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分子生物學(xué)復(fù)習(xí)資料名詞解釋體現(xiàn)型:是生物內(nèi)在遺傳因子的外在體現(xiàn),是生物的一整套顯而易見的遺傳性狀。基因型:是某畢生物個(gè)體所有基因組合的總稱。等位基因:基因以不一樣形式存在中心法則:核酸:是由眾多核苷酸聚合而成的多聚核苷酸,包括RNA和DNA?;締挝皇呛塑账幔河泻颂呛塑账岷兔撗鹾颂呛塑账?。核苷酸:是由含氮堿基、戊糖和磷酸三部分構(gòu)成。堿基:由嘌呤和嘧啶。RNA(G、A、U、C),DNA(G、A、T、C)核酸的一級(jí)構(gòu)造:是指構(gòu)成一種核酸分子的各個(gè)核苷酸構(gòu)造單元的排列次序。RNA的二級(jí)構(gòu)造:發(fā)夾構(gòu)造的形成原因:自我配對(duì),在不一樣區(qū)段的互補(bǔ)序列之間形成堿基配對(duì)正超螺旋:在一端使繩子向緊縮方向捻轉(zhuǎn)后,將繩子松弛使其處在自然狀態(tài),則會(huì)產(chǎn)生一種左旋的超螺旋以解除外加的捻轉(zhuǎn)導(dǎo)致的脅變,這樣的超螺旋叫做正超螺旋。(雙螺旋dna處在擰緊狀態(tài)時(shí)所形成的超螺旋)負(fù)超螺旋:在一端使繩子向松纏方向捻轉(zhuǎn)后,將繩子繩子兩端連接起來(lái),則會(huì)產(chǎn)生一種右旋的超螺旋以解除外加的捻轉(zhuǎn)導(dǎo)致的脅變,這樣的超螺旋叫做正超螺旋核酸的變性:在物理和化學(xué)原因的作用下,維系核酸二級(jí)構(gòu)造的氫鍵和堿基堆積力受到破壞,DNA由雙鏈解旋為單鏈的過(guò)程。增色效應(yīng):由于DNA變性引起的光吸取增長(zhǎng),也就是變性后DNA溶液的紫外吸取作用增強(qiáng)的效應(yīng)。核酸的溶解溫度(Tm):熱變性使DNA分子雙鏈解開二分之一所需的溫度稱為溶解溫度。(GC含量越高,Tm值越高。經(jīng)驗(yàn)公式:Tm=69.3+0.41*(G+C)%)核酸的復(fù)性:變性DNA在合適條件下,.分開的兩條互補(bǔ)單鏈還可以所有或部分重新形成雙螺旋DNA構(gòu)造的現(xiàn)象稱為復(fù)性(退火)核酸的分子雜交:運(yùn)用不一樣來(lái)源的核酸分子按照堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則形成穩(wěn)定的雜交雙鏈分子。(升溫變性,緩慢退火復(fù)性)基因組:細(xì)胞或者生物體所攜帶的一套完整的單倍體序列,包括全套基因和基因間區(qū)域?;颍夯瘜W(xué)本質(zhì)是DNA,是控制生物性狀的基本遺傳單位。移動(dòng)基因(轉(zhuǎn)座因子):細(xì)胞中能變化自身位置的一段脫氧核糖核酸(DNA)序列,能從染色體上的一種位置轉(zhuǎn)移到另一種位置,或者從質(zhì)粒轉(zhuǎn)移到染色體上斷裂基因:真核生物構(gòu)造基因,由若干個(gè)編碼序列和非編碼序列互相間隔開但又持續(xù)鑲嵌而成,清除非編碼序列再連接后,可翻譯出由持續(xù)氨基酸構(gòu)成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因(具有內(nèi)含子的基因)。在編碼序列中間插有與氨基酸編碼無(wú)關(guān)的DNA間隔區(qū),這些間隔區(qū)稱為內(nèi)含子;而編碼區(qū)稱為外顯子。假基因:具有與功能基因相似的序列,但由于有許多突變以致失去了合成有功能蛋白質(zhì),因此假基因是沒(méi)有功能的基因,常用ψ表達(dá)。重疊基因:具有獨(dú)立性但使用部分共同序列的基因構(gòu)造基因:是能決定某些多肽鏈(蛋白質(zhì))或酶分子一級(jí)構(gòu)造的基因。調(diào)控基因:是具有調(diào)整控制構(gòu)造基因體現(xiàn)功能的基因。是調(diào)整蛋白質(zhì)合成的基因。它能使構(gòu)造基因在需要某種酶時(shí)就合成某種酶,不需要時(shí),則停止合成,它對(duì)不一樣染色體上的構(gòu)造基因有調(diào)整作用。RNA基因:有的基因之轉(zhuǎn)錄不翻譯,如核糖體RNA基因和轉(zhuǎn)移RNA基因,產(chǎn)物分別是rRNA和tRNA開放閱讀框:是基因序列中的一段無(wú)終止序列打斷的堿基序列,可編碼對(duì)應(yīng)的蛋白。(是構(gòu)造基因的正常核苷酸序列,從起始密碼子到終止密碼子的閱讀框可編碼完整的多肽鏈,其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子)基因家族:真核細(xì)胞中,許多有關(guān)的基因常按功能成套組合(真核生物基因組中來(lái)源相似、構(gòu)造相似、功能有關(guān)的一組基因)基因簇:指基因家族中的各組員緊密成簇排列成大串的反復(fù)單位,位于染色體的特殊區(qū)域。散布的基因家族:家族組員在DNA上無(wú)明顯的物理聯(lián)絡(luò),甚至分散在多條染色體上。按序列相似度分:(1)經(jīng)典的基因家族,家族中個(gè)基因的所有序列或至少編碼序列具有高度的同源性; ①各組員間有高度的序列一致性,甚至完全相似; ②拷貝數(shù)高,常有幾十個(gè)甚至幾百個(gè)拷貝;③非轉(zhuǎn)錄的間隔區(qū)段并且一致。