三、基因調(diào)控的反式作用因子(一)TATA框結(jié)合蛋白(二)GC框結(jié)合_第1頁(yè)
三、基因調(diào)控的反式作用因子(一)TATA框結(jié)合蛋白(二)GC框結(jié)合_第2頁(yè)
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三、基因調(diào)控的反式作用因子(一)TATA框結(jié)合蛋白(二)GC框結(jié)合蛋白1,SP1的特征2,不同基因啟動(dòng)子的GC框

(三)CCAAT框結(jié)合蛋白1,CCAAT框多數(shù)是單獨(dú)起作用的2,CCAAT框結(jié)合蛋白3,CTF與NF-1是同一種蛋白4,CTF(NF-1)的作用無(wú)組織特異性(四)RNA聚合酶III及其下游啟動(dòng)區(qū)結(jié)合蛋白1,TFIIIA2,TFIIIB2,TFIIIC(五)其他轉(zhuǎn)錄因子1,概況2,熱休克因子HSF3,糖皮質(zhì)等對(duì)金屬硫蛋白基因的多重調(diào)控4,激素及其影響第五節(jié)

RNA聚合酶Ⅲ啟動(dòng)子的多樣性和三種RNA聚合酶及其啟動(dòng)子的共通性一、RNA聚合酶Ⅲ識(shí)別的基因的內(nèi)部啟動(dòng)子二、RNA聚合酶Ⅲ識(shí)別的基因的外部啟動(dòng)子及啟動(dòng)子遠(yuǎn)上游序列1,U16和7SK基因的外部啟動(dòng)子

2,U6,7SK基因的遠(yuǎn)上游序列三、三種RNA聚合酶對(duì)基因的轉(zhuǎn)錄可能存在協(xié)調(diào)作用1,三類(lèi)基因啟動(dòng)子的共通性是基因表達(dá)協(xié)調(diào)控制的基礎(chǔ)2,例子第六節(jié)

真核生物中轉(zhuǎn)錄的翻譯控制一、通用氨基酸控制1,概念2,通用氨基酸控制的順式調(diào)控成分和反式作用因子二、GCN4基因表達(dá)的翻譯控制1,GCN4mRNA的前導(dǎo)序列(圖9-21)2,GCN4mRNA的翻譯三、通用氨基酸控制基因轉(zhuǎn)錄的翻譯調(diào)控第四節(jié)

轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控一、hnRNA的選擇性加工運(yùn)輸1,hnRNA選擇性加工運(yùn)輸現(xiàn)象2,hnRNA選擇性加工運(yùn)輸?shù)臋C(jī)制(1)hnRNA選擇性加工運(yùn)輸?shù)膬?nèi)容(2)hnRNA的核內(nèi)加工和運(yùn)輸二、mRNA前體的選擇性拼接(一)蛋白質(zhì)異形體及其產(chǎn)生機(jī)制1,蛋白質(zhì)異形體2,蛋白質(zhì)異形體的產(chǎn)生機(jī)制(二)mRNA前體的選擇性拼接第五節(jié)

翻譯水平的調(diào)控一、mRNA的穩(wěn)定性(一)影響真核生物mRNA穩(wěn)定性的因素(二)幾種真核基因的壽命1,持家基因2,細(xì)胞周期蛋白3,終末分化細(xì)胞中的特殊mRNA二、mRNA翻譯起始的調(diào)控1,隱蔽mRNA(maskedmRNA)2,招慕因子三、真核生物蛋白質(zhì)合成的自體調(diào)控1,真核生物微管蛋白mRNA壽命與單體濃度的關(guān)系2,微管蛋白表達(dá)自體調(diào)控的機(jī)制第十章

