分子生物學(xué)電子教案第十章_第1頁
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文檔簡介

1、第十章 原核生物基因表達(dá)調(diào)控1課程教學(xué)內(nèi)容 (1) 原核生物基因表達(dá)調(diào)控的概述 (2) 乳糖操縱子 (3) 色氨酸操縱子的負(fù)調(diào)控 (4) 阿拉伯糖的操縱子 (5) 正調(diào)控系統(tǒng)和負(fù)調(diào)控系統(tǒng) 2課程重點(diǎn)、難點(diǎn) 原核生物基因表達(dá)調(diào)控的一般機(jī)制、乳糖操縱子、色氨酸操縱子的負(fù)調(diào)控。 3課程教學(xué)要求 (1)掌握原核生物表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)、方式和意義及相關(guān)概念; (2)掌握和理解乳糖操縱子和色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)和作用機(jī)理; (3)了解其它調(diào)控方式。   原核生物細(xì)胞的基因和蛋白質(zhì)種類較少。如大腸桿菌基因組約為4.6×106bp,假如每個基因長1000bp,一個細(xì)菌就有4000個左右的

2、基因能合成4000種左右的蛋白質(zhì),據(jù)估計(jì)一個細(xì)胞中總共含有107個蛋白質(zhì)分子,如果每個基因等同翻譯的話,任何一個多肽應(yīng)有2500個拷貝,但是這些蛋白質(zhì)并不是以相同拷貝存在于每個細(xì)胞中,有些蛋白質(zhì)數(shù)目相當(dāng)固定,另一些變化很大。例如,每個大腸桿菌細(xì)胞可以有約15000個核糖體,與其結(jié)合的約50種核糖體蛋白數(shù)量是十分恒定的,糖酵解體系的酶含量很大,其數(shù)目也極恒定,此外,如DNA聚合酶、RNA聚合酶等都是代謝過程中十分必需的酶或蛋白質(zhì),其合成速率不受環(huán)境變化或代謝狀態(tài)的影響,這一類蛋白質(zhì)的合成稱為永久型,另一類型則稱為適應(yīng)型或調(diào)節(jié)型 ,這類蛋白質(zhì)的合成速率明顯地受環(huán)境的影響而改變。例如,一般情況下,一

3、個大腸桿菌細(xì)胞中只有1-5個分子的-半乳糖苷酶,但若將細(xì)胞培養(yǎng)在只含有乳糖的培養(yǎng)基中,每細(xì)胞中這個酶的量可高達(dá)幾萬分子,其他糖代謝的酶、氨基酸、核苷酸合成系統(tǒng)的酶類,其合成速度和總量都隨培養(yǎng)條件的變化而改變。細(xì)菌中所利用的大多數(shù)基本調(diào)控機(jī)制執(zhí)行下列規(guī)則,一個體系在需要時(shí)被打開,不需要時(shí)被關(guān)閉,這種“開-關(guān)”活性是通過調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄來建立的,也就是說mRNA的合成是可以被調(diào)節(jié)的。實(shí)際上,當(dāng)我們說一個系統(tǒng)處于“off”狀態(tài)時(shí),也有本底水平的基因表達(dá),常常是每世代每個細(xì)胞只合成1或2個mRNA分子,因而合成少量蛋白質(zhì)分子,為了方便,我們通常用“off”這一術(shù)語,但必須明白所謂“關(guān)”實(shí)際意思是基因表達(dá)是特別

4、低,很難甚至無法檢測。所有生物的遺傳信息,都是以基因的形式儲藏在細(xì)胞內(nèi)的DNA分子中。隨著個體的發(fā)育,DNA分子能有序地將其所承載的遺傳信息通過密碼子反密碼子實(shí)驗(yàn),轉(zhuǎn)變?yōu)榈鞍踪|(zhì)分子,執(zhí)行各種生理生化功能完成生命的全過程??茖W(xué)家把這個DNA到蛋白質(zhì)的過程稱為基因表達(dá),對這個過程的控制稱為基因表達(dá)調(diào)控時(shí)間和空間概念,掌握了基因表達(dá)調(diào)控的秘密,我們手中就有了一把揭示生物學(xué)奧妙的金鑰匙。基因表調(diào)控主要表現(xiàn)在以下幾個方面(1)轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(2)mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(3)翻譯水平上的調(diào)控基因調(diào)控的指揮系統(tǒng)也是多樣的,不同的生物使用不同的信號來指揮基因調(diào)控。原核生物中,營養(yǎng)狀況和環(huán)境因素對基因表

5、達(dá)起著舉足輕重的影響。在真核生物尤其是高等真核生物中激素水平和發(fā)育階段是基因表達(dá)調(diào)控的最得要手段,營養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。一、        原核基因調(diào)控總論 基因表達(dá)的第一步是遺傳信息從DNA分子轉(zhuǎn)移到RNA分子的轉(zhuǎn)錄過程,這種RNA分子中一條反義鏈為模板,在依賴于DNA的RNA聚合酶的催化作用下進(jìn)行的一種聚合反應(yīng),轉(zhuǎn)錄的可靠性是一個十分復(fù)雜的問題,它包括以下幾個方面(1)       如何在復(fù)雜的核基因組內(nèi)確定正確的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)?(2) 

6、60;     如何將核苷酸按照密碼子序列插入新生的RNA鏈中?(3)       如何使RNA聚合反應(yīng)進(jìn)行到底即如何保證合成完整的RNA?(4)       如何確定轉(zhuǎn)錄的終止?這種在轉(zhuǎn)錄水平上對基因表達(dá)的調(diào)控決定于DNA的結(jié)構(gòu)、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。在研究轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控以前,我們先來分析一下原核與真核生物轉(zhuǎn)錄與翻譯的特點(diǎn):因?yàn)榧?xì)菌mRNA在形成過程中與核糖體混合在一起,所以細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄與翻譯過程幾乎發(fā)

7、生在同一個時(shí)間間隔內(nèi),轉(zhuǎn)錄與翻譯相偶聯(lián);真核生物中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物只有從核內(nèi)運(yùn)到核外,才能被核糖體翻譯成蛋白質(zhì)。(圖解) (一)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)的類型 根據(jù)某一體系代謝活性調(diào)節(jié)的類型,轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)節(jié)可分為如下幾種方式:(1)代謝產(chǎn)物對基因活性的調(diào)節(jié);(2)弱化因子對基因活性的影響;(3)降解物對基因活性的調(diào)節(jié);(4)細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)。1、 代謝產(chǎn)物對基因活性的調(diào)節(jié) 在降解代謝途徑中,起始端的酶(一般指催化第一步反應(yīng)的酶)的底物濃度往往決定是否合成這一途徑中的其他各種酶。相反,在合成代謝中,最終產(chǎn)物則往往是調(diào)節(jié)物質(zhì)。在單順反子mRNA翻譯出蛋白質(zhì)的體系中,該蛋白質(zhì)可以充當(dāng)自我調(diào)節(jié)的角色,其濃度決定了

