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I鴿子性別鑒定的PCR方法范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了鴿子性別鑒定的PCR操作方法。本標(biāo)準(zhǔn)適用于各種品類、各日齡鴿子的性別鑒定。規(guī)范性引用文件下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB/T19495.2轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要求NY/T541—2016獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范試劑或材料除另有規(guī)定外,所用試劑均為分析純,實(shí)驗(yàn)室用水均符合GB/T6682二級(jí)水規(guī)定。肝素鈉:配制方法見附錄A.1。TAE電泳濃縮緩沖液:配制方法見附錄A.2。X脂糖:配制方法見附錄A.3。雄性鴿子對(duì)照、雌性鴿子對(duì)照均為已知性別的鴿子全血DNA作為模板,-20℃保存。儀器設(shè)備4℃冰箱(溫控范圍2℃~8℃)。離心管(1.5mL~2mL)。PCR儀。電泳儀(電壓90V~120V)。凝膠成像儀。高壓滅菌鍋(滅菌溫度:105℃~135℃;工作壓力:≤0.35MPa)。微量移液器(2μL、20μL、200μL、1000μL)及配套吸頭。樣品采集、儲(chǔ)存及運(yùn)輸按NY/T541—2016規(guī)定進(jìn)行采樣。用無菌針頭于鴿子爪處刺破皮膚,吸取20μL全血并與3μL~5μL肝素鈉(參見附錄A.1)混合,編號(hào)。樣品采集和樣品處理應(yīng)戴一次性手套,不得交叉污染。采集的樣品儲(chǔ)存和運(yùn)輸,參見NY/T541—2016。試驗(yàn)步驟本實(shí)驗(yàn)具體實(shí)驗(yàn)操作符合GB/T19495.2轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要求。引物參照參考文獻(xiàn)(劉宏祥等,2013),合成針對(duì)鴿子雌雄性別染色體CHD基因的一對(duì)引物(A1/A2)作為鴿子性別鑒定的引物,引物序列參見附錄B。PCR擴(kuò)增PCR反應(yīng)總體積為25μL,引物為A1/A2,模板為采集的鴿子抗凝全血,PCR反應(yīng)體系參見附錄C。PCR反應(yīng)條件為95℃5min、55℃5min循環(huán)2次裂解紅細(xì)胞,釋放DNA,然后94℃預(yù)變性5min,94℃40s、50℃30s、72℃40s,循環(huán)擴(kuò)增31次,最后72℃延伸7min。同時(shí)設(shè)立雄性和雌性鴿子的DNA為對(duì)照。PCR產(chǎn)物電泳取8μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物,進(jìn)行1.2%的X脂糖凝膠電泳(120V,30min~50min)。電泳結(jié)束后,在凝膠成像儀上觀察結(jié)果,拍照并做好試驗(yàn)記錄。結(jié)果判定試驗(yàn)成立條件雄性對(duì)照的PCR產(chǎn)物電泳后,在600bp的位置出現(xiàn)一條特異性的擴(kuò)增條帶,雌性對(duì)照PCR產(chǎn)物電泳后在450bp和600bp處均有擴(kuò)增條帶,試驗(yàn)結(jié)果成立。否則試驗(yàn)結(jié)果不成立。(見附錄D)結(jié)果判定雄性:檢測(cè)樣品PCR產(chǎn)物電泳后,僅有600bp的一條帶,則鴿子性別為雄性。雌性:檢測(cè)樣品PCR產(chǎn)物電泳后,有450bp和600bp的兩條帶,則鴿子性別為雌性。
(規(guī)范性附錄)
溶液配制肝素鈉抗凝劑150mg肝素鈉粉末(150U/mg)與100mL生理鹽水混合溶解。TAE電泳緩沖液使用時(shí)將50倍TAE電泳濃縮緩沖液用去離子水50倍稀釋即可。50倍TAE電泳濃縮緩沖液配制方法為:取Tris堿242g去離子水溶解,加入冰醋酸57.1mL、0.5mol/LEDTA100mL,用5mol/L的NaOH調(diào)pH至8.0,定容至1000mL。1.2%X脂糖凝膠稱取1.2gX脂糖,加入100mLTAE緩沖液中加熱溶解,最后加入適量核酸染料。2×TaqMasterMix成分TaqDNAPolymerase
0.1U/μLMgCl23mMdNTPs0.4mM2×PCR反應(yīng)緩沖液
(規(guī)范性附錄)
PCR引物序列PCR引物序列見表B.1。PCR引物序列引物(primer)序列(sequence)A15'-AGTGCATTGCAGAAGCAATATT-3'A25'-GCCTCCTGTTTATTATAGAATTCAT-3'
(資料性附錄)
PCR反應(yīng)體系PCR反應(yīng)體系見表C.1。PCR反應(yīng)體系組分體積(μL)水10.32×Mix12.5上游引物(25μmoL/L)1.0下游引物(25μmoL/L)1.0模板0.2總體積
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