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文檔簡介
1、一、請任意列舉不少于三個基因(jyn)克隆技術(shù)在生物學(xué)與醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用,并且解釋原理。1、蛋白(dnbi)定位將抗體(kngt)制作為探針,加熒光標(biāo)記后將抗體注入細(xì)胞,進(jìn)行放射自顯影,從而定位蛋白質(zhì)。2、啟動子活性研究一種帶有某些標(biāo)記可供篩選的載體,如載體上面有-半乳糖苷酶基因的載體,將載體上原本的啟動子替換為你認(rèn)為有啟動子活性的序列,構(gòu)建重組載體,檢測-半乳糖苷酶表達(dá)活性來判斷目的序列的啟動活性。真核上面一般用熒光素酶報告載體,用表達(dá)的熒光素酶多少與底物發(fā)光的強(qiáng)弱來判斷目的序列的啟動活性。(1)蛋白定位。啟動子要研究蛋白GFP蛋白定位(2)基因敲除小鼠。通過外源DNA與染色體之間的同源重組,進(jìn)
2、行精確地定點修飾和基因改造。(3)基因療法。利用健康的基因來填補(bǔ)或替代基因疾病中某些缺失或病變的基因。二、請描述基礎(chǔ)基因克隆技術(shù)的大體步驟,并且描述PCR過程中可能發(fā)生的問題,以及簡單的應(yīng)對方法1、找:找到DNA片段。利用生物信息學(xué)、NCBI數(shù)據(jù)庫、BLAST查找基因。2、拉:PCR擴(kuò)增。3、剪:酶剪切4、連:DNA連接5、轉(zhuǎn):轉(zhuǎn)化PCR結(jié)果產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增,解決方法是在PCR中先將模版同引物在高于兩者變性溫度的條件下處理一段時間,然后將酶和其他成分加入擴(kuò)增,用以消除非特異性產(chǎn)物的方式,即Hot Start PCR三、1. 一個學(xué)生想試圖克隆一段DNA片段到一個載體DNA上,請幫助這個學(xué)生識別
3、這個載體,這是一個什么功能的載體,用于什么生物,抗性基因是什么? 已知XbaI為此載體唯一可以用于克隆的酶切位點,請說明如何預(yù)防載體自身黏合?2. 這個學(xué)生將1000bp DNA片段克隆了在這個載體上的XbaI位點,但是當(dāng)他做酶切檢驗時沒有發(fā)現(xiàn)1000bp的DNA片段,后期DNA測序證實DNA片段已經(jīng)成功的克隆在載體上。問,為什么當(dāng)他做酶切檢驗時DNA片段不能被酶剪切下來?答:1、GFP:綠色熒光標(biāo)記蛋白(dnbi)(載體),可用于蛋白質(zhì)定位。哺乳動物,因為CMV是哺乳動物啟動子??剐曰蚍謩e是氨芐(用于大腸桿菌基因克?。┖蚇eo(用于哺乳動物抗性篩選)??捎脡A性去磷酸酶去除末端P,此時DNA
4、連接酶不能連接,可以防止自身粘合CMV啟動子/增強(qiáng)子被廣泛應(yīng)用于構(gòu)建高效真核表達(dá)(biod)載體,CMV是大家公認(rèn)的啟動真核基因表達(dá)的最有力量的啟動子,CMV啟動子在哺乳動物中表達(dá)活性高,因此用于哺乳動物??剐曰蚴茿mp。防止自粘合使用堿性(jin xn)去磷酸酶出去末端P,此時DNA連接酶不能連接,可以防止自粘合。(結(jié)合圖說明)2、Dam-Dcm 甲基化酶無法介入,因此不能被剪切XbaI: T/CTAGAATGGTCGT TCTAGA TCGAGTGCTATGGTCGA TCTAGACCGAGTGCT四、一個學(xué)生想要在E.Coli中表達(dá)蛋白X,之后利用GST-fusion的方式將蛋白提純。
5、請幫這個學(xué)生設(shè)計出一個可用于DNA克隆和蛋白表達(dá)的載體。請解釋IPTG誘導(dǎo)的工作原理。并且請畫出預(yù)期的實驗結(jié)果。這個學(xué)生在得到實驗結(jié)果時發(fā)現(xiàn)蛋白表達(dá)非常的低,請問有什么辦法可以將蛋白表達(dá)含量提升?請解釋為什么。CMV啟動子GFPoriNEOAMPMCS1、2、3、A、密碼子優(yōu)化其他(qt)物種的密碼子,大腸桿菌利用率低,將其優(yōu)化成大腸桿菌的密碼子。最佳(zu ji)密碼子(optimal codons)稀有或利用率低密碼子B、延長IPTG誘導(dǎo)時間,原因(yunyn)是IPTG誘導(dǎo)時間過短,導(dǎo)致表達(dá)低。延長IPTG時間,時間長,表達(dá)量多。C、加大細(xì)胞濃度,原因是細(xì)胞少,表達(dá)能力有限,增大細(xì)胞濃度
6、,提升表達(dá)量。五、一個學(xué)生在小鼠中敲除基因。請簡單敘述小鼠基因敲除的原理。在敲除基因后他發(fā)現(xiàn)新孕育的小鼠在胚胎發(fā)育過程中死亡。他還有什么方法來敲除此基因?請解釋原理。六、已知酵母菌Saccharomyces cerevisiae的基因型為ura-, trp-, met-,請問以下哪些載體可以(ky)用于基因表達(dá)?請問你選擇的依據(jù)(yj)是什么?請解釋GAL啟動子是什么?其工作(gngzu)原理是什么?答:1、Neo 、Ura 和TRPIU和T合成U和T的酶,Neo是抗新霉素的抗藥基因,一般用來作為基因表達(dá)載體的篩選。trp操縱子是負(fù)責(zé)色氨酸合成的操縱子。trp操縱子是由一個啟動子和一個操縱基因
7、區(qū)組成。該操縱基因控制一個編碼色氨酸生物合成需要的5種蛋白的多順反子mRNA的表達(dá)。2、GAL啟動子是半乳糖啟動子七、1.請設(shè)計克隆引物ATGCGTAGCTAGCCGATGTCAGGTAGCTGATGCTGTAGTGCATGTAA答:1bamH1+ATGCGTAGCTAGCCGATGTCAGGTAGCTGATGCTGTAGTGCATGTAATACGCATCGATCGGCTACAGTC CATCGACTACGACATCACGTACATT+ bamH1bamH1+ATGCGTAGCTAGCCGATGTCAGbamH1+TTACATGCACTACAGCATCAGCTAC2.請設(shè)計(shj)克隆方法(
8、不少于兩種)ATGCGTAGCTAGCCGATGTCAGGTAGCTGATGCTGTAGTGCATGTAA答:1. Partial Digestion不完全(wnqun)酶切2. Fusion Cloning(lecture 3)八、一位老師的研究對象是MTF1轉(zhuǎn)錄因子,它的啟動子結(jié)合位點是CuSE。這位老師近期購買了一個由50萬個小分子藥物構(gòu)成的文庫。他想利用(lyng)酵母菌來篩選抑制MTF1結(jié)合DNA的藥物。已知酵母菌種不含有MTF1基因,請你幫助他設(shè)計一個可行性的試驗。內(nèi)容總結(jié)(1)一、請任意列舉不少于三個基因克隆技術(shù)在生物學(xué)與醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用,并且解釋原理(2)真核上面一般用熒光素酶報告載體,用表達(dá)的
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