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資料收集于網(wǎng)絡(luò) 如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系網(wǎng)站 刪除 謝謝 PartI 生化名解1.肽單元(peptide unit): 參與肽鍵的6個(gè)原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位于同一平面,Ca1和Ca2在平面上所處的位置為反式構(gòu)型,此同一平面上的6個(gè)原子構(gòu)成了肽單元,它是蛋白質(zhì)分子構(gòu)象的結(jié)構(gòu)單元。Ca是兩個(gè)肽平面的連接點(diǎn),兩個(gè)肽平面可經(jīng)Ca的單鍵進(jìn)行旋轉(zhuǎn),NCa、CaC是單鍵,可自由旋轉(zhuǎn)。2.結(jié)構(gòu)域(domain):分子量大的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)常可分割成1個(gè)和數(shù)個(gè)球狀或纖維狀的區(qū)域,折疊得較為緊密,具有獨(dú)立的生物學(xué)功能,大多數(shù)結(jié)構(gòu)域含有序列上連續(xù)的100200個(gè)氨基酸殘基,若用限制性蛋白酶水解,含多個(gè)結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)常分成數(shù)個(gè)結(jié)構(gòu)域,但各結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象基本不變。3.模體(motif):在許多蛋白質(zhì)分子中,二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象。一個(gè)模序總有其特征性的氨基酸序列,并發(fā)揮特殊功能,如鋅指結(jié)構(gòu)。4.蛋白質(zhì)變性(denaturation):在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失。主要發(fā)生二硫鍵與非共價(jià)鍵的破壞,不涉及一級(jí)結(jié)構(gòu)中氨基酸序列的改變,變性的蛋白質(zhì)易沉淀,沉淀的蛋白質(zhì)不一定變性。5.蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(isoelectric point, pI):當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兼性離子,蛋白質(zhì)所帶的正負(fù)電荷相等,凈電荷為零,此時(shí)溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。6.酶(enzyme):酶是一類對(duì)其特異底物具有高效催化作用的蛋白質(zhì)或核酸,通過降低反應(yīng)的活化能催化反應(yīng)進(jìn)行。酶的不同形式有單體酶,寡聚酶,多酶體系和多功能酶,酶的分子組成可分為單純酶和結(jié)合酶。酶不改變反應(yīng)的平衡,只是通過降低活化能加快反應(yīng)的速度。(不考)7.酶的活性中心(active center of enzymes): 酶分子中與酶活性密切相關(guān)的基團(tuán)在空間結(jié)構(gòu)上彼此靠近,組成具有特定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,能與底物特異結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。參與酶活性中心的必需基團(tuán)有結(jié)合底物,使底物與酶形成一定構(gòu)象復(fù)合物的結(jié)合基團(tuán)和影響底物中某些化學(xué)鍵穩(wěn)定性,催化底物發(fā)生化學(xué)反應(yīng)并將其轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的催化基團(tuán)。活性中心外還有維持酶活性中心應(yīng)有的空間構(gòu)象的必需基團(tuán)。8.酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)(allosteric regulation of enzymes):一些代謝物可與某些酶分子活性中心外的某部分可逆地結(jié)合,使構(gòu)象改變,從而改變酶的催化活性,此種調(diào)節(jié)方式稱酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)。被調(diào)節(jié)的酶稱為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶,使酶發(fā)生變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì),稱為變構(gòu)效應(yīng)劑,包括變構(gòu)激活劑和變構(gòu)抑制劑。9.酶的共價(jià)修飾(covalent modification of enzymes):在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價(jià)結(jié)合,從而改變酶的活性,此過程稱為共價(jià)修飾。主要包括:磷酸化去磷酸化;乙酰化脫乙?;?;甲基化去甲基化;腺苷化脫腺苷化;SH與SS互變等;磷酸化與脫磷酸是最常見的方式。10.酶原和酶原激活(zymogen and zymogen activation):有些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時(shí)只是酶的無活性前體,必須在一定的條件下水解開一個(gè)或幾個(gè)特定的肽鍵,使構(gòu)象發(fā)生改變,表現(xiàn)出酶的活性,此前體物質(zhì)稱為酶原。 由無活性的酶原向有活性酶轉(zhuǎn)化的過程稱為酶原激活。酶原的激活,實(shí)際是酶的活性中心形成或暴露的過程。11.同工酶(isoenzyme isozyme):催化同一化學(xué)反應(yīng)而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu),理化性質(zhì),以及免疫學(xué)性質(zhì)都不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。由同一基因或不同基因編碼,同工酶存在于同一種屬或同一個(gè)體的不同組織或同一細(xì)胞的不同亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中,它使不同的組織、器官和不同的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)具有不同的代謝特征。12.糖酵解(glycolysis):在機(jī)體缺氧條件下,葡萄糖經(jīng)一系列酶促反應(yīng)生成丙酮酸進(jìn)而還原生成乳酸的過程稱為糖酵解(糖的無氧氧化)。糖酵解的反應(yīng)部位在胞漿。主要包括由葡萄糖分解成丙酮酸的糖酵解途徑和由丙酮酸轉(zhuǎn)變成乳酸兩個(gè)階段,1分子葡萄糖經(jīng)歷4次底物水平磷酸化,凈生成2分子ATP。關(guān)鍵酶主要有己糖激酶,6-磷酸果糖激酶-1和丙酮酸激酶。它的意義是機(jī)體在缺氧情況下獲取能量的有效方式;某些細(xì)胞在氧供應(yīng)正常情況下的重要供能途徑。13.