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文檔簡介
分子生物學(xué)試題一、 名詞解釋1、 基因:能夠表達(dá)和產(chǎn)生蛋白質(zhì)和RNA的DNA序列,是決定遺傳性狀的功能單位。2、 基因組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體的遺傳物質(zhì)的總和。3、 端粒:以線性染色體形式存在的真核基因組DNA末端都有一種特殊的結(jié)構(gòu)叫端粒。該結(jié)構(gòu)是一段DNA序列和蛋白質(zhì)形成的一種復(fù)合體,僅在真核細(xì)胞染色體末端存在。4、 操縱子:是指數(shù)個(gè)功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動(dòng)子和操縱基因)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)所構(gòu)成的基因表達(dá)單位,所轉(zhuǎn)錄的RNA為多順反子。5、 順式作用元件:是指那些與結(jié)構(gòu)基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)、能夠被基因調(diào)控蛋白特異性識(shí)別和結(jié)合的特異DNA序列。包括啟動(dòng)子、上游啟動(dòng)子元件、增強(qiáng)子、加尾信號(hào)和一些反應(yīng)元件等。6、 反式作用因子:是指真核細(xì)胞內(nèi)含有的大量可以通過直接或間接結(jié)合順式作用元件而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì)因子。7、 啟動(dòng)子:是RNA聚合酶特異性識(shí)別和結(jié)合的DNA序列。8、 增強(qiáng)子:位于真核基因中遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),能明顯增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄效率的特殊DNA序列。它可位于被增強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄基因的上游或下游,也可相距靶基因較遠(yuǎn)。9、 基因表達(dá):是指生物基因組中結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定的生物學(xué)功能和生物學(xué)效應(yīng)的全過程。10、 信息分子:調(diào)節(jié)細(xì)胞生命活動(dòng)的化學(xué)物質(zhì)。其中由細(xì)胞分泌的調(diào)節(jié)靶細(xì)胞生命活動(dòng)的化學(xué)物質(zhì)稱為細(xì)胞間信息分子;而在細(xì)胞內(nèi)傳遞信息調(diào)控信號(hào)的化學(xué)物質(zhì)稱為細(xì)胞內(nèi)信息分子。11、 受體:是存在于靶細(xì)胞膜上或細(xì)胞內(nèi)能特異識(shí)別生物活性分子并與之結(jié)合,進(jìn)而發(fā)生生物學(xué)效應(yīng)的的特殊蛋白質(zhì)。12、 分子克隆:在體外對(duì)DNA分子按照即定目的和方案進(jìn)行人工重組,將重組分子導(dǎo)入合適宿主,使其在宿主中擴(kuò)增和繁殖,以獲得該DNA分子的大量拷貝。13、 蛋白激酶:是指能夠?qū)⒘姿峒瘓F(tuán)從磷酸供體分子轉(zhuǎn)移到底物蛋白的氨基酸受體上的一大類酶。14、 蛋白磷酸酶:是具有催化已經(jīng)磷酸化的蛋白質(zhì)分子發(fā)生去磷酸化反應(yīng)的一類酶分子,與蛋白激酶相對(duì)應(yīng)存在,共同構(gòu)成了磷酸化和去磷酸化這一重要的蛋白質(zhì)活性的開關(guān)系統(tǒng)。15、 基因工程:有目的的通過分子克隆技術(shù),人為的操作改造基因,改變生物遺傳性狀的系列過程。16、 載體:能在連接酶的作用下和外源DNA片段連接并運(yùn)送DNA分子進(jìn)入受體細(xì)胞的DNA分子。17、 轉(zhuǎn)化:指質(zhì)粒DNA或以它為載體構(gòu)建的重組DNA導(dǎo)入細(xì)菌的過程。18、 感染:以噬菌體、粘性質(zhì)粒和真核細(xì)胞病毒為載體的重組DNA分子,在體外經(jīng)過包裝成具有感染能力的病毒或噬菌體顆粒,才能感染適當(dāng)?shù)募?xì)胞,并在細(xì)胞內(nèi)擴(kuò)增。