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文檔簡介
第六章細(xì)菌和噬菌體的重組和連鎖本章重點(diǎn)1.細(xì)菌影印法研究。2.細(xì)菌和病毒的四種遺傳分析方法:轉(zhuǎn)化、接合、性導(dǎo)、轉(zhuǎn)導(dǎo)。3.掌握F+、F–、F'、Hfr×F–的特點(diǎn)。4.理解和掌握中斷雜交和重組作圖的原理。5.噬菌體結(jié)構(gòu)和基因重組特點(diǎn)。學(xué)時:10細(xì)菌和藍(lán)綠藻:一個線條狀或環(huán)狀染色體(單倍體結(jié)構(gòu));無典型的有絲分裂和減數(shù)分裂;染色體傳遞和重組方式與真核生物不同。E.coliT4Phage病毒:比細(xì)菌更簡單;在寄主細(xì)胞內(nèi)以集團(tuán)形式產(chǎn)生;屬于只有一條染色體的單倍體。第一節(jié)細(xì)菌和病毒在遺傳學(xué)
研究中的地位一、細(xì)菌:1.大?。杭?xì)胞較小、長約1~2μ
(1μ=1/1000mm)、寬約0.5μ;2.結(jié)構(gòu):鞭毛、細(xì)胞壁、質(zhì)膜、間體、核質(zhì)體、核糖體3.遺傳物質(zhì):單個主染色體、一個或多個小染色體(質(zhì)粒)4.涂布和繁殖:每個細(xì)胞在較短時間內(nèi)(如一夜)能裂殖到107個子細(xì)胞→成為肉眼可見的菌落或克隆(clone)。5.生理特性突變:①營養(yǎng)缺陷型:喪失合成某種營養(yǎng)物質(zhì)能力,不能在基本培養(yǎng)基上生長;原養(yǎng)型:野生菌株則可在基本培養(yǎng)基上生長。用不同的選擇性培養(yǎng)基測知突變的特性。②抗性突變型:如抗藥性或抗感染性。例如:青霉素(penr)抗性突變的菌落。培養(yǎng)基中加有青霉素
二、病毒:單倍體,僅一條染色體。病毒→蛋白質(zhì)外殼+核酸。病毒分類:寄主:動物、植物、細(xì)菌等;遺傳物質(zhì):DNA或RNA。煙草花葉病毒腺病毒T4噬菌體愛滋病病毒
RNA
DNA
DNA
RNA
表6-1噬菌體對于分子生物學(xué)研究具有重要意義。
三、細(xì)菌和病毒在遺傳研究中的優(yōu)越性:
1.世代周期短:大腸桿菌(E.coli)20分鐘可繁殖一代。
2.便于管理和生化分析:個體小,一般在1μ至幾μ之間,操作管理方便。3.便于研究基因突變:
裸露的DNA分子(有的病毒為RNA分子),容易受環(huán)境條件的影響而發(fā)生突變;單倍體生物,不存在顯性掩蓋隱性問題,隱性突變也能表現(xiàn)出來。
4.便于研究基因的作用:
影印培養(yǎng),易檢出營養(yǎng)缺陷型突變,有利于從生化角度來研究基因的作用。
5.便于研究基因重組:細(xì)菌具有轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和接合作用,可以進(jìn)行精密的遺傳分析。6.便于研究基因結(jié)構(gòu)、功能及調(diào)控機(jī)制:細(xì)菌和病毒的遺傳物質(zhì)簡單,易于進(jìn)行基因定位、結(jié)構(gòu)分析和分離,基因的表達(dá)調(diào)控也適于采用生理生化的方法進(jìn)行深入研究。
7.便于進(jìn)行遺傳操作:
染色體結(jié)構(gòu)簡單,沒有組蛋白和其它蛋白的結(jié)合,更宜于進(jìn)行遺傳工程的操作。四、突變型篩選
要得到特定表型的突變型,主要不是依賴使用不同的誘變劑,而是依賴于采用不同的篩選方法。
1.
糖發(fā)酵性突變株Lac-選擇:可Lac+將和Lac-涂布于伊紅-美藍(lán)(EMB)培養(yǎng)基上,Lac+可形成有金屬光澤的紫色菌落,而Lac-則形成白色菌落,因此很容易識別。
2.抗性突變體選擇:把經(jīng)過誘變處理的細(xì)胞直接涂布到含有某種噬菌體或抗菌素的培養(yǎng)基上,形成的菌落克隆就是抗性突變。
3.營養(yǎng)缺陷型突變的選擇:如選擇氨基酸營養(yǎng)缺陷型,可先把經(jīng)誘變劑,如X射線、紫外線或化學(xué)誘變劑等處理的細(xì)菌涂布在含有所有20種氨基酸的完全培養(yǎng)基上,這種培養(yǎng)基能使各種營養(yǎng)缺陷型生長,培養(yǎng)的目的是通過細(xì)胞分裂使突變型充分表現(xiàn)。
待菌落出現(xiàn)后,用印跡法(replica-platedmethod)把它們影印到基本培養(yǎng)基上鑒別出在不含任何氨基酸的培養(yǎng)基上不能生長的克隆,然后再把這一克隆培養(yǎng)到只含一種氨基酸的培養(yǎng)基上,從而判定該突變型需哪種氨基酸才能生長。
測定突變的方法──影印法:黎德伯格等(LederbergJ.和LederbergE.M.,1952)設(shè)計。LederbergJ.,1958Nobel獎獲得者,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌轉(zhuǎn)導(dǎo)和接合第二節(jié)細(xì)菌的遺傳分析
一、細(xì)菌的雜交細(xì)菌主要是無性繁殖,1946年發(fā)現(xiàn)不同品系大腸桿菌可以雜交,并進(jìn)行基因重組,從而首次發(fā)現(xiàn)了大腸桿菌也有“性別”。
命名:野生型或營養(yǎng)缺陷型:按照菌株所不能合成的物質(zhì)的前三個字母來命名,右上角標(biāo)上“+”或“-”分別代表野生型和缺陷型(突變型)??股孛舾谢蚩剐裕喝∏叭齻€字母,右上角標(biāo)上s或r,代表敏感或抗性,例如,鏈霉素敏感的寫成strs,對鏈霉素抗性的寫成strr。
不同營養(yǎng)缺陷型的大腸桿菌:
A菌株:Met-bio-thr+leu+,需加甲硫氨酸和生物素。
B菌株:Met+bio+
thr-leu-,需加蘇氨酸和亮氨酸。
*A菌株和B菌株營養(yǎng)缺陷型,不能在基本培養(yǎng)上生長。
*
A+B菌株混合培養(yǎng),在完全培養(yǎng)基上,幾小時后離心,涂布基本培養(yǎng)基上,長出原養(yǎng)型(Met+bio+thr+leu+)菌落。DemonstrationbyLederbergandTatumofgeneticrecombinationbetweenbacterialcells
這種原養(yǎng)型細(xì)胞如何出現(xiàn)?
