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文檔簡(jiǎn)介
分子生物學(xué)MolecularBiology
從分子水平研究生命現(xiàn)象、生命本質(zhì)、生命活動(dòng)及其規(guī)律的科學(xué)。研究核酸等生物大分子的
形態(tài)結(jié)構(gòu)特征、功能及其重要性和規(guī)律性科學(xué),是人類從分子水平上揭示生物世界的奧秘,
由被動(dòng)地適應(yīng)自然界轉(zhuǎn)向主動(dòng)地改造和重組自然界的基礎(chǔ)學(xué)科。
分子生物學(xué)關(guān)心的是核酸在細(xì)胞生命過(guò)程中的作用,包括核酸本身的復(fù)制、保存以及基因的
表達(dá)調(diào)控規(guī)律。這門(mén)學(xué)科應(yīng)該被稱為核酸生物學(xué)(BiologyofNucleicAcid)。
分子生物學(xué)狹義定義為以中心法則(Centraldogma)為主線的生物信息流及其機(jī)制.
分子生物學(xué)的三條基本原理
構(gòu)成生物體各類有機(jī)大分子的單體在不同生物中都是相同的;
生物體內(nèi)一切有機(jī)大分子的構(gòu)成都遵循共同的規(guī)則;
某一特定生物體所擁有的核酸及蛋白質(zhì)分子決定了它的屬性。
DNAReplication
半保留復(fù)制機(jī)制SemiconservativeReplicationMechanismofDNA
半保留復(fù)制假說(shuō)是Watson和Crick在1953年發(fā)表DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)不久后提出的。
957年,MatthewMesselson和FranklinStahl設(shè)計(jì)了令人折服的實(shí)驗(yàn)證明了DNA的半保留
復(fù)制機(jī)制。
DNA的復(fù)制遵循半保留原則進(jìn)行,親代DNA分子每一條鏈各自作為模板,合成一條互補(bǔ)
鏈,新合成的兩條鏈中一條是舊鏈,一條為新鏈。
DNA聚合酶催化的DNA鏈的合成需要模板DNA、底物dNTPs、合成方向5,一3,
復(fù)制的起點(diǎn)和方向OriginandDirectionofDNAReplication
從細(xì)菌、酵母、線粒體和葉綠體中鑒定出的起始點(diǎn)的共同特點(diǎn)是含有豐富的AT序列,可能
有利于DNA復(fù)制啟動(dòng)時(shí)雙鏈的解開(kāi)。
通常細(xì)菌、病毒、線粒體的DNA分子都是作為單個(gè)復(fù)制子完成復(fù)制的。而真核生物基因組
可以同時(shí)在多個(gè)復(fù)制起始點(diǎn)進(jìn)行雙向復(fù)制,基因組中包含多個(gè)復(fù)制子。
無(wú)論原核生物還是真核生物,DNA的復(fù)制是從固定起始點(diǎn)以雙向等速的方式進(jìn)行復(fù)制。
大腸桿菌和其他細(xì)菌DNA的復(fù)制有一個(gè)固定的起點(diǎn),稱為復(fù)制起點(diǎn)replicationorigin(ori),
復(fù)制從ori的兩個(gè)方向同時(shí)進(jìn)行,形成兩個(gè)復(fù)制叉(replicationfork)。oriC是大腸桿菌的復(fù)
制起始點(diǎn),由245個(gè)堿基組成.Ecoli基因組只有一個(gè)oriC,但人的基因組有上萬(wàn)個(gè)復(fù)制ori
復(fù)制時(shí),雙鏈DNA解開(kāi)成兩股鏈分別進(jìn)行,因此復(fù)制的起點(diǎn)呈現(xiàn)叉狀形式,被稱為復(fù)制叉(replication
fork)oDNA的復(fù)制是由固定的起點(diǎn)開(kāi)始的。把生物體的復(fù)制單位稱為復(fù)制子(replicon)。一個(gè)復(fù)制子只含
有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)。
岡崎片段(Okazakifragment)
雙鏈DNA的兩條鏈走向相反,而DNA的合成酶只能5'—3’的方向合成,這顯
然矛盾.岡崎(ReijiOkazaki)利用同位素標(biāo)記新生DNA分子后發(fā)現(xiàn),半數(shù)同位素先參入到
較短的DNA片段中.
WhatOkazakidid?
考點(diǎn):Pulse-labeling實(shí)驗(yàn):大腸桿菌在含同位素培養(yǎng)基中培養(yǎng)30秒(紅)后將分離大腸桿
菌DNA,在堿性條件下超離心;
Pulse-chase實(shí)驗(yàn):將大腸桿菌在含同位素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)30秒鐘(紅)后切換到
正常培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),幾分鐘后分離DNA,在堿性條件下進(jìn)行超離心。
DNA復(fù)制的幾種模式
雙向復(fù)制(Bidirectional):6形(大腸桿菌等細(xì)菌DNA);線性染色體(真核細(xì)胞)
單向復(fù)制(Unidirectional):D型(病毒DNA);滾環(huán)式(噬菌體DNA)
生物體DNA雙鏈的復(fù)制大都是以半保留方式進(jìn)行的,這是共性;但不同生物體內(nèi)DNA的
存在形式各不相同,有大、有小、有線性分子、有環(huán)狀分子;功能狀態(tài)也不一樣,有的保守,
有的則極為活躍。因此反映在復(fù)制方式上也有差別,這是個(gè)性。
環(huán)狀DNA雙鏈的復(fù)制
環(huán)狀DNA雙鏈的復(fù)制分為8型、滾環(huán)型和D-環(huán)型幾種類型。
(1)。型,大腸桿菌基因組的復(fù)制原點(diǎn)位于Asn合酶和ATP合酶操縱子之間,全長(zhǎng)245bp,
