基因檢測報告

1、基因檢測報告基因檢測報告this model paper was revised by linda on december 15, 2012. 上海澳斯泰醫(yī)學檢驗所 基因檢測報告患者姓名：樣品編號：送檢單位：委托人：聯(lián)系電話：委托日期： 2014年11月21日接收日期： 2014年11月24日報告日期： 2014年11月26日樣本提供者信息樣本編號：病理號：病區(qū)：床號：19科室：胸外科姓名：性別：女出生日期：1950年7月22日臨床診斷：樣本種類：新鮮組織 樣品數(shù)量：1 檢測項目內(nèi)容檢測項目1：腫瘤個體化治療療效相關(guān)融合基因檢測1. 檢測內(nèi)容：eml4-alk融合基因2. 檢測方法：實時定量逆

2、轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng) (qrt-pcr)3. 主要材料：abi熒光定量試劑盒源奇生物腫瘤相關(guān)融合基因檢測試劑盒4. 主要設(shè)備：abi 7300熒光定量pcr儀檢測項目2：腫瘤個體化治療療效相關(guān)基因突變檢測1. 檢測內(nèi)容：egfr基因突變2. 檢測方法：dna 測序法、arms法3. 主要材料：abi pcr測序試劑盒，源奇生物熒光+測序相關(guān)基因檢測試劑盒4. 主要設(shè)備：abi 3730xl dna測序儀、abi 7300熒光pcr儀檢測項目及結(jié)果實驗員: 報告人：復(fù)核人：報告時間：2014年11月26日注：此檢測結(jié)果只對本次送檢樣本負責。由于腫瘤疾病的發(fā)生和發(fā)展是動態(tài)過程，因此若是樣品采集一定間隔

3、時間后（3個月以上）的跟蹤檢測或者進行治療方案的評估，建議遵醫(yī)囑。 注：以上分析僅用于評估個體化用藥的適用程度，具體的治療方案須由臨床主治醫(yī)生決定。 如有任何疑問，請聯(lián)系相關(guān)負責人。 檢測結(jié)果附圖及解讀 一、腫瘤相關(guān)融合基因檢測結(jié)果abl-內(nèi)參eml4-alk 融合基因二、egfr基因突變檢測結(jié)果egfr exon19 基因egfr exon20 基因陽性對照標本陰性對照陽性對照陰性對照標本 egfr exon21 基因egfr 790 基因 內(nèi)參基因附：參考資料陽性對照陰性對照陽性對照標本陰性對照陽性對照標本陰性對照 1. egfr信號通路及通路上各靶標基因突變簡介 表皮生長因子受體（epi

4、dermalgrowthfactorreceptor，egfr）主要位于細胞膜上，屬受體酪氨酸激酶家族。egfr被配體激活后啟動胞內(nèi)該通路上的信號傳導(dǎo)，經(jīng)過細胞質(zhì)中銜接蛋白、酶的級聯(lián)反應(yīng)，調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子激活基因的轉(zhuǎn)錄，指導(dǎo)細胞遷移、黏附、增殖、分化和凋亡1。egfr下游的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路主要有兩條（如下圖）：一條是ras/raf/mek/erk-mapk通路，而另一條是pi3k/akt/mtor通路2。研究表明，在許多實體腫瘤中存在egfr信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路上的基因發(fā)生體細胞突變及表達異常，從而導(dǎo)致腫瘤細胞無限制的擴增和遷移。因此，近年以egfr和egfr信號通路中關(guān)鍵的組分為靶標的分子靶標檢測及靶向治療

5、成為國際腫瘤界個體化治療關(guān)注的焦點。參考文獻1. cunningham d et al. j med. 2004;351:33745.2. stintzing s et al. dtsch arztebl int. 2009;106:2026.egfr基因目前，針對egfr所開發(fā)的分子靶向藥物主要分兩類:1）小分子酪氨酸激酶抑制劑(tki)，如吉非替尼（gefitinib，也稱為易瑞沙/iressa，阿斯利康）和厄羅替尼（erlotinib，也稱為特羅凱/tarceva，羅氏制藥)，抑制egfr胞內(nèi)區(qū)酪氨酸激酶活性；2）單克隆抗體(mab)，如西妥昔（cetuximab，也稱為愛必妥/erbi

