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文檔簡(jiǎn)介

蛋白質(zhì)工程的崛起基因工程產(chǎn)物:

基因工程在原則上只能生產(chǎn)自然界已存在的蛋白質(zhì)。

這些天然蛋白質(zhì)是生物在長(zhǎng)期進(jìn)化過程中形成的,它們的結(jié)構(gòu)和功能符合特定物種生存的需要,卻不一定完全符合人類生產(chǎn)和生活的需要?;蚬こ痰膶?shí)質(zhì):將一種生物的基因轉(zhuǎn)移到另一種生物體內(nèi),后者可以產(chǎn)生它本不能產(chǎn)生的蛋白質(zhì),進(jìn)而表現(xiàn)出新的形狀一、蛋白質(zhì)工程的崛起的緣由例如:改造干擾素(半胱氨酸)體外很難保存干擾素(絲氨酸)體外可以保存半年玉米中賴氨酸含量比較低天冬氨酸激酶(352位的蘇氨酸)二氫吡啶二羧酸合成酶(104位的天冬酰胺)改造改造天冬氨酸激酶(異亮氨酸)二氫吡啶二羧酸合成酶(異亮氨酸)玉米中賴氨酸含量可提高數(shù)倍許多工業(yè)用酶是在改變天然酶的特性后,才使之適應(yīng)生產(chǎn)和使用需要的。蛋白質(zhì)工程就是為了生產(chǎn)出符合人類生產(chǎn)和生活需要的蛋白質(zhì),甚至是自然界不存在的蛋白質(zhì)。二、蛋白質(zhì)工程的基本原理1、蛋白質(zhì)工程的目標(biāo)

根據(jù)人們對(duì)蛋白質(zhì)功能的特定需求,對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分子設(shè)計(jì)。2、天然蛋白質(zhì)的合成過程(中心法則)DNA(基因)轉(zhuǎn)錄mRNA翻譯蛋白質(zhì)基因→表達(dá)(轉(zhuǎn)錄和翻譯)→形成氨基酸序列的多肽鏈→形成具有高級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)→行使生物功能由于基因決定蛋白質(zhì),要對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行設(shè)計(jì)改造,最終還必須通過基因來(lái)完成基因DNA氨基酸序列多肽鏈蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)期功能生物功能mRNA轉(zhuǎn)錄翻譯折疊DNA合成分子設(shè)計(jì)

蛋白質(zhì)的功能是DNA決定的,那么要制造出新的蛋白質(zhì),就要改造DNA,所以蛋白質(zhì)工程的原理應(yīng)該是中心法則的逆推。思考:對(duì)天然蛋白質(zhì)進(jìn)行改造,你認(rèn)為應(yīng)該直接對(duì)蛋白質(zhì)分子進(jìn)行操作,還是通過對(duì)基因的操作來(lái)實(shí)現(xiàn)?應(yīng)該從對(duì)基因的操作來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)天然蛋白質(zhì)改造,主要原因如下:(1)任何一種天然蛋白質(zhì)都是由基因編碼的,改造了基因即對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行了改造,而且改造過的蛋白質(zhì)可以遺傳下去。如果對(duì)蛋白質(zhì)直接改造,即使改造成功,被改造過的蛋白質(zhì)分子還是無(wú)法遺傳的。(2)對(duì)基因進(jìn)行改造比對(duì)蛋白質(zhì)直接改造要容易操作,難度要小得多。3、蛋白質(zhì)工程的基本途徑預(yù)期的蛋白質(zhì)功能設(shè)計(jì)預(yù)期的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)推測(cè)應(yīng)有的氨基酸序列找到相對(duì)應(yīng)的脫氧核苷酸序列(基因)蛋白質(zhì)工程流程圖從預(yù)期的蛋白質(zhì)功能出發(fā)設(shè)計(jì)預(yù)期的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)推測(cè)應(yīng)有的氨基酸序列找到相應(yīng)的脫氧核苷酸序列討論:1、怎樣得出決定這一段肽鏈的脫氧核苷酸序列?請(qǐng)把相應(yīng)的堿基序列寫出來(lái)。

討論:某多肽鏈的一段氨基酸序列是:……-丙氨酸-色氨酸-賴氨酸-甲硫氨酸-苯丙氨酸-……丙氨酸:GCU、GCC、GCA、GCG色氨酸:UGG賴氨酸:AAA、AAG甲硫氨酸:AUG苯丙氨酸:UUU、UUC

