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![基因工程知識點(diǎn)_第4頁](http://file4.renrendoc.com/view/e6389f0f1664ea0c1892fa9feb160a23/e6389f0f1664ea0c1892fa9feb160a234.gif)
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文檔簡介
名詞說明
1.基因工程:是將目的基因或DNA片段與適合的載體連接轉(zhuǎn)入目標(biāo)生物細(xì)胞,通過復(fù)制、轉(zhuǎn)
錄、翻譯外源目的基因和蛋白質(zhì)的活性表達(dá),使轉(zhuǎn)基因生物取得新的遺傳性狀的操作。
2”艮制性內(nèi)切核酸酶:能夠識別雙鏈核A分子中的某一段特東核昔酸序列,并在此切割DNA
雙鏈的內(nèi)切核酸酶。
3.同切點(diǎn)酶:又稱同裂酶,是一類來源于不同微生物、能識別相同DNA序列的限制性內(nèi)切核
酸酶。
4.同尾酶:是一類限制性內(nèi)切核酸酶,它們來源各異,識別的靶序列也各不相同,但切割后
能產(chǎn)生相同的黏性結(jié)尾。
5.酶的星號活性(Staractivity):高濃度的酶、高濃度的甘油、低離子強(qiáng)度、極端pH值
等,會使一些核酸內(nèi)切酶的識別和切割序列發(fā)生低特異性,即所謂的酶的星號活性現(xiàn)象。
連接酶:是能催化雙鏈DNA片段靠在一路的3'羥基結(jié)尾與5'端磷酸基團(tuán)結(jié)尾之間通過形
成磷酸二酯鍵,使兩結(jié)尾連接的一種核酸酶。
7.載體:在基因克隆中能攜帶外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞復(fù)制、整合或表達(dá)的工具稱為載體。
8.多克隆位點(diǎn):是包括多種同一個限制性醐切點(diǎn)的一段很短的
9.a互補(bǔ):為質(zhì)粒DNA編碼B一半乳糖昔酶的a亞基,宿主細(xì)胞可編碼B亞基盡管宿主和質(zhì)
粒編碼的片段各自都沒有酶活性,但它們能夠融為一體,形成具有酶學(xué)活性的蛋白質(zhì),這種
互補(bǔ)現(xiàn)象叫a互補(bǔ)。
10.黏粒載體(考斯質(zhì)粒載體):是一類人工構(gòu)建的含有膜DNAcos序列和質(zhì)粒復(fù)制子的特殊
類型的載體。
11.質(zhì)粒:是生物細(xì)胞內(nèi)固有的、能獨(dú)立于寄主染色體而自主復(fù)制、并被穩(wěn)固遺傳的一類核
酸分子
12.探針:當(dāng)用一個標(biāo)記的核酸分子與核酸樣品雜交,即可查明該樣品中是不是存在與該標(biāo)記
核酸分子具有同源性的核酸分子。那個標(biāo)記的核酸分子稱為探針(probe),能夠是DNA,也
能夠是RNA,或合成的寡核甘酸.