19、 轉(zhuǎn)導(dǎo):指以噬菌體為載體,在細(xì)菌之間轉(zhuǎn)移DNA的過程,有時(shí)也指在真核細(xì)胞之間通過逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)移和獲得細(xì)胞DNA的過程。20、 轉(zhuǎn)染:指病毒或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入真核細(xì)胞的過程。21、 DNA變性:在物理或化學(xué)因素的作用下,導(dǎo)致兩條DNA鏈之間的氫鍵斷裂,而核酸分子中的所有共價(jià)鍵則不受影響。22、 DNA復(fù)性:當(dāng)促使變性的因素解除后,兩條DNA鏈又可以通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合形成DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。23、 退火:指將溫度降至引物的TM值左右或以下,引物與DNA摸板互補(bǔ)區(qū)域結(jié)合形成雜交鏈。24、 筑巢PCR:先用一對(duì)外側(cè)引物擴(kuò)增含目的基因的大片段,再用內(nèi)側(cè)引物以大片段為摸板擴(kuò)增獲取目的基因。可以提高PCR的效率和特異性。25、 原位PCR:以組織固定處理細(xì)胞內(nèi)的DNA或RNA作為靶序列,進(jìn)行PCR反應(yīng)的過程。26、 定量PCR:基因表達(dá)涉及的轉(zhuǎn)錄水平的研究常需要對(duì)mRNA進(jìn)行定量測定,對(duì)此采用的PCR技術(shù)就叫定量PCR。27、 基因打靶:是指通過DNA定點(diǎn)同源重組,改變基因組中的某一特定基因,從而在生物活體內(nèi)研究此基因的功能。28、 DNA芯片:DNA芯片技術(shù)是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量的DNA探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標(biāo)記的樣品雜交,通過對(duì)雜交信號(hào)的檢測分析,即可獲得樣品的遺傳信息。由于常用計(jì)算機(jī)硅芯片作為固相支持物,所以稱為DNA芯片。29、 錯(cuò)義突變:DNA分子中堿基對(duì)的取代,使得mRNA的某一密碼子發(fā)生變化,由它所編碼的氨基酸就變成另一種的氨基酸,使得多肽鏈中的氨基酸順序也相應(yīng)的發(fā)生改變的突變。30、 無義突變:由于堿基對(duì)的取代,使原來可以翻譯某種氨基酸的密碼子變成了終止密碼子的突變。31、 同義突變:堿基對(duì)的取代并不都是引起錯(cuò)義突變和翻譯終止,有時(shí)雖然有堿基被取代,但在蛋白質(zhì)水平上沒有引起變化,氨基酸沒有被取代,這是因?yàn)橥蛔兒蟮拿艽a子和原來的密碼子代表同一個(gè)氨基酸的突變。32、 移碼突變:在編碼序列中,單個(gè)堿基、數(shù)個(gè)堿基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可以使突變位點(diǎn)之后的三聯(lián)體密碼閱讀框發(fā)生改變,不能編碼原來的蛋白質(zhì)的突變。33、 癌基因:是細(xì)胞內(nèi)控制細(xì)胞生長的基因,具有潛在的誘導(dǎo)細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的特性。當(dāng)癌基因結(jié)構(gòu)或表達(dá)發(fā)生異常時(shí),其產(chǎn)物可使細(xì)胞無限制增殖,導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。包括病毒癌基因和細(xì)胞癌基因。34、 細(xì)胞癌基因:存在于正常的細(xì)胞基因組中,與病毒癌基因有同源序列,具有促進(jìn)正常細(xì)胞生長、增殖、分化和發(fā)育等生理功能。在正常細(xì)胞內(nèi)未激活的細(xì)胞癌基因叫原癌基因,當(dāng)其受到某些條件激活時(shí),結(jié)構(gòu)和表達(dá)發(fā)生異常,能使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化。35、 病毒癌基因:存在于病毒(大多是逆轉(zhuǎn)錄病毒)基因組中能使靶細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化的基因。它不編碼病毒結(jié)構(gòu)成分,對(duì)病毒無復(fù)制作用,但是當(dāng)受到外界的條件激活時(shí)可產(chǎn)生誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生的作用。