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1/1abo基因相關(guān)多態(tài)性位點(diǎn)在abo血型不合hsct移植后嵌合體定量中的研究ABO基因相關(guān)多態(tài)性位點(diǎn)在ABO血型不合HSCT移植后嵌合體定量分析中的研究博士研究生劉峰指導(dǎo)老師胡麗華教授中文摘要第一部分ABO常見等位基因相關(guān)NPs的模板篩選目的:
篩選出攜帶5個(gè)ABO等位基因相關(guān)的NPs(261,467,802,803,1061)的正常及突變純合子和/或雜合子,為后續(xù)嵌合體分析方法的建立及方法學(xué)評(píng)價(jià)提供合適的研究模板。
方法:
收集76例體檢者血樣,用抗-A、抗-B、抗A,B、抗A1、抗H和ABO反定紅細(xì)胞進(jìn)行ABO血型鑒定,要求正反定型一致,非孟買型,其中A18人,B27人,O18人,AB13人;抽提全血基因組DNA,設(shè)計(jì)5個(gè)NPs相應(yīng)的引物及PCR-SSP擴(kuò)增體系進(jìn)行分析。
結(jié)果:
篩選到的5個(gè)NPs按血型分布如下:
A(261雜合子、467正常純合子)有7例,A(261雜合子、467雜合子、1061正常純合子)有8例,A(261正常純合子、467雜合子、1061正常純合子)有3例;B(261雜合子、803雜合子)有23例,B(803突變純合子)有4例,O(均為261突變純合子)18例,AB(467雜合子、803雜合子、1061正常純合子)有10例,AB(467正常純合子、803雜合子)有3例,未能篩選出467突變純合子,802雜合子或突變純合子,1061雜合子或突變純合子。
結(jié)論:
直接在表型確定的DNA標(biāo)本進(jìn)行NPs篩選而不需要進(jìn)行基因分型是可行的,但受到篩選群體量及種群的ABO基因頻率限制,我們無法獲得467正常位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的陰性模板,802及803正常及突變位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的陽性模板或陰性模板,因此這些位點(diǎn)均不能進(jìn)入ABO基因相關(guān)NPsSYBRgreenI實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法的研究及方法學(xué)評(píng)價(jià)。
關(guān)鍵詞:
ABO等位基因核酸多態(tài)性位點(diǎn)序列特異性引物PCR第二部分建立ABO基因相關(guān)NPsSYBRgreenI實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法目的:
建立檢測(cè)261突變位點(diǎn)、261正常位點(diǎn)、467突變位點(diǎn),803突變及正常位點(diǎn)的SYBRgreenI實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系。
方法:
以研究第一部分篩選到的261,467,803位點(diǎn)的模板為研究對(duì)象,分別建立依賴相應(yīng)的正常及突變位點(diǎn)SYBRgreenI實(shí)時(shí)熒光定量PCR,包括白蛋白基因內(nèi)參體系的建立,PCR反應(yīng)體系的建立和設(shè)計(jì)最優(yōu)的人為增加錯(cuò)配擴(kuò)增引物。
對(duì)各位點(diǎn)的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行融解曲線分析及電泳分析,各位點(diǎn)陰陽模板的△Ct值綜合確定最優(yōu)的人為增加錯(cuò)配擴(kuò)增引物,再對(duì)其擴(kuò)增產(chǎn)物通過測(cè)序分析來證實(shí)特異性。
結(jié)果:
建立的白蛋白基因內(nèi)參體系標(biāo)準(zhǔn)曲線的回歸方程為:
y=-3.04x+33.95,相關(guān)系數(shù)為1.00,此外在500
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