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文檔簡介
冰凍切片的(DIG-labeledRNAprobe)原位雜交操作程序一、
切片制備用新鮮組織制作6μm厚冰凍切片,37℃干燥1~4小時,進行下一步操作。二、
預(yù)雜交前處理預(yù)固定:4%PFA(inDEPC-PBSPh7.4)RT30~60min4%PFA:多聚甲醛20g1×PBS450ml
加熱(60℃、20min)溶解冷卻后調(diào)pH至7.41×PBS→500mlPBSRT5min×210×PBS:500mlNaCl40gKCl1gKH2PO41gNa2HPO47.7gDEPC水450ml
調(diào)Ph至7.5DEPC水加至500mlPBS(含0.3%v/vTritonX-100)RT15min臨用前配制
10%TritonX-10015ml1×PBS→500mlPBSRT5min×2第1頁/共24頁第一頁,共25頁。消化:2μg/mlProteinaseKinTEbuffer37℃10minTE:
pH8.0Tris-HCl1M5mlpH8.0EDTA0.5M1mlDEPC水→500ml0.2%GlycininPBSRT5min×2
(50xDenhart’s;
Ficoll400聚蔗糖1g后固定:4%PFAinPBSRT15minPVP聚乙烯基吡咯烷酮1g
BSA牛血清白蛋白1g
DEPC水100ml)
PBSRT3min×2
0.1
M三乙醇胺(TEA)/0.25%乙酸酐RT5min×2
0.1M三乙醇胺:三乙醇胺2.64mlDEPC水200ml
用前加入乙酸酐500μlPBSRT5min×2第2頁/共24頁第二頁,共25頁。三、
預(yù)雜交預(yù)雜交
50℃2h預(yù)雜交液:50%去離子甲酰胺
5×SSC5×Denhardt’s0.02%SDS0.1mg/mltRNA四、
雜交雜交
50℃12h以上第3頁/共24頁第三頁,共25頁。
五、
雜交后處理2×SSC脫去蓋膜(片)50℃2×SSC清洗37℃10min×220μg/mlRNaseAinRnsaebuffer37℃30minRnsaebuffer;2MTris5ml0.25MEDTA4ml3MnaCl167mlpH8.0DW→1000mlRnasebuffer37℃30min
2×SSC50℃15min×2
1×SSC(含0.02%SDS)37℃15min×25%SDS2ml
1×SSC500ml0.1×SSC37℃15min×2
第4頁/共24頁第四頁,共25頁。BufferⅠ37℃10min×2BufferⅠ:2MTris-HClPh7.625ml3MNaCl25mlD.W.→500ml封閉;0.5%抗體阻斷液inBufferⅠ(含0.2%Tween20)
37℃20min抗體阻斷液:
(1:500抗地高辛抗體in阻斷液37℃2h)阻斷劑1gTween-200.4ml
BufferⅠ37℃10min×2BufferⅠ200ml
BufferⅡ37℃10min×2第5頁/共24頁第五頁,共25頁。
顯色;BufferⅡ:2MTris10ml(1:50NBT/BCIPStockSolutioninBufferⅡ2~24h)3MNaCl6.67ml
MgCl22.033g(濕合、避光)
D.W.180ml
濃HCl調(diào)pH至9.5D.W.→200ml終止反應(yīng):
BufferⅢRT5min×2
流水沖洗
5-10min
1%甲基綠復(fù)染3-10min,
水洗,晾干,封固第6頁/共24頁第六頁,共25頁。DNA探針檢測石蠟
切片中DNA第7頁/共24頁第七頁,共25頁。組織標(biāo)本肝穿刺組織,常規(guī)石蠟包埋,4m連續(xù)石蠟切片,貼在涂有切片粘合劑的干凈載玻片上,58℃烤18h。第8頁/共24頁第八頁,共25頁。試劑1.20×SSC2.HBVcDNA-Dig探針5g3.4%多聚甲醛4.0.1mol/LPBS,pH7.45.0.2mmol/LHCl和0.1mol/L甘氨酸PBSpH7.46.0.4%TritorX-100PBSpH7.47.蛋白酶