13、SD序列:是存在于原核生物起始密碼子上游7-12個核甘酸內(nèi)的一種4-7個核甘酸的保
守片段,它與16SrRNA3,端反向互補(bǔ),因此可將mRNA的AUG起始密碼子置于核糖體的
適當(dāng)位置以便起始翻譯作用。
14、包括體:目的蛋白子啊細(xì)胞質(zhì)的還原性環(huán)境中,以不溶性的形式產(chǎn)生并聚集形成蛋白質(zhì)
聚合物即為包括體。
簡答:
1.阻礙限制性核酸內(nèi)切酶活性的因素
答:1)DNA的純度
2)DNA的甲基化程度
3)消化反映的緩沖液系統(tǒng)
4)DNA的分子結(jié)構(gòu)
5)酶的純度
6)酶切反映的溫度
7)酶的星號活性
2.大腸桿菌DNA聚合酶I與klenow片段的比較
答:1)結(jié)構(gòu)上的區(qū)別:Klenow片段是完整DNA聚合酶I的一個片段,是用途理大腸桿菌
DNA聚合酶I時,取得的兩個片段中分子量較大的一個,具有5'-3'聚合酶活性和3'T5'
的外切酶活性,不含5'T3'外切酶活性。
2)功能上的區(qū)別:可通過DNA的方式制備。而klenow酶要緊用于缺口平移標(biāo)記DNA,
也用于DNA的缺口補(bǔ)平和延伸。還在頂用于第二條鏈的合成。
3.載體的大體條件
答:1).具有針對受體細(xì)胞的親緣性或親和性(可轉(zhuǎn)移性),能夠攜帶外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞;
2)能在宿主細(xì)胞中自主復(fù)制,并實(shí)現(xiàn)外源基因的增殖;
3).具有多種單一的限制性核酸內(nèi)切酶識別切割位點(diǎn);
4).具有較高的外源DNA的載裝能力;
5).具有適合的挑選標(biāo)記。
4.質(zhì)粒的大體性質(zhì)
答:(1)自主復(fù)制。質(zhì)粒DNA上都含有一個復(fù)制起始區(qū),操縱著質(zhì)粒在宿主細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制,
這一復(fù)制起始區(qū)稱為‘復(fù)制子"。一樣一個質(zhì)粒DNA分子上只含有一個復(fù)制子。按復(fù)制能力
可將質(zhì)粒分為嚴(yán)緊型和松弛型兩類。
(2)不相容性:在沒有選擇壓力的情形下,兩種親緣關(guān)系緊密的不同質(zhì)粒,不能夠在同
一寄主細(xì)胞系中穩(wěn)固地共存的現(xiàn)象,又稱為不親和性。如此的兩種質(zhì)粒稱為不親和質(zhì)粒。
(3)轉(zhuǎn)移性:能在自然條件下自發(fā)地從一個細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個細(xì)胞(接合作用)的質(zhì)粒
稱為接合型質(zhì)粒;不能在自然條件下獨(dú)立地發(fā)生接合作用的質(zhì)粒稱為非接合型質(zhì)粒。
(4)編碼性狀:野生型的質(zhì)粒DNA上往往攜帶一個或多個遺傳標(biāo)記基因,這使得寄主
生物產(chǎn)生正常生長非必需的附加性狀。
五、Southern雜交(DNA)步驟:
答:①DNA的片段化及其電泳分離;
②凝膠電泳后的變性處置;
③轉(zhuǎn)移并固定到濾膜上;
④雜交;
⑤檢測與分析
六、基因組文庫與cDNA文庫的區(qū)別
基因組文庫:基因組文庫簡稱基因文庫,是將某一生物基因組DNA片段化并全數(shù)克隆
后取得的重組子群體的總稱。
CDNA文庫:是將生物特定的組織器官或特定發(fā)育時期的全數(shù)mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,
并全數(shù)克隆成重組子,在該重組子群集中包括了全數(shù)表達(dá)基因的轉(zhuǎn)錄本。
區(qū)別:基因組文庫包括全數(shù)基因,但cDNA文庫石油mRNA反轉(zhuǎn)錄取得的,,已經(jīng)去掉
基因中的內(nèi)含子部份
7.比較克隆載體與表達(dá)載體的異同
同:1).具有針對受體細(xì)胞的親緣性或親和性(可轉(zhuǎn)移性),能夠攜帶外源基因進(jìn)入受體
細(xì)胞;
2)能在宿主細(xì)胞中自主復(fù)制,并實(shí)現(xiàn)外源基因的增殖;
3).具有多種單一的限制性核酸內(nèi)切酶識別切割位點(diǎn);
4).具有適合的挑選標(biāo)記。
異:1)表達(dá)載體在克隆載體的基礎(chǔ)上又增加了基因表達(dá)的調(diào)控元件:即啟動子一一核
糖體結(jié)合位點(diǎn)一一克隆位點(diǎn)——轉(zhuǎn)錄終止信號(區(qū)分二者的標(biāo)志)
2)克隆載體在菌體中一樣是多拷貝的,而表達(dá)載體一樣是低拷貝的。
八、外源基因在大腸桿菌中的表達(dá)形式有哪些?如何純化?
