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文檔簡(jiǎn)介
第五章
微生物的代謝與調(diào)
節(jié)細(xì)胞內(nèi)發(fā)生的各種化學(xué)反應(yīng)的總稱(chēng)代謝分解代謝(catabolism)合成代謝(anabolism)復(fù)雜分子(有機(jī)物)分解代謝合成代謝簡(jiǎn)單小分子ATP[H]現(xiàn)在是1頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四
在微生物生命的整個(gè)代謝過(guò)程中,指令系統(tǒng)是基因,作用系統(tǒng)是酶,調(diào)控系統(tǒng)是代謝產(chǎn)物,影響因素是外界環(huán)境。在細(xì)胞內(nèi)各系統(tǒng)之間任何時(shí)候都處于相互統(tǒng)一、矛盾、協(xié)調(diào)和制約之中,是一個(gè)完美的自控體系。
現(xiàn)在是2頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四第一節(jié)微生物能量代謝能量代謝是一切生物代謝的核心問(wèn)題能量代謝的中心任務(wù),是生物體如何把外界環(huán)境中的多種形式的最初能源轉(zhuǎn)換成對(duì)一切生命活動(dòng)都能使用的通用能源------ATP。最初能源有機(jī)物還原態(tài)無(wú)機(jī)物日光化能異養(yǎng)微生物化能自養(yǎng)微生物光能營(yíng)養(yǎng)微生物通用能源(ATP)現(xiàn)在是3頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是4頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四生物氧化方式
①物質(zhì)中加氧;
②化合物脫氫;
③失去電子,如Fe2+離子失去電子變成Fe3+離子。
根據(jù)最終電子受體(氫受體)分為:有氧呼吸、無(wú)氧呼吸與發(fā)酵一、微生物的呼吸作用現(xiàn)在是5頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四生物氧化的形式包括某物質(zhì)與氧結(jié)合、脫氫或脫電子三種生物氧化的功能為:產(chǎn)能(ATP)、產(chǎn)還原力[H]和產(chǎn)小分子中間代謝物現(xiàn)在是6頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(一)底物脫氫的4條途徑多數(shù)微生物是化能異養(yǎng)型菌,葡萄糖是微生物最好的碳源和能源,可通過(guò)4條代謝途徑,EMP途徑、HMP途徑、ED途徑、磷酸解酮酶途徑完成脫氫反應(yīng),并伴隨還原力[H]和能量的產(chǎn)生。
現(xiàn)在是7頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四1.EMP途徑(Embden-Meyerhof-Parnaspathway)生物體內(nèi)葡萄糖被降解成丙酮酸的過(guò)程稱(chēng)為糖酵解,這是多數(shù)微生物共有的基本代謝途徑。
通過(guò)EMP途徑,1分子葡萄糖經(jīng)10步反應(yīng)轉(zhuǎn)變成2分子丙酮酸,產(chǎn)生2分子ATP和2分子NADH2。其總反應(yīng)式為:
C6H1206+2NAD+2ADP+2Pi——→2CH3COCOOH+2NADH2+2ATP+2H20
現(xiàn)在是8頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四在EMP途徑終反應(yīng)中,2NADH2在有氧條件下,可經(jīng)呼吸鏈的氧化磷酸化反應(yīng)產(chǎn)生6ATP,而在無(wú)氧條件下,則可將丙酮酸還原成乳酸,或?qū)⒈崦擊瘸梢胰?,后者還原為乙醇。
EMP途徑的特征性酶是1,6-二磷酸果糖醛縮酶,它催化1,6-二磷酸果糖裂解生成兩個(gè)三碳化合。2個(gè)3-磷酸甘油醛經(jīng)磷酸烯醇式丙酮酸在丙酮酸激酶作用下生成2分子丙酮酸。丙酮酸是EMP途徑的關(guān)鍵產(chǎn)物,由它出發(fā)在不同的微生物中可進(jìn)行多種發(fā)酵.現(xiàn)在是9頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是10頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(2)HMP途徑(HexoseMonophosphatePathway))
能產(chǎn)生大量NADPH2形式還原力和重要中間代謝產(chǎn)物而并非產(chǎn)能的代謝途徑。
HMP途徑可概括為三個(gè)階段
①葡萄糖分子通過(guò)幾步反應(yīng)產(chǎn)生5-磷酸核酮糖和CO2;②5-磷酸核酮糖發(fā)生同分異構(gòu)化而分別產(chǎn)生5-磷酸核糖和5-磷酸木酮糖;
③磷酸戊糖在沒(méi)有氧參與的條件下,發(fā)生碳架重排,產(chǎn)生了磷酸己糖和3-磷酸甘油醛,
現(xiàn)在是11頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四后者可通過(guò)以下兩種方式進(jìn)行代謝。
