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文檔簡介
1、2014年生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)B實(shí)驗(yàn)報告 姓 名: 姓名 學(xué) 號: 201247044 實(shí)驗(yàn)時間: 2014.11.15 實(shí)驗(yàn)分組: 第七組 組內(nèi)成員: 組員 201247002 組員 201247020 組員 201247060 任課教師: 李曉暉 小牛腸堿性磷酸酶的提取及酶活測定考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)含量SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量組員1,組員2,組員3,組員4化工與環(huán)境生命學(xué)部 化工學(xué)院 化學(xué)工程與工藝(國際)1201班摘要 本文以從小牛腸中提取堿性磷酸酶為例,介紹了生物體中分離、提取酶的方法,以及如何使用考馬斯亮藍(lán)法測定所提取酶的蛋白含量并以此得出酶活。同時通過SDS-聚丙
2、烯酰胺凝膠電泳來測定給定蛋白質(zhì)樣品的相對分子質(zhì)量。關(guān)鍵詞 小牛腸堿性磷酸酶 酶活 對硝基苯酚 吸光值 考馬斯亮藍(lán)R-250 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳 蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量堿性磷酸酶(AKP,EC 3.1.3.1)是一種非特異性水解酶,廣泛存在于動物各臟器、微生物和植物中。它在體外能催化多種磷酸單脂類化合物的水解,得到相應(yīng)的醇。不同來源的AKP,其分子量和亞基結(jié)構(gòu)各不相同。小牛腸堿性磷酸酶相對分子質(zhì)量為145000,等電點(diǎn)為7.5。在體外可催化底物對硝基苯磷酸二鈉生成對硝基苯酚,后者在405nm光波長下有最大吸收,通過測定吸光值的變化率,即可測定堿性磷酸酶的活力。酶活定義:在最適條件下,以每分鐘
3、催化水解1µmol底物的酶量為一個酶活力單位。本實(shí)驗(yàn)溫度取37。酶活力的計(jì)算: 酶活力(u/mg)=式中,A/min為405nm波長下的吸光值的變化率;VR為反應(yīng)液的體積,D為稀釋倍數(shù);E405為405nm波長下對硝基苯酚的摩爾消光系數(shù),18.3;VE為所加酶液體積;C為蛋白濃度;L為比色皿光程??捡R斯亮藍(lán)R-250測定蛋白質(zhì)含量屬于染料結(jié)合法的一種??捡R斯亮藍(lán)R-250在酸性溶液中的游離狀態(tài)呈紅褐色,當(dāng)它與蛋白質(zhì)結(jié)合后變?yōu)樗{(lán)色,前者最大吸收波長為465nm,后者為595nm。在一定蛋白濃度范圍內(nèi)(0.01-1.0mg/L),蛋白質(zhì)-色素結(jié)合物在595nm波長下的光吸收與蛋白質(zhì)含量成
4、正比,故可用于蛋白質(zhì)的定量分析。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳是分離、分析蛋白質(zhì)的常用方法,在科研工作中,經(jīng)常需要從凝膠中回收蛋白質(zhì),用于蛋白質(zhì)的測序和制備抗體1。在聚丙烯酰胺凝膠電泳中,凝膠的孔徑,蛋白質(zhì)的電荷、大小、性質(zhì)等因素共同決定了蛋白質(zhì)的電泳遷移率。但如果加入足夠量十二烷基硫酸鈉(SDS)和巰基乙醇,SDS就可以使蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵還原,蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物帶上相同密度的負(fù)電荷,并可引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變,使蛋白質(zhì)在凝膠中的遷移率,不再受蛋白質(zhì)原的電荷和形狀的影響,而取決于相對分子量的大小,因此聚丙烯酰胺凝膠電泳可以用于測定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量。SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳大多在不連續(xù)系統(tǒng)中進(jìn)
