Material Studio材料計(jì)算的工作站配置方案

MaterialStudio材料計(jì)算的工作站配置方案時(shí)間:2011-04-23來(lái)源：網(wǎng)友評(píng)論:0人氣：8450作者:本文中的硬件配置已升級(jí)到支持inteXeonE^、E5處理器架構(gòu)，較原配置性能提升100%以上，更新日期：2013年1月27日MaterialsStudio是一套材料科學(xué)的仿真軟件，MS是在化學(xué)和材料領(lǐng)域，為結(jié)構(gòu)和計(jì)算器研究者所設(shè)計(jì)的專業(yè)仿真軟件，提供用戶流暢的操作接口，并包含完整的運(yùn)算方法，讓使用者容易上手并提供功能強(qiáng)大的仿真能力。研究者通過(guò)MS提供的先進(jìn)豐富多種算法進(jìn)行綜合分析計(jì)算，在性質(zhì)預(yù)測(cè)、聚合物建模還是X射線衍射模擬，通過(guò)一些簡(jiǎn)單易學(xué)的操作來(lái)得到切實(shí)可靠的數(shù)據(jù)。協(xié)助科學(xué)家解決重要問(wèn)題，研發(fā)世界上最先進(jìn)的材料。分子模擬（材料計(jì)算）求解過(guò)程計(jì)算特點(diǎn)分析主要集中在對(duì)CPU和內(nèi)存方面，MS軟件支持主流CPU的多核并行計(jì)算，在一個(gè)架構(gòu)里，頻率越高，核數(shù)，計(jì)算速度越快，內(nèi)存方面主要體現(xiàn)在計(jì)算的規(guī)模上，隨著對(duì)自然世界的深入了解和分析，分析精度越來(lái)越高，計(jì)算量也越來(lái)越大，對(duì)內(nèi)存的要求也在不斷遞增，由于求解運(yùn)算過(guò)程中大量時(shí)間都在計(jì)算中，對(duì)顯卡的要求自然不高，圖卡主要是后期對(duì)數(shù)據(jù)的可視化有些需求，另外MS軟件運(yùn)算特點(diǎn)是將數(shù)據(jù)一次性放到內(nèi)存進(jìn)行密集計(jì)算，自然對(duì)硬盤外設(shè)的讀寫不是很頻繁，傳統(tǒng)上SATA接口也足夠了，如果內(nèi)存不夠，虛擬內(nèi)存很大的話，推薦SAS硬盤，當(dāng)然將來(lái)SSD便宜下來(lái)，內(nèi)存和虛擬內(nèi)存的比例1：2,可以考慮采用SSD硬盤硬件配置關(guān)系注意事情：經(jīng)過(guò)廠家推薦，目前12核不建議使用，8核Xeon架構(gòu)效率更高CPU一內(nèi)存關(guān)系，1核---對(duì)應(yīng)配置---2G~4G,8核處理器對(duì)應(yīng)內(nèi)存16GB~32GB.顯卡要求不高，針對(duì)不同的計(jì)算規(guī)模，配置相應(yīng)檔次圖卡，滿足后期數(shù)據(jù)可視化需求。硬盤IO在計(jì)算過(guò)程中，影響不大，資金充足的話，視多種計(jì)算軟件，SAS6Gbps是目前相當(dāng)不錯(cuò)的選擇XASUN圖形工作站配置方案XASUN當(dāng)今世界唯一能提供塔式、機(jī)架、便攜式、特種結(jié)構(gòu)等規(guī)格，提供單路、雙路、四路、八路最先進(jìn)架構(gòu)的高端圖形工作站，XASUN緊隨世界領(lǐng)先的intel和AMD的計(jì)算處理硬件主流技術(shù)，和Nvidia和ATI高性能圖卡以及一流的硬盤陣列技術(shù)，打造出具有超級(jí)性能的XASUN圖形工作站和服務(wù)器，同時(shí)充分了解不同行業(yè)應(yīng)用軟件的計(jì)算特點(diǎn)，靈活方便的配置架構(gòu)，使應(yīng)用軟件在任何一臺(tái)支持基于Windows、Linux等主流操作系統(tǒng)的服務(wù)器或工作站上最高效率的進(jìn)行運(yùn)算，從而最大限度的發(fā)揮工作站硬件性能和網(wǎng)絡(luò)資源。