一種產(chǎn)物是進(jìn)入EMP途徑生成丙酮酸,
另一種產(chǎn)物是通過(guò)二磷酸果糖醛縮酶和果糖二磷酸酶的作用而轉(zhuǎn)化為磷酸己糖。HMP途徑。
HMP途徑一次循環(huán)需要6分子葡萄糖同時(shí)參與,有5分子6-磷酸己糖再生,用去1分子葡萄糖,產(chǎn)生大量NADPH2形式的還原力。其總反應(yīng)式為:
6-磷酸葡萄糖+2NADP+H20——→5/66-磷酸葡萄糖+2NADPH2+C02+Pi現(xiàn)在是12頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四3ED途徑(Enrner-DoudoroffPathway)又稱(chēng)2-酮-3-脫氧-6-磷酸-葡萄糖酸(KDPG)裂解途徑。它是少數(shù)缺乏完整EMP途徑的細(xì)菌所特有的利用葡萄糖的替代途徑。
在ED途徑中,6-磷酸葡萄糖首先脫氫產(chǎn)生6-磷酸葡萄糖酸,繼而在脫水酶生成2-酮-3-脫氧-6-磷酸-葡萄糖(KDPG)然后在KDPG醛縮酶的作用下,產(chǎn)生1分子3-磷酸甘油醛和1分子丙酮酸。
然后3-磷酸甘油醛進(jìn)入EMP途徑轉(zhuǎn)變成丙酮酸。1分子葡萄糖經(jīng)ED途徑最后生成2分子丙酮酸、1分子ATP、1分子NADPH2和NADH2。現(xiàn)在是13頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四ED途徑的特點(diǎn):①葡萄糖經(jīng)快速反應(yīng)獲得丙酮酸(僅4步反應(yīng));②6碳的關(guān)鍵中間代謝產(chǎn)物是KDPG;③特征性酶是KDPG醛縮酶;④特征性反應(yīng)是KDPG裂解生成丙酮酸和3-磷酸甘油醛;⑤產(chǎn)能效率低,1分子葡萄糖經(jīng)ED途徑分解只產(chǎn)生1分子ATP
ED途徑在G―菌中分布較廣,
特別是假單胞菌和某些固氮菌中較多存在,如嗜糖假單胞菌、熒光假單胞菌、銅綠假單胞菌、林氏假單胞菌和運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單胞菌等現(xiàn)在是14頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四ED途徑可與EMP途徑、HMP途徑和TCA循環(huán)等各種代謝途徑相連接,因此,可以相互協(xié)調(diào),以滿足微生物對(duì)還原力、能量和不同中間代謝產(chǎn)物的需要。
通過(guò)與HMP途徑連接可獲得必要的戊糖和NADPH2等。
在ED途徑中所產(chǎn)生的丙酮酸對(duì)微好氧菌(如運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單胞菌)來(lái)說(shuō),可脫羧生成乙醛,乙醛進(jìn)一步被還原為乙醇。此種由ED途徑發(fā)酵產(chǎn)生乙醇的過(guò)程與酵母菌經(jīng)EMP途徑生產(chǎn)乙醇不同,稱(chēng)為細(xì)菌酒精發(fā)酵。
不同細(xì)菌進(jìn)行乙醇發(fā)酵的途徑也各不相同。現(xiàn)在是15頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四
TCA循環(huán)除了產(chǎn)生提供大量能量,還有以下功能:
①
TCA循環(huán)中的中間代謝產(chǎn)物是一些重要的細(xì)胞物質(zhì)如各種氨基酸、嘌呤、嘧啶和脂類(lèi)等生物合成前體物,這存在于各種生物體中的重要生物化學(xué)反應(yīng),它在多數(shù)異養(yǎng)微生物的氧化代謝中起關(guān)鍵作用.例如乙酰CoA是脂肪酸合成的起始物質(zhì);4.三羧酸循環(huán)(tricarboxylicacidcycle)現(xiàn)在是16頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四②
TCA環(huán)是糖類(lèi)有氧降解的主要途徑,也是脂肪、蛋白質(zhì)降解的必經(jīng)途徑。例如脂肪酸經(jīng)β-氧化途徑生成乙酰CoA可進(jìn)入TCA環(huán)徹底氧化成CO2和H20;如丙氨酸、天門(mén)冬氨酸、谷氨酸等經(jīng)脫氨基作用后,可分別形成丙酮酸、草酰乙酸、α-酮戊二酸等,它們都可進(jìn)入TCA環(huán)被徹底氧化。
TCA環(huán)實(shí)際上是微生物細(xì)胞內(nèi)各類(lèi)物質(zhì)的合成和分解代謝的中心樞紐?,F(xiàn)在是17頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四應(yīng)用用誘變育種等方法阻止某一代謝支路的進(jìn)行,就必然異常積累某些中間產(chǎn)物。據(jù)此,發(fā)酵工業(yè)上已篩選出優(yōu)良生產(chǎn)菌株進(jìn)行檸檬酸、異檸檬酸、α-酮戊二酸、谷氨酸、蘋(píng)果酸等的發(fā)酵。例如,利用黑曲霉生產(chǎn)檸檬酸時(shí),由于菌體內(nèi)順烏頭酸水解酶的活力極低,可積累大量檸檬酸?,F(xiàn)在是18頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(二)遞氫和受氫1.