每種氨基酸都有對(duì)應(yīng)的三聯(lián)密碼子,只要查一下遺傳密碼子表,就可以將上述氨基酸序列的編碼序列查出來(lái)。但是由于上述氨基酸序列中有幾個(gè)氨基酸是由多個(gè)三聯(lián)密碼子編碼,因此其堿基排列組合起來(lái)就比較復(fù)雜,至少可以排列出16種。同學(xué)們可以根據(jù)學(xué)過的排列組合知識(shí)自己排列一下。首先應(yīng)該根據(jù)三聯(lián)密碼子推出mRNA序列為GCU(或C或A或G)UGGAAA(或G)AUGUUU(或C),再根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)律推出脫氧核苷酸序列:CGA(或G或T或C)ACCTTT(或C)TACAAA(或G)?;蚨c(diǎn)誘變技術(shù)的常用方法是PCR法。突變點(diǎn):人工合成的引物上手段:PCR技術(shù)(定點(diǎn)突變?cè)噭┖校┠康模韩@得定點(diǎn)突變的基因2、確定目的基因的堿基序列后,怎樣才能合成或改造目的基因(DNA)?可以通過人工合成的方法獲取或基因的定點(diǎn)誘變技術(shù)來(lái)改變?;驎?huì)發(fā)生突變,突變可以自發(fā),也可以誘發(fā),這是每個(gè)稍有生物學(xué)知識(shí)的人都知道的常識(shí)。但在加拿大生物化學(xué)家M·史密斯(1932-2000)發(fā)明定點(diǎn)突變法之前,突變株的產(chǎn)生必須經(jīng)由自然界或用化學(xué)等方法誘使基因體突變。這類方法屬于隨機(jī)突變,突變株必須在生物性狀上有所改變,才能確定有突變發(fā)生,但除非用分子生物方法或遺傳方法找到此突變處,否則無(wú)法確定突變位置。也就是說,這種突變是盲目的。而史密斯發(fā)明的定點(diǎn)突變法卻是有目的的,該法可經(jīng)由設(shè)計(jì)好的寡核苷酸,在任何一個(gè)基因片段上進(jìn)行隨意或設(shè)計(jì)好的突變,也就是說,這種突變是預(yù)先設(shè)定好的,所以也有人將該法稱為“反遺傳法”。有意思的是這一給生命科學(xué)研究及應(yīng)用領(lǐng)域帶來(lái)革命性突破的方法竟然是史密斯和其同事在喝咖啡時(shí)閑聊出來(lái)的?,F(xiàn)在,幾乎每個(gè)生物實(shí)驗(yàn)室都會(huì)用定點(diǎn)突變法來(lái)研究基因或蛋白質(zhì)的功能。蛋白質(zhì)工程的概念

蛋白質(zhì)工程是指以蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)規(guī)律及其與生物功能的關(guān)系作為基礎(chǔ),通過基因修飾或基因合成,對(duì)現(xiàn)有蛋白質(zhì)進(jìn)行改造或制造一種新的蛋白質(zhì),以滿足人類對(duì)生產(chǎn)和生活的需求。前提:了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能原理:改造基因(基因修飾或基因合成)目的:定向改造或制造蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)工程的主要步驟通常包括:(1)從生物體中分離純化目的蛋白;(2)借助核磁共振和X射線晶體衍射等手段,盡可能地了解蛋白質(zhì)的二維重組和三維晶體結(jié)構(gòu);

(3)設(shè)計(jì)各種處理?xiàng)l件,了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)變化,包括折疊與去折疊等對(duì)其活性與功能的影響;(4)測(cè)定其氨基酸序列;(5)設(shè)計(jì)編碼該蛋白的基因改造方案,如定點(diǎn)突變;(6)分離、純化新蛋白,功能檢測(cè)后投入實(shí)際使用。

