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文檔簡介
第四章凝膠排阻1第1頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
排阻層析(exclusionchromatography),亦稱分子篩層析(molecularsievechromatography)、凝膠過濾(gelfiltration)。凡是利用生物大分子的相對分子質(zhì)量(relativemolecularmass,Mr)差異進(jìn)行層析分離的方法,均稱之為排阻層析。用于排阻層析的分離介質(zhì)稱為排阻層析介質(zhì)。在20世紀(jì)60年代初就開始使用凝膠介質(zhì)分離生物大分子。例如,用淀粉或者瓊脂糖作為電泳支持物分離血清中的蛋白質(zhì),凝膠在其中起分子篩作用。后來人們將凝膠制成球形微珠,作為液相層析分離介質(zhì),用于分離生物大分子,并獲得巨大成功。現(xiàn)在使用的凝膠層析介質(zhì)的用途遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了電泳分離介質(zhì)的范疇,已成為分離純化生物大分子最重要的分離介質(zhì)之一,也是作為合成帶有配基的層析介質(zhì)應(yīng)用最廣泛的一種載體。凝膠層析介質(zhì)主要是以葡聚糖、瓊脂糖、聚丙烯酰胺等為原料,通過特殊工藝合成的層析介質(zhì)。目前已成為生物化學(xué)、分子生物學(xué)和生物制藥在研究和生產(chǎn)中必不可少的分離介質(zhì)。
第一節(jié)概述2第2頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三第二節(jié)凝膠層析原理
一、基本原理凝膠類層析介質(zhì)是一種在球體內(nèi)部具有大孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)凝膠微粒,不同大小的網(wǎng)狀孔徑像篩子一樣,可以把大小不同的生物大分子按一定的順序進(jìn)行分離,好像“目數(shù)”不同的普通篩子一樣把大小不同顆粒分級篩分。但是排阻層析與普通篩分的原理不同,排阻層析是按生物分子分子量的大小排序進(jìn)行篩分的。3第3頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三相對分子質(zhì)量大的生物分子由于不能進(jìn)入或不能完全進(jìn)入凝膠內(nèi)部的網(wǎng)狀孔,沿著凝膠顆粒間的空隙或大的網(wǎng)狀孔通過,大分子相對于小分子遷移的路徑近,在柱內(nèi)的停留時間短,保留值小,所以在層析過程中遷移率最快,走在小分子的前面,先從柱中流出;4第4頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三分子量小的分子由于能夠進(jìn)入凝膠內(nèi)部的網(wǎng)狀孔,沿著凝膠顆粒不同大小的網(wǎng)狀孔流過,相對于大分子遷移的路徑長,在柱內(nèi)的停留時間長,保留值大,所以在層析過程中遷移率最慢,走在大分子的后面,后從柱中流出。5第5頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三樣品中分子量大小不同的各種分子在流過凝膠內(nèi)部網(wǎng)狀孔時就受到凝膠介質(zhì)排阻效應(yīng),也稱為分子篩效應(yīng),將它們一個一個分離,從而達(dá)到分離的目的。普通篩分是大顆粒不能通過篩子的篩孔而被截留在篩板的上面,小顆粒可以通過篩孔。所以普通篩分與凝膠層析篩分的原理是不一樣的。排阻層析分離的基本原理如圖所示。6第6頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三7第7頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三凝膠層析介質(zhì)分離的分子主要分3部分。第一部分是全排阻分子,也可稱之為上限分子量,不能起篩分作用的大分子。第二部分是部分滲透分子,稱為分離分子,是凝膠介質(zhì)有效分離的分子。第三部分是全滲透分子,稱之為下限分子量,是不能起篩分作用的小分子。
8第8頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三從圖可以看出,A-B之間為該凝膠的有效分離范圍,可分離相對分子質(zhì)量范圍是1000~100000,高于相對分子質(zhì)量為100000的是全排阻分子,低于相對分子質(zhì)量為1000的是全滲透分子。凝膠層析的分離范圍示意圖9第9頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三二、參數(shù)的表示方法及其意義1.柱床體積凝膠層析介質(zhì)經(jīng)溶脹、裝柱、沉降、體積穩(wěn)定后,所占層析柱內(nèi)的總體積,稱為柱床體積或床體積,以Vt(totalvolume)表示,單位為ml。2.外水體積存在于柱床體積內(nèi)凝膠顆粒之外、顆粒之間的空隙所占有的那一部分水相體積或溶劑體積,稱之為外水體積或外體積,以Vo(outervolume)表示,單位為m1。10第10頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三3.內(nèi)水體積是凝膠吸水溶脹后,存在于凝膠顆粒內(nèi)所占有的那一部分水相體積或溶劑體積,稱之為內(nèi)水體積或內(nèi)體積以Vi(innervolume)表示,單位為m1。4.凝膠體積是凝膠顆粒自身的體積,也就是床體積減去外水體積和內(nèi)水體積后所占有的體積,稱為膠體積或稱干膠體積,以Vg(gelvolume)表示,單位為m1。11第11頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三5.洗脫體積自加樣液時開始,到洗脫組分濃度最大時出現(xiàn)的峰(洗脫峰峰頂)為止,所收集的體積,以Ve(elutionvolume)表示,單位為m1計算法:根據(jù)層析柱體積計算總體積可用下列公式表示Vt=πr2h
