第四章：病毒的命名和分類

1、整理ppt第四章第四章 病毒的分類與命名病毒的分類與命名 一、病毒的分類一、病毒的分類（一）病毒分類的發(fā)展歷程（一）病毒分類的發(fā)展歷程n1937年：年：Levadifi&Leptin根據病毒對組織的親和性根據病毒對組織的親和性進行分類；進行分類；n1948年：年：Holmes 提出根據病毒感染引起的癥狀來分提出根據病毒感染引起的癥狀來分類；類；n1950年：國際微生物學會提出分類的八項原則；年：國際微生物學會提出分類的八項原則；n1953年：年：Andremes提出按病毒的理化特性來分；提出按病毒的理化特性來分；n1963年：國際微生物命名委員會病毒學分會提出年：國際微生物命名委員會病

2、毒學分會提出新的八項分類原則；新的八項分類原則；n1966年成立國際病毒命名委員會（年成立國際病毒命名委員會（international committee on nomenclature of virus, ICNV）；）；1971年發(fā)表第一份報告：年發(fā)表第一份報告：500多種病毒分成多種病毒分成43個個病毒屬（組）；病毒屬（組）；n1 9 7 3 年 更 名 為 國 際 病 毒 分 類 委 員 會年 更 名 為 國 際 病 毒 分 類 委 員 會（international committee on taxonomy of virus, ICTV）；）；n最新的病毒分類報告：第六次報告（最

3、新的病毒分類報告：第六次報告（ 1995年）年）n現在已知的病毒有現在已知的病毒有3600多種，它們分別屬于多種，它們分別屬于71個病毒科個病毒科;n其中動物病毒（包括脊椎動物病毒和無椎脊動其中動物病毒（包括脊椎動物病毒和無椎脊動物病毒）有物病毒）有2000余種，分屬余種，分屬27個病毒科個病毒科;整理ppt（二）分類依據（二）分類依據1 1病毒的形態(tài)學特征病毒的形態(tài)學特征病毒粒子的大小和形狀；病毒粒子的大小和形狀；有無表面纖突和纖突的特征；有無表面纖突和纖突的特征；有無囊膜；有無囊膜；衣殼對稱型和結構；衣殼對稱型和結構；整理ppt2 2理化學特性理化學特性n病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系數

4、；病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系數；n對酸堿的穩(wěn)定性；對酸堿的穩(wěn)定性；n對熱的穩(wěn)定性；對熱的穩(wěn)定性；n對兩價陽離子的穩(wěn)定性；對兩價陽離子的穩(wěn)定性；n對去污劑的穩(wěn)定性；對去污劑的穩(wěn)定性；n對脂溶劑的穩(wěn)定性；對輻射的穩(wěn)定性。對脂溶劑的穩(wěn)定性；對輻射的穩(wěn)定性。3 3基因組基因組n核酸類型：核酸類型：DNADNA或或RNARNAn基因組大??；線狀還是環(huán)狀；基因組大??；線狀還是環(huán)狀；n單股還是雙股單股還是雙股n是整個的還是分節(jié)段的，節(jié)段的大小和是整個的還是分節(jié)段的，節(jié)段的大小和數目數目4.4.基因組的復制策略、開放閱讀框架基因組的復制策略、開放閱讀框架的數目和位置、轉錄特征、翻譯特征、的數目和位置、轉

5、錄特征、翻譯特征、翻譯后加工特征。翻譯后加工特征。 整理ppt5 5蛋白質蛋白質 結構蛋白的數目、大小和功能活性，非結結構蛋白的數目、大小和功能活性，非結構蛋白的數目、大小和功能活性，蛋白質的特構蛋白的數目、大小和功能活性，蛋白質的特殊功能活性（轉錄酶、反轉錄酶、血凝素、神殊功能活性（轉錄酶、反轉錄酶、血凝素、神經氨酸酶）經氨酸酶）6 6脂質、糖類含量和特性脂質、糖類含量和特性 7 7在細胞培養(yǎng)中的生長特性在細胞培養(yǎng)中的生長特性n對細胞種類的特異性；對細胞種類的特異性；n病毒蛋白的聚集場所；病毒蛋白的聚集場所；n病毒粒子的裝配場所；病毒粒子的裝配場所；n病毒粒子成熟和釋放的部位和性質。病毒粒子

