第四章：病毒的命名和分類

1、整理ppt第四章第四章 病毒的分類與命名病毒的分類與命名 一、病毒的分類一、病毒的分類（一）病毒分類的發(fā)展歷程（一）病毒分類的發(fā)展歷程n1937年：年：Levadifi&Leptin根據(jù)病毒對(duì)組織的親和性根據(jù)病毒對(duì)組織的親和性進(jìn)行分類；進(jìn)行分類；n1948年：年：Holmes 提出根據(jù)病毒感染引起的癥狀來(lái)分提出根據(jù)病毒感染引起的癥狀來(lái)分類；類；n1950年：國(guó)際微生物學(xué)會(huì)提出分類的八項(xiàng)原則；年：國(guó)際微生物學(xué)會(huì)提出分類的八項(xiàng)原則；n1953年：年：Andremes提出按病毒的理化特性來(lái)分；提出按病毒的理化特性來(lái)分；n1963年：國(guó)際微生物命名委員會(huì)病毒學(xué)分會(huì)提出年：國(guó)際微生物命名委員會(huì)病

2、毒學(xué)分會(huì)提出新的八項(xiàng)分類原則；新的八項(xiàng)分類原則；n1966年成立國(guó)際病毒命名委員會(huì)（年成立國(guó)際病毒命名委員會(huì)（international committee on nomenclature of virus, ICNV）；）；1971年發(fā)表第一份報(bào)告：年發(fā)表第一份報(bào)告：500多種病毒分成多種病毒分成43個(gè)個(gè)病毒屬（組）；病毒屬（組）；n1 9 7 3 年 更 名 為 國(guó) 際 病 毒 分 類 委 員 會(huì)年 更 名 為 國(guó) 際 病 毒 分 類 委 員 會(huì)（international committee on taxonomy of virus, ICTV）；）；n最新的病毒分類報(bào)告：第六次報(bào)告（最

3、新的病毒分類報(bào)告：第六次報(bào)告（ 1995年）年）n現(xiàn)在已知的病毒有現(xiàn)在已知的病毒有3600多種，它們分別屬于多種，它們分別屬于71個(gè)病毒科個(gè)病毒科;n其中動(dòng)物病毒（包括脊椎動(dòng)物病毒和無(wú)椎脊動(dòng)其中動(dòng)物病毒（包括脊椎動(dòng)物病毒和無(wú)椎脊動(dòng)物病毒）有物病毒）有2000余種，分屬余種，分屬27個(gè)病毒科個(gè)病毒科;整理ppt（二）分類依據(jù)（二）分類依據(jù)1 1病毒的形態(tài)學(xué)特征病毒的形態(tài)學(xué)特征病毒粒子的大小和形狀；病毒粒子的大小和形狀；有無(wú)表面纖突和纖突的特征；有無(wú)表面纖突和纖突的特征；有無(wú)囊膜；有無(wú)囊膜；衣殼對(duì)稱型和結(jié)構(gòu)；衣殼對(duì)稱型和結(jié)構(gòu)；整理ppt2 2理化學(xué)特性理化學(xué)特性n病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系數(shù)

4、；病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系數(shù)；n對(duì)酸堿的穩(wěn)定性；對(duì)酸堿的穩(wěn)定性；n對(duì)熱的穩(wěn)定性；對(duì)熱的穩(wěn)定性；n對(duì)兩價(jià)陽(yáng)離子的穩(wěn)定性；對(duì)兩價(jià)陽(yáng)離子的穩(wěn)定性；n對(duì)去污劑的穩(wěn)定性；對(duì)去污劑的穩(wěn)定性；n對(duì)脂溶劑的穩(wěn)定性；對(duì)輻射的穩(wěn)定性。對(duì)脂溶劑的穩(wěn)定性；對(duì)輻射的穩(wěn)定性。3 3基因組基因組n核酸類型：核酸類型：DNADNA或或RNARNAn基因組大小；線狀還是環(huán)狀；基因組大??；線狀還是環(huán)狀；n單股還是雙股單股還是雙股n是整個(gè)的還是分節(jié)段的，節(jié)段的大小和是整個(gè)的還是分節(jié)段的，節(jié)段的大小和數(shù)目數(shù)目4.4.基因組的復(fù)制策略、開放閱讀框架基因組的復(fù)制策略、開放閱讀框架的數(shù)目和位置、轉(zhuǎn)錄特征、翻譯特征、的數(shù)目和位置、轉(zhuǎn)

