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文檔簡介

1、中山大學醫(yī)學圖書館數(shù)據(jù)庫檢索指南Sun Yat-sen University Library Guide SciFinder Scholar (CA)化學文摘網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫(學術(shù)版)一、數(shù)據(jù)庫介紹化學文摘是化學和生命科學研究領域中不可或缺的參考和研究工具,也是資料量最大,最具權(quán)威的出版物。網(wǎng)絡版化學文摘SciFinder Scholar,更整合了Medline醫(yī)學數(shù)據(jù)庫、歐洲和美國等30幾家專利機構(gòu)的全文專利資料、以及化學文摘1907年至今的所有內(nèi)容。它涵蓋的學科包括應用化學、化學工程、普通化學、物理、生物學、生命科學、醫(yī)學、聚合體學、材料學、地質(zhì)學、食品科學和農(nóng)學等諸多領域。SciFinder

2、Scholar可檢索數(shù)據(jù)庫包括: 數(shù)據(jù)庫內(nèi)容 Reference Databases (文獻數(shù)據(jù)庫)CAPLUSSM包含來自150 多個國家、9000 多種期刊的文獻,覆蓋1907 年到現(xiàn)在的所有文獻以及部分1907 年以前的文獻,包括有期刊、專利、會議錄、論文、技術(shù)報告、書等,涵蓋化學、生化、化學工程以及相關(guān)學科,還有尚未完全編目收錄的最新文獻。(目前2,430 萬條參考書目記錄,每天更新3000 條以上)MEDLINE 包含來自70 多個國家、3900 多種期刊的生物醫(yī)學文獻,覆蓋1951 到現(xiàn)在的所有文獻,以及尚未完全編目收錄的最新文獻。(目前1300 萬參考書目記錄,每周更新4 次)

3、Structure Database (結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫)REGISTRYSM涵蓋從1957 年到現(xiàn)在的特定的化學物質(zhì)。REGISTRY 包括了在CASM中引用的物質(zhì)以及特定的注冊。(目前7400 萬條物質(zhì)記錄,每天更新約7 萬條,每種化學物質(zhì)有唯一對應的CAS 注冊號) Reaction Database (反應數(shù)據(jù)庫)CASREACT 包括從1907 年到現(xiàn)在的單步或多步反應信息。CASREACT 中的反應包括CAS 編目的反應以及下列來源:ZIC/VINITI 數(shù)據(jù)庫,INPI1986 年以前的數(shù)據(jù),以及由教授Klaus Kieslich 博士指導編輯的生物轉(zhuǎn)化數(shù)據(jù)庫。(目前800 萬條反應記

4、錄和403,000 條文獻記錄 ,每周更新約700-1300 條) Commercial Sources Database (商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫)CHEMCATS 化學品的來源信息,包括化學品目錄手冊以及圖書館等內(nèi)的供應商的地址、價格等信息。(目前740 萬條商業(yè)化學物質(zhì)記錄,來自655 家供應商的793 種目錄) Regulatory Database ( 管制數(shù)據(jù)庫)CHEMLIST 1979 年到現(xiàn)在的管制化學品的信息,包括物質(zhì)的特征、詳細目錄、來源以及許可信息等。(22.8 萬種化合物的詳細清單,來自13 個國家和國際性組織,每周更新50 條新記錄)我校也購有CA光盤版,包括1997年至2

5、003年5月的數(shù)據(jù)。 二、SciFinder Scholar (CA)客戶端程序的安裝和運行SciFinder Scholar (CA)數(shù)據(jù)庫初次使用需要運行安裝客戶端程序,其安裝步驟如下:(一)安裝客戶端程序 (1) 客戶端程序地址:4/sfs-new.rar,對文件 sfs-new.rar 進行解壓縮,可看到ViewerLite5_04.exe, SFS2004-2.exe和site.prf三個文件* 對于曾下載并安裝sfs舊版本的用戶:sfs2004-2.exe文件為原來的sfs2004.exe的更新版本,用戶只需在卸載原程序sfs2004.exe程序后

