DNA啟動(dòng)子、終止子

1、如何分析基因序列中的啟動(dòng)子、外顯子和內(nèi)含子生命科學(xué)學(xué)院?jiǎn)?dòng)子：RNA聚合酶特異性和結(jié)合的DNA序列。 啟動(dòng)子是基因的一個(gè)組成部分，控制基因表達(dá)的起始時(shí)間和表達(dá)的程度。外顯子：斷裂基因中的編碼序列。外顯子是真核生物基因的一部分，它在剪接后仍會(huì)被保存下來(lái)，并可在蛋白質(zhì)生物合成過(guò)程中被表達(dá)為蛋白質(zhì)。內(nèi)含子：斷裂基因的非編碼區(qū)，可被轉(zhuǎn)錄，但在mRNA加工過(guò)程中被剪切掉，故成熟mRNA上無(wú)內(nèi)含子編碼序列。怎樣利用互聯(lián)網(wǎng)中的網(wǎng)站或軟件分析該序列中的外顯子、內(nèi)含子和啟動(dòng)子呢？現(xiàn)有人基因組中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT.一、根據(jù)一段堿基序列一、根據(jù)一段堿基序列找到其對(duì)應(yīng)的基因名

2、或找到其對(duì)應(yīng)的基因名或其序列號(hào)其序列號(hào)任選瀏覽器搜索“NCBI”找到后點(diǎn)擊進(jìn)入，出現(xiàn)如上界面點(diǎn)擊“BLAST”（Basic Local Alignment Search Tool, BLAST）當(dāng)出現(xiàn)如上界面時(shí)，點(diǎn)擊“nucleotide blast” 打開(kāi)頁(yè)面后，在檢索框中輸入需要查找的序列，如圖所示根據(jù)索要查詢(xún)的基因來(lái)源，選定需要查詢(xún)的基因（人類(lèi)基因）點(diǎn)擊“BLAST”打開(kāi)u出現(xiàn)頁(yè)面后向下滑動(dòng)直至出現(xiàn)圖1u尋找Ident(一致性）最高的一項(xiàng)u點(diǎn)擊進(jìn)入點(diǎn)擊進(jìn)入后見(jiàn) 所查序列名稱(chēng) 以及序列號(hào) 據(jù)此進(jìn)行操作二、已知基因的基因名或序列號(hào)找到其啟動(dòng)子、外顯子和內(nèi)含子1 1、輸入網(wǎng)址進(jìn)入、輸入網(wǎng)址進(jìn)入

3、UCSCUCSC網(wǎng)站網(wǎng)站2 2、點(diǎn)擊、點(diǎn)擊Genome BrowserGenome Browser3 3、點(diǎn)擊進(jìn)入后可看到以下頁(yè)面、點(diǎn)擊進(jìn)入后可看到以下頁(yè)面（1 1）選擇是何種生物的基因（如人類(lèi)，老鼠等）選擇是何種生物的基因（如人類(lèi)，老鼠等）（2）輸入你所需要查詢(xún)的基因名）輸入你所需要查詢(xún)的基因名稱(chēng)稱(chēng)輸入完畢，點(diǎn)擊輸入完畢，點(diǎn)擊SUBMITSUBMIT4 4、可看到以下頁(yè)面、可看到以下頁(yè)面（1 1）將）將Ensembl GenesEnsembl Genes設(shè)置為設(shè)置為densedense（顯示）（顯示）（2 2）點(diǎn)擊）點(diǎn)擊refreshrefresh5 5、可看到以下頁(yè)面、可看到以下頁(yè)面找到找

4、到Ensembl Genes Ensembl Genes 點(diǎn)擊所對(duì)應(yīng)的序列圖形點(diǎn)擊所對(duì)應(yīng)的序列圖形6 6、可看到以下頁(yè)面、可看到以下頁(yè)面繼續(xù)點(diǎn)擊所對(duì)應(yīng)的序列圖繼續(xù)點(diǎn)擊所對(duì)應(yīng)的序列圖形形7 7、可看到以下頁(yè)面、可看到以下頁(yè)面選擇選擇Genomic Genomic Sequence Sequence8 8、可看到以下頁(yè)面、可看到以下頁(yè)面（2 2）選擇表現(xiàn)形式（如）選擇表現(xiàn)形式（如外顯子大寫(xiě)，其余都小寫(xiě)）外顯子大寫(xiě)，其余都小寫(xiě)）（1 1）根據(jù)需要選擇所要展現(xiàn)）根據(jù)需要選擇所要展現(xiàn)的內(nèi)容（如外顯子、內(nèi)含子）的內(nèi)容（如外顯子、內(nèi)含子）（3 3）點(diǎn)擊）點(diǎn)擊submitsubmit9 9、可看到以下頁(yè)面、可看到以下頁(yè)面此為此為HBBHBB基因的全部序列基因的全部序列第一第一段段大寫(xiě)大寫(xiě)部分為第一部分為第一個(gè)個(gè)外顯子外顯子。第一個(gè)外顯第一個(gè)外顯子子前面的所前面的所有小寫(xiě)部分有小寫(xiě)部分為該序列的為該序列的啟動(dòng)子啟動(dòng)子。大寫(xiě)部分之大寫(xiě)部分之間間夾雜的小夾雜的小寫(xiě)部分寫(xiě)部分為該為該序列的序列的內(nèi)含內(nèi)含子子。三、檢驗(yàn)所得序列是目的序列1 1、驗(yàn)證、驗(yàn)證利用利用wordword輸入我們所得到序列的第一個(gè)外顯子輸入我們所得到序列的第一個(gè)外顯子的部分序列進(jìn)行驗(yàn)證，看是否與原題序列匹配的部分序列進(jìn)行驗(yàn)證，看是否與原題序列匹配驗(yàn)證完成后，確認(rèn)