有氧呼吸(aerobicrespiration)有氧呼吸是氧化底物時(shí),以分子氧作為最終電子受體的生物氧化過(guò)程。
脫氫酶使基質(zhì)脫氫,
通過(guò)細(xì)胞色素C將電子和氫傳遞給氧,
氧化酶使分子狀態(tài)的氧活化,成為氫受體,最終產(chǎn)物為二氧化碳和水?,F(xiàn)在是19頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(1)有氧呼吸葡萄糖糖酵解作用丙酮酸發(fā)酵有氧無(wú)氧各種發(fā)酵產(chǎn)物三羧酸循環(huán)被徹底氧化生成CO2和水,釋放大量能量。現(xiàn)在是20頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四有氧呼吸:
電子傳遞鏈;
氧分子;
(最終電子受體)呼吸作用現(xiàn)在是21頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四2.呼吸作用現(xiàn)在是22頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(電子傳遞與氧化)
糖酵解和三羧酸循環(huán)形成的NADH和FADH2
在EMP和TCA途徑中,脫下的氫或釋放出的電子經(jīng)過(guò)電子傳遞鏈的傳遞作用,最后傳遞到O2,
需氧菌和兼性菌在有氧條件下可以進(jìn)行有氧呼吸,同時(shí)釋放大量的能量??偡磻?yīng)式為:
C6H12O6+6O2+38ADP+38Pi——→6CO2+6H2O+38ATP
在電子傳遞過(guò)程中有ATP生成。
現(xiàn)在是23頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四電子傳遞鏈現(xiàn)在是24頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四電子傳遞系統(tǒng)具兩種功能:一是從電子供體接受電子(氫)并傳遞給電子受體;二是將電子傳遞過(guò)程中釋放的能量合成ATP,(又稱(chēng)氧化磷酸化)。
一分子葡萄糖通過(guò)有氧呼吸徹底氧化時(shí),可產(chǎn)生38分子ATP。
其中包含底物水平磷酸化合成,但大部分由電子傳遞磷酸化合成。
現(xiàn)在是25頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四2.無(wú)氧呼吸(anaerobicrespiration)無(wú)氧呼吸是指無(wú)機(jī)氧化物作為最終電子受體的生物氧化過(guò)程。
以無(wú)機(jī)氧化物(如NO3-、NO2-、SO42-、S2O32-、CO2等)為最終電子受體,由氧化態(tài)的無(wú)機(jī)物受氫(電子),并伴隨氧化磷酸化作用產(chǎn)生ATP。產(chǎn)生的能量較少。
有少數(shù)微生物(厭氧菌和兼性厭氧菌)
現(xiàn)在是26頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(2)無(wú)氧呼吸某些厭氧和兼性厭氧微生物在無(wú)氧條件下進(jìn)行無(wú)氧呼吸;無(wú)氧呼吸的最終電子受體不是氧,而是NO3-、NO2-、SO42-、S2O32-、CO2等無(wú)機(jī)物,或延胡索酸(fumarate)等有機(jī)物。無(wú)氧呼吸也需要細(xì)胞色素等電子傳遞體,并在能量分級(jí)釋放過(guò)程中伴隨有磷酸化作用,也能產(chǎn)生較多的能量用于生命活動(dòng)。由于部分能量隨電子轉(zhuǎn)移傳給最終電子受體,所以生成的能量不如有氧呼吸產(chǎn)生的多。現(xiàn)在是27頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是28頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(1)硝酸鹽呼吸:以硝酸鹽作為最終電子受體的生物學(xué)過(guò)程,也稱(chēng)為硝酸鹽的異化作用(Dissimilative)。只能接收2個(gè)電子,產(chǎn)能效率低;NO2-對(duì)細(xì)胞有毒;有些菌可將NO2-進(jìn)一步將其還原成N2,這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為反硝化作用:現(xiàn)在是29頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四能進(jìn)行硝酸鹽呼吸的細(xì)菌被稱(chēng)為硝酸還鹽原細(xì)菌,主要生活在土壤和水環(huán)境中,如假單胞菌、依氏螺菌、脫氮小球菌等。硝酸鹽還原細(xì)菌被認(rèn)為是一種兼性厭氧菌,無(wú)氧但環(huán)境中存在硝酸鹽時(shí)進(jìn)行厭氧呼吸,而有氧時(shí)其細(xì)胞膜上的硝酸鹽還原酶活性被抑制,細(xì)胞進(jìn)行有氧呼吸?,F(xiàn)在是30頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四反硝化作用的生態(tài)學(xué)作用:硝酸鹽還原細(xì)菌進(jìn)行厭氧呼吸土壤及水環(huán)境好氧性機(jī)體的呼吸作用氧被消耗而造成局部的厭氧環(huán)境土壤中植物能利用的氮(硝酸鹽NO3-)還原成氮?dú)舛В瑥亩档土送寥赖姆柿?。松土,排除過(guò)多的水分,保證土壤中有良好的通氣條件。反硝化作用在氮素循環(huán)中的重要作用硝酸鹽是一種容易溶解于水的物質(zhì),通常通過(guò)水從土壤流入水域中。如果沒(méi)有反硝化作用,硝酸鹽將在水中積累,會(huì)導(dǎo)致水質(zhì)變壞與地球上氮素循環(huán)的中斷。現(xiàn)在是31頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(2).硫酸鹽呼吸(sulfaterespiration)
呼吸鏈傳遞的氫交給硫酸鹽這類(lèi)末端氫受體,這是一種異化性的硫酸鹽還原作用。
微生物可在無(wú)氧條件下借呼吸鏈的電子傳遞磷酸化而獲得能量。硫酸鹽還原的最終產(chǎn)物是H2S,自然界中H2S的大多數(shù)由這一反應(yīng)產(chǎn)生。
