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微生物代謝控制發(fā)酵(生物工程專業(yè))Welcometothestudyofmicrobiology!微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
在新世紀(jì),生命科學(xué)研究、生物技術(shù)的重大突破。將在醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)、環(huán)境、能源等領(lǐng)域引發(fā)新的產(chǎn)業(yè)革命,為解決人類生存與發(fā)展面臨的健康、資源、環(huán)境等重大問題提供強(qiáng)有力的手段。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理生物工程專業(yè)20世紀(jì)40年代的發(fā)酵工學(xué)專業(yè)50年代的抗生素制造工學(xué)專業(yè)80年代的生物化學(xué)工程專業(yè)、生物化工專業(yè)90年代發(fā)展為生物工程專業(yè)生物工程專業(yè)正式設(shè)立于1998年,在1998年我國頒布的本科專業(yè)目錄中,明確生物工程專業(yè)屬于工學(xué):生物工程包含了原來的生物化工(部分)、微生物制藥、生物化學(xué)工程(部分)、發(fā)酵工程等4個(gè)專業(yè)。生物工程專業(yè)的相近專業(yè)定為應(yīng)用理學(xué)的生物技術(shù)專業(yè)。因?yàn)樯锛夹g(shù)專業(yè)培養(yǎng)應(yīng)用研究型人才,而生物工程專業(yè)培養(yǎng)應(yīng)用型工程技術(shù)人才,兩者的側(cè)重點(diǎn)不同。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理生物工程學(xué)科的內(nèi)涵是利用生物體系,應(yīng)用生物學(xué)、化學(xué)和工程技術(shù)相結(jié)合的方法,按照人類的需要改造和設(shè)計(jì)生物的結(jié)構(gòu)與功能,以便更經(jīng)濟(jì)、更有效、大規(guī)模地為人類提供所需各種產(chǎn)品的技術(shù),是生物技術(shù)成果走向工業(yè)化的關(guān)鍵技術(shù)。生物工程學(xué)科是以基因工程、蛋白質(zhì)工程、細(xì)胞工程、酶工程、發(fā)酵工程、生化工程為核心,借助于工程學(xué)技術(shù),以生物技術(shù)研究成果為對(duì)象、實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化為基本任務(wù)的工學(xué)學(xué)科。生物工程廣泛應(yīng)用于化工、醫(yī)藥、食品、農(nóng)業(yè)、能源、資源和環(huán)境等領(lǐng)域,近年來發(fā)展迅猛。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝控制發(fā)酵
細(xì)胞形態(tài)、分類、生理(營養(yǎng)和代謝)有機(jī)物種類、合成、分解?;蚍N類、轉(zhuǎn)錄、翻譯調(diào)控。?Microbiologyrevolvesaroundtwobasicthemes:basicandapplied微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理MetabolicControlFermentation課程性質(zhì)和任務(wù)性質(zhì):學(xué)位選修課,24學(xué)時(shí),2學(xué)分。任務(wù):使同學(xué)掌握利用微生物生產(chǎn)人類所需要的產(chǎn)品的先進(jìn)調(diào)控技術(shù)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理課程主要內(nèi)容和時(shí)間安排第一章緒論(2)第二章微生物代謝調(diào)節(jié)機(jī)制(6)第三章微生物代謝控制發(fā)酵(6)第四章代謝控制發(fā)酵育種的基本技術(shù)(4)第五章代謝控制發(fā)酵的應(yīng)用(6)概況原理
技術(shù)應(yīng)用vip_lxviplxl微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理考核方法平時(shí)成績(jī)(20%)上課出勤、回答問題、筆記和作業(yè)情況??荚嚦煽?jī)(80%)閉卷考試。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理教材:代謝控制發(fā)酵張克旭主編中國輕工業(yè)出版社參考教材:生物化學(xué)魏述眾主編中國輕工業(yè)出版社途徑工程——第三代基因工程張惠展主編中國輕工業(yè)出版社現(xiàn)代工業(yè)發(fā)酵調(diào)控學(xué)華東理工大學(xué)儲(chǔ)炬李友榮主編化學(xué)工業(yè)出版社微生物生物技術(shù)——應(yīng)用微生物學(xué)基礎(chǔ)原理科學(xué)技術(shù)出版社華中農(nóng)業(yè)大學(xué)陳守文喻子牛等翻譯微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第一章緒論第一節(jié)發(fā)酵工業(yè)概況代表性發(fā)酵產(chǎn)品概況:如,酒精、啤酒、酶制劑、有機(jī)酸、氨基酸、抗生素、維生素等。第二節(jié)發(fā)酵技術(shù)的歷史進(jìn)程混合菌種發(fā)酵階段;純種發(fā)酵階段;深層通風(fēng)發(fā)酵階段;代謝控制發(fā)酵階段;廣泛的生物化學(xué)工業(yè)階段(生物煉制)。第三節(jié)微生物代謝概述微生物細(xì)胞代謝的基本概念;細(xì)胞代謝的特點(diǎn);微生物細(xì)胞代謝調(diào)節(jié)的意義;代謝控制發(fā)酵理論的發(fā)展;代謝控制發(fā)酵理論的應(yīng)用;代謝工程。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第一節(jié)發(fā)酵工業(yè)概況發(fā)酵:指通過微生物培養(yǎng),使某種特定代謝產(chǎn)物大量積累的過程。發(fā)酵工程:是基于生物學(xué)知識(shí)和工程學(xué)概念,采用現(xiàn)代生物技術(shù)和工程技術(shù)手段,利用微生物和動(dòng)植物細(xì)胞的某些特定性狀功能,在反應(yīng)器中為人類生產(chǎn)有用的產(chǎn)品。
掌握生物技術(shù)及其產(chǎn)業(yè)化的科學(xué)原理、工藝過程和工程設(shè)計(jì)等基礎(chǔ)理論,基本技能,能在生物技術(shù)與工程領(lǐng)域從事設(shè)計(jì)、生產(chǎn)、管理和新技術(shù)研究、新產(chǎn)品開發(fā)的工程技術(shù)人才。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理菌種選育發(fā)酵工程的內(nèi)容過程控制產(chǎn)品提純微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物生物反應(yīng)器的研究開發(fā),新型發(fā)酵裝置、生物傳感器和使用電子計(jì)算機(jī)控制的自動(dòng)化連續(xù)發(fā)酵的技術(shù);利用微生物控制或參與工業(yè)生產(chǎn),如采礦、冶金等。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理發(fā)酵工業(yè):是以糧食和農(nóng)副產(chǎn)品為主要原料的發(fā)酵加工工業(yè)。在各產(chǎn)業(yè)部門中,年產(chǎn)值已躍居第一位(600/3600多億元),成為國民經(jīng)濟(jì)的主要文柱產(chǎn)業(yè)之一。傳統(tǒng)產(chǎn)業(yè)主要包括酒精、白酒、啤酒、葡萄酒、淀粉糖、酵母、氨基酸?,F(xiàn)代產(chǎn)業(yè)主要包括有機(jī)酸、多元醇、酶制劑、核苷酸、維生素、抗生素、生物技術(shù)藥物、疫苗、診斷試劑等行業(yè)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理產(chǎn)品產(chǎn)量(萬噸)備注味精170賴氨酸32主要為飼料檸檬酸72包括鹽和酯乳酸8酶制劑53酵母15.5主要為ADY糖醇560特種發(fā)酵品80合計(jì):990.5萬噸2006年中國發(fā)酵工業(yè)主要產(chǎn)品產(chǎn)量微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理現(xiàn)代發(fā)酵工程規(guī)模低值工業(yè)品大型化
以規(guī)模來取勝(幾十?dāng)?shù)百噸)。如味精、氨基酸、有機(jī)酸、抗生素、飼料、食品工業(yè)用產(chǎn)品等;高價(jià)值轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品小型化(幾十?dāng)?shù)百升)。基因工程大腸桿菌、酵母菌高密度培養(yǎng);動(dòng)物細(xì)胞植物細(xì)胞培養(yǎng);研究中心智能化、全能性。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酒精工業(yè)的現(xiàn)狀2003年世界乙醇總產(chǎn)量約2500萬噸,(歷史最高產(chǎn)量為2700萬噸)其中美洲產(chǎn)量1650萬噸,亞洲442萬噸,歐洲380萬噸,非洲40萬噸,大洋洲16萬噸。其中:巴西年產(chǎn)量達(dá)1100萬噸,美國年產(chǎn)發(fā)酵乙醇逾400萬噸,俄羅斯年產(chǎn)近100萬噸乙醇。在世界上乙醇的用途以燃料乙醇為主占66%,食用乙醇14%,工業(yè)溶劑11%,其它化學(xué)工業(yè)9%。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2004年我國乙醇實(shí)際產(chǎn)量340萬噸,生產(chǎn)能力600萬噸。2006年的酒精實(shí)際產(chǎn)量571萬噸。其中,燃料乙醇占132萬噸,用玉米生產(chǎn)的燃料乙醇85萬噸。到目前為止,乙醇生產(chǎn)企業(yè)(包括生產(chǎn)車間)已達(dá)1000多個(gè),遍及各省市自治區(qū)(西藏除外),其中以山東、四川最多。產(chǎn)量居世界第二位??傮w來講,我國酒精行業(yè)發(fā)展速度偏快,短期內(nèi)國內(nèi)酒精市場(chǎng)供大于求,盈利空間變小,企業(yè)生存面臨困難。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酒精工業(yè)的困難與機(jī)遇乙醇生產(chǎn)原料占總成本的70%以上,原料是企業(yè)的生命線。目前,我國酒精的原料結(jié)構(gòu)相對(duì)單一,玉米占總原料的近70%。按3.2噸玉米產(chǎn)1噸酒精計(jì)算,每年消耗玉米約1300萬噸。2006年全國玉米產(chǎn)量1.44億噸,當(dāng)年全國玉米深加工量3589萬噸,玉米價(jià)格已達(dá)到1660元/噸。進(jìn)口木薯價(jià)格仍保持高價(jià)上漲態(tài)勢(shì),原料市場(chǎng)供應(yīng)緊張。一、原料緊張微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理國家發(fā)展和改革委員會(huì)2007年9月發(fā)布微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