蛋白質(zhì)工程的實(shí)質(zhì):對(duì)編碼蛋白質(zhì)的基因進(jìn)行改造項(xiàng)目基因工程蛋白質(zhì)工程操作起點(diǎn)操作核心過程目標(biāo)結(jié)果聯(lián)系目的基因預(yù)期的蛋白質(zhì)功能基因表達(dá)載體基因獲取目的基因→構(gòu)建表達(dá)載體→導(dǎo)入受體細(xì)胞→目的基因的檢測(cè)與表達(dá)預(yù)期蛋白質(zhì)功能→設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)→推測(cè)氨基酸序列→推測(cè)核苷酸序列→合成DNA→表達(dá)出蛋白質(zhì)定向改造生物的遺傳特性,獲得人類所需的生物類型或生物產(chǎn)品定向改造或生產(chǎn)人類所需的蛋白質(zhì)生產(chǎn)自然界中已有的蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)工程是在基因工程的基礎(chǔ)上,延伸出來(lái)的第二代基因工程。因?yàn)閷?duì)現(xiàn)有蛋白質(zhì)的改造或制造新的蛋白質(zhì),必須通過基因的修飾或基因的合成。生產(chǎn)自然界沒有的蛋白質(zhì)比較基因工程和蛋白質(zhì)工程比較基因工程和蛋白質(zhì)工程基因工程蛋白質(zhì)工程相同點(diǎn)都要改造基因,都屬于分子水平產(chǎn)生新的基因型,無(wú)新基因基因(型)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)原有的新的聯(lián)系蛋白質(zhì)工程以基因工程為基礎(chǔ),是基因工程的應(yīng)用和延伸(二)蛋白質(zhì)改造工程舉例1.水蛭素改造水蛭素是水蛭唾液腺分泌的凝血酶特異抑制劑,它有多種變異體,由65或66個(gè)氨基酸殘基組成。水蛭素在臨床上可作為抗栓藥物用于治療血栓疾病。為提高水蛭素活性,在綜合各變異體結(jié)構(gòu)特點(diǎn)的基礎(chǔ)上提出改造水蛭素主要變異體HV2的設(shè)計(jì)方案,將47位的Asn(天冬酰胺)變成Lys(賴氨酸),使其與分子內(nèi)第4或第5位Thr(蘇氨酸)間形成氫鍵來(lái)幫助水蛭素N端肽段的正確取向,從而提高抗凝血效率,試管試驗(yàn)活性提高了4倍,在動(dòng)物模型上檢驗(yàn)抗血栓形成的效果,提高20倍。2.生長(zhǎng)激素改造生長(zhǎng)激素通過對(duì)它特異受體的作用促進(jìn)細(xì)胞和機(jī)體的生長(zhǎng)發(fā)育,然而它不僅可以結(jié)合生長(zhǎng)激素受體,還可以結(jié)合許多種不同類型細(xì)胞的催乳激素受體,引發(fā)其他生理過程。在治療過程中為減少副作用,需使人的重組生長(zhǎng)激素只與生長(zhǎng)激素受體結(jié)合,盡可能減少與其他激素受體的結(jié)合。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),二者受體結(jié)合區(qū)有一部分重疊,但并不完全相同,有可能通過改造加以區(qū)別。由于人的生長(zhǎng)激素和催乳激素受體結(jié)合需要鋅離子參與作用,而它與生長(zhǎng)激素受體結(jié)合則無(wú)需鋅離子參與,于是考慮取代充當(dāng)鋅離子配基的氨基酸側(cè)鏈,如第18和第21位His(組氨酸)和第17位Glu(谷氨酸)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果與預(yù)先設(shè)想一致,但要開發(fā)作為臨床用藥還有大量的工作要做。3.胰島素改造

天然胰島素制劑在儲(chǔ)存中易形成二聚體和六聚體,延緩胰島素從注射部位進(jìn)入血液,從而延緩了其降血糖作用,也增加了抗原性,這是胰島素B23-B28氨基酸殘基結(jié)構(gòu)所致。利用蛋白質(zhì)工程技術(shù)改變這些殘基,則可降低其聚合作用,使胰島素快速起作用。該速效胰島素已通過臨床實(shí)驗(yàn)。

