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文檔簡介
第五章方差分析ANOVA(analysis
of
variance)第一節(jié)
方差分析的基本原理
?
方差分析的基本特點是:將所有處理的觀察值和平均數(shù)作
為一個整體加以考慮,把觀察值總變異的自由度和平方和
分解為不同變異來源的自由度和平方和,進而獲得不同變
異來源的總體方差估計值。
通過計算這些總體方差的估計值的適當比值,就能檢驗各樣本所屬總體平均數(shù)是否相等。?
方差分析實質(zhì)上是關(guān)于觀測值變異原因的數(shù)量分析,它在
科學研究中應用十分廣泛。第一節(jié)
方差分析的基本原理方差分析的優(yōu)點:不受比較組數(shù)的限制,可比較多組均數(shù)可同時分析多個因素的作用可分析因素間的交互作用第一節(jié)
方差分析的基本原理相關(guān)術(shù)語:試驗指標(experimental
index):
為衡量試驗結(jié)果的好壞或處理效應的高低,在試驗中具體測定的性狀或觀測的項目稱為試驗指標。由于試驗目的不同,選擇的試驗指標也不相同。試驗因素(experimental
factor)
試驗中所研究的影響試驗指標的因素叫試驗因素。當試驗中考察的因素只有一個時,稱為單因素試驗;若同時研究兩個或兩個以上的因素對試驗指標的影響時,則稱為兩因素或多因素試驗。第一節(jié)
方差分析的基本原理因素水平(level
of
factor)
試驗因素所處的某種特定狀態(tài)或數(shù)量等級稱為因素水平,簡稱水平。試驗處理(treatment)
事先設計好的實施在試驗單位上的具體項目叫試驗處理。在單因素試驗中,實施在試驗單位上的具體項目就是試驗因素的某一水平。在多因素試驗中,實施在試驗單位上的具體項目是各因素的某一水平組合。試驗單位(experimental
unit)
在試驗中能接受不同試驗處理的獨立的試驗載體叫試驗單位。重復(repetition)
在試驗中,將一個處理實施在兩個或兩個以上的試驗單位上,稱為處理有重復。
第一節(jié)
方差分析的基本原理試驗效應(experiment
effect)
:試驗因素對試驗指標所起
的增加和減少的作用。簡單效應(simple
effect)
:同一因素內(nèi)兩種水平間試驗指
標的差數(shù)。主要效應(main
effect)
:一個因素內(nèi)各簡單效應的平均數(shù),
又稱平均效應,簡稱主效。交互作用
(interaction
effect)
:
兩個因素簡單效應間的
平均差異稱為交互作用效應,簡稱互作。它反映一個因素
的各個水平在另一因素的不同水平中反應不一致的現(xiàn)象。第一節(jié)
方差分析的基本原理
2×2試驗數(shù)據(jù)表(解釋各種效應)試驗因素NIP水平
P1N110N216平均
13N2-N1
6P21824216平均14206IIPP2-P1
水平
P1
8N110
8N216
8平均
130,0/2=0
N2-N1
6P218282110平均14228IIIPP2-P1
水平
P1
8N11012N216
10平均
134,4/2=2
N2-N1
6P21820192平均14184P2-P1846-4,-4/2=-2第一節(jié)
方差分析的基本原理
自由度和平方和的分解:
[例5.1]以A、B、C、D4種藥劑處理水稻種子,其中A為對照,每處理各得4個苗高觀察值(cm),試分解其自由度和平方和。藥劑苗高觀察值總和Ti平均數(shù)ABCD18201028212415272026172913221432
72
92
5611618231429T=336=21=
182
+
212
++
322
?
=
602第一節(jié)
方差分析的基本原理
自由度和平方和的分解:
1、總變異把表中的全部觀察值作為一個組看待[即把4個處理(4組、每組有4個觀察值)合并成一組,共有24個觀察值],根據(jù)前面講過的計算平方和的公式
,可以計算出總變異的平方和和自由度SST
=(y
i
?
y)2
=y2
?3362
4×4(∑
y)2
nk∑∑自由度DFT=nk-1=4×4-1=15。∑∑第一節(jié)
方差分析的基本原理
自由度和平方和的分解:
2、誤差效應
?
表中處理內(nèi)(組內(nèi))各觀察值之間,若不存在誤差,則各觀察值應該相等,由于誤差是客觀存在的,因而處理內(nèi)(組內(nèi))各觀察值之間必然是有差異的,因此,可以用組內(nèi)(處理內(nèi))的差異度量誤差效應:k
n1
1SSe
=(yij
?
yi)2
=
38+
20+
26+14
=
98
每個組內(nèi)(處理內(nèi))的自由度為:n
-1=4-1=3所以誤差的自由度為:DFe=k(n-1)=4(4-1)=12∑
?C,Ti2=
n∑(ySSt
i
?
y)
=2k1
nDFt
=
(k
?1)本例中平方和:
602=504+98自由度:15=3+12因此誤差平方和可以采用簡單的辦法計算SSe=SST-SSt=602-504=98。第一節(jié)
方差分析的基本原理
自由度和平方和的分解:
3、處理效應
?