(4)超基因家族,家族中各基因序列間沒(méi)有同源性,不過(guò)基因產(chǎn)物的功能相似。反復(fù)序列:除了基因家族外,染色體上無(wú)轉(zhuǎn)錄活性的反復(fù)DNA序列家族,重要是基因以外的DNA序列。分類:①串聯(lián)反復(fù)DNA:成簇存在于染色體上的特定區(qū)域;②散布的反復(fù)DNA:反復(fù)單位并不成簇存在,而是分散于染色體的各個(gè)位點(diǎn)上,來(lái)源于 RNA介導(dǎo)的轉(zhuǎn)座作用。原核生物一般只有一種染色體即一種DNA分子。不過(guò)在不一樣生長(zhǎng)條件下,染色體分子也許有一種、兩個(gè)、甚至更多的拷貝。質(zhì)粒和噬菌體:質(zhì)粒是細(xì)菌染色體外的可以自主復(fù)制的DNA分子。(復(fù)制起點(diǎn)、標(biāo)識(shí)基因、多功能位點(diǎn))生物合成DNA的手段:①DNA的復(fù)制;②逆轉(zhuǎn)錄DNA復(fù)制的基本特性(9個(gè)):以原DNA母鏈模板,四種脫氧核苷三磷酸為前體,需要鎂離子,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,復(fù)制產(chǎn)生新子鏈。模板雙鏈DNA分子需要解鏈,暴露構(gòu)造內(nèi)的堿基序列,才能作為模板為半保留復(fù)制:N同位素培養(yǎng)法驗(yàn)證需要引物:與DNA轉(zhuǎn)錄和翻譯不一樣,DNA復(fù)制不能從頭合成,只能在先合成引物的3'-羥基上進(jìn)行延伸。作為引物一般長(zhǎng)度為6nt-15nt的短鏈RNA,少數(shù)為蛋白質(zhì)。復(fù)制方向總是5'→3'復(fù)制起始于特定的區(qū)域,但終止的位置一般不固定。復(fù)制起始區(qū):體內(nèi)的DNA復(fù)制具有相對(duì)固定的起點(diǎn),作為復(fù)制起始點(diǎn)的核苷酸序列。(原核只有一種,真核有多種)特點(diǎn):由多種短的反復(fù)序列構(gòu)成;富具有助于DNA雙螺旋的AT堿基對(duì);可以被特定的復(fù)制起始區(qū)結(jié)合蛋白識(shí)別。復(fù)制叉:DNA復(fù)制從起始區(qū)啟動(dòng),該區(qū)域的DNA發(fā)生解鏈,形成叉狀構(gòu)造的這種構(gòu)造形象一般為雙向復(fù)制:DNA復(fù)制起動(dòng)后,同步向兩個(gè)方向展開,進(jìn)行雙向復(fù)制,每個(gè)復(fù)制起始區(qū)形成2個(gè)復(fù)制叉。(少數(shù)DNA只進(jìn)行單向復(fù)制,也只有1個(gè)復(fù)制叉)半不持續(xù)性岡崎片段:在復(fù)制叉中不持續(xù)合成的DNA片段前導(dǎo)鏈:將持續(xù)合成的DNA子鏈后導(dǎo)鏈:不持續(xù)合成的DNA子鏈具有高度的忠實(shí)性:DNA復(fù)制出錯(cuò)機(jī)會(huì)小,忠實(shí)性明顯高于轉(zhuǎn)錄、反轉(zhuǎn)錄、RNA復(fù)制和翻譯DNA聚合酶(DNApol):以DNA為模板,催化DNA合成的聚合酶。(1)最初由A.Kornberg和BobLehman在E.coli中發(fā)現(xiàn)。(2)DNA聚合酶的共同特點(diǎn)是:①需要提供合成模板;②不能起始新的DNA鏈,必須要有引物提供3'-OH;③合成的方向都是 5'→3';④除聚合DNA外尚有其他功能。(3)所有原核和真核的DNA聚合酶都具有相似的合成活性,都可以在3'-OH上加核苷酸使鏈延伸(4)DNApolΙ由polA基因編碼,是一種多功能酶,除了具有5'→3'的聚合酶活性外,還具有5'-核酸 外切酶和3'-核酸外切酶的活性(5)DNApolⅡ:具有聚合酶的活性和3'-核酸外切酶的活性,但無(wú)5'-核酸外切酶活性(6)DNApolⅢ:含多種亞基,具有5'→3'的聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,且由不一樣亞基承擔(dān)亞基:是指具有四級(jí)構(gòu)造的蛋白質(zhì)分子中,由一條多肽鏈折疊成的三級(jí)構(gòu)造的球蛋白關(guān)鍵酶:由α、ε和θ亞基構(gòu)成的,具有單獨(dú)催化DNA復(fù)制作用二聚體:表達(dá)相似或同一種類的物質(zhì)單體,以成雙的型態(tài)出現(xiàn)及聚合態(tài)DNA解鏈酶:催化DNA雙鏈進(jìn)行解鏈過(guò)程的酶,由兩個(gè)亞基或六個(gè)亞基構(gòu)成的(環(huán)狀六聚體)單鏈結(jié)合蛋白:專門與DNA單鏈區(qū)域結(jié)合的蛋白質(zhì),自身無(wú)酶活性作用:①臨時(shí)維持DNA單鏈狀態(tài),防止雙鏈復(fù)性;②防止DNA單鏈區(qū)自發(fā)形成鏈內(nèi)二級(jí)構(gòu)造,消 除對(duì)聚合酶的影響;③包被DNA單鏈區(qū),防止核酸酶的水解;④刺激某些酶的活性DNA引起酶:一類特殊的催化RNA引物合成的RNA聚合酶。DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶:一類通過(guò)催化DNA鏈的斷裂、旋轉(zhuǎn)和再連接而直接變化DNA拓?fù)鋵W(xué)性質(zhì)的酶。