稱為OriC。富含AT,并含有多個(gè)短的重復(fù)序列,能夠被復(fù)制起始點(diǎn)結(jié)合蛋白所識(shí)別。復(fù)制
的起始點(diǎn)涉及DNA雙鏈的解旋和松開(kāi),形成兩個(gè)方向相反的復(fù)制叉。前導(dǎo)鏈DNA開(kāi)始復(fù)
制前,復(fù)制原點(diǎn)的核酸序列被轉(zhuǎn)錄生成RNA鏈,作為起始DNA復(fù)制的引物。
(2)滾環(huán)型(rollingcircle),單向復(fù)制的一種特殊形式。滾環(huán)復(fù)制在噬菌體中是很常見(jiàn)的,
如X174的雙鏈環(huán)狀DNA復(fù)制型(RF)就是以這種方式復(fù)制的。DNA的合成由對(duì)正鏈原
點(diǎn)的專一性切割開(kāi)始,所形成的自由5'端被從雙鏈環(huán)中置換出來(lái)并為單鏈DNA結(jié)合蛋白
所覆蓋,使其3'-0H端在DNA聚合酶的作用下不斷延伸。這個(gè)過(guò)程中,單鏈尾巴的延伸
與雙鏈DNA的繞軸旋轉(zhuǎn)同步。
(3)D-環(huán)型(D-loop),單向復(fù)制的一種特殊形式,這種方式首先在動(dòng)物線粒體的DNA復(fù)
制中被發(fā)現(xiàn)。雙鏈環(huán)在固定點(diǎn)解開(kāi)進(jìn)行復(fù)制。但兩條鏈的合成是高度不對(duì)稱的,最初僅以一
條母鏈作為新鏈合成的模板,迅速合成出互補(bǔ)鏈,另一條鏈則成為游離的單鏈環(huán)(即D-環(huán))。
單個(gè)D-環(huán)結(jié)構(gòu)在哺乳動(dòng)物線粒體中是一段開(kāi)放的500-600堿基序列。維持D-環(huán)結(jié)構(gòu)的短鏈
是不穩(wěn)定的,它經(jīng)常被解鏈和重新合成以維持該位點(diǎn)的雙鏈開(kāi)環(huán)結(jié)構(gòu)。有些線粒體DNA擁
有幾個(gè)D-環(huán)結(jié)構(gòu),反映出細(xì)胞有多個(gè)起始點(diǎn)。葉綠體DNA也采用同樣的機(jī)制。高等植物的
葉綠體DNA有兩個(gè)D-環(huán)結(jié)構(gòu)。
線性DNA雙鏈的復(fù)制
復(fù)制叉生長(zhǎng)方式有單一起點(diǎn)的單向(如腺病毒)及雙向(如T7噬菌體)和多個(gè)起點(diǎn)的雙向
幾種。由于DNA聚合酶和RNA聚合酶只能從5'端向3'端移動(dòng),因此DNA雙向復(fù)制時(shí),
復(fù)制叉處呈“眼”型。
線性DNA在復(fù)制中,當(dāng)RNA引物被切除后,留下5'端的部分單鏈DNA,不能為DNA
聚合酶所作用,子鏈短于母鏈。因此線性DNA復(fù)制子末端的復(fù)制需要有以下特殊的機(jī)制:
(1)將線性復(fù)制子轉(zhuǎn)變?yōu)榄h(huán)狀或多聚分子。T4和T7噬菌體就是這種機(jī)制。
(2)在DNA末端形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),使該分子沒(méi)有游離的末端,草履蟲(chóng)的線性DNA就是一個(gè)
典型的例子。
(3)在某種蛋白質(zhì)(如末端蛋白,terminalprotein)的介入下,在真正的末端上啟動(dòng)復(fù)制。
29噬菌體DNA和腺病毒DNA的復(fù)制主要依賴這一機(jī)制。
原核生物DNA復(fù)制的特點(diǎn)
大腸桿菌基因組以雙鏈環(huán)狀DNA分子的形式存在,復(fù)制起始后,在OriC上形成的兩個(gè)復(fù)
制叉沿著整個(gè)基因組雙向等速進(jìn)行移動(dòng),DNA復(fù)制的中間產(chǎn)物可形成一個(gè)0,兩個(gè)復(fù)制叉
在距離起始點(diǎn)1800處回合。
DNA雙螺旋的解旋
DNA復(fù)制時(shí),雙鏈?zhǔn)紫冉忾_(kāi),形成復(fù)制叉。由多種蛋白質(zhì)和酶參與。拓?fù)洚悩?gòu)酶I解開(kāi)負(fù)
超螺旋,與解鏈酶共同作用,在復(fù)制起始點(diǎn)處解開(kāi)雙鏈,還有Dna蛋白參與,一旦局部解
開(kāi)雙鏈,必須有SSB蛋白穩(wěn)定解開(kāi)的單鏈。
引發(fā)酶等組成的引發(fā)體迅速作用于兩條單鏈DNA,前導(dǎo)鏈及后隨鏈都需要一段RNA引物
以起始子鏈DNA的合成。
重要的酶和蛋白質(zhì)包括:(1)DNA解鏈酶(DNAhelicase),通過(guò)水解ATP獲得能量解開(kāi)雙
鏈DNA。大多解鏈酶可沿后隨模板鏈的5'-3'方向并隨復(fù)制叉的前進(jìn)而移動(dòng)。只有Rep
蛋白是沿前導(dǎo)鏈模板的3'-5'方向移動(dòng)。
(2)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB蛋白),SSB可以在遠(yuǎn)低于解鏈溫度
時(shí)使雙鏈分開(kāi)并牢牢結(jié)合在單鏈DNA上,并表現(xiàn)出結(jié)合的協(xié)同效應(yīng)(第一個(gè)結(jié)合能力假設(shè)
為1,第二個(gè)結(jié)合能力高達(dá)1000)(真核生物中無(wú)協(xié)同效應(yīng))。
(3)DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNAtopoisomerase),大多數(shù)天然狀態(tài)下的DNA分子都有適度的
負(fù)超螺旋,可以形成部分的單鏈結(jié)構(gòu),利于蛋白質(zhì)與DNA的結(jié)合。復(fù)制過(guò)程中,隨著DNA
的解旋雙螺旋的盤(pán)繞數(shù)減少,超螺旋數(shù)增加,使正超螺旋增加,未解鏈部分的纏繞更加緊密,
形成的壓力阻止解鏈的繼續(xù)進(jìn)行。拓?fù)洚悩?gòu)酶能夠消除解鏈造成的正超螺旋的堆積,消除
阻礙解鏈繼續(xù)進(jìn)行的壓力,使復(fù)制得以延伸。
DNA復(fù)制的引發(fā)
所有DNA的復(fù)制都從一個(gè)固定的起始點(diǎn)開(kāi)始,目前己知的DNA聚合酶只能延長(zhǎng)已存在的