如果沒有處理效應,表中各個處理(組)平均數(shù)
yi
從理論上
講均應該相等,
因此可以用
y
來度量處理效應。s168.00=
=
20.56s8.17第一節(jié)
方差分析的基本原理
F
分布與F
檢驗
?
在一個平均數(shù)為μ、方差為σ2的正態(tài)總體中隨機抽取兩
個獨立樣本,將其均方的比值定義為F.
21
212)F(df1,df=1.0f(F)0.80.20.40.60.0F
分布?
F
分布是具平均數(shù)
μF=1和取值區(qū)間
為[0,
∞]的一組曲
線;而某一特定
曲線的形狀僅決
定于參數(shù)df1和df2。01234Fdf=2,df=5df=8,df=20df=4,df=10和s
彼此獨立。F
檢驗
?
在方差分析的體系中,F(xiàn)
檢驗可用于檢測某項變異因素
的效應或方差是否存在。所以在計算F值時,總是將要檢
驗的那一項變異因素的均方作分子,而以另一項變異(如
誤差項)作分母。
?
F
檢驗需具備的條件:
–(1)變量x遵循N(μ,σ2);–(2)s1
222查表在df1=3,df2=12時實得F=20.56>
F0.01F0.05=3.49,
F0.01=5.95
P<0.01多重比較(multiple
comparisons)?
通過平方和與自由度分解,將所估計的處理均方與誤差均
方作比較,由F檢驗推論處理間有顯著差異。但我們并不清楚那些處理間存在差異,故需要進一步做處理平均數(shù)間的比較。?
一個試驗中k個處理平均數(shù)間可能有k(k-1)/2個比較,因而這種比較是復式比較亦稱為多重比較。多重比較有多種方法,常用的有三種:最小顯著差數(shù)法(LSD法)、復極差法(q法)和Duncan氏新復極差法(SSR法)。sxi
j
x
=2se多重比較(multiple
comparisons)
?
最小顯著差數(shù)法(least
significant
difference,簡稱
LSD法),LSD法實質(zhì)上是t檢驗。其程序是:在處理間的
F檢驗為顯著的前提下,計算出顯著水平為α的最小顯著差
數(shù)
LSDα;任何兩個平均數(shù)的差數(shù)如其絕對值≥
LSDα,即
為在α水平上顯著;反之則為不顯著。2jn?LSDα
=
tαsxi
?x多重比較(multiple
comparisons)?
LSD法的t檢驗是根據(jù)兩個樣本平均數(shù)差數(shù)(k=2)的抽樣
分布提出來的,但是一組處理(k>2)是同時抽取k個樣本
的結(jié)果。抽樣理論提出k=2時與k>2時,例如k=10時其隨
機極差是不同的,隨著k的增大而增大,因而用k=2時的t
檢驗有可能夸大k=10時最大與最小兩個樣本平均數(shù)差數(shù)的
顯著性?;跇O差的抽樣分布理論,Student-Newman-
Keul提出了q檢驗或稱復極差檢驗,有時又稱SNK檢驗或
NK檢驗。se
2n多重比較(multiple
comparisons)
?
q檢驗方法是將一組k個平均數(shù)由大到小排列后,根據(jù)所比
較的兩個處理平均數(shù)的差數(shù)是幾個平均數(shù)間的極差分別確
定最小顯著極差LSRα的。q檢驗因是根據(jù)極差抽樣分布原
理,其各個比較都可保證同一個α水平。其尺度構(gòu)成為:
LSRα
=
qα,df
,Msxsx
=sxse
2不同藥劑處理水稻苗高(q法)LSRα值P234q
0.05
3.08
3.77
4.20q
0.01
4.32
5.04
5.50LSR0.05
4.40
5.39
6.01LSR0.01
6.18
7.21
7.87處理苗高平均數(shù)
差異顯著性0.05
0.01abDBAC29231814c
cAAB
BC
C不同藥劑處理水稻苗高平均數(shù)比較(q法)例5.1中==
n8.17/
4
≈
1.43多重比較(multiple
comparisons)?
q法不同秩次距M下的最小顯著極差變幅大,雖然減小了犯α錯誤的概率,但同時增加了犯β錯誤的概率。為此,D.B.Duncan(1955)提出了新復極差法,又稱最短顯著極差法(shortest
significant
ranges
SSR)。該法與q法相似,其區(qū)別在于計算最小顯著極差時不是查q表而是查SSR表,所得最小顯著極差值隨著k增大通常比q檢驗時減小。LSRα
=
SSRα,df
,Msx多重比較(multiple
comparisons)?
多重比較方法的選擇1、試驗事先確定比較的標準,凡是與對照相比較,
或與預定要比較的對象比較,一般可選用最小顯
著差數(shù)法;2、根據(jù)否定一個正確的
H0
和接受一個不正確的
H0
的相對重要性來決定。?
