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演示文稿常用功能使用教程目前一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)常用功能使用教程目前二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)Chem3D起始界面目前三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)主界面Chem3D起始界面目前四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)工具欄模型窗口模型類(lèi)型三維視圖ChemDraw切換圖標(biāo)工具欄模型數(shù)據(jù)窗口擴(kuò)大(縮?。┐翱谙⒋翱跔顟B(tài)欄目前五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇軌跡球單鍵雙鍵三鍵虛鍵文本橡皮大小調(diào)整目前六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)顯示設(shè)置目前七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)視頻設(shè)置模型顯示設(shè)置立體顯示彈出信息配體顯示結(jié)構(gòu)顯示原子標(biāo)記原子顯示色彩選項(xiàng)目前八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)顯示設(shè)置屬性ModelType線(xiàn)狀模型棒狀模型球棍模型圓柱鍵模型比例模型目前九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)帶狀模型目前十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)
結(jié)構(gòu)不同顯示方式View/Setting/ModelDispaly菜單或F6鍵:五種WireFrameSticksBall-SticksCylindricalBondsSpaceFilling
目前十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)帶狀模型常用于生物分子目前十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)代表用紅藍(lán)兩種色彩的立體顯示代表用深色顯示模型,就是對(duì)于模型的部分按觀(guān)察者的角度不同著色代表顯示兩個(gè)立體結(jié)構(gòu)完全相同的模型代表模擬現(xiàn)實(shí)的角度觀(guān)察模型,使模型更接近真實(shí)代表顯示模型的時(shí)候?qū)⒑竺娴牟糠忠躁幱靶问奖硎荆@樣模型的立體感更強(qiáng)。目前十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇【單鍵】工具,在模型窗口向右按動(dòng)圓柱鍵模型1.利用鍵工具建立模型建立3D模型目前十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)線(xiàn)狀模型目前十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)棒狀模型目前十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)球棍模型目前十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)比例模型目前十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇【軌跡球】工具,使分子模型在模型窗口沿X、Y軸旋轉(zhuǎn)X、Y軸旋轉(zhuǎn)指示目前二十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇【軌跡球】工具并按“Alt”鍵,使分子模型在模型窗口沿Z軸旋轉(zhuǎn)Z軸旋轉(zhuǎn)指示目前二十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型結(jié)構(gòu)信息光標(biāo)位于原子上,自動(dòng)顯示原子信息目前二十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)工具欄顯示原子的符號(hào)和標(biāo)號(hào)目前二十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)光標(biāo)位于鍵上,自動(dòng)顯示鍵信息模型結(jié)構(gòu)信息目前二十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型的進(jìn)一步信息顯示鍵長(zhǎng)變化顯示鍵角變化顯示二面角顯示所有沒(méi)有相鄰的原子的距離目前二十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型的鍵長(zhǎng)數(shù)據(jù)目前二十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型的鍵長(zhǎng)和鍵角數(shù)據(jù)目前二十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)乙烯模型中的雙鍵信息目前二十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)鍵級(jí)改動(dòng)目前二十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)顯示氫及孤對(duì)電子目前三十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)不顯示氫及孤對(duì)電子的環(huán)己烷原子名稱(chēng)及序數(shù)目前三十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇工具,雙擊原子,按順序改變?cè)有蛱?hào)目前三十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)隱藏或顯示其它原子居中移動(dòng)到色彩調(diào)節(jié)顯示元素符號(hào)顯示元素編號(hào)顯示實(shí)心球顯示點(diǎn)陣表面調(diào)整鍵長(zhǎng)破壞鍵調(diào)整鍵級(jí)就近結(jié)合添加質(zhì)心顛倒調(diào)整矩陣隱藏所選部分隱藏非選部分顯示所有原子顯示鄰近原子顯示背面定義基團(tuán)目前三十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)利用【鍵】工具建立的結(jié)構(gòu),鍵角及鍵長(zhǎng)可能不正常,應(yīng)【整理結(jié)構(gòu)】目前三十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)環(huán)己烷的椅式構(gòu)象目前三十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)使用【文本】工具輸入結(jié)構(gòu)式2.利用文本工具建立模型目前三十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)按【Enter】自動(dòng)轉(zhuǎn)化為模型目前三十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)括號(hào)表示支鏈目前三十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前三十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)整理結(jié)構(gòu)目前四十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)簡(jiǎn)單優(yōu)化觀(guān)察分子變化目前四十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)4-甲基-2-戊醇模型目前四十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)建立1,2-雙甲基環(huán)戊烷模型目前四十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前四十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)整理結(jié)構(gòu)目前四十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)建立Ibuprofen(布洛芬)模型目前四十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前四十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)建立十肽菌素模型目前四十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前四十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)建立十二丙氨酸醇分子模型目前五十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前五十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)改變顯示方式模型類(lèi)型窗口:目前五十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)設(shè)為線(xiàn)狀模型目前五十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前五十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)設(shè)為帶狀模型目前五十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)a-螺旋模型目前五十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)使用子結(jié)構(gòu)建立模型3.