糖異生(gluconeogenesis):是指從非糖化合物(乳酸、甘油、生糖氨基酸等)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛱窃倪^程,主要在肝、腎細(xì)胞的胞漿及線粒體。關(guān)鍵酶主要有丙酮酸羧化酶,磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶,果糖雙磷酸酶-1和葡萄糖-6-磷酸酶。糖異生主要生理作用是維持血糖水平的恒定,糖異生也是補(bǔ)充或恢復(fù)肝糖原儲(chǔ)備的重要途徑。14.底物水平磷酸化(substrate level phosphorylation):物質(zhì)在脫氫或脫水的過程中,偶聯(lián)生成高能鍵,底物分子內(nèi)部能量重新分布,使ADP(GDP)磷酸化生成ATP(GTP)的過程。15.乳酸循環(huán)(lactate cycle or cori cycle):肌收縮(尤其是供氧不足時(shí))通過糖酵解生成乳酸。肌內(nèi)糖異生活性低,所以乳酸通過細(xì)胞膜彌散進(jìn)入血液后,再入肝,在肝內(nèi)異生為葡萄糖。葡萄糖釋入血液后又可被肌攝取,這就構(gòu)成了一個(gè)循環(huán),此循環(huán)稱為乳酸循環(huán),也稱Cori循環(huán),生理意義:乳酸再利用,避免了乳酸的損失,防止乳酸的堆積引起酸中毒,間接調(diào)節(jié)血糖。16.脂肪動(dòng)員(fat mobilization):是指儲(chǔ)存在脂肪細(xì)胞中的脂肪,被脂肪酶逐步水解為FFA及甘油,并釋放入血以供其他組織氧化利用的過程。在脂肪動(dòng)員中,激素敏感性三酰甘油脂肪酶(HSL)是限速酶。17.脂肪酸的-氧化(-oxidation of fatty acid):脂酰CoA進(jìn)入線粒體基質(zhì)后,在脂肪酸的-氧化多酶復(fù)合體的催化下從脂?;?碳原子開始,進(jìn)行脫氫、加水、再脫氫、硫解四步連續(xù)反應(yīng),脂酰基斷裂生成一分子乙酰CoA及一分子比原來少兩個(gè)碳原子的脂酰CoA,此過程即脂肪酸的-氧化。在胞液、線粒體中反應(yīng),除腦組織外,大多數(shù)組織均可進(jìn)行, 其中肝、肌肉最活躍。肉堿脂酰轉(zhuǎn)移酶是脂肪酸-氧化的限速酶。18.酮體(ketone bodies):在肝細(xì)胞線粒體中以-氧化生成的乙酰CoA為原料轉(zhuǎn)化成乙酰乙酸、-羥丁酸和丙酮,三者統(tǒng)稱為酮體。是脂肪酸在肝中分解的正常中間代謝產(chǎn)物,供肝外組織利用,是肝臟輸出能源的一種形式。過量則導(dǎo)致酮癥酸中毒等疾病。19.呼吸鏈(respiratory chain):在生物氧化過程中,代謝物脫下的成對(duì)氫原子(2H)通過線粒體上多種酶和輔酶所催化的連鎖反應(yīng)的逐步傳遞,最終與氧結(jié)合生成水,并偶聯(lián)ATP的生成,這一系列酶和輔酶稱為呼吸鏈,又稱電子傳遞鏈(electron transfer chain)。20.氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation):是指代謝物脫下的成對(duì)氫原子(2H)在呼吸鏈電子傳遞過程中偶聯(lián)ADP磷酸化并生成ATP,最終與氧結(jié)合生成水,又稱為偶聯(lián)磷酸化。氧化磷酸化是體內(nèi)生成ATP的主要方式。21.氮平衡(nitrogen balance): 攝入食物的含氮量與排泄物(尿與糞)中含氮量之間的關(guān)系,包括氮總平衡、氮正平衡、氮負(fù)平衡三種平衡,可以反映體內(nèi)蛋白質(zhì)代謝的概況。(不考)22.氨基酸代謝庫(kù)(metabolic pool):食物蛋白經(jīng)消化吸收的氨基酸(外源性氨基酸)與體內(nèi)組織蛋白降解產(chǎn)生的氨基酸(內(nèi)源性氨基酸)混在一起,分布于體內(nèi)各處參與代謝,稱為氨基酸代謝庫(kù)。23.-磷酸甘油穿梭(-glycerophosphate shuttle):在哺乳動(dòng)物的腦、骨骼肌中,當(dāng)胞液的NADH較多時(shí),在胞液中磷酸甘油脫氫酶的作用下,使磷酸二羥丙酮還原成磷酸甘油,后者通過線粒體外膜,再經(jīng)位于線粒體內(nèi)膜胞液側(cè)的磷酸甘油脫氫酶的催化下,氧化生成磷酸二羥丙酮和FADH2。磷酸二羥丙酮可傳出線粒體外膜至胞液繼續(xù)進(jìn)行穿梭,而FADH2則進(jìn)入琥珀酸氧化呼吸鏈同時(shí)生成1.5molATP。(1、存在于腦和骨骼??;2、過程可用圖示;3、NADH被轉(zhuǎn)運(yùn)入線粒體進(jìn)行氧化磷酸化;4、最終生成1.5molATP)24.蘋果酸-天冬氨酸穿梭 (malate-asparate shuttle):該穿梭機(jī)制存在于心肌和肝中,胞液中的NADH在蘋果酸脫氫酶的作用下,使草酰乙酸還原生成蘋果酸,后者通過線粒體內(nèi)膜上的-酮戊二酸載體進(jìn)入線粒體,又在線粒體內(nèi)蘋果酸脫氫酶的作用下重新生成草酰乙酸和NADH。NADH進(jìn)入NADH氧化呼吸鏈,生成2.5molATP。線粒體內(nèi)的草酰乙酸經(jīng)谷草轉(zhuǎn)氨酶的作用生成天冬氨酸,后者經(jīng)酸性氨基酸載體轉(zhuǎn)運(yùn)出線粒體,再轉(zhuǎn)變成草酰乙酸,繼續(xù)進(jìn)行穿梭。(1、存在于肝和心??;2、過程可用圖示;3、NADH被轉(zhuǎn)運(yùn)入線粒體進(jìn)行氧化磷酸化;4、最終生成2.5molATP)25.一碳單位(one carbon unit):某些氨基酸代謝過程中產(chǎn)生的只含有一個(gè)碳原子的基團(tuán)稱為一碳單位,其代謝的輔基是四氫葉酸。一碳單位參與嘌呤、胸腺嘧啶的合成,主要的一碳單位有甲基、甲烯基、甲炔基、甲?;蛠啺奔谆?,一碳單位主要來自絲氨酸,甘氨酸,組氨酸及色氨酸的分解代謝。26.甲硫氨酸循環(huán)(methionine cycle): 甲硫氨酸和ATP作用轉(zhuǎn)變成S-腺苷甲硫氨酸(SAM),SAM是甲基的直接供體,參與許多甲基化反應(yīng),與此同時(shí)產(chǎn)生S-腺苷同型半胱氨酸進(jìn)一步轉(zhuǎn)變成同型半胱氨酸,后者可接受N5CH3FH4的甲基重新生成甲硫氨酸,形成一個(gè)循環(huán)過程稱作甲硫氨酸循環(huán)。其生理意義是:SAM提供甲基以進(jìn)行體內(nèi)廣泛存在的甲基化反應(yīng);N5CH3FH4提供甲基合成甲硫氨酸,同時(shí)使N5CH3FH4的FH4釋放,再參與一碳單位的代謝。27.聯(lián)合脫氨基作用(transdeamination):兩種脫氨基方式的聯(lián)合作用,使氨基酸脫下-氨基生成-酮酸的過程,包括轉(zhuǎn)氨基偶聯(lián)氧化脫氨基作用和轉(zhuǎn)氨基偶聯(lián)嘌呤核苷酸循環(huán),既是氨基酸脫氨基的主要方式,也是體內(nèi)合成非必需氨基酸的重要方式。28.嘌呤核苷酸循環(huán)(purine nucleotide cycle):骨骼肌和心肌主要通過嘌呤核苷酸循環(huán)進(jìn)行脫氨基作用。氨基酸首先通過連續(xù)的轉(zhuǎn)氨基作用將氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移給草酰乙酸,生成天冬氨酸;天冬氨酸與次黃嘌呤核苷酸生成腺苷酸代琥珀酸,經(jīng)裂解生成AMP,AMP在腺苷酸脫氫酶催化下脫去氨基。由此可見,嘌呤核苷酸循環(huán)實(shí)際上也可以看成是另一種形式的聯(lián)合脫氨基作用。29.