干凝膠用量(克)=πr2h
/膨脹度(床體積/克干膠)12第12頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三三、參數(shù)之間的關(guān)系測量法1.床體積與Vo,Vi,Vg之間的關(guān)系式是:Vt=Vo+Vi+Vg(1-1)2.洗脫體積與Vo,Vi的關(guān)系式為:Ve=Vo+KdVi(1-2)式中Kd-樣品組分在流動相和固定相之間的分配系數(shù),也可以視為相對分子質(zhì)量不同的溶質(zhì)在凝膠顆粒的內(nèi)部和外部的分配系數(shù)。它只與被分離物質(zhì)相對分子質(zhì)量的大小、凝膠顆粒空隙和網(wǎng)狀孔徑大小有關(guān),與層析柱的長短和粗細(xì)無關(guān)。Kd可以通過實驗獲得。13第13頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三3.Kd與體積之間的關(guān)系可以將式(1-2)變換一下,即可得到Kd與體積之間的關(guān)系式:(1-3)Ve–VoVi式中Ve-實驗測得的實際洗脫體積??捎貌槐荒z滯留的大的相對分子質(zhì)量組分測得,通常用相對分子質(zhì)量在2×106的藍(lán)色葡聚糖-2000測定,可以通過干膠的吸水量(每克干膠所吸附水的毫升數(shù))求得。對于一定條件的凝膠層析柱來說,只要通過實驗得知某一組分的洗脫體積Ve,就可以計算出Kd值。
以上關(guān)系可以通過圖2表示。Kd=14第14頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三15第15頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三四、Kd的幾種判斷在凝膠柱層析過程中,Kd可以有以下幾種情況:1.Kd=0時,Ve=Vo對于完全不能進(jìn)入凝膠內(nèi)部的大分子(全排阻),其洗脫體積就等于外水體積。2.Kd=1時,Ve=Vo+Vi。對于完全可以進(jìn)入凝膠內(nèi)部的小分子(全滲透),其洗脫體積就等于外水體積和內(nèi)水體積之和。
16第16頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三由此可見,對于某一凝膠介質(zhì),如果在層析過程中有兩種全排阻的大分子,即Kd=0,盡管它們在分子量之間的差別很大,但由于它們已經(jīng)超出了該凝膠質(zhì)的所能分離大分子的范疇,不可能有分離效果。17第17頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三同樣兩種小分子全部都能進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部空隙,
Kd=1,盡管它們在分子量大小仍有差異,但由于它們已經(jīng)超出了該凝膠質(zhì)的所能分離小分子的范疇,同樣也不可能有分離效果。因此,不同型號的凝膠介質(zhì)有不同的相對分子質(zhì)量分離范疇。在進(jìn)行排阻層析之前,根據(jù)分離的相對分子質(zhì)量選擇合適的凝膠介質(zhì)。18第18頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三3.0<Kd<1時,Ve=Vo十KdVi。表示凝膠顆粒內(nèi)部一部分空隙可以被不同大小的分子利用,可以有不同程度的滲入,Ve在Vo+Vi之間變化。4.Kd>1時,表示凝膠具有一定的吸附作用,此時Ve>Vo+Vi。例如某些芳香族化合物的洗脫體積遠(yuǎn)超出理論計算的最大值,這些化合物的Kd值一般都是大于1的。如苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸在SephadexG-25中的Kd值分別為1.2、1.4和2.2。19第19頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
在實際工作中,小分子不易得到Kd=1的數(shù)值,尤其是對交聯(lián)度大的凝膠介質(zhì)Kd差別較明顯,如同樣一個小分子在SphadexG-10柱層析測得的Kd是0.75左右,同樣一個小分子在SphadexG-25柱層析測得的Kd是0.8左右。20第20頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三造成這種差別的原因是由于一部分水分子與凝膠結(jié)合較牢固,成為凝膠本身的一部分,使凝膠的有效網(wǎng)狀孔變小,小分子不能擴(kuò)散和滲透到凝膠內(nèi)部,是凝膠失去了部分篩分作用所致。此時的Vi不能以凝膠的吸水量進(jìn)行計算,因此,通常以小分子化合物通過凝膠柱來測定Vi值。另外一種計算方法是不使用Vi和Kd,而是用Kav,(有效分配系數(shù))代替Kd,定義如下。21第21頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
22第22頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
在這里實際上是將原來以水作為固定相(Vi)改為凝膠顆粒(Vt-Vo)作為固定相,而洗脫劑(Ve-Vo)作為流動相。Kav,和Kd值對交聯(lián)度較小的凝膠介質(zhì)差別不大,而對交聯(lián)度大的凝膠介質(zhì)差異較大。在排阻層析過程中,凝膠層析介質(zhì)一般情況對流動相的組分無吸附作用,當(dāng)流動相的體積Vt流過后,上樣后的所有組分都應(yīng)當(dāng)被洗脫出來,這是凝膠排阻層析與其他的層析方法所不同之處。23第23頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三五、Ve與相對分子質(zhì)量的關(guān)系
