PubMed使用方法

1、PubMed使用方法暨南大學(xué)圖書館咨詢部 張春曉內(nèi)容綱要n一、PubMed及NCBI相關(guān)數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介n二、PubMed數(shù)據(jù)范圍三、PubMed主頁的結(jié)構(gòu)n四、PubMed檢索方法以及檢索結(jié)果的處理n五、PubMed CentralPubMed及相關(guān)數(shù)據(jù)庫介紹nNCBI(National Center for Biotechnology Information，美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心)nNCBI是目前國(guó)際上幾個(gè)重要分子生物信息網(wǎng)站之一，其成立的原因是為已故的參議院議員Claude Pepper發(fā)現(xiàn)計(jì)算信息處理方法對(duì)生物醫(yī)學(xué)研究的重要性，因此，在1988年11月4日成立NCBI。NCBI是Nati

2、onal Institutes of Health（NIH）底下的National Library of Medicine（NLM）的部門之一。由于NLM具有建立與維護(hù)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫經(jīng)驗(yàn)，且因它是NIH的單位，因此可執(zhí)行計(jì)算分子生物計(jì)劃。NIH目前是全世界最大的生物醫(yī)學(xué)研究單位。 nNCBI成立的主要任務(wù)為：n提供生物醫(yī)學(xué)的分析與計(jì)算工具，協(xié)助研究人員了解生物的語言-DNA在健康與疾病中所扮演的角色n發(fā)展新技術(shù)協(xié)助了解調(diào)控健康與疾病的基本分子與遺傳過程， 包括建立儲(chǔ)存與分析分子生物、生化與遺傳學(xué)知識(shí)的自動(dòng)系統(tǒng)；促 進(jìn)研究與醫(yī)學(xué)社群使用數(shù)據(jù)庫與軟件；協(xié)調(diào)生物技術(shù)信息的傳遞與 管理；執(zhí)行以計(jì)算機(jī)為

3、基礎(chǔ)的進(jìn)階信息分析過程，用以分析生物重要分子的結(jié)構(gòu)與功能。nNCBI的組織架構(gòu)n NCBI主要分為三個(gè)部門，分別為：Computational Biology Branch （CBB）、Information Engineering Branch（IEB）與Information Resources Branch（IRB），各部門分別具有不同的任務(wù)。NCBI的組織架構(gòu)nComputational Biology Branch（CBB）n處理運(yùn)算、數(shù)學(xué)及分子生物、生物與遺傳學(xué)理論問題的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究，包括基因體分析、序列比對(duì)、序列搜尋方法、巨分子結(jié)構(gòu)、動(dòng)力學(xué)與交互作用、結(jié)構(gòu)/功能預(yù)測(cè)等。n建立N

4、IH實(shí)驗(yàn)室、政府機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)單位與產(chǎn)業(yè)界之生物學(xué)家、化學(xué)家、數(shù)學(xué)家與計(jì)算機(jī)科學(xué)家間的計(jì)算分子生物合作研究計(jì)劃。n提供研究分子生物分析工具的咨詢與建議。n與分子生物社群互動(dòng)，利用計(jì)算與理論方法提高實(shí)驗(yàn)研究質(zhì)量。NCBI的組織架構(gòu)nInformation Engineering Branch（IEB）n進(jìn)行數(shù)據(jù)表現(xiàn)與分析的應(yīng)用研究，包括在分子生物、遺傳學(xué)與生物化學(xué)的計(jì)算機(jī)儲(chǔ)存、管理與檢索系統(tǒng)。n設(shè)計(jì)各種呈現(xiàn)分子生物信息的數(shù)據(jù)庫架構(gòu)與規(guī)格書，包括核酸、蛋白質(zhì)與結(jié)構(gòu)信息。n設(shè)計(jì)與發(fā)展分布式軟件系統(tǒng)，提供研究人員本機(jī)與遠(yuǎn)程的計(jì)算服務(wù)。n 協(xié)調(diào)公開序列、遺傳、結(jié)構(gòu)、目錄信息，建立管理與整合數(shù)據(jù)庫或連結(jié)至外部