36、 基因診斷:以DNA或RNA為診斷材料,通過檢查基因的存在、結(jié)構(gòu)缺陷或表達(dá)異常,對(duì)人體的狀態(tài)和疾病作出診斷的方法和過程。37、 RFLP:即限制性片段長度多態(tài)性,個(gè)體之間DNA的核苷酸序列存在差異,稱為DNA多態(tài)性。若因此而改變了限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn)則可導(dǎo)致相應(yīng)的限制性片段的長度和數(shù)量發(fā)生變化,稱為RFLP。38、 基因治療:一般是指將限定的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)入患者特定的靶細(xì)胞,以最終達(dá)到預(yù)防或改變特殊疾病狀態(tài)為目的治療方法。39、 反義RNA:堿基序列正好與有意義的mRNA互補(bǔ)的RNA稱為反義RNA??梢宰鳛橐环N調(diào)控特定基因表達(dá)的手段。40、 核酶:是一種可以催化RNA切割和RNA剪接反應(yīng)的由RNA組成的酶,可以作為基因表達(dá)和病毒復(fù)制的抑制劑。41、 三鏈DNA:當(dāng)某一DNA或RNA寡核苷酸與DNA高嘌呤區(qū)可結(jié)合形成三鏈,能特異地結(jié)合在DNA的大溝中,并與富含嘌呤鏈上的堿基形成氫鍵。42、 SSCP:單鏈構(gòu)象多態(tài)性檢測是一種基于DNA構(gòu)象差別來檢測點(diǎn)突變的方法。相同長度的單鏈DNA,如果堿基序列不同,形成的構(gòu)象就不同,這樣就形成了單鏈構(gòu)象多態(tài)性。43、 管家基因:在生物體生命的全過程都是必須的,且在一個(gè)生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的基因。44、 細(xì)胞全能性:指同一種生物的所有細(xì)胞都含有相同的DNA,即基因的數(shù)目和種類是一樣的,但在不同階段,同一個(gè)體的不同組織和器官中基因表達(dá)的種類和數(shù)目是不同的。45、 SD序列:轉(zhuǎn)錄出的mRNA要進(jìn)入核糖體上進(jìn)行翻譯,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列與大腸桿菌16S rRNA3,末端富含嘧啶的序列互補(bǔ),是核糖體的識(shí)別位點(diǎn)。46、 反義核酸技術(shù):是通過合成一種短鏈且與DNA或RNA互補(bǔ)的,以DNA或RNA為目標(biāo)抑制翻譯的反義分子,干擾目的基因的轉(zhuǎn)錄、剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯等過程的技術(shù)。47、 核酸探針:探針是指能與某種大分子發(fā)生特異性相互作用,并在相互作用之后可以檢測出來的生物大分子。核酸探針是指能識(shí)別特異堿基順序的帶有標(biāo)記的一段DNA或RNA分子。48、 周期蛋白:是一類呈細(xì)胞周期特異性或時(shí)相性表達(dá)、累積與分解的蛋白質(zhì),它與周期素依賴性激酶共同影響細(xì)胞周期的運(yùn)行。49、 CAP:是大腸桿菌分解代謝物基因活化蛋白,這種蛋白可將葡萄糖饑餓信號(hào)傳遞個(gè)許多操縱子,使細(xì)菌在缺乏葡萄糖時(shí)可以利用其他碳源。50、 順反子51、 結(jié)構(gòu)域二、 問答題(一)、病毒、原核、真核基因組的特點(diǎn)?答:1、病毒基因組的特點(diǎn): 種類單一;單倍體基因組:每個(gè)基因組在病毒中只出現(xiàn)一次;形式多樣;大小不一;基因重疊;動(dòng)物/細(xì)菌病毒與真核/原核基因相似:內(nèi)含子;具有不規(guī)則的結(jié)構(gòu)基因;基因編碼區(qū)無間隔:通過宿主及病毒本身酶切;無帽狀結(jié)構(gòu);結(jié)構(gòu)基因沒有翻譯起始序列。2、原核基因組的特點(diǎn):為一條環(huán)狀雙鏈DNA;只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn);具有操縱子結(jié)構(gòu);絕大部分為單拷貝;可表達(dá)基因約50%,大于真核生物小于病毒;基因一般是連續(xù)的,無內(nèi)含子;重復(fù)序列很少。