5、錄特征、翻譯特征、翻譯后加工特征。翻譯后加工特征。 整理ppt5 5蛋白質(zhì)蛋白質(zhì) 結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，非結(jié)結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，非結(jié)構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，蛋白質(zhì)的特構(gòu)蛋白的數(shù)目、大小和功能活性，蛋白質(zhì)的特殊功能活性（轉(zhuǎn)錄酶、反轉(zhuǎn)錄酶、血凝素、神殊功能活性（轉(zhuǎn)錄酶、反轉(zhuǎn)錄酶、血凝素、神經(jīng)氨酸酶）經(jīng)氨酸酶）6 6脂質(zhì)、糖類含量和特性脂質(zhì)、糖類含量和特性 7 7在細(xì)胞培養(yǎng)中的生長(zhǎng)特性在細(xì)胞培養(yǎng)中的生長(zhǎng)特性n對(duì)細(xì)胞種類的特異性；對(duì)細(xì)胞種類的特異性；n病毒蛋白的聚集場(chǎng)所；病毒蛋白的聚集場(chǎng)所；n病毒粒子的裝配場(chǎng)所；病毒粒子的裝配場(chǎng)所；n病毒粒子成熟和釋放的部位和性質(zhì)。病毒粒子

6、成熟和釋放的部位和性質(zhì)。8 8抗原性抗原性n與其他相關(guān)病毒的血清學(xué)關(guān)系與其他相關(guān)病毒的血清學(xué)關(guān)系9 9生物學(xué)特性生物學(xué)特性n自然宿主范圍、傳播方式、傳播介體，地理自然宿主范圍、傳播方式、傳播介體，地理分布、致病性及與疾病的關(guān)系；分布、致病性及與疾病的關(guān)系；n組織嗜性和組織病理學(xué)。組織嗜性和組織病理學(xué)。整理ppt二病毒的命名規(guī)則二病毒的命名規(guī)則（一）一般規(guī)則：（一）一般規(guī)則：1病毒的分類和命名應(yīng)是國(guó)際性的，應(yīng)普遍病毒的分類和命名應(yīng)是國(guó)際性的，應(yīng)普遍適用于所有病毒適用于所有病毒;2. 通用的病毒分類系統(tǒng)采用通用的病毒分類系統(tǒng)采用目、科、亞科、目、科、亞科、屬和種的等級(jí)制度屬和種的等級(jí)制度，在種的命

7、名尚不完善，在種的命名尚不完善的情況下，許多病毒可用國(guó)際通用的俗名。的情況下，許多病毒可用國(guó)際通用的俗名。整理ppt3ICTV不統(tǒng)一規(guī)定病毒種以下的分類和命不統(tǒng)一規(guī)定病毒種以下的分類和命名。關(guān)于血清型、基因型、病毒株、變異名。關(guān)于血清型、基因型、病毒株、變異株等的命名由公認(rèn)的國(guó)際專家組決定。株等的命名由公認(rèn)的國(guó)際專家組決定。4對(duì)人工產(chǎn)生的病毒和實(shí)驗(yàn)室雜交株不予分對(duì)人工產(chǎn)生的病毒和實(shí)驗(yàn)室雜交株不予分類考慮，這些病毒的命名也同樣由公認(rèn)的類考慮，這些病毒的命名也同樣由公認(rèn)的國(guó)際專家組決定。國(guó)際專家組決定。整理pptn5當(dāng)代表成員病毒經(jīng)過(guò)充分鑒定并在發(fā)表當(dāng)代表成員病毒經(jīng)過(guò)充分鑒定并在發(fā)表的文獻(xiàn)上描述后