乙醇工業(yè)在為國民經(jīng)濟(jì)做出突出貢獻(xiàn)的同時(shí)又是一個(gè)污染十分嚴(yán)重的行業(yè)?,F(xiàn)行的乙醇生產(chǎn)工藝所造成的污染以水污染最為嚴(yán)重,生產(chǎn)過程的廢水主要來自發(fā)酵醪蒸餾乙醇后排除的廢糟、生產(chǎn)設(shè)備的洗滌水、以及蒸煮、糖化發(fā)酵、蒸餾工藝的冷卻水等。每生產(chǎn)一噸成品乙醇約排放13-16噸乙醇廢糟,乙醇廢糟為高濃度有機(jī)廢水,呈酸性,CODCr高達(dá)50000-70000mg/L,是乙醇工業(yè)最主要的污染源。二、污染嚴(yán)重微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理世界平均水平單位酒精能耗300-400公斤標(biāo)煤,我國是800公斤。酒精生產(chǎn)企業(yè)在節(jié)能、自動(dòng)化、綜合利用和廢渣廢水治理等方面與先進(jìn)國家尚有很大差距,從另一個(gè)角度說,差距也是潛力。三、能耗太高微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酒精工業(yè)技術(shù)進(jìn)步方向1、木質(zhì)纖維素生產(chǎn)酒精微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2、清液發(fā)酵技術(shù)生產(chǎn)酒精3、高濃度發(fā)酵技術(shù)生產(chǎn)酒精國外的高濃度酒精發(fā)酵是常用的技術(shù),酒精濃度達(dá)到14-15%,我國同類工藝尚處于試驗(yàn)階段,酒精濃度也可達(dá)到14%,但相關(guān)配套工藝存在問題。4、廢棄物綜合利用技術(shù)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理啤酒工業(yè)情況2004年啤酒總產(chǎn)量達(dá)到2700萬噸,超過美國(2400萬噸),德國(1250萬噸),躍居世界第一。但人均消費(fèi)量?jī)H為世界平均水平的70%,為歐美等發(fā)達(dá)國家的1/6~1/7。工藝技術(shù),產(chǎn)品質(zhì)量,市場(chǎng)營銷等總體水平與啤酒先進(jìn)國家仍有一定的差距。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理白酒工業(yè)情況1996年白酒產(chǎn)量創(chuàng)歷史最高達(dá)到800萬噸。2004年450萬噸。白酒產(chǎn)量明顯下降,主要原因是產(chǎn)業(yè)政策、消費(fèi)習(xí)慣、社會(huì)節(jié)奏加快、健康、駕駛等原因限制了白酒的消費(fèi)。白酒是民族特色產(chǎn)品,其生產(chǎn)工藝為我國獨(dú)有,具有民族性。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理黃酒工業(yè)情況2003年黃酒產(chǎn)量為130萬噸,生產(chǎn)水平居國際領(lǐng)先,有的工藝配方被列為國家無限期秘密。但總的發(fā)展趨勢(shì)緩慢,大廠增產(chǎn),小廠減產(chǎn)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理葡萄酒工業(yè)情況2004年葡萄酒產(chǎn)量35萬噸,主要有張?jiān)?,長城,等主要廠家,中國以白葡萄酒、干白葡萄酒、紅葡萄酒為主,相對(duì)品種單一,生產(chǎn)技術(shù)和產(chǎn)品質(zhì)量與先進(jìn)國家相比有一定的差距。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶制劑工業(yè)全年總產(chǎn)量25萬噸左右,年銷售額7億元左右。糖化酶16萬噸,技術(shù)水平30000~35000u/mL,國外最高50000u/mL以上。α-淀粉酶4萬噸,6000u/mL,大多由國外引進(jìn)菌種,其中高溫淀粉酶占76%左右。蛋白酶5萬噸,技術(shù)水平20000~25000u/mL主要是洗滌劑用酶,堿性蛋白酶。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理其他酶種(小酶種)小酶種主要有纖維素酶、凝乳酶、脂肪酶、果膠酶、葡萄糖異構(gòu)酶等。國內(nèi)酶制劑工業(yè)的主要困難:(1)技術(shù)水平低,產(chǎn)品在價(jià)格與質(zhì)量上不能與國外大型公司的產(chǎn)品相比較,競(jìng)爭(zhēng)困難。中國的制造成本占銷售價(jià)的75-80%,國外占銷售價(jià)的30~35%。(2)品種少,產(chǎn)品結(jié)構(gòu)不合理。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理國內(nèi)外工業(yè)酶制劑應(yīng)用領(lǐng)域比較
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理有機(jī)酸工業(yè)的產(chǎn)業(yè)狀況
1檸檬酸
2003年28萬噸,世界檸檬酸90萬噸,歐洲約為25萬噸,美國23萬噸,中國2002年出口21萬噸。技術(shù)水平:國內(nèi)工業(yè)產(chǎn)酸水平12~16%,國外18~20%。
2衣康酸
2003年,8000噸,大部分出口。工業(yè)產(chǎn)酸水平8~12%,國外產(chǎn)酸水平14%。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理有機(jī)酸工業(yè)狀況3乳酸
2003年1.3萬噸國內(nèi)主要是DL型乳酸,L-乳酸有少量生產(chǎn),工業(yè)水平9~10%,中試水平12~14%。世界乳酸消費(fèi)量約為13~15萬噸/年,最近因?yàn)镻LA的發(fā)展,乳酸工業(yè)迅猛發(fā)展,現(xiàn)在由美國道化學(xué)公司和卡吉爾合資(CDP)建設(shè)年產(chǎn)量14萬噸的PLA工廠。據(jù)美國玉米種植協(xié)會(huì)稱,每年用于PLA制造玉米量約為1270萬噸,相當(dāng)于美國用于乙醇生產(chǎn)的玉米量。據(jù)報(bào)道,美國的L-乳酸的發(fā)酵水平約為18%。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理4蘋果酸中國最高年產(chǎn)量100噸。主要以反丁烯二酸為原料,用固定化細(xì)胞來轉(zhuǎn)化,投料濃度11.3%,轉(zhuǎn)化率90%以上。發(fā)酵法生產(chǎn)水平約為9%左右,但后提取工藝尚未解決。世界蘋果酸的需求量約為2.4萬噸,日本市場(chǎng)需要5500~6000噸/年,主要用于食品加工、化妝品、沐浴劑。直接發(fā)酵水平10~12%,固定化細(xì)胞轉(zhuǎn)化率也為90%左右。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理氨基酸工業(yè)的產(chǎn)業(yè)狀況谷氨酸(味精)
2003年世界產(chǎn)量120萬噸,我國80萬噸。技術(shù)水平:產(chǎn)酸9~10%,轉(zhuǎn)化率55-58%。提取收率92%,精制收率95%,總收率87.4%,產(chǎn)酸率12-14%,總收率95%。
2006年,我國味精產(chǎn)量達(dá)到170萬噸,比2005年提高了25%,出口量達(dá)到20多萬噸,出口到50多個(gè)國家和地區(qū)。
世界上味精主要企業(yè)有日本的味之素、韓國的CJ集團(tuán)和大象集團(tuán)、臺(tái)灣的味單公司。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理序號(hào)名稱產(chǎn)量(萬噸)1山東阜豐發(fā)酵有限公司24.752河北梅花味精集團(tuán)公司19.703山東信樂味精有限公司14.204山東菱花味精集團(tuán)公司13.535山東齊魯未經(jīng)集團(tuán)公司13.046江蘇菊花味精集團(tuán)公司11.157山東鈴蘭味精工業(yè)公司10.018沈陽紅梅集團(tuán)有限公司6.019廣州奧桑味精食品公司5.3210重慶飛亞實(shí)業(yè)公司4.67我國主要味精生產(chǎn)企業(yè)(2006年)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理賴氨酸
2006年,我國生產(chǎn)能力達(dá)70萬噸。產(chǎn)量30萬噸。市場(chǎng)需求量約22萬噸。國內(nèi)技術(shù)水平產(chǎn)酸8-10%,轉(zhuǎn)化率35-40%,提取率可達(dá)90%。異亮氨酸世界產(chǎn)量約為400噸,日本的生產(chǎn)能力約為350萬噸。國外最高產(chǎn)酸水平4-5%,我國的實(shí)際生產(chǎn)能力已達(dá)80萬噸,產(chǎn)酸水平2-2.4%轉(zhuǎn)化率25-30%,提取率60%左右。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理苯丙氨酸世界產(chǎn)量8000噸,日本產(chǎn)量2500噸,世界最高產(chǎn)酸水平5-6%。我國的生產(chǎn)能力150噸左右,技術(shù)水平:最高產(chǎn)酸3.5%,酶法生產(chǎn)月2.5㎏月桂酸生產(chǎn)1㎏苯丙氨酸。蘇氨酸2006年,全球飼料中蘇氨酸的需求量11萬噸/年,中國的需求量2萬噸/年。我國的生產(chǎn)能力2萬噸左右,產(chǎn)酸水平7-8%,轉(zhuǎn)化率30-35%。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理維生素發(fā)酵工業(yè)的狀況
維生素Vc
實(shí)際產(chǎn)量3.5萬噸,二步發(fā)酵技術(shù)由我國發(fā)明,居世界領(lǐng)先水平。VB2
實(shí)際產(chǎn)量500噸左右,細(xì)菌發(fā)酵水平為7000mg/L,酵母發(fā)酵水平約為4500mg/L。國外細(xì)菌發(fā)酵水平12-15g/L。醫(yī)藥級(jí)收率65%,飼料級(jí)收率85%,發(fā)酵時(shí)間65-72h。VB12