6、安裝程序更新版本sfs2004-2.exe到原安裝目錄文件夾內(nèi)。 * 對于未曾下載sfs舊版本的用戶:可按照接下來的步驟進行安裝;1. 關(guān)閉其他應用程序。2. 運行SFS2004-2.exe,按照系統(tǒng)的提示安裝客戶端軟件。建議選用典型安裝。3. 安裝過程中系統(tǒng)提問“Do you have a disk labeled custom site files?”時,請選擇“否”。其它選擇項默認,完成客戶端軟件SFS2004-2.exe的安裝。(二)配置客戶端軟件將解壓縮后得到的文件site.prf復制到客戶端軟件安裝的目錄區(qū)內(nèi)(默認路徑為C:SFSCHLR)。如果用戶在安裝過程中選擇了其他路徑,請注

7、意路徑和目錄。(三)安裝ViewerLiteViewerLite是一個觀看三維結(jié)構(gòu)的工具,在SciFinder Scholar檢索出的物質(zhì)結(jié)果中,有很多都是提供3D視圖的,如果安裝了ViewerLite,直接點擊物質(zhì)名上的三維圖像按鈕即可查看。用戶可自行選擇是否安裝:運行解壓縮后得到的文件ViewerLite5_04.exe,按系統(tǒng)提示完成安裝。(四)訪問SciFinder Scholar數(shù)據(jù)庫(1) 專線訪問。(2) 運行SciFinder Scholar客戶端程序:開始程序SciFinder Scholar 2004 EditionSciFinder Scholar(3)開始檢索。(五)需

8、經(jīng)由代理訪問的IP使用 SciFinder Scholar 方法凡非正式IP,需經(jīng)由代理服務器訪問校外網(wǎng)絡的用戶,經(jīng)與學校網(wǎng)絡中心的老師溝通,目前只能通過架設代理層訪問SciFinder Scholar。步驟如下:(1) 下載 SocksCap 軟件并安裝,SocksCap 需要定期更新,請留意更新時間。目前提供其一下載地址:SocksCaP(4/sc32r237.exe)(2) 啟動 SocksCap 軟件,F(xiàn)ile中選擇“Setting”,在 SOCKS Server 中填寫所使用的代理服務器,如;在Port中填寫端口,如

9、1080。(因各校區(qū)代理服務器地址和端口各不相同,請用戶查閱網(wǎng)絡中心發(fā)的校園網(wǎng)用戶管理手冊)。 Protocol選擇 SOCKS 5,其他默認。(3) 啟動 SocksCap 軟件,點擊“New”,出現(xiàn)“新運行程序”對話框后,點擊“Browse.”,在彈出選擇框內(nèi)選擇在客戶端軟件所安裝的目錄區(qū)(默認路徑為C:SFSCHLR),然后在其中選擇 sfschlr.exe 程序,然后確定即可。在 SocksCap 內(nèi)運行 sfschlr 即進行連接。注意:本數(shù)據(jù)庫并發(fā)用戶為5人,北校區(qū)等通過代理訪問的用戶連接速度較慢,如果暫時連接不上,請耐心等候。三、SciFinder Scholar 使用的簡單介紹

10、:(一) 進入數(shù)據(jù)庫雙擊SciFinder Scholar圖標,在License Agreement的彈出窗口中,用戶選擇Accept按鈕, 關(guān)掉Message of day的彈出窗口,就進入了Science Finder Scholar的Explore主檢索界面,見圖2。點擊工具條的第一個圖標New task,也可以得到Explore界面,見圖1。工具條包括常用的一些功能:新任務,后退,向前,打印,保存,全文獲取,參數(shù)設置,數(shù)據(jù)庫,歷史紀錄,網(wǎng)址,幫助,退出程序。參數(shù)設置新任務數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址圖1 公司名稱和研究機構(gòu)瀏覽目錄研究主題文獻情報著者姓名化學物質(zhì)或化學反應圖2 (二) SciFinder