對同一類型的化合物,洗脫特性與組分的相對分子質(zhì)量有關(guān),各種組分流過凝膠柱時,洗脫順序按相對分子質(zhì)量(Mr)的大小排列先后流出。Ve與Mr的關(guān)系式如下。Ve=K1-K2lgMr(1-7)式中:K1-常數(shù);K2-常數(shù);Mr-相對分子質(zhì)量;Ve-洗脫體積。A-SephadexG100;B-sephadexG-20024第24頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
有時Ve也可以用分離體積(Ve-Vo)、相對保留體積(Ve/Vo)、簡化洗脫體積(Ve/Vt)或有效分配系數(shù)(Kav)代替,它們與相對分子質(zhì)量的關(guān)系與公式(1-7)相同,只是常數(shù)不同。但實際操作過程中大多數(shù)都是以Kav對相對分子質(zhì)量的對數(shù)(1gMr)作圖,得到工作曲線,也稱之為“選擇曲線”,如圖3所示。曲線的斜率是表明凝膠的性質(zhì),是一個重要的特征。在凝膠允許的分離范圍內(nèi),曲線的斜率越陡,分級分離的效果越好。25第25頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三凝膠排阻層析分離主要決定于溶質(zhì)中相對分子質(zhì)量的大小和相應(yīng)凝膠的交聯(lián)度。在同一類型的生物大分子(球形分子或線形分子)的前提下,凝膠分級分離的范圍越窄,測定的相對分子質(zhì)量越準(zhǔn)確。凝膠排阻層析具有設(shè)備簡單、操作方便、重復(fù)性好、條件溫和等優(yōu)點,是實驗室測定相對分子質(zhì)量常用的方法,也是生物大分子分離純化常用的分離手段。26第26頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三第三節(jié)凝膠層析介質(zhì)
一、凝膠的基本性質(zhì)
自然界天然凝膠和化學(xué)合成的凝膠種類很多,但能用排阻層析的凝膠則不多。排阻層析的凝膠是一種球形顆粒,球內(nèi)部是多孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。與普通凝膠在性能上主要有以下幾點區(qū)別。27第27頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三1.化學(xué)穩(wěn)定性合成凝膠的原料和合成凝膠介質(zhì)以后所保留的化學(xué)基團(tuán)(如羥基等)必須具有良好的惰性,不與待分離物質(zhì)發(fā)生化學(xué)反應(yīng),不影響被分離物質(zhì)原有的性質(zhì)(如生物活性、構(gòu)象等);在比較苛刻的環(huán)境中(在偏堿或偏酸的溶液中和在高濃度的鹽溶液中)不發(fā)生降解、變性反應(yīng),保持相對穩(wěn)定。2.無特異性吸附凝膠顆粒上不存在或存在極少的離子基團(tuán),不與溶液中的離子化合物發(fā)生離子交換、吸附或親和反應(yīng)。在低離子強(qiáng)度下,洗脫峰不出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,被分離物質(zhì)有較高的回收率。28第28頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三3.具有較好的耐受性凝膠顆粒對溫度和有機(jī)溶劑具有較好的耐受性,尤其是對物理聚合的凝膠,在高溫下(100℃左右)不發(fā)生熔融,在有機(jī)溶劑中凝膠的體積不發(fā)生收縮變形。4.剛性好凝膠顆粒具有一定機(jī)械強(qiáng)度,在允許的操作壓范圍內(nèi),柱床體積保持穩(wěn)定,在層析的過程中流速不發(fā)生改變。29第29頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三二、凝膠層析介質(zhì)的分類
目前,常用于排阻層析的凝膠類介質(zhì)主要有4大類,即葡聚糖凝膠、瓊脂糖凝膠、聚丙烯酰胺凝膠和瓊脂糖-聚丙烯酰胺混合凝膠等層析介質(zhì)。1.葡聚糖凝膠層析介質(zhì)葡聚糖凝膠層析介質(zhì)是由多聚葡聚糖通過與環(huán)氧氯丙烷交聯(lián)而合成的,是一類具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的珠狀凝膠顆粒。葡聚糖凝膠交聯(lián)的程度(簡稱交聯(lián)度)與凝膠顆粒網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)孔徑的大小有直接關(guān)系,交聯(lián)度越大,網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的孔徑越小,分離的分子量就??;反之,交聯(lián)度越小,網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的孔徑越大,分離的分子量就大。葡聚糖凝膠交聯(lián)結(jié)構(gòu)如圖4。30第30頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三31第31頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三交聯(lián)的葡聚糖不溶于有機(jī)溶劑和水的聚合物,但由于其結(jié)構(gòu)中含有大量的羥基,又具有很強(qiáng)的親水性,能迅速在水和電解質(zhì)溶液中溶脹,在層析過程中非常容易與水溶性溶質(zhì)接觸。合成的葡聚糖凝膠在酸性條件下糖苷鍵容易被水解,在堿性環(huán)境中比較穩(wěn)定。一般在0.25mol/LNaOH溶液中,60℃的條件下放置兩個月以上仍不改變其原有的基本性質(zhì)。所以常用稀堿溶液處理葡聚糖凝膠層析介質(zhì),以除去殘留在凝膠介質(zhì)上的變性蛋白和其他雜質(zhì)。32第32頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三在氧化劑的作用下葡聚糖凝膠上的羥基容易氧化成羧基,增加了帶電荷基團(tuán),容易與溶液中的離子化合物發(fā)生交換反應(yīng),使其非特異性吸附的能力增強(qiáng),從而影響分離效果和回收率。葡聚糖凝膠對溫度具有較好的耐受性,通常在溶脹狀態(tài)的葡聚糖凝膠可以耐受110℃高溫,而在未溶脹狀態(tài)下的干膠可以耐受120℃的高溫。33第33頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