6、成熟和釋放的部位和性質。8 8抗原性抗原性n與其他相關病毒的血清學關系與其他相關病毒的血清學關系9 9生物學特性生物學特性n自然宿主范圍、傳播方式、傳播介體，地理自然宿主范圍、傳播方式、傳播介體，地理分布、致病性及與疾病的關系；分布、致病性及與疾病的關系；n組織嗜性和組織病理學。組織嗜性和組織病理學。整理ppt二病毒的命名規(guī)則二病毒的命名規(guī)則（一）一般規(guī)則：（一）一般規(guī)則：1病毒的分類和命名應是國際性的，應普遍病毒的分類和命名應是國際性的，應普遍適用于所有病毒適用于所有病毒;2. 通用的病毒分類系統采用通用的病毒分類系統采用目、科、亞科、目、科、亞科、屬和種的等級制度屬和種的等級制度，在種的命

7、名尚不完善，在種的命名尚不完善的情況下，許多病毒可用國際通用的俗名。的情況下，許多病毒可用國際通用的俗名。整理ppt3ICTV不統一規(guī)定病毒種以下的分類和命不統一規(guī)定病毒種以下的分類和命名。關于血清型、基因型、病毒株、變異名。關于血清型、基因型、病毒株、變異株等的命名由公認的國際專家組決定。株等的命名由公認的國際專家組決定。4對人工產生的病毒和實驗室雜交株不予分對人工產生的病毒和實驗室雜交株不予分類考慮，這些病毒的命名也同樣由公認的類考慮，這些病毒的命名也同樣由公認的國際專家組決定。國際專家組決定。整理pptn5當代表成員病毒經過充分鑒定并在發(fā)表當代表成員病毒經過充分鑒定并在發(fā)表的文獻上描述后

8、，才能建立一個類，以便的文獻上描述后，才能建立一個類，以便與相似的類區(qū)別。同樣，命名一個病毒時，與相似的類區(qū)別。同樣，命名一個病毒時，該病毒必須經過充分鑒定并在文獻上發(fā)表該病毒必須經過充分鑒定并在文獻上發(fā)表以明確區(qū)別于相似的病毒以明確區(qū)別于相似的病毒 整理ppt（二）關于類和病毒的命名原則（二）關于類和病毒的命名原則6現有的類和病毒的名稱無論是否適用均應現有的類和病毒的名稱無論是否適用均應予保留。予保留。7在類和病毒的命名中不遵守優(yōu)先率。在類和病毒的命名中不遵守優(yōu)先率。8不使用人名。不使用人名。9類和病毒的名稱應便于使用，容易記憶，類和病毒的名稱應便于使用，容易記憶，最好使用聽起來悅耳的名稱。

9、最好使用聽起來悅耳的名稱。整理ppt10不使用上標、下標、連字符、斜杠和希臘字不使用上標、下標、連字符、斜杠和希臘字母。母。11新名稱不應與已通過的名稱有重復，應選用新名稱不應與已通過的名稱有重復，應選用與正在使用的或過去使用的名稱不相近的名稱。與正在使用的或過去使用的名稱不相近的名稱。12如果縮拼詞對病毒學家有意義，且得到公認如果縮拼詞對病毒學家有意義，且得到公認的國際專家組的推薦，可以接受作為類的名稱。的國際專家組的推薦，可以接受作為類的名稱。整理ppt關于類和病毒的命名原則關于類和病毒的命名原則13由一個類或病毒的名稱所由一個類或病毒的名稱所隱含的任何意隱含的任何意義義都會因在名稱中涉及

10、不是所有成員或潛都會因在名稱中涉及不是所有成員或潛在成員所具有的特征，以及不是均等地適在成員所具有的特征，以及不是均等地適用于不同類的特征而排斥該類中的合適成用于不同類的特征而排斥該類中的合適成員病毒，員病毒，這種情況應當避免。這種情況應當避免。 14新名的選用應考慮國家或民族敏感性問題。新名的選用應考慮國家或民族敏感性問題。應采用那些被病毒學家在科學雜志上發(fā)表的工應采用那些被病毒學家在科學雜志上發(fā)表的工作中常用的名稱及衍生名稱作為命名的基礎，作中常用的名稱及衍生名稱作為命名的基礎，此時可不必考慮國家來源；在有一個以上的候此時可不必考慮國家來源；在有一個以上的候選名稱時，相應的研究組或分委員會

11、向選名稱時，相應的研究組或分委員會向ICTV執(zhí)執(zhí)行委員會提出建議，由執(zhí)行委員會決定取哪一行委員會提出建議，由執(zhí)行委員會決定取哪一個名稱。個名稱。 15新的名稱和名稱的變更應以分類建議格式提新的名稱和名稱的變更應以分類建議格式提交交ICTV。16病毒種是組成一個復制系并占有一個特定生病毒種是組成一個復制系并占有一個特定生態(tài)環(huán)境的一類多原則病毒。態(tài)環(huán)境的一類多原則病毒。17種名應由少而實用的字組成種名應由少而實用的字組成 18種名，通常與株名一起，必須表示明確的特種名，通常與株名一起，必須表示明確的特征，不涉及屬名或科名。征，不涉及屬名或科名。19已經廣泛應用的數字、字母及其組合可用作已經廣泛應用