A、B菌株分別培養(yǎng)在基本培養(yǎng)基上→一邊加壓和吸引使培養(yǎng)液充分混合→結(jié)果任何一臂的培養(yǎng)基上均未長出原養(yǎng)型細(xì)菌。
∴直接接觸(接合)是原養(yǎng)型細(xì)胞出現(xiàn)的必要條件。A菌株B菌株大分子可通過,細(xì)菌不能通過濾片U型管的實(shí)驗(yàn)(Davis,1950)
A、B菌株中都有鏈霉素敏感型(Strs)和抗鏈霉素突變型(Strr
)。在不含鏈霉素的基本培養(yǎng)基上將這兩個菌株進(jìn)行正反交,即Astrs×Bstrr與Astrr×Bstrs
,結(jié)果都可以得到原養(yǎng)型菌落;在含有鏈霉素的基本培養(yǎng)基上進(jìn)行同樣雜交時,只有Astrs×Bstrr得到原養(yǎng)型菌落,而雜交中Astrr×Bstrs未產(chǎn)生原養(yǎng)型菌落。
說明菌株A和菌株B在雜交中起著不同的作用,菌株A相當(dāng)于雄性,是遺傳物質(zhì)的供體(donor),而菌株B相當(dāng)于雌性,是遺傳物質(zhì)的受體(receptor)。
在含有鏈霉素的基本培養(yǎng)基中,Astrs×Bstrr的雜交能得到重組原養(yǎng)型菌落,因?yàn)楣w雖然對鏈霉素敏感,不能分裂,但鏈霉素并不影響供體的基因轉(zhuǎn)移。受體是對鏈霉素抗性的,所以在含有鏈霉素的培養(yǎng)基中既不影響細(xì)胞分裂,也不影響它接受外源遺傳物質(zhì)而發(fā)生重組,從而形成原養(yǎng)型菌落。
反交Astrr
×Bstrs得不到原養(yǎng)型,因?yàn)槭荏w對鏈霉素敏感,雖然供體能轉(zhuǎn)移遺傳物質(zhì),但受體細(xì)胞不能分裂,所以不能形成原養(yǎng)型菌落。
遺傳物質(zhì)是單向轉(zhuǎn)移的。海斯(HayesW.,1952)證明:接合過程是一種單向轉(zhuǎn)移,A菌株遺傳物質(zhì)→B菌株,從供體(donor)到受體(receptor)。二、F因子
1.概念
F因子(Ffactor或Felement):又稱性因子(sexfactor)或致育因子(fertilityfactor),是能夠獨(dú)立增殖的環(huán)狀DNA分子,是一種附加體。
F因子是一種封閉的環(huán)狀DNA分子,相對分子質(zhì)量約為3.5×106,全長約為6×104個bp,大約為大腸桿菌環(huán)狀染色體全長的2%。他可以以游離狀態(tài)存在于細(xì)胞質(zhì)中。攜帶F因子的菌株稱為供體菌或雄性,用F+表示。未攜帶F因子的菌株為受體菌或雌性,用F-表示。2.F因子結(jié)構(gòu)包含3個區(qū)域
(1)原點(diǎn)(origin)是轉(zhuǎn)移的起點(diǎn);(2)致育基因(fertilitygene)使它具有感染性,其中一些基因是編碼形成F纖毛(Fpilus)的蛋白質(zhì),既纖毛與F-細(xì)胞表面的受體相結(jié)合,在兩個細(xì)胞間形成細(xì)胞質(zhì)橋;
(3)配對區(qū)(pairingregion)與細(xì)菌染色體多處的核苷酸序列相對應(yīng),因此F因子可以分別地與染色體上這些同源序列配對,通過交換整合到染色體中,成為細(xì)菌染色體的一部分。3.F因子的三種狀態(tài):以大腸桿菌為例:
①沒有F因子,即F-;
②一個自主狀態(tài)F因子,即F+;
③一個整合到自己染色體內(nèi)的F因子,即Hfr。
4.自主狀態(tài)時
F因子獨(dú)立進(jìn)行分裂。
三、接合(conjugation):
1.概念:是指原核生物的遺傳物質(zhì)從供體(donor)轉(zhuǎn)移到受體(receptor)內(nèi)的過程。特點(diǎn):需通過細(xì)胞的直接接觸。Bacteriacantransferplasmids,throughconjugation2.F因子的傳遞:帶F因子的細(xì)菌較少。具有F因子的菌株可以作為供體。
∵
F因子中有形成F性傘毛(Fpilus)的基因→接合管→
F+細(xì)胞中的F因子由接合管向F-傳遞→
F-受體變成F+。
F+×F-:先形成接合管,F(xiàn)因子的DNA邊轉(zhuǎn)移邊復(fù)制,F(xiàn)-細(xì)胞F+細(xì)胞。(a)duringconjugation,thepiluspullstwobacteriatogether(b)next,abridgeformsbetweenthetwocells
低頻重組(lowfrequencyrecombination,Lfr):F+和F-之間雜交只有F因子的傳遞,而細(xì)菌染色體并不轉(zhuǎn)移,因此盡管F因子轉(zhuǎn)移頻率很高,但兩者染色體之間重組頻率很低,因此F+品系稱為~。3.Hfr細(xì)胞的形成及染色體的轉(zhuǎn)移:F因子整合到細(xì)菌染色體上(F+→Hfr細(xì)胞),其繁殖與細(xì)菌染色體同步進(jìn)行。此時,細(xì)菌基因的重組頻率增加4倍以上,∴染色體上整合有F因子的菌株,稱為Hfr菌株。
在Hfr×F-結(jié)合時,細(xì)菌染色體由一小段單鏈的F因子為前導(dǎo)而轉(zhuǎn)移到F-受體→邊進(jìn)入邊合成。一般僅小部分細(xì)菌染色體能夠轉(zhuǎn)入,接合中斷→受體細(xì)胞為F-,F(xiàn)因子仍留在供體內(nèi)。InsertionoftheFfactorintotheE.colichromosomebycrossing-over
高頻重組(highfrequencyrecombination,Hfr):F因子整合到細(xì)菌染色體中,與F-細(xì)胞接合后可以將供體染色體的一部分或全部傳遞給F-受體,當(dāng)供體和受體的等位基因帶有不同標(biāo)記時,在它們之間就可以發(fā)生重組,重組頻率可達(dá)10-2以上,故稱為Hfr品系。ThetransferofE.colichromosomemarkersmediatedbyF.4、細(xì)菌接合重組的特點(diǎn)
在接合期間,Hfr細(xì)胞和F-細(xì)胞之間的接合管常會自發(fā)斷裂,進(jìn)入的Hfr染色體也隨之?dāng)嗔眩话阏f很少有整條Hfr染色體轉(zhuǎn)入F-細(xì)胞的。所以:
(1)
F-細(xì)胞得到的只是F因子的一部分,F(xiàn)因子其余部分依賴于整條Hfr染色體的轉(zhuǎn)移。這樣在Hfr×F-雜交中選出的大多數(shù)重組子仍為F-。