8、啟動子的轉(zhuǎn)錄活性,每一調(diào)節(jié)類型的分子機(jī)理相差甚遠(yuǎn)。但一般可以分為負(fù)調(diào)節(jié)與正調(diào)節(jié)兩種情況。在負(fù)調(diào)節(jié)體系中,細(xì)胞中存在著抑制物,它使轉(zhuǎn)錄處于關(guān)閉狀態(tài),抗抑制物通常稱為誘導(dǎo)物,在轉(zhuǎn)錄的開啟中發(fā)揮重要作用。在正調(diào)節(jié)體系中,一個效應(yīng)物分子激活啟動子,而抑制物也在正調(diào)節(jié)中起作用,正負(fù)調(diào)節(jié)之間并不相互排斥,有些系統(tǒng)中既有正調(diào)節(jié),也有負(fù)調(diào)節(jié),因而需要兩種調(diào)節(jié)物。調(diào)節(jié)類型及其特點(diǎn)調(diào)節(jié)物結(jié)合到DNA上正調(diào)節(jié)負(fù)調(diào)節(jié)是開啟關(guān)閉否關(guān)閉開啟通過特殊代謝物調(diào)節(jié)的基因活性主要有可誘導(dǎo)和可阻遇兩大類:(1)可誘導(dǎo)調(diào)節(jié):是指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來關(guān)閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化。這

9、類基因中最突出的例子是大腸桿菌的乳核操縱子。大腸桿菌在含有葡萄糖的培養(yǎng)基中可以長得很好,在只含乳糖的培養(yǎng)基中,開始時(shí)生長不好,直到合成了利用乳糖的一系列酶,具備了利用乳糖作為碳源的能力,才能在這一培養(yǎng)基中生存下來,細(xì)菌獲得這一能力的原因就是因?yàn)樵谡T導(dǎo)物乳糖的誘導(dǎo)作用下,開動了乳糖操縱子,表達(dá)它編碼的3個酶:半乳糖苷酶(使乳糖水解為半乳糖和葡萄糖);半乳糖苷透過酶(使乳糖進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞內(nèi));半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶(使半乳糖第6位碳原子乙?;?。這個操縱子開動的效果是十分明顯的,以半乳糖苷酶為例在葡萄糖培養(yǎng)基中生長時(shí),每個細(xì)胞只有幾個酶分子,但若轉(zhuǎn)移到乳糖培養(yǎng)基中,幾分鐘后,每個細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)可產(chǎn)生300

10、0個酶分子,這一類基因稱為可誘導(dǎo)基因,這類酶稱為誘導(dǎo)酶,這種生化過程稱為酶的誘導(dǎo)過程。(2)可阻遏調(diào)節(jié):這類基因平時(shí)都是開啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,但由于一些特殊代謝物或化合物的積累將其關(guān)閉,阻遏了基因的表達(dá),所以稱為可阻遏基因。如大腸桿菌色氨酸的合成,色氨酸為生活中必需的氨基酸,所以它的操縱子是一直開啟著的。當(dāng)細(xì)菌的培養(yǎng)基中加入色氨酸,于是細(xì)菌完全可以利用培養(yǎng)基中現(xiàn)成的色氨酸來維持,無需化力氣來合成。這種基因稱為阻遏基因,這些酶稱為可阻遏酶,這個現(xiàn)象稱為可阻遏現(xiàn)象,這些起阻遏作用的小分子稱為抑制物。一般規(guī)律:(1)可誘導(dǎo)的操縱子是一些編碼糖和氨基酸水解代謝蛋白的基因,這些糖和氨基

11、酸平時(shí)含量很少,因此,細(xì)菌總是利用更一般的能源物質(zhì)葡萄糖的水解來提供能量,所以這些操縱子常常是關(guān)閉的,但當(dāng)生存條件發(fā)生變化,如葡萄糖缺乏而必須利用乳糖作為能源時(shí),就要打開這些基因;(2)可阻遏基因情況恰好相反,它們是一些合成各種細(xì)胞代謝過程中所必需的小分子物質(zhì)的基因,由于這些小分子物質(zhì)在生命過程中的重要地位,這些基因總是打開著的,當(dāng)這些小分子在細(xì)菌生活環(huán)境中含量較高時(shí),就關(guān)閉這些基因,停止其合成。2、 弱化因子對基因活性的影響 屬這種調(diào)節(jié)方式的有大腸桿菌中的色氨酸操縱子、苯丙氨酸操縱子、蘇氨酸操縱子、異亮氨酸操縱子和纈氨酸操縱子,以及沙門氏菌的組氨酸操縱子和亮氨酸操縱子、嘧啶合成操縱

12、子等。在這種調(diào)節(jié)方式中,起信號作用的是有特殊負(fù)載的氨基酰tRNA的濃度,如色氨酸操縱子中是色氨酰tRNA濃度,當(dāng)操縱子被阻遏,RNA合成被終止時(shí),起終止轉(zhuǎn)錄信號作用的那一段核苷酸稱為弱化子,這種因?yàn)楹颂求w在基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的不同位置,決定了RNA可以形成哪一種形式的二級結(jié)構(gòu),并由此決定基因能否繼續(xù)轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)方式確定是異常巧妙的,起調(diào)節(jié)作用的信號分子是細(xì)胞中某一氨基酸或嘧啶濃度只要稍加變動就可影響整個體系的功能。3、 降解物對基因活性的調(diào)節(jié) 操縱子學(xué)說的核心是使基因從表達(dá)抑制狀態(tài)中解脫出來進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,是從負(fù)調(diào)節(jié)的角度來考慮基因表達(dá)調(diào)控的,那么有沒有從相反的角度進(jìn)行調(diào)節(jié),從而提高基因的轉(zhuǎn)錄水平

13、,使它由原來的低水平表達(dá)變成高水平表達(dá)的呢?這就是降解物抑制作用的調(diào)節(jié)。有葡萄糖存在的情況下,即使在細(xì)菌培養(yǎng)基中加入乳糖、半乳糖、阿拉伯糖或麥芽糖等誘導(dǎo)物,與其相對應(yīng)的操縱子也不會啟動,產(chǎn)生通過代謝這些糖的酶來,這種現(xiàn)象稱為葡萄糖效應(yīng)或稱為降解物抑制作用的調(diào)節(jié)。添加葡萄糖后,細(xì)菌所需要的能量便可從葡萄糖得到滿足,葡萄糖是最方便能源,細(xì)菌無需開動一些不常用的基因去利用這些稀有的糖類。由于葡萄糖的存在會抑制細(xì)菌的腺苷酸環(huán)化酶,減少環(huán)腺苷酸(cAMP)的合成,與它結(jié)合的蛋白質(zhì)(cAMP受體蛋白)因找不到配體而不能形成復(fù)合物,這個復(fù)合物是一個正調(diào)節(jié)物質(zhì),可以與操縱子上的啟動區(qū)結(jié)合,起動基因轉(zhuǎn)錄,所以有

14、葡萄糖存在時(shí),不易形成復(fù)合物cAMPCRP形成復(fù)合物并與啟動子結(jié)合,促進(jìn)乳糖操縱子的表達(dá),降解物抑制作用是通過促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄來正調(diào)節(jié)基因表達(dá)的,這是一種積極的調(diào)節(jié)方式。4、 細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng) 上面講述的是細(xì)菌處于正常生活條件下的基因表達(dá)調(diào)節(jié)方式,所謂“正?!币舶ㄉ瞽h(huán)境中缺少某一種或兩種能源,但能找到其他代用物。可是細(xì)菌有時(shí)會碰到萬分緊急的狀況,比如氨基酸饑餓時(shí),就不是缺少一、二個氨基酸,而是氨基酸的全面匱乏,為了緊縮開支,渡過難關(guān),細(xì)菌將會產(chǎn)生一個應(yīng)急反應(yīng),包括生產(chǎn)各種RNA,糖脂肪和蛋白質(zhì)在內(nèi)的幾乎全部生物化學(xué)反應(yīng)過程均被停止,實(shí)施這一應(yīng)急反應(yīng)的信號是鳥苷四磷酸(pppGpp)和鳥