3、真核基因組的特點(diǎn):真核生物基因組遠(yuǎn)大于原核生物基因組,結(jié)構(gòu)復(fù)雜,基因數(shù)龐大,具有多個(gè)復(fù)制起點(diǎn);基因組DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合成染色體,儲(chǔ)存于細(xì)胞核內(nèi);真核基因?yàn)閱雾樂醋?,而?xì)菌和病毒的結(jié)構(gòu)基因多為多順反子;基因組中非編碼區(qū)多于編碼區(qū);真核基因多為不連續(xù)的斷裂基因,由外顯子和內(nèi)含子鑲嵌而成;存在大量的重復(fù)序列;功能相關(guān)的基因構(gòu)成各種基因家族;存在可移動(dòng)的遺傳因素;體細(xì)胞為雙倍體,而精子和卵子為單倍體。(二)、乳糖操縱子的作用機(jī)制?答:1、乳糖操縱子的組成:大腸桿菌乳糖操縱子含Z、Y、A三個(gè)結(jié)構(gòu)基因,分別編碼半乳糖苷酶、透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個(gè)操縱序列O,一個(gè)啟動(dòng)子P和一個(gè)調(diào)節(jié)基因I。2、阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié):沒有乳糖存在時(shí),I基因編碼的阻遏蛋白結(jié)合于操縱序列O處,乳糖操縱子處于阻遏狀態(tài),不能合成分解乳糖的三種酶;有乳糖存在時(shí),乳糖作為誘導(dǎo)物誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu),不能結(jié)合于操縱序列,乳糖操縱子被誘導(dǎo)開放合成分解乳糖的三種酶。所以,乳糖操縱子的這種調(diào)控機(jī)制為可誘導(dǎo)的負(fù)調(diào)控。3、CAP的正性調(diào)節(jié):在啟動(dòng)子上游有CAP結(jié)合位點(diǎn),當(dāng)大腸桿菌從以葡萄糖為碳源的環(huán)境轉(zhuǎn)變?yōu)橐匀樘菫樘荚吹沫h(huán)境時(shí),cAMP濃度升高,與CAP結(jié)合,使CAP發(fā)生變構(gòu),CAP結(jié)合于乳糖操縱子啟動(dòng)序列附近的CAP結(jié)合位點(diǎn),激活RNA聚合酶活性,促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合于操縱子后促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄,對(duì)乳糖操縱子實(shí)行正調(diào)控,加速合成分解乳糖的三種酶。4、協(xié)調(diào)調(diào)節(jié):乳糖操縱子中的I基因編碼的阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控與CAP的正調(diào)控兩種機(jī)制,互相協(xié)調(diào)、互相制約。(三)、真核生物轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控機(jī)制?答:真核生物在轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控主要是通過反式作用因子、順式作用元件和RNA聚合酶的相互作用來完成的,主要是反式作用因子結(jié)合順式作用元件后影響轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成過程。1、 轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成:真核生物RNA聚合酶識(shí)別的是由通用轉(zhuǎn)錄因子與DNA形成的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物,只有當(dāng)一個(gè)或多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合到DNA上,形成有功能的啟動(dòng)子,才能被RNA聚合酶所識(shí)別并結(jié)合。轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成過程為:TFD結(jié)合TATA盒;RNA聚合酶識(shí)別并結(jié)合TFD-DNA復(fù)合物形成一個(gè)閉合的復(fù)合物;其他轉(zhuǎn)錄因子與RNA聚合酶結(jié)合形成一個(gè)開放復(fù)合物。在這個(gè)過程中,反式作用因子的作用是:促進(jìn)或抑制TFD與TATA盒結(jié)合;促進(jìn)或抑制RNA聚合酶與TFD-DNA復(fù)合物的結(jié)合;促進(jìn)或抑制轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成。