12、的數字、字母及其組合可用作種名性質形容詞。但新提出的連續(xù)數字、字母種名性質形容詞。但新提出的連續(xù)數字、字母或其組合不單獨接受作為種名性質形容詞?；蚱浣M合不單獨接受作為種名性質形容詞。 整理pptn20ICTV通過新提議的種、種名和型名的通過新提議的種、種名和型名的程序分兩步：首先，給予暫時性通過，這程序分兩步：首先，給予暫時性通過，這樣的建議將發(fā)表在樣的建議將發(fā)表在ICTV報告中；然后，經報告中；然后，經過三年的等候期，如果不撤銷或修正，該過三年的等候期，如果不撤銷或修正，該建議將得到最后通過。建議將得到最后通過。 整理ppt（三）關于屬的規(guī)則（三）關于屬的規(guī)則n21屬是一組具有某些共同特性的

13、種。屬是一組具有某些共同特性的種。n22屬名應是一個以屬名應是一個以“Virus”結尾的單詞。結尾的單詞。n23通過一個屬名的同時需通過一個代表種。通過一個屬名的同時需通過一個代表種。n瘟病毒屬：瘟病毒屬：Pestivirusn冠狀病毒屬：冠狀病毒屬：Coronavirus整理ppt（四）關于亞科的規(guī)則（四）關于亞科的規(guī)則n24亞科是一組具有某些共同特性的屬。只有亞科是一組具有某些共同特性的屬。只有當需要處理復雜等級結構問題時才使用亞科。當需要處理復雜等級結構問題時才使用亞科。n25亞科名應是一個以亞科名應是一個以“Virinae”結尾的單詞。結尾的單詞。 E.g. Retrovirinae

14、：反轉錄病毒亞科反轉錄病毒亞科 Spumavirinae：泡沫病毒亞科泡沫病毒亞科整理ppt（五）關于科的規(guī)則（五）關于科的規(guī)則 n26科是一組具有某些共同特性的屬（不科是一組具有某些共同特性的屬（不管這些屬是否組成了亞科）。管這些屬是否組成了亞科）。n27科名應是一個以科名應是一個以“Viridae”結尾的單結尾的單詞。詞。n28通過一個科名的同時需通過一個屬名。通過一個科名的同時需通過一個屬名。皰疹病毒科：皰疹病毒科：Herpesviridae腺病毒科：腺病毒科：Adenoviridae整理ppt（六）關于目的規(guī)則（六）關于目的規(guī)則 n29目是一組具有某些共同特性的科。目是一組具有某些共同

15、特性的科。n30目名應是一個以目名應是一個以“Virales”結尾的單詞。結尾的單詞。動物病毒的命名現狀：動物病毒的命名現狀：1 1、種的命名、種的命名1 1）大多用其所引起疾病的名稱，后加）大多用其所引起疾病的名稱，后加“病毒病毒”兩字兩字 脊髓灰質炎病毒、豬瘟病毒、流脊髓灰質炎病毒、豬瘟病毒、流感病毒感病毒2 2）在病名前加上最初發(fā)現該病毒的地名）在病名前加上最初發(fā)現該病毒的地名日本乙型腦炎病毒、東方型馬腦炎病毒日本乙型腦炎病毒、東方型馬腦炎病毒3 3）直接用地名稱呼病毒）直接用地名稱呼病毒新城疫病毒新城疫病毒（Newcastle disease virus)Newcastle disea

16、se virus)4 4）用人名稱呼）用人名稱呼馬立克氏病病毒馬立克氏病病毒( (MarekMareks disease virus)s disease virus)2 2、科、屬的命名科、屬的命名1 1）依據病毒粒子的形態(tài)和理化學特性）依據病毒粒子的形態(tài)和理化學特性小小RNARNA病毒科、反轉錄病毒科、輪狀病毒屬病毒科、反轉錄病毒科、輪狀病毒屬2 2）依據病毒所引起的病變的性質）依據病毒所引起的病變的性質皰疹病毒科、痘病毒科皰疹病毒科、痘病毒科3 3）以病毒酶作用的基質）以病毒酶作用的基質正粘病毒科、副粘病毒科正粘病毒科、副粘病毒科4 4）以病毒的最初分離部位）以病毒的最初分離部位腺病毒科腺