(這與化能自養(yǎng)菌的反應(yīng)不同,因?yàn)槭茄趸袡C(jī)質(zhì))
硫酸鹽還原菌都是專(zhuān)性厭氧細(xì)菌。
現(xiàn)在是32頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(3)碳酸鹽呼吸(carbonaterespiration)
碳酸鹽呼吸有兩種類(lèi)型:一種是產(chǎn)甲烷細(xì)菌的碳酸鹽呼吸,另一種是產(chǎn)乙酸細(xì)菌的碳酸鹽呼吸,
均以CO2或重碳酸鹽作為無(wú)氧呼吸鏈的末端氫受體。它們均是一些專(zhuān)性厭氧菌?,F(xiàn)在是33頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四3.發(fā)酵(fermentation)在無(wú)氧條件下,最終電子受體是未被徹底氧化的中間產(chǎn)物。即有機(jī)物既是被的基質(zhì),又作為最終電子受體,基質(zhì)未被徹底氧化的中間產(chǎn)物。
由于發(fā)酵作用對(duì)有機(jī)物的氧化不徹底,發(fā)酵結(jié)果是積累有機(jī)物,且產(chǎn)生能量較少。
“發(fā)酵”在這里是指不需氧的產(chǎn)能代謝?,F(xiàn)在是34頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(2).廣義的發(fā)酵概念
在有氧或無(wú)氧條件下,利用好氧或兼性厭氧、厭氧微生物的新陳代謝活動(dòng),將有機(jī)物氧化轉(zhuǎn)化為有用的代謝產(chǎn)物,從而獲得發(fā)酵產(chǎn)品和工業(yè)原料的過(guò)程。
現(xiàn)在是35頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四1.發(fā)酵(fermentation)有機(jī)物氧化釋放的電子直接交給本身未完全氧化的某種中間產(chǎn)物,同時(shí)釋放能量并產(chǎn)生各種不同的代謝產(chǎn)物。有機(jī)化合物只是部分地被氧化,因此,只釋放出一小部分的能量。發(fā)酵過(guò)程的氧化是與有機(jī)物的還原偶聯(lián)在一起的。被還原的有機(jī)物來(lái)自于初始發(fā)酵的分解代謝,即不需要外界提供電子受體。呼吸作用與發(fā)酵作用的根本區(qū)別:
電子載體不是將電子直接傳遞給底物降解的中間產(chǎn)物,而是交給電子傳遞系統(tǒng),逐步釋放出能量后再交給最終電子受體?,F(xiàn)在是36頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(1)
有EMP途徑中丙酮酸出發(fā)的發(fā)酵、
在厭氧條件
有EMP途徑(糖酵解途徑)、
HMP途徑(磷酸戊糖支路)、
ED途徑、PK或HK途徑(磷酸解酮酶途徑)等。
現(xiàn)在是37頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四①乙醇發(fā)酵②乳酸發(fā)酵③丙酸發(fā)酵④混合酸發(fā)酵⑤丁二醇發(fā)酵⑥丁酸型發(fā)酵現(xiàn)在是38頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四
a.酒精發(fā)酵
a.
第一型發(fā)酵酵母菌在無(wú)氧和酸性條件下(pH3.5~4.5),
經(jīng)過(guò)EMP途徑將葡萄糖分解為丙酮酸,丙酮酸再由丙酮酸脫羧酶作用形成乙醛和CO2,乙醛作為NADH2的氫受體,在乙醇脫氫酶的作用下還原為乙醇?,F(xiàn)在是39頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四酒精發(fā)酵(fermentation)丙酮酸CO2乙醛NADHNAD+乙醇磷酸二羥基丙酮NADHNAD+磷酸甘油甘油3%的亞硫酸氫鈉(pH7)Saccharomycescerevisiae厭氧發(fā)酵(磺化羥基乙醛)現(xiàn)在是40頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四②同型乳酸發(fā)酵葡萄糖經(jīng)乳酸菌的EMP途徑,發(fā)酵產(chǎn)物只有乳酸的稱(chēng)同型乳酸發(fā)酵
進(jìn)行同型乳酸發(fā)酵的微生物,如乳酸乳球菌乳酸亞種、乳酸乳球菌乳脂亞種、嗜熱鏈球菌、德氏乳桿菌保加利亞亞種(舊稱(chēng)保加利亞乳桿菌)、嗜酸乳桿菌等。
現(xiàn)在是41頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四乳酸發(fā)酵廣泛應(yīng)用于食品:泡菜、酸菜、酸牛奶、乳酪以及青貯飼料等都是利用乳酸發(fā)酵的發(fā)酵制品。
由于乳酸菌的代謝活動(dòng),積累乳酸,酸化環(huán)境,抑制其他微生物的生長(zhǎng),能使蔬菜、牛奶、青貯飼料等得以保存。
近代工業(yè)多以淀粉為原料,經(jīng)糖化和德氏乳酸桿菌(L.delbrueckii)進(jìn)行乳酸發(fā)酵生產(chǎn)純?nèi)樗帷?/p>
現(xiàn)在是42頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四.混合酸發(fā)酵能積累多種有機(jī)酸的葡萄糖發(fā)酵稱(chēng)為混合酸發(fā)酵,又稱(chēng)甲酸發(fā)酵。
大多數(shù)腸道細(xì)菌,如大腸桿菌、傷寒沙門(mén)氏菌、產(chǎn)氣腸桿菌等均能進(jìn)行混合酸發(fā)酵。
先經(jīng)EMP途徑將葡萄糖分解為丙酮酸,在不同酶的作用下丙酮酸分別轉(zhuǎn)變成甲酸、乙酸、乳酸、琥珀酸、CO2和H2等。
CH3COCOOH+CoASH——→CH3COSCoA+HCOOH
丙酮酸甲酸
現(xiàn)在是43頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四腸道細(xì)菌的混合酸發(fā)酵特性對(duì)鑒定菌種有實(shí)際意義大腸桿菌在厭氧條件下可合成甲酸氫解酶,在酸性條件下(pH<6.2)將由丙酮酸裂解產(chǎn)生的甲酸分解為CO2和H2,故大腸桿菌能發(fā)酵葡萄糖產(chǎn)酸又產(chǎn)氣;