變構(gòu)調(diào)節(jié) (allosteric regulation):小分子化合物與酶分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)象變化,從而改變酶的活性,這種調(diào)節(jié)稱為酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)或別構(gòu)調(diào)節(jié)。被調(diào)節(jié)的酶稱為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶,使酶發(fā)生變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì),稱為變構(gòu)效應(yīng)劑,包括變構(gòu)激活劑和變構(gòu)抑制劑。30.化學(xué)修飾調(diào)節(jié):(chemicalmodification)酶蛋白肽鏈上某些殘基在酶的催化下發(fā)生可逆的共價(jià)修飾,從而引起酶活性改變,這種調(diào)節(jié)稱為酶的化學(xué)修飾。主要包括:磷酸化去磷酸化;乙?;撘阴;患谆ゼ谆?;腺苷化脫腺苷化;SH與SS互變等;磷酸化與脫磷酸是最常見的方式。31.變構(gòu)酶(allosteric enzyme):指代謝途徑中參與變構(gòu)調(diào)節(jié)的關(guān)鍵酶稱為變構(gòu)酶,變構(gòu)酶常為多個(gè)亞基構(gòu)成的寡聚體,有催化亞基含結(jié)合底物催化反應(yīng)的活化中心及調(diào)節(jié)亞基含與變構(gòu)效應(yīng)劑結(jié)合引起調(diào)節(jié)作用的調(diào)節(jié)部位,對(duì)酶催化活性調(diào)節(jié)的方式稱為變構(gòu)效應(yīng),具有協(xié)同效應(yīng)。32.變構(gòu)效應(yīng)劑(allosteric effector):與酶分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)象變化,從而改變酶的活性的底物、終產(chǎn)物與其他小分子代謝物質(zhì),稱為變構(gòu)效應(yīng)劑,引起酶活性增加的變構(gòu)效應(yīng)劑稱變構(gòu)激活劑,引起酶活性降低的變構(gòu)效應(yīng)劑稱變構(gòu)抑制劑。33.生物轉(zhuǎn)化作用(Biotransformation):機(jī)體將來自體外的非營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)在肝臟進(jìn)行氧化、還原、水解和結(jié)合反應(yīng),使這些物質(zhì)生物活性或毒性降低甚至消除,這一過程稱為生物轉(zhuǎn)化作用。生物轉(zhuǎn)化的對(duì)象包括內(nèi)源性的激素、胺類等和外源性的藥物、毒物等非營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。肝是主要器官,但在肺、腎、胃腸道和皮膚也有一定生物轉(zhuǎn)化功能。意義:對(duì)體內(nèi)的非營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)行轉(zhuǎn)化,使其滅活或解毒;更為重要的是可使這些物質(zhì)的溶解度增加,易于排出體外。34.膽汁酸的肝腸循環(huán)(bile acid enterohepatic circulation):在肝細(xì)胞合成的初級(jí)膽汁酸,隨膽汁進(jìn)入腸道,協(xié)助脂類物質(zhì)的消化吸收后,受腸菌作用轉(zhuǎn)變?yōu)榇渭?jí)膽汁酸。腸道中各種膽汁酸約95%被腸道重吸收經(jīng)門靜脈入肝,并同新合成的膽汁酸一起再次被排入腸道,這一過程被稱為膽汁酸的腸肝循環(huán)。意義:將有限的膽汁酸反復(fù)利用以滿足人體對(duì)膽汁酸的生理需要。35.膽素原的腸肝循環(huán)(bilinogen enterohepatic circulation):腸道中有少量的膽素原可被腸粘膜細(xì)胞重吸收,經(jīng)門靜脈入肝,其中大部分再隨膽汁排入腸道,形成膽素原的腸肝循環(huán)。只有少量經(jīng)血液循環(huán)入腎并隨尿排出,膽素原接觸空氣后被氧化成尿膽素,后者是尿的主要色素。 分子生物學(xué)名詞解釋第二章 核酸的結(jié)構(gòu)與功能1.DNA的變性與復(fù)性(denaturation and renaturation of DNA): 雙鏈DNA(dsDNA)在變性因素(如過酸、過堿、加熱、尿素等)影響下,解鏈成單鏈DNA(ssDNA)的過程稱之為DNA變性。DNA變性后,生物活性喪失,但一級(jí)結(jié)構(gòu)沒有改變,所以在一定條件下仍可恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu)。熱變性的DNA經(jīng)緩慢冷卻后,兩條互補(bǔ)鏈可重新恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱為復(fù)性,也稱退火。2.核酸分子雜交(hybridization of nucleic acids):是核酸研究中一項(xiàng)最基本的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。其基本原理就是應(yīng)用核酸分子的變性和復(fù)性的性質(zhì),使來源不同的DNA(或RNA)片段,按堿基互補(bǔ)關(guān)系形成雜交雙鏈分子。雜交雙鏈可以在DNA與DNA鏈之間,也可在RNA與DNA鏈之間形成。這種現(xiàn)象稱為核酸分子雜交。簡(jiǎn)稱雜交(hybridization)3.增色效應(yīng)與減色效應(yīng)(hyperchromic effect and hypochromic effect): DNA變性時(shí),雙螺旋松解,堿基暴露,OD260值增高稱之為增色效應(yīng);除去變性因素后,單鏈DNA依堿基配對(duì)規(guī)律恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu),OD260值減小稱為減色效應(yīng)。4.核酶(ribozyme):核酶是具有催化功能的RNA分子。大多數(shù)核酶通過催化轉(zhuǎn)磷酸酯和磷酸二酯鍵水解反應(yīng)參與RNA自身剪切、加工過程。第八章 核苷酸代謝1.從頭合成途徑(de novo synthesis pathway): 利用磷酸核糖、氨基酸、一碳單位及CO2等簡(jiǎn)單物質(zhì)為原料合成嘌呤或嘧啶核苷酸的過程,稱為從頭合成途徑,是體內(nèi)的主要合成途徑。2.補(bǔ)救合成途徑(salvage synthesis pathway):利用體內(nèi)游離嘌呤或嘧啶堿基和游離嘌呤或嘧啶核苷,經(jīng)簡(jiǎn)單反應(yīng)過程生成嘌呤或嘧啶核苷酸的過程。在部分組織如腦、骨髓中只能通過此途徑合成核苷酸。第十章 DNA的生物合成(復(fù)制)1.半保留復(fù)制(semiconservative replication):DNA復(fù)制時(shí),親代DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)解開,分別以解開的兩股單鏈為模板,以dNTP(dATP、 dGTP 、dTTP 、dCTP)為原料,按照堿基互補(bǔ)的原則,合成與模板鏈互補(bǔ)的新鏈,從而形成兩個(gè)子代DNA雙鏈,其結(jié)構(gòu)與親代DNA雙鏈完全一致。因子代DNA雙鏈中的一股單鏈源自親代,另一股單鏈為合成的新鏈,形成的雙鏈與親代雙鏈的堿基序列完全一致,故稱為半保留復(fù)制。2.