oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座

Oncomine數(shù)據(jù)庫應(yīng)用oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第1頁Oncomine介紹Oncomine是大型腫瘤基因芯片數(shù)據(jù)庫，涵蓋65個(gè)基因芯片數(shù)據(jù)集、4700個(gè)芯片及4億8千萬個(gè)基因表示數(shù)據(jù)，可用于分析基因表示差異、尋找離群值、預(yù)測(cè)共表示基因等，并可依據(jù)腫瘤分期、分級(jí)、組織類型等臨床信息進(jìn)行分類，還可依據(jù)已知基因—藥品分析尋找可能分子標(biāo)識(shí)物與治療靶點(diǎn)。下面僅介紹怎樣分析表示差異，更多內(nèi)容可參考網(wǎng)站onlinehelponcomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第2頁一、賬號(hào)注冊(cè)需要非盈利機(jī)構(gòu)郵箱：大學(xué)或研究機(jī)構(gòu)無償使用可滿足普通需要，若想導(dǎo)出數(shù)據(jù)需要付費(fèi)（我們能夠經(jīng)過手動(dòng)輸入數(shù)據(jù)，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行簡單分析）oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第3頁二、鍵入用戶名和密碼oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第4頁三、登陸后用戶主界面oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第5頁四、鍵入要搜索基因oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第6頁五、限制搜索條件1、AnalysisType-DifferentialAnalysis-Cancervs.NormalAnalysisoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第7頁3、CancerType-ProstateCanceroncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第8頁4、SampleType-ClinicalSpecimenoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第9頁5、DataType-mRNAoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第10頁我們選定條件會(huì)出現(xiàn)在篩選框中,點(diǎn)擊搜索，右邊界面以下列圖六、按限定條件搜索oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第11頁右邊柱狀圖默認(rèn)為第一個(gè)機(jī)構(gòu)研究結(jié)果oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第12頁勾選各研究機(jī)構(gòu)所做研究七、對(duì)多組數(shù)據(jù)進(jìn)行meta分析oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第13頁對(duì)所勾選結(jié)果進(jìn)行合并，進(jìn)行meta分析oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第14頁研究結(jié)果為該基因高表示機(jī)構(gòu)oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第15頁研究結(jié)果為該基因相對(duì)低表示機(jī)構(gòu)oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第16頁選擇一個(gè)較為可信機(jī)構(gòu)作數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)并分析八、結(jié)果分析oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第17頁展開該機(jī)構(gòu)右邊下拉箭頭，點(diǎn)擊其下方研究，會(huì)出現(xiàn)右邊所表示柱狀圖oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第18頁將鼠標(biāo)移至每個(gè)柱子上，會(huì)分別跳出一個(gè)說明框，統(tǒng)計(jì)每個(gè)柱子Expressionvalueoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第19頁分別統(tǒng)計(jì)正常前列腺和前列腺癌expressionvalue并用GraphPadPrism5作圖九、作散點(diǎn)圖oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第20頁錄入正常前列腺和前列腺癌expressionvalueoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第21頁點(diǎn)擊Graphs下方Data1即顯示最側(cè)散點(diǎn)圖oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第22頁點(diǎn)擊Results出現(xiàn)右方對(duì)話框，點(diǎn)擊OKoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第23頁繼續(xù)點(diǎn)擊OKoncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第24頁自動(dòng)計(jì)算出P值，按P<0.05，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義oncomine應(yīng)用實(shí)例專題知識(shí)專家講座第25頁十、結(jié)論對(duì)