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文檔簡介
關(guān)于基因和基因組及基因工程的概念第一節(jié)
基因的概念
一、基因與“遺傳因子”二、基因與染色體三、基因與蛋白質(zhì)四、基因與DNA五、基因密碼的破譯六、基因的概念七、基因的新概念第2頁,共42頁,2024年2月25日,星期天一、基因與“遺傳因子”對遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)的認識有個發(fā)展過程,孟德爾(G.Menodel)在1857~1864年以豌豆為材料進行雜交實驗的研究中,提出“遺傳因子”決定和控制著生物體的各種性狀。1909年丹麥生物學(xué)家W.Johannsen為了強調(diào)“遺傳因子”與生命的關(guān)系,他根據(jù)希臘“給予生命”之義的詞“gene”(基因)創(chuàng)造性地用“gene”這個術(shù)語來代替“遺傳因子”?;蜻@個詞當(dāng)時被用來描述遺傳性狀,但對基因的物質(zhì)概念還未能認識,只是遺傳的一個符號。第3頁,共42頁,2024年2月25日,星期天孟德爾的豌豆雜交試驗
遺傳因子是成對的,一個來自父本,一個來自母本,形成配體時彼此分開,在性細胞中是成單的,雜交子一代各自保持獨立和純一狀態(tài),形成配子時又彼此分開,互不混雜,完整地傳給后代,雌雄配
子結(jié)合有等同隨機結(jié)合的機會。
圓形種子+皺形種子
雜交第一代(均為圓形)
回交
圓形豆皺形豆
5474粒1850粒
3:1黃色圖形+綠色皺形雜交第一代(均為黃色圓形)回交黃色圓形豆黃色皺形豆綠色圓形豆綠色皺形豆315粒121粒108粒32粒9
:
:
:331第4頁,共42頁,2024年2月25日,星期天二、基因與染色體1910年~1926年,美國的摩爾根(T.H.Morgan)選用果蠅做研究材料,發(fā)現(xiàn)了基因連鎖和交換現(xiàn)象,創(chuàng)立了遺傳的染色體理論(Chromosomoltheoryofinheritance),繪制了基因連鎖圖,接受了孟德爾的遺傳原理,指出遺傳物質(zhì)必須由某種獨立的要素組成,即遺傳因子或叫做基因。從而證明了基因是位于染色體上呈直線按順序排列的遺傳單位,基因是攜帶遺傳信息的結(jié)構(gòu)單位,又是控制遺傳性狀的功能單位。第5頁,共42頁,2024年2月25日,星期天摩爾根果蠅雜交試驗有4對染色體,一對小粒狀,2對V形,一對呈棒狀XX或XY(性染色體)
X1X2(紅眼)+XWY(白眼)(野生型)(突變型)雜交子一代(雌雄均為紅眼)
X1XW,X1Y,X2XW,X2YX1X1,X1Y,XWX1,XWY,X2X1,X2Y,XWX2,XWY?為紅眼雄性及白眼雄性第6頁,共42頁,2024年2月25日,星期天三、基因與蛋白質(zhì)1941年G.W.Beadle和E.L.Tatum應(yīng)用X射線誘導(dǎo)鏈孢霉菌(Newosporecrassa)在DNA損傷修復(fù)后,產(chǎn)生了大量營養(yǎng)缺陷性突變體,提出了“一個基因一種酶”學(xué)說,后來又修正為“一個基因一種蛋白質(zhì)”的學(xué)說,或“一個基因一種多肽鏈”學(xué)說。
第7頁,共42頁,2024年2月25日,星期天四、基因與DNA1928年美國O.T.Avery首次證明了控制遺傳特性的物質(zhì)是DNA,而不是蛋白質(zhì),染色體上的基因為DNA分子。1953年J.watson和F.Crick根據(jù)堿基配對規(guī)律和DNA分子的X射線衍射圖譜等實驗,提出了DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)。1958年證明了DNA半保留復(fù)制和DNARNA蛋白質(zhì)合成的中心法則(如圖)。第8頁,共42頁,2024年2月25日,星期天遺傳中心法則第9頁,共42頁,2024年2月25日,星期天五、基因密碼的破譯1961年F.Crick,S.Brenner,M.W.Nirenberg,H.G.Khorana等確立了每三個核苷酸可作為決定一個氨基酸的密碼子。1964年64種三聯(lián)密碼子全部被破譯公布。64種密碼子中有61個密碼子可用于編碼20種氨基酸,有3個密碼子為終止信號,只表示鏈的終止,不表達任何氨基酸。其中AUG為啟始密碼子,并具有通用性、偏愛性和簡并性。