實(shí)際產(chǎn)量4噸左右。國外發(fā)酵水平:150-160mg/L;發(fā)酵時(shí)間168h,醫(yī)藥級(jí)收率70%,飼料級(jí)收率80%,搖瓶條件200r/min。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理β-胡蘿卜素(β-carotane)年生產(chǎn)能力10噸左右,國外發(fā)酵水平2000-2500mg/L發(fā)酵時(shí)間96-120h晶體產(chǎn)品收率75-80%。我國發(fā)酵生產(chǎn)水平1000-1200mg/L,實(shí)驗(yàn)室水平:2000mg/L。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物多糖與功能性寡糖產(chǎn)業(yè)狀況黃原膠(xanthangum)我國的實(shí)際生產(chǎn)能力達(dá)到2.5萬噸。世界市場(chǎng)需求3.5萬噸左右,國外產(chǎn)糖水平:3.5%,發(fā)酵時(shí)間48h,轉(zhuǎn)化率70-75%。收率90%。我國的產(chǎn)糖率2.6-3.0%,轉(zhuǎn)化率65-70%。每口油井需要黃原膠3.5噸。主要用途分散劑和食品。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理β-環(huán)狀糊精中國實(shí)際產(chǎn)量450萬噸,酶法轉(zhuǎn)化率70-75%,收率80-85%。國外品種較齊全,有α-、β-、γ-等及其衍生物。低聚異麥芽糖中國實(shí)際產(chǎn)量1.5萬噸,世界產(chǎn)量3萬噸左右。低聚果糖國內(nèi)實(shí)際生產(chǎn)能力600噸,世界的產(chǎn)量4500噸。固定化細(xì)胞轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化率在50%以上。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理低聚木糖國內(nèi)正在建廠生產(chǎn)。以玉米芯和蔗糖渣中的半纖維素為原料用木聚糖水解酶水解而成。國內(nèi)外工藝一樣,但國外應(yīng)用開發(fā)較好,目前世界市場(chǎng)需要400噸,在所有寡聚糖中價(jià)格最貴,約2500-3000日元/㎏。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理海藻糖(Trehalose)國內(nèi)已經(jīng)生產(chǎn),國內(nèi)是從酵母發(fā)酵液中提取,以淀粉為原料酶法生產(chǎn)正在研制中。國外兩種工藝都存在,均已工業(yè)化生產(chǎn)。酶法生產(chǎn)的產(chǎn)量可以大幅度提高,成本低于前者的70倍。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酵母工業(yè)
2004年酵母工業(yè)總產(chǎn)量約為4.3萬噸左右,其中安琪酵母公司3萬噸,主要以面包酵母,釀酒活性干酵母為主,藥用酵母也呈下降趨勢(shì)。但近來食用酵母的開發(fā)受到重視。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理發(fā)酵甘油中國的發(fā)酵甘油技術(shù)居國際領(lǐng)先水平,產(chǎn)率達(dá)10-12%,最高可以達(dá)到14-15%,國內(nèi)實(shí)際生產(chǎn)能力約有2000噸左右,由于受到皂化甘油價(jià)格的沖擊,世界性發(fā)酵甘油都處于緩慢發(fā)展中。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理木糖醇工業(yè)生物加氫生產(chǎn)木糖醇國內(nèi)有兩條路線:Xylose→XylitolGlucose→Arabitol→Xylulose→Xylitol第一路線已經(jīng)進(jìn)入較大規(guī)模試驗(yàn),第二路線正在研究,國外與我國的研究進(jìn)展基本一致,但更重視以葡萄糖為原料的工藝研究。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理核糖工業(yè)D-核糖(D-Ribose)已有兩家工廠生產(chǎn),能力400噸左右。發(fā)酵產(chǎn)糖量6-8%,轉(zhuǎn)化率35-45%,發(fā)酵時(shí)間60-80h,提取收率75%。D-核糖有多種用途,但目前主要用來作為半合成VB2的原料,從經(jīng)濟(jì)角度,它優(yōu)于目前的VB2發(fā)酵法。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第二節(jié)發(fā)酵工業(yè)的歷史進(jìn)程發(fā)酵工業(yè)的歷程幾乎與中華文明史同步,在史前就有傳說
起源階段(混合菌種發(fā)酵)純種發(fā)酵
深層通風(fēng)發(fā)酵
代謝控制發(fā)酵廣泛的生物化學(xué)工業(yè)
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理起源階段(混合菌種發(fā)酵)起源階段天然發(fā)酵(混合菌種發(fā)酵),主要產(chǎn)品:以酒類和釀造產(chǎn)品為主,該階段的特點(diǎn)是人們不清楚發(fā)酵機(jī)理,只是靠經(jīng)驗(yàn)相互傳授。主要產(chǎn)品黃酒、白酒、醬品、腐乳、干酪等。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理純種發(fā)酵--
發(fā)酵工業(yè)的第一個(gè)臺(tái)階知識(shí)背景:微生物的發(fā)現(xiàn),純種培養(yǎng)技術(shù)的成熟,產(chǎn)品有酒精、乳酸、丙酮丁醇等。特點(diǎn):參與的微生物已經(jīng)搞清楚,但發(fā)酵的機(jī)理不清楚。發(fā)酵類型:主要是厭氧發(fā)酵。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理深層通風(fēng)發(fā)酵
發(fā)酵工業(yè)的第二個(gè)臺(tái)階知識(shí)背景:1929年弗萊明發(fā)現(xiàn)青霉素,二次大戰(zhàn)對(duì)青霉素的大量需求。主要產(chǎn)品:抗生素、維生素、有機(jī)酸、酶制劑、酵母等。特點(diǎn):利用微生物自身代謝的產(chǎn)品,一般為好氧代謝。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝控制發(fā)酵
發(fā)酵工業(yè)的第三個(gè)臺(tái)階知識(shí)背景:生物化學(xué)、微生物遺傳學(xué)及分析分析方法的進(jìn)步,同位素的使用,對(duì)微生物代謝途徑的認(rèn)識(shí)。主要產(chǎn)品:1956年谷氨酸的發(fā)酵成功,氨基酸發(fā)酵,核苷酸、有機(jī)酸發(fā)酵等。特點(diǎn):人為干預(yù)了微生物的代謝。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理廣泛的生物化學(xué)工業(yè)
(發(fā)酵工業(yè)第四個(gè)臺(tái)階)知識(shí)背景:現(xiàn)代生物技術(shù)的發(fā)展,分子生物學(xué)的應(yīng)用,基因工程、細(xì)胞工程、定向育種技術(shù)、工程菌株的構(gòu)建、克隆技術(shù)、動(dòng)植物細(xì)胞發(fā)酵等知識(shí)的應(yīng)用。產(chǎn)品:氨基酸、有機(jī)酸、細(xì)胞生長因子、白細(xì)胞介素、激素類藥物、疫苗、(乙肝酵母科隆疫苗),甚至器官組織等??寺 谏镞M(jìn)化中,只能通過有性生殖的生物,但以人為干擾的方式產(chǎn)生同質(zhì)后代的技術(shù)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理生物煉制生物煉制是對(duì)應(yīng)于石油煉制而出現(xiàn)的術(shù)語。生物煉制是以生物質(zhì)(農(nóng)業(yè)廢棄物、油脂、植物基淀粉和木質(zhì)纖維素材料)為原料,生產(chǎn)各種化學(xué)品、可降解材料、燃料和其它生物能源等。生物煉制的名詞是21世紀(jì)才出現(xiàn)的,第一屆國際生物煉制大會(huì)于2005年在比利時(shí)的根特舉行。生物煉制的內(nèi)涵早已被科學(xué)家重視,它的發(fā)展將是一個(gè)長期的漸進(jìn)過程,只有在產(chǎn)品質(zhì)量、價(jià)格等方面競(jìng)爭(zhēng)過石化產(chǎn)品時(shí),才能被市場(chǎng)所接受。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理生物煉制目前研究熱點(diǎn)乙二醇、丙二醇、丙三醇(甘油)、1,3-丙二醇聚乳酸(PLA)聚丁二酸丁二醇酯,即聚丁烯琥珀酸酯(PBS)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第三節(jié)微生物代謝概述3.1細(xì)胞代謝的基本概念微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝的概念(p1)代謝(Metabolism):包括合成代謝和分解代謝
,是細(xì)胞內(nèi)發(fā)生的各種化學(xué)反應(yīng)的總和。分解代謝(Catabolism):又稱異化作用,是指由復(fù)雜的營養(yǎng)物質(zhì)分解成簡(jiǎn)單化合物的過程;合成代謝(Anabolism):又稱同化作用,是指由簡(jiǎn)單的化合物合成復(fù)雜的細(xì)胞物質(zhì)的過程。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理初級(jí)代謝(primarymetabolism):是微生物產(chǎn)生和生長、繁殖所必需的物質(zhì)(如蛋白質(zhì)、核酸等)的過程。次級(jí)代謝(Secondarymetabolism):微生物在一定的生長時(shí)期,以初級(jí)代謝產(chǎn)物為前體,合成一些對(duì)微生物的生命活動(dòng)無明確功能的物質(zhì)的過程。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理碳源氮源生長因子概念來源常用作用凡能為微生物提供所需C的營養(yǎng)物質(zhì)凡能為微生物提供所需N的營養(yǎng)物質(zhì)微生物生長不可缺少的微量有機(jī)物無機(jī):CO2、NaHCO3;有機(jī):糖類、脂肪酸、花生粉餅、石油等無機(jī):N2、氨、銨鹽、硝酸鹽等;有機(jī):尿素、牛肉膏、蛋白胨、氨基酸等。維生素、氨基酸、堿基、蛋白胨、動(dòng)植物提取液等糖類尤其是葡萄糖銨鹽、硝酸鹽維生素用于構(gòu)成細(xì)胞物質(zhì)和代謝產(chǎn)物。還可以是異養(yǎng)型微生物的主要能源物質(zhì)主要用于合成蛋白質(zhì)、核酸以及含N的代謝產(chǎn)物一般是酶和核酸的組成成分微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理生物反應(yīng)都在溫和的條件下進(jìn)行,大多為酶所催化;反應(yīng)具有順序性;具有靈敏的自動(dòng)調(diào)節(jié)機(jī)制。