MS軟件配備豐富的應(yīng)用功能模塊，硬件如何配合好所有軟件模塊，非一般經(jīng)驗(yàn)的硬件工程師所能了解的，今天我們對(duì)計(jì)算規(guī)模按原子數(shù)量初步劃分，大致分三個(gè)檔次：小規(guī)模計(jì)算工作站配置方案定位：原子數(shù)不超過(guò)100個(gè)求解規(guī)模推薦：4核XeonE31270v2(3.5Ghz)/16GB/Quadro600/12GBSSD+1TBSATA機(jī)器型號(hào)XASUNT32013516-S11T1AA主要配置4核XeonE31270v2/16GB/Q600/120GBSSD+1TBSATA企業(yè)級(jí)硬件配置明細(xì)配件品牌和型號(hào)數(shù)量CPU4核XeonE31270v213.5G/hz8MB/超線程/睿頻，共計(jì)4核芯片組intelC216+PCHChips1內(nèi)存8GDDR31600RegECC2顯卡NvidiaQuadro6001GB1系統(tǒng)盤120GBSSD1數(shù)據(jù)盤1TBSATA企業(yè)級(jí)1網(wǎng)卡千兆以太端口2工作站平臺(tái)XASUNSSIEC105P7S(700WEPS)1顯示器可選1噪音控制系統(tǒng)靜音級(jí)(全速計(jì)算45分貝以內(nèi))硬件性能指標(biāo)

CPUGPUCPUGPU幾何三角形處理：2.1億/秒，支持1*2單屏幕，最高分辨率2560*1600幾何三角形3億/秒，像素填充率380億/秒支持32X全景反鋸齒(FSAA)支持30位色彩精度1GBGDDR3顯存IO讀寫帶寬100MB/S,IOPS200次/秒通過(guò)匯聚功能，實(shí)現(xiàn)2Gbps硬盤網(wǎng)絡(luò)端口硬件升級(jí)能力CPU顯卡內(nèi)存槽硬盤位PCI硬盤網(wǎng)絡(luò)端口硬件升級(jí)能力CPU顯卡內(nèi)存槽硬盤位PCI擴(kuò)展操作系統(tǒng)支持WindowsServer2003、2008支持WindowsXP、Vista、7支持Redhat、SuseLinux全系列支持NvidaiQuadro和ATIFirepro系列4個(gè)，單根內(nèi)存最大8GB,最大容量32GB4個(gè)，單塊最大SATA：2TB2*PCIE3.0x8,2*PCIE3x4,1*PCI應(yīng)用軟件報(bào)價(jià)￥19,800元基于windows、linux環(huán)境下軟件全系列報(bào)價(jià)￥19,800元中大規(guī)模計(jì)算高端圖形工作站配置方案應(yīng)用定位：原子數(shù)100~1000個(gè)之間求解規(guī)模推薦：8核XeonE52643(3.3G)/48GB/quadro2000/240GBSSD+2TBSATA企業(yè)級(jí)如果從軟件和硬件的價(jià)格對(duì)比，買一臺(tái)配置最高的圖形工作站，是最好的發(fā)揮軟件性能的不二選擇。機(jī)器型號(hào)XASUNT56023348-S12T1BB參考配置：硬件配置明細(xì)配件品牌和型號(hào)數(shù)量CPU4核XeonE526433.3Ghz/10MB/6.4GTs/睿頻，共計(jì)8核2芯片組intelC600+PCHChips1內(nèi)存8GDDR31333RegECC6顯卡NvidiaQuadro20001GB1系統(tǒng)盤240GBSSD+2TBSATA企業(yè)級(jí)1

