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文檔簡介
生物化學(xué)酶的動力學(xué)張秀華酶化學(xué)之二1酶化學(xué)之二§6.4酶促反應(yīng)動力學(xué)§6.5酶的分離提純及活力測定§6.6重要的酶類§6.7酶在醫(yī)藥學(xué)上的應(yīng)用2重點掌握:酶促反應(yīng)動力學(xué)-米氏方程,溫度、pH、激活劑、抑制劑對酶促反應(yīng)速度的影響;掌握三種可逆抑制作用的動力學(xué)特點;了解:過渡態(tài)底物類似物對酶的抑制作用以及多酶體系、別構(gòu)酶、共價調(diào)節(jié)酶、同工酶、固定化酶的概念。熟悉:酶的分離提純的一般方法;酶活力、比活力的概念及其測定方法。【目的與要求】3Section4KineticsofEnzyme-CatalyzedReaction
第四節(jié)酶促反應(yīng)動力學(xué)4
酶促反應(yīng)動力學(xué)(kineticsofenzyme-catalyzedreactions)是研究酶促反應(yīng)速度及其影響因素的科學(xué)。酶促反應(yīng)的影響因素:酶的濃度、底物的濃度、pH、溫度、抑制劑和激活劑等。在探討各種因素對酶促反應(yīng)速度的影響時,通常測定其初始速度來代表酶促反應(yīng)速度,即底物轉(zhuǎn)化量<5%時的反應(yīng)速度。
5
1902年,Henri用蔗糖酶水解蔗糖的實驗中觀察到:在蔗糖酶濃度一定的條件下測定底物(蔗糖)濃度對酶反應(yīng)速度的影響,它們之間的關(guān)系呈現(xiàn)矩形雙曲線(rectangularhyperbola)。如下圖所示:一、底物濃度對酶反應(yīng)速度的影響6在底物濃度很低時,反應(yīng)速度隨底物濃度的增加而急驟加快,兩者呈正比關(guān)系,表現(xiàn)為一級反應(yīng)。
7隨著底物濃度的升高,酶逐漸被底物飽和,反應(yīng)速度不再呈正比例加快,反應(yīng)速度增加的幅度不斷下降。該階段為混合級反應(yīng)。8如果繼續(xù)加大底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為零級反應(yīng)。此時,無論底物濃度增加多大,反應(yīng)速度也不再增加,說明酶已被底物所飽和。9為解釋酶被底物飽和現(xiàn)象,德國化學(xué)家Michaelis和Menten做了大量的定量研究,積累了足夠的實驗數(shù)據(jù),提出了酶促反應(yīng)的動力學(xué)方程:10為解釋酶被底物飽和現(xiàn)象,德國化學(xué)家Michaelis和Menten做了大量的定量研究,積累了足夠的實驗數(shù)據(jù),提出了酶促反應(yīng)的動力學(xué)方程:11根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說:E+SESE+Pk2k1k3k4米氏方程是在三個假設(shè)的基礎(chǔ)上建立的:1.反應(yīng)初期,產(chǎn)物生成量極少,E+P→ES可忽略不計;2.[S]>>[E],[S]-[ES]≈[S]3.E與S迅速生成ES復(fù)合物,并達到平衡(穩(wěn)態(tài))即[ES]的生成速度等于[ES]的分解速度;(一)米氏方程12
ES的形成速度=k1[E][S]ES的分解速度=(k2+k3)[ES]
穩(wěn)態(tài)平衡下:[ES]的形成速度等于[ES]分解速度
k1[E][S]=(k2+k3)[ES]
即:[E][S]/[ES]=(k2+k3)/k1=Km
[ES]=[E][S]/KmE+SESE+Pk2k1k3k413
[ES]=[E][S]/Km恒態(tài)時[E]=[E0]
-[ES]代入上式得:
[ES]=[E0]
[S]/(Km+[S])
