三代基因測序儀加耗材參數(shù)

—PAGE8—三代基因測序儀加耗材參數(shù)采購編號貨物名稱采購數(shù)量計量單位設備最高限價（萬元）國別備注2023-JKMXJY-W3004三代基因測序儀2套40R國產(chǎn)□進口配套耗材耗材參數(shù)★所投試劑生產(chǎn)廠家的試劑檢測內(nèi)容需包含DNA病毒、RNA病毒、細菌，真菌，寄生蟲，耐藥基因、疑似背景微生物。耗材年用量15.3萬元/年/臺序號耗材名稱耗材年預估量耗材最高限價（單價）耗材最高限價（總價）1病原微生物宏基因組檢測試劑2400測試45元/測試1080002靶向多重病原體檢測試劑1600測試28.125元/測試45000合計153000采購項目技術要求設備功能要求三代測序技術，區(qū)別于傳統(tǒng)的用聚合酶擴增引入帶有熒光標記的核苷酸，捕獲其光信號，再轉化成數(shù)字信號的方式，三代測序技術是核酸序列（DNA/RNA）通過有離子的納米孔，從而產(chǎn)生電流波動，獲取電流波動的信息進而計算出對應的核酸序列，是不使用聚合酶直接讀取電信號模式。實現(xiàn)了Real-Time讀取核酸序列，通量較高，單張芯片理論最高單鏈產(chǎn)量50Gb。讀長沒有限制，取決于樣品提取時核酸序列的長度，目前最長的讀長記錄是4.2Mb，可以直接讀取DNA甲基化，無需像二代測序那樣做bisulfite處理，在DNA單堿基修飾相關方面研究有極大幫助。三代測序儀是目前市面上唯一一個可以直接測RNA的技術，可讀取RNA序列上單堿基修飾（6mA/5mC）。三代測序平臺非常便攜，不僅操作簡單，無需像傳統(tǒng)測序平臺那樣有比較多的配套設施與人員，可輕松的實現(xiàn)測序實驗，同時儀器對實驗環(huán)境無限制，室內(nèi)、野外、太空都可以進行測序。軟硬件配置清單序號描述數(shù)量1主機2臺2服務器2臺技術參數(shù)要求序號指標名稱技術參數(shù)1測序類型三代測序儀，直接測序DNA/RNA，無需PCR擴增，無需熒光標記。避免由于PCR擴增和熒光標記產(chǎn)生的偏離和原始樣本的失真。2＃測序讀長最長讀長高達4.2Mb，具體讀長長度取決于DNA或RNA片段的長度和質(zhì)量3CONTIGSN50目前超長讀長contigN50=1Mb(具體取決于樣品類型、質(zhì)量等)4★準確性1X準確度99%，30X準確度99.6%，100X準確度99.999%5＃數(shù)據(jù)量單張芯片理論最高單鏈產(chǎn)量50Gb（內(nèi)測數(shù)據(jù)）6運行時間1分鐘至64小時；按需測序，無固定運行時間7便攜性一個人可輕松搬運，測序實驗不受環(huán)境限制8混樣建庫測序12，24，48，96個樣本試劑盒可選9＃測序模式實時堿基讀取，用戶可以實時讀取堿基序列信息，無需通過熒光信號轉換。直接，迅速給出測序結果。10★服務器配置1.單次可并行分析6個樣本以上，分析時間最快可達5min/樣本；2.高性能CPU、GPU配置；GPUCUDA核心數(shù)不少于2400，運行速度快；3.內(nèi)存至少128Gb；固態(tài)硬盤不低于1T，機械硬盤不低于4T；11服務器性能可直接完成原始電信號堿基讀?。‵AST5ToFASTQ）、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制（QC）、可實現(xiàn)barcode拆分（Demultiplexing）、序列比對（Alignment）、基因組組裝（Assembly）、宏基因組分析（Metagenomics）、擴增子分析（Amplicon）、測序錯誤校正（Errorcorrection）、變異分析（Variantcalling）、堿基修飾（Basemodification）等功能12#產(chǎn)地進口設備售后服務要求（每一項都是“★”）1質(zhì)保期1年2備件庫國內(nèi)有備件庫3維修站國內(nèi)有維修站4收費標準質(zhì)保期外只收取維修配件成本費5培訓支持現(xiàn)場培訓6維修響應2小時內(nèi)回應，48小時內(nèi)到達現(xiàn)場7到貨時間