DNA鏈,而不能從頭合成DNA鏈。
DNA聚合酶都從3'羥基端起始DNA合成,DNA復(fù)制時(shí)往往先由引發(fā)酶(一種特殊的RNA
聚合酶)在DNA模板上合成一段RNA鏈,提供引發(fā)末端(引物,primer),接著DNA聚
合酶從RNA引物3'端開(kāi)始合成新的DNA鏈。前導(dǎo)鏈和后隨鏈都需要RNA引物,只是前
者比較簡(jiǎn)單,后者要復(fù)雜得多。
后隨鏈的引發(fā)往往需要由引發(fā)體(primosome)來(lái)完成。引發(fā)體由6種蛋白質(zhì)(n,n,,n“,
DnaB、C和1)共同組成,當(dāng)引發(fā)前體(preprimosome)與引發(fā)酶(primase)進(jìn)一步組裝成
引發(fā)體,才能發(fā)揮作用?引發(fā)酶是dnaG的基因產(chǎn)物,是在特定條件下發(fā)揮作用的RNA聚
合酶,僅用于合成DNA復(fù)制時(shí)所需要的一小段RNAo
引發(fā)體像火車(chē)頭一樣在后隨鏈分叉的方向上前進(jìn),并在模板上斷斷續(xù)續(xù)地引發(fā)生成后隨鏈的
引物RNA鏈,再由DNA聚合酶HI作用合成DNA,直至遇到下一個(gè)引物或?qū)槠螢橹埂?/p>
由RNaseH降解RNA引物并由DNA聚合酶I將缺口補(bǔ)齊,再由DNA連接酶將岡崎片段
連接成大分子DNA鏈。
岡崎片段與半不連續(xù)復(fù)制
由于DNA雙螺旋的兩條鏈反向平行,復(fù)制叉附近解開(kāi)的DNA鏈一條是5'-3'方向,而
另一條鏈?zhǔn)?'-5'方向,兩條模板極性不同。所有已知的DNA聚合酶的合成方向是5'
-*3'。
岡崎通過(guò)怠;同位素標(biāo)記證明后隨鏈的復(fù)制是不連續(xù)的片段式合成,即岡崎片段,長(zhǎng)度大約
1000-2000bp?現(xiàn)在知道原核中的要長(zhǎng)些,真核中的要短些。
岡崎片段通過(guò)RNA引物切除、缺口補(bǔ)齊、連接酶連接成成熟的DNA鏈。
復(fù)制的終止
除Tus蛋白以外,鏈的終止看起來(lái)不需要太多的蛋白質(zhì)的參與。當(dāng)復(fù)制叉遷移,遇到約22
個(gè)堿基的重復(fù)性終止子序列(Ter)時(shí),Ter-Tus復(fù)合物能使DnaB不再將DNA解鏈,阻擋
復(fù)制叉繼續(xù)前移,等到相反方向的復(fù)制叉到達(dá)后停止復(fù)制,其間仍有50-100bp未被復(fù)制,
由修復(fù)方式填補(bǔ)空缺,而后兩條鏈解開(kāi)。在DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶IV的作用下使復(fù)制叉解體,
釋放子鏈DNA。
DNA聚合酶
大腸桿菌中存在DNA聚合酶I、II、III、IV和V。
DNAPolI是第一個(gè)被鑒定出來(lái)的DNAPoL該蛋白被蛋白酶切成兩個(gè)片段,占蛋白2/3的
C端區(qū)域(68000)又稱Klenow片段或Klenow酶,同時(shí)具有DNA聚合酶活性和3'f5'
核酸外切酶活性,既可合成DNA鏈,又可降解DNA鏈,保證了DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性。它的
N端區(qū)域(35000)具有5'-3'核酸外切酶活性,可作用于雙鏈DNA,又可水解5'端或
距5'端幾個(gè)核甘酸處的磷酸二酯鍵,被認(rèn)為在切除因紫外線照射形成的喀咤二聚體中起著
重要作用,也能除去岡崎片段5'端RNA引物。
DNAPoIII具有5'-3'方向聚合酶活性,但活性很低,相當(dāng)于聚合酶I的5%,不是復(fù)制
中的主要酶。3'f5'核酸外切酶的活性可起到校正作用,用于修復(fù)DNA。
DNAPolIH包含7種不同的亞單位和9個(gè)亞基基,生物活性形式為二聚體,既有5'-3'
方向聚合酶活性,也有3'-5,核酸外切酶活性。酶的活性強(qiáng),是聚合酶I的15倍,聚合
醐II的300倍。
DNAPolIV和V分別由dinB和umuD'2C編碼,主要在SOS修復(fù)過(guò)程發(fā)揮作用。
大腸桿菌中至少有五種DNA聚合酶
DNA聚合酶I由一條肽鏈組成,含三種酶活性,蛋白水解酶subtilisin酶解后得到的大片段
部分為Klenowfragment,擁有兩個(gè)酶活性,去掉了5'->3,外切酶活性。
DNA聚合酶I的切口平移反應(yīng)(Nicktranslation)
聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)原理
Topol和TopoIl松弛DNA負(fù)超螺旋
TopoIl(gyrase)催化改變DNA互繞數(shù)Gyrase,回旋酶,促旋酶(大腸桿菌的H類拓?fù)洚?/p>
構(gòu)酶,可在DNA中引入負(fù)超螺旋。
由TopoII參與的各種反應(yīng):由TopoII參與的各種反應(yīng)
DNA復(fù)制過(guò)程中形成的鏈狀分子(catenanes)需要拓?fù)涿竵?lái)幫助解離
1.DnaA等蛋白質(zhì)結(jié)合到大腸桿菌復(fù)制起始位點(diǎn)oriC的特征核甘酸序列上
2.解旋酶(Helicase)幫助將雙鏈DNA解旋成單鏈DNA
3.SSB(單鏈DNA結(jié)合蛋白)與單鏈DNA結(jié)合幫助穩(wěn)定單鏈結(jié)構(gòu)
4.Primerase合成RNA片段
5.DNA聚合酶III以RNA片段為引物開(kāi)始合成DNA
6.DNA復(fù)制叉(replicationfork)的形成,DNA合成向兩個(gè)方向同時(shí)進(jìn)行,滯后鏈(lagging
strand)上的Okazaki片段不斷被連接成大片段
7.拓?fù)洚悩?gòu)酶(Topoisomerases)幫助消除復(fù)制過(guò)程中DNA螺旋產(chǎn)生的糾纏
8.RNA引物被DNA聚合酶I去除,補(bǔ)齊缺口;
9.最終由連接酶連接成完整的染色體DNA.