11、 Scholar的檢索方法SciFinder Scholar提供六種基本檢索途徑(見圖二),下面簡要介紹各種途徑的使用:1、 化學物質(zhì)或化學反應(Chemical Substance or Reaction)用戶可以選擇三種途徑檢索: 化學結(jié)構(gòu)式(Chemical Structure)您可以在CAS的2200萬種有機和無機物質(zhì)的注冊中,查找結(jié)構(gòu)匹配項。要按結(jié)構(gòu)檢索,只需使用結(jié)構(gòu)繪圖窗口繪制、導入或者“粘貼”您要檢索的化學結(jié)構(gòu)。如圖3,畫出Ibuprofen 的結(jié)構(gòu),單擊“Get Substances(獲取化學物質(zhì))”,然后選擇確切的匹配項或相關(guān)結(jié)構(gòu),單擊OK。圖3您可單擊CAS注冊號上方顯示的

12、任何按鈕,查看相關(guān)物質(zhì)的更多信息。點擊AB,彈出窗口,選擇該物質(zhì)在反應中的位置,如選擇Product,則將Ibuprofen作為產(chǎn)物的反應檢索出來。如下圖4:獲取反應管制化學品商業(yè)來源信息物質(zhì)的引文物質(zhì)的3D 模型圖4圖5也可以點擊反應式中的任何物質(zhì)獲取更多信息,如果點擊Reactions,則彈出選項,這里我們選擇了Substance Detail,提供CAS Registry 記錄,點擊其中的超鏈接,可以查看得到此結(jié)果的參考文獻內(nèi)容。圖5、6。Get References 可以獲取相關(guān)文獻,Analyze/Refine 可以對結(jié)果進行分析或二次檢索。圖6您可以通過繪制化學結(jié)構(gòu),限定反應中的作

13、用,從700多萬種反應中查找相匹配的信息。使用結(jié)構(gòu)繪圖板繪制您的反應查詢。添加反應箭頭,制定反應參與項的作用。請單擊“Get Reaction(獲取反應)”。單擊任何反應參與項,獲得該物質(zhì)的更多詳情。要確認該物質(zhì)是否已投入市場、購買地點、銷售價格,請單擊“Commercial Sources(商業(yè)資源)”。您將看到供應商列表。單擊“顯微鏡”圖標,屏幕將提供有關(guān)供應商的詳細信息,包括地址、電話、傳真號碼、電子郵件地址等連連信息。如果您選擇部分結(jié)構(gòu)檢索功能,SciFinder Scholar為您提供新的結(jié)構(gòu)檢索可能性。使用機構(gòu)繪圖板繪制相關(guān)子結(jié)構(gòu)。定義立體結(jié)合、環(huán)狀構(gòu)造、鏈鎖結(jié)構(gòu)、替換和取待基團。

14、單擊“Get Substances(獲取物質(zhì))”并指定子結(jié)構(gòu)。單擊OK。如果結(jié)構(gòu)繪圖包含立體結(jié)構(gòu)。SciFinder Scholar將通過與您的查詢進行比較自動分析您的答案。選擇所需的組要進一步精確查明答案,單擊“Analyze/Refine(分析/精調(diào))”?!癆nalyze”為您提供若干選項。例如可選擇“Ring Skeletons(環(huán)狀構(gòu)造)”。單擊OK。SciFinder Scholar將根據(jù)同一環(huán)狀構(gòu)造中特定的原子和結(jié)合,對答案集中的物質(zhì)進行分析和分組。 物質(zhì)標識符 (Substance Identifier)您可以從2200萬種有機和無機的物質(zhì)中按化學名稱或CAS注冊號查找相關(guān)物質(zhì)。

15、通過物質(zhì)標識符進行檢索,輸入一個或多個通用名稱、物質(zhì)別名或CAS注冊號,例如:50-00-0;Acetaminophen,單擊OK。SciFinder Scholar將檢索與您的物質(zhì)標識符相對應的CAS注冊記錄。 分子式 (Molecular Formula)通過分子式進行檢索,SciFinder Scholar 會分析您所輸入的分子式,并重新編排原子,使之成為能被計算機識別的Hill System Order,搜索CAS Registry 數(shù)據(jù)庫,并顯示匹配結(jié)果;如果輸入的原子是模糊的,則彈出窗口提示修改,如元素符號的上標、下表,元素符號之間以空格隔開等(多數(shù)情況下會自動修正);如果是多組分

