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文檔簡(jiǎn)介
胰島素是由胰島B細(xì)胞受內(nèi)源性或外源性物質(zhì)如葡萄糖、乳糖、核糖、精氨酸、胰高血糖素等的刺激而分泌的一種蛋白質(zhì)激素。胰島素是機(jī)體內(nèi)唯一降低血糖的激素,同時(shí)促進(jìn)糖原、脂肪、蛋白質(zhì)合成。外源性胰島素主要用來(lái)糖尿病治療。胰島素這類(lèi)活性蛋白多肽和細(xì)胞因子具有高度生物活性,分子量很大,立體結(jié)構(gòu)異常復(fù)雜,體外難以人工合成。所以過(guò)去糖尿病患者只能服用從牛、豬體中提取的胰島素來(lái)治療;但牛、豬胰島素結(jié)構(gòu)上與人胰島素有差別,如與豬胰島素B鏈第30個(gè)氨基酸殘基不同,長(zhǎng)期服用會(huì)引起腎和眼的疾病,故必需要用基因工程方法獲得重組人胰島素進(jìn)行治療。2022/11/171胰島素是由胰島B細(xì)胞受內(nèi)源性或外源性物質(zhì)如葡萄糖、乳糖、核糖基因工程制胰島素三種方法一、A鏈和B鏈分別表達(dá)法化學(xué)合成A鏈和B鏈的編碼序列2022/11/172基因工程制胰島素三種方法一、A鏈和B鏈分別表達(dá)法化學(xué)合成A鏈基因工程制胰島素三種方法一、A鏈和B鏈分別表達(dá)法表達(dá)產(chǎn)物的后期處理路線(xiàn):2022/11/173基因工程制胰島素三種方法一、A鏈和B鏈分別表達(dá)法表達(dá)產(chǎn)物的后基因工程制胰島素三種方法二、人胰島素原表達(dá)法基因工程菌的構(gòu)建戰(zhàn)略:2022/11/174基因工程制胰島素三種方法二、人胰島素原表達(dá)法基因工程菌的構(gòu)建基因工程制胰島素三種方法二、人胰島素原表達(dá)法表達(dá)產(chǎn)物的后期處理路線(xiàn):2022/11/175基因工程制胰島素三種方法二、人胰島素原表達(dá)法表達(dá)產(chǎn)物的后期處基因工程制胰島素三種方法三、A鏈和B鏈同時(shí)表達(dá)法2022/11/176基因工程制胰島素三種方法三、A鏈和B鏈同時(shí)表達(dá)法2022/1方法一:
由于A鏈和B鏈上共存在六個(gè)半胱氨酸殘基,體外二硫鍵的正確配對(duì)率較低,通常只有10%-20%,因此成本高。
方法二:
胰島素原能形成良好的空間構(gòu)象,三對(duì)二硫鍵的正確配對(duì)率提高,折疊率高。工藝路線(xiàn)依然繁瑣。
方法三:
需體外折疊?;蚬こ讨埔葝u素三種方法三種方法比較:2022/11/177方法一:
由于A鏈和B鏈上共存在六個(gè)半胱氨酸殘基,體基因工程獲取胰島素的步驟一、獲取外源目的基因片段二、選擇與獲取表達(dá)載體三、重組目的DNA片段與表達(dá)載體四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞五、重組體導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞六、對(duì)重組體細(xì)胞進(jìn)行篩選純化鑒定七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存八、發(fā)酵培養(yǎng)2022/11/178基因工程獲取胰島素的步驟一、獲取外源目的基因片段2022/1一、獲取外源目的基因片段1.選擇實(shí)驗(yàn)材料2.提取RNA,分離RNA3.逆轉(zhuǎn)錄mRNA,得cDNA第一鏈4.得雙鏈DNA5.DNA序列糾錯(cuò)6.目的基因通過(guò)細(xì)胞克隆擴(kuò)增7.目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目的基因獲取2022/11/179一、獲取外源目的基因片段1.選擇實(shí)驗(yàn)材料2022/11/10一、獲取外源目的基因片段1.選擇實(shí)驗(yàn)材料胰島素是一種蛋白質(zhì)類(lèi)激素,體內(nèi)胰島素是胰島B細(xì)胞(即胰島β細(xì)胞)受內(nèi)源性或外源性物質(zhì)如葡萄糖、乳糖、核糖、精氨酸、胰高血糖素等的刺激而分泌的。胰島素基因只有在胰島B細(xì)胞中才能轉(zhuǎn)錄出信使RNA,所以用基因工程方法生產(chǎn)胰島素時(shí),選用胰島B細(xì)胞為獲取目的基因的實(shí)驗(yàn)材料。2022/11/1710一、獲取外源目的基因片段1.選擇實(shí)驗(yàn)材料2022/11/10一、獲取外源目的基因片段2.提取RNA,分離RNA2.1總RNA的提取
2.2
mRNA的純化
2.3
