用MS進(jìn)行石墨烯建模導(dǎo)入VASP

本文格式為Word版，下載可任意編輯——用MS進(jìn)行石墨烯建模導(dǎo)入VASP用materialstudio構(gòu)建石墨烯模型

弄了好久，終究會(huì)構(gòu)建石墨烯模型了，看了好多帖子，覺得都寫的不是很詳細(xì)，對(duì)于新手來說，有些困難，所以特發(fā)此貼。越簡單的問題越簡單被人忽略~

1、開啟materialstudio，新建一個(gè)工程，導(dǎo)入石墨graphite.msi（也可以自己build，然后添加原子）。

2、build->makep1（目的是消除對(duì)稱性，這樣才能夠刪除一層原子）。3、刪除一層原子（選中原子->delete）。

。。。

4、修改晶格參數(shù)：build->crystal->rebuildcrystal，設(shè)置方位角α=90,β=90,γ=605、構(gòu)建supercell（便利摻雜，也為了好看）：build->symetry->supercell，構(gòu)建一個(gè)5x5x1的超原胞。

6、cleavesurface（為了能夠添加真空層）：build->surface->cleavesurface,(h,k,l)改為（0,0，-1）

7、添加20埃真空層（添加真空層是為了減小層與層之間的影響，至少20埃，大點(diǎn)沒關(guān)系，最多是計(jì)算時(shí)時(shí)間長一點(diǎn)）：build->srystal->buildvacuum。構(gòu)建好后，模型如下：

接下來，在export導(dǎo)出*.p的文件，就可以用于vasp計(jì)算了。

最近為了在VASP中弛豫石墨烯，要在在MS中建立石墨烯模型，總結(jié)了一下步驟，僅供參考：

1、開啟materialstudio，新建一個(gè)工程，import石墨graphite.msi，在structure/ceramic中

2、build->makep1（目的是消除對(duì)稱性，這樣才能夠刪除一層原子）。

3、刪除一層原子（選中原子->delete），并移動(dòng)剩下的原子到中間。

4、構(gòu)建supercell（便利摻雜，也為了好看）：build->symetry->supercell，構(gòu)建一個(gè)6*6*1的超原胞，這樣建立的超胞模型是扶手型。

要建立鋸齒狀的，在建立supercell之前，build>symmetry>findsymmetry,然后imposesymmetry，此時(shí)只顯示兩個(gè)原子，然后建立supercell，6*6*1

（假使需要supercell是斜六面體，這樣就可以了，假使需要矩形，繼續(xù)下一步）5、修改晶格參數(shù)：build->crystal->rebuildcrystal，設(shè)置方位角和length。由斜六面體改為矩形首先改方位角，假使只改方位角，會(huì)發(fā)現(xiàn)周期性邊界變化，

所以還要修改length，修改以后變成矩形。我的是6*6*1,a：12.78，b:12.2999

6、下面就是需要導(dǎo)出到VASP中

點(diǎn)擊castep計(jì)算energy，保存file，到相應(yīng)文件夾下找到graphite(66-cub).cell文件，此文件為隱含文件，開啟，把相應(yīng)的latticeparameter和坐標(biāo)拷到POSCAR，就搞定了。一、

1先導(dǎo)入石墨（陶瓷文件里有），然后buildsurfacecleave,此時(shí)注意hkl的選取以及uv的方向的選取；然后點(diǎn)擊確定即可。

2加真空層的厚度，在BUILD--CRYSTAL有vacumm選項(xiàng)，注意厚度的選擇，一般大于15，3然后做超胞即可，superwell選項(xiàng)二、

導(dǎo)入graphite（inthefileofstructure-ceramics),然后build-Symmetry-makeP1.

然后切掉中間一層。然后切掉其中一層，將剩下的一層移到c軸中間附近。

bulid-Symmetry-findsymmetry-imposesymmetry。這樣就得到了honeycomblatticeprimitivecell。

假使需要大片結(jié)構(gòu)，可以用bulid-symmetry-Surpercell來構(gòu)建。。。得到菱形格子。假使需要正交格子，將primitivecell通過supercell2*2然后，然后留下立方格子的4個(gè)原子，其他切掉。重新構(gòu)建晶格，build-reb