(2)F-受體細(xì)胞只接受部分的供體染色體,這樣的細(xì)胞就稱為部分二倍體(partialdiploid)或稱為半合子(merozygote)。
外基因子(exogenote):在部分二倍體細(xì)胞中,供體提供的部分基因組稱為~。內(nèi)基因子(endogenote):在部分二倍體細(xì)胞中,受體提供完整的基因組,稱為~。∴受體和供體的重組就是內(nèi)基因子與外基因子之間的重組,而且這種重組不同于真核生物的完整的二倍體重組。部分二倍體:當(dāng)F+或Hfr的細(xì)菌染色體進(jìn)入F-后,在一個短時期內(nèi),F(xiàn)-細(xì)胞內(nèi)的某些位點(diǎn)就會成為二倍體DNA。部分二倍體中發(fā)生交換:
單數(shù)交換:打開環(huán)狀染色體,產(chǎn)生一個線性染色體,這種細(xì)胞是不能成活的。
偶數(shù)交換:產(chǎn)生可遺傳的重組體和片段。
①如果內(nèi)外基因子只發(fā)生單交換,則環(huán)狀染色體被破壞,形成的線狀染色體不能復(fù)制,因而含有這種線狀染色體的細(xì)胞就不能繁殖。只有偶數(shù)次的交換才能保持細(xì)菌染色體的完整性,產(chǎn)生有活性的重組子。
②偶數(shù)次交換得到的重組子只有一種類型,因?yàn)橄喾吹闹亟M子(reciprocalrecombinant)是一個線狀的片段,照例不能復(fù)制,隨著細(xì)胞分裂而被丟失,所以重組后細(xì)胞所產(chǎn)生的菌落不再是部分二倍體,而是單倍體。CrossoverbetweenexogenoteandendogenoteinamerozygoteThemerozygoteAsinglecrossoverleadstoapartlydiploidlinearchromosomeAnevennumberofcrossoversleadstoaringplusalinearfragment四、中斷雜交
50年代,雅科(JacobF.)和沃爾曼(WollmanE.):
中斷雜交試驗(yàn):發(fā)現(xiàn)接合時遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移是直線進(jìn)行。
其方法為:
①Hfr菌株與F-菌株混合培養(yǎng)。
Hfr菌株:strsa+b+c+d+對鏈霉素敏感
F-菌株:strr
a-b-c-d-
抗鏈霉素②不同時間取樣→攪拌器中斷雜交→
稀釋→含鏈霉素完全培養(yǎng)基→
殺死Hfr細(xì)菌→
抗str細(xì)菌菌落→
影印培養(yǎng)法:鑒定a+b+c+d+各基因轉(zhuǎn)移時間。例題:Hfr菌株:蘇氨酸(thr+)、亮氨酸(leu+)、抗疊氮化物(azir)、抗T1噬菌體(tonr)、半乳糖(gal+)、乳糖(lac+)、strs
。F-菌株:thr-、leu-、azis、tons、gal-、lac-
strr型。
在時間t=0時,讓這兩種細(xì)胞培養(yǎng)物混合進(jìn)行通氣培養(yǎng),每隔一定時間取樣,把菌液放入攪拌器內(nèi)攪動以打斷配對的接合管,使接合的細(xì)胞分開以中斷雜交,將中斷接合的細(xì)菌接種在幾種不同的培養(yǎng)基上,測定形成了何種重組子。
中斷雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在接合開始后,Hfr的不同非選擇標(biāo)記可與F-細(xì)胞的染色體在不同時間形成重組子。①8分鐘時:thr+進(jìn)入F-細(xì)胞;
8.5分鐘時:leu+進(jìn)入F-細(xì)胞;②9分鐘時:出現(xiàn)疊氮化物抗性的菌落,少數(shù)azir基因進(jìn)入F-細(xì)胞;③11分鐘時:出現(xiàn)抗噬菌體T1的F-細(xì)菌;④18和25分鐘時:分別出現(xiàn)乳糖和半乳糖發(fā)酵基因,即lac+和galb+進(jìn)入F-細(xì)胞。①.重組體中各標(biāo)志基因進(jìn)入F-
細(xì)胞中時間不同,達(dá)到最高水平的時間也不同;②.隨時間的推遲,某個基因的重組率增加;一定程度后,重組率便不再增加。如:10`tonr首次出現(xiàn),15`時40%、25`后80%?!郒fr中基因是按一定的線性順序依次進(jìn)入F-菌株的。Interrupted-matingconjugationexperimentswithE.coli
中斷雜交技術(shù)(interruptedmatingtechnigue):在若干不同的選擇培養(yǎng)基(selsctivemedia)上,分析Hfr染色體上其它非選擇性標(biāo)記基因進(jìn)入F-細(xì)菌的順序和所需時間(分鐘),繪制出連鎖圖。這種根據(jù)供體基因進(jìn)入受體細(xì)胞的順序和時間繪制連鎖圖的技術(shù),稱為~?;蜣D(zhuǎn)入時間(min)頻率thr+leu+azistonslac+gal+88.59111825100(選擇標(biāo)記)100(選擇標(biāo)記)90704025表6-2大腸桿菌Hfr
thr+leu+lac+gal+azistonsstrs×F-
thr-leu-lac-gal-azirtonr
strr
的結(jié)果
不同基因所能達(dá)到的穩(wěn)定轉(zhuǎn)移頻率不同,這表明它們與thr和leu座位之間以及它們之間的順序和距離不同。
Hfr細(xì)菌的基因按一定的時間順序依次地出現(xiàn)在F-細(xì)胞。因?yàn)榛蛟谌旧w上,染色體從這一端開始稱為原點(diǎn),以線性方式進(jìn)入F-細(xì)胞中。
基因離開原點(diǎn)越遠(yuǎn),進(jìn)入F-越遲。離開原點(diǎn)較遠(yuǎn)的基因,可能在轉(zhuǎn)移過程(transferprocess)停止以前,仍未轉(zhuǎn)移,因而斜率較低,達(dá)到的最高值也較小。
以基因出現(xiàn)的時間為標(biāo)準(zhǔn)→作出E.coli的遺傳連鎖圖。
用基因轉(zhuǎn)移時間進(jìn)行作圖,圖距單位用分鐘來度量,全部染色體轉(zhuǎn)移需90分鐘,每分鐘以3.3×104bp即1.2μmDNA的均衡速度進(jìn)行轉(zhuǎn)移,因此大腸桿菌整個環(huán)形遺傳圖為90min。
同一個Hfr菌株的轉(zhuǎn)移的起始點(diǎn)以及轉(zhuǎn)移順序在不同實(shí)驗(yàn)中都是相同的,但是一個F+品系可產(chǎn)生許多Hfr品系,這是因?yàn)镕因子在細(xì)菌染色體上有許多插入位點(diǎn)而且其插入取向不同而形成的。