作用:清除在染色體重塑、DNA復(fù)制、重組和轉(zhuǎn)錄過(guò)程中產(chǎn)生的正超螺旋,可以細(xì)調(diào)細(xì)胞內(nèi)DNA 的超螺旋程度,增進(jìn)DNA與蛋白質(zhì)的互相作用,防止胞內(nèi)DNA形成有害的過(guò)度超螺旋。DNA鏈接酶:參與DNA復(fù)制、修復(fù)和重組,是基因工程中的工具酶。復(fù)制過(guò)程:連接后鏈上相鄰的岡崎片段,是后隨鏈成為一條持續(xù)的鏈;修復(fù)和重組中:縫合在DNA鏈上產(chǎn)生的切口。端粒酶:也稱端粒末端轉(zhuǎn)移酶,是真核細(xì)胞特有的,位于一條染色體末端的特殊構(gòu)造,有蛋白質(zhì)和DNA構(gòu)成,維持染色體端粒構(gòu)造的完整性,防止染色體的降解和互相發(fā)生不正常的融合或重組。復(fù)制子:DNA復(fù)制的基本單位,任何一種復(fù)制子都具有一種復(fù)制起始區(qū),有些復(fù)制子還也許具有特定的終止區(qū)。(DNA復(fù)制:識(shí)別、起始、延伸、終止)DNA復(fù)制的高度忠實(shí)性(1)四種脫氧核苷三磷酸濃度的平衡(1)DNApol的自我校對(duì):有DNA自身具有的3'-核酸外切酶的活性來(lái)執(zhí)行錯(cuò)配修復(fù):是細(xì)胞最終一道“防線”專門修復(fù)復(fù)制中錯(cuò)配的核苷酸。使用RNA作為引物:似乎既耗能,又耗時(shí);DNA復(fù)制的極性也與忠實(shí)性有關(guān)逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA導(dǎo)致DNA損傷的原因與類型細(xì)胞內(nèi)因:(1)DNA構(gòu)造自身不穩(wěn)定;(2)DNA復(fù)制過(guò)程中自然發(fā)生錯(cuò)誤,重要是堿基互補(bǔ)配對(duì);(3)細(xì)胞內(nèi)活性氧帶來(lái)的破壞作用環(huán)境原因:化學(xué)(化學(xué)誘變劑:黃曲霉素、芥子氣、烷基化試劑...)與物理原因(紫外輻射和離子輻射)DNA損傷分為:(1)堿基損傷: ①堿基丟失,水分子攻打DNA分子上的糖苷鍵(鏈接堿基和核糖)引起,以嘌呤為主。危害:導(dǎo)致癌癥;②堿基轉(zhuǎn)換,具有氨基的堿基自發(fā)或在化學(xué)試劑(亞硝酸)的作用下發(fā)生脫氨基反應(yīng),A和C→I和U;③堿基修飾,某些化學(xué)試劑、生物試劑或ROS直接作用堿基導(dǎo)致,如:烷基化修飾鳥嘌呤→6-烷基鳥嘌呤;④堿基交聯(lián),紫外線導(dǎo)致DNA鏈上相鄰的嘧啶堿基,重要是T之間形成環(huán)丁烷嘧啶二聚體或6-4光產(chǎn)物;⑤堿基錯(cuò)配,4中脫氧核苷三磷酸濃度的失調(diào)、堿基的互變異構(gòu)或堿基之間的差異局限性以讓聚合酶對(duì)的辨別。DNA鏈的損傷①鏈的斷裂:離子輻射、化學(xué)試劑;②DNA鏈的交聯(lián):雙功能試劑的作用;③DNA與蛋白質(zhì)之間的交聯(lián):UV可以誘導(dǎo)DNA與結(jié)合在其上的蛋白質(zhì)形成共價(jià)交聯(lián)。DNA的修復(fù)機(jī)制(1)直接修復(fù):不需要將受損傷的堿基切除,直接將其逆轉(zhuǎn)為正常的堿基。(嘧啶二聚體、6-烷基鳥嘌呤)(2)切除修復(fù):先切除損傷的堿基或核苷酸,后重新組合成正常的核苷酸,再經(jīng)連接酶重新連接,經(jīng)歷識(shí)別、切除、重新合成合重新連接四個(gè)過(guò)程。堿基切除修復(fù)和核苷酸切除修復(fù)(怎樣識(shí)別損傷)堿基切除修復(fù)BER:直接識(shí)別詳細(xì)的受損傷的堿基,識(shí)別的標(biāo)識(shí)是受損傷堿基的化學(xué)變化核苷酸切除修復(fù)NER:識(shí)別損傷對(duì)DNA雙螺旋構(gòu)造導(dǎo)致的扭曲。DNA糖苷酶:具有修復(fù)較輕的堿基損傷,并具催化切除功能的酶。所有的DNA糖苷酶都是沿著雙螺旋的小溝掃描DNA,發(fā)現(xiàn)受損傷的堿基后即與DNA結(jié)合,并誘導(dǎo)DNA構(gòu)造發(fā)生歪曲,使損傷堿基被擠出雙螺旋進(jìn)入DNA糖苷酶的活性中心進(jìn)行切割。AP內(nèi)切酶:剪切掉DNA5'端脫嘌呤和脫嘧啶位點(diǎn)的蛋白質(zhì)酶。(作用位點(diǎn):DNA分子經(jīng)DNA核苷酶作用產(chǎn)生的無(wú)嘌呤或無(wú)嘧啶位點(diǎn))(3)雙鍵斷裂修復(fù)(DSBR):①同源重組:通過(guò)同源重組從同源染色體中獲得合適的修復(fù)斷裂的信息,精確度較高;②非同源末端連接(NHEJ):能在無(wú)序列同源的狀況下,讓斷裂的末端重新連接起來(lái),精確性低,不過(guò)人類修復(fù)雙鏈斷裂的重要方式。(4)易錯(cuò)修復(fù):由高水平的DNA損傷引起的多種基因的協(xié)同誘導(dǎo)作用重組修復(fù)(損傷跨越):在DNA進(jìn)行復(fù)制時(shí),由于該損傷部位不能成為模板,不能合成互補(bǔ)的DNA鏈,因此產(chǎn)生缺口,而從本來(lái)DNA的對(duì)應(yīng)部位切出對(duì)應(yīng)的部分將缺口填滿,從而產(chǎn)生完整無(wú)損的子代DNA的這種修復(fù)現(xiàn)象。