mRNA的保存2022/11/1711一、獲取外源目的基因片段2.提取RNA,分離RNA2022/一、獲取外源目的基因片段2.1總RNA的提取總RNA的抽提方法有多種,TRIzol試劑是使用組廣泛的RNA抽提試劑,主要由苯酚和異硫氰酸胍組成,可以迅速破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu),使存在于細(xì)胞質(zhì)及核內(nèi)的RNA釋放出來(lái),并使核糖體蛋白與RNA分子分離。苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來(lái)抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。TRIzol是從細(xì)胞和組織中提取總RNA的即用型試劑,在樣品裂解或勻漿過(guò)程中,TRIzol能保持RNA完整性。提取RNA時(shí),首先用液氮研磨材料,勻漿,加入TRIzol試劑,進(jìn)一步破碎細(xì)胞并溶解細(xì)胞成分。然后加入氯仿抽提,離心,分離水相和有機(jī)相,收集含有RNA的水相,通過(guò)異丙醇沉淀,可獲得比較純的總RNA,用于下一步mRNA的純化。
2022/11/1712一、獲取外源目的基因片段2.1總RNA的提取2022/11一、獲取外源目的基因片段2.1.1TRIzol法提取流程(1)樣品處理①培養(yǎng)細(xì)胞:收獲細(xì)胞1-5*10^7,移入1.5ml離心管中,加入1mlTRIzol,混勻,室溫靜置5min。②組織:取50-100mg組織(新鮮或-70℃及液氮中保存的組織均可)置1.5ml離心管中,加入1mlTRIzol充分勻漿,室溫靜置5min。(2)加入0.2ml氯仿,振蕩15s,靜置2min。(3)4℃離心,12000g*15min,取上清液。(4)加入0.5ml異丙醇,將管中液體輕輕混勻,室溫靜置10min。(5)4℃離心,12000g*10min,棄上清液。(6)加入1ml75%乙醇,輕輕洗滌沉淀。4℃,7500g*5min,棄上清液。(7)晾干,加入適量的DEPCH2O溶解(65℃促溶10-15min)。2022/11/1713一、獲取外源目的基因片段2.1.1TRIzol法提取流程2一、獲取外源目的基因片段2.1.1TRIzol法提取流程圖2022/11/1714一、獲取外源目的基因片段2.1.1TRIzol法提取流程圖一、獲取外源目的基因片段2.2
mRNA的純化該方法利用mRNA
3'端含有PolyA(多聚腺苷酸)的特點(diǎn),當(dāng)RNA流經(jīng)寡聚dT纖維素柱時(shí),在高鹽緩沖液的作用下,mRNA被特異性的結(jié)合在柱上,再用低鹽溶液或蒸餾水洗脫mRNA。經(jīng)過(guò)兩次寡聚纖維柱后可得到較高純度的mRNA。2022/11/1715一、獲取外源目的基因片段2.2mRNA的純化2022/11一、獲取外源目的基因片段2.2.1寡聚(dT)纖維素柱純化mRNA(1)試劑準(zhǔn)備:①3M醋酸鈉(pH5.2);②0.1MNaOH;③上樣緩沖液:20mMTris-HCl(pH7.6),0.5MNaCl,1MEDTA(pH8.0),0.1%SLS(十二烷基氨酸鈉)。配制時(shí)可先配制Tris-HCl(pH7.6)、NaCl、EDTA(pH8.0)的母液,經(jīng)高壓消毒后按各成分確切含量,經(jīng)混合后再高壓消毒,冷卻至65℃,加入經(jīng)65℃溫育(30min)的10%SLS至終濃度為0.1%;④洗脫緩沖液:10mMTris-HCl(pH7.6),1mMEDTA(pH8.0),0.05%SDS;⑤無(wú)水乙醇、70%乙醇;⑥D(zhuǎn)EPC(0.1%焦炭酸二乙酯)2022/11/1716一、獲取外源目的基因片段2.2.1寡聚(dT)纖維素柱純化一、獲取外源目的基因片段2.2.1寡聚(dT)纖維素柱純化mRNA(2)操作步驟:①將0.5-1.0g寡聚(dT)纖維懸浮于0.1M的NaOH溶液中。②用DEPC處理的1ml注射器或適當(dāng)?shù)募?xì)管,將寡聚(dT)纖維素裝柱0.5-1ml,用3倍柱床體積的DEPCH2O洗柱。③使用1*上樣緩沖液洗柱,直至洗出液pH值小于8.0。④將RNA溶解于DEPCH2O中,在65℃中溫育10min左右,冷卻至室溫后加入等體2*上樣緩沖液,混勻后上柱,立即收集流出液。當(dāng)RNA上樣液全部進(jìn)入柱床后,再用1*上樣緩沖液洗柱,繼續(xù)收集流出液。⑤將所有流出液于65℃加熱5min,冷卻至室溫后再次上柱,收集流出液。⑥用5-10倍柱床體積的1*上樣緩沖液洗柱,每管1ml分步收集,OD260測(cè)定RNA含量。前部分收集管中流出液的OD260值很高,其內(nèi)含物為無(wú)polyA尾的RNA。