用不同的Hfr菌株進(jìn)行中斷雜交實(shí)驗(yàn),則他們的轉(zhuǎn)移起點(diǎn)、基因轉(zhuǎn)移順序以及轉(zhuǎn)移方向都不相同。
用一種大腸桿菌的不同Hfr菌株進(jìn)行中斷雜交實(shí)驗(yàn),作出連鎖圖,其基因向F-細(xì)胞轉(zhuǎn)移的順序不同。Hfr類型原點(diǎn)基因轉(zhuǎn)移順序HfrH
O
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lac
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thi1
O
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3
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galAB312
O
thi
thr
pro
lac
gur
gal
his
gly轉(zhuǎn)移的順序是不是隨機(jī)?例如:thrthigly
。
每一Hfr菌株的基因順序雖不相同,但不是隨機(jī)的。任何線性的Hfr染色體的形成都可用F因子插入環(huán)狀染色體的不同地點(diǎn)來說明。CirculationoftheE.colichromosome差異:不同Hfr菌株轉(zhuǎn)移的原點(diǎn)(O)和轉(zhuǎn)移
方向不同。進(jìn)一步說明F因子和細(xì)菌染色體都是環(huán)狀。五、重組作圖(recombinationmapping)
中斷雜交是根據(jù)基因轉(zhuǎn)移的先后次序,以時間為單位進(jìn)行基因定位的。
重組作圖是根據(jù)基因間重組率進(jìn)行基因定位的。兩種方法相互補(bǔ)充,提高基因定位的精確性。
基因距離較遠(yuǎn)中斷雜交作圖很有效。基因距離較近,基因間轉(zhuǎn)移時間<2分鐘時,僅用中斷雜交實(shí)驗(yàn)進(jìn)行基因定位不精確可靠,應(yīng)采用傳統(tǒng)的重組作圖法。中斷雜交可為重組作圖提供某些基因之間連鎖關(guān)系及其前后次序的依據(jù)。例:根據(jù)中斷雜交實(shí)驗(yàn)已知二個基因緊密連鎖:
lac-(乳糖不發(fā)酵)
ade-(腺嘌呤缺陷型)
Hfrlac+ade+×F-lac-ade-雜交中是lac+
先進(jìn)入F-受體,而ade+后進(jìn)入。
①因?yàn)楣wHfr轉(zhuǎn)入片段不能獨(dú)立復(fù)制,如果未進(jìn)入F-受體的基因組中去,那么在以后的細(xì)胞分裂中就丟失了;②如果已進(jìn)入F-基因組中去,而且在缺乏腺嘌呤的培養(yǎng)基上表型為F-lac+ade+,這顯然是這兩個基因之外發(fā)生雙交換的產(chǎn)物,lac-ade這兩個基因之間并未發(fā)生重組;Hfrlac+ade+轉(zhuǎn)入受體后將會發(fā)生:
③表型為lac+ade-,這種類型在缺乏腺嘌呤的培養(yǎng)基上就不能生長,所以篩選不出來,而且對測定這兩個基因之間的圖距也沒有意義,因?yàn)榭赡苁莑ac+進(jìn)入,而ade+還未進(jìn)入F-細(xì)胞;
④只有在缺乏腺嘌呤的完全培養(yǎng)基上選出lac-ade+才是真正的重組子。因?yàn)橐阎猘de+是在lac+之后進(jìn)入F-細(xì)胞,既然ade+已進(jìn)入,lac+也已先進(jìn)入,所以選出重組子F-lac-ade+必然是外基因子和內(nèi)基因子在這兩個基因之間發(fā)生交換的結(jié)果。
F-lac-ade-在缺乏腺嘌呤的條件下是不能生長的,當(dāng)然對于計算這兩個基因之間的圖距也沒有意義。因此lac與ade之間的圖距應(yīng)為:
RF(lac-ade)
用重組頻率(RF)所測得的基因間距離與用中斷雜交以時間(T)為單位的基因間距離基本上是一致的。
兩個位點(diǎn)間的時間約為1分鐘,兩個值的比RF:T約等于20,即它們之間的關(guān)系大約是1min等于20個圖距單位。六、F′因子與性導(dǎo)F+與Hfr兩種菌株可以相互轉(zhuǎn)變,F(xiàn)因子可以插入到染色體中去,形成Hfr菌株;又可通過規(guī)則的交換和剪切,從染色體上完整地游離下來形成F+菌株。
F因子整合過程:可逆:發(fā)生環(huán)出時,F(xiàn)因子又可重新離開染色體。整合環(huán)出OriginandreintegrationoftheF′factor
Adelberg和Burns(1959):
*
F′因子(F′-factor):
F因子偶爾在環(huán)出時不夠準(zhǔn)確,會攜帶出染色體上的一些基因,這種因子稱為F′因子。
*
F′因子攜帶染色體的節(jié)段大小:從一個標(biāo)準(zhǔn)基因到半個細(xì)菌染色體。
由于F因子在細(xì)菌染色體上插入位置不同而構(gòu)成不同的Hfr品系,由此形成不同的F′因子。它們各自攜帶細(xì)菌的不同基因和不同長度的DNA片段,有的F′因子攜帶若干個基因的一大段細(xì)菌的染色體。F′因子使細(xì)菌帶有某些突出的特點(diǎn):⑴F′因子轉(zhuǎn)移基因頻率極高,如同F(xiàn)因子轉(zhuǎn)移頻率;⑵F′因子自然整合率極高,并且整合在一定的座位上。∵攜帶與細(xì)菌染色體一樣的同源區(qū)段;而正常F因子可在不同座位整合。
性導(dǎo)(sexduction或F′-duction):指接合時由F′因子所攜帶的外源DNA整合到細(xì)菌染色體的過程。雅科和阿代爾伯格發(fā)現(xiàn):特殊的Hfr菌株能把lac+
等位基因高頻率地轉(zhuǎn)移到Flac-受體中?!撷賚ac基因位于遠(yuǎn)端,中斷雜交實(shí)驗(yàn)中只1/1000重組率;②由F′攜帶lac+基因進(jìn)入受體后可在lac位點(diǎn)上形成部分二倍體F′lac+/lac-。
F′因子轉(zhuǎn)移細(xì)菌基因不同于Hfr菌株。
1.Hfrthr+leu+strs×F-thr-leu-strr
篩選出F-:thr+leu+strr重組子
2.F′thr+leu+strs×F-thr-leu-strr
篩選出F′:thr+leu+strr重組子
雜交中把混合培養(yǎng)物涂布在含鏈霉素的基本培養(yǎng)基上,第一個雜交選出的菌株都是F-,因此不能將thr+leu+轉(zhuǎn)入F-菌株。
第二個雜交選出的菌株都帶有活性的F`因子,能與其他F-菌株雜交,并能將thr+leu+轉(zhuǎn)入F-菌株,而且這些菌株也具有F′因子,所以都是F+,仍具有感染能力。