利用子結(jié)構(gòu)建立模型目前五十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)子結(jié)構(gòu)模型庫(kù)目前五十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇所需的子結(jié)構(gòu),然后復(fù)制目前五十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)粘貼復(fù)制結(jié)果目前六十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)在子結(jié)構(gòu)上進(jìn)行編輯目前六十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)4.使用模板建立模型目前六十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前六十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)ChemDraw中畫(huà)出的分子結(jié)構(gòu)復(fù)制粘貼到Chem3D中5.ChemDraw和Chem3D信息轉(zhuǎn)換目前六十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)Chem3D中畫(huà)出的分子模型復(fù)制粘貼到ChemDraw中目前六十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)(1)查找原子的范德瓦爾斯半徑
【View】【AtomTypes.TBL】窗口,找到各種元素在不同環(huán)境的半徑計(jì)算功能演示目前六十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前六十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前六十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)(2)觀(guān)察分子的大小建立苯模型。執(zhí)行【View】【ConnollyMolecular】彈出Suface對(duì)話(huà)框;【solid】選項(xiàng)可以選擇分子表面的類(lèi)型;【Resolution】滑動(dòng)到右邊,其值為100目前六十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)View/SolventAccessible菜單甲苯結(jié)構(gòu)目前七十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)(3)計(jì)算分子體積建立苯模型。執(zhí)行【Analyze】【ComputeProperties】在【AvailableProperties】選框中雙擊【ConnollySolvent-ExcludedVolumeSVE-ChemPropStd】選項(xiàng),使之加入到【SelectedProperties】框中。單擊ok,目前七十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前七十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前八十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)(4)檢查結(jié)構(gòu)能量目前八十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型旋轉(zhuǎn)對(duì)位交叉目前八十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)總能量計(jì)算目前八十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)空間位阻能:0.977kcal/mol計(jì)算結(jié)果目前八十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型的二面角數(shù)據(jù)目前八十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)數(shù)據(jù)與模型對(duì)應(yīng)目前八十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)顯示原子符號(hào)及序號(hào)目前八十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)按動(dòng)旋轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)相應(yīng)改變目前八十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)(5)分子軌道(HOMO及LUMO)首先用雙鍵畫(huà)出乙烯分子目前八十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)顯示軌道時(shí)必須選擇目前九十頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇分子軌道目前九十一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇HOMO軌道HOMO軌道顯示軌道選項(xiàng)HOMO和LUMO各6個(gè)能量隨所選軌道不同而不同實(shí)心顯示(絲網(wǎng)顯示圓點(diǎn)顯示半透明顯示)目前九十二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)乙烯分子的HOMO軌道目前九十三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)選擇LUMO軌道LUMO軌道顯示目前九十四頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)乙烯分子的LUMO軌道目前九十五頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前九十六頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前九十七頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前九十八頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前九十九頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前一百頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前一百零一頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前一百零二頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)其他計(jì)算從頭算程序:GamessGaussian
需另外安裝這兩個(gè)程序。半經(jīng)驗(yàn)或分子力學(xué)計(jì)算
MechanicsMopac(Am1,Mindo/3,Mndo,PM3)計(jì)算方式:計(jì)算性質(zhì),最小能,過(guò)渡態(tài)優(yōu)化,光譜分析目前一百零三頁(yè)\總數(shù)一百零五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)模型的輸入和輸出:以NaCl晶體為例:【File】【Template】選擇【NaClCrystal.C3T】選擇以
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