2、 反式作用因子:一般具有三個(gè)功能域(DNA識(shí)別結(jié)合域、轉(zhuǎn)錄活性域和結(jié)合其他蛋白結(jié)合域);能識(shí)別并結(jié)合上游調(diào)控區(qū)中的順式作用元件;對(duì)基因的表達(dá)有正性或負(fù)性調(diào)控作用。3、 轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控:反式作用因子的活性調(diào)節(jié):表達(dá)式調(diào)節(jié)反式作用因子合成出來就具有活性;共價(jià)修飾磷酸化和去磷酸化,糖基化;配體結(jié)合許多激素受體是反式作用因子;蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)復(fù)合物的解離與形成。反式作用因子與順式作用元件的結(jié)合:反式作用因子被激活后,即可識(shí)別并結(jié)合上游啟動(dòng)子元件和增強(qiáng)子中的保守性序列,對(duì)基因轉(zhuǎn)錄起調(diào)節(jié)作用。反式作用因子的作用方式成環(huán)、扭曲、滑動(dòng)、Oozing。反式作用因子的組合式調(diào)控作用:每一種反式作用因子結(jié)合順式作用元件后雖然可以發(fā)揮促進(jìn)或抑制作用,但反式作用因子對(duì)基因調(diào)控不是由單一因子完成的而是幾種因子組合發(fā)揮特定的作用。(四)、真核生物轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控機(jī)制?答:(1)、5,端加帽和3,端多聚腺苷酸化的調(diào)控意義:5,端加帽和3,端多聚腺苷酸化是保持mRNA穩(wěn)定的一個(gè)重要因素,它至少保證mRNA在轉(zhuǎn)錄過程中不被降解。(2)、mRNA選擇性剪接對(duì)基因表達(dá)調(diào)控的作用(3)、mRNA運(yùn)輸?shù)目刂疲ㄎ澹?、受體的特點(diǎn)?答:1、高度專一性;2、高度親和性;3、可逆性;4、可飽和性;5、特定的作用模式(六)、表皮生長因子介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)途徑?答:表皮生長因子受體是一個(gè)典型的蛋白酪氨酸激酶受體,這個(gè)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的主要步驟是:1、 受體二聚化的形成及其磷酸化:表皮生長因子與受體的結(jié)合使受體發(fā)生二聚化,從而改變受體構(gòu)象,使蛋白酪氨酸激酶活性增強(qiáng),受體自身的幾個(gè)蛋白酪氨酸殘基在激酶的作用下發(fā)生磷酸化。2、 募集接頭蛋白Grb2:表皮生長因子受體自身被磷酸化后,不僅其激酶活性增強(qiáng),而且其構(gòu)象發(fā)生變化,從而適合與含SH2結(jié)構(gòu)域的蛋白分子相結(jié)合。Grb2是作為接頭蛋白結(jié)合到受體上。3、 調(diào)控分子SOS的活化:SOS含有可與SH3結(jié)構(gòu)域相結(jié)合的富含脯氨酸基序,當(dāng)Grb2結(jié)合到磷酸化的表皮生長因子受體后,它的兩個(gè)SH3結(jié)構(gòu)域即可結(jié)合SOS,使之活化。4、 低分子量G蛋白R(shí)as的活化:SOS可促進(jìn)Ras釋放GDP,結(jié)合GTP的反應(yīng),使Ras激活?;罨腞as作用其下游分子Raf,使之活化。Raf是MAPK級(jí)聯(lián)反應(yīng)的第一個(gè)分子,由此啟動(dòng)了MAPK的三級(jí)激活過程。5、 MAPK的級(jí)聯(lián)激活:Raf是一種MAPKKK,它作用于MEK,使之磷酸化而激活,活化的MEK在作用于MAPK家族的ERK1,使之磷酸化激活由此完成了三級(jí)激活。6、 轉(zhuǎn)錄因子的磷酸化及轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用:活化的ERK可以轉(zhuǎn)至細(xì)胞核內(nèi),使某些轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子發(fā)生磷酸化,從而影響基因的轉(zhuǎn)錄。(七)、cAMP信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑?答:1、組成:胞外信息分子(主要是胰高血糖素、腎上腺素和促腎上腺皮質(zhì)激素),受體,G蛋白,AC,cAMP , PKA。2、途徑:? 信號(hào)分子與受體結(jié)合,引起受體構(gòu)象變化? 