重組跨越:運(yùn)用同源重組的措施將DNA模板進(jìn)行互換以克服損傷對(duì)復(fù)制的障礙。跨越合成:有特殊的DNApol取代停留在損傷位點(diǎn)上的催化復(fù)制的DNApol,在在子鏈上隨機(jī)插入核苷酸,以實(shí)現(xiàn)對(duì)損傷位點(diǎn)無(wú)錯(cuò)或易錯(cuò)的跨越。SOS反應(yīng):指細(xì)胞在受到潛在致死性壓力之后,作出的有助于細(xì)胞生存、但以突變?yōu)榇鷥r(jià)的代謝預(yù)警反應(yīng)。DNA的突變突變:發(fā)生在DNA分子上的可遺傳的永久性構(gòu)造變化突變體:帶有一種給定突變的基因、基因組、細(xì)胞或個(gè)體。DNA突變的本質(zhì)就是堿基序列上發(fā)生的任何變化。根據(jù)堿基的變化方式分為:點(diǎn)突變、移碼突變。點(diǎn)突變:也稱簡(jiǎn)樸突變或單一突變,其最重要的形式為堿基對(duì)置換,專指DNA分子單一位點(diǎn)上所發(fā)生的堿基對(duì)變化,堿基替代又分為轉(zhuǎn)換和顛換兩類。點(diǎn)突變具有很高的答復(fù)突變率。點(diǎn)突變?nèi)N不一樣成果:沉默突變TGT→TGCCys→Cys;錯(cuò)義突變TGT→TGGCys→Trp;無(wú)義突變TGT→TGACys→終止移碼突變:又稱移框突變,指蛋白質(zhì)基因的編碼區(qū)發(fā)生的一種或多種核苷酸(非3的整數(shù)倍)的缺失或插入。突變將會(huì)導(dǎo)致翻譯的閱讀框發(fā)生變化,致使插入點(diǎn)或缺失點(diǎn)下游的氨基酸序列發(fā)生主線性的變化,也許導(dǎo)致提前引入終止密碼子使多肽鏈被截?cái)?。(隱性突變體現(xiàn)為蛋白質(zhì)沒(méi)有活性和和顯性突變)突變?cè)簩?dǎo)致DNA突變的內(nèi)在、外原因總稱自發(fā)突變:內(nèi)在原因引起的突變。(自發(fā)點(diǎn)突變、自發(fā)脫氨基、堿基的烷基化、活性氧類ROS的氧化,對(duì)堿基導(dǎo)致的損傷可以變化堿基的配對(duì)性質(zhì),鳥嘌呤的產(chǎn)物——8-氧鳥嘌呤與A配對(duì),導(dǎo)致G:C堿基對(duì)到T:A堿基對(duì)的顛倒)誘發(fā)突變:外在原因引起的突變,堿基類似物、烷基化試劑、脫氨基試劑、羥胺正向突變:指變化了野生型形狀的突變(由原始的野生型基因變異為突變型基因的過(guò)程)答復(fù)突變:突變基因再次發(fā)生突變又恢復(fù)本來(lái)的基因。DNA重組:指DNA分子內(nèi)或分子間核苷酸序列發(fā)生的互換、重排和我轉(zhuǎn)移過(guò)程。包括同源重組、特異位點(diǎn)重組和轉(zhuǎn)座重組等類型。同源重組:指發(fā)生在非姐妹染色單體(sisterchromatin)之間或同一染色體上具有同源序列的DNA分子之間或分子之內(nèi)的重新組合。由于同源重組嚴(yán)格依賴分子之間的同源性,不依賴于序列的特異性。發(fā)生同源重組必須條件:(1)進(jìn)行重組的互換區(qū)域有完全相似或幾乎相似的核苷酸序列;(2)兩個(gè)雙鏈DNA分子之間需要互相靠近,并發(fā)生互補(bǔ)配對(duì);(3)需要特定的重組酶的催化,重組酶對(duì)堿基無(wú)特異性;(4)形成異源雙鏈;(50)發(fā)生聯(lián)會(huì)。位點(diǎn)特異性重組:發(fā)生在DNA特異性位點(diǎn)上的重組。需要專門的蛋白質(zhì)識(shí)別和結(jié)合。(可以發(fā)生在2個(gè)DNA分子之間:整合或基因反復(fù);也可以發(fā)生在1個(gè)DNA分子內(nèi)部:缺失或倒位)位點(diǎn)特異性重組的功能:(1)調(diào)整噬菌體DNA與宿主菌染色體DNA的整合;(2)調(diào)整特定基因的體現(xiàn);(3)調(diào)整胚胎發(fā)育期間程序性的DNA重排。轉(zhuǎn)座重組:指DNA上的核苷酸序列從一種位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一種位點(diǎn)的現(xiàn)象。轉(zhuǎn)座的機(jī)制依賴DNA的交錯(cuò)剪切和復(fù)制,但不依賴于同源序列。轉(zhuǎn)座波及轉(zhuǎn)座酶,解離酶和DNA聚合酶,共分為復(fù)制型、非復(fù)制及保守型三種類型。轉(zhuǎn)座的過(guò)程中會(huì)形成共合體。兩個(gè)轉(zhuǎn)座因子之間的重組會(huì)引起缺失和倒位。轉(zhuǎn)座子:基因組中一段可移動(dòng)的DNA序列,可以通過(guò)切割、重新整合等一系列過(guò)程從基因組的一種位置“跳躍”到另一種位置。存在于染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位。復(fù)制型DNA轉(zhuǎn)座子:轉(zhuǎn)座因子在轉(zhuǎn)座期間先復(fù)制一份拷貝,而后拷貝轉(zhuǎn)座到新的位置,在原先的位置上仍然保留本來(lái)的轉(zhuǎn)座因子。