生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索方法與技巧講義整理課件

北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館信息咨詢部liucy@PubMed生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索方法與技巧PubMed生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索方法與技巧1主要內(nèi)容PubMed概況

PubMed數(shù)據(jù)來(lái)源PubMed檢索機(jī)制PubMed檢索運(yùn)算符PubMed檢索方法結(jié)果的顯示、打印、保存其他輔助功能主要內(nèi)容PubMed概況21.PubMed概況創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國(guó)生物技術(shù)信息中心(NCBI)1997年6月開(kāi)始向全球開(kāi)放特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn)，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。1.PubMed概況創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國(guó)32.PubMed數(shù)據(jù)來(lái)源MEDLINE：

[pubmed-indexedformedline]InProcessCitations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的電子文獻(xiàn)，每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。2.PubMed數(shù)據(jù)來(lái)源MEDLINE：43.PubMed檢索機(jī)制自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)3.PubMed檢索機(jī)制自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能5對(duì)于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對(duì)照匹配和轉(zhuǎn)換，再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表期刊刊名表短語(yǔ)表作者索引如果在以上4個(gè)表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語(yǔ)分開(kāi)，以單詞為單位，分別重復(fù)以上的過(guò)程，檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞，則用單個(gè)詞在所有字段查找，各個(gè)詞之間也是AND邏輯關(guān)系。3.1自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能對(duì)于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對(duì)照匹配6人重組三葉因子（humanrecombinanttrefoilfactor）

("humans"[MeSHTerms]OR"humans"[AllFields]OR"human"[AllFields])

ANDrecombinant[AllFields]

AND("trefoilfactor"[SupplementaryConcept]OR"trefoilfactor"[AllFields])人重組三葉因子（humanrecombinanttref74.PubMed檢索運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符4.PubMed檢索運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符8邏輯運(yùn)算符①邏輯“與”運(yùn)算AND：

檢索式寫成AandB，表示文獻(xiàn)中同時(shí)包含檢索詞A和檢索詞B的文獻(xiàn)才是命中文獻(xiàn)。

AIDSandtherapy②邏輯“或”運(yùn)算OR：

檢索式寫成AorB，表示包含檢索詞A的文獻(xiàn)或者包含檢索詞B的文獻(xiàn)或者同時(shí)包含檢索詞A和B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。

AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③邏輯“非”運(yùn)算NOT：

檢索式寫成AnotB，表示包含檢索詞A同時(shí)不包含檢索詞B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。

HepatitisnotAnimal邏輯運(yùn)算符①邏輯“與”運(yùn)算AND：9IP地址：PubMed網(wǎng)址PubMed網(wǎng)址10基本檢索高級(jí)檢索主題檢索臨床咨詢基本檢索高級(jí)檢索主題檢索臨床咨詢115.PubMed檢索方法5.1基本檢索5.2高級(jí)檢索5.3主題檢索5.4臨床咨詢5.PubMed檢索方法5.1基本檢索125.1基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊5.1基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊13關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語(yǔ)：⑴輸入任意關(guān)鍵詞：livercancer、Lungcancer；⑵帶有雙引號(hào)”

”作為短語(yǔ)檢索：”cancertherapy”；⑶帶有連接號(hào)”-”作為一個(gè)詞組檢索：interleukin-6。限制檢索字段：如livercancer[ti]作者：SmithJ、僅知道作者姓，則必須加上字段標(biāo)識(shí)，如：Smith[au]2002年以后的文獻(xiàn)若文中有作者全稱可用全稱檢索如：JoshuaLederberg5.1基本檢索關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語(yǔ)：5.1基本檢索14期刊刊名：⑴可用期刊全稱：GENETHERAPY[TA]；

⑵可用期刊簡(jiǎn)稱：JAMA[TA]；(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)

復(fù)雜表達(dá)式：livercancerANDtherapy帶有摘要文獻(xiàn)的檢索：livercancerANDhasabstract5.1基本檢索期刊刊名：5.1基本檢索15分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面：肝癌：livercancer；酒精：alcohol兩個(gè)主題之間的邏輯關(guān)系是AND，即livercancerANDalcohol

基本檢索舉例：肝癌和酒精的關(guān)系分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面：基本檢索舉例：肝癌和酒精的關(guān)16基本檢索舉例：肝癌和酒精的關(guān)系輸入：livercancerANDalcohol基本檢索舉例：肝癌和酒精的關(guān)系輸入：livercancer17“肝癌和酒精的關(guān)系”的基本檢索結(jié)果“肝癌和酒精的關(guān)系”的基本檢索結(jié)果185.2高級(jí)檢索高級(jí)檢索5.2高級(jí)檢索高級(jí)檢索195.2高級(jí)檢索5.2高級(jí)檢索20分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面：作者為：馬大龍（madl）；作者單位為：北京大學(xué)（pekinguniversity）。