8、，才能建立一個(gè)類，以便的文獻(xiàn)上描述后，才能建立一個(gè)類，以便與相似的類區(qū)別。同樣，命名一個(gè)病毒時(shí)，與相似的類區(qū)別。同樣，命名一個(gè)病毒時(shí)，該病毒必須經(jīng)過(guò)充分鑒定并在文獻(xiàn)上發(fā)表該病毒必須經(jīng)過(guò)充分鑒定并在文獻(xiàn)上發(fā)表以明確區(qū)別于相似的病毒以明確區(qū)別于相似的病毒 整理ppt（二）關(guān)于類和病毒的命名原則（二）關(guān)于類和病毒的命名原則6現(xiàn)有的類和病毒的名稱無(wú)論是否適用均應(yīng)現(xiàn)有的類和病毒的名稱無(wú)論是否適用均應(yīng)予保留。予保留。7在類和病毒的命名中不遵守優(yōu)先率。在類和病毒的命名中不遵守優(yōu)先率。8不使用人名。不使用人名。9類和病毒的名稱應(yīng)便于使用，容易記憶，類和病毒的名稱應(yīng)便于使用，容易記憶，最好使用聽起來(lái)悅耳的名稱。

9、最好使用聽起來(lái)悅耳的名稱。整理ppt10不使用上標(biāo)、下標(biāo)、連字符、斜杠和希臘字不使用上標(biāo)、下標(biāo)、連字符、斜杠和希臘字母。母。11新名稱不應(yīng)與已通過(guò)的名稱有重復(fù)，應(yīng)選用新名稱不應(yīng)與已通過(guò)的名稱有重復(fù)，應(yīng)選用與正在使用的或過(guò)去使用的名稱不相近的名稱。與正在使用的或過(guò)去使用的名稱不相近的名稱。12如果縮拼詞對(duì)病毒學(xué)家有意義，且得到公認(rèn)如果縮拼詞對(duì)病毒學(xué)家有意義，且得到公認(rèn)的國(guó)際專家組的推薦，可以接受作為類的名稱。的國(guó)際專家組的推薦，可以接受作為類的名稱。整理ppt關(guān)于類和病毒的命名原則關(guān)于類和病毒的命名原則13由一個(gè)類或病毒的名稱所由一個(gè)類或病毒的名稱所隱含的任何意隱含的任何意義義都會(huì)因在名稱中涉及

10、不是所有成員或潛都會(huì)因在名稱中涉及不是所有成員或潛在成員所具有的特征，以及不是均等地適在成員所具有的特征，以及不是均等地適用于不同類的特征而排斥該類中的合適成用于不同類的特征而排斥該類中的合適成員病毒，員病毒，這種情況應(yīng)當(dāng)避免。這種情況應(yīng)當(dāng)避免。 14新名的選用應(yīng)考慮國(guó)家或民族敏感性問(wèn)題。新名的選用應(yīng)考慮國(guó)家或民族敏感性問(wèn)題。應(yīng)采用那些被病毒學(xué)家在科學(xué)雜志上發(fā)表的工應(yīng)采用那些被病毒學(xué)家在科學(xué)雜志上發(fā)表的工作中常用的名稱及衍生名稱作為命名的基礎(chǔ)，作中常用的名稱及衍生名稱作為命名的基礎(chǔ)，此時(shí)可不必考慮國(guó)家來(lái)源；在有一個(gè)以上的候此時(shí)可不必考慮國(guó)家來(lái)源；在有一個(gè)以上的候選名稱時(shí)，相應(yīng)的研究組或分委員會(huì)