保留型DNA轉(zhuǎn)座子:轉(zhuǎn)座因子直接從本來(lái)位置上轉(zhuǎn)座插入新的位置,并留在插入位置上,成果是在本來(lái)的位置上丟失了轉(zhuǎn)座因子。自主型轉(zhuǎn)座子:具有開放的閱讀框架,編碼轉(zhuǎn)座所需的酶或蛋白質(zhì),能獨(dú)立進(jìn)行轉(zhuǎn)座。非自主型轉(zhuǎn)座子:編碼能力局限性,不能獨(dú)立進(jìn)行轉(zhuǎn)座,但保留了轉(zhuǎn)座所必需的順式序列。(在自主型轉(zhuǎn)座子編碼的轉(zhuǎn)座酶的作用下,可以進(jìn)行轉(zhuǎn)座)基因體現(xiàn):轉(zhuǎn)錄和翻譯的總稱。轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA的過(guò)程;翻譯:以RNA為模板合成蛋白質(zhì)的過(guò)程。轉(zhuǎn)錄的一般特性:(1)轉(zhuǎn)錄發(fā)生在DNA分子上某些特定區(qū)域(具有轉(zhuǎn)錄活性的區(qū)域),也就是說(shuō)不是所有區(qū)域都能被轉(zhuǎn)錄,雖然能轉(zhuǎn)錄也不是每時(shí)每刻都在轉(zhuǎn)錄。DNA分子上作為模板的那條鏈稱為模板鏈(無(wú)意義鏈);與模板鏈互補(bǔ)的鏈稱為編碼鏈(故意義鏈)。(2)以四種核苷三磷酸(ATP、GTP、CTP、UTP)為底物,并需要Mg離子的激活;(3)需要模板,需要DNA的解鏈,但不需要引物;(4)第一種被轉(zhuǎn)錄的核苷酸一般是嘌呤核苷酸(占90%左右)(5)與DNA復(fù)制同樣,轉(zhuǎn)錄的方向總是5'→3';(6)轉(zhuǎn)錄具有高度的忠實(shí)性,指一種特定的基因轉(zhuǎn)錄具有固定的起點(diǎn)和固定的終點(diǎn)嚴(yán)格遵守堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)則。轉(zhuǎn)錄忠實(shí)性低于DNA復(fù)制,重要原因是RNApol缺乏3'核酸外切酶活性。(7)轉(zhuǎn)錄是受到嚴(yán)風(fēng)格控,調(diào)控的位點(diǎn)重要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄的其實(shí)階段。轉(zhuǎn)錄是一種很復(fù)雜的酶促反應(yīng),重要由RNA聚合酶催化。RNA聚合酶全名:依賴于DNA的RNA聚合酶,具有高度保守,尤其在三維構(gòu)造上。所有的多亞基RNApol都具有5個(gè)關(guān)鍵亞基,真細(xì)菌還具有一種識(shí)別啟動(dòng)子的σ因子,真核細(xì)胞的三種細(xì)胞核RNApol除具有5個(gè)關(guān)鍵亞基外,尚有5個(gè)共同的亞基。盡管RNApol與DNApol都是以DNA為模板,從5'→3'方向催化多聚核苷酸的合成,不過(guò)其區(qū)別如下:(1)RNApol只有5'→3'的聚合酶活性,沒(méi)有5'→3'核酸外切酶和3'→5'核酸外切酶的活性。從而導(dǎo)致喪失自我校對(duì)的能力而減少轉(zhuǎn)錄的忠實(shí)性。(2)真細(xì)菌的RNApol具有解鏈酶的活性,自身可以增進(jìn)DNA雙鏈解鏈;(3)RNApol能直接催化RNA的從頭合成,不需要引物;(4)RNApol的底物是核苷三磷酸,而不是脫氧核苷三磷酸;(5)RNApol使用UTP替代dTTP;(6)RNApol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄需要識(shí)別啟動(dòng)子。(7)RNApol在轉(zhuǎn)錄的起始階段收到多種調(diào)整蛋白的調(diào)整。轉(zhuǎn)錄也劃分為識(shí)別、(起始)結(jié)合、延伸、終止啟動(dòng)子(是識(shí)別位點(diǎn)):是基因轉(zhuǎn)錄精確和特異性啟動(dòng)所必需的DNA序列。在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游存在啟動(dòng)子序列,具有高度的保守性。作為標(biāo)識(shí),可以被RNApol直接或間接識(shí)別,并從特定的位點(diǎn)啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄。原核轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)RNApol全酶能直接識(shí)別啟動(dòng)子并與之結(jié)合,真核轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)RNApol不能能直接識(shí)別啟動(dòng)子,而是需要特殊的轉(zhuǎn)錄因子。強(qiáng)啟動(dòng)子:一種基因的啟動(dòng)子序列與一致序列越相近,該啟動(dòng)子的啟動(dòng)效率就越高。(是對(duì)轉(zhuǎn)錄酶有較高的親和力,可高效啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)子,能指導(dǎo)合成大量的mRNA)弱啟動(dòng)子:一種基因的啟動(dòng)子序列與上面的一致序列相差越大,該啟動(dòng)子的啟動(dòng)效率就越低。