小結(jié):
⑴DNA解螺旋酶解開(kāi)雙鏈DNA。
⑵SSB結(jié)合于DNA單鏈。
⑶DNA旋轉(zhuǎn)酶引入負(fù)超螺旋,消除復(fù)制叉前進(jìn)時(shí)帶來(lái)的扭曲張力。
(4)DNA引物酶(在引發(fā)體中)合成RNA引物。
⑸DNApol.III在兩條新生鏈上合成DNA。
(6)DNApolI切除RNA引物,并補(bǔ)上DNA。
⑺DNAligase連接一個(gè)岡崎片段。
DNA復(fù)制過(guò)程中,聚合酶對(duì)dTTP和dUTP的分辨能力高,有少量dUTP摻入DNA鏈中,此
時(shí),U-糖甘酶、AP內(nèi)切酶、DNApolI、DNAligase共同作用,切除尿喘咤,接上正確的
堿基。
真核生物DNA的復(fù)制的特點(diǎn)
真核生物DNA的復(fù)制與原核生物的有很多不同,如真核生物每條染色體上可以有多處復(fù)制
起始點(diǎn),原核生物只有一個(gè);真核生物的染色體在全部完成復(fù)制之前,每個(gè)起始點(diǎn)上DNA
的復(fù)制不能再開(kāi)始,而在快速生長(zhǎng)的原核生物中,復(fù)制起始點(diǎn)上可以連續(xù)開(kāi)始新的DNA復(fù)
制,表現(xiàn)為雖只有一個(gè)復(fù)制單元,但可以有多個(gè)復(fù)制叉。
真核生物細(xì)胞中,DNA復(fù)制只是細(xì)胞周期的一部分,只在S期進(jìn)行。第一批復(fù)制子的激活
標(biāo)志著S期的開(kāi)始,在之后的幾個(gè)小時(shí)里,其余的復(fù)制子相繼啟動(dòng)。
真核生物的復(fù)制子相對(duì)較小,約在40-100kb。
真核生物復(fù)制起始區(qū)的特點(diǎn)
到目前為止,釀酒酵母的復(fù)制起始位點(diǎn)已被簽定,長(zhǎng)約150bp,包含數(shù)個(gè)復(fù)制起始必需的保
守區(qū)。將這個(gè)特殊序列作為一個(gè)部件來(lái)構(gòu)建一個(gè)環(huán)狀的DNA分子,這個(gè)核外DNA分子在
酵母中能夠自主復(fù)制。這個(gè)序列被稱為自主復(fù)制序列(autonomouslyreplicatingsequences,
ARS).
后來(lái)在其他真核生物中也發(fā)現(xiàn)類似ARS元件的序列。
真核生物DNA復(fù)制起始需要起始點(diǎn)識(shí)別復(fù)合物(originrecognitioncomplex,ORC)參與。
真核生物DNA復(fù)制叉的移動(dòng)速度大約只有50bp/s,不到大腸桿菌的1/20,因此人類DNA
每間隔30000-300000個(gè)堿基就有一個(gè)復(fù)制起始點(diǎn)。
已發(fā)現(xiàn)的真核生物DNA聚合酶有15種以上,哺乳動(dòng)物細(xì)胞中主要有5種。
真核生物DNA聚合酶與細(xì)菌DNA聚合酶的基本性質(zhì)相同:
以dNTPs為底物;需鎂離子激活;需要模板鏈;需要具有3'-OH末端的引物;鏈延伸方
向:5'-3'
但一般都不具備核酸外切酶的活性,推測(cè)一定有另外的酶在DNA復(fù)制中起校正作用。
真核生物DNA的復(fù)制過(guò)程
在復(fù)制叉上存在一個(gè)DNA聚合酶a/引發(fā)酶復(fù)合體和另外兩個(gè)DNA聚合酶復(fù)合體。這兩個(gè)
聚合酶中一個(gè)是聚合酶,另一個(gè)是第二個(gè)聚合酶8或聚合酶e,前者延伸前導(dǎo)鏈,后者合
成后隨鏈的岡崎片段。
岡崎片段RNA引物的除去分兩步,首先一種可特異性切除DNA-RNA雜合底物的RNaseHl
發(fā)揮核酸內(nèi)切酶的活性,在靠近RNA與DNA的連接處切開(kāi)引物,又具備5'-3'核酸外切
酶活性的FEN1蛋白降解RNAo最后,由DNA連接酶I將相鄰岡崎片段連接起來(lái)。
真核復(fù)制過(guò)程中組蛋白的裝配
真核復(fù)制過(guò)程中DNA的復(fù)制是半保留的,而組蛋白則是全保留的。
組蛋白以完整的八聚體形式直接轉(zhuǎn)移到子代DNA的前導(dǎo)鏈上,新合成的組蛋白與后隨鏈組
裝成核小體。
試驗(yàn)證據(jù):環(huán)己酮亞胺抑制組蛋白合成,電子顯微鏡下觀察。
真核生物DNA復(fù)制的終止
端粒(telomeres):是真核細(xì)胞染色體末端所特有的結(jié)構(gòu),一段DNA序列與蛋白質(zhì)形成
的一種復(fù)合體。
功能:⑴保證線性DNA的完整復(fù)制;⑵保護(hù)染色體末端;⑶決定細(xì)胞壽命,胚系細(xì)胞
含端粒酶,體細(xì)胞不表達(dá)端粒酶。
端粒末端的重復(fù)序列,通過(guò)端粒醒(telomerase)將其加到染色體末端。
端粒酶含有RNA和蛋白質(zhì)(起DNA聚合酶的作用)兩種組分,RNA分子約159b,含有多
個(gè)CyAx重復(fù)序列,RNA分子用作端粒TxGy鏈合成的模板。
端粒酶是一種反轉(zhuǎn)錄酶,它只合成與酶自身的RNA模板互補(bǔ)的DNA片段。
DNA修復(fù)DNARepair
由于染色體DNA在生命過(guò)程中占有至高無(wú)上的地位,DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性以及DNA日常保
養(yǎng)中的損傷修復(fù)就有特別重要的意義。
一個(gè)細(xì)胞通常只含有一套或兩套基因組DNA,損傷的蛋白質(zhì)和RNA分子可以通過(guò)DNA密
碼信息很快被替代,但DNA分子自身是不能被替代的。維持DNA分子中信息的完整性是
細(xì)胞必須要做的事,由DNA修復(fù)系統(tǒng)執(zhí)行。
DNA可能由于某些作用而受損傷,有些是自發(fā)的,有些是環(huán)境因素造成的,DNA復(fù)制過(guò)程
也有可能因錯(cuò)配堿基導(dǎo)致遺傳信息的損傷。
Mutationsarelinkedtocancer
ApermanentchangeinthenucleotidesequenceofDNAiscalledamutation(在
核酸序列上發(fā)生的永久性的變化叫突變)。
Inmammals,thereisastrongcorrelationbetweentheaccumu-lationofmutations
andcanceroMutation,Mutant,Mutagenesis,Mutagen,Mutein(Mutain)
突變可能涉及一個(gè)堿基對(duì)被另一個(gè)堿基對(duì)所替代一替代或取代突變(substitutionmutation),
或者插入或缺失一個(gè)或多個(gè)堿基對(duì)一插入突變或缺失突變(insertionmutationsordeletion
mutations如果突變影響的是非必須DNA或不影響一個(gè)基因的功能,這樣的突變被稱為
沉默突變(silentmutation)o很少發(fā)生突變?cè)斐缮飳W(xué)優(yōu)勢(shì),然而,大多數(shù)突變是有害的。
突變的類型
■點(diǎn)突變:DZA分亍中一個(gè)堿基對(duì)替代另一^介堿基
對(duì)稱為點(diǎn)突變.
