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SAGE基因表達(dá)系列分析SerialAnalysisOfGeneExpression是通過(guò)快速和詳細(xì)分析成千上萬(wàn)個(gè)EST(expresssequencedtags)來(lái)尋找出表達(dá)豐富度不同的SAGE標(biāo)簽序列。主要應(yīng)用:全基因組基因表達(dá)分析、尋找差異基因、發(fā)現(xiàn)新基因。能同時(shí)對(duì)大量的轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行定性和定量的分析,可以同時(shí)反映正?;虍惓5炔煌δ軤顟B(tài)下細(xì)胞整個(gè)基因組基因的全貌,特別對(duì)低豐度表達(dá)基因有較高的檢測(cè)結(jié)果。它不但能快速詳細(xì)的分析成千上萬(wàn)個(gè)基因轉(zhuǎn)錄子的豐富信息,還能發(fā)現(xiàn)新的基因。SAGE的原理SAGE的主要依據(jù)有兩個(gè):1、一個(gè)9~10堿基的短核苷酸序列標(biāo)簽包含有足夠的信息,能夠唯一確認(rèn)一種轉(zhuǎn)錄物。例如,一個(gè)9堿基順序能夠分辨262144個(gè)不同的轉(zhuǎn)錄物,而人類(lèi)基因組估計(jì)僅能編碼80000種轉(zhuǎn)錄物,所以理論上每一個(gè)9堿基標(biāo)簽?zāi)軌虼硪环N轉(zhuǎn)錄物的特征序列。2、如果能將9堿基的標(biāo)簽集中于一個(gè)克隆中進(jìn)行測(cè)序,并將得到的短序列核苷酸順序以連續(xù)的數(shù)據(jù)形式輸入計(jì)算機(jī)中進(jìn)行處理,就能對(duì)數(shù)以千計(jì)的mRNA轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行分析。
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