端粒(telomere):是位于真核細(xì)胞線性染色體末端的特殊結(jié)構(gòu),由一段串聯(lián)重復(fù)的DNA短序列與端粒結(jié)合蛋白構(gòu)成;端粒具有穩(wěn)定染色體結(jié)構(gòu),防止末端降解和融合的功能;并維持DNA復(fù)制的完整性。端粒復(fù)制要靠具有反轉(zhuǎn)錄酶性質(zhì)的端粒酶來完成。3.端粒酶(telomerase ):由RNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成的一種核糖核蛋白復(fù)合體,RNA分子含復(fù)制端粒DNA所需的核苷酸模板,蛋白質(zhì)部分具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,同時(shí)具有核酸內(nèi)切酶活性。催化端粒DNA的合成,維持染色體末端的端粒結(jié)構(gòu)。4.逆轉(zhuǎn)錄和逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcription and reverse transcriptase):指遺傳信息從RNA流向DNA。即以RNA為模板,dNTP為原料,在逆轉(zhuǎn)錄酶催化下,合成與RNA互補(bǔ)的雙鏈DNA的過程。逆轉(zhuǎn)錄酶 (依賴RNA的DNA聚合酶)為多功能酶, 具有三種酶活性:1)RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶:利用病毒RNA作模板合成一條互補(bǔ)DNA鏈;2)RNase H:水解RNA-DNA雜化雙鏈中的RNA鏈; 3)DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶:以新合成的DNA鏈為模板合成另一條互補(bǔ)DNA鏈。第十一章 RNA的生物合成(轉(zhuǎn)錄)1.不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetric transcription):有兩重含義,一是指雙鏈DNA分子中只有一股單鏈作為轉(zhuǎn)錄模板(模板鏈),另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;二是模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一單鏈上。2.斷裂基因(splite gene):真核生物的結(jié)構(gòu)基因是由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。3.外顯子和內(nèi)含子(exon and intron):在斷裂基因及其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上出現(xiàn),并表達(dá)為RNA的核酸序列稱為外顯子(真核生物結(jié)構(gòu)基因中為蛋白質(zhì)編碼的可轉(zhuǎn)錄序列)。內(nèi)含子是隔斷基因線性表達(dá)而在剪接過程中被除去的核苷酸序列(真核生物結(jié)構(gòu)基因中不為蛋白質(zhì)編碼的可轉(zhuǎn)錄序列)。第十二章 蛋白質(zhì)的生物合成(翻譯)1.多聚核蛋白體(polyribosome):一條mRNA模板鏈可附著10-100個(gè)核糖體,這些核糖體依次結(jié)合起始密碼子并沿5-3移動(dòng),同時(shí)進(jìn)行肽鏈合成,這種mRNA與多個(gè)核糖體形成的聚合物稱多聚核糖體。多聚核糖體的形成可以大大提高蛋白質(zhì)生物合成的速度和效率。2.信號(hào)肽(signal peptide):各種新生分泌蛋白的N端存在保守的氨基酸序列稱信號(hào)肽,約13-36個(gè)氨基酸殘基,可分為N端堿性區(qū)、疏水區(qū)和C端加工區(qū)三個(gè)區(qū)段。可將合成的蛋白質(zhì)引導(dǎo)至細(xì)胞的適當(dāng)靶部位,是決定蛋白質(zhì)靶向輸送特性的重要元件。3.開放閱讀框架(open reading frame, ORF):從mRNA 5端起始密碼子AUG到3端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一條蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開放閱讀框架。第十三章 基因表達(dá)調(diào)控1.組成性基因表達(dá)(constitutive gene expression):無論表達(dá)水平高低,管家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長(zhǎng)階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。區(qū)別于其他基因,這類基因表達(dá)被視為組成性基因表達(dá)。2.管家基因( housekeeping gene): a)是一類對(duì)維持細(xì)胞基本生命活動(dòng)所必需的基因 b)幾乎在所有的細(xì)胞和所有的發(fā)育階段都持續(xù)表達(dá) c)其表達(dá)基本不受環(huán)境因素的影響 d)主要受啟動(dòng)子的調(diào)節(jié) 管家基因的表達(dá)屬于組成性表達(dá)3.操縱子(operon):原核生物絕大多數(shù)基因按功能相關(guān)性成簇地串聯(lián)、密集于染色體上,共同組成一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位操縱子。一個(gè)操縱子只含一個(gè)啟動(dòng)序列及數(shù)個(gè)可轉(zhuǎn)錄的編碼基因。通常,這些編碼基因可轉(zhuǎn)錄出多順反子mRNA。原核基因的協(xié)調(diào)表達(dá)就是通過調(diào)控單個(gè)啟動(dòng)基因的活性來完成的。4.增強(qiáng)子(enhancer):指遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的時(shí)間、空間特異性、增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列。其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無關(guān)。 是遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的、激活基因轉(zhuǎn)錄的正性調(diào)控元件。增強(qiáng)子與轉(zhuǎn)錄激活因子最終增強(qiáng)RNA聚合酶的活性決定基因表達(dá)的空間和時(shí)間特異性其作用與其位置和方向無關(guān)增強(qiáng)子與啟動(dòng)子在結(jié)構(gòu)上可重疊,在功能上互相依賴5.順式作用元件(cis-acting element):能調(diào)控自身基因表達(dá)活性的特異DNA序列。是RNA-pol和TF識(shí)別結(jié)合的位點(diǎn)。據(jù)其在基因中的位置、轉(zhuǎn)錄激活作用的性質(zhì)及發(fā)揮作用的方式分為:啟動(dòng)子、增強(qiáng)子和沉默子。6.反式作用因子(trans-acting factor):由某一基因表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)因子,通過與另一基因的特異的順式作用元件結(jié)合,調(diào)控該基因的表達(dá),這種蛋白質(zhì)因子稱為反式作用因子,也叫轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子。轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子按功能特性分為基本轉(zhuǎn)錄因子和特異轉(zhuǎn)錄因子。第十四章 基因重組和基因工程1.DNA克隆:應(yīng)用酶學(xué)的方法, 在體外將各種來源的遺傳物質(zhì)DNA與載體DNA接合成具有自我復(fù)制能力的DNA分子復(fù)制子,再通過轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染宿主細(xì)胞,篩選出含有目的基因的轉(zhuǎn)化子細(xì)胞,經(jīng)擴(kuò)增提取獲得大量同一DNA分子的過程,也稱基因克隆、重組DNA。2.基因組文庫(kù) (genomic DNA library):是指包含某一生物細(xì)胞全部基因組DNA序列的克隆群體,它以DNA片段的形式貯存著該生物的全部基因組DNA的信息。其構(gòu)建過程是分離生物體的全部染色體DNA,用限制性核酸內(nèi)切酶隨機(jī)切割成長(zhǎng)短大致相同的數(shù)以萬計(jì)的片段,將所有片段重組于同一類載體上,便得到許多重組體,將重組體全部轉(zhuǎn)化入宿主菌中保存起來,就形成基因文庫(kù)。3.cDNA文庫(kù) (cDNA library) :是指包含某一組織細(xì)胞在一定條件下所表達(dá)的全部mRNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄而合成的cDNA序列的克隆群體,它以cDNA片段的形式貯存著該組織細(xì)胞的基因表達(dá)信息。其構(gòu)建過程是將細(xì)胞表達(dá)的所有mRNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,與適當(dāng)?shù)妮d體連接后,轉(zhuǎn)入宿主細(xì)胞而獲得的克隆群體,包含了細(xì)胞表達(dá)的各種mRNA信息。第十五章 細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)1.第二信使(secondary messenger):通常將Ca2+ 、DAG、IP3 、Cer、cAMP、cGMP等在細(xì)胞內(nèi)傳遞信息的小分子化合物稱為第二信使,其作用是對(duì)胞外信號(hào)起轉(zhuǎn)換和放大的作用。細(xì)胞表面受體接受胞外信號(hào)后,經(jīng)過信號(hào)轉(zhuǎn)換激活質(zhì)膜上的效應(yīng)器,產(chǎn)生細(xì)胞內(nèi)的信息物質(zhì)第二信使,進(jìn)一步將信息傳遞到細(xì)胞內(nèi),產(chǎn)生相應(yīng)的生物學(xué)效應(yīng)。第二十章 癌基因與抑癌基因1.癌基因(oncogene):能在體外引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化,在體內(nèi)誘發(fā)腫瘤的基因,包括病毒癌基因和細(xì)胞癌基因。大多數(shù)癌基因是正常原癌基因的突變形式,后者參與調(diào)控細(xì)胞的生長(zhǎng)和分裂。2.抑癌基因(tumor suppressor gene ):是一類能抑制細(xì)胞過度生長(zhǎng)增殖,促進(jìn)細(xì)胞分化,從而抑制腫瘤發(fā)生的負(fù)調(diào)控基因。其丟失或失活可能導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。第二十一章 常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用1.DNA印跡技術(shù)(Southern blotting):是將基因組DNA經(jīng)限制性內(nèi)切酶消化后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,變性處理后再利用毛細(xì)作用將膠中的DNA分子轉(zhuǎn)移并固定到膜性支持物上(NC膜)進(jìn)行雜交反應(yīng)的技術(shù)。主要用于基因組DNA的分析,亦可分析重組質(zhì)粒和噬菌體。2.RNA印跡技術(shù)(Northern blotting):指RNA經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離后轉(zhuǎn)移至膜性支持物上(NC膜)用于雜交反應(yīng)的技術(shù)。主要用于檢測(cè)某一組織或細(xì)胞中已知的特異mRNA的表達(dá)水平以及比較不同組織和細(xì)胞中的同一基因的表達(dá)情況。無需限制性內(nèi)切酶切割。3.蛋白質(zhì)印跡術(shù)或免疫印跡技術(shù)(Western blotting):指蛋白質(zhì)經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳分離之后轉(zhuǎn)移(電轉(zhuǎn))到膜性支持物上(NC膜),再與溶液中的抗體探針相互結(jié)合的技術(shù)。主要用于檢測(cè)樣品中特異性蛋白質(zhì)的存在、細(xì)胞中特異蛋白質(zhì)的半定量分析以及蛋白質(zhì)分子間的相互作用研究等。system n. 系統(tǒng);體系;制度PartII 生物化學(xué)與分子生物學(xué)名詞解釋第二章蛋白質(zhì)1、GSH即谷胱甘肽,是由谷氨酸,半胱氨酸和甘氨酸通過肽鍵縮合而成的三肽。2、蛋白質(zhì)變性(protein denaturation)蛋白質(zhì)在某些物理和化學(xué)因素作用下其特定的空間構(gòu)象被改變,從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)變性。3、-螺旋(-helix)蛋白質(zhì)中常見的一種二級(jí)結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個(gè)氨基酸殘基(第n個(gè))的羰基氧與多肽鏈C端方向的第3個(gè)殘基(第n3個(gè))的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手-螺旋結(jié)構(gòu)中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個(gè)氨基酸殘基,每個(gè)殘基沿著螺旋的長(zhǎng)軸上升0.15nm。4、-折疊片層(-sheet)是蛋白質(zhì)中的常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過一個(gè)肽鍵的羰基氧和位于同一個(gè)肽鏈或相鄰肽鏈的另一個(gè)酰胺氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(走向都是由N到C方向);或者是反平行排列(肽鏈反向排列)。5、-轉(zhuǎn)角(-turn)也是多肽鏈中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),連接蛋白質(zhì)分子中的二級(jí)結(jié)構(gòu)(-螺旋和-折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有216個(gè)氨基酸殘基。含有5個(gè)氨基酸殘基以上的轉(zhuǎn)角又常稱之環(huán)(loops)。常見的轉(zhuǎn)角含有4個(gè)氨基酸殘基,有兩種類型。轉(zhuǎn)角I的特點(diǎn)是:第1個(gè)氨基酸殘基羰基氧與第4個(gè)殘基的酰胺氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角II的第3個(gè)殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第2個(gè)殘基大都是脯氨酸。