基因表達(dá)調(diào)控的分子機(jī)制第一節(jié)概述一、基因表達(dá)調(diào)控的定義任何影響轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程的較為直接的因素及其作用二、基因表達(dá)調(diào)控涉及的環(huán)節(jié)DNA合成、RNA復(fù)制、蛋白質(zhì)合成等的各個(gè)過(guò)程都可以成為基因表達(dá)調(diào)控的環(huán)節(jié)三、基因表達(dá)調(diào)控涉及的分子間相互作用(1)核酸內(nèi)部及分子之間的相互作用(2)核酸與蛋白質(zhì)分子之間的相互作用(3)蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)分子之間的相互作用第二節(jié)兩類(lèi)遺傳信息的差異一、I類(lèi)信息和Ⅱ類(lèi)信息二、I類(lèi)信息和Ⅱ類(lèi)信息的差別1,信息解讀體系I類(lèi)信息的解讀依賴(lài)外在的體系II類(lèi)信息的解讀以?xún)?nèi)在和外在相結(jié)合的方式進(jìn)行2,信息解讀范圍類(lèi)信息的解讀范圍較小3,信息解讀方式I類(lèi)信息通過(guò)堿基配對(duì)的方式解讀II類(lèi)信息的解讀通過(guò)蛋白質(zhì)與核酸形成氫鍵4,信息編碼方式I類(lèi)信息是一維、線(xiàn)性的,只位于一條DNA鏈上II類(lèi)信息是三維的,位于兩條DNA鏈上5,信息密碼的簡(jiǎn)并性II類(lèi)信息的簡(jiǎn)并性更高三、調(diào)控密碼形式的復(fù)雜性1,氨基酸殘基與堿基形成氫鍵的復(fù)雜性2,氨基酸殘基與堿基之間的vanderwaal力作用第三節(jié)

調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的對(duì)稱(chēng)性與識(shí)別序列的對(duì)稱(chēng)性一、調(diào)節(jié)蛋白的組織形式1,高級(jí)結(jié)構(gòu)多數(shù)調(diào)控蛋白質(zhì)以多聚體形式存在2,調(diào)節(jié)蛋白以多聚體形式與DNA作用的優(yōu)點(diǎn)節(jié)省編碼的DNA減少大分子裝配的隨機(jī)錯(cuò)誤通過(guò)單體和聚體之間的平衡達(dá)到迅速控制基因活性的目的可以提高調(diào)控作用的特異性二、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的對(duì)稱(chēng)性與其識(shí)別序列之間的關(guān)系1,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)多聚體可能的組合方式(圖10-2)(1)平移對(duì)稱(chēng)(2)二倍軸對(duì)稱(chēng)(3)二倍旋轉(zhuǎn)對(duì)稱(chēng)(4)螺絲對(duì)稱(chēng)2,調(diào)節(jié)蛋白二聚體可能識(shí)別的DNA序列特征大多數(shù)屬于二倍旋轉(zhuǎn)對(duì)稱(chēng),即反向重復(fù)序列第四節(jié)

λ噬菌體的阻遏蛋白和Cro蛋白所組成的轉(zhuǎn)錄開(kāi)關(guān)系統(tǒng)一、λ噬菌體由源原周期轉(zhuǎn)變?yōu)榱呀庵芷诘幕虮磉_(dá)及CI及Cro蛋白的作用二、λ阻遏蛋白及Cro蛋白1,λ阻遏蛋白

(1)Aa數(shù):236(2)功能結(jié)構(gòu)域N端1-92Aa:與操作子的結(jié)合位點(diǎn)C端132-236Aa:負(fù)責(zé)二聚體的形成與操作子的親和力2,Cro蛋白(1)Aa數(shù):66(2)功能結(jié)構(gòu)域:一個(gè),包括DNA結(jié)合及二聚體結(jié)合位點(diǎn)與操作子的親和力三、λ阻遏蛋白及Cro蛋白與操作子結(jié)合的機(jī)制(一)λ阻遏蛋白與OR操作子結(jié)合的機(jī)制1,λ阻遏蛋白對(duì)早期操縱元的負(fù)調(diào)控作用(1)λ阻遏蛋白與OR操作子的結(jié)合λ阻遏蛋白與OR1的結(jié)合可促進(jìn)其與OR2的結(jié)合λ阻遏蛋白與OR1、OR2

結(jié)合,使RNA聚合酶不能進(jìn)入PR,早期基因轉(zhuǎn)錄被關(guān)閉2,λ阻遏蛋白的正調(diào)控作用結(jié)合于OR2

的λ阻遏蛋白促進(jìn)PM啟動(dòng)子cI基因的轉(zhuǎn)錄3,λ阻遏蛋白的表達(dá)的自身身負(fù)調(diào)控高濃度的λ阻遏蛋白可與OR3結(jié)合,阻遏cI基因從PM的轉(zhuǎn)錄(二)Cro蛋白與操作子結(jié)合的機(jī)制Cro蛋白二聚體首先與OR3結(jié)合,關(guān)閉cI基因的活性Cro蛋白二聚體與OR2、OR1結(jié)合,關(guān)閉早期基因轉(zhuǎn)錄第五節(jié)