受體活化G蛋白? 活化后的G蛋白激活腺苷酸環(huán)化酶(AC)? AC催化ATP生成cAMP? cAMP活化PKA,PKA使目標(biāo)蛋白磷酸化,調(diào)節(jié)代謝酶的活性或調(diào)節(jié)基因的表達(dá)(八)、IP3-Ca2+信號(hào)途徑:? 信號(hào)分子與受體結(jié)合,引起受體構(gòu)象變化? 受體活化G蛋白? 活化后的G蛋白激活PLC? PLC水解PIP2生成IP3 和DG? IP3 使鈣通道打開,細(xì)胞內(nèi)Ca2+升高? Ca2+與CaM結(jié)合,激活Ca2+-CaM依賴的蛋白激酶? Ca2+-CaM依賴的蛋白激酶使目標(biāo)蛋白磷酸化。(九)、分子克隆中常用的工具酶及良好載體的條件?答:(1)、常用的工具酶1、 限制性核酸內(nèi)切酶:是細(xì)菌產(chǎn)生的一類能識(shí)別和切割雙鏈DNA分子內(nèi)特定的堿基順序的核酸水解酶。2、 DNA連接酶:將兩段DNA分子拼接起來的酶。3、 DNA聚合酶:催化單核苷酸鏈延伸。4、 逆轉(zhuǎn)錄酶:依賴于RNA的DNA聚合酶,這是一種有效的轉(zhuǎn)錄RNA成為DNA的酶,產(chǎn)物DNA又稱互補(bǔ)DNA。5、 末端脫氧核糖核酸轉(zhuǎn)移酶:將脫氧核糖核酸加到DNA的3末端。6、 堿性磷酸酶:催化去除DNA、RNA等的5磷酸基團(tuán)。7、 依賴DNA的RNA聚合酶:識(shí)別特異性啟動(dòng)子,RNA轉(zhuǎn)錄。(2)、良好載體的條件1、必須有自身的復(fù)制子;2、載體分子上必須有限制性核酸內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn),即多克隆位點(diǎn),以供外源DNA插入;3、載體應(yīng)具有可供選擇的遺傳標(biāo)志,以區(qū)別陽性重組子和陰性重組子;4、載體分子必須有足夠的容量;5、可通過特定的方法導(dǎo)入細(xì)胞;6、對(duì)于表達(dá)載體還應(yīng)具備與宿主細(xì)胞相適應(yīng)的啟動(dòng)子、前導(dǎo)順序、增強(qiáng)子、加尾信號(hào)等DNA調(diào)控元件。(十)、藍(lán)-白篩選的原理?答:某些質(zhì)粒帶有大腸桿菌的半乳糖苷酶基因片段,在半乳糖苷酶基因的基因區(qū)外又另外引入了一段含多種單一限制酶位點(diǎn)的DNA序列。這些位點(diǎn)上如果沒有克隆外源性DNA片段,在質(zhì)粒被導(dǎo)入lac-的大腸桿菌后,質(zhì)粒攜帶的半乳糖苷酶基因?qū)⒄1磉_(dá),與大腸桿菌的半乳糖苷酶基因互補(bǔ),產(chǎn)生有活性的半乳糖苷酶,加入人工底物X-gal和誘導(dǎo)劑IPTG后,出現(xiàn)藍(lán)色的菌落。如果在多克隆位點(diǎn)上插入外源DNA片段,將使lac Z基因滅活,不能生成半乳糖苷酶,結(jié)果菌落出現(xiàn)白色。由于這種顏色標(biāo)志,重組克隆和非重組克隆的區(qū)分一目了然。十一)SANGER雙脫氧鏈終止法的原理?答:DNA鏈中核苷酸以3,5-磷酸二酯鍵連接,合成DNA所用的底物是 2-脫氧核苷三磷酸。2,3ddNTP與普通dNTP不同,它們?cè)诿撗鹾颂堑?位置缺少一個(gè)羥基。在DNA聚合酶作用下通過三磷酸基團(tuán)摻入到延伸的DNA鏈中,但由于沒有3羥基,不能同后續(xù)的dNTP形成磷酸二酯鍵,因此,正在延伸的DNA鏈不能繼續(xù)延伸。在DNA合成反應(yīng)混合物的4種普通dNTP中加入少量的一種ddNTP,鏈延伸將與偶然發(fā)生但卻十分特異的鏈終止競爭,產(chǎn)物是一系列的核苷酸鏈,其長度取決于引物末端到出現(xiàn)過早鏈終止位置間的距離。在4組獨(dú)立酶反應(yīng)中分別采用4種不同的ddNTP,結(jié)果將產(chǎn)生4組寡核苷酸,它們將分別終止于模板鏈的A、C、G或T位置。(十二)、核酸分子雜交的原理?答:具有互補(bǔ)序列的兩條單鏈核酸分子在一定的條件下(適宜的溫度及離子強(qiáng)度等)堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合,重新形成雙鏈;在這一過程中,核酸分子經(jīng)歷了變性和復(fù)性的變化,以及在復(fù)性過程中個(gè)分子間鍵的形成和斷裂。雜交的雙方是待測核酸和已知序列。(十三)、影響雜交的因素?答:1、核酸分子的濃度和長度:核酸濃度越大,復(fù)性速度越快。探針長度應(yīng)控制在50-300個(gè)堿基對(duì)為好。2、溫度:溫度過高不利于復(fù)性,而溫度過低,少數(shù)堿基配對(duì)形成的局部雙鏈不易解離,適宜的溫度是較TM值低25度。