堿^^化替換:a,轉(zhuǎn)換(transition):b,顛映Ctransversion>
?移碼完支
-描入突變:DZA分亍中播入一~針或幾個(gè)堿基稱為插入
用O
-缺失究變;DZA分子中缺失一個(gè)鬟多個(gè)堿基對(duì)稱為缺
失作用。
“沉默突變:突變影響非必需的DZA或突變對(duì)一個(gè)基
因的功能的影響可忽略,稱為沉默突變或同義突變。
TGTTGC
Cys-------Cys
〃無(wú)義突變:突變的密瑪子變?yōu)榻K止鏘傳子.
TGT------?TGA
Cys?終止
“回復(fù)突變:一些突變可以克服第一次突變?cè)斐傻挠?/p>
響,這類突變稱為回復(fù)突變。
彳通讀突變(加長(zhǎng)突變):終止密瑪子突變?yōu)榉墙K止
密嗎子,使突變的mRMA在擁譯時(shí)發(fā):生通讀,從而
使肽鏈加長(zhǎng)。
一條件突變體:突變效果很微妙,只有在極端條件下
(如溫度提高)才顯露出來(lái)。
突變的原因
自Cspontaneousmutation):由
正梏的細(xì)胞潔動(dòng),逐細(xì)胞與環(huán)境的隨機(jī)相
互作用而弓I起的褻變。
誘<induoedmutation):的7pls
或;物理因素弓I起的DZA后歹U改變。
DZA分子的自發(fā):性損傷
1、DZA復(fù)制中的車(chē)昔誤
2、DZA的自發(fā)性化學(xué)變化
生物體內(nèi)DZA分子可以由于各種原因發(fā);生變化
<???塞的異構(gòu)茸變:
②》?基的脫氧基作用:
③脫口票哈與脫畸碇:
④S*基修飾與鏈斷裂:
Amestestforcarcinogens用一種攜帶了組氨酸合成途徑中醉基因突變的沙門(mén)氏菌,檢測(cè)
化合物對(duì)該基因的恢復(fù)突變。艾姆氏試驗(yàn)
Mutagens化學(xué)誘變因素:烷化劑、亞硝酸、嵌入劑;
物理誘變因素:電離輻射(UV、X射線、射線等宇宙射線);
物理因素弓I起的DMA損傷
1、紫夕卜線弓I起的DZA損傷
當(dāng)DMA受到最易被其吸收波長(zhǎng)(?260nm)的紫夕卜
線照射時(shí),主要是使同一條DZA鏈上相鄰的嘴碇以共價(jià)
鍵連成二奧體.
2、電溜輻射弓I起的DZA損傷
電離輻射損傷DZA有直接和間接的效應(yīng),直接效應(yīng)
是1>、人直接吸收射線能量而遭損傷;間接效應(yīng)是指1>ZA
周?chē)渌肿樱ㄖ饕撬肿樱┪丈渚€能量產(chǎn)生具有
很高反應(yīng)活性的自由基進(jìn)而損傷DZA。損傷包括:8t
基變化;②脫毓核糖變化;③DZA鏈斷裂;④交聯(lián)。
化學(xué)因素引起的DMA損傷
1、烷化劑對(duì)DZA的損傷
①堿基烷基化;②堿基脫落;③斷鏈;④交聯(lián)
2、堿基類似物、修飾劑對(duì)DNA的損傷
如:人工可以合成一些堿基類似物用作促突變劑或
抗癌藥物,如5-漠尿唯晦(5-BU)、5-氟尿畸口定C5-
FU)、2-氨基腺噪嶺C2-AP)等。
還有一些人工合成或環(huán)境中存在的化學(xué)物質(zhì)能專一
修飾DZA鏈上的堿基或通過(guò)影響DNA復(fù)制而改變堿基
序列,例如亞硝酸鹽能使C脫氨變成U,經(jīng)過(guò)復(fù)制就可
使DNA上的C-C變成A-T對(duì)?