5、數(shù)據(jù)庫。n 建立NIH內(nèi)部與外部學(xué)術(shù)單位的信息學(xué)合作研究計(jì)劃。n提供軟件與數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)咨詢與建議。n發(fā)展與提倡數(shù)據(jù)庫、數(shù)據(jù)交換與生物命名的標(biāo)準(zhǔn)。NCBI的組織架構(gòu)nInformation Resources Branch（IRB）n計(jì)劃、監(jiān)督與管理NCBI的計(jì)算機(jī)技術(shù)操作，包含用來研究、發(fā)展與存取公開數(shù)據(jù)庫的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)。n提供NCBI人員與外來使用者技術(shù)支持。n提供NCBI服務(wù)之網(wǎng)絡(luò)操作指導(dǎo)。n規(guī)劃使用NCBI資源的教育訓(xùn)練與研討會(huì)。n計(jì)劃、發(fā)展與管理政府合約與合作協(xié)議書，已獲得支持NCBI信息n功能的設(shè)備與服務(wù)。n作為基因體計(jì)劃使用者與服務(wù)辦事處之聯(lián)絡(luò)人。n執(zhí)行應(yīng)用研究與發(fā)展，提供技術(shù)支持與指

6、導(dǎo)，鑒定使用者需求；n 管理生物使用社群之問卷調(diào)查，以評(píng)估NCBI發(fā)展的軟件使用情形。n協(xié)調(diào)政府其它辦事處與生物信息資源，促進(jìn)NCBI數(shù)據(jù)儲(chǔ)存的發(fā)展。NCBI的組織架構(gòu)nNCBI還有一個(gè)跨多學(xué)科的基礎(chǔ)研究群，組成人員包括計(jì)算機(jī)科學(xué)家、分子生物學(xué)家、數(shù)學(xué)家、生化學(xué)家與物理學(xué)家，共同致力于計(jì)算分子生物的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究。他們一起研究利用數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)方法解決分子層面的基本生物醫(yī)學(xué)問題，這些問題包含了基因結(jié)構(gòu)偵測(cè)與分析、序列分析、立體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、重復(fù)序列類型（Pattern）、建立基因體圖譜、HIV感染動(dòng)力學(xué)的數(shù)學(xué)模型、分析序列錯(cuò)誤對(duì)數(shù)據(jù)庫搜尋的影響、發(fā)展數(shù)據(jù)庫搜尋與多重序列比對(duì)的新算法、建立無重復(fù)的序列

7、數(shù)據(jù)庫、使用數(shù)學(xué)模型評(píng)估序列相似性在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的重要性、建立文章檢索的載體（Vector）模型等。除此之外，這些研究人員尚與NIH的研究單位、學(xué)術(shù)單位的研究實(shí)驗(yàn)室與政府機(jī)構(gòu)的研究實(shí)驗(yàn)室間維持合作關(guān)系，目前仍有多項(xiàng)研究計(jì)劃正在進(jìn)行當(dāng)中。NCBI資源nNCBI目前提供的生物信息資源主要分為n生物數(shù)據(jù)庫n生物信息工具NCBI資源n生物數(shù)據(jù)庫n生物數(shù)據(jù)庫是一個(gè)永久數(shù)據(jù)的大的組織體，通常結(jié)合計(jì)算機(jī)軟件執(zhí)行更新、查詢與存取數(shù)據(jù)的功能。對(duì)于研究人員而言，數(shù)據(jù)庫必須符合：容易取得信息以及只取得回答特殊生物問題的信息兩項(xiàng)功能。nNCBI的數(shù)據(jù)庫搜尋與存取系統(tǒng)-Entrez，可用來獲取單一數(shù)據(jù)庫或許多數(shù)據(jù)庫的整合數(shù)

8、據(jù)。例如Entrez蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫除了可查詢蛋白質(zhì)信息，同時(shí)亦可連結(jié)到生物分類數(shù)據(jù)庫查詢生物分類信息。目前，NCBI提供的公開（Open Access）數(shù)據(jù)庫包括如下：Entrez以及BLASTnEntrez是NCBI的為用戶提供整合的訪問序列，定位，分類，和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的搜索和檢索系統(tǒng)。Entrez同時(shí)也提供序列和染色體圖譜的圖形視圖。Entrez是一個(gè)用以整合NCBI數(shù)據(jù)庫中信息的搜尋和檢索工具。這些數(shù)據(jù)庫包括核酸序列，蛋白序列，大分子結(jié)構(gòu)，全基因組，和通過PubMed檢索的MEDLINE。Entrez的一個(gè)強(qiáng)大和獨(dú)特的特點(diǎn)是檢索相關(guān)的序列，結(jié)構(gòu)，和參考文獻(xiàn)的能力。雜志文獻(xiàn)通過PubMed獲得，