1)包括體蛋白:純化步驟:細(xì)胞搜集與破碎,洗滌與溶解,變性蛋白質(zhì)的純化,重組
蛋白質(zhì)的復(fù)性,天然蛋白質(zhì)的分離。
2)融合蛋白:融合蛋白的提取,重折疊,純化,天然蛋白的回收和蛋白質(zhì)的水解愛惜。
3)分泌型蛋白:第一要進(jìn)行濃縮處置,然后再依照發(fā)酵液中的有效成份和雜質(zhì)之間的
理化性質(zhì)存在的不同來考慮選擇適合的純化方式。如離子互換層析,親和層析,凝膠過濾等。
4)可溶性表達(dá)產(chǎn)物:經(jīng)細(xì)胞破碎后的可溶性離心上清液,可利用若是有可利用的單克
隆抗體或相對特異性的親和配基,,可選用親和層析分離法。對處于極端等電點(diǎn)的蛋白,采
納離子互換層析分離。
5)周質(zhì)表達(dá)蛋白:大腸桿菌細(xì)胞低濃度溶菌酶處置,滲透壓裂解法,周質(zhì)腔分離出目
的蛋白。
九、抑制性消減雜交(SSH)的原理和進(jìn)程
原理:SSH的核心技術(shù)是抑制性PCR,它是一種將檢測子cDNA單鏈標(biāo)準(zhǔn)化步驟和消減
雜交步驟融為一體的技術(shù)。抑制性PCR是利用鏈內(nèi)復(fù)性優(yōu)先于鏈間復(fù)性的原理,是非目標(biāo)
序列片段兩頭的長反向重復(fù)序列在復(fù)性時產(chǎn)生"鍋柄樣''結(jié)構(gòu)或"發(fā)夾結(jié)構(gòu)''而無法與引物配
對,從而選擇性地抑制了非目標(biāo)序列的擴(kuò)增。
FirstHytondizMion
A
B
SecondHybndization:
non-denatunng.mixsaniples.addfreshdenatureddriver,anneal
A,B,C,D,andE
A.B.C.D,andE
Fillintheends
A?,
B:::S
cS——5——
□
?UsesuppressionPCR(annealat65℃),onlyEcan
givePCRproducts;
?Usenestedprimerstoenhancespecificity
論述題:
一、PCR技術(shù)的原理、成份、步驟、應(yīng)用及引物設(shè)計的要求
1)原理:PCR技術(shù)是以DNA互補(bǔ)鏈的聚合反映為基礎(chǔ),通過DNA變性、引物與模板
DNA一側(cè)的互補(bǔ)序列復(fù)性雜交,由DNA聚合酶催化引物延伸,最終取得特異DNA片段的體
外擴(kuò)增方式。
2)成份:模板、引物、DNA聚合酶(耐高溫)、Dntp
3)步驟:①變性:系統(tǒng)加熱至92C-96C,使dsDNA(雙鏈)解鏈成為ssDNA(單鏈),
且熱變性不改變其化學(xué)性質(zhì);
②退火:降溫至37℃-72℃,使引物與模板的互補(bǔ)區(qū)相結(jié)合;
③延伸:在72℃條件下,DNA聚合酶將dNTP持續(xù)加到引物的3,-0H端,合成
DNA。
4)應(yīng)用:一、引物設(shè)計;二、限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)分析;3、DNA基元查找;4、同源性分
析
5)引物設(shè)計:
①長度:至少16bp,一樣為18-30bp:
②兩個引物之間的Tm最好接近,最好1C之內(nèi),最多不超過5℃;
③幸免引物內(nèi)部或引物之間存在互補(bǔ)序列;
?G+C含量應(yīng)盡可能操縱在40%至60%之間;
⑤引物3,端的末位堿基對T叫酶的DNA合成效率有較大的阻礙,A的錯配概率較高,應(yīng)盡
可能幸免利用;
