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代測序與二代測序的區(qū)別與聯(lián)系Sanger法測序(一代測序)Sanger法測序利用一種DNA聚合酶來延伸結(jié)合在待定序列模板上的引物。 直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應(yīng)構(gòu)成, 每個反應(yīng)含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸 (ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-0H基團,使延長的寡聚核苷酸選擇性地在 G、A、T或C處終止。終止點由反應(yīng)中相應(yīng)的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對濃度可以調(diào)整,使反應(yīng)得到一組長幾百至幾千堿基的鏈終止產(chǎn)物。 它們具有共同的起始點, 但終止在不同的的核苷酸上,可通過高分辨率變性凝膠電泳分離大小不同的片段,凝膠處理后可用 X-光膠片放射自顯影或非同位素標(biāo)記進行檢測。高通量測序(二代測序)高通量測序技術(shù)(High-throughputsequencing,HTS是對傳統(tǒng)Sanger測序(稱為一代測序技術(shù))革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定 ,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing,NGS)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細(xì)致全貌的分析成為可能 ,所以又被稱為深度測序(Deepsequencing)。第一代和第二代測序技術(shù)第X代公司平臺名稱測序方法檢測方法大約讀長(堿基數(shù))優(yōu)點相對局限性ABI/3130桑格-熒光高讀長,準(zhǔn)確度一通量低;樣品制備第 生命xL-3毛細(xì)管/光600-次性達標(biāo)率咼,能成本咼,使之難以技術(shù)730x電泳測1000很好處理重復(fù)序做大量的平行測代公司L序法學(xué)列和多聚序列序第貝克GeXP桑格-熒光/600-高讀長,準(zhǔn)確度一通量低;單個樣品-~一遺傳毛細(xì)管次性達標(biāo)率咼,能的制備成本相對曼光學(xué)1000代分析電泳測很好處理重復(fù)序較高
系統(tǒng)序法列和多聚序列;易小型化
第代羅氏/454基因組測序儀FLX系統(tǒng)焦磷酸測序法光學(xué)230400在第二代中最高讀長;比第一代的測序通量大樣品制備較難;難于處理重復(fù)和同種堿基多聚區(qū)域;試劑沖洗帶來錯誤累積;儀器昂貴HiSe可逆鏈第以魯q200終止物熒光/2x15儀器昂貴;用于數(shù) 很高測序通量據(jù)刪節(jié)和分析的米那0/mi和合成光學(xué)0代Seq測序法費用很高很高測序通量;在測序運行時間長;5500廣為接受的幾種第ABI/xlSO連接測熒光/25-3第二代平臺中,所讀長短,造成成本-~二SOLiLiD序法光學(xué)5要拼接出人類基高,數(shù)據(jù)分析困難代D系統(tǒng)因組的試劑成本和基因組拼接困難;儀器昂貴最低讀長短,推高了測第赫利Heli單分子熒光/25-3高通量;在第二代序成本,降低了基 scop合成測中屬于單分子性克斯光學(xué)0因組拼接的質(zhì)量;代e序法質(zhì)的測序技術(shù)儀器非常昂貴 資料來源于文獻
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