9、PubMed是一個(gè)網(wǎng)絡(luò)搜索界面，可以提供對(duì)在MEDLINE上的九百萬雜志引用的訪問，包含了鏈接到參與的出版商網(wǎng)絡(luò)站點(diǎn)的全文文章。 nBLAST是一個(gè)NCBI開發(fā)的序列相似搜索程序，還可作為鑒別基因和遺傳特點(diǎn)的手段。BLAST能夠在小于15秒的時(shí)間內(nèi)對(duì)整個(gè)DNA數(shù)據(jù)庫執(zhí)行序列搜索。NCBI提供的附加的軟件工具有：開放閱讀框?qū)ひ捚鳎∣RF Finder），電子PCR，和序列提交工具，Sequin和BankIt。所有的NCBI數(shù)據(jù)庫和軟件工具可以從WWW或FTP來獲得。NCBI還有E-mail服務(wù)器，提供用文本搜索或序列相似搜索訪問數(shù)據(jù)庫一種可選方法。Entrez可以檢索的數(shù)據(jù)庫nBooks 出版社

10、提供之?dāng)?shù)字生醫(yī)圖書與醫(yī)生參考書籍?dāng)?shù)據(jù)庫nCancer Chromosomes 美國(guó)國(guó)立癌癥研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer數(shù)據(jù)庫里已經(jīng)整合好的cytogenetic、臨床與文獻(xiàn)相關(guān)數(shù)據(jù)nConserved Domain Database（CDD），蛋白質(zhì)功能區(qū)塊保留序列數(shù)據(jù)庫n3D Domains，蛋白質(zhì)功能區(qū)塊立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)nGene，包含許多物種的基因數(shù)據(jù)庫nGenome，包含超過800種物種的基因組數(shù)據(jù)庫nGENSAT，小鼠中樞神經(jīng)系統(tǒng)基因表現(xiàn)圖譜nGEO Datasets，基因表現(xiàn)實(shí)驗(yàn)與生物芯片數(shù)值結(jié)果數(shù)據(jù)

11、nGEO Profiles，基因表現(xiàn)圖譜nHomoloGene，同源基因批注數(shù)據(jù)庫nJournals，期刊文獻(xiàn)（包含PubMed）nMeSH，醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)索引字符串nNCBI Web Site，所有NCBI網(wǎng)頁nNLM Catalog，美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館館藏書目、期刊、視聽數(shù)據(jù)目錄nNucleotide sequence database，核酸序列數(shù)據(jù)庫（包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列數(shù)據(jù)庫）Entrez可以檢索的數(shù)據(jù)庫nOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人類遺傳疾病相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫nPopSet，族群演化分析相關(guān)研究資料nPr

12、otein sequence database，蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫（包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等數(shù)據(jù)庫與從GenBank、RefSeq核酸序列轉(zhuǎn)譯之蛋白質(zhì)序列資料）nPubChem BioAssay，化學(xué)成分之生物活性篩選資料nPubChem Compound，小分子化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)nPubChem Substance，具生物活性之化學(xué)物質(zhì)篩選數(shù)據(jù)nPubMed，科學(xué)文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫nPubMed Central，科學(xué)文獻(xiàn)數(shù)字全文數(shù)據(jù)庫nSite Search，可搜尋NCBI的網(wǎng)頁與FTPnSNP，單點(diǎn)核酸多樣性數(shù)據(jù)庫(dbSNP)nStructure，分子模型數(shù)據(jù)(MMDB)