6、功能蛋白質(zhì)組(functional proteome)指的是特定時(shí)間、特定環(huán)境和實(shí)驗(yàn)各種下,基因組活躍表達(dá)的蛋白質(zhì)。7、肽鍵(peptide bond )在蛋白質(zhì)分子中,一分子氨基酸的-羧基與另一分子氨基酸的-氨基脫水縮合后而形成的酰胺鍵稱為肽鍵。8、基序/模體(motif)模體屬于蛋白質(zhì)的超二級(jí)結(jié)構(gòu),由2個(gè)或2個(gè)以上具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象,并發(fā)揮專一的功能。一種類型的模體總有其特征性的氨基酸序列。9、結(jié)構(gòu)域(domain)在蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)內(nèi)的獨(dú)立折疊單元。結(jié)構(gòu)域通常都是幾個(gè)超二級(jí)結(jié)構(gòu)單元的組合。10、氨基酸殘基在多肽鏈中的氨基酸,由于其部分基團(tuán)參與了肽鍵的形成,剩余的結(jié)構(gòu)部分則稱氨基酸殘基。它是一個(gè)分子的一部分,而不是一個(gè)分子。11、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondary structure of protein)指某段多肽鏈中主鏈骨架在局部空間有規(guī)律的盤繞和折疊,即蛋白質(zhì)分子中某段肽鏈主鏈原子的相對(duì)空間位置,不包括與其他鏈段的相互關(guān)系及側(cè)鏈構(gòu)象的內(nèi)容。12、蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)(Tertiary structure of protein)指在二級(jí)結(jié)構(gòu)、模體的基礎(chǔ)上,由于側(cè)鏈R基團(tuán)的相互作用,整條肽鏈進(jìn)一步折疊和盤曲成球狀分子,即整條肽鏈所有原子在三維空間的排布位置。13、蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)(Quaternary structure of protein)由兩條或兩條以上具有獨(dú)立三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈以非共價(jià)鍵連接的空間排布和接觸部位的布局稱蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。14、別構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect)當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)(酶)與它的配體(某種小分子物質(zhì))結(jié)合后,引起蛋白質(zhì)(酶)的空間結(jié)構(gòu)(構(gòu)象)發(fā)生改變,使其適合功能的需要,這種變化稱別構(gòu)效應(yīng)或變構(gòu)效應(yīng)。15、鹽析(Salting out)向某些蛋白質(zhì)溶液中加入某些無機(jī)鹽溶液后,可以使蛋白質(zhì)凝聚而從溶液中析出,這種作用叫作鹽析,可復(fù)原。16、亞基(subunit)有四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)的每條具有獨(dú)立三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈稱為亞基或亞單位。17、蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(pI)溶液處于某一PH時(shí),氨基酸解離成正負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兩性離子,凈電荷為零,在電場(chǎng)中不向陽(yáng)極也不向陰極移動(dòng),此時(shí)溶液的pH稱為氨基酸的等電點(diǎn)。 第三章核酸1、DNA變性在某些理化因素作用下,DNA分子互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵斷裂,使DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)松 散,變?yōu)閱捂?,即為DNA變性。2、核酶(ribozyme)具有催化活性的RNA, 即化學(xué)本質(zhì)是核糖核酸RNA, 卻具有酶的催化功能。3、增色效應(yīng)變性的DNA,分子兩條互補(bǔ)鏈可完全解開成為兩條單鏈,使得堿基暴露,260nm 處 紫外吸收增強(qiáng),這種現(xiàn)象稱為增色效應(yīng)。4、Tm值即解鏈溫度,DNA的變性從開始解鏈到完全解鏈,是在一個(gè)相當(dāng)窄的溫度內(nèi)完成,在這一范圍內(nèi),紫外光吸收值達(dá)到最大值50%時(shí)的溫度稱為DNA的解鏈溫度,這一現(xiàn)象和結(jié)晶的融解過程類似,又稱融解溫度(Tm)。5、DNA超螺旋(DNA supercoil)DNA雙螺旋本身進(jìn)一步盤繞稱超螺旋。超螺旋有正超螺旋和負(fù)超螺旋兩種。當(dāng)盤旋方向與DNA雙螺旋方向相同時(shí),其超螺旋結(jié)構(gòu)為正超螺旋,反之則為負(fù)超螺旋,負(fù)超螺旋的存在對(duì)于轉(zhuǎn)錄和復(fù)制都是必要的。6、hnDNA即核不均一RNA,是mRNA的前體。7、DNA復(fù)性DNA的復(fù)性指變性DNA 在適當(dāng)條件下,二條互補(bǔ)鏈全部或部分恢復(fù)到天然雙螺旋結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象,它是變性的一種逆轉(zhuǎn)過程。 第四、五章酶1、同工酶(isoenzyme)能夠催化相同的化學(xué)反應(yīng),而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。2、酶活性中心(active center)酶分子中必需基團(tuán)在一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但在空間結(jié)構(gòu)上彼此靠近,構(gòu)成具有特定動(dòng)態(tài)構(gòu)象的局部空間結(jié)構(gòu),直接參與酶促反應(yīng),與外部的底物特異地結(jié)合并使底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物的區(qū)域稱為酶的活性中心或活性部位。3、Km值是當(dāng)酶反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度的大小。4、共價(jià)修飾(covalent modification)酶分子上某些特殊基團(tuán)在其他酶作用下,發(fā)生可逆的共價(jià)結(jié)合而被修飾,并快速改變的活性稱共價(jià)修飾調(diào)節(jié)或化學(xué)修飾。5、酶原(zymogen)在細(xì)胞內(nèi)合成及初分泌時(shí)處于無活性狀態(tài)的酶的前體。6、全酶(holoenzyme)酶蛋白和輔助因子結(jié)合形成的具有催化作用的復(fù)合物稱為全酶。7、米氏方程(Michaelis-Menten equation)表示酶促反應(yīng)的起始速度與底物濃度關(guān)系的速度方程,VVmaxS/(Km+S)。