高級(jí)檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)分析該檢索課題，包含兩個(gè)方面：高級(jí)檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部21高級(jí)檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)輸入：madl輸入：pekinguniversity高級(jí)檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)輸入：ma22高級(jí)檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)高級(jí)檢索舉例：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)235.3主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引的規(guī)范性，利用主題詞進(jìn)行的研究，對(duì)提高查全率、查準(zhǔn)率會(huì)有相當(dāng)?shù)膸椭｜c(diǎn)擊MeSHDatabase打開(kāi)主題檢索界面5.3主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引的規(guī)范性，利用24高級(jí)檢索主題檢索基本檢索高級(jí)檢索主題檢索基本檢索255.3主題檢索5.3主題檢索26主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)分析該檢索課題，有2個(gè)概念：長(zhǎng)春新堿（Vincristine）、白血?。╨eukemia）：對(duì)長(zhǎng)春新堿來(lái)說(shuō)是利用其治療疾病，故其應(yīng)組配副主題詞“治療應(yīng)用（therapeuticuse）”；對(duì)白血病來(lái)說(shuō)是利用藥物來(lái)治療，故其應(yīng)組配副主題詞“藥物療法（drugtherapy）”。同時(shí)這兩個(gè)概念之間是AND的關(guān)系。主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血27主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長(zhǎng)春新堿/治療應(yīng)用主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血28主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長(zhǎng)春新堿/治療應(yīng)用主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血29主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長(zhǎng)春新堿/治療應(yīng)用副主題詞主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血30主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長(zhǎng)春新堿/治療應(yīng)用主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血31主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn)第1步：檢索長(zhǎng)春新堿/治療應(yīng)用主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血32主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血33主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血34主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血35主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)第2步：檢索白血病/藥物療法主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血36主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn)主題檢索舉例：

長(zhǎng)春新堿（Vincristine）治療白血375.4臨床咨詢和系統(tǒng)評(píng)價(jià)可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻(xiàn)，如臨床疾病的診斷、治療、病因和預(yù)后等；也可以用它來(lái)檢索臨床實(shí)踐過(guò)程中遇到的一些具體問(wèn)題，如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗(yàn)、循證醫(yī)學(xué)、實(shí)踐指導(dǎo)以及有關(guān)遺傳學(xué)方面的問(wèn)題等。

5.4臨床咨詢和系統(tǒng)評(píng)價(jià)可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床385.4臨床咨詢和系統(tǒng)評(píng)價(jià)臨床咨詢系統(tǒng)評(píng)價(jià)檢索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究方面的文獻(xiàn)5.4臨床咨詢和系統(tǒng)評(píng)價(jià)臨床咨詢系統(tǒng)評(píng)價(jià)檢索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究39生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索方法與技巧講義整理課件406.結(jié)果的顯示、打印、保存顯示保存、打印6.結(jié)果的顯示、打印、保存顯示416.1結(jié)果的顯示顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多，一般較常用的有以下4種：（1）Summary：為默認(rèn)顯示格式。顯示的信息包括文獻(xiàn)的標(biāo)題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻(xiàn)的原文語(yǔ)種等。（2）Abstract：顯示信息除了文獻(xiàn)標(biāo)題、著者、出處等基本信息外，還包括摘要信息，以便用戶了解文獻(xiàn)詳細(xì)內(nèi)容。6.1結(jié)果的顯示顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多，一般較常42（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)的記錄格式來(lái)顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語(yǔ)種、出版類型、出處、MeSH、文獻(xiàn)ID、出版狀態(tài)等。6.1結(jié)果的顯示（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)的記錄格式來(lái)顯示436.1結(jié)果的顯示6.1結(jié)果的顯示44保存記錄在“sendto”下拉菜單中選擇“File”，可完成將記錄保存為文件。選擇“E-mail”，則可將結(jié)果發(fā)送至郵箱。在檢索結(jié)果顯示頁(yè)面可將某一次檢索的全部記錄或標(biāo)記記錄保存；而“Clipboard”頁(yè)面可用于保存一次或多次檢索的結(jié)果記錄。6.2檢索結(jié)果的保存

保存記錄6.2檢索結(jié)果的保存456.2檢索結(jié)果的保存

6.2檢索結(jié)果的保存467其他輔助功能7.1檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用7.2全文鏈接7.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接7其他輔助功能7.1檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用477.1檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用使用MyNCBI(Cubby)首先要登記注冊(cè)保存檢索策略定期瀏覽新的檢索結(jié)果7.1檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用使用MyNCBI(Cubby)487.2全文鏈接-摘要格式顯示