而志賀氏菌因無(wú)此酶,發(fā)酵葡萄糖只產(chǎn)酸而不產(chǎn)氣。
在菌種鑒定的生化反應(yīng)試驗(yàn)中,可通過(guò)葡萄糖發(fā)酵試驗(yàn)將是否產(chǎn)酸產(chǎn)氣的細(xì)菌區(qū)別開(kāi)來(lái)。
現(xiàn)在是44頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四混合發(fā)酵(fermentation)不同微生物發(fā)酵產(chǎn)物的不同,也是細(xì)菌分類(lèi)鑒定的重要依據(jù)。大腸桿菌:丙酮酸裂解生成乙酰CoA與甲酸,甲酸在酸性條件下可進(jìn)一步裂解生成H2和CO2產(chǎn)酸產(chǎn)氣志賀氏菌:丙酮酸裂解生成乙酰CoA與甲酸,但不能使甲酸裂解產(chǎn)生H2和CO2產(chǎn)酸不產(chǎn)氣現(xiàn)在是45頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是46頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是47頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四1.發(fā)酵(fermentation)大腸桿菌:產(chǎn)氣氣桿菌:V.P.試驗(yàn)陽(yáng)性甲基紅試驗(yàn)陰性V.P.試驗(yàn)陰性甲基紅試驗(yàn)陽(yáng)性現(xiàn)在是48頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四產(chǎn)氣腸桿菌也能進(jìn)行混合酸發(fā)酵,不過(guò)分解葡萄糖產(chǎn)生的丙酮酸又可縮合、脫羧生成乙酰甲基甲醇(3-羥基丁酮),后者還原成2,3-丁二醇。
乙酰甲基甲醇在堿性環(huán)境中易被氧化成二乙酰,二乙酰與蛋白胨中的精氨酸的胍基作用,生成紅色化合物。
故產(chǎn)氣腸桿菌V.P(VogesProskauertest)試驗(yàn)陽(yáng)性。若加入-萘酚和少量肌酸或肌酐可促進(jìn)此反應(yīng)進(jìn)行。
而大腸桿菌無(wú)此反應(yīng),V.P試驗(yàn)陰性,故可與產(chǎn)氣腸桿菌區(qū)別。現(xiàn)在是49頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四大腸桿菌發(fā)酵葡萄糖,由于產(chǎn)酸較多pH降至4.2以下,發(fā)酵液中加入甲基紅指示劑呈紅色;
產(chǎn)氣腸桿菌發(fā)酵葡萄糖,由于產(chǎn)酸少,加入甲基紅指示劑,發(fā)酵液呈橙黃色,這就是甲基紅試驗(yàn)。
在食品衛(wèi)生檢驗(yàn)時(shí)常以大腸桿菌、產(chǎn)氣腸桿菌等的存在作為糞便污染食品指示菌,故甲基紅試驗(yàn)、V.P試驗(yàn)均是腸道細(xì)菌常用的鑒定方法現(xiàn)在是50頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(2).通過(guò)HMP途徑的發(fā)酵——異型乳酸發(fā)酵
①異型乳酸發(fā)酵的經(jīng)典途徑某些乳酸細(xì)菌進(jìn)行異型乳酸發(fā)酵過(guò)程中分解己糖和戊糖的途徑。
該途徑的特征性酶是磷酸解酮酶。
根據(jù)解酮酶的不同,
將具有磷酸戊糖解酮酶的途徑叫PK途徑,
具有磷酸己糖解酮酶的途徑叫HK途徑。(略)現(xiàn)在是51頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四異型乳酸發(fā)酵發(fā)酵后除生成乳酸外,還有乙醇(或乙酸)和CO2等多種發(fā)酵產(chǎn)物。
一些短乳桿菌(Lactibacillusbrevis)、發(fā)酵乳桿菌(L.fermentum)、兩歧雙歧桿菌(Bifidobacteriumbifidum)、腸膜明串珠菌(Leuconostocmesenteroides)、乳脂明串珠菌(L.cremoris)、根霉(Rhizopus)等進(jìn)行異型乳酸發(fā)酵。
因它們?nèi)狈MP途徑中的關(guān)鍵性酶——果糖二磷酸醛縮酶和異構(gòu)酶,其葡萄糖的降解完全依賴(lài)HMP途徑?,F(xiàn)在是52頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四磷酸解酮酶途徑
某些乳酸細(xì)菌進(jìn)行異型乳酸發(fā)酵過(guò)程中分解己糖和戊糖的途徑。
該途徑的特征性酶是磷酸解酮酶。
根據(jù)解酮酶的不同,
將具有磷酸戊糖解酮酶的途徑叫PK途徑,
具有磷酸己糖解酮酶的途徑叫HK途徑。(略)現(xiàn)在是53頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是54頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四②異型乳酸發(fā)酵的雙歧途徑兩歧雙歧乳酸桿菌(Bifidobacteriumbifidum)、雙叉乳酸桿菌(Lactobacillusbifidum)等雙歧桿菌對(duì)葡萄糖的代謝也可歸入異型乳酸發(fā)酵,但與其他乳酸菌異型發(fā)酵不同。
它們通過(guò)HK途徑將2分子葡萄糖發(fā)酵產(chǎn)生2分子乳酸和3分子乙酸,并產(chǎn)生5分子ATP,總反應(yīng)式為:
C6H12O6+5ADP+5Pi———→2CH3CHOHCOOH+3CH3COOH+5ATP現(xiàn)在是55頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四兩歧雙歧乳酸桿菌(Bifidobacteriumbifidum)、雙叉乳酸桿菌(Lactobacillusbifidum)等雙歧桿菌對(duì)葡萄糖的代謝也可歸入異型乳酸發(fā)酵,但與其他乳酸菌異型發(fā)酵不同。
它們通過(guò)HK途徑將2分子葡萄糖發(fā)酵產(chǎn)生2分子乳酸和3分子乙酸,并產(chǎn)生5分子ATP,總反應(yīng)式為:
C6H12O6+5ADP+5Pi———→2CH3CHOHCOOH+3CH3COOH+5ATP雙歧途徑現(xiàn)在是56頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(3)通過(guò)ED途徑進(jìn)行的發(fā)酵它是少數(shù)缺乏完整EMP途徑的細(xì)菌所特有的利用葡萄糖的替代途徑。
現(xiàn)在是57頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四◆在Stickland反應(yīng)中,一種氨基酸作為氫供體氧化脫氨,另一種氨基酸作為氫受體還原脫氨,生成相應(yīng)的有機(jī)酸、-酮酸和氨。◆這是氧化脫氨與還原脫氨相偶聯(lián)的特殊發(fā)酵。丙氨酸、纈氨酸、異亮氨酸、亮氨酸等為氫供體。甘氨酸、羥脯氨酸、脯氨酸和鳥(niǎo)氨酸等為氫受體。例如:CH3CHNH2COOH+2
CH2NH2COOH→3CH3COOH+3NH3+CO2
丙氨酸甘氨酸乙酸
(氫供體)(氫受體)(4)由氨基酸發(fā)酵產(chǎn)能---Stickland反應(yīng)現(xiàn)在是58頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四(5)發(fā)酵中的產(chǎn)能反應(yīng)底物磷酸化(自學(xué))現(xiàn)在是59頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四四、自養(yǎng)微生物的生物氧化
在化能無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)型的微生物中,其所需能量ATP是通過(guò)還原態(tài)無(wú)機(jī)物經(jīng)過(guò)生物氧化產(chǎn)生的,
還原力[H]是通過(guò)耗ATP的無(wú)機(jī)氫(H++e)逆呼吸鏈傳遞而產(chǎn)生;
在光能自養(yǎng)微生物中,其ATP和還原力[H]都是通過(guò)循環(huán)光合磷酸化、非循環(huán)光合磷酸化或通過(guò)紫膜光合磷酸化而獲得?,F(xiàn)在是60頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四1.化能自養(yǎng)微生物的生物氧化
氧化無(wú)機(jī)物獲得能量,對(duì)自然界的物質(zhì)轉(zhuǎn)化起重要作用。
它們分別屬于氫細(xì)菌、硫細(xì)菌、鐵細(xì)菌和硝化細(xì)菌。
現(xiàn)在是61頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四第二節(jié)微生物產(chǎn)能代謝三.自養(yǎng)微生物的生物氧化化能無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)型:從無(wú)機(jī)物的氧化獲得能量以無(wú)機(jī)物為電子供體這些微生物一般也能以CO2為唯一或主要碳源合成細(xì)胞物質(zhì)自養(yǎng)微生物從對(duì)無(wú)機(jī)物的生物氧化過(guò)程中獲得生長(zhǎng)所需要能量的微生物一般都是:化能無(wú)機(jī)自養(yǎng)型微生物現(xiàn)在是62頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四復(fù)雜分子(有機(jī)物)分解代謝合成代謝簡(jiǎn)單小分子ATP[H]自養(yǎng)微生物的合成代謝:
將CO2先還原成[CH2O]水平的簡(jiǎn)單有機(jī)物,然后再進(jìn)一步合成復(fù)雜的細(xì)胞成分。化能異養(yǎng)微生物:ATP和還原力均來(lái)自對(duì)有機(jī)物的生物氧化化能自養(yǎng)微生物:無(wú)機(jī)物氧化過(guò)程中主要通過(guò)氧化磷酸化產(chǎn)生ATP如果作為電子供體的無(wú)機(jī)物的氧化還原電位足夠低,也在氧化磷酸化的過(guò)程中產(chǎn)生還原力,但大多數(shù)情況下都需要通過(guò)電子的逆向傳遞,以消耗ATP為代價(jià)獲得還原力。現(xiàn)在是63頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四硝化細(xì)菌氨的氧化是由硝化細(xì)菌完成。
硝化細(xì)菌是一些專(zhuān)性好氧的G+菌,大多數(shù)是專(zhuān)性無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)型。
硝化細(xì)菌有兩種,一是亞硝酸細(xì)菌,
另一則硝酸細(xì)菌。
這些細(xì)菌在自然界的氮素循環(huán)中起重要作用。它們使自然界中的氨氧化為亞硝酸,進(jìn)一步轉(zhuǎn)化成硝酸,被稱(chēng)為硝化作用。
現(xiàn)在是64頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四亞硝酸細(xì)菌利用氨氧化成亞硝酸的過(guò)程中放出的能量,使CO2還原成有機(jī)物,這類(lèi)細(xì)菌形成的亞硝酸對(duì)生物是有毒的。亞硝酸細(xì)菌:NH4++3/2O2———→NO2-+H2O+2H++270.7kJ
硝酸細(xì)菌利用亞硝酸氧化成硝酸的氧化過(guò)程中釋放的能量來(lái)同化CO2。
硝酸細(xì)菌:NO2-+1/2O2———→NO3-+77.4kJ
現(xiàn)在是65頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四硝化細(xì)菌NH3、亞硝酸(NO2-)等無(wú)機(jī)氮化物可以被某些化能自養(yǎng)細(xì)菌用作能源亞硝化細(xì)菌:硝化細(xì)菌:將氨氧化為亞硝酸并獲得能量將亞硝氧化為硝酸并獲得能量這兩類(lèi)細(xì)菌往往伴生在一起,在它們的共同作用下將銨鹽氧化成硝酸鹽,避免亞硝酸積累所產(chǎn)生的毒害作用。這類(lèi)細(xì)菌在自然界的氮素循環(huán)中也起者重要的作用,在自然界中分布非常廣泛?,F(xiàn)在是66頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四氨的氧化亞硝化細(xì)菌:硝化細(xì)菌:現(xiàn)在是67頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四三.自養(yǎng)微生物的生物氧化氨的氧化NH3、NO2-的氧化還原電勢(shì)均比較高,以氧為電子受體進(jìn)行氧化時(shí)產(chǎn)生的能量較少,而且進(jìn)行合成代謝所需要的還原力需消耗ATP進(jìn)行電子的逆呼吸鏈傳遞來(lái)產(chǎn)生,因此這類(lèi)細(xì)菌生長(zhǎng)緩慢,平均代時(shí)在10h以上?,F(xiàn)在是68頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四非循環(huán)磷酸化是各種綠色植物、藻類(lèi)和藍(lán)細(xì)菌所共有的利用光能產(chǎn)生ATP的磷酸化反應(yīng)。高等植物和藍(lán)細(xì)菌主要通過(guò)非循環(huán)式磷酸化作用產(chǎn)生ATP、O2和NADPH2。