產(chǎn)生F′因子的Hfr菌株仍保持單倍體狀態(tài),F(xiàn)′因子轉(zhuǎn)入到受體細(xì)胞之后,由于引入了供體細(xì)胞的部分基因,從而構(gòu)成了部分二倍體。性導(dǎo)在遺傳學(xué)
分析中的作用部分二倍體如果不發(fā)生重組
1.F′因子自主復(fù)制,可在細(xì)菌細(xì)胞中延續(xù)下去;
2.性導(dǎo)所形成的部分二倍體可用作不同突變型之間的互補(bǔ)測驗(yàn)→確定這兩個突變型是屬于同一個基因或是兩個不同基因;3.觀察由性導(dǎo)形成的雜合的部分二倍體中某一性狀的表現(xiàn)→確定等位基因中的顯隱性關(guān)系;
4.分離出大量F′因子(每個F′因子攜帶有不同大腸桿菌基因)
→利用不同基因在一起的并發(fā)性導(dǎo)的頻率來作圖;部分二倍體如果發(fā)生了重組
即F′因子所攜帶的供體細(xì)菌染色體同受體細(xì)菌染色體之間的同源重組,如果發(fā)生了單交換,就導(dǎo)致F′整合形成Hfr品系,同時F′因子上所攜帶的基因發(fā)生重組;如果雙交換,則形成F′品系,只是F′因子的細(xì)菌基因和受體染色體的等位基因之間發(fā)生互換。并發(fā)性導(dǎo)(co-sexduction):是建立遺傳圖的另一手段,兩個位點(diǎn)必須密切相連才能處在同一個F′因子上。獲得兩個位點(diǎn)間重組率→每個片段的連鎖群。
性導(dǎo)作圖法與轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖法相同。三種不同的致育因子的相互關(guān)系
1.F′是帶有部分細(xì)菌染色體F因子,它的性質(zhì)在F和Hfr之間。Hfr通過交換,可以形成帶有部分細(xì)菌染色體的F′因子,而F′因子又可通過交換整合到細(xì)菌染色體的原來位置,回復(fù)到以前的Hfr狀態(tài)。
2.F′因子連同它所帶有的部分細(xì)菌染色體可一起轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞,其轉(zhuǎn)移速率近于F因子。
3.有F因子的細(xì)胞是F+細(xì)胞,沒有F因子的細(xì)胞是F-細(xì)胞。F因子由供體進(jìn)入F-細(xì)胞,使受體細(xì)胞成為F+細(xì)胞,但供體細(xì)胞仍為F+,其染色體很少轉(zhuǎn)移。F因子可通過簡單交換整合到細(xì)菌染色體上,形成Hfr染色體。反過來,通過簡單交換,又可從Hfr染色體產(chǎn)生F因子。不同的Hfr菌株的染色體轉(zhuǎn)移起始點(diǎn)和方向不同,這是由于F因子整合的位置和方向不同的緣故。
4.Hfr能以高頻率把細(xì)菌染色體轉(zhuǎn)移到F-細(xì)菌中,而F因子因位于Hfr染色體的最末端,極少進(jìn)入。F′因子和F因子很容易轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞中,但供體染色體的轉(zhuǎn)移率很低。SummaryofthevariouseventsthattakeplaceintheconjugationcycleE.coli七、轉(zhuǎn)化(transformation)概念:某些細(xì)菌通過其細(xì)胞膜攝取周圍供體的染色體片段,將此外源DNA片段通過重組整合到自己染色體組的過程。1928年,格里費(fèi)斯(GriffithF.)在肺炎雙球菌中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化現(xiàn)象。1944年,阿委瑞(AveryO.T.)進(jìn)行肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化試驗(yàn);證實(shí)遺傳物質(zhì)是DNA;轉(zhuǎn)化是細(xì)菌交換基因的方法之一。轉(zhuǎn)化的條件:細(xì)菌活躍攝取外源DNA分子;具備重組程序所必需的酶。轉(zhuǎn)化三種細(xì)菌:肺炎雙球菌;枯草桿菌;流感嗜血桿菌。轉(zhuǎn)化的兩個例子:①用兩個帶有不同抗性的肺炎雙球菌群體混合→可以發(fā)現(xiàn)帶有雙抗性的細(xì)菌。細(xì)菌裂解→DNA殘留→其它細(xì)菌攝取轉(zhuǎn)化。②枯草桿菌活細(xì)胞表面分泌DNA,可被其它細(xì)胞攝取。(一)供體與受體的互作:①轉(zhuǎn)化片斷的大?。悍窝纂p球菌轉(zhuǎn)化:DNA片斷至少有800bp;枯草桿菌的轉(zhuǎn)化:DNA片斷至少有16000bp。②供體DNA分子存在的數(shù)目:供體DNA分子數(shù)目與特定基因的成功轉(zhuǎn)化有關(guān)。鏈霉素抗性基因轉(zhuǎn)化:每個細(xì)胞含有10個DNA分子之前,抗性轉(zhuǎn)化體數(shù)目一直與DNA分子存在數(shù)目成正比。
原因:細(xì)菌的細(xì)胞壁或細(xì)胞膜上有固定數(shù)量的DNA接受座位,故一般細(xì)菌攝取的DNA分子數(shù)<10個。③受體的生理狀態(tài):感受態(tài)是處于剛停止DNA合成、而蛋白質(zhì)合成繼續(xù)活躍進(jìn)行時的狀態(tài)?;钴S合成的蛋白質(zhì)可使細(xì)菌細(xì)胞壁易于接受轉(zhuǎn)化DNA。
只有感受態(tài)受體細(xì)胞才能攝取并轉(zhuǎn)化外源DNA,而這種感受態(tài)也只能發(fā)生在細(xì)菌生長周期的某一時間范圍內(nèi)。(二)轉(zhuǎn)化DNA的攝取和整合過程:
①結(jié)合與穿入:雙鏈DNA分子結(jié)合在受體座位上(可逆),可被DNA酶降解;接受座位飽和性。
DNA攝取(不可逆),不受DNA酶破壞。
穿入后,由外切酶或DNA移位酶降解其中一條鏈。
②聯(lián)會:按各個位點(diǎn)與其相應(yīng)的受體DNA片段聯(lián)會。親緣關(guān)系越遠(yuǎn),聯(lián)會越小、轉(zhuǎn)化的可能性越小?!壅?重組):
是指單鏈的轉(zhuǎn)化DNA與受體DNA對應(yīng)位點(diǎn)的置換→穩(wěn)定地進(jìn)入到受體DNA。對同源DNA具有特異性。異源DNA,視親緣關(guān)系遠(yuǎn)近也可發(fā)生不同頻率整合。
(三)連鎖判斷
①如果A和B是連鎖的,當(dāng)DNA濃度下降時,AB同時轉(zhuǎn)化頻率和A或B轉(zhuǎn)化頻率下降程度相同;