3.2微生物代謝的特點(diǎn)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物的生長及代謝生長曲線時(shí)間調(diào)整期指數(shù)期穩(wěn)定期衰亡期菌體數(shù)目代謝特點(diǎn)時(shí)間細(xì)菌數(shù)目的對(duì)數(shù)增長不明顯快速增長活菌數(shù)目達(dá)到最大(K值)活菌數(shù)目急劇減少代謝活躍體積增大大量合成初級(jí)代謝產(chǎn)物細(xì)胞分裂速率最快個(gè)體形態(tài)、生理特征較穩(wěn)定繁殖速率等于死亡速率細(xì)胞內(nèi)大量積累次級(jí)代謝產(chǎn)物,某些細(xì)菌可形成芽孢繁殖速率小于死亡速率菌體出現(xiàn)多種形態(tài)(畸形),細(xì)胞解體、釋放代謝產(chǎn)物微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理生長曲線時(shí)間調(diào)整期指數(shù)期穩(wěn)定期衰亡期成因應(yīng)用時(shí)間細(xì)菌數(shù)目的對(duì)數(shù)適應(yīng)新環(huán)境適應(yīng)了環(huán)境后,條件適宜、營養(yǎng)物質(zhì)充足等營養(yǎng)物質(zhì)消耗、有毒代謝產(chǎn)物積累、PH值的變化,種內(nèi)斗爭(zhēng)加劇生存條件極度惡化,有毒代謝產(chǎn)物積累過,生存斗爭(zhēng)最劇烈長短與菌種、培養(yǎng)條件有關(guān)可作為菌種也可作科研材料制取代謝產(chǎn)物特別是次級(jí)產(chǎn)物微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理分子水平調(diào)控3.3微生物代謝調(diào)控微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理RenewablerawmaterialsBiofuelsBiomaterialsChemicalsCellFactory細(xì)胞水平調(diào)控營養(yǎng)物質(zhì)、輔助因子、膜的通透性、生長特性微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理反應(yīng)器水平調(diào)控微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理3.4細(xì)胞代謝調(diào)節(jié)的意義(P1)通過代謝調(diào)節(jié),將錯(cuò)綜復(fù)雜的代謝反應(yīng)相互制約,使其彼此協(xié)調(diào),隨著細(xì)胞內(nèi)外條件的變化而調(diào)節(jié)代謝反應(yīng)的速率、方向和流量,既不使代謝物積累而造成浪費(fèi),也不致因代謝物的缺損而供不應(yīng)求,保持各種代謝物的濃度相對(duì)穩(wěn)定和動(dòng)態(tài)平衡,使細(xì)胞正常生長。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理3.5代謝控制發(fā)酵的概念(P2)發(fā)酵:指通過微生物培養(yǎng),使某種特定代謝產(chǎn)物大量積累的過程。代謝控制發(fā)酵:利用遺傳學(xué)的方法或其他生物化學(xué)的方法,人為地在DNA分子水平上,改變和控制微生物的代謝,使有用目的產(chǎn)物大量生成、積累的發(fā)酵。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理3.6代謝控制發(fā)酵理論的發(fā)展(P2)1956年,谷氨酸發(fā)酵成功后,對(duì)生產(chǎn)菌株本身的研究逐漸深入,開始形成了代謝控制發(fā)酵技術(shù)。代謝控制發(fā)酵理論使發(fā)酵由野生型菌株的發(fā)酵向高度人為控制的發(fā)酵轉(zhuǎn)移,由依賴于微生物分解代謝的發(fā)酵向依賴于合成代謝(產(chǎn)物大量積累)的發(fā)酵轉(zhuǎn)移。從隨機(jī)誘變盲目地挑選高產(chǎn)菌株發(fā)展到菌種定向選育。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝控制發(fā)酵理論發(fā)展的基礎(chǔ)(P3)生物化學(xué)的發(fā)展:代謝途徑研究不斷深入微生物遺傳學(xué)的發(fā)展:發(fā)現(xiàn)了分解代謝途徑的操縱子和合成代謝操縱子的調(diào)控機(jī)制分子生物學(xué)的發(fā)展:通過轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)化、接合、原生質(zhì)體融合等方法獲得目的重組子,通過DNA重組技術(shù)構(gòu)建工程菌株設(shè)備及工程學(xué)的發(fā)展:合理控制環(huán)境條件、采用過程控制的方法對(duì)發(fā)酵過程進(jìn)行最優(yōu)化控制。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理3.7代謝控制發(fā)酵理論的應(yīng)用(P5)加速限速步驟的反應(yīng)速度;改變分支代謝途徑流向;構(gòu)建代謝旁路;改變能量代謝途徑;延伸代謝途徑;構(gòu)建新的生物合成途徑。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理分子育種Kelloggetal,1981體外進(jìn)化Timmisetal,1988途徑工程MacQuity,1988Tongetal,1991細(xì)胞工程N(yùn)erem,1991代謝工程Baley,1991Stephanetal,1991微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝工程:1991,CIT&MIT,Bailey&Stephanopoulos,ScienceTowardascienceofmetabolicengineeringNetworkrigidityandmetabolicengineeringinmetaboliteoverproduction1996,第一次國際代謝工程會(huì)議召開。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
代謝工程是關(guān)于代謝途徑的分析與修飾的科學(xué)。它是應(yīng)用分子生物學(xué)與反應(yīng)工程技術(shù)不斷發(fā)展融合的結(jié)果,是對(duì)細(xì)胞(包括微生物、植物、動(dòng)物、乃至人體細(xì)胞)內(nèi)的代謝途徑網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)分析的基礎(chǔ)上進(jìn)行定向地有目的的改造,以更好的利用細(xì)胞代謝進(jìn)行化學(xué)轉(zhuǎn)化、能量轉(zhuǎn)導(dǎo)和超分子組裝。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝工程的用途:幾乎跨越了生物技術(shù)的全部領(lǐng)域,主要包括:異源蛋白的生產(chǎn);擴(kuò)大底物利用范圍;生產(chǎn)新物質(zhì);對(duì)環(huán)境有害物質(zhì)的降解;提高菌體對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力;阻斷或降低副產(chǎn)物的生成;代謝產(chǎn)品生產(chǎn)速率和生產(chǎn)能力的提高;植物、動(dòng)物代謝工程;人體和組織代謝工程。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝工程的方法步驟分析反應(yīng)工程技術(shù)確定決定生理狀態(tài)的參數(shù)闡明代謝網(wǎng)絡(luò)的控制結(jié)構(gòu)提出待修飾的靶標(biāo)評(píng)價(jià)修飾后的生化影響合成應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)宿主細(xì)胞中新基因的表達(dá)基因的插入、缺失等改造酶量的調(diào)節(jié),內(nèi)源酶的擴(kuò)增酶活性的調(diào)節(jié),解除抑制等
代謝工程的實(shí)質(zhì)是:將通量及其控制進(jìn)行量化的方法與分子生物學(xué)技術(shù)結(jié)合起來,用以執(zhí)行所建議的基因修飾任務(wù)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理代謝工程的核心——代謝控制分析(MCA)通過途徑中酶的活性、代謝物、效應(yīng)物和其它參數(shù)所施加的通量控制程度進(jìn)行定量的表述。代謝工程必須包括實(shí)驗(yàn)和理論兩種方法來確定細(xì)胞的代謝通量。如物質(zhì)平衡、同位素標(biāo)記、光譜學(xué)方法(如NMR)、質(zhì)譜學(xué)及聯(lián)用方法(如GC-MS,LC-MS等)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第二章微生物代謝調(diào)節(jié)機(jī)制第一節(jié)細(xì)胞結(jié)構(gòu)在代謝調(diào)節(jié)中的作用第二節(jié)酶活性調(diào)節(jié)機(jī)制第三節(jié)酶量調(diào)節(jié)機(jī)制第四節(jié)能荷調(diào)節(jié)及細(xì)胞膜透性調(diào)節(jié)第五節(jié)分支合成代謝途徑的反饋調(diào)節(jié)模式微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物是自然界長期進(jìn)化的產(chǎn)物,它之所以能生存至今,是因?yàn)槲⑸锛?xì)胞具有為了生存和競(jìng)爭(zhēng)而進(jìn)行自身調(diào)節(jié)的保障機(jī)制。代謝控制發(fā)酵的關(guān)鍵,取決于微生物代謝調(diào)節(jié)機(jī)制是否能夠被解除,即能否人為地控制微生物的代謝,使有用的目標(biāo)產(chǎn)物大量生成。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
工業(yè)發(fā)酵是微生物群體活動(dòng)的動(dòng)態(tài)過程。此過程即伴隨異化和同化作用而發(fā)生的物質(zhì)流動(dòng);又伴隨能量形式的轉(zhuǎn)換而發(fā)生的電子流動(dòng);還伴隨不同水平上的代謝調(diào)節(jié)而發(fā)生的信息流動(dòng)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第一節(jié)細(xì)胞結(jié)構(gòu)在代謝調(diào)節(jié)中的作用微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理細(xì)胞內(nèi)酶的隔離分布代謝途徑有關(guān)酶類常常組成多酶體系,分布于細(xì)胞的某一區(qū)域。
酶的隔離分布的意義