光驅(qū)網(wǎng)卡工作站平臺(tái)光驅(qū)網(wǎng)卡工作站平臺(tái)顯示希千兆以太端口XASUNS600C105PAS(1000WEPS)可選CPUGPU硬盤網(wǎng)絡(luò)端口運(yùn)算速度每秒2112億次幾何三角形處理:4.1億/秒，最高分辨率2560*1600192個(gè)流處理器，1GB緩存,64X反鋸齒IO讀寫帶寬100MB/S，IOPS200次/秒通過(guò)匯聚功能，實(shí)現(xiàn)2Gbps噪音控制系統(tǒng)靜音級(jí)（全速計(jì)算45分貝以內(nèi)）硬件性能指標(biāo)硬件升級(jí)能力CPU 支持2顆XeonE52600全系列顯卡 支持Quadro全系列，支持雙QuadroPlex內(nèi)存槽 16個(gè)，單根內(nèi)存最大32GB，最大容量512GB硬盤位 4個(gè)，單塊最大SAS：1TB、SATA：2TBPCI擴(kuò)展2*PCIE3.0x16,2*PCIE3.0x8操作系統(tǒng)支持WindowsServer2003、2008支持WindowsXP、Vista、7支持Redhat、SuseLinux全系列應(yīng)用軟件基于windows、linux環(huán)境下軟件全系列報(bào)價(jià) ￥46,500元超大規(guī)模計(jì)算分布式集群服務(wù)器解決方案定位：原子數(shù)1000個(gè)以上求解規(guī)模下面的方案主要是基于辦公環(huán)境的計(jì)算應(yīng)用，Xeon架構(gòu)的計(jì)算機(jī)單機(jī)性能越來(lái)越強(qiáng)大，最新Xeon5600和單核時(shí)代的Xeon相比，快15倍以上，所以基于辦公環(huán)境的小集群（40核以內(nèi)），放在辦公環(huán)境，計(jì)算性能滿足大部分應(yīng)用，同

時(shí)也便于維護(hù)和使用。22U高度(4U*5+1U+1U)分布式服務(wù)器集群方案管理節(jié)點(diǎn)配置：6核XeonE52620(2.0Ghz)/24GB/600GSAS+4*18BSATA計(jì)算節(jié)點(diǎn)配置：8核XeonE52643(3.3Ghz)/48GB/300GSAS計(jì)算節(jié)點(diǎn)數(shù)量：4個(gè)硬件參考配置方案1.圖形管理服務(wù)器(管理節(jié)點(diǎn))機(jī)器型號(hào)：XASUNM56022032-S16T8ARC主要配置6核XeonE52620/32GB/Q4000/600GSAS+8TB陣列

硬件配置明細(xì)配件品牌和型號(hào)數(shù)量CPU6核XeonE5262012.0G/152MB/7.2GTs/超線程/Turbo芯片組intelC600+PCHChips1內(nèi)存8GDDR31600RegECC4顯卡NvidiaQuadro40002GB1系統(tǒng)盤600GSAS6Gbps1超級(jí)陣列1TBSATA企業(yè)級(jí)88portSAS2-RAID1光驅(qū)DVD刻錄機(jī)1網(wǎng)卡千兆以太端口（可選萬(wàn)兆或IB卡）2工作站平臺(tái)XASUNS600R416PAS(1000WEPS)12計(jì)算節(jié)點(diǎn)機(jī)器型號(hào)XASUNR56023348-S13i主要配置8核XeonE52643/48GB/300GSAS硬件配置明細(xì)配件品牌和型號(hào)數(shù)量CPU4核XeonE5264323.06G/12MB/6.4GTs/超線程/Turbo芯片組intelC600+PCHChips內(nèi)存8GDDR31600RegECC6顯卡集成1系統(tǒng)盤300GSAS1光驅(qū)DVD1網(wǎng)卡千兆以太端口2服務(wù)器平臺(tái)XASUNS600U416PAS(1000WEPS)1

3.服務(wù)器集群設(shè)備匯總表NO品牌和型號(hào)數(shù)量硬件配置明細(xì)圖形服務(wù)器集群1.1管理圖形存儲(chǔ)服務(wù)器11.2計(jì)算服務(wù)器（計(jì)算節(jié)