調(diào)控蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)花式及其與DNA相互作用的細(xì)微機(jī)制一、概述調(diào)節(jié)蛋白DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域的結(jié)構(gòu)花式(圖10-9)二、α螺旋—轉(zhuǎn)角—α螺旋(一)λ阻遏蛋白N-末端及其與操作子的結(jié)合1,λ阻遏蛋白N-末端結(jié)構(gòu)域的結(jié)構(gòu)(圖10-10)有5個(gè)α螺旋,其間是4個(gè)轉(zhuǎn)角氨基末端是一個(gè)柔性長(zhǎng)臂2,λ阻遏蛋白二聚體與操作子的結(jié)合模型(圖10-11)(二)Cro蛋白結(jié)構(gòu)及其與操作子的結(jié)合1,Cro蛋白的結(jié)構(gòu)(圖10-12)有3個(gè)α螺旋和1個(gè)折疊沒(méi)有氨基末端手臂2,操作子上受Cro蛋白保護(hù)的基團(tuán)(圖10-13)堿基位于同側(cè)的兩股大溝中,且呈二倍對(duì)稱(chēng)性磷酸基因位于同側(cè)的兩股大溝之間(三)CI、Cro蛋白及λ操作子相互作用的保守基團(tuán)1,與CI、Cro蛋白結(jié)合的λ操作子的保守堿基與兩種蛋白的α螺旋3的第一和第二個(gè)氨基酸殘基(Gln,Ser)結(jié)合的A和G2,決定CI、Cro蛋白與O位點(diǎn)結(jié)合親和力的氨基酸兩種蛋白的α螺旋3的第五和第六個(gè)氨基酸殘基(四)α螺旋—轉(zhuǎn)角—α螺旋結(jié)構(gòu)的普遍性1,其他原核生物調(diào)控蛋白的α螺旋—轉(zhuǎn)角—α螺旋結(jié)構(gòu)(表10-1)2,識(shí)別螺旋調(diào)控蛋白的α螺旋—轉(zhuǎn)角—α螺旋結(jié)構(gòu)中,位于DNA雙螺旋大溝中的α螺旋對(duì)于識(shí)別DNA具有決定性的意義,稱(chēng)為識(shí)別螺旋3,真核生物調(diào)控蛋白中的α螺旋—轉(zhuǎn)角—α螺旋結(jié)構(gòu)(1)酵母結(jié)合型調(diào)控蛋白a1Α2(2)AntP及其同源蛋白AntPXIHbox2Hox2.3(五)識(shí)別螺旋與DNA堿基序列作用的機(jī)制1,同種噬菌體阻遏蛋白及Cro蛋白識(shí)別螺旋的置換效應(yīng)2,異種噬菌體阻遏蛋白識(shí)別螺旋的互換效應(yīng)

完全互換的體外實(shí)驗(yàn)體內(nèi)實(shí)驗(yàn):不成功434阻遏蛋白外側(cè)面換成P22阻遏蛋白相對(duì)應(yīng)的Aa的效應(yīng)(圖10-15)3,結(jié)論識(shí)別螺旋是調(diào)控蛋白DNA結(jié)合專(zhuān)一性的主要決定因素識(shí)別螺旋的外側(cè)面的氨基酸是它與DNA結(jié)合專(zhuān)一性的主要決定因素,其余部分很可能是結(jié)合所必需的,但對(duì)結(jié)合的專(zhuān)一性沒(méi)有貢獻(xiàn)三、鋅指結(jié)構(gòu)鋅指是DNA結(jié)合蛋白的一個(gè)通用基序(motif)。鋅指結(jié)構(gòu)通常串聯(lián)重復(fù)排列在一起。不同蛋白鋅指數(shù)目不等,有的有9個(gè),有的只有兩個(gè)(一)TFⅢA轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)域1,氨基酸數(shù)目3442,N端結(jié)構(gòu)域(12-276Aa殘基)負(fù)責(zé)與DNA結(jié)合3,C端結(jié)構(gòu)域(276-344Aa殘基)促進(jìn)轉(zhuǎn)錄活性(二)TFⅢA鋅指結(jié)構(gòu)的組成DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域的9個(gè)正向重復(fù)單位構(gòu)成9個(gè)“手指”(三)C2/H2型鋅指蛋白(圖10-18a)1,保守Aa及其形成的結(jié)構(gòu)配位結(jié)構(gòu):由Zn++

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