20g/ml8.0.25%乙酸酐,用0.1mol/L三乙醇胺配制9.預(yù)雜交緩沖液和雜交緩沖液10.AKP標(biāo)記抗DigFab段二抗,可1:500稀釋11.TSM、TSM2(配制參閱附錄4)12.NBT和BCIP顯色液或用AKP顯色Kit
第9頁/共24頁第九頁,共25頁。操作流程雜交前處理預(yù)雜交雜交雜交后漂洗雜交后檢測結(jié)果判斷第10頁/共24頁第十頁,共25頁。雜交前處理1.石蠟切片常規(guī)脫蠟至水2.0.02MpH7.4PBS洗3×3min3.0.2MHCI20min室溫(除去蛋白)4.2×SSC(內(nèi)含5MEDTA)50℃洗30min5.蛋白酶
2g/ml37℃20min6.0.1M甘氨酸PBS洗10min室溫,中止酶反應(yīng)7.4%多聚甲醛,20min室溫8.PBS洗3×3min9.75%,85%,95%和無水乙醇各2min第11頁/共24頁第十一頁,共25頁。預(yù)雜交和雜交
加預(yù)雜交液20l/每片,42℃2h。
加雜交液10~20ul/每片(內(nèi)含HBV-cDNADig標(biāo)記探針4g/ml),加蓋硅化玻片,將切片置于95℃10min,使探針和靶病毒DNA雙鏈打開(變性),然后迅速置于冰上5min,再將切片置于盛有2×SSC濕合內(nèi),42℃雜交過夜(12~16h)。第12頁/共24頁第十二頁,共25頁。雜交后漂洗1.將切片置于2×SSC液內(nèi)振動移去蓋片2.2×SSC洗2×10min,55℃3.0.5×SSC2×5min,50℃4.PBS洗3×3min5.10%醋酸20min室溫,阻斷內(nèi)源性堿性磷酸酶6.PBS洗3×3min第13頁/共24頁第十三頁,共25頁。信號放大和顯示1.1:500稀釋AKP標(biāo)記抗Dig二抗,37℃4h,或4℃過夜2.PBS洗3×3min3.TSM1洗2×5min4.TSM2洗2×5min5.顯色液在1mlTSM2中加入4.5lNBT,3.5l,BCIP
混合后,顯色30min~12h,中間不斷觀察6.TSM2洗,PBS洗3×3min,核固紅或甲基綠襯染7.蒸鎦水洗,系列乙醇脫水,二甲苯透明,樹脂封片第14頁/共24頁第十四頁,共25頁。結(jié)果判斷
第15頁/共24頁第十五頁,共25頁。ISH流程探針合成組織細胞標(biāo)本的準(zhǔn)備ISH試劑的配制操作流程第16頁/共24頁第十六頁,共25頁。探針1、根據(jù)文獻報道合成PCR引物一對。
2、PCR擴增:用高保真DNA聚合酶進行PCR擴增。第17頁/共24頁第十七頁,共25頁。3、將PCR擴增產(chǎn)物亞克隆入pGEM2Z質(zhì)粒(EcoRI和ACCI酶切位點),在大腸桿菌中擴增,純化。原理:PGEM3質(zhì)粒購于promega公司,含有位于pUc19MCS側(cè)面的SP6和T7RNA聚合酶啟動子,在將所需序列插入MCS后,一個簡單的基于lacZα-肽滅活的顏色選擇方案將促進重組體的篩選。在體外,將SP6或T7RNA聚合酶加入到含有標(biāo)記物的三磷酸核苷前體的轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)中,可允許從任何一方向產(chǎn)生多拷貝DNA插入序列的標(biāo)記RNA探針。第18頁/共24頁第十八頁,共25頁。4、
利用Roche生產(chǎn)的體外轉(zhuǎn)錄標(biāo)記RNAkit(Cat.No999644)操作流程參閱《原位檢測技術(shù)》p132-133。第19頁/共24頁第十九頁,共25頁。
組織細胞標(biāo)本的準(zhǔn)備
ISH試劑的配制(所有試劑和用具均用DEPC水處理)第20頁/共24頁第二十頁,共25頁。操作流程11、活細胞經(jīng)4%多聚甲醛固定20min,室溫,PBS
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