13、nTaxonomy，以核酸或蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的分類學(xué)信息nUniGene，人類unique基因序列數(shù)據(jù)庫nUniSTS，unique序列卷標(biāo)地址數(shù)據(jù)庫PubMed數(shù)據(jù)范圍n數(shù)據(jù)類型：期刊論文、綜述、以及與其他數(shù)據(jù)資源鏈接。n特點(diǎn)：n免費(fèi)提供題錄和文摘n提供與原文的網(wǎng)址鏈接(部分免費(fèi)獲?。?n提供檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配n操作簡(jiǎn)便、快捷PubMed數(shù)據(jù)范圍nMEDLINEn4800余種生物醫(yī)學(xué)期刊，內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理、牙科、獸醫(yī)、健康保健系統(tǒng)、前臨床醫(yī)學(xué)等學(xué)科。這些期刊來源于美國(guó)和世界上70多個(gè)國(guó)家和地區(qū)。n文獻(xiàn)量達(dá)1千2百多萬條記錄，并回溯到1966年。n記錄中用indexed for MEDLINE標(biāo)

14、記表示注 截止2006年3月15日PubMed公布的數(shù)據(jù)nIn process citationn提供MEDLINE尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。n獲MeSH詞后，再加入MEDLINE。n記錄中用in process標(biāo)記表示。nPublisher Supplied Citationsn出版商直接向PubMed提供電子記錄n包括MEDLINE未收錄的部分記錄n記錄中用PubMed-as supplied by publisher標(biāo)記表示。nOldMedlinen1950-1965年間發(fā)表的200多萬篇文獻(xiàn)n沒有MeSH字段和摘要n記錄中用PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966標(biāo)記表示

15、。nPubMed not MedlinenPubMed 收錄Medline不收錄的文獻(xiàn)。n記錄中用PubMed標(biāo)記表示。PubMed與MEDLINE的區(qū)別n收錄范圍廣：nMEDLINE收錄的部分生命科學(xué)相關(guān)文章的非醫(yī)學(xué)專業(yè)期刊（物理、天文、化學(xué)等）n收錄記錄新：n在MEDLINE數(shù)據(jù)標(biāo)引前的最新題錄n文獻(xiàn)類型全：n提供電子原文鏈接（部分免費(fèi)）基本檢索輸入框特征欄提供輔助檢索功能側(cè)欄提供其他檢索如期刊數(shù)據(jù)庫檢索、規(guī)范詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻(xiàn)檢索執(zhí)行檢索PubMed主頁主頁P(yáng)ubMed 基本檢索規(guī)則n在檢索欄中輸入:n一個(gè)或多個(gè)檢索詞(系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索）如：placenta growth o

16、xygen genbacev on著者姓名,姓在前,名首字母在后。如: smith abn刊名輸全稱或MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式 如：clin exp immunoln布爾邏輯運(yùn)算式： (運(yùn)算符須大寫） 如 ：Stem ti AND neuroscience多個(gè)檢索詞輸入Moore AM撰寫的有關(guān)接觸性皮炎的文章刊名的輸入（字段限定來源出SO）著者檢索moore amau檢索提問輸入僅檢索有文摘的文獻(xiàn)PubMed 基本檢索規(guī)則n截詞檢索：treat*n強(qiáng)迫短語檢索：“brca 1”（不再自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索）PubMed 基本檢索規(guī)則n自動(dòng)轉(zhuǎn)換檢索詞（automatic term ma

17、pping）n自動(dòng)對(duì)照規(guī)范詞表,期刊名表，短語，著者名索引, 依次尋找轉(zhuǎn)n短語尋找轉(zhuǎn)換n單詞轉(zhuǎn)換單詞在上述四個(gè)字段尋找轉(zhuǎn)換在所有字段中轉(zhuǎn)換n如：輸入stemti AND neurosciencenDetails顯示： stemti AND (neurosciencesTIAB NOT MedlineSB) OR neurosciencesMeSH Terms OR neuroscienceText Word)n自動(dòng)擴(kuò)展檢索n系統(tǒng)自動(dòng)對(duì)主題詞、副主題詞進(jìn)行擴(kuò)展檢索，如：輸入“hypertension therapy,系統(tǒng)自動(dòng)將高血壓的藥物治療、飲食療法，PubMed的輔助檢索nLimits（檢索