5、行,其電泳槽緩沖液的pH與離子強(qiáng)度不同于配膠緩沖液。該凝膠包括濃縮膠和分離膠兩部分。當(dāng)兩電極間接通電流后,凝膠中形成移動界面,并帶動加入凝膠的樣品的SDS多肽復(fù)合物向前推進(jìn)。樣品通過高度多孔性的濃縮膠后,復(fù)合物在分離膠表面聚集成一條很薄的區(qū)帶(或稱積層)。由于不連續(xù)緩沖系統(tǒng)具有把樣品中的復(fù)合物全部濃縮于極小體積的能力,從而大大提高了SDS聚丙烯酰胺凝膠的分辨率,使蛋白依各自的大小得到分離。由于SDS和巰基乙醇的作用,蛋白質(zhì)完全變形和解聚,解離成亞甲基或單個肽鏈,因此測定的結(jié)果只是亞基或單條肽鏈的分子質(zhì)量。1 實(shí)驗(yàn)部分1.1 試劑與儀器(1)試劑 正丁醇、丙酮(置-20冰箱保存)。 1mol/L
6、乙酸(CH3COOH),1mol/L NaOH,硫酸銨,對硝基苯磷酸二鈉,二乙醇胺,鹽酸。 平衡緩沖液:0.01mol/L Tris-HCl,pH8.0,含1.0×10-3mol/L MgCl2和1.0×10-5mol/L ZnCl2。 底物緩沖液:1mol/L二乙醇胺-鹽酸緩沖液(pH9.8),含1.0×10-3mol/L MgCl2。 酶的底物溶液:用底物緩沖液配制15×10-3mol/L對硝基苯磷酸二鈉溶液。 考馬斯亮藍(lán)G-250溶液。 30%丙烯酰胺。 分離膠緩沖液(1.5mol/L Tris-HCl緩沖液(pH8.8),已加入10% SDS)、
7、濃縮膠緩沖液(0.5mol/L Tris-HCl緩沖液(pH6.8),已加入10% SDS) 10%過硫酸銨(AP)、TEMED(四甲基乙二胺) 上樣緩沖液(稱100mg SDS,2mg溴酚藍(lán),2g甘油,加0.1mL巰基乙醇,2ml 0.05mol/L pH8.0 Tris-HCl,加超純水定容至10mL)、染色液(配制含0.1%考馬斯亮藍(lán)R250,體積分?jǐn)?shù)40%甲醇,體積分?jǐn)?shù)10%冰醋酸的染色液500mL,過濾后備用)、脫色液(500mL體積分?jǐn)?shù)10%甲醇和體積分?jǐn)?shù)10%冰醋酸的脫色液1000mL)、電泳緩沖液(含0.1% SDS,0.05mol/L Tris,0.384mol/L甘氨酸pH
8、8.3)。(2)儀器及耗材 離心管,剪刀,載玻片,冰凍離心機(jī),濾布,量筒,燒杯,移液槍,試管,制膠板,染色缸,所需儀器見下表。使用儀器生產(chǎn)廠家DYY-2C型電泳儀北京市六一儀器廠JYL-350A料理機(jī)九陽股份有限公司W(wǎng)D-9405A型脫色搖床沃德生物醫(yī)學(xué)儀器公司電熱恒溫水浴鍋HWS-12上海一恒科技有限公司UV762紫外可見分光光度計(jì)上海精密科學(xué)儀器有限公司電子天平北京醫(yī)用天平廠 1.2 實(shí)驗(yàn)過程(一)小牛腸堿性磷酸酶的提取與酶活測定 (1) 酶的分離 取新鮮小牛腸,用剪刀縱向剖開,用載玻片將腸黏膜刮下,加入勻漿機(jī)中高速勻漿15s,重復(fù)二十次。 用量筒量體積后放入燒杯中,加入1.5體積的蒸餾水
9、,搖勻。 緩緩加入1倍體積的冰冷正丁醇,搖勻,將勻漿倒入離心管中,配平,4、10000r/min離心15min。 取下層水相,用濾布過濾除雜質(zhì),把清液倒入分液漏斗靜置取下層清液,然后用1mol/L HAc調(diào)pH到4.9,4下10000r/min離心10min。 取上清(12.9mL),用1mol/L NaOH調(diào)pH至6.5,加入5%的硫酸銨0.6455g,搖勻至溶解后,再加入0.47倍體積(6.1mL)的冰冷丙酮,混勻,4放置41min。 4、10000r/min離心10min,除去沉淀,向上清液(18.5mL)中加入1.07倍體積(19.8mL)的冰冷丙酮,4放置31min。 4、10000