最常用的葡聚糖凝膠層析介質(zhì)是SephadexG系列產(chǎn)品,它是由Pharmacia生產(chǎn)的,介質(zhì)的型號不同,其交聯(lián)度也不同,分離相對分子質(zhì)量的范圍有差異。例如SephadexG-25、SephadexG-50、SephadexG-75、SephadexG-100、SephadexG-200等,代表著不同型號的葡聚糖凝膠,英文字母G后面的阿拉伯?dāng)?shù)字,表示凝膠吸水量。不同型號的葡聚糖凝膠的有關(guān)技術(shù)參數(shù)見表-1。34第34頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三表-1葡聚糖凝膠層析介質(zhì)的有關(guān)技術(shù)參數(shù)凝膠型號顆粒大小/μm
溶脹體積/(m1/g)
分離范圍(Mr)
SephadexG-10SephadexG-15SephadexG-25SephadexG-50SephadexG-75SephadexG-100SephadexG-150SephadexG-200
40~12040~12050~15050~15040~12040~12040~12040~120
2~32.5~3.54~69~1112~1515~2020~3020~40
小于7×102小于1.5×1031.0×103~5.0×1031.5×103~3.0×1043.0×103~8.0×1044.0×103~1.0×1055.0×103~3.0×1055.0×103~6.0×105
35第35頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三SephadexG系列產(chǎn)品,“G”后面的阿拉伯?dāng)?shù)字越大,表示交聯(lián)度越小,凝膠孔徑越大,相對分子質(zhì)量分離范圍越大,凝膠的溶脹體積大。與此相反,“G”后面的阿拉伯?dāng)?shù)越小,表示交聯(lián)度越大,凝膠孔徑越小,相對分子質(zhì)量分離范圍越小,凝膠的溶脹體積小。凝膠的特性:具有耐高溫(100℃沸水煮)、在酸性或堿性條件下穩(wěn)定(在pH2~11范圍內(nèi)穩(wěn)定),但是在高鹽濃度下體積易收縮,凝膠的剛性較差。
36第36頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三2.瓊脂糖凝膠層析介質(zhì)瓊脂是自然界廣泛存在的一種天然多糖混合物,主要來源于海藻。瓊脂主要由兩部分組成,一部分是中性鏈狀多糖,稱為瓊脂糖(agarose),其基本結(jié)構(gòu)是由B-D-吡喃半乳糖和3,6-脫水-L-吡喃半乳糖相間結(jié)合而成的鏈狀多糖;另一部分是帶負(fù)電荷的瓊脂糖(agaropectin),在分子中含有磺酸基和羧基,在制備瓊脂糖時需要用氯代十六烷吡啶或聚乙烯醇等有機(jī)溶劑將瓊膠沉淀除去。其部分結(jié)構(gòu)如下。
37第37頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三圖538第38頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三目前能生產(chǎn)瓊脂糖凝膠層析介質(zhì)廠家很多,生產(chǎn)工藝和產(chǎn)品的名稱也因生產(chǎn)廠家不同而異,但介質(zhì)的基本性能都很相近。例如瑞典生產(chǎn)的Sepharose系列、美國生產(chǎn)的SuperAgoGel系列、英國生產(chǎn)的Sagavac系列、丹麥生產(chǎn)的Gelarose系列、我國生產(chǎn)的QT系列等都是以瓊脂糖為原料制成的。
39第39頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
瓊脂糖凝膠是一種大孔膠,由于半乳糖的分子中含有許多羥基,具有良好的親水性,在層析過程中非常容易與水溶性溶質(zhì)或溶劑接觸。它的交聯(lián)度隨著瓊脂的濃度增加而增大,制備時以物理的方式聚膠,首先配制一定濃度的瓊脂糖,加溫直至使其完全融化,然后迅速冷卻獲得凝膠,凝膠內(nèi)部的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)主要是依靠糖鏈之間的次級鍵如氫鍵來維持穩(wěn)定,網(wǎng)狀孔徑的大小通過改變凝膠的交聯(lián)度來控制。瓊脂糖分子中不帶電荷,所以非特異性吸附較少,樣品在排阻層析分離時回收率較高。40第40頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三由于瓊脂糖凝膠鏈與鏈之間不是共價結(jié)合,所以對于未經(jīng)特殊處理的瓊脂糖凝膠,當(dāng)環(huán)境的溫度高于56oC時就會開始融化,如果經(jīng)過特殊方式處理或經(jīng)過交聯(lián)的瓊脂糖可以耐受100~120℃的高溫,機(jī)械強(qiáng)度也有較大的提高。
41第41頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三最常用的瓊脂糖凝膠層析介質(zhì)是SepharoseB系列產(chǎn)品,它是由Pharmacia生產(chǎn)的,介質(zhì)的型號不同,其交聯(lián)度也不同,分離分子量的范圍有差異。例如,Sepharose4B、Sepharose6B、Sepharose8B等。不同型號的瓊脂糖凝膠表示不同的瓊脂糖百分含量,有關(guān)技術(shù)參數(shù)見表2。42第42頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三凝膠型號
顆粒大?。蘭
凝膠濃度/%
分離范圍(Mr)
Sepharose2BSepharose4BSepharose6B
Sepharmse8BSepharose12B50~13050~13050~130