4.治癌酶的改造癌癥的基因治療分二個(gè)方面:藥物作用于癌細(xì)胞,特異性地抑制或殺死癌細(xì)胞;藥物保護(hù)正常細(xì)胞免受化學(xué)藥物的侵害,可以提高化學(xué)治療的劑量。皰疹病毒(HSV)胸腺嘧啶激酶(TK)可以催化胸腺嘧啶和其它結(jié)構(gòu)類似物磷酸化而使這些堿基3’-OH缺乏,從而阻斷DNA的合成,殺死癌細(xì)胞。HSV—TK催化能力可以通過基因突變來(lái)提高。從大量的隨機(jī)突變中進(jìn)行篩選出一種酶,在酶活性部位附近有6個(gè)氨基酸被替換,催化能力20倍以上。蛋白質(zhì)工程的發(fā)展很快,研究工作很多,以上僅介紹了幾個(gè)例子。蛋白質(zhì)工程除了用于改造天然蛋白質(zhì)或設(shè)計(jì)制造新的蛋白質(zhì)外,其本身還是研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能的一種強(qiáng)有力的工具,它在解決生物理論方面所起的作用,可以和任何重大的生物研究方法相提并論。三、蛋白質(zhì)工程的進(jìn)展和前景

蛋白質(zhì)工程匯集了當(dāng)代分子生物學(xué)等學(xué)科的一些前沿領(lǐng)域的最新成就,它把核酸與蛋白質(zhì)結(jié)合、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與生物功能結(jié)合起來(lái)研究。蛋白質(zhì)工程將蛋白質(zhì)與酶的研究推進(jìn)到嶄新的時(shí)代,為蛋白質(zhì)和酶在工業(yè)、農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥方面的應(yīng)用開拓了誘人的前景。蛋白質(zhì)工程開創(chuàng)了按照人類意愿改造、創(chuàng)造符合人類需要的蛋白質(zhì)的新時(shí)期。1、前景誘人:如用此技術(shù)制成的

,具有

、耗電少和

的特點(diǎn)。2、難度很大:主要是目前科學(xué)家對(duì)大多數(shù)蛋白質(zhì)的

的了解還很不夠。電子元件體積小效率高高級(jí)結(jié)構(gòu)旁欄思考題

你知道人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃嗎?它與蛋白質(zhì)工程有什么關(guān)系?我國(guó)科學(xué)家承擔(dān)了什么任務(wù)?人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃是繼人類基因組計(jì)劃之后,生命科學(xué)乃至自然科學(xué)領(lǐng)域一項(xiàng)重大的科學(xué)命題。2001年,國(guó)際人類蛋白質(zhì)組組織宣告成立。之后,該組織正式提出啟動(dòng)了兩項(xiàng)重大國(guó)際合作行動(dòng):一項(xiàng)是由中國(guó)科學(xué)家牽頭執(zhí)行的“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”;另一項(xiàng)是以美國(guó)科學(xué)家牽頭執(zhí)行的“人類血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃”,由此拉開了人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的帷幕?!叭祟惛闻K蛋白質(zhì)組計(jì)劃”是國(guó)際上第一個(gè)人類組織/器官的蛋白質(zhì)組計(jì)劃,由我國(guó)賀福初院士牽頭,這是中國(guó)科學(xué)家第一次領(lǐng)銜的重大國(guó)際科研協(xié)作計(jì)劃,總部設(shè)在北京,目前有16個(gè)國(guó)家和地區(qū)的80多個(gè)實(shí)驗(yàn)室報(bào)名參加。它的科學(xué)目標(biāo)是揭示并確認(rèn)肝臟的蛋白質(zhì),為重大肝病預(yù)防、診斷、治療和新藥研發(fā)的突破提供重要的科學(xué)基礎(chǔ)。人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的深入研究將是對(duì)蛋白質(zhì)工程的有力推動(dòng)和理論支持。[隨堂基礎(chǔ)鞏固]1.蛋白質(zhì)工程中需要直接進(jìn)行操作的對(duì)象是(

)A.氨基酸結(jié)構(gòu) B.蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)C.肽鏈結(jié)構(gòu) D.基因結(jié)構(gòu)解析:蛋白質(zhì)工程是指以蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)規(guī)律及其與生物功能的關(guān)系作為基礎(chǔ),通過基因修飾或基因合成,對(duì)現(xiàn)有蛋白質(zhì)進(jìn)行改造,或制造一種新的蛋白質(zhì),以滿足人類的生產(chǎn)和生活需求。因此,歸根到底,還是要對(duì)基因進(jìn)行改造。答案:D2.蛋白質(zhì)工程在設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)時(shí)依據(jù)的是(

)A.基因功能B.蛋白質(zhì)功能C.氨基酸序列D.mRNA密碼子序列解析:蛋白質(zhì)工程

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