而酶促反應(yīng)的生成速度即是產(chǎn)物的生成速度:
V=k3[ES]=k3[E0]
[S]/(Km+[S])
=Vmax[S]/(Km+[S])其中Vmax=k3[E0]
即為酶促反應(yīng)可達到的最大反應(yīng)速度([s]很大,E全部轉(zhuǎn)為ES,[ES]=[E0],此時V=Vmax)
E+SESE+Pk2k1k3k414
Vmax指該酶促反應(yīng)的最大速度,[S]為底物濃度,Km是米氏常數(shù),VO是在某一底物濃度時相應(yīng)的反應(yīng)速度。從米氏方程可知:15當(dāng)?shù)孜餄舛群艿蜁r[S]<<Km,則V≌Vmax[S]/Km,反應(yīng)速度與底物濃度呈正比16當(dāng)?shù)孜餄舛群芨邥r[S]>>Km,此時V≌Vmax
,反應(yīng)速度達最大速度,底物濃度再增高也不影響反應(yīng)速度。17當(dāng)=
Vmax/2時,Km=[S]。因此,Km等于酶促反應(yīng)速度達最大值一半時的底物濃度。──Vmax2Vmax[S]
Km+[S]
=(二)米氏常數(shù)(Km)的意義和應(yīng)用18Km可以反映酶與底物親和力的大?。?/p>
Km
值愈大,酶與底物的親和力愈??;Km值愈小,酶與底物親和力愈大。酶與底物親和力大,表示不需要很高的底物濃度,便可容易地達到最大反應(yīng)速度。(二)米氏常數(shù)(Km)的意義和應(yīng)用Km等于酶促反應(yīng)速度達最大值一半時的底物濃度19Km
值是酶的特征性常數(shù):與酶的性質(zhì),底物和酶促反應(yīng)條件(如溫度、pH、有無抑制劑等)有關(guān),而與酶的濃度無關(guān)。酶的種類不同,Km值不同,同一種酶與不同底物作用時,Km
值也不同。各種酶的Km
值范圍很廣,大致在10-1~10-7M
之間。(二)米氏常數(shù)(Km)的意義和應(yīng)用20Km在實際應(yīng)用中的重要意義(1)判斷酶的最佳底物:如果一種酶作用于不同底物,就有幾個不同的Km值,其中Km最小對應(yīng)的底物就是酶的天然底物。如蔗糖酶既可催化蔗糖水解(Km=28mmol/L),也可催化棉子糖水解(Km=350mmol/L),兩者相比,蔗糖為該酶的天然底物。21(3)判斷反應(yīng)方向或趨勢:催化正逆反應(yīng)的酶,其正逆兩向的反應(yīng)的Km不同,如果正逆反應(yīng)的底物濃度相當(dāng),則反應(yīng)趨向于Km小對應(yīng)底物的反應(yīng)方向。(2)計算一定速度下的底物濃度:如某一反應(yīng)要求的反應(yīng)速度達到最大反應(yīng)速度的99%,則[S]=99Km22(4)反應(yīng)激活劑或抑制劑的存在:酶不僅與底物結(jié)合,也可與其他配體結(jié)合(如激活劑、抑制劑)而影響Km值。因此,若發(fā)現(xiàn)某種酶在體外測定的Km值與體內(nèi)差別較大,可以預(yù)料體內(nèi)可能存在著天然激活劑降低了Km值或抑制劑提高了Km值。
同時也可用不同物質(zhì)對Km值的影響,識別生理上有重要意義的調(diào)節(jié)物。23(三)Km的求法24(三)Km的求法25雙倒數(shù)作圖法雙倒數(shù)方程直線斜率:Km/Vmax1/V的截距:1/Vmax1/[S]的截距:-1/K26二、pH的影響與最適pH大多數(shù)酶活性受pH影響顯著,在某一pH下表現(xiàn)最大活力,高于或低于此pH,酶活力顯著下降。酶表現(xiàn)最大活力的pH稱為酶的最適PH。典型的最適pH曲線是鐘罩型曲線,但有的酶速度-pH曲線并非一定呈鐘罩型。27大多數(shù)酶的最適pH在5~8之間,但也有例外,如胃蛋白酶的最適pH約1.5,肝精氨酸酶最適pH約為9.8。一些酶的最適pH1.528
pH對酶促反應(yīng)速度的影響機理:1、pH影響酶和底物的解離:
酶活性基團的解離和底物的解離狀態(tài)都受pH影響,在某一反應(yīng)pH下,二者的解離狀態(tài)最有利于它們的結(jié)合,酶促反應(yīng)表現(xiàn)出最大活力。2、pH影響酶分子的構(gòu)象:過高或過低pH都會影響酶分子活性中心的構(gòu)象,或引起酶的變性失活。29一般來說,酶促反應(yīng)速度隨溫度的增高而加快。但當(dāng)溫度增加達到某一點后,由于酶蛋白的熱變性作用,反應(yīng)速度迅速下降,直到完全失活。三、溫度的影響與最適溫度30酶促反應(yīng)速度隨溫度升高而達到一最大值時對應(yīng)的溫度就稱為酶的最適溫度(optimumtempe-rature)。三、溫度的影響與最適溫度31溫度對酶促反應(yīng)速度的影響機理32最適溫度不是酶的特征常數(shù),因為酶的最適溫度受酶的純度、底物、激活劑、抑制劑、酶反應(yīng)時間等因素的影響。因此,酶的最適溫度與其它反應(yīng)條件有關(guān)。三、溫度的影響與最適溫度33四、酶濃度對反應(yīng)速度的影響在一定溫度和pH下,酶促反應(yīng)在底物濃度大大超過酶濃度時,反應(yīng)初速度與酶的濃度呈正比,即ν=k[E]
。34五、激活劑的影響能提高酶的活性,促使酶促反應(yīng)速度加快的物質(zhì)稱為激活劑(activator)。酶的激活劑大多數(shù)是無機離子(K+、Mg2+、Mn2+、等)。能除去抑制劑的物質(zhì)也可以稱為激活劑,如乙二胺四乙酸(EDTA)(金屬螯合劑)能除去金屬雜質(zhì)。通常,酶對激活劑有一定的選擇性,且有一定的濃度要求,一種酶的激活劑對另一種酶來說可能是抑制劑,當(dāng)激活劑的濃度超過一定的范圍時,它就成為抑制劑。
35六、抑制劑的影響凡能使酶的活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)稱為酶的抑制劑(inhibitor)。抑制劑對酶有一定的選擇性,一種抑制劑只能引起某一類或幾類酶的抑制。使酶變性失活(稱為酶的鈍化)的因素如強酸、強堿等,不屬于抑制劑。按照抑制劑的抑制作用,可將其分為不可逆抑制和可逆抑制兩大類。36抑制劑與酶分子的必需基團共價結(jié)合引起酶活性喪失,不能采用透析、超濾等方法除去抑制劑而恢復(fù)酶活力。按其作用特點,又分專一性不可逆抑制及非專一性不可逆抑制兩種。(一)不可逆抑制371.非專一性不可逆抑制抑制劑與酶分子中一類或幾類基團作用,不論是必需基團與否,皆可共價結(jié)合,由于其中必需基團也被抑制劑結(jié)合,從而導(dǎo)致酶的抑制失活。
381.非專一性不可逆抑制某些重金屬(Pb2+、Cu2+、Hg2+)能與酶分子的巰基進行不可逆結(jié)合,許多以巰基作為必需基團的酶(通稱巰基酶),會因此而遭受抑制。用二巰基丙醇或二巰基丁二酸鈉等含巰基的化合物可使酶復(fù)活。
39該抑制劑專一地作用于酶的活性中心或其必需基團,進行共價結(jié)合,從而抑制酶的活性。2.專一性不可逆抑制
40有機磷殺蟲劑能專一作用于膽堿酯酶活性中心的絲氨酸殘基,不可逆地抑制酶活性,使其失去水解乙酰膽堿(Ach)的作用,造成Ach大量蓄積,使一些以乙酰膽堿為傳導(dǎo)介質(zhì)的神經(jīng)系統(tǒng)處于過度興奮狀態(tài),引起神經(jīng)中毒癥狀。2.專一性不可逆抑制
41(二)可逆抑制作用抑制劑與酶以非共價鍵結(jié)合,用透析等物理方法除去抑制劑后,酶的活性能恢復(fù),即抑制劑與酶的結(jié)合是可逆的??赡嬉种谱饔冒ǜ偁幮砸种?、反競爭性抑制和非競爭性抑制幾種類型。
421.競爭性抑制(competitiveinhibition)抑制劑(I)和底物(S)對游離酶(E)的結(jié)合有競爭作用,互相排斥,已結(jié)合底物的ES復(fù)合體,不能再結(jié)合I。同樣已結(jié)合抑制劑的EI復(fù)合體,不能再結(jié)合S。(1)含義和反應(yīng)式43競爭性抑制44Km