15、苷五磷酸(pppGpp)。產(chǎn)生這兩種物質(zhì)的誘導(dǎo)物是空載tRNA。當(dāng)氨基酸饑餓時(shí),細(xì)胞中便存在大量的不帶氨基酸的tRNA,這種空載的tRNA會激活焦磷酸轉(zhuǎn)移酶,使pppGpp大量合成,其濃度可增加10倍以上。ppGpp的出現(xiàn)會出現(xiàn)關(guān)閉許多基因,當(dāng)然也會打開一些合成氨基酸的基因,以應(yīng)付這種緊急狀況,關(guān)于PPGpp的作用原理還不太清楚。據(jù)認(rèn)為RNA聚合酶有不同的構(gòu)型,這些構(gòu)象可以識別不同的啟動子區(qū),ppGpp與RNA聚合酶結(jié)合會使它的某些構(gòu)象穩(wěn)定下來,從而改變了基因轉(zhuǎn)錄的效率,或關(guān)閉,或減弱,或增加;也有人認(rèn)為,基因的轉(zhuǎn)錄起始附近有一些保守序列,它們可能是ppGpp或有關(guān)調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)合位點(diǎn),當(dāng)這些信

16、點(diǎn)上的啟動子與ppGpp結(jié)合后,就使它們不再與RNA聚合酶結(jié)合,基因被關(guān)閉,與的作用范圍十分廣泛,它不是只影響一個或幾個操縱子,而是影響一大批,所以它們是超級調(diào)控因子。(二)環(huán)腺苷酸受體蛋白對轉(zhuǎn)錄的調(diào)控 環(huán)腺苷酸(CAMP)受體蛋白(CRP)并稱分解代謝激活蛋白(CAP),當(dāng)大腸桿菌生長在缺乏葡萄糖的培養(yǎng)基中,CAMP合成量增加,與CRP結(jié)合后所形成的復(fù)合物具有激活半乳糖(gal)、麥芽糖、乳糖(lac)等啟動子的功能,它是由兩個相同亞基組成的二聚體,每個亞基含有210個氨基酸殘基,分為兩個結(jié)構(gòu)域,氨基末端結(jié)構(gòu)域與CAMP結(jié)合,羧基末端結(jié)構(gòu)域與DNA結(jié)合,cAMP的結(jié)合能提高CRP對雙鏈DNA

17、的親和力,CRP與啟動子結(jié)合是激活轉(zhuǎn)錄的必需條件。根據(jù)17個能與CRP結(jié)合只啟動子序列進(jìn)行分析的結(jié)果表明,存在以5TGTGANNTNNNCANAT 3為特征的共同序列,其中TGTGA保守性最強(qiáng)。 一些依賴于CRP的啟動子缺乏一般啟動子所具有的典型的-35區(qū)序列特征,因此,大腸桿菌RNA聚合酶難以與其結(jié)合,CRP的存在能顯著提高酶與啟動子的結(jié)合常數(shù),有研究證明,CRP與 Lac啟動子的最強(qiáng)結(jié)合區(qū)域達(dá)到2830bp,結(jié)合后能使DNA做90180的彎曲,為酶分子提供結(jié)合部位,另一方面,酶的存在又提高了CAMPCRP與lac和gal啟動子的親和力,在cAMP存在的條件下,酶能與CRP共沉淀,這些事實(shí)說

18、明,酶與CRP可以發(fā)生相互作用,由此推想,CRP通過改變啟動子構(gòu)象以及與酶的相互作用幫助酶分子正確定向以便與-10區(qū)結(jié)合實(shí)際,起到了取代-35區(qū)功能的作用。 CRP還能抑制RNA聚合酶與DNA中其他位點(diǎn)的結(jié)合,從而提高與某一特定啟動子結(jié)合概率。 二、 乳糖操縱子 操縱子學(xué)說是,關(guān)于原核生物基因結(jié)構(gòu)及其表達(dá)調(diào)控的學(xué)說,它是由法國巴斯德研究所著名科學(xué)家Jacob和Monod在1961年首先提出,并在10年內(nèi)經(jīng)許多科學(xué)家的補(bǔ)充和修正得以逐步完善。大腸桿菌乳糖操縱子(lectose operon)包括3個結(jié)構(gòu)基因:Z、Y和A,以及啟動子、控制子和阻遏子等,轉(zhuǎn)錄時(shí)RNA聚合酶首先與啟動區(qū)(P)結(jié)合,通過

19、操縱區(qū)(O)向右轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄從O區(qū)的中間開始,按ZYA,每次轉(zhuǎn)錄出來的一條mRNA上都帶有這3個基因,轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是在啟動區(qū)和操縱區(qū)進(jìn)行的。(圖解)3個結(jié)構(gòu)基因各決定一種酶:Z編碼-半乳糖苷酶;Y編碼-半乳糖苷透過酶; A編碼-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶。-半乳糖苷酶是一種-半乳糖苷鍵的專一性酶,除能將乳糖果水解成葡萄糖和半乳糖外,還能水解其他-半乳糖苷,-半乳糖苷透過酶的作用是使外界的-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),所以大腸桿菌如半乳糖為碳源和能源的話,以上兩酶是必需的。-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶的作用是把乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)移到半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖,它在乳糖的利用中

20、并非必須。(一)酶的誘導(dǎo)Lac體系受調(diào)控的證據(jù) 1、 Lac基因的誘導(dǎo)表達(dá) 乳糖代謝體系的開啟和關(guān)閉的過程如下:(1)在不含乳糖及-乳糖的培養(yǎng)基中,Lac+基因型大腸桿菌細(xì)胞內(nèi)-半乳糖苷酶和透過酶的濃度很低,每個細(xì)胞內(nèi)大約只有1-2個酶分子,但是,如果在培養(yǎng)基中加入乳糖,酶的濃度很快達(dá)到細(xì)胞總蛋白量的6%或7%,每個細(xì)胞中可有超過105個酶分子。(2)有乳糖供應(yīng)時(shí),在無葡萄糖培養(yǎng)基中生長的Lac+細(xì)菌,-半乳糖苷酶和透過酶將同時(shí)合成,進(jìn)一步用32P標(biāo)記的mRNA與模板DNA進(jìn)行定量分子雜交,表明培養(yǎng)基中加入乳糖12min后,編碼-半乳糖苷酶和透過酶的LacmRNA量就明顯迅速增加,去