18、限制選擇）n字段限制：著者、刊名、篇名、濾過（filter原文收藏處）等n數(shù)據(jù)輸入時(shí)間：默認(rèn)檢索可回溯到1950年，限制選擇30天-10年n7種文獻(xiàn)類型限制n7種語種限制n12種子文檔：(01年新增2種Space Life Sciences and Bioethics ）編制檢索式n主題詞型n哮喘的藥物治療（asthma, drug therapy） asthma/drug therapyn手損傷的治療（hand injuries, surgery, therapy） hand injuries/surgery OR hand injuries/therapyn阿司匹林治療心肌梗死（aspir

19、in, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapy）aspirin/therapeutic use ANDmyocardial infarction/drug therapyn混合型n檢索舌根腫瘤的病理學(xué)(tongue neoplasms, pathology, tongue base, base of the tongue)tongue neoplasms/pathology AND (“tongue base” OR “base of the tongue”)編制檢索式編制檢索式n字段限制查找聞?dòng)衩方淌诘奈墨I(xiàn)Wen ymau查找

20、 Jhon Adorn Williams 撰寫的文章Williams JAAU查找英語綜述文獻(xiàn)englishla AND reviewptPubMed記錄字段說明文摘文摘第一著者單位地址第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識(shí)別號(hào)出版商提供文獻(xiàn)識(shí)別號(hào)著者群著者群版權(quán)說明版權(quán)說明參考評(píng)論文獻(xiàn)參考評(píng)論文獻(xiàn)合著者合著者文獻(xiàn)參考評(píng)論文獻(xiàn)參考評(píng)論定稿版定稿版校樣版校樣版輸入日期輸入日期輸入完成日期輸入完成日期電子出版日期電子出版日期電子出版日期電子出版日期文獻(xiàn)出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入數(shù)據(jù)加入PubMed日期日期文獻(xiàn)勘誤文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部著者姓名全部調(diào)研者姓名全部調(diào)研者姓名作為文

21、章主題的著者全稱作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號(hào)基金編號(hào)基因符號(hào)基因符號(hào)期編號(hào)期編號(hào)資助調(diào)研者資助調(diào)研者資助調(diào)研單位資助調(diào)研單位國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)美國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館識(shí)別號(hào)美國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館識(shí)別號(hào)期刊全稱期刊全稱最后修訂日期最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識(shí)別號(hào)題錄提供機(jī)構(gòu)的識(shí)別號(hào)病史相關(guān)與原始記錄病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時(shí)間出版商提供數(shù)據(jù)時(shí)間期刊出版國(guó)期刊出版國(guó)數(shù)

22、據(jù)庫文獻(xiàn)編號(hào)數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號(hào)作為主題詞的個(gè)人姓名作為主題詞的個(gè)人姓名出版狀態(tài)出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)類型出版模式（紙張或電子）出版模式（紙張或電子） 參考文獻(xiàn)數(shù)參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章修訂和再版的文章子專題文檔子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號(hào)分子序列訪問號(hào)原文來源原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼作者限定作者限定添加作者姓名輸入框添加作者姓名輸入框清除限定清除限定期刊限定期刊限定作者姓名

23、索引選詞作者姓名索引選詞多作者邏輯多作者邏輯匹配選項(xiàng)匹配選項(xiàng)全文、免費(fèi)全文、摘要限全文、免費(fèi)全文、摘要限定定日期限定日期限定出版日期限定出版日期限定入庫日期限定入庫日期限定研究對(duì)象研究對(duì)象人人/動(dòng)物限定動(dòng)物限定研究對(duì)象性別限定研究對(duì)象性別限定語種限定語種限定子文檔限定子文檔限定文獻(xiàn)類型限定文獻(xiàn)類型限定研究對(duì)象年齡限定研究對(duì)象年齡限定檢索字段限定檢索字段限定執(zhí)行檢索執(zhí)行檢索清除所有限定清除所有限定Previw/index（檢索策略預(yù)覽）n瀏覽檢索式n改變檢索式n（可用檢索式編號(hào)#1 OR #2）n瀏覽索引（index）檢索預(yù)覽檢索預(yù)覽檢索歷史檢索歷史索引加詞檢索索引加詞檢索Index（索引字順表