50~13050~130
246
812
5×105~15×1072×105~15×1065×104~2×106
2×104~7×1055×103~5×104
表2瓊脂糖凝膠層析介質(zhì)的有關(guān)技術(shù)參數(shù)43第43頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三在SepharoseB系列產(chǎn)品中,“B”前面的阿拉伯?dāng)?shù)字表示瓊脂糖的百分濃度,瓊脂糖濃度越高表示交聯(lián)度越大,凝膠孔徑越小,相對分子質(zhì)量分離范圍越小。與此相反瓊脂糖濃度越低表示交聯(lián)度越小,凝膠孔徑越大,相對分子質(zhì)量分離范圍越大,因此瓊脂糖凝膠的交聯(lián)度表示方法與葡聚糖凝膠相反。
44第44頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三瓊脂糖凝膠的特性:具有良好的大孔性和機(jī)械強(qiáng)度,交聯(lián)的瓊脂糖凝膠除了能耐受120℃蒸汽壓力處理外,還可以耐受一定的酸堿度(在pH3~12范圍內(nèi)穩(wěn)定)和在6M尿素中不變形。45第45頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三3.聚丙烯酰胺凝膠層析介質(zhì)聚丙烯酰胺凝膠是一種化學(xué)合成的凝膠,組成的基本單位是丙烯酰胺(acrylamide,簡稱Acy),也稱之為單體,分子式(CH2=CII-CONH2);交聯(lián)劑是N,N-亞甲基雙丙烯酰胺(N,N,-methylenebisacrylamide,簡稱bis)。丙烯酰胺和N,N二亞甲基雙丙烯酰胺在自由氧基的誘發(fā)下發(fā)生聚合反應(yīng),在制備過程中經(jīng)過特殊工藝合成球形的聚丙酰胺凝膠珠。通過控制丙烯酰胺濃度和N,N,-亞甲基雙丙烯酰胺的比例,就可以得到不同交聯(lián)度的聚丙酰胺凝膠。其部分結(jié)構(gòu)式如下。46第46頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三47第47頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
聚丙烯酰胺凝膠層析介質(zhì)的穩(wěn)定性不如交聯(lián)的聚葡糖凝膠,它在酸性的條件下酰胺鍵容易被水解生成羧酸,使凝膠介質(zhì)帶有一定的離子交換基團(tuán),在排阻層析時對溶液中帶電荷組分發(fā)生離子交換作用,使介質(zhì)的非特異性吸附增加。因此,聚丙烯酰胺凝膠層析應(yīng)當(dāng)盡量避免使用酸性較強(qiáng)的緩沖液。盡管目前使用的聚丙烯酰胺凝膠層析介質(zhì)在說明書上表明對酸堿溶液有較大的耐受性(在pH2~11的溶液中),但是,如果介質(zhì)長時間處于酸性環(huán)境中還是有一定影響的。
48第48頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三最常用的聚丙烯酰胺凝膠層析介質(zhì)是Bio-Gel-P系列產(chǎn)品,它是由Bio-Rad公司生產(chǎn)的,介質(zhì)的型號不同,其交聯(lián)度也不同,分離相對分子質(zhì)量的范圍有差異。介質(zhì)的有關(guān)技術(shù)參數(shù)見表3。49第49頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三表3聚丙烯酰胺凝膠層析介質(zhì)的有關(guān)技術(shù)參數(shù)凝膠型號
溶脹體積/(ml/g)
排阻下限(×103)
分離范圍(Mr)
Bio-GelP~2Bio-GelP~4Bio-GelP~6Bio-GelP~10Bio-GelP~30Bio-GelP~60Bio-GelP~100Bio-GelP~150Bio-GelP~200Bio-GelP~300
3.85.88.812.414.919.019.024.034.040.0
1.63.64.6103060100150200300
2×102~2×1035×102~4×1031×103~5×1035×103~1.7×1042×104~5×1043×104~7×1044×104~1×1055×104~1.5×1058×104~3×1051×105~4×105
50第50頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
在Bio-GelP系列產(chǎn)品中,“P”后面的阿拉伯?dāng)?shù)字越大,表示交聯(lián)越小,凝膠孔徑越大,相對分子質(zhì)量分離范圍越大,凝膠的溶脹體積越大。與此相反,“P”后面的阿拉伯?dāng)?shù)字越小,表示交聯(lián)越大,凝膠孔徑越小,相對分子質(zhì)量分離范圍越小,凝膠的溶脹體積越小。它與葡聚糖凝膠介質(zhì)的表示方法一樣。
51第51頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三聚丙烯酰胺凝膠的特點:具有良好的大孔性和機(jī)械強(qiáng)度,交聯(lián)后具有一定的耐受性。但在低于pH2的酸性環(huán)境中或高溫下,分子中的酰胺基易被水解產(chǎn)生羧酸;對偏酸或偏堿性的化合物及芳香族類化合物均有不同程度的吸附。52第52頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三4.瓊脂糖-聚丙烯酰胺混合凝膠層析介質(zhì)瓊脂糖-聚丙烯酰胺混合凝膠層析介質(zhì)是由瓊脂糖聚丙烯酰胺按不同比例制成的混合型凝膠。它利用聚丙烯酰胺作為三維空間骨架,在骨架中間填充瓊脂糖凝膠,由于聚丙烯酰胺骨架機(jī)械性能比瓊脂糖凝膠高,制成的凝膠剛性好,孔徑大,很適合于生物大分子的分離。制備這類介質(zhì)在工藝和技術(shù)上要比制備單一材料的凝膠復(fù)雜得多。其理化性質(zhì)介于瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠之間。最常用的瓊脂糖聚丙烯酰胺混合凝膠層析介質(zhì)是UltrolGelAcA系列。介質(zhì)的主要技術(shù)參數(shù)見表4。