21、掉乳糖后,LacmRNA量立即下降到幾乎無法檢測,表明乳糖確定能激發(fā)LacmRNA的合成,科學(xué)家對于這個操縱子誘導(dǎo)作用的機(jī)理奠定了我們對代謝調(diào)節(jié)認(rèn)識的基石。實(shí)驗(yàn)室里通常使用含硫的乳糖類似物異丙基巰基半乳糖苷(IPTG)和巰甲基半乳糖苷(TMG),另外,在酶活性分析中通常用生色底物O-硝基半乳糖苷(ONPG)。研究發(fā)現(xiàn),它們都是高效誘導(dǎo)物,因?yàn)檫@些都不是半乳糖苷酶的底物,所以又稱為安慰性誘導(dǎo)物。(3)為了證實(shí)誘導(dǎo)物的作用是誘導(dǎo)新酶合成,而不是將已存在于細(xì)胞中的酶前體轉(zhuǎn)化為有活性的酶,設(shè)計(jì)了同位素示誘實(shí)驗(yàn),把大腸桿菌細(xì)胞放在加有放射性35S標(biāo)記的氨基酸但沒有任何半乳糖苷誘導(dǎo)物的培養(yǎng)基中,隨著培養(yǎng)基

22、中誘導(dǎo)物的加入,-半乳糖苷酶便開始合成,分離純化-半乳糖苷酶,發(fā)現(xiàn)這種酶無35S標(biāo)記,說明酶的合成不是由前體轉(zhuǎn)化而來的,而是加入誘導(dǎo)物后新合成的。2、 I型和O型的發(fā)現(xiàn)及其意義 已經(jīng)分離到一種在有誘導(dǎo)物或沒有誘導(dǎo)物的情況下都能產(chǎn)生LacmRNA的突變體,這種失去調(diào)節(jié)能力的突變體稱為永久型突變體,Jacob和Monod用這兩種突變體構(gòu)建了各種局部二倍體細(xì)胞,并將這些突變株歸納為兩類:I型和O型,為了和野生型相區(qū)別,兩類突變型分別以下列符號標(biāo)記:I型:野生型為I+,突變型為I;O型:野生型為O+,突變型為Oc。這樣的突變往往是多效性突變,因?yàn)镮+ I 或O+Oc后,Z、Y、A結(jié)構(gòu)基因均表

23、現(xiàn)為永久表達(dá),所以I基因被稱為調(diào)節(jié)基因(regnlatory gene)。I 突變株的行為像大多數(shù)基因的隱性突變那樣,當(dāng)I+ 細(xì)胞停止LacmRNA的合成時(shí),I突變體中仍然有LacmRNA合成,很顯然,I基因是一個產(chǎn)生抑制物的調(diào)節(jié)基因,其產(chǎn)物使體系關(guān)閉,I 突變體由于不能產(chǎn)生這種抑制物,細(xì)胞因此成為Lac永久型,在I+/ I 的局部二位體中有一個正常的I基因,Lac操縱子的表達(dá)仍然可能被抑制。Jocob和Monod稱I基因產(chǎn)物為Lac阻遏物,最初人們還不清楚Lac阻遏物究竟是一種蛋白質(zhì)還是一種由I基因轉(zhuǎn)錄形成的RNA分子,后來發(fā)現(xiàn)此基因有琥珀突變體,初步證明了是一種蛋白質(zhì),1967年,人們首次

24、分離到了阻遏物,并使之純化。OC突變體的一個顯著特征是某些情況下表現(xiàn)出顯性,這些OC 突變體顯性特征的重要意義在某些二倍體中更加清楚,這兩種組合由于有功能正常Z基因而表現(xiàn)為Lac+。但OCZ/O+Z+,盡管有OC突變存在,-半乳糖苷酶的合成仍然是可誘導(dǎo)型的兩個組合的差異在于OC突變存與Z突變處于同一個DNA分子中,而7種OC與Z+在同一個DNA分子上,所以只有當(dāng)OC與Z+在同一個DNA分子上時(shí),OC才能引起半乳糖苷酶的永久型合成。有一個重要的實(shí)驗(yàn)證實(shí)了一個結(jié)論,檢測-半乳糖苷酶突變型的免疫系結(jié)果表明,在OCZ/O+Z+的局部二倍體中,有突變酶永久型合成,而只有加入誘導(dǎo)物之后,才能會合成野生型的

25、酶,關(guān)于OC突變位于I與Z之間 ,所以Lac體系的4個基因序列為IOZY,通過這些觀察,Jocob和Monod推斷OC突變代表DNA鏈上的一個位點(diǎn)或一個非編碼區(qū)域,而不是一個基因,因?yàn)榭删幋a的基因具有互補(bǔ)性,而OC沒有這一特性,O決定相鄰Z基因產(chǎn)物是誘導(dǎo)型合成還是永久型合成,O區(qū)域稱為操縱基因。(二)操縱子模型 Jacob和Monod認(rèn)為誘導(dǎo)酶現(xiàn)象是個基因調(diào)控問題,而且可以用實(shí)驗(yàn)方法進(jìn)行研究,通過大量的實(shí)驗(yàn),終于建立了操縱子的控制模型(圖解)。其要點(diǎn)為: (1)Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼; (2)這個mRNA分子的啟動子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P)

26、,不能單獨(dú)起動合成-半乳糖苷酶和透性酶的生理過程。 (3)操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn); (4)當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時(shí),LacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制; (5)誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)LacmRNA的合成,即有誘導(dǎo)物存在時(shí),操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能移順利起始mRNA的合成。 這一簡單模型解釋了Lac體系及其他負(fù)調(diào)控系統(tǒng)的許多現(xiàn)象,但是在乳糖操縱子中同樣也存在著正調(diào)控。 1、 Lac操縱子的本底水平表達(dá) 有兩個矛盾是操縱子理論所不能解釋的,首先,誘導(dǎo)物需要穿過細(xì)胞膜才能與阻遏物結(jié)

27、合,而轉(zhuǎn)運(yùn)誘導(dǎo)物需要透過物,后者的合成又需要誘導(dǎo),這樣必須解釋第一個誘導(dǎo)物是如何達(dá)到細(xì)胞內(nèi)的,只有兩種可能,或者一些誘導(dǎo)物可以在透過酶不存在時(shí)進(jìn)入細(xì)胞,或者一些透過酶可以在沒有誘導(dǎo)物的情下合成,后者的解釋是正確的。 其次,研究還發(fā)現(xiàn)乳糖,并不和阻遏物結(jié)合,真正的誘導(dǎo)物是乳糖的異構(gòu)體異構(gòu)乳糖,但是,異構(gòu)乳糖是在-半乳糖苷酶的催化下由乳糖形成的。因此,乳糖誘導(dǎo)-半乳糖苷酶的合成需要有-半乳糖苷酶的預(yù)先存在。這一現(xiàn)象的解釋是:在非誘導(dǎo)狀態(tài)下有少量的LacmRNA合成(大約每代有15個mRNA分子),這種合成稱之為本底水平的永久型合成。 2、 Lac+大腸桿菌對乳糖的反應(yīng) 假設(shè)細(xì)菌生長以甘油

28、為碳源的培養(yǎng)基中,按照Lac操縱子本底水平的表達(dá),每個細(xì)胞可有幾個分子的-半乳糖苷酶和乳糖透過酶,加入乳糖在單個透過酶分子作用下,少量乳糖分子進(jìn)入細(xì)胞,又在單個-半乳糖苷酶分子的作用下轉(zhuǎn)變成異構(gòu)乳糖,某個異構(gòu)乳糖與操縱基因上的阻遏物結(jié)合,并使后者失活而離開基因,這樣mRNA的合成就開始了,這些mRNA分子編碼大量的-半乳糖苷酶及乳糖透過酶,其結(jié)果是乳糖涌入細(xì)胞,又在單個-半乳糖苷酶分子的作用下轉(zhuǎn)變成異構(gòu)乳糖,然后與細(xì)胞內(nèi)的阻遏物結(jié)合,阻遏物的失活促進(jìn)mRNA的高速合成,進(jìn)一步提高了透過酶和-半乳糖苷酶的濃度降解產(chǎn)生的葡萄糖被細(xì)胞用作碳源和能源,降解產(chǎn)生的半乳糖則被另一套酶體系轉(zhuǎn)變成葡萄糖,這些

