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新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題選修1專(zhuān)題2課題2PCR技術(shù)新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題自學(xué)提綱:知識(shí)回顧:分子的結(jié)構(gòu)(外側(cè)、內(nèi)側(cè)、基本單位);2.DNA復(fù)制過(guò)程和特點(diǎn);技術(shù)概念及應(yīng)用。基本概念:變性、復(fù)性、TaqDNA聚合酶、引物理解PCR技術(shù)的原理掌握PCR技術(shù)的全過(guò)程比較PCR技術(shù)和體內(nèi)DNA復(fù)制的異同點(diǎn)。新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題一、基礎(chǔ)知識(shí)(一)、PCR技術(shù)的概念是一種體外迅速擴(kuò)增DNA片段的技術(shù),它能以極少量的DNA為模板,在幾小時(shí)內(nèi)復(fù)制出上百份的DNA拷貝(二)、PCR技術(shù)的應(yīng)用遺傳疾病的診斷、刑偵破案、古生物學(xué)、基因克隆和DNA序列測(cè)定新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題PCR的應(yīng)用1從藍(lán)藻里面克隆SOD(超氧化物歧化酶)清除人體內(nèi)細(xì)胞中自由基抗氧化、抗輻射、消炎、抗衰老、抗癌高壓氧中毒、肺氣腫、糖尿病、早衰食品、保健品、藥品、化妝品基因庫(kù)檢索SOD的序列設(shè)計(jì)引物以藍(lán)藻總DNA位模板做PCR獲得的基因片斷連接在表達(dá)載體原核表達(dá)蛋白新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題PCR的應(yīng)用2檢測(cè)粉末樣品是否含有炭疽桿菌炭疽菌恐慌,降臨美國(guó),席卷全球生命力強(qiáng)、傳染快、發(fā)作快、死亡率高。有兩對(duì)引物是根據(jù)編碼炭疽桿菌EF因子的基因序列設(shè)計(jì)的,僅與各種炭疽桿菌的EF因子同源。PCR產(chǎn)物是1247bp和208bp的片斷。非炭疽桿菌均呈陰性。用營(yíng)養(yǎng)肉湯培養(yǎng)2小時(shí)取培養(yǎng)液直接作PCR新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題PCR的應(yīng)用3基因測(cè)序新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題一、基礎(chǔ)知識(shí)(三)、PCR技術(shù)的原理新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題1、體內(nèi)DNA復(fù)制的條件:解旋酶DNA母鏈4種脫氧核苷酸DNA聚合酶引物(RNA)打開(kāi)DNA雙鏈提供DNA復(fù)制的模板合成子鏈的原料催化DNA子鏈合成使DNA聚合酶能從引物3’端開(kāi)始連接脫氧核苷酸變性(80-100)Taq聚合酶(耐高溫)20—30個(gè)核苷酸構(gòu)成,是一小段DNA或RNAATP提供能量新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題2、DNA合成的方向(1)DNA單鏈兩端的命名①基本單位-脫氧核苷酸脫氧核糖磷酸T1號(hào)碳5號(hào)碳3號(hào)碳新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題連接ATGCATGC5,端含磷酸基團(tuán)3,端(含羥基)3,端5,端②DNA單鏈兩端的命名新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(2)DNA聚合酶的特性DNA聚合酶不能從頭開(kāi)始合成DNA,而只能從3’端延伸DNA鏈。因此,DNA復(fù)制需要引物。2、DNA合成的方向新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(3)DNA合成的方向從子鏈由5’
端向3’端延伸新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題3、DNA復(fù)制的前提
——是______________
用_________________方法
思考:DAN復(fù)制的前提是什么?體外擴(kuò)增DNA如何打開(kāi)雙鏈?雙鏈的解開(kāi)控制溫度新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題DNA雙鏈單鏈變性(加熱80-100℃)復(fù)性(緩慢冷卻)4、DNA分子的熱變性原理:PCR儀原理變性的目的:復(fù)性的目的:解開(kāi)雙鏈有利于引物Ⅰ和引物Ⅱ與兩條單鏈的結(jié)合新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題思考:高溫使DNA解旋,但普通DNA聚合酶會(huì)失活,
__________________找到耐高溫DNA聚合酶P21托馬斯.布魯克新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題5、體外DNA復(fù)制的條件(PCR
反應(yīng)的條件)①DNA模板;②分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物;③四種脫氧核苷酸;④耐高溫的聚合酶;⑤控制溫度,但不需解旋酶.新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題以便增加大分子模板DNA徹底變性的概率二、PCR的反應(yīng)過(guò)程1、循環(huán)之前的一次預(yù)變性2、PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán)新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(1)變性:當(dāng)溫度上升到90℃以上時(shí),雙鏈DNA解聚為單鏈。(2)復(fù)性:溫度下降到50℃左右,兩種引物通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條單鏈DNA結(jié)合。(3)延伸:溫度上升到72℃左右,溶液中的四種脫氧核苷酸(A,T,C,G)在DNA聚合酶的作用下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則合成新的DNA鏈。