②如果A和B不連鎖,AB轉(zhuǎn)化頻率下降將遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過A或B轉(zhuǎn)化頻率下降的程度,因?yàn)樵谳^低的濃度范圍內(nèi),轉(zhuǎn)化頻率和轉(zhuǎn)化DNA的濃度成正比關(guān)系。(四)轉(zhuǎn)化頻率低的原因:
1.受體細(xì)菌細(xì)胞壁只在特定區(qū)域形成臨時通道,允許外源DNA片段通過。2.外源DNA進(jìn)入還必須有酶或蛋白質(zhì)分子以及能量的協(xié)同作用。(五)細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與作圖轉(zhuǎn)化中供體DNA片段可以攜帶若干個基因,連鎖基因可同時被轉(zhuǎn)化,但同時被轉(zhuǎn)化的基因不一定連鎖。黎德伯格等用枯草桿菌進(jìn)行轉(zhuǎn)化和重組試驗(yàn):
DNA片段進(jìn)入受體細(xì)胞后,可與受體染色體發(fā)生重組。緊密連鎖的兩個基因有較多的機(jī)會在同一個DNA片段中→同時整合到受體染色體中。
枯草桿菌菌株trp2+his2+tyr1+
作為供體,提取其DNA向受體trp2-his2-tyr1-菌株進(jìn)行轉(zhuǎn)化。
trp2+his2+tyr1+
×
trp2-his2-tyr1-座位轉(zhuǎn)化體類別trp2+---+++his2++-+--+tyr1+++--+-11940366068541826001071180親本型(++)重組型(+-)和(-+)重組值trp2-his211940+11802600+107+3660+4180.34trp2-tyr111940+1072600+1180+3660+6850.40His2-tyr111940+3660418+1180+685+1070.13三者并發(fā)轉(zhuǎn)化的頻率高,故這3個基因是連鎖的,其中his2和tyr1連鎖最為緊密:單交換時,染色體開環(huán)易降解,故不存在單交換類型;只有雙交換和偶數(shù)的多交換才有效。第三節(jié)噬菌體的遺傳分析
MicrographofabacteriophageattachingtoabacteriumandinjectingitsDNA
一、噬菌體的結(jié)構(gòu):1.結(jié)構(gòu)簡單:
蛋白質(zhì)外殼、核酸、某些碳水化合物、脂肪等。2.多樣性的原因:外殼的蛋白質(zhì)種類、染色體類型和結(jié)構(gòu)。3.兩大類:①烈性噬菌體:T噬菌體系列(T1~T7);②溫和性噬菌體:P1和λ噬菌體。T4噬菌體從大腸桿菌中釋放(一)烈性噬菌體
1.概念:烈性噬菌體(virulentphages):感染宿主細(xì)胞后就進(jìn)入裂解反應(yīng),使宿主細(xì)胞裂解。2.結(jié)構(gòu)大同小異,外貌一般呈蝌蚪狀:
T偶列噬菌體
頸部:中空的針狀結(jié)構(gòu)及外鞘;尾部:由基板、尾針和尾絲組成。頭部:雙鏈DNA分子的染色體;3.T偶列噬菌體的侵染過程(如T4噬菌體)尾絲固定于大腸桿菌,遺傳物質(zhì)注入→破壞寄主細(xì)胞遺傳物質(zhì)→降解細(xì)菌的染色體,為自身DNA合成提供游離的核苷酸,→合成噬菌體遺傳物質(zhì)和蛋白質(zhì)→組裝許多新的子噬菌體→溶菌酶裂解細(xì)菌→釋放出大量噬體。T4噬菌體侵染大腸桿菌的生活周期PhageT4,showinitsfreestateandintheprocessofinfectinganE.colicellAgeneralizedbacteriophagelyticcycle(二)溫和噬菌體
1.概念:溫和(溶源性)噬菌體(temperatephages):感染宿主細(xì)胞后具有裂解和溶源兩種發(fā)育途徑。
例如:λ和P1噬菌體,λ和P1各代表一種略有不同的溶源性類型。2.溶源性噬菌體的生活周期:①λ噬菌體:噬菌體侵入后,細(xì)菌不裂解→附在E.coli染色體上的gal和bio位點(diǎn)間的attλ座位上→整合到細(xì)菌染色體,并能阻止其它λ噬菌體的超數(shù)感染。λ噬菌體特定位點(diǎn)的整合②P1噬菌體:不整合到細(xì)菌的染色體上,而是獨(dú)立存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)。
原噬菌體:整合到宿主基因組中或在染色體外以游離形式存在的噬菌體。僅少數(shù)基因活動,表達(dá)出阻礙物關(guān)閉其它基因。原噬菌體經(jīng)誘導(dǎo)可轉(zhuǎn)變?yōu)榱倚允删w→
裂解途徑。3.P1和λ噬菌體的特性:①
P1和λ各代表不同的溶源性類型:
P1噬菌體:侵入后并不整合到細(xì)菌的染色體上,獨(dú)立存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi);
λ噬菌體:通過交換整合到細(xì)菌染色體上。②溶源性細(xì)菌分裂→兩個子細(xì)胞:
P1噬菌體復(fù)制則使每個子細(xì)胞中至少含有一個拷貝;
λ噬菌體隨細(xì)胞染色體復(fù)制而復(fù)制,細(xì)胞中有一個拷貝。③共同特點(diǎn):核酸既不大量復(fù)制,也不大量轉(zhuǎn)錄和翻譯。P1和λ噬菌體的生活周期特性
溫和噬菌體的感染周期
生活周期分為裂解途徑溶源途徑裂解周期(lyticcycle)溶源周期(lysogeniccycle)Alternativecellcyclesofatemperatephageanditshost
溶源性細(xì)菌(lysogenicbacterium):帶有某種噬菌體,但并不立即導(dǎo)致溶菌的現(xiàn)象稱為溶源性,這樣的細(xì)菌就稱為~。非溶源性細(xì)菌(non-lysogenicbacterium):失去原噬菌體的細(xì)菌稱為~。
溶源性細(xì)菌有兩個重要特性:
1.免疫性:細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)已有了侵入的噬菌體,再也不會受到同一種噬菌體的侵染。
2.可誘導(dǎo)性:通常由于原噬菌體的自發(fā)誘導(dǎo),每一代可能有萬分之一溶源性細(xì)菌被裂解,釋放出大量噬菌體,這一過程稱為裂解周期。用紫外線或化學(xué)物質(zhì)誘導(dǎo),90%的溶源性細(xì)菌進(jìn)入裂解周期,完成組裝的完整噬菌體釋放出來。二、溶源性的遺傳基礎(chǔ)