8、別構(gòu)酶(allosteric enzyme)別構(gòu)酶一種其活性受到結(jié)合在活性部位以外部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。9、輔酶(coenzyme)輔酶是一類可以將化學(xué)基團(tuán)從一個(gè)酶轉(zhuǎn)移到另一個(gè)酶上的有機(jī)小分子,與酶較為松散地結(jié)合,對(duì)于特定酶的活性發(fā)揮是必要的。10、輔基(prosthetic group)酶的輔助因子或結(jié)合蛋白質(zhì)的非蛋白部分,其中較小的非蛋白質(zhì)部分稱輔基,與酶或蛋白質(zhì)結(jié)合的非常緊密,用透析法不能除去。 第六章糖代謝1、糖酵解(glycolysis)糖無氧分解即糖酵解,是指葡萄糖在無氧條件下分解生成乳酸并釋放出能量的過程。2、糖異生(gluconeogenesis)由非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛱窃倪^程稱為糖異生。3、糖原(glycogen)是由許多葡萄糖分子聚合而成的帶有分支的高分子多糖類化合物。4、底物水平磷酸化(substrate level phosophoryltion)底物在氧化過程中直接將高能磷酸鍵轉(zhuǎn)移給ADP生成ATP的過程。5、巴斯德效應(yīng)(Pasteur effect)有氧氧化抑制糖酵解的現(xiàn)象。6、磷酸戊糖途徑(pentose phosphate pathway)指從G-6-P脫氫反應(yīng)開始,經(jīng)一系列代謝反應(yīng)生成磷酸戊糖等中間代謝物,然后再重新進(jìn)入糖氧化分解代謝途徑的一條旁路代謝途徑。7、三羧酸循環(huán)(TriCarboxylic Acid cycle,TCA)三羧酸循環(huán)(檸檬酸循環(huán)或Krebs循環(huán))是指在線粒體中,乙酰CoA首先與草酰乙酸縮合生成檸檬酸,然后經(jīng)過一系列的代謝反應(yīng),乙?;谎趸纸?,而草酰乙酸再生的循環(huán)反應(yīng)過程。 第七章脂類代謝1、脂肪酸-氧化脂肪酸在體內(nèi)氧化時(shí)在羧基端的-碳原子上進(jìn)行氧化,碳鏈逐次斷裂,每次斷下一個(gè)二碳單位,即乙酰CoA,該過程稱作-氧化。2、酮體(ketone body)脂肪酸在肝臟中氧化分解所生成的乙酰乙酸、-羥丁酸和丙酮三種中間代謝產(chǎn)物統(tǒng)稱為酮體。3、血漿脂蛋白(lipoprotein)血脂與血漿中的蛋白質(zhì)結(jié)合,以血漿脂蛋白的形式存在及運(yùn)輸。4、脂肪動(dòng)員(fat mobilization)貯存于脂肪組織中的脂肪被一系列脂肪酶水解為甘油和游離脂肪酸并釋放入血供全身各組織利用的過程。5、初級(jí)膽汁酸(primary bile acid)有肝細(xì)胞直接合成的膽汁酸成為初級(jí)膽汁酸。6、載脂蛋白(apolipoprotein,Apo)血漿脂蛋白中的蛋白質(zhì)部分。7、必需脂肪酸(essential fatty acid,EFA)多數(shù)脂肪酸在人體內(nèi)能合成,只有不飽和脂肪酸的亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸在體內(nèi)不能合成,必須從植物油攝取,稱為人體必需脂肪酸。8、脂類(lipid)脂類是脂肪、類脂及其衍生物的總稱,是一類不溶于水而易溶于有機(jī)溶劑,并能為機(jī)體利用的有機(jī)化合物。 第八章生物氧化1、氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)在線粒體中,底物分子脫下的氫原子經(jīng)呼吸鏈傳遞給氧,在此過程中釋放能量使ADP磷酸化生成ATP,這種能量的生成方式就稱為氧化磷酸化。2、呼吸鏈(respiratory chain)存在于線粒體內(nèi)膜上,按一定順序排列的一系列酶或輔酶。其作用是以傳遞電子和H+的形式傳遞代謝物氧化脫下的氫原子,最后使活化的氫與活化的氧結(jié)合生成水。該傳遞鏈與細(xì)胞呼吸過程有關(guān),故稱為呼吸鏈,又稱電子傳遞鏈。3、P/O比值物質(zhì)氧化時(shí),每消耗一摩爾氧原子所消耗的無機(jī)磷的摩爾數(shù)稱為P/O比值,即ATP生成的摩爾數(shù)。4、高能化合物指體內(nèi)氧化分解中,一些化合物通過能量轉(zhuǎn)移得到了部分能量,把這類儲(chǔ)存了較高能量的化合物,如三磷酸腺苷(ATP),磷酸肌酸,稱為高能化合物。它們是生物釋放,儲(chǔ)存和利用能量的媒介,是生物界直接的供能物質(zhì)。5、解偶聯(lián)劑(uncoupler)使氧化與磷酸化偶聯(lián)過程脫離的物質(zhì)稱為解偶聯(lián)劑。 第九章氨基酸代謝1、必需氨基酸(essential amino acid)指體內(nèi)需要而又不能自身合成,必須由食物供給的氨基酸,共有8種。2、一碳單位(one carbon unit)某些氨基酸代謝過程中產(chǎn)生的只含有一個(gè)碳原子的基團(tuán),稱為一碳單位。3、生酮氨基酸(ketogenic amino acid)分解代謝過程中能轉(zhuǎn)變成乙酰乙酰輔酶A的氨基酸,共有亮氨酸、賴氨酸、色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸5種。4、生糖氨基酸(glucogenic amino acid)能通過糖異生轉(zhuǎn)變成葡萄糖的氨基酸。5、鳥氨酸循環(huán)(orinithine cycle)尿素生成的過程由Hans Krebs 和Kurt Henseleit 提出,稱為鳥氨酸循環(huán),又稱尿素循環(huán)(urea cycle)或Krebs- Henseleit循環(huán)。6、苯酮尿癥(phenylketonurics,PKU)是一種常見的氨基酸代謝病,是由于苯丙氨酸代謝途徑中的酶缺陷,使得苯丙氨酸不能轉(zhuǎn)變成為酪氨酸,導(dǎo)致苯丙氨酸及其酮酸蓄積并從尿中大量排出。7、聯(lián)合脫氨基作用(transdeamination)轉(zhuǎn)氨與脫氨相偶聯(lián)而脫出氨基的作用稱聯(lián)合脫氨基作用,亦稱轉(zhuǎn)氨脫氨基作用。8、丙氨酸-葡萄糖循環(huán)(alanine-glucose cycle)丙氨酸和葡萄糖反復(fù)的在肌和肝之間進(jìn)行氨的轉(zhuǎn)運(yùn),故將這一途徑稱為丙氨酸-葡萄糖循環(huán)。9、氧化脫氨基(oxidative deamination)氨基酸先經(jīng)過脫氫生成不穩(wěn)定的亞氨基酸,然后水解產(chǎn)生-酮酸和氨,此反應(yīng)成為氧化脫氨基作用。10、轉(zhuǎn)氨基作用(transamination)在轉(zhuǎn)氨酶作用下,某一氨基酸的-氨基轉(zhuǎn)移到另一種-酮酸的酮基上,生成相應(yīng)的氨基酸,原來的氨基酸則轉(zhuǎn)變成-酮酸的過程。11、尿素的腸肝循環(huán)血液中的尿素滲入腸道,受腸菌尿素酶水解而生成氨的過程。12、-谷氨酰基循環(huán)(-glutamyl cycle)指通過谷胱甘肽的代謝作用將氨基酸吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)的過程。13、蛋氨酸循環(huán)SAM通過轉(zhuǎn)甲基作用,將甲基轉(zhuǎn)移給甲基接受體后,其本身轉(zhuǎn)變?yōu)镾-腺苷同型半胱氨酸,進(jìn)而又轉(zhuǎn)變成同型半胱氨酸,同型半胱氨酸可接受N5-CH3-FH4分子中的甲基再生成蛋氨酸。從蛋氨酸活化為SAM到轉(zhuǎn)出甲基以及再生成蛋氨酸的全過程稱為蛋氨酸循環(huán)。 