29、酶的合成也是可誘導(dǎo)的,這個可誘導(dǎo)的體系就是半乳糖操縱子,半乳糖是它的誘導(dǎo)物。 3、 Lac阻遏物I基因產(chǎn)物及功能 一般通過與放射性標(biāo)記的IPTG相結(jié)合的方法分離和純化阻遏物,Lac阻遏蛋白有4個相同的亞基,每個亞基均含有347個氨基酸殘基,并能與1分子IPTG結(jié)合,未經(jīng)分級分離的細(xì)胞提取物的結(jié)合能力大約為每細(xì)胞結(jié)合2040個IPTG分子,因此推斷每個細(xì)胞中有510個阻遏物分子,進(jìn)一步觀察發(fā)現(xiàn)在某I突變體的細(xì)胞提取物中缺少阻遏物,從而證明了它與IPTG結(jié)合的分子確定是蛋白質(zhì)。 由于阻遏物含量極低,一般認(rèn)為每個細(xì)胞中這些蛋白質(zhì)分子是由12個被轉(zhuǎn)錄的阻遏物mRNA模板翻譯而來的。mRNA的

30、數(shù)量如此之少,因此很可能阻遏物的合成也受到調(diào)節(jié),或者這種mRNA是從一個弱啟動子轉(zhuǎn)錄而來的?,F(xiàn)已表明,Lac操縱子阻遏物mRNA是一個弱啟動子控制下永久型合成的。 4、 葡萄糖對Lac操縱子的影響 -半乳糖苷酶在乳糖代謝中的作用是降解乳糖,形成葡萄糖及半乳糖,如果將葡萄糖及乳糖同時(shí)加入培養(yǎng)基中,大腸桿菌在耗盡外源葡萄糖之前,不會誘發(fā)Lac操縱子,當(dāng)有葡萄糖存在時(shí),因?yàn)闆]有LacmRNA合成,所以也沒有-半乳糖苷酶產(chǎn)生。 葡糖對LacmRNA轉(zhuǎn)錄的抑制可能來自兩個方面:(1)葡萄糖阻止了誘導(dǎo)物引起的阻遏物失活效應(yīng);(2)僅僅去掉阻遏物并不能啟動Lac基因表達(dá),還有其他因素參與調(diào)控這一基

31、因表達(dá)。 葡萄糖對Lac操縱子表達(dá)的抑制是間接的,如:有一個E. coli突變體,它在糖酵解途徑中不能將葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)變成下一步代謝中間物,這些細(xì)菌的Lac基因能在葡萄糖存在時(shí)被誘導(dǎo)合成,所以不是葡萄糖而是它的某些降解產(chǎn)物抑制了LacmRNA的合成,我們把葡萄糖的這種效應(yīng)稱之為代謝阻遏效應(yīng)。 5、 cAMP與代謝物激活蛋白 廣泛存在于動、植物組織中的cAMP是在腺苷酸環(huán)化酶的作用下轉(zhuǎn)變而來的,在許多真核生物激素調(diào)節(jié)過程中起著重要作用,它也存在于大腸桿菌中,其濃度受葡萄糖代謝的調(diào)節(jié),如果將細(xì)菌放入缺乏碳源的培養(yǎng)基中培養(yǎng),細(xì)胞內(nèi)cAMP濃度非常高。如果在含葡萄糖的培養(yǎng)基中培養(yǎng),cAM

32、P的濃度就很低,如果培養(yǎng)基中只有甘油或乳糖等不進(jìn)行糖酵解途徑的碳源,cAMP的濃度也會很高,因此,推測糖酵解途徑中位于葡萄糖-6-磷酸與甘油之間的某些代謝產(chǎn)物是腺苷酸環(huán)化酶活性的抑制劑。 大腸桿菌中的分解代謝物激活蛋白,由crp基因編碼,能與cAMP形成復(fù)合物,凡crp及腺苷酸環(huán)化酶基因突變的細(xì)菌都不能合成LacmRNA,CAP和cAMP都是合成LacmRNA所必需的,事實(shí)上,cAMP-CAP復(fù)合物是Lac體系中一個有活性的復(fù)合物,細(xì)菌對此復(fù)合物的重要是獨(dú)立的,與阻遏體無關(guān),因?yàn)閏rp基因和環(huán)化酶基因的突變細(xì)菌即使同時(shí)也是L或OC突變,仍然不能合成出LacmRNA,轉(zhuǎn)錄必須有cAMP-CAP復(fù)

33、合物結(jié)合在DNA的啟動子區(qū)域上,所以認(rèn)為cAMP-CAP是一個不同于阻遏物的正調(diào)控因子,而Lac操縱子的功能是正負(fù)兩個相互獨(dú)立的調(diào)控體系作用下實(shí)現(xiàn)的。 (三) Lac操縱子DNA的調(diào)控區(qū)域P、O區(qū) 現(xiàn)在利用分子生物學(xué)技術(shù)已經(jīng)分離得到含有Lac操縱子DNA片段,其P-O區(qū)核苷酸序列已全部分析清楚,P區(qū)是從I基因結(jié)束到mRNA轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),共長82bp,O區(qū)就是阻遏物結(jié)合區(qū),位于P區(qū)后半部和轉(zhuǎn)錄起始區(qū)。把mRNA起始到結(jié)構(gòu)基因起始密碼子之間的序列稱為前導(dǎo)區(qū)(Leader),P區(qū)是從-82 +1,阻遏物結(jié)合區(qū)大約從-7 + 28。該區(qū)(-7 + 28)的堿基序列有對稱性,其對稱軸在+11位堿基對,P

34、區(qū)的cAMP-CAP復(fù)合物結(jié)合區(qū)(-67 -52)也有一個對稱區(qū),其對稱軸在-60 -59之間,對稱區(qū)在蛋白質(zhì)與DNA的識別和結(jié)合中有重要意義。在反應(yīng)體系中先加入阻遏物,后加入RNA聚合酶,體系無轉(zhuǎn)錄活性,反之若先加RNA聚合酶,后加阻遏物,體系有轉(zhuǎn)錄活性。已知PO區(qū)有7bp重迭,很可能阻遏物與O區(qū)的結(jié)合影響了RNA聚合酶與Pribnow區(qū)緊密結(jié)合形成穩(wěn)定的起始復(fù)合物,gal操縱子的PO區(qū)也是緊密相連并有重疊現(xiàn)象,面而trp操縱子的O區(qū)則完全在P區(qū)內(nèi)。Lac操縱子的調(diào)控區(qū)有幾個值得注意的特點(diǎn): (1)       mRNA合成的起始位

35、點(diǎn)在操縱基因中,當(dāng)阻遏物蛋白存在時(shí),該位點(diǎn)被阻遏物占據(jù)。 (2)       若RNA聚合酶預(yù)先結(jié)合在啟動子區(qū)域,阻遏物無法與操縱基因結(jié)合。(3)       cAMPCAP的結(jié)合位點(diǎn)非常接近于RNA聚合酶的作用位點(diǎn),但不與之重合。(4)       整個調(diào)節(jié)區(qū)域的長度為115bp,約為DNA螺旋的12圈。(5)       這一區(qū)域的序列為IPOZ,這個序