10、r/min離心10min,保留沉淀,逐漸加入平衡緩沖液,使沉淀剛好完全溶。(2)酶活力的測定 取150µL酶的底物溶液,置于37水浴中10min; 用平衡緩沖溶液將酶液稀釋10倍(10µL酶溶液稀釋至100µL); 取兩個2mL(0.5光程)比色皿,各加入1.5mL底物緩沖液,放入分光光度計(jì)中校對歸零; 取出其中一個加入20µL稀釋后的酶液,迅速搖勻,放回分光光度計(jì)中,測定酶動力學(xué)曲線,讀出吸光值的變化率。(二)考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)含量 玻璃試管中加入5ml考馬斯亮藍(lán)。 在1.5ml離心管中,取實(shí)驗(yàn)一(1)中的酶液10µL分別稀釋25、50、
11、100倍。 各取100µl加入到5ml考馬斯亮藍(lán)試管中,混勻,反應(yīng)5min以上(觀察溶液至淺藍(lán)色)。 紫外分光光度計(jì)檢測條件:595nm波長; 取2個比色皿(1cm光程),加入考馬斯亮藍(lán)(比色皿的2/3),分光光度計(jì)中校對歸零。將樣品放入外側(cè)比色皿中,讀取吸光值(0.1-0.5之間)。根據(jù)蛋白質(zhì)濃度標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算蛋白質(zhì)濃度。(三)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量 (1)裝板:將垂直板型電泳的玻璃片洗凈、晾干;放好膠條,用夾子夾好玻璃板,上面插上梳子,垂直放置在水平臺面上備用。(2)制備分離膠:在小燒杯中按下表配制所需濃度的分離膠。 分離膠配制試劑用量水4.1mL30%丙
12、烯酰胺3.4mL1.5mol/L Tris-HCl緩沖液pH8.82.4mL10%過硫酸銨100µLTEMED10µL 最后加入TEMED,應(yīng)快速搖勻分離膠,向玻璃板間隙,沿著長玻璃板的內(nèi)側(cè)緩緩注膠,然后再用移液槍貼壁慢慢移動注入乙醇200µL,以防止氧氣進(jìn)入膠內(nèi)。15min后,分離膠和乙醇之間出現(xiàn)分界線,表明分離膠凝固,倒出乙醇。 (3)制備濃縮膠:在小燒杯中按下表配制所需濃度的濃縮膠。 濃縮膠配制試劑用量水3.4mL30%丙烯酰胺1.0mL0.5mol/L Tris-HCl緩沖液pH6.81.5mL10%過硫酸銨60µLTEMED8µL 一
13、旦加入TEMED,應(yīng)快速搖勻濃縮膠,在已凝固的分離膠層上加濃縮膠,立即將梳子插入膠液頂部,避免進(jìn)入氣泡,放置待濃縮膠凝固。 (4)蛋白樣品處理:在1.5mL離心管中按1:1體積比加入樣品和上樣緩沖液,100加熱3min使蛋白質(zhì)變性。 (5)27min后,濃縮膠聚合完全,去掉夾子和膠條,拔去梳子,把凝膠玻璃板固定于電泳裝置內(nèi)槽上,加入電泳緩沖液,緩沖液高過玻璃板凹面。 (6)用移液槍在泳道加樣(1-4道為SW混合樣品,7-10道為SB混合樣品,5道為標(biāo)準(zhǔn)樣)。 (7)電泳:連接正負(fù)極,打開電源,開始時,電流控制在40A,樣品進(jìn)入分離膠后,緩慢升高電壓至140V。保持電流強(qiáng)度不變,2.35h后溴酚
14、藍(lán)指示劑遷移至下沿處,停止電泳。 (8)剝膠染色:電泳結(jié)束后,取出凝膠玻璃板,用金屬片從玻璃兩側(cè)輕輕撬開,使板內(nèi)進(jìn)入空氣,同時用水沖洗,取出凝膠板。將剝離下來的凝膠用水漂洗,轉(zhuǎn)入染色缸中,加染色液,置搖床染色15min。 (9)脫色:染色完畢,回收染色液,用水漂洗,加入脫色液,置搖床脫色,30min換一次脫色液,脫色至背景清晰。 (10)觀察測定蛋白質(zhì)遷移率以及條帶,對比標(biāo)準(zhǔn)樣品,分析蛋白質(zhì)的純度和分子量。2 結(jié)果與討論2.1 考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)含量 根據(jù)考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,如下圖可得吸光度與蛋白質(zhì)溶液濃度的關(guān)系函數(shù)為 y=0.697x-0.007,實(shí)驗(yàn)所測的蛋白質(zhì)溶液稀釋2