53第53頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三表4瓊脂糖.聚丙烯酰胺混合凝膠層析介質(zhì)的主要技術(shù)參數(shù)凝膠型號
丙烯酰胺
濃度/%瓊脂糖
濃度/%
分離范圍(Mr)UltrolGelAcA22UltrolGelAcA34
UltrolGelAcA44UltrolGelAcA54
23
45
24
44
1×105~1.2×1062×104~3.5×105
1×104~1.3×1055×103~7×104
54第54頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三UltrolGel“AcA”表示合成時用的丙烯酰胺和瓊脂糖的量,其后面阿拉伯?dāng)?shù)字分別表示聚丙烯酰胺和瓊脂糖的百分濃度,阿拉伯?dāng)?shù)字越小表示丙烯酰胺和瓊脂糖濃度越低,其交聯(lián)度越小,凝膠孔徑越大,分離分子量的范圍越大。與此相反,阿拉伯?dāng)?shù)字越大表示丙烯酰胺和瓊脂糖濃度越高,其交聯(lián)度越大,凝膠孔徑越小,分離分子量的范圍越小。交聯(lián)度的表示方法與瓊脂糖凝膠一樣。
55第55頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三三、凝膠的規(guī)格與用途凝膠排阻層析介質(zhì)根據(jù)其用途和使用的規(guī)模,具有不同的規(guī)格,也就是說在同一交聯(lián)度、同一性能的條件下的凝膠介質(zhì)有不同的規(guī)格。主要從球形介質(zhì)的直徑大小可以分為粗、中粗、中細(xì)、細(xì)、超細(xì)等幾類,但不同型號的凝膠分類略有區(qū)別,如中粗葡聚糖凝膠顆粒,直徑大小一般在40~120μm之間,而瓊脂糖凝膠顆粒,直徑大?。骸阍?0~150/μm之間。不同規(guī)格的凝膠見表5所示。56第56頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三表5不同規(guī)格的凝膠及用途
凝膠規(guī)格
粒度范圍/μm
用途
粗中粗中細(xì)細(xì)超細(xì)
100~30040~16020~8010~403~5
大規(guī)模制備或工業(yè)化生產(chǎn)析常規(guī)分析或小量制備實驗室分析測定或微量制備
微量分析超微量分析或用于HPLC填料
57第57頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三四、凝膠性能的比較不同的凝膠層析介質(zhì),由于合成介質(zhì)的原料不同,其分辨率存在著較大的差別。例如SephadexG-75和Bio-GelP-30分離同一種樣品,SephadexG-75分離的不如Bio-GelP-30好,如圖7-1所示。同一種凝膠介質(zhì)不同型號,由于它們的交聯(lián)度不同,其分辨率也會有較大的差異。例如SephadexG-75、SephadexG-100、SephadexG-150的分辨率有較大的差異。如圖7-2所示。58第58頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三59第59頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三第四節(jié)凝膠(排阻)層析分離條件的確定一、凝膠層析介質(zhì)的選擇1.凝膠層析介質(zhì)型號的選擇
根據(jù)相對分子質(zhì)量分離范圍選擇相應(yīng)型號的凝膠介質(zhì),確定是組別分離還是組分分離。組別分離是指相對分子質(zhì)量之間相差很大(數(shù)十至數(shù)百倍)的樣品,如生物大分子與有機(jī)小分子或無機(jī)鹽等的分離;組分分離是指相對分子質(zhì)量之間相差較小(±2000以上)的生物大分子。60第60頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
組別分離一般選用交聯(lián)度較大的凝膠層析介質(zhì),例如,蛋白質(zhì)脫鹽可選用葡聚糖凝膠SephadexG-25或聚丙烯酰胺凝膠Bio-GelP-6、Bio-GelP-10。組分分離要根據(jù)被分離組分所預(yù)測的最大相對分子質(zhì)量的上限值和最小相對分子質(zhì)量的下限值的分離范圍來選擇合適的凝膠。如分離相對分子質(zhì)量在5000~60000之間的多種組分,可選用葡聚糖凝膠SephadexG-75或UltrolGelAcA54。61第61頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三2.凝膠粒度的選擇
選擇凝膠粒度的大小,主要是基于分離樣品是層析的規(guī)?;蛳噜弮山M分相對分子質(zhì)量的差異進(jìn)行選擇。粒度較大的凝膠介質(zhì)流速快,適于具有一定規(guī)模的分離或者組別分離,但由于其顆粒大層析時渦旋擴(kuò)散影響較大,被分離組分在柱內(nèi)容易擴(kuò)散,分辨率較低。粒度較小的凝膠介質(zhì)適于分析分離,層析時渦旋擴(kuò)散影響較小,組分在柱內(nèi)擴(kuò)散小,分辨率相對較高,但流速較慢。實驗室常用的凝膠介質(zhì)的粒度范圍是中粗級。
62第62頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三凝膠介質(zhì)粒度的均勻性也是很重要的,凝膠介質(zhì)的最大顆粒和最小顆粒的差值越小越好,說明介質(zhì)的均勻度好。均勻度好的介質(zhì)流速相對于均勻度差的介質(zhì)快,效率高。63第63頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三二、層析柱的選擇