第10頁,共42頁,2024年2月25日,星期天第11頁,共42頁,2024年2月25日,星期天遺傳密碼的兼并性第12頁,共42頁,2024年2月25日,星期天六、基因的概念按照分子生物學(xué)理論,基因的概念應(yīng)當(dāng)是指編碼有功能蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA分子所必需的全部核酸序列(即DNA序列)。根據(jù)這個概念,一個基因不僅含編碼蛋白質(zhì)肽鏈或RNA分子的核酸序列,還包括保證轉(zhuǎn)錄所必需的非編碼的調(diào)控序列即位于編碼區(qū)上游5’端的啟動子非編碼序列、內(nèi)含子(intron)和位于編碼區(qū)下游3’端的終止子非編碼序列。編碼區(qū)是發(fā)揮基因功能的結(jié)構(gòu)基因(或功能基因),而起調(diào)控、啟動和終止作用的非編碼區(qū)屬于調(diào)控基因。
第13頁,共42頁,2024年2月25日,星期天七、基因的新概念1、移動基因2、斷裂基因(splitgene)3、重疊基因4、假基因5、重復(fù)序列及重復(fù)基因第14頁,共42頁,2024年2月25日,星期天1、移動基因
移動基因(movablegene)又叫轉(zhuǎn)位因子(transposableelements),由于它可以在染色體基因組上移動,甚至可在不同染色體間躍遷,故又稱跳躍基因(jumpinggene),這種基因是J.A.Shapiro在研究大腸桿菌高效突變時發(fā)現(xiàn)的。有三種類型:1.插入序列(insertionsequences,簡稱IS),其長度為數(shù)百個到數(shù)千個堿基對之間(如圖2-1)。2.轉(zhuǎn)位子(Tn),即兩側(cè)的IS和一個中心序列(帶有遺傳信息)3.噬菌體Mu和D108,其轉(zhuǎn)位作用如圖2-2。第15頁,共42頁,2024年2月25日,星期天2、斷裂基因(splitgene)
在真核細胞中的核苷酸序列中間插入與氨基酸編碼無關(guān)的DNA間隔區(qū)段,使一個有功能的結(jié)構(gòu)基因分隔成不連續(xù)的若干區(qū)段,將這種編碼序列不連續(xù),有間隔區(qū)段的DNA片斷稱為斷裂基因。這種非編碼間隔區(qū)段DNA稱間隔子(內(nèi)含子),有轉(zhuǎn)錄和編碼功能的編碼序列稱表達子。原核細胞無內(nèi)含子。其二者mRNA剪輯作用如圖2-3,2-4,2-5第16頁,共42頁,2024年2月25日,星期天3、重疊基因
不同基因的核苷酸序列有時為相鄰兩個基因共用,將核苷酸彼此重疊的兩個基因稱為重疊基因(overlappinggenes),在
174噬菌體有兩種類型的重疊基因(圖2-6)。第17頁,共42頁,2024年2月25日,星期天4、假基因
在珠蛋白基因簇(genecluster)各片斷核苷酸序列分析時發(fā)現(xiàn),除了有正常的功能基因之外,還有功能失活的特殊序列片斷,它不能行使表達功能。該類無表達功能的畸變核苷酸基因序列片斷,稱為假基因。其產(chǎn)生原因如圖2-7、2-8第18頁,共42頁,2024年2月25日,星期天5、重復(fù)序列及重復(fù)基因
幾乎所有的真核細胞(酵母除外)的基因組DNA中都具有重復(fù)序列(repeatedsequence),它無轉(zhuǎn)位移動能力,因此它區(qū)別于轉(zhuǎn)位作用的IR(invertedrepeat)。IR是指序列的重復(fù)性。但無基因序列的交叉重疊性,故不同于重疊基因序列。重復(fù)序列可分為四種類型:(1)不重復(fù)序列,是唯一的序列,只有一個拷貝。(2)低度重復(fù)序列,一般有1-10個拷貝。(3)中度重復(fù)序列,有數(shù)十至數(shù)萬(105)拷貝。如圖2-9、2-10(4)高度重復(fù)序列拷貝數(shù)可達106以上,包括衛(wèi)星DNA、高豐度SINE家族的Alu序列。第19頁,共42頁,2024年2月25日,星期天第二節(jié)
基因組
“基因組”是表示某物種單倍體的總DNA,對于二倍體高等生物其配子的DNA總和即為一組基因組。不同生物基因組數(shù)目不同,如表第20頁,共42頁,2024年2月25日,星期天研究得較多的為以下三類基因組:
一、病毒基因組二、細菌基因組三、真核生物基因組第21頁,共42頁,2024年2月25日,星期天第三節(jié)
基因工程的定義和研究內(nèi)容