第十章核苷酸代謝1、從頭合成(de novo synthesis)利用一些簡(jiǎn)單的前體物,如5-磷酸核糖,氨基酸,一碳單位及CO2等,逐步合成嘌呤核苷酸的過程稱為從頭合成途徑。2、補(bǔ)救途徑(salvage pathway)指利用分解代謝產(chǎn)生的游離堿基或核苷合成相應(yīng)核苷酸的過程,又稱再利用合成途徑。3、痛風(fēng)(metabolic arthritis)嘌呤核苷酸分解代謝異常使血尿酸升高,尿酸鈉晶體沉積于軟骨、關(guān)節(jié)、軟組織及腎臟引起皮下結(jié)節(jié),關(guān)節(jié)疼痛的癥狀。4、自殺抑制作用(suicide substrate)底物類似物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑,例如別嘌呤醇對(duì)黃嘌呤氧化酶的抑制。5、Lesch-Nyhan綜合征(Lesch-Nyhan syndrome)也稱為自毀容貌癥,是先天性嘌呤代謝缺陷病,源于次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(HGPRT)的缺失。第十一章 血紅素與膽色素代謝1、結(jié)合膽紅素(conjugated bilirubin)在肝細(xì)胞滑面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,膽紅素Y-蛋白或膽紅素Z-蛋白,在UDP-葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶(UGT)催化下,由UDP-葡萄糖醛酸提供葡萄糖醛酸基,膽紅素和葡萄糖醛酸基結(jié)合轉(zhuǎn)變生成結(jié)合膽紅素,即葡萄糖醛酸膽紅素。2、游離膽紅素(free bilirubin)膽紅素-清蛋白復(fù)合物中的膽紅素與清蛋白以非共價(jià)結(jié)合,不牢固、易解離,故稱游離膽紅素或未結(jié)合膽紅素、血膽紅素。3、膽色素(bilin)是血紅素的降解產(chǎn)物,血紅素游離出金屬離子,剩下的卟啉環(huán)代謝分解,生成膽色素。4、范登堡試驗(yàn)(Van den Bergh reaction)用重氮試劑(重氮苯磺酸)與膽紅素吡咯環(huán)上亞氨基反應(yīng),形成偶氮化合物,其在中性介質(zhì)中呈紫紅色,用來鑒別結(jié)合膽紅素和未結(jié)合膽紅素。 第十二章 DNA的生物合成1、半保留復(fù)制(semiconservative replication)DNA的復(fù)制方式,親代雙鏈分離后,每條單鏈均作為新鏈合成的模板。因此,復(fù)制完成時(shí)將有兩個(gè)子代DNA分子,且每個(gè)分子的核苷酸序列均與親代分子相同。2、拓?fù)洚悩?gòu)酶DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶是存在于細(xì)胞核內(nèi)的一類酶,能夠催化DNA鏈的斷裂和結(jié)合,從而控制DNA的拓?fù)錉顟B(tài),以克服DNA復(fù)制過程中解鏈時(shí)產(chǎn)生的扭結(jié)現(xiàn)象。3、岡崎片段(Okazaki fragment)DNA雙鏈進(jìn)行半保留復(fù)制時(shí),在DNA后隨鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段。4、復(fù)制叉(replication fork)DNA復(fù)制時(shí)在DNA鏈上通過解旋、解鏈和SSB蛋白的結(jié)合等過程形成的Y字型結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉。在復(fù)制叉處,作為模板的雙鏈DNA解旋,同時(shí)合成新的DNA鏈。5、端粒酶(telomerase)是基本的核蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶,可將端粒DNA加至真核細(xì)胞染色體末端。6、前導(dǎo)鏈(leading strand)與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致,通過連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。7、后隨鏈(lagging strand)與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反,通過不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。8、半不連續(xù)復(fù)制(Semi-ondisctinuousreplication)DNA復(fù)制的基本過程,指DNA復(fù)制時(shí),前導(dǎo)鏈上DNA的合成是連續(xù)的,后隨鏈上是不連續(xù)的,故稱為半不連續(xù)復(fù)制。9、Klenow片段(Klenow fragment)E.coli(大腸桿菌)DNA聚合酶I經(jīng)部分水解生成的C末端605個(gè)氨基酸殘基片段。該片段保留了DNA聚合酶的5-3聚合酶和3-5外切酶活性,但缺少完整酶的5-3外切酶活性。10、引發(fā)體(primosome)蛋白復(fù)合體,主要成份是引物酶和DNA解旋酶,是在合成用于DNA復(fù)制的RNA引物時(shí)裝配的。引發(fā)體與DNA結(jié)合后隨即由引物酶合成RNA引物。11、反轉(zhuǎn)錄(reverse transcription)反轉(zhuǎn)錄是以反義RNA為模板通過反轉(zhuǎn)錄酶合成DNA的過程,也稱逆轉(zhuǎn)錄,是DNA生物合成的一種特殊方式。12、滾環(huán)復(fù)制(rolling-circle replication)噬菌體中常見的DNA復(fù)制方式。親代DNA的一條鏈在復(fù)制起點(diǎn)處被切開,其5端游離出來。這樣,DNA聚合酶便可以將脫氧核糖核苷酸聚合在3-OH端。當(dāng)復(fù)制向前進(jìn)行時(shí),親代DNA上被切斷的5端繼續(xù)游離下來,并且很快被單鏈結(jié)合蛋白所結(jié)合。因?yàn)?端從環(huán)上向下解鏈的同時(shí)伴有環(huán)狀雙鏈DNA環(huán)繞其軸不斷的旋轉(zhuǎn),而且以3-OH端為引物的DNA生長(zhǎng)鏈則不斷地以另一條環(huán)狀DNA鏈為模板向前延伸,因而稱為滾環(huán)復(fù)制。13、雙向復(fù)制(bidirectional replication)DNA合成時(shí)從一個(gè)單獨(dú)的復(fù)制起始點(diǎn)上形成兩個(gè)復(fù)制叉,然后相背而行,這種復(fù)制方式稱為雙向復(fù)制。 第十三章 RNA的生物合成1、啟動(dòng)子(Promoters)RNA聚合酶特異性識(shí)別和結(jié)合的DNA序列,指導(dǎo)著RNA復(fù)制,控制基因表達(dá)(轉(zhuǎn)錄)的起始時(shí)間和表達(dá)的程度。2、核心酶(core enzyme)大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5個(gè)亞基組成、和兩個(gè)亞基,可寫作2,失去亞基的叫核心酶(2)。3、RNA聚合酶(RNA polymerase)以一條DNA鏈或RNA為模板催化由核苷-5-三磷酸合成RNA的酶,是催化以DNA為模板、三磷酸核糖核苷為底物、通過磷酸二酯鍵而聚合的合成RNA的酶,也稱轉(zhuǎn)錄酶。4、內(nèi)含子(introns)基
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