層析柱的選擇,主要考慮被分離組分相對分子質(zhì)量的差異,選用相應(yīng)的柱長與柱內(nèi)徑之比的層析柱。對于組別分離的層析柱,由于被分離的組分相對分子質(zhì)量差別較大可采用短粗的層析柱,柱長度:柱內(nèi)徑=10:1或20:1,如脫鹽柱。對組分分級分離的層析柱,用細(xì)長的層析柱;柱長度:柱內(nèi)徑=50:1或100:1,如蛋白質(zhì)組分分離。64第64頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三三、流動相的選擇
排阻層析所使用的緩沖溶液比較簡單,一般只使用一種緩沖液。但是在選擇緩沖溶液時主要考慮3方面的因素:1.考慮被分離物質(zhì)的穩(wěn)定性,包括緩沖液的pH值、離子強(qiáng)度及保護(hù)劑等。2.考慮凝膠介質(zhì)的穩(wěn)定性能,不與介質(zhì)發(fā)生化學(xué)反應(yīng),不變形,不降解。3.考慮分離物質(zhì)的后處理,被分離組分經(jīng)排阻層析分離后還需采用其他層析方法進(jìn)行分離(如用離子交換或親和層析分離等),最好選用與后續(xù)層析方法相同的緩沖液。如果后處理是冰凍干燥,可選用易揮發(fā)性的溶液。如NH4HC03、HAC或NH40H等。65第65頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三四、樣液的制備
排阻層析的樣液在上樣前,要進(jìn)行適當(dāng)?shù)奶幚?,去部分雜質(zhì)。樣液的濃度不宜太稀,組分不宜太多,質(zhì)量至少要相差±2000以上。
66第66頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三五、上樣體積
排阻層析的上樣量相對于其他層析方法要求更嚴(yán)格,上樣后的各個組分隨著流動相往前流動,不會停留在介質(zhì)上。各個組分的分離峰極容易產(chǎn)生擴(kuò)散效應(yīng),流出體積只有增大,而不會減少。一般情況,對組分分離的洗脫體積是原體積的幾倍至幾十倍。因此對組分分離的上樣體積不超過柱床體積的0.5%~5%;組別分離的上樣體積不超過柱床體積的30%。67第67頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三第五節(jié)凝膠介質(zhì)的后處理
一、凝膠柱的保存
凝膠柱內(nèi)的層析介質(zhì)是浸泡在溶液中,容易長菌。尤其是葡聚糖和瓊脂糖類凝膠介質(zhì),極易染菌,某些微生物能分泌降解多糖糖苷鍵的酶,使葡聚糖和瓊脂糖的糖苷鍵發(fā)生降解,而改變凝膠層析介質(zhì)原有的性質(zhì)。68第68頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
雖然聚丙烯酰胺凝膠介質(zhì)不容易被微生物所降解,但長期浸泡在溶液中容易孳生細(xì)菌,使其化學(xué)性質(zhì)發(fā)生某些變化,如發(fā)生氧化,離子化等而改變層析的特性:為了避免微生物的生長,殘留在凝膠柱內(nèi)的磷酸鹽和有機(jī)物必須要洗凈,然后將層析柱真空或低溫保存。低溫保存的溫度不能低于柱內(nèi)溶液的冰點,防止柱內(nèi)的凝膠結(jié)冰,而破壞凝膠的交聯(lián)度和網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。69第69頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
防止微生物生長最常用的方法是在凝膠溶液中加人一定的抑菌劑,如0.02%疊氮鈉、0.01%~0.02%三氯丁醇、0.005%~0.01%乙基汞硫代水楊酸鈉、0.001%~0.01%苯基汞代乙酸鹽、苯基汞代硝酸鹽或苯基汞代硼酸鹽等。70第70頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三二、凝膠介質(zhì)的處理與干燥
凝膠層析介質(zhì)一般不與溶液中的溶質(zhì)發(fā)生任何作用,所以在層析分離后用平衡液稍加平衡即可進(jìn)行下一次層析,但是在實際操作中常常有些雜質(zhì)污染凝膠和層析柱表面的凝膠。因此,層析柱在使用一段時間后必須做適當(dāng)?shù)奶幚?,除去凝膠表面的污染物。處理所用的溶液和溶液濃度略有不同,一般對交聯(lián)的葡聚糖凝膠類介質(zhì)可以用0.1mol/LNaOH和0.5mol/LNaCl混合處理,聚丙烯酰胺和瓊脂糖凝膠類介質(zhì)可以用0.5~1.0mol/LNaCl溶液處理。
71第71頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三凝膠層析介質(zhì)如果在較長的時間內(nèi)不再使用,可以將其干燥長期保存。使用過的凝膠層析介質(zhì),首先按一般的再生程序?qū)⒔橘|(zhì)再生處理、漂洗干凈,然后用乙醇從低濃度到高濃度逐級脫水(先后用30%、50%、70%、80%、95%、無水乙醇、乙醚),脫水后的介質(zhì)在室溫下晾干,將乙醚揮發(fā)盡,即可。72第72頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三第六節(jié)凝膠過濾(排阻)的分離模式一、脫鹽
在生物大分子的分離純化過程時,常用一些無機(jī)鹽或有機(jī)小分子作為洗脫劑,在洗脫液中常常含有較高濃度的鹽或其他小分子化合物,一般要將小分子和生物大分子分開,常采用透析的方法。雖然透析法操作簡單,但是費時,處理的量有限;如果采用排阻層析法除鹽,既可以節(jié)省時間,又不影響生物大分子的特性。73第73頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三74第74頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