——避免了各種代謝途徑互相干擾。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理胞質(zhì):糖酵解,糖原合成,磷酸成糖途徑,脂肪酸合成,部分蛋白質(zhì)合成線粒體:脂肪酸β氧化,三羧酸循環(huán),呼吸鏈,氧化磷酸化細(xì)胞核:核酸的合成、修飾內(nèi)質(zhì)網(wǎng):蛋白質(zhì)合成,磷脂合成胞質(zhì)和線粒體:糖異生,膽固醇合成溶酶體:多種水解酶微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理細(xì)胞膜的物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)功能1.單純擴(kuò)散(simplediffusion)
O2、CO2等脂溶性氣體分子,由細(xì)胞膜的高濃度一側(cè)向低濃度一側(cè)擴(kuò)散。
2.易化擴(kuò)散(facilitateddiffusion)
不溶于脂質(zhì)的物質(zhì),在膜蛋白的介導(dǎo)下,也能由膜的高濃度一側(cè)向低濃度一側(cè)擴(kuò)散。
3.主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)(activetransport)
物質(zhì)(分子或離子)由膜的低濃度一側(cè)移向高濃度一側(cè),由細(xì)胞膜上的特殊蛋白質(zhì)參與,必須由被轉(zhuǎn)運(yùn)的物質(zhì)外部(膜或細(xì)胞)供給能量。
4.出胞(exocytosis)和入胞(endocytosis)
大分子物質(zhì)或物質(zhì)團(tuán)塊的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)。被轉(zhuǎn)運(yùn)的物質(zhì)由膜性結(jié)構(gòu)包圍后進(jìn)行轉(zhuǎn)運(yùn)。Ca2+在物質(zhì)出胞過程中起重要作用。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第二節(jié)酶活性調(diào)節(jié)機(jī)制酶(enzyme)是具有生物催化功能的生物大分子。一類是經(jīng)典的酶,即由活細(xì)胞產(chǎn)生的具有催化功能的蛋白質(zhì)(P酶);另一類主要是由RNA或DNA組成的核酸酶(R酶)?,F(xiàn)在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的生物體內(nèi)存在的酶有近8000種,而且每年都有新酶發(fā)現(xiàn)。迄今數(shù)百種酶已達(dá)到了均一純度,大約有200多種酶得到了結(jié)晶。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理三大營養(yǎng)素共同中間產(chǎn)物共同最終代謝通路糖脂肪蛋白質(zhì)乙酰CoATCA2H氧化磷酸化ATPCO2三大營養(yǎng)素可在體內(nèi)氧化供能。1、微生物代謝體系微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理由氨基酸合成嘌呤環(huán)甘氨酸再與R-5-P合成核酸微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理天冬氨酸(Asp)=o=o
嘧啶環(huán)合成的原料GlnCO2微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理脂肪分解增強(qiáng)ATP增多ATP/ADP比值增高任一供能物質(zhì)的代謝占優(yōu)勢(shì),常能抑制和節(jié)約其他物質(zhì)的降解。糖分解被抑制
6-磷酸果糖激酶-1被抑制(糖分解代謝限速酶之一)例如微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理從能量供應(yīng)的角度看,三大營養(yǎng)素可以互相代替,并互相制約。一般情況下,供能以糖、脂為主,并盡量節(jié)約蛋白質(zhì)的消耗。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
primarystructurebuildingblock
secondarystructurestructuredomain
tertiarystructuresubunitquaternarystructure2、“酶”相關(guān)的基本概念微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理絕大部分酶的化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì),具有一般蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次 NH2
H—C—COOH
R
氨基酸結(jié)構(gòu)單元酶的晶體分析表明酶是鏈長約為100-2500個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶活性中心(多為疏水區(qū))結(jié)構(gòu)中心(維持空間結(jié)構(gòu)、決定酶的專一性、參與活性調(diào)節(jié)、免疫、分子識(shí)別等過程)結(jié)合基團(tuán)催化基團(tuán)SerHisAspCysTyrGlu微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶的作用機(jī)制酸堿催化共價(jià)催化鄰近和定向效應(yīng)變形或張力作用金屬離子催化多元催化化學(xué)結(jié)構(gòu)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理關(guān)鍵酶(keyenzyme)關(guān)鍵酶是參與代謝調(diào)節(jié)的酶的總稱。作為一個(gè)反應(yīng)鏈的限速因子,對(duì)整個(gè)反應(yīng)起限速作用。代謝途徑是一系列酶促反應(yīng)組成的,其速度及方向由其中的關(guān)鍵酶決定。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理例:糖代謝的關(guān)鍵酶微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理PRPP的合成POH2COHOHOH
O-P-O-PPOH2COHOHO
OPRPP合成酶ATPAMP
R-5-PPRPP微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理①速度最慢,它的速度決定整個(gè)代謝途徑的總速度,故又稱其為限速酶(limitingvelocityenzymes)。②催化單向反應(yīng)不可逆或非平衡反應(yīng),它的活性決定整個(gè)代謝途徑的方向。③這類酶活性除受底物控制外,還受多種代謝物或效應(yīng)劑的調(diào)節(jié)。關(guān)鍵酶催化的反應(yīng)具有以下特點(diǎn):微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
快速代謝調(diào)節(jié)
遲緩代謝調(diào)節(jié)數(shù)秒、數(shù)分鐘通過改變酶的活性數(shù)小時(shí)、幾天通過改變酶的含量變構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulation)化學(xué)修飾調(diào)節(jié)(chemicalmodification)代謝調(diào)節(jié)主要是通過對(duì)關(guān)鍵酶活性的調(diào)節(jié)而實(shí)現(xiàn)的。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理按照酶在代謝調(diào)節(jié)中的作用不同進(jìn)行分類(P8-9):調(diào)節(jié)酶:包括變構(gòu)酶、同工酶、多功能酶靜態(tài)酶:一般與代謝調(diào)節(jié)關(guān)系不大潛在酶:指酶原、非活性型或與抑制劑結(jié)合的酶3、酶活力的調(diào)控機(jī)制變構(gòu)調(diào)節(jié)化學(xué)修飾調(diào)節(jié)激活輔酶調(diào)節(jié)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理(1).變構(gòu)調(diào)節(jié)的概念小分子化合物與酶分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)象變化,從而改變酶的活性,這種調(diào)節(jié)稱為酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)或別構(gòu)調(diào)節(jié)。關(guān)鍵酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理被調(diào)節(jié)的酶稱為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶(allostericenzyme)使酶發(fā)生變構(gòu)效應(yīng)的物質(zhì),稱為變構(gòu)效應(yīng)劑(allostericeffector)
?變構(gòu)激活劑
allostericeffector
——引起酶活性增加的變構(gòu)效應(yīng)劑。?變構(gòu)抑制劑
allostericeffector
——引起酶活性降低的變構(gòu)效應(yīng)劑。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理(2).變構(gòu)調(diào)節(jié)的機(jī)制變構(gòu)酶催化亞基調(diào)節(jié)亞基變構(gòu)效應(yīng)劑:底物、終產(chǎn)物其他小分子代謝物調(diào)節(jié)酶一般為變構(gòu)酶,是具有多亞基四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),具有兩個(gè)活性部位(催化部位和變構(gòu)部位)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理變構(gòu)效應(yīng)劑+酶的調(diào)節(jié)亞基酶的構(gòu)象改變酶的活性改變(激活或抑制)疏松亞基聚合緊密亞基解聚酶分子多聚化微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理當(dāng)酶處于T型時(shí),因其調(diào)節(jié)部位轉(zhuǎn)至聚合體內(nèi)部而難以與AMP結(jié)合,故對(duì)AMP不敏感而表現(xiàn)出較高的活性。在第一個(gè)AMP分子與調(diào)節(jié)部位結(jié)合后,T型逐步轉(zhuǎn)變成R型,各亞基構(gòu)象相繼發(fā)生改變,調(diào)節(jié)部位相繼暴露,與AMP的親和力逐步增加,酶的活性逐漸減弱。果糖-1,6-二磷酸酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)(疏松和緊密)Fructose-1,6-disphosphate微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理乙酰CoA羧化酶,它是脂肪酸合成過程中的關(guān)鍵酶。它的每個(gè)亞基有不同的功能,分別是:①生物素載體蛋白,它能結(jié)合輔基生物素;②生物素羧化酶,它能催化生物素發(fā)生羧化反應(yīng);③羧基轉(zhuǎn)移酶,它能將生物素上的羧基轉(zhuǎn)移給乙酰CoA形成丙二酰CoA;④調(diào)節(jié)亞基,它能與檸檬酸或異檸檬酸結(jié)合,使原聚體聚合為多聚體。乙酰CoA羧化酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)(酶分子多聚化)由四種不同亞基構(gòu)成的原聚體微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