基因工程的定義通常是指在體外把核酸分子(基因)組合到特定的載體上(病毒,質(zhì)粒,噬菌體等)并使之進入(或?qū)耄┑皆瓉頉]有這類分子的宿主體內(nèi),能使基因在宿主內(nèi)繁殖或表達生物活性物質(zhì)?;蚬こ痰暮诵膬?nèi)容是重組DNA技術(shù),還包括體外DNA突變,體內(nèi)基因操作以及基因的化學(xué)合成等。第22頁,共42頁,2024年2月25日,星期天第四節(jié)
基因工程的發(fā)展史
一、四大里程碑二、三大技術(shù)發(fā)明三、基因工程的誕生第23頁,共42頁,2024年2月25日,星期天病毒基因組特點:1.結(jié)構(gòu)簡單,無細胞結(jié)構(gòu),基因組為DNA或RNA組成,有雙鏈/單鏈,環(huán)狀/線狀。2.有調(diào)控元件和轉(zhuǎn)錄元件組成,轉(zhuǎn)錄元件可轉(zhuǎn)錄成為多順反子mRNA。3.有重疊基因。4.逆轉(zhuǎn)錄病毒(RV)可使RNA變cDNA其結(jié)構(gòu)如圖,具U3RU5的長末端重復(fù)序列(LTR),具隨機整和能力,可用作病毒載體。第24頁,共42頁,2024年2月25日,星期天細菌基因組約有三千個基因,無內(nèi)含子,為雙鏈DNA,但無核仁、核膜,多為單拷貝,無重疊基因,有多種功能調(diào)控區(qū),有復(fù)制起始區(qū)、終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄起始區(qū),終止區(qū)常有反向重復(fù)序列。另外有質(zhì)粒存在,質(zhì)??勺鳛檩d體。第25頁,共42頁,2024年2月25日,星期天真核生物基因組特點:大而復(fù)雜,為雙倍體,有低中高重復(fù)序列,多為斷裂基因,基因組中非編碼區(qū)多于編碼區(qū)(占90%),大多于蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體,DNA占35%,RNA占5%,其余為蛋白質(zhì)(組蛋白或非組蛋白)與C值矛盾:一般高等生物的全部DNA量(稱C值)均大于低等生物,但某些植物或兩棲動物的C值比人高出幾十倍,這種與進化復(fù)雜性不一致的C值反?,F(xiàn)象稱為C值矛盾。類型多基因家族第26頁,共42頁,2024年2月25日,星期天四大里程碑遺傳物質(zhì)的明確——DNADNA雙螺旋結(jié)構(gòu)理論(半保留復(fù)制及其中心法則)基因遺傳密碼子的破譯基因轉(zhuǎn)譯載體的發(fā)現(xiàn)第27頁,共42頁,2024年2月25日,星期天三大技術(shù)發(fā)明工具酶的發(fā)明:內(nèi)切酶、合成酶、連接酶基因合成和測序(合成儀、測序儀)PCR技術(shù)(PCR擴增儀)第28頁,共42頁,2024年2月25日,星期天基因工程的誕生
1972年是基因工程的誕生之年。美國斯坦福大學(xué)P.Berg將SV40的DNA導(dǎo)入噬菌體載體在大腸桿菌中獲表達。S.Cohen等人將抗四環(huán)素、新霉素基因的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌,獲得抗四環(huán)素,抗新霉素重組菌落,從而揭開基因工程的序幕。第29頁,共42頁,2024年2月25日,星期天類型單拷貝序列:人類約占60%~65%中度重復(fù)序列:長短300~700bp,重復(fù)次數(shù)達105。通常為Alu、KpnⅠ、Hinf、rRNA、tRNA、組蛋白基因等。高度重復(fù)序列:衛(wèi)星DNA及微衛(wèi)星DNA反向重復(fù)序列:人類約占5%,長度300bp在復(fù)性時,若有間隔序列,可形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),若無間隔序列,可形成回文結(jié)構(gòu),可能與復(fù)制、轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)。第30頁,共42頁,2024年2月25日,星期天多基因家族指來源相同,結(jié)構(gòu)相似,功能相關(guān)的基因在染色體上成串存在,形成多基因家族。如rRNA、tRNA、組蛋白基因等為成串的,干擾素、珠蛋白、生長激素等為分散的。第31頁,共42頁,2024年2月25日,星期天衛(wèi)星DNA衛(wèi)星D
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