11、向選名稱時(shí)，相應(yīng)的研究組或分委員會(huì)向ICTV執(zhí)執(zhí)行委員會(huì)提出建議，由執(zhí)行委員會(huì)決定取哪一行委員會(huì)提出建議，由執(zhí)行委員會(huì)決定取哪一個(gè)名稱。個(gè)名稱。 15新的名稱和名稱的變更應(yīng)以分類建議格式提新的名稱和名稱的變更應(yīng)以分類建議格式提交交ICTV。16病毒種是組成一個(gè)復(fù)制系并占有一個(gè)特定生病毒種是組成一個(gè)復(fù)制系并占有一個(gè)特定生態(tài)環(huán)境的一類多原則病毒。態(tài)環(huán)境的一類多原則病毒。17種名應(yīng)由少而實(shí)用的字組成種名應(yīng)由少而實(shí)用的字組成 18種名，通常與株名一起，必須表示明確的特種名，通常與株名一起，必須表示明確的特征，不涉及屬名或科名。征，不涉及屬名或科名。19已經(jīng)廣泛應(yīng)用的數(shù)字、字母及其組合可用作已經(jīng)廣泛應(yīng)用

12、的數(shù)字、字母及其組合可用作種名性質(zhì)形容詞。但新提出的連續(xù)數(shù)字、字母種名性質(zhì)形容詞。但新提出的連續(xù)數(shù)字、字母或其組合不單獨(dú)接受作為種名性質(zhì)形容詞。或其組合不單獨(dú)接受作為種名性質(zhì)形容詞。 整理pptn20ICTV通過(guò)新提議的種、種名和型名的通過(guò)新提議的種、種名和型名的程序分兩步：首先，給予暫時(shí)性通過(guò)，這程序分兩步：首先，給予暫時(shí)性通過(guò)，這樣的建議將發(fā)表在樣的建議將發(fā)表在ICTV報(bào)告中；然后，經(jīng)報(bào)告中；然后，經(jīng)過(guò)三年的等候期，如果不撤銷或修正，該過(guò)三年的等候期，如果不撤銷或修正，該建議將得到最后通過(guò)。建議將得到最后通過(guò)。 整理ppt（三）關(guān)于屬的規(guī)則（三）關(guān)于屬的規(guī)則n21屬是一組具有某些共同特性的

13、種。屬是一組具有某些共同特性的種。n22屬名應(yīng)是一個(gè)以屬名應(yīng)是一個(gè)以“Virus”結(jié)尾的單詞。結(jié)尾的單詞。n23通過(guò)一個(gè)屬名的同時(shí)需通過(guò)一個(gè)代表種。通過(guò)一個(gè)屬名的同時(shí)需通過(guò)一個(gè)代表種。n瘟病毒屬：瘟病毒屬：Pestivirusn冠狀病毒屬：冠狀病毒屬：Coronavirus整理ppt（四）關(guān)于亞科的規(guī)則（四）關(guān)于亞科的規(guī)則n24亞科是一組具有某些共同特性的屬。只有亞科是一組具有某些共同特性的屬。只有當(dāng)需要處理復(fù)雜等級(jí)結(jié)構(gòu)問(wèn)題時(shí)才使用亞科。當(dāng)需要處理復(fù)雜等級(jí)結(jié)構(gòu)問(wèn)題時(shí)才使用亞科。n25亞科名應(yīng)是一個(gè)以亞科名應(yīng)是一個(gè)以“Virinae”結(jié)尾的單詞。結(jié)尾的單詞。 E.g. Retrovirinae

14、：反轉(zhuǎn)錄病毒亞科反轉(zhuǎn)錄病毒亞科 Spumavirinae：泡沫病毒亞科泡沫病毒亞科整理ppt（五）關(guān)于科的規(guī)則（五）關(guān)于科的規(guī)則 n26科是一組具有某些共同特性的屬（不科是一組具有某些共同特性的屬（不管這些屬是否組成了亞科）。管這些屬是否組成了亞科）。n27科名應(yīng)是一個(gè)以科名應(yīng)是一個(gè)以“Viridae”結(jié)尾的單結(jié)尾的單詞。詞。n28通過(guò)一個(gè)科名的同時(shí)需通過(guò)一個(gè)屬名。通過(guò)一個(gè)科名的同時(shí)需通過(guò)一個(gè)屬名。皰疹病毒科：皰疹病毒科：Herpesviridae腺病毒科：腺病毒科：Adenoviridae整理ppt（六）關(guān)于目的規(guī)則（六）關(guān)于目的規(guī)則 n29目是一組具有某些共同特性的科。目是一組具有某些共同