36、列與遺傳分析的結(jié)果相吻合。三、TrP操縱子 色氨酸操縱子(tryptophane operon)負(fù)責(zé)色氨酸的生物合成,它的激活與否完全根據(jù)培養(yǎng)基中有無色氨酸而定,當(dāng)培養(yǎng)基中有足夠的色氨酸時(shí),這個操縱子自動關(guān)閉,缺乏色氨酸時(shí)操縱子被打開,trp基因表達(dá),在這里色氨酸與其代謝有關(guān)的某種物質(zhì)在阻遏過程中起作用,由于trp參與生物合成而不是降解,它不受葡萄糖或cAMP-CAP的調(diào)控。色氨酸的合成分5步完成,每個環(huán)節(jié)需要一個酶編碼,這5種酶的基因是緊密連鎖在一起的,所以5個基因被轉(zhuǎn)錄在一條多順反子mRNA分子上,分別以trpE、trpO、trpC、trpB、trpA代表,編碼了鄰氨基苯甲酸合成酶,鄰氨基

37、苯甲酸焦磷酸合成酶,trpE基因是第一個被翻譯的基因和trpE緊鄰酸是啟動子區(qū)和操縱區(qū)。另外前導(dǎo)區(qū)和弱化子區(qū)分別定名為trpL和trpa(不是trpA),trp操縱子中產(chǎn)生阻遏物的基因是trpR,該基因距trp基因簇很遠(yuǎn),后者在大腸桿菌染色體圖上25min處,而前者則位于90min處,在位于65min處還有一個trpS(色aatRNA合成酶),它和攜帶有trp的tRNATrp也參與trp操縱子的調(diào)控作用(圖解)。trp操縱子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控除了阻遏系統(tǒng)以外,還有弱化系統(tǒng)(圖解)。L區(qū)編碼了前導(dǎo)肽,當(dāng)有高濃度Trp存在時(shí),由于弱化子a的作用,轉(zhuǎn)錄迅速減弱停止,生成140核苷酸的前導(dǎo)RNA,當(dāng)Trp濃度

38、較低時(shí),弱化子不起作用,轉(zhuǎn)錄得以正常進(jìn)行,生成約7kb的mRNA,操縱子中第一個結(jié)構(gòu)基因的起始密碼子AUG在+162處。(一)trp操縱子的阻遏系統(tǒng) trp基因突變常引起trpmRNA的永久型合成,該基因產(chǎn)物因此被稱為輔阻遏蛋白(aporepressor)除非培養(yǎng)基中有色氨酸,否則這個輔阻遏物不會與操縱區(qū)結(jié)合。輔阻遏蛋白與色氨酸相結(jié)合形成有活性的阻遏物,與操縱區(qū)結(jié)合并使之關(guān)閉轉(zhuǎn)錄trpmRNA。輔阻遏蛋白 + 操縱區(qū) 有活性的操縱區(qū)(能發(fā)生轉(zhuǎn)錄)輔阻遏蛋白 + 色氨酸 有活性阻遏物 + 操縱區(qū) (操縱區(qū)無活性,不發(fā)生轉(zhuǎn)錄) 如果停止或大幅度減少外源色氨酸的供應(yīng),以上反應(yīng)的平衡向左移動,操縱區(qū)的

39、位置空出來,又開始轉(zhuǎn)錄,這就是基本的開關(guān)調(diào)節(jié)機(jī)理。 啟動子與操縱區(qū)的區(qū)域有很大程度的重疊,有活性阻遏物的結(jié)合與RNA聚合酶的結(jié)合同樣發(fā)生競爭。在體外,如果先加入阻遏物,則RNA聚合酶不能結(jié)合,反過來則阻遏物不能結(jié)合。 Trp操縱子調(diào)節(jié)基因堿基序列,操縱區(qū)20bp的18bp形成了反面重復(fù)的對稱結(jié)構(gòu)。 Trp操縱子調(diào)節(jié)基因堿基序列(圖解) 阻遏操縱機(jī)制對trp來說是一個一級的開關(guān),主管轉(zhuǎn)錄是否啟動,相當(dāng)于Trp操縱子的粗調(diào)開關(guān),Trp操縱子中對應(yīng)于色氨酸生物合成的還有另一個系統(tǒng)進(jìn)行細(xì)調(diào)控,這種細(xì)調(diào)控主管已經(jīng)啟動的轉(zhuǎn)錄是否繼續(xù)下去,在這個系統(tǒng)中,酶的濃度根據(jù)氨基酸的變化而變化,這個細(xì)調(diào)控是通過轉(zhuǎn)錄達(dá)

40、到每個結(jié)構(gòu)基因之前的過早終止來實(shí)現(xiàn)的,由Trp的濃度來調(diào)節(jié)這種過早終止的頻率。 (二)弱化子(衰減子)與前導(dǎo)肽 1、弱化子 trpmRNA5TrpE基因的起始密碼前有一個長162bp的mRNA片段被稱為前導(dǎo)區(qū),其中堿基序列123-150位如果缺失,trp基因表達(dá)可提高6倍,而且無論是在阻遏細(xì)胞內(nèi)還是永久性突變的細(xì)胞內(nèi)都是這樣(即無論trpR 或trpR )。研究發(fā)現(xiàn)當(dāng)mRNA合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全沒有色氨酸轉(zhuǎn)錄總是在這個區(qū)域終止,產(chǎn)生一個僅有140個核苷酸的RNA分子,終止trp基因轉(zhuǎn)錄,這就是123150序列缺失會提高trp基因表達(dá)的原因,因?yàn)檗D(zhuǎn)錄終止發(fā)生在這一區(qū)域,并且這種終止是被

41、調(diào)節(jié)的,這個區(qū)域就被稱為弱化子。 研究引起終止的mRNA 基序列,發(fā)現(xiàn)此區(qū)mRNA通過自我配對,可以形成莖一環(huán)結(jié)構(gòu),有典型的終止子特點(diǎn)。 2、前導(dǎo)肽 各種實(shí)驗(yàn)表明衰減作用需要有負(fù)載tRNATrp參與,這意味著前導(dǎo)序列的某些部分被翻譯了, 分析前導(dǎo)序列,發(fā)現(xiàn)它包括起始密碼子AUG和終止密碼子UGA,如果翻譯起始于AUG,應(yīng)該產(chǎn)生一個含有14個氨基酸的多肽,這個假說的多肽(還未實(shí)際觀察到)被稱為前導(dǎo)肽,在mRNA上AUG位點(diǎn)5端有一個核糖體結(jié)合位點(diǎn),此外,前導(dǎo)肽編碼區(qū)與trpE基因5端融合可產(chǎn)生一種融合蛋白質(zhì),該蛋白質(zhì)具有與前導(dǎo)肽同樣的N未端序列。 前導(dǎo)序列具有一個非常有意義的特點(diǎn),在其第10和第