原始E.coli菌株對于λ溫和噬菌體來說是溶源菌。如果F+與F-細(xì)胞間進(jìn)行雜交,發(fā)現(xiàn)雜交結(jié)果與所用的溶源菌菌株有關(guān)。Zygoticinduction
正交F+
(λ)×F-,即F+細(xì)胞是帶有λ噬菌體的溶源菌時,幾乎不產(chǎn)生溶源性重組子。∵在Hfr(λ)×F-中,Hfr菌株的前端基因可在F-受體中出現(xiàn),但后端基因的重組子得不到。
反交F+
×F-(λ),即F-細(xì)胞是帶有λ噬菌體的溶源菌時,可偶爾產(chǎn)生溶源性重組子。
∵在雜交Hfr×F-(λ)中,Hfr基因轉(zhuǎn)移到F-細(xì)胞,所以有Hfr基因的溶源性F-重組子很容易得到。
合子誘導(dǎo)(zygoticinduction):溶源性Hfr與非溶源性F-受體雜交時,經(jīng)過一定時間,λ原噬菌體進(jìn)入一個無免疫能力的細(xì)胞,原噬菌體隨即開始復(fù)制,使細(xì)胞裂解,釋放出游離的噬菌體,這個現(xiàn)象叫~。原噬菌體進(jìn)入非溶源性細(xì)胞后,使受體細(xì)胞裂解,這樣在λ噬菌體轉(zhuǎn)移以后才進(jìn)入F-細(xì)胞的Hfr后端基因就無法得到了。三、噬菌體突變的基因重組與作圖
1.噬菌體遺傳性狀分為兩類:
形成的噬菌斑形狀:指噬菌斑大小、邊緣清晰度、透明程度。
寄主范圍:指噬菌體感染和裂解的菌株范圍。2.T2突變型的兩點(diǎn)測交①正常噬菌體r+:緩慢溶菌,噬菌斑小而邊緣模糊。
r–突變體(rapidlysis,速溶性):快速溶菌,噬菌斑大而邊緣清楚。②寄主范圍突變體:指能克服噬菌體抗性的突變體。例:h+
噬菌體:只侵染大腸桿菌B株→半透明噬菌斑。
h–突變株:能利用B株和B/2株→透明噬菌斑。
③雙重感染:
h–和h+均能感染B株→可用T2兩個親本h–r+和h+r–同時感染B菌株。
h–r+(透明,小)×h+r–(半透明,大)
↓同時感染B菌株獲得噬菌體子代
親本型:h–r+,h+r–
重組型:h–r–,h+r+將親本型和重組型混合子代
↓感染混合有B和B/2菌株的培養(yǎng)基
↓h–r+(親):噬菌斑透明、小,邊緣模糊h+r–(親):噬菌斑半透明、大,邊緣清楚h–r–(重組):噬菌斑透明、小,邊緣清楚h+r+(重組):噬菌斑半透明、小,邊緣模糊表型推導(dǎo)的基因型透明,小半透明,大半透明,小透明,大h-r+h+r-h+r+h-r-④重組值計算:重組值=重組噬菌斑數(shù)/總噬菌斑×100%
=[(h+r++h–r–)/(h+r–+h–r++h+r++h–r–)]×100%去掉%即可作為圖距。AdoubleinfectionofE.colibytwophagePlaquephenotypesproducedbyprogenyofthecrossh
-r+
×h+
r-
⑤不同的快速溶菌突變型在表型上不同,記作ra、rb、rc,用不同快速溶菌突變型h+rx-與宿主范圍突變型h-rx+雜交。重組值隨著r基因的不同而有變化,可以據(jù)此作連鎖圖。h+r-×h-r+獲得試驗(yàn)結(jié)果列于下表:
分別作出ra
、rb
、rc與h的三個連鎖圖:雜交每一基因型的%重組值h+r+h+r-h-r+h-r-h+ra×
h-r+h+rb×h-r+h+rc×h-r+12.05.90.734.032.039.042.056.059.012.06.40.924/100=24%12.3/100.3=12.3%1.6/99.6=1.6%
四種可能的基因排列連鎖圖:
?
1234再做雜交:rcrb+
×
rc+rb
↓結(jié)果表明:rc—rb的重組值>rb—h∴h位于rb及rc之間,排列順序→
rc–h–rb。由于T2噬菌體的連鎖圖是環(huán)狀的,所以2、3排列都對。
3.T4突變型的三點(diǎn)測交
在噬菌體中也可以用三點(diǎn)測交進(jìn)行基因定位。用T4噬菌體的兩個品系感染大腸桿菌。
一個品系m:小噬菌斑
r:快速溶菌
tu:渾濁溶菌斑另一個品系是對這三個性狀都是野生型+++。T4的mrtu×+++三點(diǎn)測交結(jié)果類型噬菌斑數(shù)百分?jǐn)?shù)%重組頻率m-rr-tum-tu親本類型mrtu+++3467372933.536.1單交換型m+++rtu5204745.04.6√√單交換型mr+++tu8539658.29.3√√雙交換型m+tu+r+1621721.61.7√√合計1034212.920.827.1
根據(jù)這些結(jié)果,可繪制出這三個基因的染色體圖:
m←12.9→r←20.8→tu
三點(diǎn)測交所得的8種噬菌斑都可觀察到,因?yàn)椴《臼菃伪扼w,親本型與重組型可直接從后代中表現(xiàn)出來,直接統(tǒng)計各種噬菌斑類型即可,不必考慮對子代如何進(jìn)行選擇。四、轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)
1.概念:指以噬菌體為媒介進(jìn)行的細(xì)菌遺傳物質(zhì)重組,是細(xì)菌遺傳物質(zhì)傳遞和交換方式之一。
2.特點(diǎn):以噬菌體為媒介→細(xì)菌的一段染色體被錯誤地
包裝在噬菌體的蛋白質(zhì)外殼內(nèi)→通過感染轉(zhuǎn)移到另一個受體細(xì)胞內(nèi)。
∵感染細(xì)菌的能力決定于噬菌體的蛋白質(zhì)外殼。(一)普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransduction):可以轉(zhuǎn)移細(xì)菌染色體的很多不同部分,這類噬菌體的轉(zhuǎn)導(dǎo)叫做~。
黎德伯格與津德(1951)發(fā)現(xiàn)鼠傷寒沙門氏菌中轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象。(1)將兩個沙門氏菌的營養(yǎng)缺陷型進(jìn)行雜交:phe-trp-tyr-met+his+
×
phe+trp+tyr+met-his-
↓混合培養(yǎng)在基本培養(yǎng)基發(fā)現(xiàn)原養(yǎng)型的菌落
頻率為1/105但在使用戴維斯U形管時也出現(xiàn)了原養(yǎng)性菌落。(2)產(chǎn)生上述結(jié)果的原因:
①是否屬于恢復(fù)突變?高頻率出現(xiàn)不可能是回復(fù)突變。
②是否屬于接合、性導(dǎo)?戴維斯U型管試驗(yàn)(防止細(xì)胞直接接觸)→結(jié)果也獲得野生型重組體,排除由于接合或性導(dǎo)而產(chǎn)生基因重組可能性。
③是否屬于轉(zhuǎn)化?