15、特性的科。n30目名應(yīng)是一個(gè)以目名應(yīng)是一個(gè)以“Virales”結(jié)尾的單詞。結(jié)尾的單詞。動(dòng)物病毒的命名現(xiàn)狀：動(dòng)物病毒的命名現(xiàn)狀：1 1、種的命名、種的命名1 1）大多用其所引起疾病的名稱，后加）大多用其所引起疾病的名稱，后加“病毒病毒”兩字兩字 脊髓灰質(zhì)炎病毒、豬瘟病毒、流脊髓灰質(zhì)炎病毒、豬瘟病毒、流感病毒感病毒2 2）在病名前加上最初發(fā)現(xiàn)該病毒的地名）在病名前加上最初發(fā)現(xiàn)該病毒的地名日本乙型腦炎病毒、東方型馬腦炎病毒日本乙型腦炎病毒、東方型馬腦炎病毒3 3）直接用地名稱呼病毒）直接用地名稱呼病毒新城疫病毒新城疫病毒（Newcastle disease virus)Newcastle disea

16、se virus)4 4）用人名稱呼）用人名稱呼馬立克氏病病毒馬立克氏病病毒( (MarekMareks disease virus)s disease virus)2 2、科、屬的命名科、屬的命名1 1）依據(jù)病毒粒子的形態(tài)和理化學(xué)特性）依據(jù)病毒粒子的形態(tài)和理化學(xué)特性小小RNARNA病毒科、反轉(zhuǎn)錄病毒科、輪狀病毒屬病毒科、反轉(zhuǎn)錄病毒科、輪狀病毒屬2 2）依據(jù)病毒所引起的病變的性質(zhì)）依據(jù)病毒所引起的病變的性質(zhì)皰疹病毒科、痘病毒科皰疹病毒科、痘病毒科3 3）以病毒酶作用的基質(zhì)）以病毒酶作用的基質(zhì)正粘病毒科、副粘病毒科正粘病毒科、副粘病毒科4 4）以病毒的最初分離部位）以病毒的最初分離部位腺病毒科腺

17、病毒科5 5）感染宿主的部位）感染宿主的部位鼻病毒屬、腸道病毒屬鼻病毒屬、腸道病毒屬6 6）以幾個(gè)屬的縮拼詞作為科名）以幾個(gè)屬的縮拼詞作為科名乳多空病毒科乳多空病毒科整理ppt流感病毒的命名方法流感病毒的命名方法1.國(guó)際上通用的流感病毒命名方法國(guó)際上通用的流感病毒命名方法 型別型別/分離地點(diǎn)分離地點(diǎn)/分離序號(hào)分離序號(hào)/分離時(shí)間（年代）分離時(shí)間（年代）（血凝素和神經(jīng)氨酸酶序號(hào)）（血凝素和神經(jīng)氨酸酶序號(hào)） e.g A/Hongkong/1/68（H3N2） A/京科京科/1/56（H1N1）H：hemagglutinin 血凝素血凝素N：neuraminidase 神經(jīng)氨酸酶神經(jīng)氨酸酶整理ppt流