紫外線可使DNA分子中同一條鏈上兩個(gè)相鄰的胸腺喀咤堿基之間形成二聚體(TT),兩個(gè)
T以共價(jià)鍵形成環(huán)丁烷結(jié)構(gòu)。
DNArepairssystems
錯(cuò)配修復(fù)(Mismatchrepair)
堿基切除修復(fù)(Base-excisionrepair)堿基切除修復(fù)(BER)核昔酸切除修復(fù)(NER)
大腸桿菌中錯(cuò)配修復(fù)主要依靠甲基化識(shí)別機(jī)制
?Dam在復(fù)制叉上進(jìn)行
甲基化,使GATC序
列中的A殘基甲基化
?MutH在未甲基化的
子鏈上進(jìn)行切割
堿基切除修復(fù)
(1)
C2)
>*1
-fe>JT=r-
,二、CZA——&?糖基化酶是損傷特異性
睫蠡靈舞T異2口翌震中有玄理提裒不同
JUV多Hfefe=_特異性的DNA糖基化酶
(4)DNA-。金*糖基化酶通過(guò)水解糖背鍵
D-去除受損堿基
核昔酸切除修復(fù)(Nucleotide-excisionrepair)
直接修復(fù)(Directrepair,光復(fù)活)1949年已發(fā)現(xiàn)細(xì)菌光復(fù)活現(xiàn)象,可見(jiàn)光(最有效
400nm)可激活光復(fù)活酶,此醐能分解由于紫外線形成的口密咤二聚體。高等哺乳動(dòng)物沒(méi)有此
酶。
A形成喀呢二聚體B.光復(fù)合酶結(jié)合于損傷部位C酶被可見(jiàn)光激活D.修復(fù)后釋放酶
06-甲基鳥(niǎo)嚓咻更容易與T配對(duì),會(huì)高頻導(dǎo)致突變。O6-methylguanine-DNA
methyltransferase的半胱氨酸筑基接受甲基后自身永久失活,“舍己救人”的典范。
(發(fā)生在復(fù)制后):復(fù)制時(shí),跳過(guò)損傷部位,新鏈產(chǎn)生缺口
由母鏈彌補(bǔ),原損傷部位并沒(méi)有切除,但在后代逐漸稀釋。
重組修復(fù)與易錯(cuò)修復(fù)(recombinationanderror-pronerepair)
RecombinationalDNArepairhasthesamemechanismofDNArecombinationduringmeiosis
雙鏈斷裂修復(fù)(Doublestrandbreakrepair)
應(yīng)急反應(yīng)(SOSresponse)
一SOS反應(yīng):細(xì)胞DNA受至u嚴(yán)重才員佞或DNAjg_錯(cuò),]系統(tǒng)受
剃孫1制的緊■,忽狀態(tài)下,為本?生存而出現(xiàn)的應(yīng)急員皮.
?SOS反應(yīng)包括二
「避免基裙妁修"復(fù)育官力增^雖
-J涉導(dǎo)產(chǎn)生無(wú)校正功背巳的DNA聚合薛合成
一打布J細(xì)胞分裂
ASOS員皮區(qū)生物在不開(kāi)弓壞比中#_捋生存妁一種基本
叨育L對(duì)原移:生物它產(chǎn)生離變.異,對(duì)高等動(dòng)物則是錢(qián)
瘡妁,
應(yīng)急反應(yīng)導(dǎo)致大量基因表達(dá),部分參與易錯(cuò)表達(dá)
DiseaseswithimpairedDNArepairsystems
切除修復(fù)缺損著色性干皮病(XerodermaPigmentosumXp)
錯(cuò)配修復(fù)缺損遺傳性非息肉結(jié)腸癌(HereditaryNonpoly-posisColorectalCancer,HPCC)
Brcal/Brca2基因缺損乳腺癌高發(fā)
RNAmetabolism
轉(zhuǎn)錄Transcription(FromDNAtoRNA)
轉(zhuǎn)錄一以DNA為模板,按堿基配對(duì)原則(dA-U、dT-A、dG-C、dC-G)合成RNA鏈。
轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的相似點(diǎn)
1.都是酣促的核昔酸聚合過(guò)程;
2.都需依賴DNA的聚合酶;
3.模板均為DNA;
4.延長(zhǎng)機(jī)理都是形成磷酸二酯鍵;
5.方向均為5'-3';
6.都遵從堿基配對(duì)規(guī)律一但轉(zhuǎn)錄忠實(shí)性要低于DNA復(fù)制;
7.轉(zhuǎn)錄與復(fù)制都受到嚴(yán)格的調(diào)控
轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的不同點(diǎn)
RNA的合成稱為轉(zhuǎn)錄(transcription),是以DNA為模板由RNA聚合酶催化的反應(yīng),RNA的
延伸方向?yàn)?'f3'.
NTP+(NMP)nRNA聚合酶(NMP)n+l+PPi
RNA延伸了的RNA
1961年S.Spiegelman用分子雜交方法證明了DNA與RNA之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系
原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶(RNApolymerase,
RNA-pol)其他蛋白質(zhì)因子
E.ColiRNA聚合酶是由五種亞基組成(a2p|3(3)。,MW48000)?。亞基加上核心酶(a
266')稱為全酶(holoenzyme)。(3未知,醐制劑有,全酶中無(wú))
RNA聚合的
其他原核生物的RNA聚合酶,在結(jié)構(gòu)、組成、功能上均與E.coli相似。
原核生物的RNA聚合醐都受一類抗結(jié)核藥利福平或利福霉素的特異性抑制。這類藥物能與
RNA聚合酶的亞基特異結(jié)合,從而影響酶的活性。
雙鏈DNA分子中能作為模板轉(zhuǎn)錄出RNA的那條鏈,稱為模板鏈。又叫無(wú)義鏈(sense
strand)或Watson鏈。
另一條互補(bǔ)鏈稱為編碼鏈,又叫反義鏈(antisensestrand)或Crick鏈。
與轉(zhuǎn)錄起始有關(guān)的DNA結(jié)構(gòu)啟動(dòng)子(Promoter)
RNA聚合酶結(jié)合模板DNA的部位,稱為啟動(dòng)子。
一10區(qū),保守序列為T(mén)ATAAT-Pribnow框(pribnowbox,TATA框),是RNA聚合酶的
牢固結(jié)合位點(diǎn),簡(jiǎn)稱結(jié)合位點(diǎn)。
。的存在保證原核生物RNA聚合酶只能與啟動(dòng)子區(qū)而不是其它區(qū)域形成穩(wěn)定的二元復(fù)合
物。
細(xì)菌中常見(jiàn)兩種啟動(dòng)子突變:-啟動(dòng)子上升突變,提高轉(zhuǎn)錄活性;-
啟動(dòng)子下降突變,降低轉(zhuǎn)錄水平。
Sextama框:-35區(qū),保守序列為T(mén)TGACA—Sextama框,是RNA聚合酶中。的識(shí)別
位點(diǎn),也是RNA聚合酶的初始結(jié)合位點(diǎn)。
Pribnow框與Sextama框之間的堿基序列并不重要,但兩個(gè)序列之間的距離十分重要;
天然啟動(dòng)子這段距離多為15?2Obp,距離的大小可能是決定啟動(dòng)子強(qiáng)度的因素之一。
實(shí)驗(yàn)表明:兩個(gè)序列之間的距離為17bp時(shí),轉(zhuǎn)錄效率最高。