17、病毒科5 5）感染宿主的部位）感染宿主的部位鼻病毒屬、腸道病毒屬鼻病毒屬、腸道病毒屬6 6）以幾個屬的縮拼詞作為科名）以幾個屬的縮拼詞作為科名乳多空病毒科乳多空病毒科整理ppt流感病毒的命名方法流感病毒的命名方法1.國際上通用的流感病毒命名方法國際上通用的流感病毒命名方法 型別型別/分離地點分離地點/分離序號分離序號/分離時間（年代）分離時間（年代）（血凝素和神經氨酸酶序號）（血凝素和神經氨酸酶序號） e.g A/Hongkong/1/68（H3N2） A/京科京科/1/56（H1N1）H：hemagglutinin 血凝素血凝素N：neuraminidase 神經氨酸酶神經氨酸酶整理ppt流

18、感病毒的命名方法流感病毒的命名方法2. 動物流感病毒的命名則在型別與分離地點之動物流感病毒的命名則在型別與分離地點之間加上動物宿主名稱間加上動物宿主名稱 e.g 甲甲/馬馬/布拉格布拉格/1/56（H1N1） 三、三、Baltimore 的分類系統的分類系統n以以mRNA為核心：根據病毒的為核心：根據病毒的DNA或或RNA是是與與mRNA互補互補(-）和不互補）和不互補（+) 而將病毒分而將病毒分為為6類。類。II類（+DNA）I類（DNA） mRNAIII類（RNA）V類（-RNA）VI類IV類+RNA整理ppt一一 DNA病毒病毒 （一）單鏈（一）單鏈DNA病毒病毒 細小病毒科（細小病毒科

19、（Parvoviridae)：豬細小病毒（豬細小病毒（PPV） 圓環(huán)病毒科（圓環(huán)病毒科（Circoviridae) ：豬圓環(huán)病毒（豬圓環(huán)病毒（PCV）四、動物病毒的分類現狀四、動物病毒的分類現狀整理ppt（二）二） 雙鏈雙鏈DNA病毒病毒 痘病毒科（痘病毒科（Poxviridae)：痘苗病毒、天花病毒痘苗病毒、天花病毒 皰疹病毒科（皰疹病毒科（Herpesviridae)：偽狂犬病病毒偽狂犬病病毒（PRV）、）、馬立克氏病病毒（馬立克氏病病毒（MDV）、）、雞傳染性雞傳染性喉氣管炎病毒（喉氣管炎病毒（ILTV）、）、鴨瘟病毒（鴨瘟病毒（DPV）、）、牛牛傳染性鼻氣管炎病毒（傳染性鼻氣管炎病毒（

20、IBRV） 腺病毒科（腺病毒科（Adenoviridae)：減蛋綜合癥病毒減蛋綜合癥病毒（EDS76） 整理ppt 乳多空病毒科（乳多空病毒科（Papovaviridae)：猴空泡病猴空泡病毒毒40(SV40) 非洲豬瘟病毒科（非洲豬瘟病毒科（Asfarviridae)：非洲豬瘟非洲豬瘟病毒病毒 嗜肝嗜肝DNA病毒科（病毒科（Hepadnaviridae)：人乙人乙型肝炎病毒（型肝炎病毒（HBV） 虹彩病毒科（虹彩病毒科（Iridoviridae)： 桿狀病毒科（桿狀病毒科（Baculoviridae)：整理ppt二二 RNA反轉錄病毒反轉錄病毒 反轉錄病毒科（反轉錄病毒科（Retroviri

21、dae)：馬傳馬傳染性貧血病毒（染性貧血病毒（EIAV）、）、人免疫缺陷病人免疫缺陷病病毒（病毒（HIV）整理ppt三三 RNA病毒病毒 （一）雙股（一）雙股RNA病毒病毒 呼腸孤病毒科（呼腸孤病毒科（Reoviridae)：藍舌病病藍舌病病毒（毒（BTV）、）、輪狀病毒輪狀病毒 雙雙RNA病毒科（病毒科（Birnaviridae)：雞傳染雞傳染性法氏囊病病毒（性法氏囊病病毒（IBDV） 整理ppt（二）單股負鏈（二）單股負鏈RNA病毒（不分節(jié)段）病毒（不分節(jié)段） 副粘病毒科（副粘病毒科（Paramyxoviridae)：新城疫病毒新城疫病毒（NDV） 彈狀病毒科（彈狀病毒科（Rhabdoviridae)：狂犬病病毒狂犬病病毒（RV）、）、水皰性口炎病毒（水皰性口炎病毒（VSV） 絲狀病毒科（絲狀病毒科（Filoviridae)：埃博拉病毒（埃博拉病毒（EBV）整理ppt(三）單股負鏈三）單股負鏈RNA病毒（分節(jié)段）病毒（分節(jié)段） 正粘病毒科（正粘病毒科（O