18、感病毒的命名方法流感病毒的命名方法2. 動(dòng)物流感病毒的命名則在型別與分離地點(diǎn)之動(dòng)物流感病毒的命名則在型別與分離地點(diǎn)之間加上動(dòng)物宿主名稱間加上動(dòng)物宿主名稱 e.g 甲甲/馬馬/布拉格布拉格/1/56（H1N1） 三、三、Baltimore 的分類系統(tǒng)的分類系統(tǒng)n以以mRNA為核心：根據(jù)病毒的為核心：根據(jù)病毒的DNA或或RNA是是與與mRNA互補(bǔ)互補(bǔ)(-）和不互補(bǔ)）和不互補(bǔ)（+) 而將病毒分而將病毒分為為6類。類。II類（+DNA）I類（DNA） mRNAIII類（RNA）V類（-RNA）VI類IV類+RNA整理ppt一一 DNA病毒病毒 （一）單鏈（一）單鏈DNA病毒病毒 細(xì)小病毒科（細(xì)小病毒科

19、（Parvoviridae)：豬細(xì)小病毒（豬細(xì)小病毒（PPV） 圓環(huán)病毒科（圓環(huán)病毒科（Circoviridae) ：豬圓環(huán)病毒（豬圓環(huán)病毒（PCV）四、動(dòng)物病毒的分類現(xiàn)狀四、動(dòng)物病毒的分類現(xiàn)狀整理ppt（二）二） 雙鏈雙鏈DNA病毒病毒 痘病毒科（痘病毒科（Poxviridae)：痘苗病毒、天花病毒痘苗病毒、天花病毒 皰疹病毒科（皰疹病毒科（Herpesviridae)：偽狂犬病病毒偽狂犬病病毒（PRV）、）、馬立克氏病病毒（馬立克氏病病毒（MDV）、）、雞傳染性雞傳染性喉氣管炎病毒（喉氣管炎病毒（ILTV）、）、鴨瘟病毒（鴨瘟病毒（DPV）、）、牛牛傳染性鼻氣管炎病毒（傳染性鼻氣管炎病毒（

20、IBRV） 腺病毒科（腺病毒科（Adenoviridae)：減蛋綜合癥病毒減蛋綜合癥病毒（EDS76） 整理ppt 乳多空病毒科（乳多空病毒科（Papovaviridae)：猴空泡病猴空泡病毒毒40(SV40) 非洲豬瘟病毒科（非洲豬瘟病毒科（Asfarviridae)：非洲豬瘟非洲豬瘟病毒病毒 嗜肝嗜肝DNA病毒科（病毒科（Hepadnaviridae)：人乙人乙型肝炎病毒（型肝炎病毒（HBV） 虹彩病毒科（虹彩病毒科（Iridoviridae)： 桿狀病毒科（桿狀病毒科（Baculoviridae)：整理ppt二二 RNA反轉(zhuǎn)錄病毒反轉(zhuǎn)錄病毒 反轉(zhuǎn)錄病毒科（反轉(zhuǎn)錄病毒科（Retroviri

21、dae)：馬傳馬傳染性貧血病毒（染性貧血病毒（EIAV）、）、人免疫缺陷病人免疫缺陷病病毒（病毒（HIV）整理ppt三三 RNA病毒病毒 （一）雙股（一）雙股RNA病毒病毒 呼腸孤病毒科（呼腸孤病毒科（Reoviridae)：藍(lán)舌病病藍(lán)舌病病毒（毒（BTV）、）、輪狀病毒輪狀病毒 雙雙RNA病毒科（病毒科（Birnaviridae)：雞傳染雞傳染性法氏囊病病毒（性法氏囊病病毒（IBDV） 整理ppt（二）單股負(fù)鏈（二）單股負(fù)鏈RNA病毒（不分節(jié)段）病毒（不分節(jié)段） 副粘病毒科（副粘病毒科（Paramyxoviridae)：新城疫病毒新城疫病毒（NDV） 彈狀病毒科（彈狀病毒科（Rhabdoviridae)：狂犬病病毒狂犬病病毒（RV）、）、水皰性口炎病毒（水皰性口炎病毒（VSV） 絲狀病毒科（絲狀病毒科（Filoviridae)：埃博拉病毒（埃博拉病毒（EBV）整理ppt(三）單股負(fù)鏈三）單股負(fù)鏈RNA病毒（分節(jié)段）病毒（分節(jié)段） 正粘病毒科（正粘病毒科（O