三種方法的顯著尺度不同,LSD法最低,SSR法次之,q
法最高。故LSD檢驗犯α錯誤的概率最大,q法最小,SSR法介于兩者之間,因此,對于試驗結(jié)論事關(guān)重大或有嚴格要求的,宜用q法;一般試驗可用SSR法。方差分析的線性數(shù)學模型?
方差分析是建立在一定的線性可加模型的基礎上的。所謂線性可加模型是指總體每一個變量可按其變異
的原因分解成若干個線性組成部分,它是方差分析的基礎。數(shù)據(jù)的線性模型可表示為:?
式中,μ為總體平均數(shù),τi為試驗處理效應,εij為隨機誤差具有N(0,σ2)。xij
=
μ
+τ
i
+εij方差分析的線性數(shù)學模型?
在以樣本符號表示時,樣本的線性組成為:xij
=
x
+
ti
+
eij?
式中,x
是μ的無偏估計值,
ti
=
(xi
?
x)
→τ
i
+
eieij
=
(xij
?
xi)
→
εij方差分析的線性數(shù)學模型在線性可加模型中,由于對τi有不同解釋產(chǎn)生了固定模型和隨機模型。一、固定模型(fixed
model)指試驗的各處理都抽自特定的處理總體,其處理效應τi=(μi-μ
)是一個固定的常量,我們的目的就在于研究τi,所測驗的假設是H0:τi=0或H0:μi=
μ。①因素的水平確定后,因素的效應即被確定。②因素的
a個水平是人為特意選擇的。③方差分析所得結(jié)論只適用于所選定的a個水平。指試驗中的各處理皆是抽自N(0,
)的一組隨機樣
τ
σ方差分析的線性數(shù)學模型二、隨機模型(random
model)本,因而處理效應τi是隨機的,它會因試驗的不同而不同;故我們的目的不在于研究τi而在于研究τi的變異度。隨機模型在遺傳、育種和生態(tài)的研究試驗方面有較廣泛的用處。①因素的水平確定之后,其效應并不固定。②因素的
a
個水平是從水平總體中隨機抽取的。③從隨機因素的
a
個水平所得到的結(jié)論,可推廣到該因素的所有水平上。2第二節(jié)
單因素方差分析方差分析的基本步驟現(xiàn)歸納如下:(一)計算各項平方和與自由度。(二)列出方差分析表,進行F檢驗。(三)若F檢驗顯著,則進行多重比較。處理
第二節(jié)
單因素方差分析根據(jù)各處理內(nèi)重復數(shù)是否相等,單因素方差分析又分為重
復數(shù)相等和重復數(shù)不等兩種情況。當重復數(shù)不等時,各項平
方和與自由度的計算,多重比較中標準誤的計算略有不同。[例5.2見教材P100例6.3]小麥種子切胚乳試驗的方差分析
小麥切胚乳試驗單株粒重(g)表
株號合計平均數(shù)12345678910Ⅰ212924222530272620425.5Ⅱ2025252329312426202124424.4Ⅲ24222825212614624.3sxse
2第二節(jié)
單因素方差分析
小麥切胚乳試驗方差分析表dfSum
SqMean
SqF
valuePr(>F)0.31760.7314groupResiduals2216.767223.7333.38310.654Total23230.510.654
8
#The
result
of
R
computing.?
如果F檢驗顯著,則需多重比較,計算n0
24×2==
n0≈1.16光照(A)
5h/d
10h/d
15h/d
25℃143,138,
120,107
96,103,
78,91
79,83,
96,98
溫度(B)
30℃101,100,
80,83
79,61,
83,59
60,71,
78,64
35℃
89,93,101,76
80,76,
61,67
67,58,
71,83
第三節(jié)
二因素方差分析具有重復觀察值的二因素方差分析
[例5.3見教材P106例6.5]
不同溫度及光照條件下某種昆蟲滯育天數(shù)(天)表
第三節(jié)
二因素方差分析具有重復觀察值的二因素方差分析
某種昆蟲滯育天數(shù)方差分析表dfSum
SqMean
SqF
valuePr(>F)Group
AGroup
B
A×B2245367.15391.1
464.92683.52695.5
116.221.934522.0326
0.95012.199e-06
***2.119e-06
***
0.4505Residuals
273303.2122.3Total3514526.3#The
result
of
R
computing.∑TsABsAB∑TsABsABsssAB第三節(jié)
二因素方差分析
二因素方差分析表變異來源dfSS固定模型
F隨機模型
F混合模型(A隨
機、B固定)F
A因素B因素a-1b-1A×B互作(a-1)(b-1)試驗誤差ab(n-1)總變異abn-12SST=?C∑
xSSASSe
=
SST
?
SSA
?
SSB
?
SSABSSB
2i?
2?
j==/bn?C/an?C2SS
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