足跡法原理(Footprinting)利用足跡法確定RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)
RNA起始核甘酸為pppG或pppA
終止子結(jié)構(gòu)提供轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的序列-終止子(terminator),終止信號(hào)存在于RNA聚合
酶已經(jīng)轉(zhuǎn)錄過(guò)的序列之中。
原核生物終止子分為兩類:一類是不依賴于P因子的轉(zhuǎn)錄終止;
一類是依賴P因子的轉(zhuǎn)錄終止;
兩類終止子有共同的序列特征:
在轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)之前有一段間斷的回文結(jié)構(gòu)。(出現(xiàn)在限制性核酸內(nèi)切酶、轉(zhuǎn)錄終止子)
兩類終止子堿基組成的不同點(diǎn):
不依賴P因子回文結(jié)構(gòu)富含G-C下游富含A-T
依賴P因子G-C含量較少下游無(wú)特征
原核生物轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:
RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。
DNA雙鏈解開(kāi),使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。
轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程
1.因子辨認(rèn)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)(-35區(qū)的TTGACA序列)
2.RNA聚合酶全酶()與模板一35序列結(jié)合,形成閉合的二元閉合啟動(dòng)子復(fù)合物。
3.RNA聚合酶向一10區(qū)轉(zhuǎn)移,并與之牢固結(jié)合。
4.—10區(qū)DNA雙鏈解開(kāi)12?17bp,形成開(kāi)放的二元啟動(dòng)子復(fù)合物(模板一前)。
5.在RNA聚合酶B亞基催化下形成第一個(gè)磷酸二酯鍵,形成三元復(fù)合物(模板一酶一
RNA)。5-pppG-OH+NTP-5-pppGpN-OH3+ppi
轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH3
RNA聚合酶有兩個(gè)核甘酸結(jié)合位點(diǎn):
一個(gè)是起始核甘酸位點(diǎn)、一個(gè)是延長(zhǎng)核昔酸位點(diǎn)。一般只有噂吟核甘酸填充了起始位點(diǎn),才
能形成第一個(gè)磷酸二酯鍵。
6.當(dāng)三元復(fù)合物中RNA長(zhǎng)6?9個(gè)核甘酸時(shí),因子從全酶解離下來(lái),進(jìn)入延長(zhǎng)階段。
原核生物轉(zhuǎn)錄的延長(zhǎng)
1.亞基脫落,RNA-pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;
2.在核心前作用下NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長(zhǎng)。
3.堿基配對(duì)原則:A-U,T-A,G-C
4延長(zhǎng)中的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物也叫轉(zhuǎn)錄空泡。隨著RNA聚合酶前移,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA不斷移出轉(zhuǎn)
錄空泡,已轉(zhuǎn)錄完畢的DNA雙鏈又重新復(fù)合而不再打開(kāi)。
5.原核生物的轉(zhuǎn)錄和翻譯偶聯(lián)進(jìn)行。
原核生物轉(zhuǎn)錄的終止和新生RNA鏈的釋放
RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來(lái)不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來(lái)。
分類依賴P因子的轉(zhuǎn)錄終止非依賴P因子的轉(zhuǎn)錄終止
RNAtranscriptionineukaryoticcells
ThreetypesofRNApolymerases
PromoterofRNApolymeraseII
MultipleproteinsinvolvedinRNAtranscriptionbyRNApolymeraseII
StartoftranscriptionbypolymeraseII
Promoterof5SrRNAgeneislocatedinsidethegene
post-transcriptionalRNAprocessing
真核細(xì)胞三種RNA聚合酶的分工不同
RNApolymeraseI:轉(zhuǎn)錄rRNA前體
RNApolymeraseII:轉(zhuǎn)錄mRNA
RNApolymeraseIII:轉(zhuǎn)錄tRNA,5SrRNA
真核細(xì)胞的三種RNA聚合酶
放線菌素D和口丫咤的抑制機(jī)制
一些常用的轉(zhuǎn)錄抑制劑
利福霉素細(xì)菌的全酶(靶酶)與B亞基結(jié)合,阻止起始
鏈霉溶菌素細(xì)菌的核心酶與B亞基結(jié)合,阻止延長(zhǎng)
放線菌素D真核RNA聚合酶I與DNA結(jié)合,并阻止延長(zhǎng)
a-鵝膏蕈堿真核RNA聚合酶II與RNA聚合酶II結(jié)合
真核生物的啟動(dòng)子真核生物的三種RNA聚合酶,每一種都有自己的啟動(dòng)子類型。
RNA聚合酶I的啟動(dòng)子
即rRNA基因的啟動(dòng)子,稱I類啟動(dòng)子。I類啟動(dòng)子分兩部分:
-40?+5稱為近啟動(dòng)子,決定轉(zhuǎn)錄起始的位點(diǎn);
-165?-40稱為遠(yuǎn)啟動(dòng)子,影響轉(zhuǎn)錄的頻率。
RNA聚合酶H的啟動(dòng)子
即mRNA基因的啟動(dòng)子,稱n類啟動(dòng)子
1、帽子位點(diǎn)(capsite):即轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),其堿基大多為A。
2、TATA框:又稱Hogness框,由含有TATA的6?7個(gè)核甘酸組成,保守序列為T(mén)ATA
(A/T)A(A/T)。但TATA框的兩側(cè)富含G-C堿基對(duì)。TATA框位于一25-30附近,是
解鏈位置,決定轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)。其序列的完整與準(zhǔn)確對(duì)維持啟動(dòng)子的功能是必需的。
(有一些H類啟動(dòng)子沒(méi)有TATA框)
3、CAAT框:與RNA聚合前的結(jié)合有關(guān)位于一75附近,保守序列為GGNCAATCT,
頭兩個(gè)G非常重要,一但突變,轉(zhuǎn)錄效率大大下降。
CAAT框控制著轉(zhuǎn)錄起始的頻率。
4、GC框:某些轉(zhuǎn)錄因子可結(jié)合位于一110附近,以5'CCGCC3'序列為特征。