無(wú)效合成:開放復(fù)合物內(nèi)的RNApol反復(fù)催化短RNA分子的合成并釋放這樣的合成。轉(zhuǎn)錄的終止:依賴于ρ因子(同源六聚體蛋白)的蛋白質(zhì)因子;不需要ρ因子,需要RNA轉(zhuǎn)錄物3'-端的終止子的序列。不需要ρ因子的終止機(jī)制(簡(jiǎn)樸終止)特性:一是依賴于位于RNA轉(zhuǎn)錄物3'-端的一串U序列;二是需要位于緊靠U序列上游的一種富含GC堿基對(duì)的發(fā)夾構(gòu)造。(試驗(yàn)證明,但凡影響到富含GC莖穩(wěn)定的突變與變化dA:rU雜交長(zhǎng)度的突變就會(huì)影響到終止子的效率。)三種重要的RNA:mRNA、rRNA、tRNA在真核細(xì)胞核原核細(xì)胞中所經(jīng)歷的后加工反應(yīng)并不而完全相似,并且同一種RNA前體(一般是mRNA前體)也也許有不相似的加工路線。細(xì)胞內(nèi),由RNA聚合酶合成的原初轉(zhuǎn)錄物轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓腞NA分子所需的一系列變化,該過(guò)程稱為轉(zhuǎn)錄后加工。初級(jí)轉(zhuǎn)錄物:基因轉(zhuǎn)錄的直接產(chǎn)物。原核細(xì)胞RNA前體的后加工:mRNA前體的后加工(很少經(jīng)歷后加工)、rRNA前體的后加工(剪切和修剪、核苷酸的修飾)、tRNA前體的后加工(剪切和修剪、核苷酸的修飾)。原核細(xì)胞RNA前體的后加工:mRNA前體的后加工、rRNA前體的后加工、tRNA前體的后加工mRNA前體的后加工:5'-端“加帽”、3'-端“加尾”、內(nèi)部甲基化、拼接和編輯(1)5'-端“加帽”(0型(m7GpppN1pN2p)、1型(m7GpppmN1pN2p)、2型(m7GpppmN1pmN2p)):加上7-甲基鳥嘌呤帽子的功能:①有助于某些mRNA前體的對(duì)的拼接;②有助于成熟mRNA轉(zhuǎn)運(yùn)出細(xì)胞核;③保護(hù)mRNA,防止核酸酶的降解;④增強(qiáng)mRNA的可翻譯性。(2)3'-端“加尾”:尾巴本質(zhì)是一段多聚腺苷酸序列(polyA),位于絕大多數(shù)真核細(xì)胞核mRNA的3'-端,約由250個(gè)左右的腺苷酸構(gòu)成。polyA尾巴不存在于mRNA的編碼鏈上,也并無(wú)對(duì)應(yīng)的polyA序列,是在轉(zhuǎn)錄后添加上去的。順式元件(內(nèi)因):位于mRNA前體內(nèi)部的特殊核苷酸序列,充當(dāng)加尾信號(hào)。反式元件(外因):是與順式元件互相作用的蛋白質(zhì)或催化加尾反應(yīng)的酶。尾巴的功能:①提高mRNA的穩(wěn)定性;②增強(qiáng)mRNA的可翻譯性,提高mRNA翻譯的效率;③影響最終一種內(nèi)含子的切除;④某些的先天缺乏終止密碼子的mRNA通過(guò)加尾反應(yīng)發(fā)明終止密碼子UGA(在UG序列后加尾產(chǎn)生)或UAA(在UA序列后加尾產(chǎn)生);⑤通過(guò)選擇性加尾調(diào)整基因的體現(xiàn)。內(nèi)部甲基化:重要是指mRNA分子內(nèi)部的某些腺嘌呤堿基C6被甲基化修飾。發(fā)生在內(nèi)含子上,也發(fā)生在外顯子上,占總腺苷酸的0.1%。拼接:編輯:蛋白質(zhì)的生物合成:翻譯參與蛋白質(zhì)生物合成的重要的成分的有核糖體、mRNA、多種氨酰-tRNA、氨酰-tRNA合成酶和若干輔助性蛋白質(zhì)因子。核糖體:是催化氨基酸之間形成肽鍵的分子機(jī)器,在翻譯過(guò)程,與mRNA、可逆結(jié)合,按照mRNA的指令,合成具有特定一級(jí)構(gòu)造的多肽鏈。原生物只有一種核糖體,真生物有諸多核糖體(細(xì)胞質(zhì)、線粒體、葉綠體)。任何核糖體,在化學(xué)構(gòu)成上都很相似,都由幾種rRNA和幾十種蛋白質(zhì)構(gòu)成,具有大小兩個(gè)亞基。小亞基:細(xì)菌細(xì)胞質(zhì)核糖體沉降系數(shù)30S,rRNA為16S,21種蛋白質(zhì);真核生物細(xì)胞質(zhì)核糖體沉降系數(shù)40S,rRNA為18S,33中蛋白質(zhì),兩者都只含1個(gè)單一的rRNA。大亞基:E.coli的沉降系數(shù)為50S,34種蛋白質(zhì),2種rRNA(5S、23S);真核生物為60S,50種蛋白質(zhì),3種rRNA。原核生物16SrRNA的3'-端具有的反SD序列可以與mRNA5'-端的SD序列互補(bǔ)配對(duì),這對(duì)mRNA識(shí)別核糖體上的對(duì)的定位和閱讀框內(nèi)起始密碼子有著重要作用。反SD序列:SD序列:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。SD序列在細(xì)菌mRNA起始密碼子AUG上游7-12個(gè)核苷酸處,有一段富含嘌呤的堿基序列,能與細(xì)菌16SrRNA3’端識(shí)別,協(xié)助從起始AUG處開始翻譯。