多聚體催化活性,ATPMg2+可使多聚體解聚為原聚體而使酶失活。長鏈脂酰-CoA可拮抗檸檬酸的促聚合作用,因此,它們都是該酶的變構(gòu)抑制劑。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
調(diào)節(jié)酶一般為變構(gòu)酶,是具有多亞基四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),具有兩個(gè)活性部位(催化部位和變構(gòu)部位)。天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶ATCaseAspartatetranscarbamoylase
(3).變構(gòu)調(diào)節(jié)的特點(diǎn)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理來自E.coli的天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶(ATCase)是研究得最多的一個(gè)調(diào)節(jié)酶它提供了一個(gè)生物合成途徑的調(diào)節(jié)中別構(gòu)反饋抑制的最好的一個(gè)例子ArthurPardee等人發(fā)現(xiàn)ATCase的一個(gè)最有效的抑制劑是代謝途徑的終產(chǎn)物胞嘧啶三磷酸(CTP)當(dāng)CTP水平高時(shí),CTP與ATCase結(jié)合,降低CTP合成的速度,反之當(dāng)細(xì)胞內(nèi)CTP水平低時(shí),CTP從ATCase上解離,加快CTP合成速度。他們還發(fā)現(xiàn)ATP是酶的別構(gòu)激活劑。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理aregulatorysubunitwithCTPbound(theright-handimage)andwithoutCTP(theleft-handimage).微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理調(diào)節(jié)酶的反應(yīng)速度與底物濃度(或變構(gòu)抑制劑濃度)的關(guān)系曲線呈S型,有協(xié)同性,存在有底物或效應(yīng)物對(duì)反應(yīng)速度發(fā)生影響的閾值。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理調(diào)節(jié)酶多處在合成代謝途徑上,而且一般在代謝途徑的第一步或分支點(diǎn)上,多受終產(chǎn)物的反饋抑制。中間產(chǎn)物不影響調(diào)節(jié)酶的活力。調(diào)節(jié)酶后面酶的活性對(duì)最終產(chǎn)物是不敏感的。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理變構(gòu)酶具有脫敏作用,即經(jīng)特定處理后,不喪失酶活性而失去對(duì)變構(gòu)效應(yīng)物的敏感性。此時(shí),一般發(fā)生了變構(gòu)酶解聚或結(jié)構(gòu)基因突變。調(diào)節(jié)酶與負(fù)效應(yīng)劑非共價(jià)結(jié)合而引起的變構(gòu)作用,對(duì)酶活性的控制是一種快速、敏感和高效的調(diào)節(jié)方式。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理(4).變構(gòu)調(diào)節(jié)的生理意義①
代謝終產(chǎn)物反饋抑制(feedbackinhibition)反應(yīng)途徑中的酶,使代謝物不致生成過多。乙酰CoA
乙酰CoA羧化酶丙二酰CoA長鏈脂酰CoA微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
②變構(gòu)調(diào)節(jié)使能量得以有效利用,不致浪費(fèi)。G-6-P–+糖原磷酸化酶抑制糖的氧化糖原合酶促進(jìn)糖的儲(chǔ)存微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理③變構(gòu)調(diào)節(jié)使不同的代謝途徑相互協(xié)調(diào)。檸檬酸–+6-磷酸果糖激酶-1抑制糖的氧化
乙酰輔酶A
羧化酶
促進(jìn)脂酸的合成微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶的化學(xué)修飾調(diào)節(jié)1.化學(xué)修飾的概念酶蛋白肽鏈上某些殘基在酶的催化下發(fā)生可逆的共價(jià)修飾(covalentmodification),從而引起酶活性改變,這種調(diào)節(jié)稱為酶的化學(xué)修飾。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2.化學(xué)修飾的主要方式磷酸化---去磷酸乙?;?--脫乙酰甲基化---去甲基腺苷化---脫腺苷SH與–S—S–互變微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶的磷酸化與脫磷酸化-OHThrSerTyr酶蛋白H2OPi磷蛋白磷酸酶ATPADP蛋白激酶ThrSerTyr-O-PO32-磷酸化的酶蛋白微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理Examplesofcovalentmodification微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理ProteinphosphotasesReversetheeffectsofkinases,catalyzehydrolyticremovalofphosphorylgroupsattachedtoproteins微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理3.化學(xué)修飾的特點(diǎn)①酶蛋白的共價(jià)修飾是可逆的酶促反應(yīng),在不同酶的作用下,酶蛋白的活性狀態(tài)可互相轉(zhuǎn)變。催化互變反應(yīng)的酶在體內(nèi)可受調(diào)節(jié)因素如激素的調(diào)控。②具有放大效應(yīng),效率較變構(gòu)調(diào)節(jié)高。③磷酸化與脫磷酸是最常見的方式。
同一個(gè)酶可以同時(shí)受變構(gòu)調(diào)節(jié)和化學(xué)修飾調(diào)節(jié)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理丙酮酸脫氫酶的磷酸化共價(jià)修飾例1丙酮酸脫氫酶微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理例2谷氨酰胺合成酶圖2-35通過共價(jià)修飾對(duì)GlnS調(diào)節(jié)的機(jī)制
ATase-腺苷?;D(zhuǎn)移酶;UTase-尿苷?;D(zhuǎn)移酶;UR-脫尿苷?;?;
?-KG○1和Gln○1分別表示?-KG和Gln對(duì)酶的抑制作用
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理例3,膠質(zhì)紅假單胞菌中的檸檬酸裂解酶(CL)也是一種共價(jià)調(diào)節(jié)酶
圖2-36共價(jià)調(diào)節(jié)酶
酶的可逆共價(jià)修飾的作用:
(1)因酶構(gòu)型的轉(zhuǎn)換是由酶催化的,故可在很短時(shí)間內(nèi)經(jīng)信號(hào)啟動(dòng),觸發(fā)生成大量有活性的酶(或改變酶的活性)有效控制細(xì)胞的生理代謝。(2)這種修飾作用可更容易控制酶的活性的響應(yīng)代謝環(huán)境的變化,這系統(tǒng)有能隨時(shí)響應(yīng)的特性,經(jīng)常處于活化與鈍化狀態(tài)之間的來回變換。
6H2O
6HAc
脫乙酰基酶
Glu○I
AcS-CL
Hs-CL
無活性
檸檬酸
連接酶
連接酶
(有活性)
(無活性)
6AMP+6PPi
ATP+6HAc
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理潛在酶的激活微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理調(diào)節(jié)酶:包括變構(gòu)酶、同工酶、多功能酶靜態(tài)酶:一般與代謝調(diào)節(jié)關(guān)系不大潛在酶:指酶原、非活性型或與抑制劑結(jié)合的酶變構(gòu)調(diào)節(jié)化學(xué)修飾調(diào)節(jié)激活輔酶調(diào)節(jié)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理通過輔酶水平的活性調(diào)節(jié)輔酶是一些小分子有機(jī)化合物,主要參與酶的催化過程,在反應(yīng)中傳遞電子、質(zhì)子或一些基團(tuán),多為維生素。與酶結(jié)合緊密的輔酶成為輔基,與酶結(jié)合疏松的為輔底物。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理輔酶在酶促反應(yīng)中的作用特點(diǎn)輔酶在催化反應(yīng)過程中,直接參加了反應(yīng)。每一種輔酶都具有特殊的功能,可以特定地催化某一類型的反應(yīng)。同一種輔酶可以和多種不同的酶蛋白結(jié)合形成不同的全酶。一般來說,全酶中的輔酶決定了酶所催化的類型(反應(yīng)專一性),而酶蛋白則決定了所催化的底物類型(底物專一性)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理水溶性維生素與輔酶大多數(shù)輔酶的前體主要是水溶性B族維生素。許多維生素的生理功能與輔酶的作用密切相關(guān)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理1、嘧啶環(huán)中的兩個(gè)氮原子來自()
A.谷氨酰胺B谷氨酸和氨基甲酰磷酸C.谷氨酰胺和天冬酰胺D.天冬氨酸和氨基甲酰磷酸E.谷氨酰胺和谷氨酸2、羧化酶的輔酶含()
