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文檔簡介
常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及其應(yīng)用級(jí)臨床醫(yī)學(xué)第一頁,共二十五頁,2022年,8月28日概述(一)分子雜交與印跡技術(shù)在DNA復(fù)性過程中,如果將不同種類的DNA單鏈分子或RNA分子放在同一溶液中,只要兩種單鏈分子之間存在著一定程度的堿基配對(duì)關(guān)系,在適宜的條件下,就可以在不同的分子間形成雜化雙鏈。這種現(xiàn)象稱為核酸分子雜交。將各種生物大分子從凝膠轉(zhuǎn)移到一種固定基質(zhì)上的過程稱為印跡技術(shù)。第二頁,共二十五頁,2022年,8月28日(二)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)
PCR技術(shù)在基因診斷中已得到廣泛應(yīng)用。在應(yīng)用中,PCR常與其它技術(shù)如分子雜交,限制酶酶譜分析,單鏈構(gòu)象多態(tài)性檢測,限制性片段長度多態(tài)性分析,DNA序列測定等聯(lián)合應(yīng)用。(三)單鏈構(gòu)象多態(tài)性
單鏈構(gòu)象多態(tài)性(singlestrandconformationpolymorphism,sscp)檢測是一種基于單鏈DNA構(gòu)象差別來檢測點(diǎn)突變的方法,常與PCR聯(lián)合應(yīng)用,稱為PCR—SSCP技術(shù)。第三頁,共二十五頁,2022年,8月28日(四)限制酶酶譜分析基因突變可能導(dǎo)致基因上某一限制酶位點(diǎn)的丟失或其相對(duì)位置發(fā)生改變,以此酶消化待測DNA和野生型對(duì)照DNA,通過比較二者的酶切片段的長度、數(shù)量上的差異就可判斷待測DNA的突變情況。(五)DNA序列測定
DNA序列測定是進(jìn)行基因突變檢測的最直接、最準(zhǔn)確的方法,可以確定突變的部位的突變的性質(zhì)。(六)DNA芯片技術(shù)應(yīng)用DNA芯片,可以檢測基因的結(jié)構(gòu)及其突變多態(tài)性,對(duì)基因表達(dá)的情況進(jìn)行分析。第四頁,共二十五頁,2022年,8月28日第一節(jié)分子雜交與印跡技術(shù)、探針技術(shù)
第五頁,共二十五頁,2022年,8月28日一、分子雜交與印跡技術(shù)的原理第六頁,共二十五頁,2022年,8月28日在DNA變性后的復(fù)性過程中,如果將不同種類的DNA單鏈分子或RNA分子放在同一溶液中,只要兩種單鏈分子之間存在著一定程度的堿基配對(duì)關(guān)系,在適宜的條件(溫度及離子強(qiáng)度)下,就可以在不同的分子間形成雜化雙鏈(heteroduplex)。這種雜化雙鏈可以在不同的DNA與DNA之間形成,也可以在DNA和RNA分子間或者RNA與RNA分子間形成。這種現(xiàn)象稱為核酸分子雜交。核酸分子雜交(hybridization)第七頁,共二十五頁,2022年,8月28日(一)印跡技術(shù)將各種生物大分子從凝膠轉(zhuǎn)移到一種固定基質(zhì)上的過程稱為印跡技術(shù)(blotting)。第八頁,共二十五頁,2022年,8月28日分子印跡(漬)的概念。將凝膠中的DNA片段變性使其成為單鏈,然后再將一張硝酸纖維素(nitrocellulose,NC)膜放在凝膠上,上面放上吸水紙巾,利用毛細(xì)管作用原理使DNA片段轉(zhuǎn)移到NC膜上,使之成為固相化分子。載有DNA單鏈分子的NC膜就可以在雜交液與另一種帶有標(biāo)記的DNA或RNA分子(即探針)進(jìn)行雜交,具有互補(bǔ)序列的RNA或DNA結(jié)合到存在于NC膜的DNA分子上,經(jīng)放射自顯影或其他檢測技術(shù)就可以顯現(xiàn)出雜交分子的區(qū)帶。由于這種技術(shù)類似于用吸墨紙吸收紙張上的墨跡,因此稱為印跡技術(shù)。第九頁,共二十五頁,2022年,8月28日(二)探針技術(shù)第十頁,共二十五頁,2022年,8月28日
探針(probe)
一小段用同位素、生物素或熒光染料標(biāo)標(biāo)記其末端或全鏈的已知序列的多聚核苷酸,與固定在NC膜上的核苷酸結(jié)合,判斷是否有同源的核酸分子存在。因此印跡技術(shù)與探針技術(shù)往往同時(shí)使用。第十一頁,共二十五頁,2022年,8月28日
分子雜交、印跡技術(shù)、探針技術(shù)實(shí)驗(yàn)①②③目錄第十二頁,共二十五頁,2022年,8月28日二、印跡技術(shù)的類別及應(yīng)用DNA印跡技術(shù)
(Southernblotting)
RNA印跡技術(shù)
(Northernblotting)
蛋白質(zhì)的印跡分析
(Westernblotting)
第十三頁,共二十五頁,2022年,8月28日(一)DNA印跡技術(shù)(Southern印跡法)
DNA印跡技術(shù)是最經(jīng)典的基因分析方法,不但能檢出特異的DNA片段,而且能進(jìn)行定位和測定分子量,可用于:
基因的酶切圖譜分析、基因突變分析、基因組基因的定性及定量分析、限制性片段長度多態(tài)性分析(RFLP)等。為了紀(jì)念Southern先生,以其姓氏稱DNA印跡技術(shù)為Southernblotting(Southern印跡法)。第十四頁,共二十五頁,2022年,8月28日(二)RNA印跡技術(shù)(Northernblotting)
用于組織細(xì)胞中總RNA或mRNA的定性和定量分析。其基本原理與DNA印跡技術(shù)類似。第十五頁,共二十五頁,2022年,8月28日(三)蛋白質(zhì)的印跡分析(Westernblotting)
用于蛋白質(zhì)定性定量及相互作用研究。
第十六頁,共二十五頁,2022年,8月28日三種印跡技術(shù)第十七頁,共二十五頁,2022年,8月28日放射自顯影照片目錄第十八頁,共二十五頁,2022年,8月28日第二節(jié)
PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù)的原理與應(yīng)用第十九頁,共二十五頁,2022年,8月28日1993年美國科學(xué)家穆利斯(K.Mullis)因發(fā)明“聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)”法,在遺傳領(lǐng)域研究中取得突破性成就、加拿大籍英裔科學(xué)家史密斯因開創(chuàng)“寡聚核甙酸基定點(diǎn)誘變”方法而共同獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。第二十頁,共二十五頁,2022年,8月28日問題的提出?在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,并設(shè)計(jì)引物做啟動(dòng)子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。
但是,DNA聚合酶在高溫時(shí)會(huì)失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不僅操作煩瑣,而且價(jià)格昂貴。
第二十一頁,共二十五頁,2022年,8月28日發(fā)現(xiàn)耐熱DNA聚合酶—Taq酶對(duì)于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個(gè)循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時(shí)也大大降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。
第二十二頁,共二十五頁,2022年,8月28日一、PCR技術(shù)的工作原理PCR由變性--退火--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;第二十三頁,共二十五頁,2022年,8月28日③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就
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