15、5倍,50倍,100倍時,其吸光度分別為0.5330,0.3199,0.1526,代入方程計(jì)算并乘于稀釋倍數(shù)得到各蛋白質(zhì)濃度分為50倍:21.50mg/mL,100倍:21.00mg/mL。求平均值可得原蛋白溶液的濃度為21.25mg/mL。2.2 小牛腸堿性磷酸酶酶活計(jì)算 公式:酶活力(u/mg)=根據(jù)酶動力學(xué)曲線,如下圖估算得曲線的斜率A/min為1.1062。VR =1.5mL,D=10,E405=18.3L/(mol×cm),VE=0.020mL,C=21.25mg/mL,L=0.5cm。帶入上述公式求得:酶比活力(u/mg)=4.267u/mg。圖 Error! Main
16、Document Only.2.3 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量圖 Error! Main Document Only.圖 Error! Main Document Only.從圖1中可以看出,mark中出現(xiàn)四條蛋白質(zhì)標(biāo)記線,對照標(biāo)準(zhǔn)樣品在該系統(tǒng)電泳中所作出的標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖3)及各低分子量蛋白的組成(圖2),根據(jù)其間距及參考給出的mark泳道各蛋白質(zhì)標(biāo)記線間距,可判定mark泳道中四條線從上到下分別是兔磷酸化酶B,牛血清白蛋白,兔肌動蛋白和牛碳酸酐酶。其中樣品蛋白質(zhì)標(biāo)記線與牛血清蛋白遷移率基本相同,所以待測蛋白相對分子質(zhì)量大致為為66200g/mol。參考文獻(xiàn)1 Ausube
17、l F., Brent R., Kingston R. E., et al. Short protocols in molecular biology. (3rd). New York: John Wiley and Sons. Inc. ,1995,329-409.2許文濤,黃昆侖,常世敏,羅云波. SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳快速染脫色方法的比較研究J. 食品科學(xué),2004,S1:150-153.3張龍翔等. 生化試驗(yàn)方法和技術(shù). 人民教育出版社,北京,1981.4羅貴民主編. 酶工程. 北京:化學(xué)工業(yè)出版社現(xiàn)代生物技術(shù)與醫(yī)藥科技出版中心,2002.5李昌厚.紫外可見分光光度計(jì)及其應(yīng)用M.化
18、學(xué)工業(yè)出版社,2010-08-016包永明,生物工程實(shí)驗(yàn)技術(shù)手冊M.化學(xué)工業(yè)出版社.2005 7 孫士青,王少杰,李秋順,李雪梅,史建國. 考馬斯亮藍(lán)法快速測定乳品中蛋白質(zhì)含量J. 山東科學(xué),2011,06:53-55. 8修志龍主編. 生物化學(xué). 北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2008.5.Extraction of the Calf Intestinal Alkaline Phosphatase and Determination of its ActivityDetermination of the Protein Content by Using Coomassie Brilliant Blue MethodDetermination of the Protein Molecular Weight by Using SDS-PAGE Eletrophoresis MethodCong Yang, Wu Ye, Wang Hedun, Lv BaiyaoFaculty of Chemical, Environmental and Biological Science and Technology,
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