結(jié)果表現(xiàn)為不受DNA酶的影響,排除了由于DNA片斷通過濾片經(jīng)轉(zhuǎn)化實(shí)現(xiàn)基因重組可能性。
(3)唯一可能的結(jié)論是:這種重組通過一種過濾性因子實(shí)現(xiàn)。
這種過濾性因子稱為FA,不受DNA酶的影響。FA為噬菌體P22(溶源性)。
①濾板孔徑允許這種因子通過,因此稱為過濾因子,而這種因子大小和質(zhì)量與P22相同;
②免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證這種因子可以被P22抗血清滅活;
③如果用抗性品系來代替敏感品系,那么在U型管的兩端都不出現(xiàn)野生型重組了。
④進(jìn)一步研究也驗(yàn)證了細(xì)菌菌株是攜帶P22原噬菌體的溶源性細(xì)菌。
P22在感染細(xì)菌細(xì)胞時,細(xì)菌染色體斷裂成小片段。在形成噬菌體顆粒時,偶爾錯誤地把細(xì)菌染色體的片段組裝到頭部,而不是他們自己的遺傳物質(zhì)。
轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體(transducingphage)或轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒(transducingparticles):把細(xì)菌染色體片段包裝在噬菌體蛋白質(zhì)外殼內(nèi)而產(chǎn)生的假噬菌體(不包含噬菌體的遺傳物質(zhì))。
決定噬菌體的吸附和注入DNA這兩種功能取決于它的蛋白質(zhì)外殼,所以轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒可以吸附到細(xì)菌細(xì)胞上,并注入他們的DNA。此時噬菌體DNA中包含了部分的細(xì)菌基因。
當(dāng)轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體內(nèi)容物注入一個受體細(xì)胞后,形成一個部分二倍體,然后導(dǎo)入的基因通過重組,整合到宿主細(xì)菌的染色體上。錯誤包裝(1/1000機(jī)率)同源重組同源重組
噬菌體攜帶供體的染色體片段完全是隨機(jī)的,也就是說,供體基因組中所有基因具有同等機(jī)會被轉(zhuǎn)導(dǎo)形成部分二倍體,經(jīng)交換和重組后,形成不同轉(zhuǎn)導(dǎo)子。各個標(biāo)記基因轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率大致相同,這種轉(zhuǎn)導(dǎo)就是普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generaltransduction)。Themechanismofgeneralizedtransduction.∵轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體——一般只有0.3%左右噬菌體基因組大小相當(dāng)于沙門氏菌的1%∴普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率很低,對每一個基因來說轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率是有限的。頻率:1%×0.3%=3×10-5
如果細(xì)菌的兩個基因之間距離大于噬菌體的染色體長度,一般不能同時進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo),除非攜帶不同基因顆粒同時感染同一細(xì)菌細(xì)胞。頻率:10-5×10-5=10-10
共轉(zhuǎn)導(dǎo)或并發(fā)轉(zhuǎn)導(dǎo)(cotransduction):兩個基因同時轉(zhuǎn)導(dǎo)的現(xiàn)象。
如果兩個基因始終是一起轉(zhuǎn)導(dǎo)或同時轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率較高,那么可以證明這兩個基因是連鎖的。兩個基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率愈高,表明兩個基因連鎖愈緊密,相反,共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率愈低,則表明這兩個基因距離愈遠(yuǎn)。
雙因子轉(zhuǎn)導(dǎo)(two-factortransduction):每次觀察兩個基因的轉(zhuǎn)導(dǎo),通過每兩個基因之間的共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率可以確定這些基因在染色體上的次序。若要分析3個基因則需做3次雙因子轉(zhuǎn)導(dǎo)實(shí)驗(yàn),才能確定這3個基因的次序。
假定這3次實(shí)驗(yàn)結(jié)果為:①a基因和b基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率高;②a基因和c基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率也高;③b和c基因的共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率很低,那么這3個基因的次序就應(yīng)為b、a、c。
三因子轉(zhuǎn)導(dǎo)(three-factortransduction)分析,則只做一次實(shí)驗(yàn)就可推出3個基因的次序。以普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體P1為例,測定大腸桿菌的leu(亮氨酸合成)、thr(蘇氨酸合成)、azi(疊氮化鈉抗性)三個基因的順序。每個選擇的標(biāo)記基因進(jìn)行多次試驗(yàn):三個位點(diǎn)之間的連鎖關(guān)系:實(shí)驗(yàn)1:
2種可能排列:
azi
leu
thr
√
leu
azi
thr實(shí)驗(yàn)2:肯定三個基因的順序是:
azi
leu
thr實(shí)驗(yàn)3:證明這一順序,因?yàn)閘eu+和thr+片段之間從未攜帶有azir。實(shí)驗(yàn)選擇的標(biāo)記基因未選擇的標(biāo)記基因頻率123
leu+
thr+
leu+thr+50%azir2%thr+3%leu+0%azir
0%azir
通過合轉(zhuǎn)導(dǎo)關(guān)系求出兩基因之間的物理距離:
d=同一染色體上兩基因之間的物理距離;
L=轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA的平均長度;
X=兩個基因共轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率。由以上公式可知:
轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA的平均長度約為1個病毒基因組的大小;通過試驗(yàn)測知兩個基因的合轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率,就可估算出兩個基因間的物理距離。
通過3因子轉(zhuǎn)導(dǎo)可以得到不同類型的轉(zhuǎn)導(dǎo)子及其頻率,顯然頻率最低的一類轉(zhuǎn)導(dǎo)子是最難于轉(zhuǎn)導(dǎo)的,因?yàn)樗漠a(chǎn)生需要同時發(fā)生的交換次數(shù)最多。這種轉(zhuǎn)導(dǎo)子的3個基因中,兩邊的應(yīng)為供體基因,中間的受體基因。
例如:大腸桿菌leu+arg+met+細(xì)胞作供體,leu-arg-met-作為受體,由P1噬菌體作為載體進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo)。最初選擇的是leu+轉(zhuǎn)導(dǎo)子,然后檢查leu+轉(zhuǎn)導(dǎo)子中其他兩個基因被轉(zhuǎn)導(dǎo)的情況,得到的轉(zhuǎn)導(dǎo)子類型和數(shù)目如下:(1)leu+arg-met-453(2)leu+arg+met-114(3)leu+arg+met+36(4)leu+arg-met+0603IncorporationofalatemarkerintotheF-E.colichromosome
可見:
①第四類基因型的轉(zhuǎn)導(dǎo)子是很難發(fā)生的,由此類轉(zhuǎn)導(dǎo)子基因型可以看出這三個基因的排列次序是leuargmet;
②
leu+和arg+在第二、三類轉(zhuǎn)導(dǎo)子中
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