42、11位上有抑制的兩個色氨酸密碼子,這一點(diǎn)很重要,因?yàn)榻M氨酸操縱子中,也具有弱化子也具有一個類似的能編碼前導(dǎo)肽的堿基序列,此序列中含有7個相鄰的組氨酸密碼子,苯丙氨酸操縱子中同樣存在弱化子結(jié)構(gòu),其前導(dǎo)序列中也有7個苯丙氨酸密碼子。 3、 mRNA前導(dǎo)區(qū)的序列分析 trp前導(dǎo)區(qū)的堿基序列已經(jīng)全部測定,引人注目的是其中4個分別以1、2、3和4表示的片段能以兩種以上的不同方式進(jìn)行堿基配對,有時(shí)以12和34配對,有時(shí)只以23方式互補(bǔ)配對(圖解)。Rnase降解實(shí)驗(yàn)(此酶不能水解配對的RNA)表明純化的Trp前導(dǎo)序列中只有12和34的配對方式,由此定位的34配對區(qū)正好位于終止密碼子的識別區(qū),當(dāng)這

43、個區(qū)域發(fā)生破壞自我配對,堿基突變時(shí)有利于轉(zhuǎn)錄的繼續(xù)進(jìn)行。 4、 轉(zhuǎn)錄衰減作用 這一理論認(rèn)為mRNA轉(zhuǎn)錄終止是通過前導(dǎo)肽基因的翻譯來調(diào)節(jié)的,因?yàn)榍皩?dǎo)肽基因中有兩個相 鄰的色氨酸密碼子,所以這個前導(dǎo)肽的翻譯必定對tRNATRP的濃度敏感,當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸濃度很低時(shí),負(fù)載有色氨酸的tRNATRP也就少,這樣翻譯通過兩個相鄰的色氨酸密碼子的速度就會很慢。當(dāng)4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時(shí),核糖體才進(jìn)行到1區(qū),這時(shí)的前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)不形成34配對的終止結(jié)構(gòu),所以轉(zhuǎn)錄可繼續(xù)進(jìn)行,直到將Trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因全部轉(zhuǎn)錄,當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸濃度高時(shí),核糖體可順利通過兩個相鄰的色氨酸密碼子,在4區(qū)被轉(zhuǎn)錄之間,核糖體就達(dá)到2區(qū)

44、,這樣使23不能配對,34區(qū)可以自由配對形成第一環(huán)狀終止子結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄停止。trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因被關(guān)閉而不再合成色氨酸,所以弱化子對RNA聚合酶的影響前導(dǎo)肽翻譯中核糖體所處的位置。 大腸桿菌和沙門氏桿菌中,陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了不少操縱子中具有弱化作用,從前導(dǎo)區(qū)序列可以看到它們都具有前導(dǎo)肽。 (三)阻遏作用與衰減作用的協(xié)調(diào) 有實(shí)驗(yàn)證明,在不加Trp的培養(yǎng)基中,trpmRNA的合成仍然受到部分阻遏,因?yàn)橛幸粋€無阻遏物活性的突變細(xì)胞系中,trp合成酶濃度要高在野生型細(xì)胞中10倍以上。事實(shí)上,現(xiàn)在一般認(rèn)為,野生型細(xì)胞中同時(shí)存在著有活性和無活性的阻遏物,培養(yǎng)基中色氨酸濃度的變化,能夠使這兩種阻遏物間的平衡發(fā)生傾

45、斜,最終做在關(guān)閉或啟動trp操縱子的決定,從而維持一定的trp含量。細(xì)菌為什么需要有弱化子系統(tǒng)呢?一種可能是阻遏物從有活性向無活性的轉(zhuǎn)錄速度極低,需要有一個能更快地做在反應(yīng)的系統(tǒng),以保持培養(yǎng)基中適當(dāng)?shù)纳玜a水平,也有可能弱化子系統(tǒng)主要是對外源色aa濃度做在反應(yīng),但是這個信號還不足以很快引發(fā)內(nèi)源色aa的合成,于是在這種環(huán)境下,衰減子就通過抗終止的辦法來增加trp基因表達(dá),從而提高內(nèi)源色氨酸濃度。阻遏物的作用目前認(rèn)為是當(dāng)有大量外源色氨酸存在時(shí),阻止非必需的先導(dǎo)mRNA的合成,它使這個合成系統(tǒng)更加經(jīng)濟(jì),它擁有功能上與Trp操縱子完全相同的弱化子,這個弱化子能夠形成一個有3個堿基配對的區(qū)域,組氨酸操縱

46、子沒有阻遏物,這就說明完全受弱化子調(diào)節(jié)。四、    其它操縱子 (一)半乳糖操縱子 大腸桿菌半乳糖操縱子(galactose operon)在大腸桿菌遺傳圖上位于17min處,包括3個結(jié)構(gòu)基因:(1)異構(gòu)酶(UDPgalactose,galE);(2)半乳糖激酶(galactose Rinase,galK);(3)半乳糖磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactosetramferanse,galT),這3個酶的作用是使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸,半乳糖操縱子的調(diào)節(jié)基因是galR位于遺傳圖上35min處,gal操縱子與lac操縱子所不同的是galR與galE、T、K及操縱

47、區(qū)O等離得很遠(yuǎn),而galR產(chǎn)物對galO的作用與lacIlacO的作用相同,因?yàn)樵趃alR和galOC突變體中E、T、K基因得到永久性表達(dá)。gal操縱子的誘導(dǎo)物主要是半乳糖。gal操縱子還有兩個特點(diǎn):(1)具有兩個啟動子,其mRNA可以從兩個不同的起始點(diǎn)開始轉(zhuǎn)錄;(2)它有兩個O區(qū),一個在P區(qū)上游-67-53,另一個在結(jié)構(gòu)基因galE內(nèi)部。1、 cAMP-CRP對gal啟動子的作用 因?yàn)榘肴樘堑睦眯时绕咸烟堑?,人們猜想葡萄糖存在時(shí)半乳糖操縱子不被誘導(dǎo),但實(shí)際上有葡萄糖存在時(shí),gal操縱子仍可被誘導(dǎo),現(xiàn)已分離到一些突變株,其中一類突變株能在不含葡萄糖的培養(yǎng)基中高水平合成半乳糖代謝酶

48、類(gal結(jié)構(gòu)基因高效表達(dá));而另一類突變株中g(shù)al基因的表達(dá)不依賴半乳糖代謝酶類。據(jù)此科學(xué)家認(rèn)為gal操縱子存在著兩個啟動子,對這個操縱子的PO區(qū)進(jìn)行堿基序列分析,證實(shí)確有兩個相距僅為5bp的啟動子,gal操縱子可以從兩個啟動子分別起始基因轉(zhuǎn)錄,每個啟動子擁有各自的RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)S1和S2,cAMP-CRP對S1和S2起始轉(zhuǎn)錄有不同的作用。 從S1起始的轉(zhuǎn)錄只有在培養(yǎng)基中無葡萄糖時(shí)才順利進(jìn)行,RNA聚合酶與S1的結(jié)合需要半乳糖、CRP和較高濃度的cAMP。當(dāng)腺苷環(huán)化酶突變(cya)或cAMP受體蛋白(crp)時(shí),gal操縱子不能以S1起始轉(zhuǎn)錄,此時(shí)如在體外系統(tǒng)中加入cAMP-CRP就能