CAAT和GC框?yàn)樯嫌我蜃?,?duì)轉(zhuǎn)錄起始頻率有較大影響。
5、增強(qiáng)子(enhancer)及作用特點(diǎn):能結(jié)合反式作用因子(非DNA元件或非同一條DNA
轉(zhuǎn)移或構(gòu)件而來(lái)的元件),決定基因的時(shí)間和空間特異性表達(dá),增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的DNA
序列。
⑴增強(qiáng)效應(yīng)明顯:使轉(zhuǎn)錄頻率增加百倍或千倍。(時(shí)空特異性,和順式作用元件一起作用)
⑵增強(qiáng)效應(yīng)與其所處的位置和取向無(wú)關(guān):增強(qiáng)子以5'-3'或3'-5'排列對(duì)啟動(dòng)子都有作
用。⑶多為重復(fù)序列:約50bp,適合與反式因子結(jié)合,內(nèi)部常有一個(gè)核心序列,為增強(qiáng)效
應(yīng)所必需。⑷增強(qiáng)效應(yīng)具有嚴(yán)密的組織和細(xì)胞特異性。⑸沒(méi)有基因?qū)R恍浴?/p>
(6)許多增強(qiáng)子受外部信號(hào)的調(diào)控。
RNA聚合酶II的啟動(dòng)子序列特征
轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)沒(méi)有廣泛的序列同源性,但第一個(gè)堿基為腺噂吟,而兩側(cè)是口密丁堿基。這個(gè)區(qū)
域被稱為起始子(initiator,Inr),序列可表示為Py2CAPy5(.Inr元件位于-3—+5。僅由
Inr元件組成的啟動(dòng)子是具有可被RNA聚合醐II識(shí)別的最簡(jiǎn)單啟動(dòng)子形式。
多數(shù)II類啟動(dòng)子有一個(gè)被稱為T(mén)ATA盒的共有序列,通常處于-30區(qū),相對(duì)于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)
的位置比較固定。
也有一些II類啟動(dòng)子不含有TATA盒,這樣的啟動(dòng)子稱為無(wú)TKTA盒啟動(dòng)子。
RNA聚合酶m的啟動(dòng)子
即tRNA基因的啟動(dòng)子,稱m類啟動(dòng)子。
山類啟動(dòng)子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下游,稱下游啟動(dòng)子或內(nèi)部啟動(dòng)子。
HI類啟動(dòng)子包括:A盒、B盒。A盒靠近5'方向;B盒靠近3'方向。
III類啟動(dòng)子需要的轉(zhuǎn)錄因子包括:TFmC、TFWB、TFmA,前兩者是共同的,后者
為5srRNA基因轉(zhuǎn)錄所需。
真核生物和原核生物轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)差異
原核生物真核生物
帽子結(jié)構(gòu)沒(méi)有有
起始核昔酸口票吟或喀咤口票吟(A為主)
啟動(dòng)區(qū)范圍較小(+1?-70)較大(+1?-110)
上游序列TTGACACAAT、GC、增強(qiáng)子
真核生物轉(zhuǎn)錄的起始
真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)段比原核生物多樣化。轉(zhuǎn)錄起始時(shí),RNA-pol不直接結(jié)合模板,
而需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子,與模板結(jié)合形成轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物,其起始過(guò)程比原核生物復(fù)雜
得多。
順式作用元件(cis-actingelement)
TATAbox:?jiǎn)?dòng)子核心序列,-25bp區(qū)段;CAAT盒;GC盒;增強(qiáng)子
參與RNA-polII轉(zhuǎn)錄的TFH
TF:transcriptionfactor,I、IKIII三類-TFI、TFII和TFIIh
轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)
真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核膜相隔,沒(méi)有轉(zhuǎn)錄與翻譯同步的現(xiàn)象。
RNA-pol前移處處都遇上核小體。
轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程中可以觀察到核小體移位和解聚現(xiàn)象。
轉(zhuǎn)錄終止1、RNA聚合酶I轉(zhuǎn)錄出rRNA前體3'末端后,繼續(xù)向下游轉(zhuǎn)錄超過(guò)1000個(gè)
bp時(shí),存在一個(gè)18bp的終止序列。
2、RNA聚合酶IH轉(zhuǎn)錄模板的下游存在一個(gè)終止子,是位于GC豐富序列之中的TTTT?
RNA聚合酶m有內(nèi)原性的轉(zhuǎn)錄終止功能。
3、RNA聚合酶II的轉(zhuǎn)錄沒(méi)有明確的終止信號(hào)。
原核生物與真核生物轉(zhuǎn)錄的區(qū)別
原核生物真核生物
RNApol一種高度分工
起始轉(zhuǎn)錄因子沒(méi)有需要(各不同)
延長(zhǎng)核小體影響沒(méi)有有
啟動(dòng)子以外序列沒(méi)有有且復(fù)雜
轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物多順?lè)醋訂雾樂(lè)醋?/p>
場(chǎng)所轉(zhuǎn)錄與翻譯偶聯(lián)不偶聯(lián)
轉(zhuǎn)錄終止兩種終止子不明確
RNA生物合成抑制劑
概念:能阻斷、抑制或者干擾核酸的代謝過(guò)程,最終抑制轉(zhuǎn)錄的一類化合物,稱RNA生物
合成抑制劑。分三類:1、喋吟和嗓咤類似物,抑制核酸前體的合成;2、通過(guò)與DNA結(jié)
合而改變模板的功能;3、與RNA聚合酶結(jié)合而影響其活力。
1、利福霉素及利福平,特異地抑制細(xì)菌RNA聚合酶的活性,因而抑制細(xì)菌RNA的合成。
利福霉素可與RNA聚合酶的B亞基結(jié)合,并阻止起始位點(diǎn)的填充,利福平則阻止RNA聚
合酶的移動(dòng)。
2、利迪鏈菌素,與細(xì)菌的RNA聚合酶B亞基結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄過(guò)程中RNA鏈的延長(zhǎng)反應(yīng)。
3、a-鵝膏蕈堿,抑制真核生物的RNA聚合酶,且RNApolH極為敏感。對(duì)細(xì)菌RNA聚
合酶作用極弱。
轉(zhuǎn)錄后力口工Post-transcriptionalprocessing
atMAPr^oc^ssing
?XZeryFewRIMZX.molecule三are七ranwuribed
dir^cxtlyintotheTinalmanureRZA.
?W1ost:newly±ranwuribedRZA.molecules
(primary*racwurip±w)umdergoxzarious
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