A.生物素B.硫胺素C.核黃素D.尼克酰胺E.葉酸3、下列()可促進(jìn)可逆的酶促反應(yīng)
A.己糖激酶B.磷酸果糖激酶C.磷酸甘油磷酸激酶D.丙酮酸激酶E.糖原磷酸化酶4、下列關(guān)于酶的磷酸化敘述錯(cuò)誤的是()
A.磷酸化和去磷酸化都是酶促反應(yīng)B.磷酸化或去磷酸化可伴有亞基聚合和解聚C.磷酸化只能使酶變?yōu)橛谢钚缘男问紻.磷酸化反應(yīng)消耗ATPE.磷酸化發(fā)生在酶的特定部位。5、常見的酶活性中心的必需基團(tuán)有()
A.半胱氨酸和胱氨酸的巰基B.組氨酸的咪唑基
C.谷氨酸、天冬氨酸的側(cè)鏈羧基D.蘇氨酸的羥基E.絲氨酸的羥基ACCB\EC微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理第二章微生物代謝調(diào)節(jié)機(jī)制第一節(jié)細(xì)胞結(jié)構(gòu)在代謝調(diào)節(jié)中的作用第二節(jié)酶活性調(diào)節(jié)機(jī)制第三節(jié)酶量調(diào)節(jié)機(jī)制第四節(jié)分支合成代謝途徑的調(diào)節(jié)模式第五節(jié)能荷調(diào)節(jié)及細(xì)胞膜透性調(diào)節(jié)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理本次課程主要內(nèi)容酶量調(diào)節(jié)原理;操縱子的概念和類型;操縱子調(diào)控機(jī)理舉例;二次生長現(xiàn)象;降解物阻遏和CRP正調(diào)機(jī)制;真核細(xì)胞的酶量調(diào)節(jié)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
一、酶量調(diào)節(jié)原理
基本概念酶量的調(diào)節(jié),指微生物合成酶的數(shù)量的調(diào)節(jié)。在微生物生物合成體系中,代謝產(chǎn)物常常抑制或者誘導(dǎo)酶的生物合成,這種酶的數(shù)量調(diào)節(jié)的方式又稱為酶合成調(diào)控。由代謝終產(chǎn)物抑制酶合成的負(fù)反饋?zhàn)饔梅Q為反饋?zhàn)瓒簦╢eedbackrepression),反之,正反饋稱為酶誘導(dǎo)作用(induction)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶量的調(diào)節(jié)是通過控制酶基因的生物合成來進(jìn)行的基因(Gene):是一段編碼蛋白質(zhì)多肽鏈和功能RNA的DNA?;蚪M(genome):一個(gè)細(xì)胞或病毒所攜帶的全部遺傳信息或整套基因。基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生具有特異生物學(xué)功能的蛋白質(zhì)分子的過程。基因表達(dá)是受調(diào)控的。*基因表達(dá)(geneexpression)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理基因表達(dá)的規(guī)律1、時(shí)間特異性或發(fā)育階段特異性按功能需要,某一特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生,稱之為基因表達(dá)的時(shí)間特異性(temporalspecificity)。多細(xì)胞生物基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱階段特異性(stagespecificity)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2、空間特異性或組織細(xì)胞特異性基因表達(dá)伴隨時(shí)間順序所表現(xiàn)出的這種分布差異,實(shí)際上是由細(xì)胞在器官的分布決定的,所以空間特異性又稱細(xì)胞或組織特異性(cellortissuespecificity)。在個(gè)體生長全過程,某種基因產(chǎn)物在個(gè)體按不同組織空間順序出現(xiàn),稱之為基因表達(dá)的空間特異性(spatialspecificity)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理基因表達(dá)的方式按對(duì)刺激的反應(yīng)性,基因表達(dá)的方式分為:1.組成性表達(dá)某些基因在一個(gè)個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá),基本不受環(huán)境因素的影響,通常被稱為管家基因(housekeepinggene)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理無論表達(dá)水平高低,管家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。區(qū)別于其他基因,這類基因表達(dá)被視為組成性基因表達(dá)(constitutivegeneexpression)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2.可誘導(dǎo)和可阻遏表達(dá)在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,相應(yīng)的基因被激活,基因表達(dá)產(chǎn)物增加,這種基因稱為可誘導(dǎo)基因??烧T導(dǎo)基因在特定環(huán)境中表達(dá)增強(qiáng)的過程,稱為誘導(dǎo)(induction)。
如果基因?qū)Νh(huán)境信號(hào)應(yīng)答是被抑制,這種基因是可阻遏基因??勺瓒艋虮磉_(dá)產(chǎn)物水平降低的過程稱為阻遏(repression)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理在一定機(jī)制控制下,功能上相關(guān)的一組基因,無論其為何種表達(dá)方式,均需協(xié)調(diào)一致、共同表達(dá),即為協(xié)調(diào)表達(dá)(coordinateexpression),這種調(diào)節(jié)稱為協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)(coordinateregulation)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理基因表達(dá)調(diào)節(jié)的基本原理1、基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控基因激活轉(zhuǎn)錄水平轉(zhuǎn)錄后加工mRNA降解蛋白質(zhì)降解蛋白質(zhì)的投遞和運(yùn)輸?shù)鞍踪|(zhì)翻譯翻譯后加工修飾基因表達(dá)可在多層次上受到調(diào)節(jié)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2、基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)基本要素基因表達(dá)的調(diào)節(jié)與基因的結(jié)構(gòu)、性質(zhì),生物個(gè)體或細(xì)胞所處的內(nèi)、外環(huán)境,以及細(xì)胞內(nèi)所存在的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白有關(guān)。三個(gè)基本要素:1)特異的DNA調(diào)節(jié)序列2)調(diào)節(jié)蛋白3)RNA聚合酶微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶量的調(diào)節(jié)
誘導(dǎo)阻遏終產(chǎn)物的阻遏分解代謝產(chǎn)物阻遏例如:葡萄糖效應(yīng)例如:乳糖操縱子例如:色氨酸操縱子微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理二、操縱子的概念和舉例
(原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié))RegulationofProkaryoticGeneTranscription微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理——調(diào)節(jié)的主要環(huán)節(jié)在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行
(一)原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)的特點(diǎn)1、σ因子決定RNA聚合酶識(shí)別特異性2、主要通過操縱子模式進(jìn)行調(diào)節(jié)3、阻遏蛋白對(duì)轉(zhuǎn)錄的抑制作用(阻遏機(jī)制)是普遍存在的負(fù)調(diào)控作用微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理存在于原核生物中的一種主要的調(diào)控模式是操縱子(operon)調(diào)控模式,該模式也見于低等真核生物中。所謂操縱子(operon)是指原核生物基因組的一個(gè)表達(dá)調(diào)控序列,長度約1000bp左右,由若干結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,其表達(dá)受到同一調(diào)控系統(tǒng)的調(diào)控。
(二)操縱子的概念和特點(diǎn)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理編碼序列
啟動(dòng)序列
操縱序列調(diào)節(jié)基因(promoter)(operator)典型的操縱子可分為控制區(qū)和信息區(qū)兩部分??刂茀^(qū)由各種調(diào)控基因所組成,而信息區(qū)則由若干結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起構(gòu)成。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理(1)酶合成的誘導(dǎo)作用:
在細(xì)菌中普通存在,如大腸桿菌可利用多種糖作為碳源,當(dāng)用乳糖作為唯一碳源時(shí),開始細(xì)菌不能利用乳糖,但2~3分鐘后就合成了與乳糖代謝有關(guān)的三種酶
(1)β—半乳糖苷酶:水解乳糖的酶,使乳糖水解成半乳糖和葡萄糖
(2)β-半乳糖透性酶:促使乳糖通過細(xì)胞膜。
(3)β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙?;福虼肴樘擒辙D(zhuǎn)乙酰酶):這酶的功能不清,可能是將不能代謝的乳糖類似物乙?;?,并將它們排出體外。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理乳糖究竟如何誘導(dǎo)了這三種酶的合成呢?