⑥引物3,端顯現(xiàn)3個以上的持續(xù)堿基,如GGG或CCC,也會使錯誤引發(fā)機(jī)率增加;
⑦最好在模板cDNA的保守區(qū)內(nèi)設(shè)計;
⑧引物序列在模板內(nèi)應(yīng)當(dāng)沒有相似性較高,尤其是3,端相似性較高的序列,不然容易致使
錯誤引發(fā);
⑨的5'端能夠修飾,而3'端不可修飾。
2.基因工程技術(shù)流程
答:1)目的基因克隆
2)載體的預(yù)備
3)目的基因與載體的連接
4)重組DNA轉(zhuǎn)化/轉(zhuǎn)染/轉(zhuǎn)導(dǎo)
5)體的挑選與鑒定
6)重組體的大量培育,外源基因表達(dá)效應(yīng)分析與開發(fā)應(yīng)用
3、轉(zhuǎn)化率的計算(結(jié)合2回答)
例題:某一DNA重組實(shí)驗的充沛率為20%,轉(zhuǎn)化率為107/mg載體,經(jīng)酶切和連接處置后
的重組載體轉(zhuǎn)化率比天然載體低約100倍,欲取得104個重組克隆,需要投入多少載體DNA
進(jìn)行重組實(shí)驗?
解答:假設(shè)重組率為100%,那么轉(zhuǎn)化后產(chǎn)生104個重組克隆需要載體DNA,重組率為20%
時投入載體為,載體投入量確信后,即可按10:1的要求算出5mg。
4、依照同源性設(shè)計引物(pl02?104)/5TIACE擴(kuò)增
1)分析核心區(qū)段
取得某蛋白質(zhì)的氨基酸序列,依照密碼子與氨基酸對應(yīng)關(guān)系,選取兩段持續(xù)的保守氨基酸序
列,寫出其可能的編碼序列,對蛋白質(zhì)同源性或同源性基因cDNA序列進(jìn)行充分的比對,
若是利用的是蛋白質(zhì)序列資料,在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中比較與之同源的蛋白序列,找出蛋白質(zhì)保
守性高的區(qū)域,作為引物設(shè)計的位點(diǎn),若是是利用同源cDNA的資料,從數(shù)據(jù)庫中取得多
個近緣物種同源序列后,進(jìn)行序列多重比較,選擇高保守性區(qū)段序列并設(shè)計引物。
2)設(shè)計簡并引物和擴(kuò)增核心區(qū)段
由于一個氨基酸可對應(yīng)一個到多個密碼子,因此一段氨基酸序列能夠有多個可能的編碼序
列,稱為簡并序列。相應(yīng)合成這一段序列作PCR擴(kuò)增體系的引物即為簡并引物。在選取氨
基酸序列時往往優(yōu)先選取對應(yīng)密碼子較少的殘基,為了降低簡并度,舍棄最后一個氨基酸其
密碼子的第三位堿基。設(shè)計核心區(qū)段擴(kuò)增的簡并引物還要考慮擴(kuò)增區(qū)段的長度和在cDNA
分子中的位置,通常擴(kuò)增序列在幾百堿基內(nèi)成效較好。
3)設(shè)計RACE引物,并進(jìn)行TRACE和TRACE擴(kuò)增
3,RACE依照中間核心序列設(shè)計出3,端RACE的上游引物后,利用dT作為下游引物,利用
mRNA反轉(zhuǎn)錄成的第一鏈cDNA作為模板將CDNA3,端擴(kuò)增出來
5'RACE盡管其下游引物能夠依照克隆的核心序列能夠確信下來,但由于5,端上游序列未
知,上游的引物難以確信,因此5,RACE要采納一些特殊方式確信其上游引物位點(diǎn)。
5.基因工程的平安性問題(主觀題,可兩方面分析)
其他知識點(diǎn)
一、Northern雜交(RNA);Western雜交(蛋白質(zhì))
二、核酸分子骨架中的磷酸
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