核糖體的三維構(gòu)造及其功能:(1)A部位(Asite),即氨酰tRNA結(jié)合部位,也稱受體部位(2)P部位(Psite),即肽酰tRNA結(jié)合部位,也稱供體部位(3)E部位(Esite),即空載tRNA在離開核糖體之前與核糖體臨時(shí)結(jié)合部位。(4)肽酰轉(zhuǎn)移酶活性部位,該部位負(fù)責(zé)催化肽鍵的形成(5)mRNA的結(jié)合部位(6)多肽鍵離開通道(7)某些可溶性蛋白質(zhì)因子(起始因子、延伸因子、終止因子)的結(jié)合部位同工受體:攜帶同一種氨基酸的幾種不一樣tRNA分子mRNA是翻譯的模板,由它懂得蛋白質(zhì)的合成。內(nèi)部至少具有一種有起始密碼子開始、一終止密碼子結(jié)束的一段持續(xù)的核苷酸序列構(gòu)成的開放閱讀框。tRNA在翻譯中的功能:(1)將氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)到核糖體上;(2)通過(guò)反密碼子與mRNA上的密碼子之間的互相作用對(duì)遺傳密碼進(jìn)行解碼,將其最終轉(zhuǎn)化成多肽鏈上的氨基酸序列。tRNA的二級(jí)構(gòu)造:三葉草構(gòu)造;三級(jí)構(gòu)造:呈胖的倒L型。氨酰tRNA合成酶:氨基酸在參入多肽鏈之前必須被活化,氨酰tRNA是它的活化形式。輔助因子:在翻譯某一階段與核糖體臨時(shí)結(jié)合。起始因子(IF參與肽鏈合成起始)、延伸因子(EF參與肽鏈延伸)、釋放因子(RF參與多肽鏈的釋放)、核糖體循環(huán)因子(RRF增進(jìn)核糖體循環(huán))翻譯的四個(gè)階段:翻譯具有極性、三聯(lián)一體密碼、反密碼子決定特異性、擺動(dòng)規(guī)則(1)翻譯具有極性:閱讀模板時(shí)的方向性(翻譯時(shí)閱讀mRNA的方向都是從5'→3');多肽鏈延伸的方向總是從N-端→C-端(2)三聯(lián)體密碼(簡(jiǎn)樸性):由3個(gè)核苷酸決定1種氨基酸的編碼形式遺傳密碼的重要性質(zhì):(1)簡(jiǎn)并性與兼職;(2)遺傳密碼是明確的,而不是模糊的(一種指編碼一種氨基酸);(3)密碼子的選定不是隨機(jī)的,代表相似或相似氨基酸的密碼子在序列上傾向于相似;(4)通用性和例外;(5)不重疊性;(6)無(wú)標(biāo)點(diǎn);反密碼子決定特異性:肽鏈延伸過(guò)程中對(duì)的的氨基酸的參入取決于密碼子與反密碼子之間的互相作用,與tRNA所攜帶的氨基酸無(wú)關(guān)。擺動(dòng)規(guī)則:容許某些反密碼子不止識(shí)別一種密碼子。擺動(dòng)規(guī)則的意義:在于翻譯時(shí),tRNA和mRNA由于有一對(duì)堿基不是嚴(yán)格配對(duì),氫鍵較弱而更輕易分離,從而加緊翻譯的速度。翻譯的詳細(xì)機(jī)制:氨基酸的活化(識(shí)別SD序列與識(shí)別mRNA上的反SD序列)、起始、延伸、終止和釋放及折疊與后加工。翻譯的起始:是整個(gè)翻譯過(guò)程的限速環(huán)節(jié)。分為:起始密碼子的識(shí)別、起始復(fù)合物的形成。翻譯延伸:當(dāng)起始復(fù)合物形成后,進(jìn)入延伸階段。多次發(fā)生由進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽和移位反應(yīng)構(gòu)成循環(huán)。翻譯后加工的重要方式:多肽鏈的修剪、剪切或拼接、N-端添加氨基酸、氨基酸殘基的修飾(磷酸化、乙?;⒓谆?、羧基化、羥基化、糖基化...)、二硫鍵的形成、添加膚質(zhì)因子(金屬離子、輔酶或輔基)、多肽鏈的折疊和四級(jí)構(gòu)造的形成。磷酸化:由蛋白質(zhì)激酶催化,重要發(fā)生在Ser、Thr、Tyr這三種羥基氨基酸上,被修飾的氨基酸重要是His。反應(yīng)是可逆的激酶:是一類從高能供體分子(如ATP)轉(zhuǎn)移磷酸基團(tuán)到特定靶分子(底物)的酶蛋白質(zhì)的一級(jí)構(gòu)造決定其高級(jí)構(gòu)造。分子伴侶:一類能協(xié)助其他蛋白質(zhì)進(jìn)行對(duì)的組裝、折疊、轉(zhuǎn)運(yùn)、介導(dǎo)錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)進(jìn)行降解的蛋白。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)折疊時(shí),它們能保護(hù)蛋白質(zhì)分子免受其他蛋白質(zhì)的干擾。不構(gòu)成這些蛋白質(zhì)構(gòu)造執(zhí)行功能時(shí)的組份。是胞內(nèi)蛋白折疊、組裝與轉(zhuǎn)運(yùn)的協(xié)助蛋白。分子伴侶的功能:(1)防止新生肽鏈錯(cuò)誤的折疊和聚合;(2)協(xié)助或增進(jìn)這些肽鏈迅速的折疊成對(duì)的的三維構(gòu)象,成為具有完整構(gòu)造和功能的多肽和蛋白質(zhì)。四級(jí)構(gòu)造的形成(亞基):自組裝過(guò)程,需要分子伴侶的協(xié)助,臨時(shí)與亞基結(jié)合沒(méi)保護(hù)亞基的疏水表面防止它們匯集,直到各亞基接觸。蛋白質(zhì)翻譯后的定向和分揀:蛋白質(zhì)合成后來(lái)所經(jīng)歷的這種,如組蛋白進(jìn)入細(xì)胞核、細(xì)胞色素c進(jìn)入線粒體、蛋白類激素被分泌但細(xì)胞外等轉(zhuǎn)移和定位的過(guò)程。