24、）n選擇限制字段n輸入檢索詞（詞根）n在字順表中選擇檢索詞n選用邏輯算符建立檢索式n點(diǎn)擊GO步驟步驟3 索引選詞索引選詞步驟步驟4 確定與檢索欄中確定與檢索欄中檢索提問的邏輯關(guān)系檢索提問的邏輯關(guān)系步驟步驟2 輸入待選詞輸入待選詞步驟步驟1 點(diǎn)擊預(yù)覽和索引點(diǎn)擊預(yù)覽和索引History（檢索史）n檢索式回顧n編輯檢索式n如#3 AND child檢索歷史回顧檢索式檢索時(shí)間檢出篇數(shù)檢索式編號(hào)可替代檢索式進(jìn)行輸入檢索如：#5 AND #6Details （匹配過程）n顯示檢索詞轉(zhuǎn)換匹配運(yùn)算詳細(xì)過程n用途：轉(zhuǎn)換、確定規(guī)范詞n如：liver cancer - liver neoplasmsn修改檢索策略檢

25、索明細(xì)檢索明細(xì)數(shù)據(jù)庫匹配過程數(shù)據(jù)庫匹配過程檢索詞轉(zhuǎn)換檢索詞轉(zhuǎn)換顯示用戶輸入的檢索式顯示用戶輸入的檢索式數(shù)據(jù)庫匹配過程詞轉(zhuǎn)換你輸入的檢索式修改檢索策略n檢索框中隨時(shí)修改n“Limit” 、 “Preview/index”、 “History”、 “Details”功能實(shí)現(xiàn)。四.其他檢索nMesh Databasen功能：n確定規(guī)范檢索詞n查看詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表n副主題詞、擴(kuò)展、主要主題詞n 例：欲查腎衰竭的飲食療法相關(guān)文獻(xiàn)？基本檢索腎衰竭的飲食療法結(jié)果中有些主要內(nèi)容并非腎衰竭M(jìn)eSH Database 規(guī)范主題詞數(shù)據(jù)庫檢索規(guī)范主題詞數(shù)據(jù)庫檢索腎衰竭飲食療法課題腎衰竭飲食療法課題1.輸入檢索詞輸

26、入檢索詞3.點(diǎn)按規(guī)范詞可獲詳細(xì)注解點(diǎn)按規(guī)范詞可獲詳細(xì)注解2.執(zhí)行瀏覽執(zhí)行瀏覽主題詞注釋主題詞注釋可選副主題詞可選副主題詞限定作為限定作為主要主題主要主題詞匹配詞匹配不進(jìn)行下位詞擴(kuò)檢不進(jìn)行下位詞擴(kuò)檢該主題詞所替代的該主題詞所替代的非規(guī)范詞形式非規(guī)范詞形式主題詞樹形結(jié)構(gòu)主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的表：顯示該詞的學(xué)科隸屬關(guān)系學(xué)科隸屬關(guān)系通過通過MeSH Database檢索的結(jié)果，其中檢索的結(jié)果，其中41篇綜述文獻(xiàn)篇綜述文獻(xiàn)檢出結(jié)果更為專指n例：從主題途徑查找例：從主題途徑查找FK506副作用和腎移植的副作用和腎移植的文獻(xiàn)（限定條件：文獻(xiàn)（限定條件：n1年，人類，英語）年，人類，英語）n檢索流程檢索

27、流程n第一步：主題分析第一步：主題分析 英文轉(zhuǎn)換英文轉(zhuǎn)換nFK506 adverse effectsnkidney transplantation點(diǎn)擊點(diǎn)擊MeSH Database Mesh界面界面 依次輸入檢索詞依次輸入檢索詞 goMeSH Database FK506第二步：第二步：選定該主題詞選定該主題詞 主題詞輪排表主題詞輪排表點(diǎn)擊該主題詞點(diǎn)擊該主題詞 主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏 主題詞輪排主題詞輪排提示相關(guān)詞提示相關(guān)詞主題詞輪排表主題詞輪排表第三步：第三步：主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏（主題詞詞義注釋、副主題詞、主題詞詞義注釋、副主題詞、加權(quán)或不擴(kuò)展、入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)）加權(quán)或不擴(kuò)展