7.2全文鏈接-摘要格式顯示

497.2全文鏈接-打開(kāi)單篇詳細(xì)頁(yè)面

7.2全文鏈接-打開(kāi)單篇詳細(xì)頁(yè)面

507.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接7.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接517.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接7.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接52檢索練習(xí)眼結(jié)核（OcularTuberculosis）引起失明（Blindness）的文獻(xiàn)年代限定1999－2008年檢索有關(guān)“醫(yī)院水凈化（WaterPurification）管理”方面的綜述文獻(xiàn)檢索練習(xí)眼結(jié)核（OcularTuberculosis）引53Questions?Thanks!電話：82801292-608liucy@Questions?54

1、想要體面生活，又覺(jué)得打拼辛苦；想要健康身體，又無(wú)法堅(jiān)持運(yùn)動(dòng)。人最失敗的，莫過(guò)于對(duì)自己不負(fù)責(zé)任，連答應(yīng)自己的事都辦不到，又何必抱怨這個(gè)世界都和你作對(duì)？人生的道理很簡(jiǎn)單，你想要什么，就去付出足夠的努力。

2、時(shí)間是最公平的，活一天就擁有24小時(shí)，差別只是珍惜。你若不相信努力和時(shí)光，時(shí)光一定第一個(gè)辜負(fù)你。有夢(mèng)想就立刻行動(dòng)，因?yàn)楝F(xiàn)在過(guò)的每一天，都是余生中最年輕的一天。

3、無(wú)論正在經(jīng)歷什么，都請(qǐng)不要輕言放棄，因?yàn)閺膩?lái)沒(méi)有一種堅(jiān)持會(huì)被辜負(fù)。誰(shuí)的人生不是荊棘前行，生活從來(lái)不會(huì)一蹴而就，也不會(huì)永遠(yuǎn)安穩(wěn)，只要努力，就能做獨(dú)一無(wú)二平凡可貴的自己。

4、努力本就是年輕人應(yīng)有的狀態(tài)，是件充實(shí)且美好的事，可一旦有了表演的成分，就會(huì)顯得廉價(jià)，努力，不該是為了朋友圈多獲得幾個(gè)贊，不該是每次長(zhǎng)篇贅述后的自我感動(dòng)，它是一件平凡而自然而然的事，最佳的努力不過(guò)是：但行好事，莫問(wèn)前程。愿努力，成就更好的你！

5、付出努力卻沒(méi)能實(shí)現(xiàn)的夢(mèng)想，愛(ài)了很久卻沒(méi)能在一起的人，活得用力卻平淡寂寞的青春，遺憾是每一次小的挫折，它磨去最初柔軟的心智、讓我們懂得累積時(shí)間的力量；那些孤獨(dú)沉寂的時(shí)光，讓我們學(xué)會(huì)守候內(nèi)心的平和與堅(jiān)定。那些脆弱的不完美，都會(huì)在努力和堅(jiān)持下，改變模樣。

6、人生中總會(huì)有一段艱難的路，需要自己獨(dú)自走完，沒(méi)人幫助，沒(méi)人陪伴，不必畏懼，昂頭走過(guò)去就是了，經(jīng)歷所有的挫折與磨難，你會(huì)發(fā)現(xiàn)，自己遠(yuǎn)比想象中要強(qiáng)大得多。多走彎路，才會(huì)找到捷徑，經(jīng)歷也是人生，修煉一顆強(qiáng)大的內(nèi)心，做更好的自己！

7、“一定要成功”這種內(nèi)在的推動(dòng)力是我們生命中最神奇最有趣的東西。一個(gè)人要做成大事，絕不能缺少這種力量，因?yàn)檫@種力量能夠驅(qū)動(dòng)人不停地提高自己的能力。一個(gè)人只有先在心里肯定自己，相信自己，才能成就自己！

8、人生的旅途中，最清晰的腳印，往往印在最泥濘的路上，所以，別畏懼暫時(shí)的困頓，即使無(wú)人鼓掌，也要全情投入，優(yōu)雅堅(jiān)持。真正改變命運(yùn)的，并不是等來(lái)的機(jī)遇，而是我們的態(tài)度。

9、這世上沒(méi)有所謂的天才，也沒(méi)有不勞而獲的回報(bào)，你所看到的每個(gè)光鮮人物，其背后都付出了令人震驚的努力。請(qǐng)相信，你的潛力還遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒(méi)有爆發(fā)出來(lái)，不要給自己的人生設(shè)限，你自以為的極限，只是別人的起點(diǎn)。寫給渴望突破瓶頸、實(shí)現(xiàn)快速跨越的你。

10、生活中，有人給予幫助，那是幸運(yùn)，沒(méi)人給予幫助，那是命運(yùn)。我們要學(xué)會(huì)在幸運(yùn)青睞自己的時(shí)候?qū)W會(huì)感恩，在命運(yùn)磨練自己的時(shí)候?qū)W會(huì)堅(jiān)韌。這既是對(duì)自己的尊重，也是對(duì)自己的負(fù)責(zé)。