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真核生物基因表達的調(diào)控
(ControlofEukaryoticGeneExepression)DNA水平的調(diào)控轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控(transcriptionalregulation)轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控(posttranscriptionalregulation)翻譯水平的調(diào)控(translationalregulation)翻譯后水平的調(diào)控(proteinmaturation)真核基因組結(jié)構(gòu)特點真核基因組結(jié)構(gòu)龐大3×109bp、染色質(zhì)、染色體、核膜單順反子(monocistron)含有大量重復(fù)序列
基因不連續(xù)性斷裂基因(interruptedgene)、內(nèi)含子(intron)、外顯子(exon)非編碼區(qū)較多多于編碼序列(9:1)原核生物:生長調(diào)控;真核生物:分化調(diào)控多層次調(diào)控失活DNA水平的調(diào)控染色質(zhì)的丟失:不可逆核的全能性(totipotency):細胞核內(nèi)保存了個體發(fā)育所必需的全部基因基因擴增(geneamplification):增加基因的拷貝數(shù)非洲爪蟾卵母細胞rRNA基因卵裂時,擴增2000倍,達1012個核糖體藥物:誘導(dǎo)抗藥性基因的擴增;腫瘤細胞:原癌基因拷貝數(shù)異常增加基因重排(generearrangement):如免疫球蛋白基因重排,多樣性DNA水平的調(diào)控DNA甲基化(DNAmethylation):mCpG,即“CpG島(CpG-richislands)”甲基化(methylated)程度高,基因表達降低;去甲基化(undermethylated):基因表達增加染色質(zhì)(chromatin)或染色體(chromosome)結(jié)構(gòu)對基因表達的調(diào)控:DNA甲基化與X染色體失活雌性胎生哺乳動物細胞中兩條X染色體之一在發(fā)育早期隨機失活X染色體失活中心(X-chromosomeinactivationcenter,Xic):Xist基因(Xi-specifictranscript)XistX染色體其他位點甲基化,不轉(zhuǎn)錄活性去甲基化,活性去甲基化,轉(zhuǎn)錄失活甲基化,失活常染色質(zhì):結(jié)構(gòu)松散,基因表達異染色質(zhì):結(jié)構(gòu)緊密,基因不表達有基因表達活性的染色質(zhì)DNA對DNaseⅠ更敏感,即DnaseⅠ的敏感性可作為該基因的轉(zhuǎn)錄活性的標(biāo)志。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控最重要順式作用元件(cis-actingelement)反式作用因子(trans-actingfactor)轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控順式作用元件(cis-actingelement)影響自身基因表達活性的DNA序列非編碼序列分啟動子、增強子、沉默子啟動子:TATA盒,-25bp上游啟動子元件(upstreampromotorelements,UPE):CAAT盒,-75bp;GC序列等順式作用元件增強子(enhancer):遠離轉(zhuǎn)錄起始點(1~30kb),增強啟動子轉(zhuǎn)錄活性DNA序列,與方向、距離無關(guān)沉默子(silencer):負(fù)性調(diào)節(jié)元件,起阻遏作用順式作用元件增強子感染真核細胞的病毒DNA,大多具有可被寄主細胞蛋白質(zhì)激活的增強子。小鼠乳腺瘤病毒(MMTV)的DNA,具有糖皮質(zhì)激素基因的增強子。在能被類固醇激活的細胞(如乳腺上皮細胞)中,MMTV病毒能旺盛生長。病毒有寄主范圍,因它有組織特異和物種特異的增強子。反式作用因子(trans-actingfactor)概念:為DNA結(jié)合蛋白,核內(nèi)蛋白,可使鄰近基因開放(正調(diào)控)或關(guān)閉(負(fù)調(diào)控)通用或基本轉(zhuǎn)錄因子(generaltranscriptionfactors)—RNA聚合酶結(jié)合啟動子所必需的一組蛋白因子。TFⅡA、TFⅡB、TFⅡD、TFⅡE等
特異轉(zhuǎn)錄因子(specialtranscriptionfactors)—個別基因轉(zhuǎn)錄所必需的轉(zhuǎn)錄因子.OCT-2:在淋巴細胞中特異性表達,識別Ig基因的啟動子和增強子。反式作用因子特點三個功能結(jié)構(gòu)域:DNA識別結(jié)合域(DNA-bindingdomain);轉(zhuǎn)錄活性域(transcriptionalactivationdomain);結(jié)合其他蛋白的結(jié)合域能識別并結(jié)合順式作用元件(cis-actingelement)正調(diào)控與負(fù)調(diào)控功能
結(jié)構(gòu)域反式作用因子結(jié)構(gòu)域的模式DNA結(jié)合域(DNA-bandingdomain)鋅指結(jié)構(gòu)(zincfingermotif)同源結(jié)構(gòu)域(homodomain,HD):螺旋-回折-螺旋(helix-turn-helix)亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)(leucinezipper)螺旋-環(huán)-螺旋(helix-loop-helix,HLH)堿性α螺旋(alkalineα-helix)鋅指結(jié)構(gòu)(zincfingermotif)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(helix-turn-helix)亮氨酸拉鏈(leucinezipper)TRE:TPAresponseelement螺旋-環(huán)-螺旋(helix-loop-helix,HLH)螺旋-環(huán)-螺旋反式作用因子結(jié)構(gòu)域的模式轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域(transcriptionalactivationdomain)酸性α-螺旋結(jié)構(gòu)域(acidicα–helixdomain)富含谷氨酰胺結(jié)構(gòu)域(glutamine-richdomain)富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域(proline-richdomain)轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成關(guān)鍵:轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor,TF);啟動子與TF結(jié)合后,才能被RNApol識別與結(jié)合;-25~-30區(qū):TATA盒轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控TBP:TATA-bindingproteinTAFs:TBPassociatedfactors轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控反式作用因子的活性調(diào)節(jié)合成后即有活性:需要時合成,可迅速降解共價修飾:磷酸化-去磷酸化,糖基化配體結(jié)合:如激素與受體的結(jié)合蛋白質(zhì)與蛋白
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