6、tux，默克公司）和帕尼單抗（panitumumab，也稱為維克替比/vectibix，安進公司)，與egfr胞外區(qū)結(jié)合，阻斷依賴于配體的egfr活化。上述藥物通過不同途徑阻斷egfr介導(dǎo)的細胞內(nèi)信號通路，從而抑制腫瘤生長、轉(zhuǎn)移和血管生成，并促進腫瘤細胞凋亡，提高放化療敏感性。egfr酪氨酸激酶抑制劑（egfr-tki），吉非替尼和厄羅替尼已被fda批準用于治療晚期非小細胞肺癌（nsclc）。這些靶向藥物已應(yīng)用于晚期和不適宜傳統(tǒng)化療方案的nsclc患者 的臨床治療。但是，臨床運用結(jié)果表明這些靶向藥物僅對部分患者有效。進一步的研究發(fā)現(xiàn)egfr基因外顯子19和21的突變（體細胞突變）是患者對此類靶

7、向藥物有效的必要前提1。2004年，美國哈佛醫(yī)學院的研究人員lynch等率先報道，肺癌細胞中有egfr酪氨酸激酶基因編碼區(qū)外顯子19缺失或外顯子21突變的患者，靶向藥物易瑞沙的有效率高達80以上2。臨床研究表明，egfr突變分布與臨床上egfr-tki治療的優(yōu)勢人群相一致，主要見于女性、腺癌、非吸煙者及亞裔患者3。然而，一部分對egfr-tki治療有效的患者最終都會對egfr-tki 產(chǎn)生耐藥性。進一步臨床研究還表明，egfr基因外顯子20的體細胞突變是egfr-tki繼發(fā)耐藥的主要機制之一4。外顯子20的突變類型主要是第790位密碼子出現(xiàn)ct的轉(zhuǎn)換，引起egfr蛋白中該位點的氨基酸由蘇氨酸轉(zhuǎn)

8、變?yōu)榧琢虬彼?(t790m)。這一突變僅見于藥物治療后復(fù)發(fā)者，突變使得非小細胞肺癌患者對吉非替尼和厄羅替尼產(chǎn)生抗性。美國國家癌癥綜合網(wǎng)絡(luò)(nccn)2009年版的臨床指南5中明確指出：egfr突變，尤其是外顯子19缺失突變與腫瘤對tkis如吉非替尼的敏感度有重要關(guān)系。所以egfr的活化突變能夠被用來為這些患者選擇最好的治療方法。參考文獻h et cancer res2006;12:3915-21.s et engl j ;359:366-77.2.eml4-alk 融合基因及耐藥棘皮動物微管相關(guān)蛋白樣(eml4)編碼蛋白n-末端部分融合至間變淋巴瘤激酶(alk)的細胞內(nèi)酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域，重排為

9、eml4-alk，導(dǎo)致異常酪氨酸激酶表達。2007年soda等首次在非小細胞肺癌患者術(shù)后標本中檢測到eml4-alk重排融合。shaw等研究表明，在限定篩選條件的人群中，eml4-alk融 合比例增高，如不吸煙或僅少量吸煙且無egfr突變者，eml4-alk陽性率高達33%，這也是迄今報道eml4-alk檢出率最高人群。這項研究的結(jié)果提示，上述這些egfr-tkis治療優(yōu)勢而不敏感人群實質(zhì)上蘊藏著新的分子事件。 2010年asco會議上報道的i期臨床研究結(jié)果顯示，82例存在eml4-alk融合的nsclc患者接受crizotinib治療(250 mg，bid)，90%出現(xiàn)腫瘤縮小，57%的患者

10、獲得客觀緩解。2011年asco會議上，shaw等更新了i期研究的生存數(shù)據(jù)：82例接受crizotinib治療的患者，1年生存率為77%，2年生存率為64%，中位os尚未達到。鑒于這種不俗的療效和輕微的不良反應(yīng)，eml4-alk融合的發(fā)現(xiàn)與治療突破被評為2011年臨床腫瘤界十大進展之一，而美國fda于2011年8月26日批準crizotinib上市，用于治療alk融合的nsclc患者。2012年nccn更新之一即為：對于非鱗nsclc患者，一線治療時建議檢測eml4-alk，若為陽性，推薦接受crizotinib治療。a8081005研究針對化療失敗并檢測到eml4-alk融合的nsclc患者，已于2012年4月份結(jié)束招募，全球共隨機818例，陽性率為%(818/3927)。2012年的asco年會上報道了最新的有效性及安全性數(shù)據(jù)：中為治療周期25周，orr為53%，12周的dcr為85%，中位pfs 個月。常見的不良反應(yīng)為視覺異常(50%)，惡心(46%)，嘔吐(39%)，腹瀉(35%，多為12級)。有146例患者在pd后仍繼續(xù)crizotinib治 療，多為單器官病灶的進展。53%的患者pd后crizotinib治療超過2周，中位pd后治療時間為10周，大多數(shù)患者有較好的體力