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文檔簡介

1、DNA的瓊脂糖凝膠檢測的瓊脂糖凝膠檢測 在分光光度計檢測的基礎上,進一步用瓊脂糖凝膠電泳法檢測DNA的純度與濃度,重點檢測DNA是否降解,是否含RNA與蛋白質(zhì)。實驗目的了解瓊脂糖電泳法檢測DNA質(zhì)量與濃度的原理掌握瓊脂糖電泳法檢測DNA質(zhì)量與濃度的方法學會分辨不同質(zhì)量DNA的電泳帶型實驗原理 電泳是現(xiàn)在用于分離和純化DNA片段的最常用技術(shù)。制備好一塊“膠”即一塊包含電解質(zhì)的多孔支持介質(zhì),并把它置于靜電場中,DNA分子將向陽極移動,這是因為DNA分子沿其雙螺旋骨架兩側(cè)帶有富含負電荷的磷酸根殘基。當DNA長度增加時,來自電場的驅(qū)動力和來自凝膠的阻力之間的比率就會降低,不同長度的DNA片段就會出現(xiàn)不

2、同的遷移率。因而就可依據(jù)DNA分子的大小使其分離。 瓊脂糖濃度 凝膠中的瓊脂糖含量%(W/V)DNA/RNA分子的分離范圍(kb)0.35600.61200.70.8100.90.571.20.461.50.232.00.12用各種濃度的瓊脂糖凝膠可以分離長度為200bp至近50kb的DNA/RNA片段。瓊脂糖凝膠瓊脂糖凝膠 溴化乙錠(EB)是一種吖啶類染料,它在紫外燈照射下能發(fā)射熒光,當DNA樣品在瓊脂糖凝膠中電泳時,瓊脂糖凝膠中的EB就插入DNA分子中形成熒光絡合物,使DNA發(fā)射的熒光增強幾十倍,電泳后就可直接紫外燈照射下檢測瓊脂糖中的DNA。 EB染料電泳緩沖液的組成 常用的電泳緩沖液的

3、配制緩沖液使用液濃貯存液(每升)Tris乙酸(TAE)1:0.04moL/L Tris乙酸 0.001moL/L EDTA 50:242g Tris堿57.7mL 冰乙酸100mL 0.5moL/L EDTA (PH8.0)Tris磷酸(TPE)1:0.09moL/L Tris磷酸 0.002moL/L EDTA10:108g Tris堿15.5mL 85%磷酸40mL 0.5moL/L EDTA(PH8.0)Tris硼酸(TBE)0.50.045moL/L Tris硼酸 0.001moL/L EDTA5:54g Tris堿27.5g硼酸20mL 0.5moL/L EDTA(PH8.0)加樣緩

4、沖液緩沖液類型 6緩沖液貯存溫度I 0.25%溴酚藍 0.25%二甲苯青FF 40%(W/V)蔗糖水溶液4II 0.25%溴酚藍 0.25%二甲苯青FF 15%聚蔗糖水溶液室溫III 0.25%溴酚藍 0.25%二甲苯青FF 30%甘油水溶液4IV 0.25%溴酚藍 40%(W/V蔗糖水溶液)4 V(堿性加樣緩沖液) 300m moL/L NaoH 6 mmoL/L EDTA 18%聚蔗糖水溶液 015%溴甲酚綠 025%二甲苯青FF4增大樣品密度,確保DNA均勻進入樣品孔內(nèi)。使樣品呈現(xiàn)顏色,從而使加樣操作更為便利。溴酚藍移動的速率約為二甲苯青FF的2.2倍, 溴酚藍移動的速率約與長300bp

5、雙鏈線性DNA相同,而二甲苯青FF的速率則與4kb雙鏈線性DNA相同。 DNA片段長度標記 DNA片段長度標記通常叫作 DNA Marker,本實驗使用Bio DL2000 為DNA片段長度標記,分別由100bp、250 bp、500 bp、750 bp、1000 bp、2000 bp、DNA Marker不僅可以作為凝膠中DNA片段長度的一個標記,還可以作為電泳的對照。每次取5ul電泳時,每條帶的DNA量為50ng,750bp為100ng。所需儀器、耗材 電泳儀、電泳槽微量移液器凝膠成像系統(tǒng)天平各種玻璃器皿(燒杯、容量瓶及廣口瓶)所需試劑 溴化乙錠(EB)瓊脂糖TBE緩沖液加樣緩沖液實驗方法

6、視頻 實驗方法 1.配制瓊脂糖凝膠稱取0.2g瓊脂糖,放入250ml錐形瓶中,加入0.5TBE緩沖液20 ml,于微波爐中溶解,定容至20ml。冷卻至60左右,加入1ul goldview,混勻。將凝膠床水平放置,插入兩端的擋板,用滴管吸取少量的凝膠封好膠床邊緣。放入梳子,使梳齒高于底板0.5-1mm。倒入瓊脂糖凝膠溶液,其厚度為3-5mm,放置待冷卻,膠硬化。去掉兩端的擋板,小心撥出梳子,檢查樣品孔是否完整。2.加樣取一PCR小管,加入5ul DNA樣品,再加入3ul電泳上樣緩沖液,混勻后加樣于凝膠的孔格內(nèi)。操作時,可用右手持移液器,左手握住右手腕,左肘支撐桌面,防止點樣時右手晃動。同樣操作在第一樣品孔內(nèi)加入5ul DNA分子質(zhì)量標準物。3.電泳電泳槽中加入電泳緩沖液,將膠床放入,液面高出膠面1-2mm。蓋上電泳槽蓋,接通電源,樣品端接負極(DNA向陽極移動),以5V/cm電壓電泳。使DNA移入瓊脂糖膠內(nèi),一般為溴酚藍遷移2cm左右。4.觀察取出凝膠,置短波紫外線(254nm)下觀察照像。比較樣品DNA與DNA標準品的熒光強度,并計算出樣品中DNA濃度。觀察有無RNA、蛋白質(zhì)及DNA降解條帶。標準DNA樣品結(jié)果分析結(jié)果分析DNA樣品中有RNA污染DNA樣品中有蛋白質(zhì)DNA有降解,從總DNA開始拖尾注意事項防止紫外線對人皮膚及眼睛的損傷,避免直接

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