1961年法國Monod和Jacob提出了著名的乳糖操縱子(lactoseoperon)模型,這模型的提出猶如當(dāng)年Watson和Crick發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋模型一樣,受到人們的重視,人們把它看作生物學(xué)的第二個(gè)里程碑。
這里乳糖是誘導(dǎo)物、誘導(dǎo)了這三種酶的合成,這三種酶就是誘導(dǎo)酶。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理乳糖操縱子調(diào)節(jié)機(jī)制1、乳糖操縱子(lacoperon)的結(jié)構(gòu)與組成
調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動(dòng)序列操縱序列
結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙酰基轉(zhuǎn)移酶ZYAOPDNA微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理結(jié)構(gòu)基因:決定酶蛋白或蛋白質(zhì)的基因。
操縱基因:轉(zhuǎn)錄的開關(guān),可打開或關(guān)閉結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。
啟動(dòng)子:專管轉(zhuǎn)錄起始,上面有RNA聚合酶的結(jié)合位點(diǎn)。
調(diào)節(jié)基因:編碼阻遏蛋白的基因。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理乳糖操縱子模型的基本要點(diǎn):
調(diào)節(jié)基因啟動(dòng)子操縱基因結(jié)構(gòu)基因A操縱子(operon)BC一群功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因相鄰,并且共同受同一個(gè)操縱基因和啟動(dòng)子所控制。
一群功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因(structuralgene)和操縱基因(operator)、啟動(dòng)子(promoter)組成了一個(gè)操縱子(operon)。
為什么稱它們?yōu)橐粋€(gè)操縱子呢?因?yàn)樗鼈冇止餐芤粋€(gè)調(diào)節(jié)基因(regulatorgene)所調(diào)節(jié)。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控
(環(huán)境中沒有乳糖時(shí)的基因狀態(tài))微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控
(環(huán)境中具有乳糖時(shí)的基因狀態(tài))微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理(2)酶合成的阻遏作用
最終產(chǎn)物的阻遏:
以E.ColiTrp操縱子為例,Trp操縱子含有5個(gè)結(jié)構(gòu)基因,它們編碼的酶蛋白催化分支酸轉(zhuǎn)變?yōu)門rp,Trp是輔助遏物(corepressor)。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理色氨酸合成Trp操縱子微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理色氨酸操縱子(trpoperon)屬于阻遏型操縱子,主要參與調(diào)控一系列用于色氨酸合成代謝的酶蛋白的轉(zhuǎn)錄合成。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)缺乏色氨酸時(shí),此操縱子開放,而當(dāng)細(xì)胞內(nèi)合成的色氨酸過多時(shí),此操縱子被關(guān)閉。
色氨酸操縱子的調(diào)控機(jī)制與乳糖操縱子類似,但通常情況下,操縱子處于開放狀態(tài),其輔阻遏蛋白不能與操縱基因結(jié)合而阻遏轉(zhuǎn)錄。而當(dāng)色氨酸合成過多時(shí),色氨酸作為輔阻遏物與輔阻遏蛋白結(jié)合而形成阻遏蛋白,后者與操縱基因結(jié)合而使基因轉(zhuǎn)錄關(guān)閉。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理酶合成的阻遏作用微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理TrpTrp高時(shí)Trp低時(shí)mRNAOPtrpR調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶RNA聚合酶?1、色氨酸操縱子(轉(zhuǎn)錄衰減作用)色氨酸操縱子微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理色氨酸操縱子轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation)機(jī)制:即在色氨酸操縱子第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因與啟動(dòng)基因之間存在有一衰減區(qū)域,當(dāng)細(xì)胞內(nèi)色氨酸酸濃度很高時(shí),通過與轉(zhuǎn)錄相偶聯(lián)的翻譯過程,形成一個(gè)衰減子結(jié)構(gòu),使RNA聚合酶從DNA上脫落,導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄終止。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理UUUU……UUUU……調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因trpROP前導(dǎo)序列衰減子區(qū)域UUUU……前導(dǎo)mRNA1234衰減子結(jié)構(gòu)
第10、11密碼子為trp密碼子終止密碼子14aa前導(dǎo)肽編碼區(qū):
包含序列1形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)
trp密碼子
UUUU……微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理UUUU……34UUUU3’34核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA1.當(dāng)色氨酸濃度高時(shí)轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制125’trp密碼子衰減子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導(dǎo)DNAUUUU3’RNA聚合酶終止微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理UUUU……342423UUUU……核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA15’trp密碼子
結(jié)構(gòu)基因前導(dǎo)DNARNA聚合酶2.當(dāng)色氨酸濃度低時(shí)Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄序列3、4不能形成衰減子結(jié)構(gòu)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
分解代謝產(chǎn)物的阻遏:
在基質(zhì)中當(dāng)同時(shí)存在多種分解代謝物時(shí),某些酶的合成往往被容易分解利用的碳源(如葡萄糖)所阻遏。后來知道這是由于葡萄糖分解代謝產(chǎn)物引起的,因此又稱為分解代謝產(chǎn)物阻遏(cataboliterepression)。這種現(xiàn)象過去稱為葡萄糖效應(yīng)(glucoseeffect)。
1942年,Monod首次發(fā)現(xiàn)E.Coli的培養(yǎng)基中既含葡萄糖,又含乳糖時(shí),則優(yōu)先利用葡萄糖,等葡萄糖耗盡后才能利用乳糖,也就是說在大量葡萄糖時(shí),乳糖操縱子還是關(guān)閉,葡萄糖阻遏了乳糖代謝有關(guān)的酶的合成。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理GC-+ATPcAMP5'-AMP腺苷酸環(huán)化酶磷酸二酯酶CRPcAMPCRP復(fù)合物結(jié)構(gòu)基因分解代謝產(chǎn)物啟動(dòng)子操縱基因分解代謝產(chǎn)物阻遏,即葡萄糖效應(yīng)的機(jī)制:cAMP:環(huán)腺苷酸cAMP受體蛋白簡(jiǎn)稱:CRP或CAP抑制激活微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理幾點(diǎn)結(jié)論分解代謝產(chǎn)物阻遏的實(shí)質(zhì)是:細(xì)胞內(nèi)缺少了cAMP分解代謝產(chǎn)物阻遏作用是發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平上的cAMP在乳糖操縱子中的作用:是調(diào)節(jié)mRNA的生成,屬于轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
現(xiàn)在知道乳糖操縱子除需誘導(dǎo)物外,還需cAMP和cAMP受體蛋白(CRP),當(dāng)cAMP與CRP結(jié)合成復(fù)合物時(shí),這復(fù)合物能結(jié)合到啟動(dòng)子上,促使轉(zhuǎn)錄的起始。
結(jié)構(gòu)基因操縱基因啟動(dòng)子RNA聚合酶CRPcAMP復(fù)合物CRP+cAMP位點(diǎn)活化微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)※當(dāng)阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CRP對(duì)該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用;※如無CRP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性。單純?nèi)樘谴嬖跁r(shí),細(xì)菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時(shí),細(xì)菌首先利用葡萄糖。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2、阿拉伯糖操縱子的正調(diào)節(jié)作用和負(fù)調(diào)節(jié)作用
是一個(gè)利用同一種調(diào)節(jié)蛋白的不同結(jié)構(gòu)形式活化和抑制操縱子的調(diào)控方式。
AraC蛋白是一個(gè)具有兩種不同功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)。P1型為阻遏子,P2型為激活子。調(diào)節(jié)作用分三種情況:1)葡萄糖很豐富且沒有阿拉伯糖情況下,AraC與操縱基因araO2和AraC的一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)araI結(jié)合,結(jié)合于araO2和araI的兩個(gè)AraC蛋白之間互相結(jié)合,形成一個(gè)約210堿基對(duì)的一個(gè)環(huán),從而使araBAD啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄被抑制,基因araB、A、D不被轉(zhuǎn)錄,阻止操縱子的轉(zhuǎn)錄(陰性調(diào)控或負(fù)調(diào)節(jié)作用)微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2)當(dāng)葡萄糖不存在(或低水平)而阿拉伯糖存在時(shí),CAP-cAMP很豐富,與araI附近的CRP結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合,阿拉伯糖與AraC蛋白結(jié)合改變了構(gòu)象,成為激活子,DNA環(huán)被打開,能與CAP-cAMP協(xié)同誘導(dǎo)araBAD基因的轉(zhuǎn)錄(陽性調(diào)控或正調(diào)節(jié))3)阿拉伯糖和葡萄糖均不存在或阿拉伯糖和葡萄糖均豐富時(shí),操縱子均處于阻遏狀態(tài)。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理由成群的操縱子組成的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)稱為調(diào)節(jié)子。通過組成調(diào)節(jié)子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對(duì)若干操縱子及若干蛋白質(zhì)的合成進(jìn)行協(xié)同調(diào)控,從而達(dá)到整體調(diào)控的目的。典型的整體調(diào)控模式是SOS反應(yīng),這是由一組與DNA損傷修復(fù)有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)基因組成。在正常情況下,這些基因均被LexA阻遏蛋白封閉。當(dāng)有紫外線照射時(shí),細(xì)菌體內(nèi)的RecA蛋白水解酶被激活,催化LexA阻遏蛋白裂解失活,從而導(dǎo)致與DNA損傷修復(fù)有關(guān)的基因表達(dá)。
3、原核生物轉(zhuǎn)錄的整體調(diào)控模式微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理SOS反應(yīng)
SOS基因紫外線激活RecALexA阻遏蛋白
與DNA損傷修復(fù)有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)基因表達(dá)LexA阻遏蛋白操縱序列DNA微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理
利用操縱子模型解釋酶合成的誘導(dǎo)和阻遏,但要注意操縱子僅僅存在于原核細(xì)胞,操縱子的調(diào)控是原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控。真核細(xì)胞中沒有操縱子,即真核細(xì)胞中功能上彼此有關(guān)的基因往往分布在不同染色體上,它們并不組成一個(gè)操縱子。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理真核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)RegulationofEukaryoticGeneTranscription微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理一、真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)1、真核基因組結(jié)構(gòu)龐大哺乳類動(dòng)物基因組DNA
約3×109
堿基對(duì)編碼基因約有30000個(gè),占總長的6%微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2、單順反子單順反子(monocistron)
即一個(gè)編碼基因轉(zhuǎn)錄生成一個(gè)mRNA分子,經(jīng)翻譯生成一條多肽鏈。3、重復(fù)序列單拷貝序列(一次或數(shù)次)高度重復(fù)序列(106
次)中度重復(fù)序列(103~104次)多拷貝序列4、基因不連續(xù)性
:斷裂基因真核生物中的基因具有不連續(xù)性,即一個(gè)基因的編碼序列往往被一些非編碼序列分隔開?;蛑心軌蜣D(zhuǎn)錄并進(jìn)一步編碼多肽鏈合成的部分稱為外顯子(exon),而在轉(zhuǎn)錄后會(huì)被剪除的部分則稱為內(nèi)含子(intron)。
微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理二、真核基因表達(dá)調(diào)節(jié)的特點(diǎn)1、RNA聚合酶活性受轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控:RNA聚合酶有三種,分別轉(zhuǎn)錄不同的RNA。2、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變參與基因表達(dá)的調(diào)控:1)對(duì)核酸酶敏感活化基因常有超敏位點(diǎn),位于調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合位點(diǎn)附近。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理2)DNA拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化天然雙鏈DNA均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在;基因活化后RNA-pol正超螺旋負(fù)超螺旋轉(zhuǎn)錄方向3)DNA堿基修飾變化真核DNA約有5%的胞嘧啶被甲基化,甲基化范圍與基因表達(dá)程度呈反比。微生物代謝控制發(fā)酵-緒論-原理4)組蛋白變化①富含Lys組蛋白水平降低②H2A,H2B二聚體不穩(wěn)定性增加③組蛋白
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