(1+)+〔S〕〔I〕KiVmax〔S〕Vi=(2)競爭性抑制劑的動力學(xué)方程45
競爭性抑制劑雙倒數(shù)曲線,如下圖所示:46有I存在時,Km值增大Vmax值不變,Km/Vmax增大。Kmapp隨[I]濃度增大而增大。抑制程度取決于[I]與[S],[I]越大,則抑制作用越大;但增加[S]可使抑制作用減弱甚至消除。(3)競爭性抑制動力學(xué)特點47磺胺類藥物對二氫葉酸合成酶的競爭性抑制
對氨基苯甲酸磺胺類+二氫蝶呤啶+對氨基苯甲酸谷氨酸FH2合成酶FH248
FH2能轉(zhuǎn)變?yōu)镕H4,它是細(xì)菌合成核酸不可缺少的輔酶。由于磺胺藥是FH2合成酶的競爭性抑制劑,進而減少細(xì)菌體內(nèi)四氫葉酸的合成,使核酸合成障礙,從而抑制細(xì)菌的生長和繁殖。+二氫蝶呤啶+對氨基苯甲酸磺胺類谷氨酸FH2合成酶FH2磺胺類藥物對二氫葉酸合成酶的競爭性抑制
49磺胺藥物的抑菌作用50I和S與E的結(jié)合互不相關(guān),既不排斥,也不促進。S可與E結(jié)合,也可與EI復(fù)合體結(jié)合;I可與E結(jié)合生成EI,也可與ES復(fù)合物結(jié)合生成ESI。一旦形成ESI復(fù)合物,再不能釋放形成產(chǎn)物P。2.非競爭性抑制(non-competitiveinhibition)51非競爭性抑制動力學(xué)圖Vm[S]·v=(Km+[S])(1+[I]Ki)52非競爭性抑制動力學(xué)圖V1/Vmax1/Vmax(1+[I]/Ki)Vmax=appVmax1+[I]/Ki53Km不變,Vm減?。籏m/Vmax增大。
隨[I]的增加而減?。灰种瞥潭扰c[I]成正比,而與[S]無關(guān)。非競爭性抑制的動力學(xué)特點VmaxappVmax=appVmax1+[I]/Ki543.反競爭性抑制(uncompetitiveinhibition)反競爭性抑制劑不能與游離酶結(jié)合,
而是與ES結(jié)合成EIS,并阻止產(chǎn)物生成,稱酶的反競爭性抑制。55酶561Vi=KmVmax1〔S〕+1Vmax〔I〕Ki(1+)Vi=Vmax〔S〕〔S〕〔I〕Ki(1+)Km+反競爭性抑制動力學(xué)圖Km1-(1+Ki[I])57當(dāng)I存在時,Km和Vmax都減小,Km/Vmax不變;表觀Km和Vmax都隨[I]的增加而減小。抑制程度與[I]、[S]均成正比。反競爭性抑制的特點Vmax=appVmax1+[I]/KiKm=appKm1+[I]/Ki5859某種類似于一個酶促反應(yīng)中底物的過渡態(tài)的物質(zhì)是酶的有效抑制劑,這種物質(zhì)稱為過渡態(tài)類似物。酶的自殺底物是一類酶的天然底物的衍生物或類似物。(三)過渡態(tài)類似物與自殺底物60在自殺S的結(jié)構(gòu)中含有一種化學(xué)活性基團,當(dāng)E把它們作為底物來結(jié)合時,其潛在的化學(xué)基團能被解開或激活,并與酶的活性部位發(fā)生共價結(jié)合,使結(jié)合物停留在某種狀態(tài),從而不能分解成產(chǎn)物,酶因而致“死”,此過程稱為酶的自殺,這類底物稱為自殺底物(suicidesubstrate)。(三)過渡態(tài)類似物與自殺底物61第五節(jié)酶的分離、提純和活性測定Section5theseparation,purificationandmeasurationofactivityofenzyme62
一、酶的分離提純胞外酶:水解酶類,易收集,不必破碎細(xì)胞,緩沖液或水浸泡細(xì)胞或發(fā)酵液離心得到上清液即為含酶液。
