信息。第三十二張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月基因芯片技術(shù)基因芯片:通過微加工技術(shù) ,將數(shù)以萬計(jì)的特定序列的DNA片段(基因探針)有規(guī)律地排列固定于支持物上,構(gòu)成的一個(gè)二維DNA探針陣列,與計(jì)算機(jī)的電子芯片十分相似,所以被稱為基因芯片。 第三十三張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月基片:又稱載片,是基因芯片中用于固定探針的基質(zhì),通常采用標(biāo)準(zhǔn)的載玻片或者其他固體載體,經(jīng)過化學(xué)修飾制備而成。 基因芯片探

15、針:又稱寡核苷酸探針,是基因芯片中固定于基質(zhì)表面、能與樣本DNA互補(bǔ)、用于探測樣本DNA信息的核酸分子。 雜交:指兩條互補(bǔ)的單鏈核酸形成一條穩(wěn)定的 雙螺旋分子的過程第三十四張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月基因芯片檢測原理:探針與待測樣品中目標(biāo)序列按堿基互補(bǔ)原理發(fā)生特異性雜交反應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)序列的檢測。第三十五張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月基因芯片檢測流程樣品核酸cDNA文庫DNA列陣基片基因芯片標(biāo)記的核酸核酸雜交洗滌檢測提取PCR、標(biāo)記PCR、純化固定第三十六張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月基因芯片技術(shù)在轉(zhuǎn)基因食品檢驗(yàn)中的應(yīng)用 檢測芯片: 進(jìn)行轉(zhuǎn)基因成分篩選

16、; 轉(zhuǎn)基因食品品系或品種確定; 轉(zhuǎn)基因重組體構(gòu)成元件分析。 表達(dá)譜芯片 主要應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因食品安全性評(píng)估 ,評(píng)價(jià)轉(zhuǎn)基因食品中外源特異性成分產(chǎn)生了怎樣的影響。包括:營養(yǎng)成分、毒性、過敏物質(zhì)等變化;基 因突變或代謝途徑改變;人體內(nèi)發(fā)生 突變而有害人體健康的可能性等。 第三十七張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月優(yōu)點(diǎn):基因芯片與傳統(tǒng)的檢測方法相比,靈敏性、特異性高,假陽性、假陰性率低,操作簡便快速,高通量。缺點(diǎn):成本高第三十八張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月Thank you!第三十九張,PPT共四十二頁,創(chuàng)作于2022年6月基片材料選擇固體類或薄膜類:普通玻璃片、硅片、聚丙烯膜、尼龍膜等能適應(yīng)透射光和反射光測量 具有惰性和穩(wěn)定性能使單位載體上結(jié)合的分子數(shù)達(dá)到最大具有活性基團(tuán)基片活化對(duì)載體表面進(jìn)行化學(xué)預(yù)

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