3、離子強(qiáng)度:在低離子強(qiáng)度下,核酸雜交非常緩慢,隨著離子強(qiáng)度的增加,雜交反應(yīng)率增加。高濃度的鹽使堿基錯(cuò)配的雜交體更穩(wěn)定,所以進(jìn)行序列不完全同源的核酸分子雜交時(shí)必須維持雜交反應(yīng)液中的鹽濃度和洗膜液中的鹽濃度。4、雜交液中的甲酰胺:甲酰胺能降低核酸雜交的TM值。它有以下優(yōu)點(diǎn):在低溫下探針更穩(wěn)定;能更好地保留非共價(jià)結(jié)合的核酸。5、核酸分子的復(fù)雜性:是指存在于反應(yīng)體系中的不同順序的總長度。兩個(gè)不同基因組DNA變性后的相對(duì)雜交速率取決于樣品濃度絕對(duì)一致時(shí)的相對(duì)復(fù)雜性(即DNA中的堿基數(shù))。6、非特異性雜交反應(yīng):在雜交前應(yīng)對(duì)非特異性雜交反應(yīng)位點(diǎn)進(jìn)行封閉,以減少其對(duì)探針的非特異性吸附作用。(十四)、探針的種類和優(yōu)缺點(diǎn)?答:1、cDNA探針:通過逆轉(zhuǎn)錄獲得cDNA后,將其克隆于適當(dāng)?shù)目寺≥d體,通過擴(kuò)增重組質(zhì)粒而使cDNA得到大量的擴(kuò)增。提取質(zhì)粒后分離純化作為探針使用。它是目前應(yīng)用最為廣泛的一種探針。2、基因組探針:從基因組文庫里篩選得到一個(gè)特定的基因或基因片段的克隆后,大量擴(kuò)增、純化,切取插入片段,分離純化為探針。3、寡核苷酸探針:根據(jù)已知的核酸順序,采用DNA合成儀合成一定長度的寡核苷酸片段作為探針。4、RNA探針:采用基因克隆和體外轉(zhuǎn)錄的方法可以得到RNA或反義RNA作為探針。(十五)、探針的標(biāo)記法?答:1、缺口平移法:此法是利用適當(dāng)濃度的DNase 在DNA雙鏈上隨機(jī)切割單鏈,造成單鏈切口。切口處產(chǎn)生一個(gè)5末端和3末端,3末端就可以作為引物,在大腸桿菌DNA聚合酶的催化下,以互補(bǔ)的DNA單鏈為摸板,依次將dNTP連接到切口的3末端的羥基上,合成新的DNA單鏈;同時(shí)DNA聚合酶的53的核酸外切酶活性在切口處將舊鏈從5末端逐步切除,新合成鏈不斷延伸,從而使原DNA分子上的部分核苷酸殘基被標(biāo)記的核苷酸所取代。2、隨機(jī)引物法:隨機(jī)引物是人工合成的長度為6個(gè)寡核苷酸殘基的寡聚核苷酸片段的混合物。對(duì)于任何一個(gè)用作探針的DNA片段,隨機(jī)引物混合物中都會(huì)有一些六核苷酸片段可以與之結(jié)合,起到DNA合成引物的作用。將這些引物與變性的DNA單鏈結(jié)合后,以4種dNTP(其中一種是標(biāo)記物標(biāo)記的dNTP)為底物,合成與探針DNA互補(bǔ)的切帶有標(biāo)記物的DNA探針。3、PCR標(biāo)記法:在PCR反應(yīng)底物中,將一種dNTP換成標(biāo)記物標(biāo)記的dNTP, 這樣標(biāo)記的dNTP就在PCR反應(yīng)的同時(shí)摻入到新合成的DNA鏈上。4、末端標(biāo)記法:只是將DNA片段的一端進(jìn)行標(biāo)記。(十六)、PCR的基本原理?答:PCR是在試管中進(jìn)行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來控制的。需要重復(fù)進(jìn)行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸個(gè)步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94。退火:引物單鏈DNA?雜交鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70 左右, Taq DNA聚合酶以種dNTP為原料,以目的DNA為模板,催化以引物末端為起點(diǎn)的53DNA鏈延伸反應(yīng),形成新生DNA鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的DNA得到高效快速擴(kuò)增。(十七)、PCR引物設(shè)計(jì)的基本要求?答:1、引物長度一般為1530個(gè)核苷酸。過短影響PCR的特異性,過長會(huì)提高相應(yīng)退火溫度,使延伸溫度超過TaqDNA聚合酶最適溫度74,影響產(chǎn)物的生成。2、引物的堿基盡可能隨機(jī),避免出現(xiàn)嘌呤、嘧啶堿基堆積現(xiàn)象。3端不應(yīng)有連續(xù)3個(gè)G和C。否則會(huì)使引物和模板錯(cuò)誤配對(duì)。