信號(hào)肽:是一段在一級(jí)構(gòu)造上持續(xù)的氨基酸序列,一般有15~60個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成,它們有的N末端,有的在C末端、有的在多肽鏈的內(nèi)部。引導(dǎo)蛋白質(zhì)從細(xì)胞液進(jìn)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、胞外、細(xì)胞核、線粒體、葉綠體和過(guò)氧化物酶體的分揀信號(hào)屬于信號(hào)肽序列。蛋白質(zhì)不止一種信號(hào)序列。信號(hào)肽序列在分揀完畢后被信號(hào)肽酶切除。信號(hào)斑:存在于已折疊的蛋白質(zhì)中,是蛋白質(zhì)完畢折疊后來(lái),在其表面形成的有來(lái)自不一樣區(qū)域的氨基酸序列組合在一起的三維分揀信號(hào)。翻譯后路過(guò):通過(guò)翻譯后路過(guò)進(jìn)行定向、分揀的蛋白質(zhì)由細(xì)胞核基因編碼、定位于線粒體、質(zhì)體、細(xì)胞核和過(guò)氧化物酶體等細(xì)胞器。生物體內(nèi)的基因根據(jù)體現(xiàn)的狀況分為兩類:(1)管家基因;(2)奢侈基因管家基因:指所有細(xì)胞中均要體現(xiàn)的一類基因,其產(chǎn)物是對(duì)維持細(xì)胞基本生命活動(dòng)所必需的,維持細(xì)胞生存不可缺乏的,一直體現(xiàn),體現(xiàn)量相對(duì)恒定。奢侈基因:只是在特定的時(shí)段里或者在需要的時(shí)候才體現(xiàn)。基因體現(xiàn)的多種水平調(diào)控:DNA水平、轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后加工水平、翻譯水平、翻譯后加工水平。根據(jù)調(diào)控的效果分,基因體現(xiàn)的調(diào)控模式有:(1)正調(diào)控;(2)負(fù)調(diào)控正調(diào)控:在沒(méi)有調(diào)整蛋白會(huì)者調(diào)整蛋白失活的狀況下,基因不體現(xiàn)或體現(xiàn)量局限性。一旦存在調(diào)整蛋白或者調(diào)整蛋白被激活,基因則才能體現(xiàn)或大量體現(xiàn)。激活蛋白:在基因體現(xiàn)調(diào)控過(guò)程中,某一特定的調(diào)整蛋白被激活,而使基因體現(xiàn)的酶。調(diào)整基因與操縱基因結(jié)合后能增強(qiáng)或啟動(dòng)其所調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)整蛋白負(fù)調(diào)控:在沒(méi)有調(diào)整蛋白會(huì)者調(diào)整蛋白失活的狀況下,基因正常體現(xiàn)。一旦存在調(diào)整蛋白或者調(diào)整蛋白被激活,基因則不體現(xiàn),即基因體現(xiàn)受到阻遏。阻遏蛋白:基于某種調(diào)整基因所生成的一種控制蛋白質(zhì),在原核生物中具有克制特定基因(群)產(chǎn)生特性蛋白質(zhì)的作用。調(diào)整基因與操縱基因結(jié)合后能減弱或制止其所調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)整蛋白別構(gòu)蛋白:是指除了具有結(jié)合底物的活性部位,還具有結(jié)合調(diào)整物別構(gòu)部位的一種調(diào)整蛋白質(zhì)。別構(gòu)蛋白的活性部位和別構(gòu)部位可以分屬不一樣的亞基(活性亞基和調(diào)整亞基),活性部位之間以及活性部位與調(diào)整部位之間通過(guò)蛋白質(zhì)構(gòu)象的變化而互相作用。別構(gòu)效應(yīng)物:細(xì)胞中某些特定的物質(zhì)能與別構(gòu)蛋白結(jié)合,使調(diào)整蛋白的構(gòu)象發(fā)生變化,從而變化別構(gòu)蛋白與操縱基因的結(jié)合活性,影響到基因轉(zhuǎn)錄的活性,這些特定物統(tǒng)稱為別構(gòu)效應(yīng)物。(不直接波及蛋白質(zhì)活性的物質(zhì),結(jié)合于蛋白質(zhì)活性部位以外的其他部位(別構(gòu)部位),引起蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象變化,而導(dǎo)致蛋白質(zhì)活性變化的現(xiàn)象。)操縱子:是原核生物基因體現(xiàn)和調(diào)控最重要的形式,原核生物基因多數(shù)以操縱子的形式構(gòu)成基因體現(xiàn)調(diào)控的單元。構(gòu)成操縱子的最基本元件:?jiǎn)?dòng)子、操縱基因、構(gòu)造基因、有關(guān)的調(diào)整基因啟動(dòng)子:是能被RNApol識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。(一種操縱子只有一種啟動(dòng)子,并位于構(gòu)造基因上

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