脫鹽最常用的凝膠介質(zhì)是SephadexG-25。例如經(jīng)三氯乙酸提取的卵黏蛋白,經(jīng)SephadexG-25柱層析除去雞卵黏蛋白中的鹽,見圖8所示。蛋白質(zhì)脫鹽時,某些蛋白質(zhì)由于脫鹽后溶液中電解質(zhì)下降,導(dǎo)致其溶解度降低,有時會出現(xiàn)沉淀或被吸附在柱上洗不下來。遇見這種情況,可以用揮發(fā)性的鹽類洗脫,然后冰凍干燥。75第75頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三76第76頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三二、測定相對分子質(zhì)量凝膠排阻層析是測定相對分子質(zhì)量的一個常用的方法。使用一系列已知相對分子質(zhì)量的混合標(biāo)準(zhǔn)品在同一凝膠柱內(nèi)同一條件下進(jìn)行分離,收集每一個組分的洗脫體積,然后將每一個組分的洗脫體積對相對分子質(zhì)量的對數(shù)作圖,獲得標(biāo)準(zhǔn)相對分子質(zhì)量的工作曲線,也稱之為標(biāo)準(zhǔn)曲線。77第77頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三在同樣的條件下將未知樣品通過凝膠排阻層析分離,并獲得未知樣品的洗脫體積,用該洗脫體積從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查得未知樣品相對分子質(zhì)量的對數(shù)值,在查反對數(shù)就知道該樣品的相對分子質(zhì)量。如圖9所示,以牛血清蛋白(67000)、雞卵清清蛋白(43000)、糜蛋白酶原(25000)、(20000)、細(xì)胞色素(12000)為例。78第78頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三79第79頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
凝膠排阻層析是測定相對分子質(zhì)量的方法不需要復(fù)雜的儀器設(shè)備,操作簡單,樣品用量少,具有一定的使用價值。但是此法測定的相對分子質(zhì)量會產(chǎn)生一定偏差,線形分子和球形分子也有所不同,在同樣的條件下線形分子的結(jié)果會偏大,球形分子會偏小。凝膠排阻層析測定的相對分子質(zhì)量與生物大分子的形狀有密切的關(guān)系,如某些線形蛋白、球形蛋白、纖維蛋白和糖蛋白等。80第80頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三因此,在測定時如果未知樣品是球形分子最好選擇球形分子作標(biāo)準(zhǔn)蛋白,未知樣品是線形分子最好選擇線形分子作標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì),這樣產(chǎn)生的偏差相對小一些。如果對未知樣品相對分子質(zhì)量的精確測定還需要與其他相對分子質(zhì)量的測定方法進(jìn)行比較,參考其他方法做出判斷。81第81頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三三、分離蛋白質(zhì)
凝膠排阻層析是生物大分子在分離純化過程中不可缺少的一種手段,它是通過分子的質(zhì)量進(jìn)行分離唯一的一種技術(shù)。在層析方法中絕大多數(shù)都是以化合物的電荷差異進(jìn)行分離的(如離子交換層析、螯合層析、吸附層析等)或以化合物的極性進(jìn)行分離(如分配層析、反相層析、疏水層析等)。82第82頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三凝膠排阻層析可以將相對分子質(zhì)量相近、分子結(jié)構(gòu)和形狀相似的化合與其他分子分開。例如SephadexG-75柱層析可以分離相對分子質(zhì)量在3000~80000球形蛋白分子或1000~50000線形蛋白分子。用SephadexG-50柱層析從大鼠睪丸的提取液中分離金屬結(jié)合蛋白,如圖10所示。83第83頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三84第84頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三第七節(jié)應(yīng)用實例
雞卵黏蛋白相對分子質(zhì)量的測定一、原理葡聚糖凝膠SephadexG-75的相對分子質(zhì)量分離范圍在3000~80000之間。用4種已知相對分子質(zhì)量蛋白通過SephadexG-75排阻層析分離,得到相應(yīng)的洗脫峰,分別合并各洗脫峰的體積,并可計算出各種標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的Kav,以相對分子質(zhì)量的對數(shù)lgMr為橫坐標(biāo),Kav為縱坐標(biāo),繪出標(biāo)準(zhǔn)曲線。然后將卵黏蛋白在SephadexG-75排阻層析分離得到相應(yīng)的洗脫峰所計算出來的Kav值,從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查得相應(yīng)的lgMr,即可知道卵黏蛋白的相對分子質(zhì)量。85第85頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三
二、試劑與材料試劑:標(biāo)準(zhǔn)相對分子質(zhì)量蛋白質(zhì),卵黏蛋白,藍(lán)色葡聚糖-2000,乙酸,乙酸鉀等。材料:SephadexG-75,層析柱(1cm×l00cm)。
86第86頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三三、操作步驟1.凝膠介質(zhì)的選擇及溶脹稱取10gSephadexG-75干粉放人500ml的燒杯中,加入200m10.025mol/L氯化鉀,0.2mol/L乙酸緩沖液,在沸水浴中熱溶脹2h,冷卻至室溫后,抽真空脫去凝膠中殘留的空氣,或在室溫下溶脹24h,真空脫氣,備用。87第87頁,共93頁,2023年,2月20日,星期三2.裝柱取一支長度為100cm,內(nèi)徑為lcm的層析柱。洗凈,向柱內(nèi)裝人1/4左右柱床體積的緩沖液,然后把溶脹處理好的SephadexG-75,一次裝入層析柱內(nèi),在柱的下
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