16、的物質(zhì)如聚合物,鹽類等,則各個組分之間以英文的句號 . 隔開。如Component1.Component2。2、 研究主題(Research Topic)您可以使用描述相關(guān)主題的詞句或詞語,查找CAS數(shù)據(jù)庫中的2300萬參考文獻和MEDLINE中的1340萬種參考文獻。在“Explore by Research Topic”框中輸入描述您的研究主題的單詞或短語,例如:the effect of antibiotic residues on dairy products。選擇Additional Options按鈕可以從出版年、文獻類型、語種、著者、公司名稱五個方面進行限制。Remove Opt

17、ions按鈕可以回到原來的簡單主題檢索。得到若干候選主題主題詞之間的邏輯組配,見圖7??蛇M行多選。選擇合適主題,單擊Get Reference以檢索全部參考文獻。圖7圖8截取了部分相關(guān)文獻結(jié)果,單擊右邊有“顯微鏡”的圖標,可以查看完整的書目詳情及相關(guān)參考文獻的摘要。單擊“電腦”圖標,可以查看全文。SciFinder Scholar通過ChemPort連接雜志和專利原文。如果是已經(jīng)訂閱或開放的電子文獻,就可以直接查看全文,當然也有可能出現(xiàn)要求付費才能查看的頁面。Chemport提供了SciFinder收錄的100多年來的許多期刊的全文鏈接,其中核心期刊1870余種(即每一期每篇文章都有鏈接,最新

18、的核心期刊列表請訪問/sent.html 查看)SciFinder Scholar 是每天更新的數(shù)據(jù)庫,所以很多最新的全文鏈接也一直被添加進來。SciFinder Scholar中包含了近五百萬條專利記錄,其涵蓋范圍請參看/EO/caspat.html 。大部分專利全文都可以在網(wǎng)上免費獲得,Chemport也提供了相應的鏈接。文摘全文圖8Analyze/Refine按鈕,可以Analyze對所選文獻按照年、機構(gòu)來源、著者等進行分析得到直方圖(histogram);或者Refine從研究主題、機構(gòu)名稱、著者名稱、出版年、文獻類型

19、、語種、數(shù)據(jù)庫、是否可獲取全文八個方面對已有的結(jié)果進行二次檢索。Get Related可以查看關(guān)聯(lián)信息:所選文獻引用的文獻(Cited Reference),引用所選文獻的文獻(Citing Reference), 所選文獻中的物質(zhì)(Substance), 所選文獻中的反應(Reactions),eScience 可以將您的檢索擴展到整個網(wǎng)絡。3、 著者姓名(Author Name)1907年至今化學和相關(guān)領域內(nèi)任何作者出版的研究文獻,均可通過SciFinder Scholar檢索。輸入作者姓名時,請記住一定要輸入姓氏(Last Name),名字或中間名是可選項。SciFinder Schol

20、ar將提供您所需作者姓名的所有姓氏,包括其它拼寫。對于復姓如OSullivan, Chace-Scott, or Johnson Taylor可直接輸入;如果帶有元音變音的,輸入字母即可,或在后面接一個e,會同時搜索名、姓以及姓、名;對于不確認的名,可以輸入首字母。4、 文件標識(Document Identifier)如果您可提供專利號,SciFinder Scholar能夠?qū)⒛B接到其電子版本。用專利號進行檢索,單擊“Document Identifier(文獻情報)”,在檢索框中鍵入專利號,一次可輸入多個,分行輸入。也可以按單擊“Read from file”按鈕從文件中導入專利號。單擊

21、“顯微鏡”圖標,可以查看專利的詳情。單擊“電腦”圖標,可以通過ChemPort Connection SM鏈接至網(wǎng)站中的電子版專利。下表列出了一些常用的文件標識:NumberExamplesCA Accession Number120:152971994:15297Patent numberCA 2107100Patent application numberJP 1992-502228Priority application numberIT 1998-BO661PubMed ID(National Library of Medicine)20041235、 公司名稱和研究機構(gòu)(Company Name/Organization)SciFinder Scholar讓您可輕易地尋找所在研究領域的競爭對手或同事。要按公司或組織進行檢索,單擊“Company Name/Organization”,輸入您要檢索的組織名稱。要查找該組織是否針對相關(guān)主題進行了研究,請使用SciFinder Sch

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