G+C含量一般占45 -55。3端和5端引物具有相似的Tm值,Tm值計(jì)算公式:Tm4(G+C)+ 2(A+T)3、引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列以避免折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。引物的連續(xù)互補(bǔ)序列,一般不超過3bp。4、兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其應(yīng)避免3端的互補(bǔ)重疊。5、引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不超過70,引物3末端連續(xù)8個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。6、引物3端堿基是引發(fā)延伸的起點(diǎn),因此一定要與模板DNA配對(duì)。引物3端最佳堿基選擇是G和C,形成的堿基配對(duì)比較穩(wěn)定。7、引物與模板結(jié)合時(shí),引物的5端最多可以游離十幾個(gè)堿基而不影響PCR反應(yīng)的進(jìn)行。8、引物的5端可以修飾,如附加限制酶位點(diǎn),引入突變位點(diǎn),用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標(biāo)記,加入其它短序列包括起始密碼子、終止密碼子等(十八)、PCR的反應(yīng)條件?答:1、PCR反應(yīng)的緩沖液: ? Tris-HCl緩沖液? KCl 促進(jìn)引物的退火,濃度太高時(shí)會(huì)抑制Taq DNA聚合酶活性。? 加入BSA或明膠有利于保護(hù)TaqDNA聚合酶活性。? 必要時(shí)加入適量二甲基亞砜(DMSO)或甲酰胺利于破壞模板二級(jí)結(jié)構(gòu),提高PCR反應(yīng)特異性。2、鎂離子濃度 一般用量1.5-2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶活性需要Mg 2+。Mg 2+濃度過低,會(huì)顯著降低酶活性。Mg 2+濃度過高又使酶催化非特異性擴(kuò)增增強(qiáng)。Mg 2+濃度還會(huì)影響引物的退火、模板與PCR產(chǎn)物的解鏈溫度,從而影響擴(kuò)增片段的產(chǎn)率。 3、底物濃度 工作濃度20-200umol/L, dNTPs濃度過高可加快反應(yīng)速度,也增加堿基的錯(cuò)配率和實(shí)驗(yàn)成本。降低濃度會(huì)導(dǎo)致反應(yīng)速度下降,可提高反應(yīng)的特異性。在PCR反應(yīng)中,4種dNTP必須以等摩爾濃度配制,以減少PCR反應(yīng)的錯(cuò)配誤差并提高使用效率。4、Taq DNA聚合酶 75-80時(shí)具有最高的聚合酶活性,150個(gè)核苷酸/秒;具有良好的熱穩(wěn)定性,95仍有活性,應(yīng)用濃度一般為1-2.5u/100ul反應(yīng)體積。5、引物 0.1-0.5umol/L。引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配或非特異性擴(kuò)增、生成引物二聚體,使目的DNA片段產(chǎn)率下降。退火溫度與引物Tm值有關(guān),引物Tm值在55-80 范圍較為理想。6、反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù)(十九)、影響大腸桿菌系統(tǒng)外源基因表達(dá)的因素?答:1、啟動(dòng)子的強(qiáng)弱;2、基因的劑量;3、影響RNA轉(zhuǎn)錄和翻譯效率的因素:SD序列、mRNA;4、外源基因密碼子的選擇;5、表達(dá)產(chǎn)物的大??;6、表達(dá)產(chǎn)物的穩(wěn)定性。(二十)、大腸桿菌系統(tǒng)表達(dá)外源基因必須具備的條件?答:1、要求外源基因的編碼區(qū)不能含有內(nèi)含子;2、表達(dá)的外源片段要位于大腸桿菌啟動(dòng)子的下游,并形成正確的閱讀框架;3、轉(zhuǎn)錄出的mRNA必須有與大腸桿菌16S rRNA3,末端相匹配的SD序列,才能被有效的翻譯成蛋白質(zhì)。4、蛋白產(chǎn)物必須穩(wěn)定,不易被細(xì)胞內(nèi)蛋白酶快速降解,且對(duì)宿主無害。(二十一)、真核細(xì)胞表達(dá)外源基因的條件?答:1、首先必須具備哺乳動(dòng)物細(xì)胞
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