28、、入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)） 選擇合適的副主題詞選擇合適的副主題詞選擇加權(quán)或不擴(kuò)展選擇加權(quán)或不擴(kuò)展 send to 主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞詞義注釋主題詞詞義注釋主題詞細(xì)節(jié)屏主題詞細(xì)節(jié)屏副主題詞選擇副主題詞選擇主題詞詞義注釋主題詞詞義注釋加權(quán)檢索加權(quán)檢索不擴(kuò)展檢索不擴(kuò)展檢索p175曾用詞曾用詞藥理作用藥理作用樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)曾用詞曾用詞入口詞入口詞樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)藥理作用藥理作用 選擇組配方式選擇組配方式Search Box with ANDSearch Box with ORSearch Box with NOT 第四步：第四步：search box 點(diǎn)擊點(diǎn)擊 search PubMe

29、d 檢索結(jié)果檢索結(jié)果search boxTacrolimus / adverse effectsMeSH1194篇篇1251篇篇題錄格式界面題錄格式界面BMJ 2005 Mar 5 ; 330(7490) : 516文摘格式文摘格式Free full textAbstractMethodsResultsDiscussion第五步：第五步：Limits 選擇限定條件選擇限定條件 （字段、文獻(xiàn)類型、年齡、時(shí)間、（字段、文獻(xiàn)類型、年齡、時(shí)間、語種、人類或動(dòng)物、性別）語種、人類或動(dòng)物、性別） 檢索結(jié)果檢索結(jié)果邏輯組配邏輯組配 (#7 AND #10)19篇篇n Pubmed主題詞檢索的功能：主題詞檢索

30、的功能：n理解詞義和收入詞表的時(shí)間理解詞義和收入詞表的時(shí)間n限定副主題詞限定副主題詞 ，提高查準(zhǔn)率。，提高查準(zhǔn)率。 n加權(quán)檢索，提高查準(zhǔn)率。加權(quán)檢索，提高查準(zhǔn)率。n了解樹形結(jié)構(gòu)了解樹形結(jié)構(gòu),擴(kuò)展檢索，提高查全率擴(kuò)展檢索，提高查全率n了解同義詞，提高查全率。了解同義詞，提高查全率。n引文匹配器（Citation Matcher）n輸入題錄信息，查找特定文獻(xiàn)進(jìn)行補(bǔ)缺。n刊名要準(zhǔn)確，縮寫要標(biāo)準(zhǔn)n著者姓名大小寫不敏感n如查找：Taiwan I Hsueh Hui Chih由Chang PY（taiwan yi xue hui za zhi ) 撰寫、 1975 發(fā)表文獻(xiàn)的其他著者輸入待檢刊名輸入待檢第

31、一著者特定文獻(xiàn)查找（已知文獻(xiàn)第一著者，欲查其他信息如其他著者等得出其他著者n期刊數(shù)據(jù)庫（Journal database）n通過輸入刊名、縮寫名、等瀏覽期刊文獻(xiàn)。n提供電子原文的超鏈鍵。期刊數(shù)據(jù)庫檢索查找刊名中包含查找刊名中包含immunology的期刊的期刊p178110種種111種種輸入輸入Med Pediatr Oncol刊名簡(jiǎn)稱，刊名簡(jiǎn)稱，了解其全稱了解其全稱及其出版情況及其出版情況。查找查找Med Pediatr Oncol全稱全稱Medical and Pediatric Oncology創(chuàng)刊時(shí)間創(chuàng)刊時(shí)間 1975p179瀏覽全部期刊列表瀏覽全部期刊列表 點(diǎn)擊屏幕中部的點(diǎn)擊屏幕中部

32、的links to full-text web sites，可獲得可獲得PubMed收錄的全部期刊列表，按英文字收錄的全部期刊列表，按英文字母順排列。依據(jù)此列表可以了解母順排列。依據(jù)此列表可以了解Pubmed的收刊的收刊情況以及錄入這些期刊的電子出版商的網(wǎng)址。情況以及錄入這些期刊的電子出版商的網(wǎng)址。 提供電子原文的超鏈鍵。提供電子原文的超鏈鍵。瀏覽全部期刊列表瀏覽全部期刊列表241 providers,5300 journals2006.10.6期刊出版商期刊出版商CSIROEBSCOHighWire PressInfotrieveOvid TechnologiesProQuestSciencep180EBSCOHighWire pressInfotrieveOvid提供電子原文的超鏈鍵提供電子原文的超鏈鍵n臨床問題（Clinical Queries)n專門檢索臨床研究方法學(xué)（循證醫(yī)學(xué)）