49、夠促進(jìn)從S1起始的轉(zhuǎn)錄。 從S2起始的轉(zhuǎn)錄則完全依賴于葡萄糖,高水平的cAMP-CRP能抑制由這個啟動子起始的轉(zhuǎn)錄。CAMP-CRP在gal操縱子中所起的調(diào)節(jié)作用比在lac操縱子中更為復(fù)雜,大腸桿菌的cya或crp突變型不能利用乳糖,但可以利用半乳糖作唯一碳源。CAMP-CRP能夠刺激gal操縱子轉(zhuǎn)錄,用含有g(shù)al操縱子調(diào)節(jié)區(qū)的DNA片段作模板進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄時(shí),發(fā)現(xiàn)cAMP-CRP抑制從S2的轉(zhuǎn)錄而刺激從S1的轉(zhuǎn)錄,當(dāng)有cAMP-CRP時(shí),轉(zhuǎn)錄從S1開始,當(dāng)cAMP-CRP時(shí)轉(zhuǎn)錄從S2開始。有一個gal啟動子突變株,不能利用培養(yǎng)基中的半乳糖,若將此突變株再行突變?yōu)閏ya 或crp,細(xì)胞恢復(fù)了利用

50、半乳糖的能力,這很可能是由于第一次突變失去了從S1起始轉(zhuǎn)錄的能力,但并不影響從S2起始轉(zhuǎn)錄能力,該株不能利用半乳糖是因?yàn)閏AMPCRP的存在抑制了從S2開始的基因轉(zhuǎn)錄,使gal操縱子既不能從S1起始,又無法從S2開始基因轉(zhuǎn)錄。雙重突變后,無論是cya突變,還是crp突變都能夠去cAMPCRP對S2的阻遏作用,導(dǎo)致gal基因表達(dá)恢復(fù)利用半乳糖作為能源的能力。對這一突變體啟動區(qū)核苷酸序列分析的結(jié)果支持了上述觀點(diǎn),已知突變發(fā)生在-11位核苷酸,使原來的A突變?yōu)門,這個位點(diǎn)是Pribnow區(qū)S1區(qū)的第二位核苷酸,已知許多啟動子中這一核苷酸的保守性很強(qiáng),AT毫無疑問帶來了功能上的改變,導(dǎo)致不能從S1處開

51、始轉(zhuǎn)錄。雖然這一核苷酸也是Pribnow區(qū),S2區(qū)的第七位核苷酸,從其他啟動子核苷酸的變化情況看,這個位點(diǎn)A T變化并不影響S2區(qū)RNA聚合酶的結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始活性。2、 雙啟動子的生理功能 gal的雙啟動子很可能與半乳糖在細(xì)胞代謝中的雙重作用有關(guān),半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細(xì)胞生長,而且與之相關(guān)的物質(zhì)尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大腸桿菌細(xì)胞壁合成的前體。在沒有外源半乳糖的情況下,UDP-gal是通過半乳糖向異構(gòu)酶的作用,由UDP-葡萄糖合成的,該酶是galE基因的產(chǎn)物,因此生長過程中的所有時(shí)間里細(xì)胞必須能夠合成差向異構(gòu)酶。另一方面,因?yàn)楹铣杉?xì)胞壁過程中對異構(gòu)酶的需要量很小,本

52、底水平的永久型合成就能夠滿足生理需要,實(shí)際上,galmRNA的永久合成水平已高于lac操縱子所合成lacmRNA的水平,顯然這個mRNA是在沒有半乳糖的情況下合成的。(二)阿拉伯糖操縱子 阿拉伯糖(arabinose)是另一個可為代謝提供碳源的五碳糖,在大腸桿菌中阿拉伯糖的降解需要3個基因:araB、araA、araD,它們形成一個基因簇,簡寫為araBAD,它們分別編碼3個酶:araB基因編碼核酮糖激酶,araA編碼L阿拉伯糖異構(gòu)酶,araD編碼L-核酮糖-5-磷酸-4-差 異構(gòu)酶。在gal操縱子中,基因的排列序列就是代謝途徑中酶的作用序列,而這個操縱子卻不同。阿拉伯糖代謝是以araA、ar

53、aB、araD的序列進(jìn)行的,另外還有負(fù)責(zé)將阿拉伯糖透入細(xì)胞的基因即araE和araF,它們位于遠(yuǎn)離這個基因簇的地方,araE和araF分別編碼一個膜蛋白和一個位于細(xì)胞壁與細(xì)胞膜之間的阿拉伯糖結(jié)合蛋白。 與araBAD相鄰的是一個復(fù)合的啟動子區(qū)域和一個調(diào)節(jié)基因araC這個調(diào)節(jié)基因的性質(zhì)與前面的Lac及gal操縱子中的調(diào)節(jié)基因的性質(zhì)全然不同,AraC蛋白同時(shí)顯示正、負(fù)調(diào)節(jié)因子的功能,與之相反在Lac和gal操縱子中,阻遏蛋白只能作為負(fù)調(diào)節(jié)因子,而cAMPCRP蛋白只能是正調(diào)節(jié)因子,araBAD和araC基因的轉(zhuǎn)錄是分別在兩條鏈上以相反的方向進(jìn)行的。 Ara操縱子也是可誘導(dǎo)的,阿拉伯糖本身就是誘導(dǎo)物

54、,在野生型操縱子中,只有阿拉伯糖存在時(shí)才轉(zhuǎn)錄在araBADmRNA,而有葡萄糖存在時(shí)則不轉(zhuǎn)錄,在腺苷酸環(huán)化酶的缺陷型和Crp突變株也不形成araBADmRNA,說明以PBAD起始的轉(zhuǎn)錄過程也重要cAMP-CRP。 AraC蛋白說明ara操縱子的正負(fù)調(diào)節(jié)蛋白,又是它們負(fù)調(diào)節(jié)蛋白。(圖解) 五、    轉(zhuǎn)錄后調(diào)控 原核生物的基因表達(dá)調(diào)控雖然主要表現(xiàn)在轉(zhuǎn)錄水平上,但也有一些轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控機(jī)制。 (一)稀有密碼子對翻譯的影響 翻譯水平上的調(diào)控大致可分為兩類:即固定式和非固定式調(diào)控。固定式調(diào)控機(jī)制包括在DNA序列之內(nèi),如稀有密碼子和重疊基因的使用等調(diào)控不受環(huán)境影響,非固定式調(diào)

55、控是受環(huán)境影響的調(diào)控,與DNA序列無關(guān)。 大腸桿菌DNA復(fù)制時(shí)岡崎片段之前的RNA引物是由dnaG基因編碼并由引物酶催化合成的,細(xì)胞對這種酶的需求是不大,若引物酶過多還將導(dǎo)致細(xì)胞死亡,已知dnaG和rpoD及rpsU屬于大腸桿菌基因組的同一個操縱子,而這3個基因產(chǎn)物在數(shù)量上都大不相同,每個細(xì)胞dnaG產(chǎn)物50拷貝,而rpoD為2800拷貝,rpsU則高達(dá)40000拷貝之多,細(xì)胞通過翻譯調(diào)控,解決了這個問題。 研究dnaG序列發(fā)現(xiàn)其中含有不少稀有密碼子,也就是說這些密碼子在其他基因中利用頻率很低,而在dnaG中卻很高。分別計(jì)算大腸桿菌中25種非調(diào)節(jié)蛋白和dnaG和rpoD序列中64種密碼子的利用頻率,可以看出dnaG與其他兩類有明顯不同。 許多調(diào)控蛋白如LacI、AraC、TrpR等在細(xì)胞內(nèi)含量也很低,編碼

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