胞內(nèi)酶:除水解酶類外的其它酶類,需破碎細(xì)胞,不同的酶分布部位不同,最好先將酶存在的細(xì)胞器分離后再破碎該細(xì)胞器,然后將酶用適當(dāng)?shù)木彌_溶液或水抽提。酶在細(xì)胞中的分布:63分離提純的原則選擇酶含量豐富的材料避免蛋白質(zhì)變性:避免強酸、強堿,低溫每一步驟,都要測定酶的總活力和比活力64每一步都要測定酶的純度(比活力)并計算純化倍數(shù)和產(chǎn)率以決定該步驟的效益和取舍。酶的比活力(純度)=活力單位數(shù)/毫克蛋白純化倍數(shù)=每次比活力/第一次比活力產(chǎn)率=(每次總活力/第一次總活力)×100%純化分離提純的步驟選材-破碎細(xì)胞-抽提-純化-保存65二、酶的活力測定(定量)
酶的活力:一般把酶催化一定化學(xué)反應(yīng)的能力稱為酶活力。
酶的活力大小的表示:在一定條件下E所催化的某一化學(xué)反應(yīng)的速度,一定量的酶制劑催化某一化學(xué)反應(yīng)速度快,活力大;反之,活力小。66酶活力單位:最適條件下,單位時間內(nèi),酶催化底物的減少量或產(chǎn)物的生成量。
1961年國際酶學(xué)委員會統(tǒng)一規(guī)定1個酶活力國際單位(1U):特定條件下,1分鐘內(nèi)生成1微摩爾/升產(chǎn)物的酶量(或轉(zhuǎn)化1微摩爾底物的酶量)。
1972年國際酶學(xué)委員會又推薦一種新單位,即Katal(Kat)單位:最適條件下,每秒鐘可使1mol/L底物轉(zhuǎn)化的酶量。即1Kat=6×107IU67第六節(jié)重要的酶類一、寡聚酶(oligomericenzyme)含有2個以上的亞基,分子量大(35000以上)??煞譃楹嗤瑏喕墓丫勖负秃煌瑏喕墓丫勖?。含不同亞基的寡聚酶的不同亞基執(zhí)行不同的功能。催化功能和底物載體的功能。68二、同工酶(isoenzyme)概念:
催化相同的化學(xué)反應(yīng),但分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。
存在于同一種屬或不同種屬,同一個體的不同組織、同一細(xì)胞的不同亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中。乳酸脫氫酶(LDH)是研究的最多的同工酶,具有多種分子組成形式:LDH5(M4)、LDH4(M3H)、LDH3(M2H2)、LDH2(MH3)、LDH1(H4)。69乳酸脫氫酶同工酶形成示意圖多肽亞基mRNA四聚體結(jié)構(gòu)基因ab乳酸脫氫酶同工酶電泳圖譜+–H4MH3M2H2M3HM4點樣線70不同組織中LDH同工酶的電泳圖譜LDH1(H4)LDH2(H3M)LDH3(H2M2)LDH4(HM3)LDH5(M4)心肌腎肝骨骼肌血清-+原點71四、調(diào)節(jié)酶
該類酶分子中有活性區(qū)和調(diào)節(jié)區(qū),其催化活力可因與調(diào)節(jié)劑的結(jié)合而改變,有調(diào)節(jié)代謝反應(yīng)的能力。分為共價調(diào)節(jié)和變構(gòu)調(diào)節(jié)。72(一)共價調(diào)節(jié)酶調(diào)節(jié)劑通過共價鍵與酶分子結(jié)合,以增減酶分子上的基團來改變酶的活性(高/低,有/無)。
常見類型磷酸化與脫磷酸化(最常見)乙?;兔撘阴;谆兔摷谆佘栈兔撓佘栈璖H與-S-S互變73變構(gòu)酶又稱為別構(gòu)酶,分子中除活性中心外,還有別構(gòu)中心(結(jié)合調(diào)節(jié)物或稱效應(yīng)劑)。變構(gòu)效應(yīng):調(diào)節(jié)物與別構(gòu)中心結(jié)合引起酶蛋白構(gòu)象變化,使酶活性中心對底物的結(jié)合和催化作用受影響(改變酶活性),從而調(diào)節(jié)酶促反應(yīng)速度。(二)變構(gòu)酶74變構(gòu)劑:凡能使酶分子發(fā)生別構(gòu)作用的物質(zhì)。變構(gòu)激活劑:酶產(chǎn)生變構(gòu)效應(yīng)后,導(dǎo)致酶激
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