特點(diǎn)是:①電子傳遞途徑為非循環(huán)式;
②在有氧條件下進(jìn)行;
③有兩個(gè)光合系統(tǒng),其中的色素系統(tǒng)Ⅰ(含葉綠素a)可以利用紅光,色素系統(tǒng)Ⅱ(含葉綠素b)可以利用藍(lán)光;
④反應(yīng)同時(shí)有ATP(產(chǎn)自系統(tǒng)Ⅰ)、還原力[H](產(chǎn)自系統(tǒng)Ⅱ)和O2產(chǎn)生。
⑤還原力NADPH2中的[H]是來(lái)自H2O分子光解后的H+和e-。
1.非循環(huán)磷酸化(二)光能營(yíng)養(yǎng)微生物現(xiàn)在是69頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四非環(huán)式光合磷酸化的反應(yīng)式:2NADP++2ADP+2Pi+2H2O→2NADPH+2H++2ATP+O21非環(huán)式光合磷酸化產(chǎn)氧型光合作用(綠色植物、藍(lán)細(xì)菌)現(xiàn)在是70頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四2.環(huán)式光合磷酸化光合細(xì)菌主要通過(guò)環(huán)式光合磷酸化作用產(chǎn)生ATP不是利用H2O,而是利用還原態(tài)的H2、H2S等作為還原CO2的氫供體,進(jìn)行不產(chǎn)氧的光合作用;電子傳遞的過(guò)程中造成了質(zhì)子的跨膜移動(dòng),為ATP的合成提供了能量。通過(guò)電子的逆向傳遞產(chǎn)生還原力;現(xiàn)在是71頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四2.循環(huán)光合磷酸化循環(huán)磷酸化是指在光驅(qū)動(dòng)下通過(guò)電子的循環(huán)式傳遞而完成的磷酸化,
其特點(diǎn)是:①在光能的驅(qū)使下,電子從葉綠素分子上逐出后,通過(guò)類(lèi)似于呼吸鏈的循環(huán),又回到葉綠素,其間產(chǎn)生了ATP;
②產(chǎn)ATP與產(chǎn)還原力[H]分別進(jìn)行;
③還原力來(lái)自H2S等的無(wú)機(jī)氫供體;
④不產(chǎn)生氧。光合細(xì)菌主要通過(guò)循環(huán)式光合磷酸化作用產(chǎn)生ATP,此類(lèi)細(xì)菌主要包括紫色硫細(xì)菌、綠色細(xì)菌、紫色非硫細(xì)菌和綠色非硫細(xì)菌。
現(xiàn)在是72頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四現(xiàn)在是73頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四四.能量轉(zhuǎn)換3.嗜鹽菌紫膜的光合作用一種只有嗜鹽菌才有的,無(wú)葉綠素或細(xì)菌葉綠素參與的獨(dú)特的光合作用。嗜鹽菌細(xì)胞膜紅色部分(紅膜)紫色部分(紫膜)主要含細(xì)胞色素和黃素蛋白等用于氧化磷酸化的呼吸鏈載體在膜上呈斑片狀(直徑約0.5mm)獨(dú)立分布,其總面積約占細(xì)胞膜的一半,主要由細(xì)菌視紫紅質(zhì)組成。四種生理類(lèi)型的微生物在不同光照和氧下的ATP合成實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在波長(zhǎng)為550-600nm的光照下,嗜鹽菌ATP的合成速率最高,而這一波長(zhǎng)范圍恰好與細(xì)菌視紫紅質(zhì)的吸收光譜相一致?,F(xiàn)在是74頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四四.能量轉(zhuǎn)換3、光合磷酸化(photophosphorylation)(3)嗜鹽菌紫膜的光合作用紫膜的光合磷酸化是迄今為止所發(fā)現(xiàn)的最簡(jiǎn)單的光合磷酸化反應(yīng)現(xiàn)在是75頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四一、兩用代謝途徑
凡在分解代謝和合成代謝中均具有功能的代謝途徑,稱(chēng)為兩用代謝途徑(amphibolicpathway)。EMP、HMP和TCA循環(huán)等都是重要的兩用途徑。例如:葡糖異生作用(gluconeogenesis)。第二節(jié)分解代謝與合成代謝的聯(lián)系現(xiàn)在是76頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四①在兩用代謝途徑中,合成途徑并非分解途徑的完全逆轉(zhuǎn)。②在分解代謝與合成代謝途徑的相應(yīng)代謝步驟中,包含了完全不同的中間代謝物。③在真核生物中,合成代謝和分解代謝一般在細(xì)胞的不同區(qū)域中分隔進(jìn)行;原核生物因其細(xì)胞結(jié)構(gòu)上的間隔程度低,故反應(yīng)的控制主要在簡(jiǎn)單的酶分子水平上進(jìn)行?,F(xiàn)在是77頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四分解代謝與合成代謝的關(guān)系圖現(xiàn)在是78頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四二.
