非編碼RNA研究專題02circRNA的調(diào)控與應(yīng)用

?circRNA的調(diào)控及應(yīng)用解螺旋|

知識(shí)金牌知識(shí)金牌Contents課程目錄第一部分第二部分第三部分circRNA的研究背景circRNA的類型及功能研究

circRNA的高分文章解讀解螺旋|陪伴

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circRNA的研究背景01知識(shí)金牌第一部分：circRNA的研究背景解螺旋|陪伴

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什么是環(huán)狀RNA？Circular

RNA

(or

circRNA)

is

a

type

of

RNA

which,

unlike

the

better

knownlinear

RNA,

forms

a

covalently

closed

continuous

loop,

i.e.,

in

circular

RNA

the

3'

and

5'

ends

normally

present

in

an

RNA

molecule

have

beenjoined

together.知識(shí)金牌第一部分：circRNA的研究背景circRNA的特點(diǎn)：閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)：無5‘cap和3’polyA；特異性的back

splicingsite（circRNA

junction）；半衰期長，能夠穩(wěn)定存在于細(xì)胞中；穩(wěn)定：不受外切酶影響；不翻譯蛋白；組織特異性、時(shí)序特異性、疾病特異性；調(diào)控作用：ceRNA、hostgene；目前發(fā)現(xiàn)10%以上的基因可以產(chǎn)生circRNA，85%來源于外顯子，含1-5個(gè)外顯子。解螺旋|陪伴

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02circRNA的類型及功能研究知識(shí)金牌第二部分：circRNA的類型及功能研究一、circRNA的類型解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌第二部分：circRNA的類型及功能研究二、circRNA的功能研究Exonic

circRNA功能研究解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌二、circRNA的功能研究circular

intronicRNA（ciRNA）功能研究第二部分：circRNA的類型及功能研究解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌二、circRNA的功能研究exon-intron

circRNA（EIciRNA）功能研究第二部分：circRNA的類型及功能研究解螺旋|陪伴

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03circRNA的高分文章解讀知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀一、circRNA晉升為新一代臨床biomarkercircRNA的特征：成環(huán)易出膜：容易進(jìn)入體液不易被RNA外切酶降解組織特異性、疾病特異性時(shí)序特異性circRNA數(shù)目相對較少理想biomarker的特征：無損傷驗(yàn)證：取材容易穩(wěn)定性高：準(zhǔn)確檢測特異性好：組織特異性、疾病特異性靈敏度高：能夠準(zhǔn)確地指示疾病狀態(tài)指標(biāo)數(shù)少：減少檢測復(fù)雜性，經(jīng)濟(jì)、快速最新的RNA研究熱點(diǎn)易于快速發(fā)文章解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀qRT-PCR

analysis

of

circ-KLDHC10

levels

in

normal

serum

and

CRC

serum

(n

=

11,

respectively)解螺旋|陪伴

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Production

of

ANRIL

in

human

is

correlated

with

therisk

of

atherosclerosis(動(dòng)脈粥樣硬化)腫瘤代謝病知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀Detection

of

circRNA

for

miRNA-7

(ciRS-7)

in

sporadic

Alzheimer'sdisease

(AD)

and

age-matched

control

hippocampal

CA1神經(jīng)系統(tǒng)解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀Differentially

expressed

circRNAs

between

HCC

tissues

and

adjacent

nontumorous

tissuesThe

expression

levels

of

candidate

circRNAs

for

validationin

HCC

tissue

and

adjacent

liver

tissue

samplesHsa_circ_0005075

could

serve

as

a

biomarker

for

HCC解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀The

predicted

hsa_circ_0005075targeted

circRNA-miRNA-mRNA/genenetwork

based

on

sequence-pairingprediction.解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀肝癌組織VS癌旁組織（N=3）Arraystar

Huamn

circRNA

Array檢測到61個(gè)差異表達(dá)的circRNA，其中26個(gè)上調(diào)，35個(gè)下調(diào)QPCR（N=60）肝癌組織中hsa_circ_0005075顯著上調(diào)臨床數(shù)據(jù)證明hsa_circ_0005075可作為肝癌診斷潛在的生物標(biāo)志物通過生信分析構(gòu)建出circRNA-miRNA-mRNA的互作網(wǎng)絡(luò)；GO分析揭示了hsa_circ_0005075參與肝癌發(fā)展過程中的細(xì)胞粘附作用解螺旋|陪伴

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知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀二、circRNA的功能研究前期研究：circ-Foxo3抑制腫瘤細(xì)胞生長，繼而探究相關(guān)功能研究circ-Foxo3表達(dá)水平與G1期阻滯呈正相關(guān)功能研究：circ-Foxo3異常表達(dá)（RNAi和過表達(dá)）導(dǎo)致細(xì)胞周期改變、抑制細(xì)胞增殖機(jī)制研究：RIP和RNApull-down證明circ-Foxo3通過結(jié)合CDK2與p21，導(dǎo)致cyclin

A和cyclinE從CDK2上脫離，進(jìn)而改變細(xì)胞周期，抑制細(xì)胞

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知識(shí)金牌第三部分：circRNA的高分文章解讀糖尿病小鼠和野生型小鼠心肌組織（N=4）Arraystar

Huamn

circRNA

Array檢測到76個(gè)差異表達(dá)的circRNA，其中45個(gè)上調(diào)，31個(gè)下調(diào)QPCR糖尿病心肌組織中circRNA_000203與其宿主基因Myo9a的表達(dá)量顯著上升功能研究：過表達(dá)circRNA_000203促進(jìn)纖維化基因Col1a2、Col3a1和α-SM