二、PCR的反應(yīng)過(guò)程3、每個(gè)循環(huán)包括:變性——復(fù)性——延伸新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(1)PCR循環(huán)--變性95℃變性新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(1)PCR循環(huán)--變性95℃變性新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(1)PCR循環(huán)--變性95℃變性新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(2)PCR循環(huán)—復(fù)性55℃復(fù)性新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(3)PCR循環(huán)—延伸新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(3)PCR循環(huán)—延伸新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(3)PCR循環(huán)—延伸新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題(3)PCR循環(huán)—延伸新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題4、循環(huán)特點(diǎn):①上一次循環(huán)的產(chǎn)物為下一循環(huán)的模板②結(jié)果單鏈中有最初母鏈的只兩條(無(wú)引物存于兩個(gè)子代DNA分子中③其它子代DNA分子都為雙引物分子式④處于兩引物之間的DNA序列呈指數(shù)增長(zhǎng)1×2N①②練習(xí):見(jiàn)課課練P79第10題新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題二、實(shí)驗(yàn)步驟:①準(zhǔn)備好PCR反應(yīng)體系的配方②用微量移液器按配方在微量試管中加入各組分③蓋嚴(yán)蓋子,用手指輕輕彈擊管壁④離心10分鐘⑤將離心管放入PCR儀上,設(shè)置好循環(huán)程序⑥電泳檢測(cè)PCR結(jié)果新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題三、操作提示:
操作提示
1.為避免外源DNA等因素的污染,PCR實(shí)驗(yàn)中使用的微量離心管、槍頭、緩沖液以及蒸餾水等在使用前必須進(jìn)行高壓滅菌。
2.PCR所用的緩沖液和酶應(yīng)分裝成小份,并在-20℃儲(chǔ)存。使用前,將所需試劑從冰箱拿出,放在冰塊上緩慢融化。
3.在微量離心管中添加反應(yīng)成分時(shí),每吸取一種試劑后,移液器上的槍頭都必須更換。所有的成分都加入后,蓋嚴(yán)離心管口的蓋子,用手指輕輕彈擊管的側(cè)壁,使反應(yīng)液混合均勻,再將微量離心管放在離心機(jī)上,離心約10s,使反應(yīng)液集中在離心管底部,再放入PCR儀中進(jìn)行反應(yīng)。目的:避免外源性DNA大量擴(kuò)增造成假陽(yáng)性反應(yīng)。新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題四、結(jié)果分析與評(píng)價(jià)1、原理:DNA在260nm的紫外線(xiàn)波段有一強(qiáng)烈的吸收峰(圖5-11)。可以利用DNA的這一特點(diǎn)進(jìn)行DNA含量的測(cè)定。新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題四、結(jié)果分析與評(píng)價(jià)(了解)2、具體方法如下。1).將樣品進(jìn)行50倍稀釋?zhuān)喝?μLPCR反應(yīng)液,加入98μL蒸餾水。2).以蒸餾水作為空白對(duì)照,在波長(zhǎng)260nm處,將紫外分光光度計(jì)(圖5-12)的讀數(shù)調(diào)節(jié)至零。3).加入步驟1中的DNA稀釋液100L至比色杯中,測(cè)定260nm處的光吸收值。4).根據(jù)下面的公式計(jì)算DNA含量。
DNA含量(μg/ml)=50x(260nm的讀數(shù))x稀釋倍數(shù)新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題五、課題延伸1、PCR優(yōu)點(diǎn):2、PCR技術(shù)的意義原理雖然復(fù)雜,但操作卻十分簡(jiǎn)單??焖?、高效、靈活和易于操作新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題復(fù)習(xí):PCR技術(shù)與體內(nèi)DNA復(fù)制的區(qū)別:1.PCR不需要解旋酶;體內(nèi)DNA復(fù)制需要;2.PCR需要耐熱的DNA聚合酶(常用TaqDNA聚合酶),而生物體內(nèi)的聚合酶在高溫時(shí)會(huì)變性;3.PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán),而生物體內(nèi)DNA復(fù)制需要生物體自身的復(fù)制。新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題練習(xí)1、書(shū)本2、課課練新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題練習(xí):見(jiàn)課課練P79第10題新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題9下圖為PCR過(guò)程的前三次循環(huán)的圖解,請(qǐng)據(jù)圖回答:
(])請(qǐng)將PCR緩沖液中提供的4種組分填寫(xiě)在圖中的方框內(nèi):
(2)第一輪循環(huán)中變性是指_____________________________;復(fù)性是指__________________________________________________;延伸是指___________________________________________________。
(3)假設(shè)PGR反應(yīng)中的DNA模板為P,第一輪循環(huán)的產(chǎn)物2個(gè)子代DNA為
Nl,第二輪的產(chǎn)物4個(gè)子代DNA為N2,第二輪的產(chǎn)物8個(gè)子代DNA為
N3,則Nl、N2、N3中分別含有模板DNA單鏈的DNA分子
,
__________________、____________________個(gè),若繼續(xù)循環(huán)36次,則N36中將有——個(gè)DNA分子含有模板DNA單鏈。
(4)N3的8個(gè)DNA分子中①②是以N2中的_____________為模板復(fù)制而來(lái)的,③④是以N2中的
為模板復(fù)制而采的,⑤⑥是以N2中的
為模板復(fù)制而來(lái)的,⑦⑧是以N2中的
為模板復(fù)制而來(lái)的。從圖中可以看出,DNA聚合酶只能特異地復(fù)制處于2個(gè)引物之間的DNA序列,使這段固定長(zhǎng)度的序列呈指數(shù)擴(kuò)增,原因是____________________________________________________練習(xí):見(jiàn)課課練P79第10題新教材選修3—2PCR技術(shù)專(zhuān)題練習(xí)二(課堂檢測(cè))1、DNA單鏈的________末端為3,端,________末端為5,端,在DNA復(fù)制時(shí),引物從模板鏈的___端配對(duì)結(jié)合.在___________酶的作用下,引物提供____端,使子鏈向下延伸.2每次循環(huán)可以分
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