回補(bǔ)途徑(replenishmentpathway)
三羧酸循環(huán)是產(chǎn)能反應(yīng)和生物合成的重要代謝環(huán)節(jié),作為電子的供體和碳骨架,此外,通過(guò)TCA四碳、五碳、六碳酸均可在有氧環(huán)境下被微生物利用,通過(guò)氧化磷酸化產(chǎn)生能量。
若將三羧酸循環(huán)中的有機(jī)酸分子移去而用于生物合成將會(huì)影響三羧酸循,草酰乙酸在每次循環(huán)后都能再生的情況下才能進(jìn)行。
微生物可利用回補(bǔ)途徑來(lái)解決這一矛盾。
現(xiàn)在是79頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四
回補(bǔ)途徑
補(bǔ)充在兼用代謝途徑(如三羧酸循環(huán))中因合成代謝而消耗的中間代謝產(chǎn)物的反應(yīng)。
不同微生物在不同條件下具有各自的TCA回補(bǔ)途徑,主要有乙醛酸循環(huán)途徑和甘油酸途徑。
現(xiàn)在是80頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四①乙醛酸循環(huán)途徑
以乙酸作為底物,草酰乙酸將通過(guò)乙醛酸途徑再生。
這條途徑由三羧酸循環(huán)中的反應(yīng)和另外的兩種酶組成:
異檸檬酸裂解酶ICL(催化異檸檬酸裂解成琥珀酸和乙醛酸)
蘋(píng)果酸合成酶MS(將乙醛酸和乙酰輔酶A轉(zhuǎn)化為蘋(píng)果酸)。
(2)
現(xiàn)在是81頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四乙醛酸循環(huán)的生物合成途徑:
異檸檬酸被裂解成琥珀酸和乙醛酸,使琥珀酸可以進(jìn)入生物合成途徑,
而乙醛酸與乙酰輔酶A結(jié)合生成蘋(píng)果酸,后者又轉(zhuǎn)化為草酰乙酸,以維持三羧酸循環(huán)的進(jìn)行。
琥珀酸可以直接圖用于卟啉的合成,或者氧化為草酰乙酸后,作為四碳化合物碳骨架,或者用于合成葡萄糖(經(jīng)由草酰乙酸和磷酸烯醇式丙酮酸)。
乙醛酸循環(huán)較普遍存在于好氧微生物中。
細(xì)菌中的醋酸桿菌、固氮菌、大腸桿菌、產(chǎn)氣腸桿菌、脫氮副球菌、熒光假單胞菌,以及真菌中的酵母菌、黑曲霉和青霉菌等,都已證明有乙醛酸循環(huán),
它們可以利用乙酸作為唯一碳源和能源生長(zhǎng)。現(xiàn)在是82頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四在乙醛酸循環(huán)中有兩個(gè)關(guān)鍵酶——它們可使丙酮酸和乙酸等化合物合成4C二羧酸,以保證微生物正常生物合成的需要。異檸檬酸裂合酶(isocitratelyase,ICL)蘋(píng)果酸合酶(malatesynthase,MS)現(xiàn)在是83頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四第三節(jié)微生物的獨(dú)特代謝途徑舉例自學(xué)!
初級(jí)代謝與次級(jí)代謝現(xiàn)在是84頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四微生物的次生代謝微生物代謝產(chǎn)物一般可以分為兩類(lèi):
初級(jí)代謝產(chǎn)物
次級(jí)代謝產(chǎn)物現(xiàn)在是85頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四一、微生物的初級(jí)代謝及其產(chǎn)物初級(jí)代謝產(chǎn)物(primarymetabolite)
初級(jí)代謝產(chǎn)物一般屬于分解代謝或能量代謝的產(chǎn)物,如乙醇、有機(jī)酸、氨基酸等初級(jí)代謝產(chǎn)物與微生物生長(zhǎng)、繁殖密切相關(guān)。與食品有關(guān)的微生物初級(jí)代謝產(chǎn)物有酸類(lèi)、醇類(lèi)、氨基酸和維生素等。
現(xiàn)在是86頁(yè)\一共有95頁(yè)\編輯于星期四二、微生物的次級(jí)代謝及其產(chǎn)物次級(jí)代謝通過(guò)支路代謝合成一些對(duì)自身的生命活動(dòng)無(wú)明確功能的物質(zhì)的過(guò)程。通常以一簇結(jié)構(gòu)相似的化合物組成。
次級(jí)代謝產(chǎn)物的形成與微生物的生長(zhǎng)和繁殖無(wú)關(guān)。既不參與細(xì)胞的組成,又不是酶的活性基,也不是細(xì)胞的貯存物質(zhì),大
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