后部分收集管中流出液的OD260值很低或無(wú)吸收。⑦用2-3倍柱容積的洗脫緩沖液洗脫poly(A+)RNA,分步收集,每部分為1/3-1/2柱體積。⑧OD260測(cè)定poly(A+)RNA分布,合并含poly(A+)RNA的收集管,加入1/10體積3MNaAc(pH5.2)、2.5倍體積的預(yù)冷無(wú)水乙醇,混勻,-20℃放置30min。⑨4℃離心,10000g*15min,小心吸棄上清。用70%乙醇洗滌沉淀。4℃離心,10000g*5min,棄上清,室溫晾干。⑩用適量的DEPCH2O溶解RNA。2022/11/1717一、獲取外源目的基因片段2.2.1寡聚(dT)纖維素柱純化一、獲取外源目的基因片段2.2.1寡聚(dT)纖維素柱純化mRNA(3)注意事項(xiàng)①整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程必須防止Rnase的污染。②步驟④中將RNA溶液置65℃中溫育然后冷卻至室溫再上樣的目的有兩個(gè),一個(gè)是破壞RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),尤其是mRNApoly(A+)尾處的二級(jí)結(jié)構(gòu),使poly(A+)尾充分暴露,從而提高poly(A+)RNA的回收率;另一個(gè)目的是能解離mRNA與rRNA的結(jié)合,否則會(huì)導(dǎo)致rRNA的污染。所以此步驟不能省略。③十二烷基肌氨酸鈉鹽在18℃以下溶解度下降,會(huì)阻礙柱內(nèi)液體流動(dòng),若室溫低于18℃最好用LiCl替代NaCl。④寡聚(dT)纖維素柱可在4℃貯存,反復(fù)使用。每次使用前應(yīng)該依次用NaOH、滅菌ddH2O、上樣緩沖液洗柱。⑤一般而言,107哺乳動(dòng)物培養(yǎng)細(xì)胞能提取1-5μgpoly(A+)RNA,約相當(dāng)于上柱總RNA量的1%-2%。2022/11/1718一、獲取外源目的基因片段2.2.1寡聚(dT)纖維素柱純化一、獲取外源目的基因片段2.3
mRNA的保存用少量水溶解mRNA,即可用于cDNA合成或保存在70%乙醇中并于-70℃下貯存。2022/11/1719一、獲取外源目的基因片段2.3mRNA的保存2022/11一、獲取外源目的基因片段胰島素基因mRNA序列2022/11/1720一、獲取外源目的基因片段胰島素基因mRNA序列2022/11一、獲取外源目的基因片段胰島素基因mRNA序列NCBI中搜索得2022/11/1721一、獲取外源目的基因片段胰島素基因mRNA序列NCBI中搜索一、獲取外源目的基因片段3.逆轉(zhuǎn)錄mRNA,得cDNA第一鏈mRNA在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下由引物引導(dǎo)合成cDNA。加入高濃度的
Oligo(dT)引物,
,Oligo(dT)引物與
mRNA
的
3'
末端的
poly(A)配對(duì),引導(dǎo)反轉(zhuǎn)錄酶以
mRNA
為模板合成第一鏈
cDNA
。這種
cDNA
合成的方法在
cDNA
文庫(kù)構(gòu)建中應(yīng)用極為普遍,其缺點(diǎn)主要是由于
cDNA
末端存在較長(zhǎng)的
poly(A)而影響
cDNA
測(cè)序。(原因:oligo(dT)結(jié)合在mRNA的3‘端,因此合成全長(zhǎng)的cDNA需要反轉(zhuǎn)錄酶從mRNA分子的一端移動(dòng)到另一端,有時(shí)這種全合成難以達(dá)到)2022/11/1722一、獲取外源目的基因片段3.逆轉(zhuǎn)錄mRNA,得cDNA第一鏈一、獲取外源目的基因片段4.得雙鏈DNA
4.1合成cDNA第二鏈得雙鏈DNA
4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增2022/11/1723一、獲取外源目的基因片段4.得雙鏈DNA2022/11/10一、獲取外源目的基因片段4.1合成cDNA第二鏈得雙鏈DNAmRNA-cDNA
雜合雙鏈中的
mRNA
鏈在
RNA
酶
H
作用下先形成很多切口,
mRNA
鏈就被切割成很多的小片段,這些小片段為大腸桿菌
DNA
聚合酶
Ⅰ
提供了合成第二鏈的引物。大腸桿菌
DNA
聚合酶
Ⅰ
以第一鏈
cDNA
為模板合成一段段互補(bǔ)的
cDNA
片段。這些
cDNA
片段進(jìn)而在
DNA
連接酶的作用下連接成一條鏈,即
cDNA
的第二鏈。遺留在
5'-末端的一段很小的
mRNA
也被大腸桿菌
DNA
聚合酶
Ⅰ
的
5'3'
核酸外切酶和
RNA
酶
H
降解,暴露出與第一鏈
cDNA
對(duì)應(yīng)的
3'-端部分序列。同時(shí),大腸桿菌
DNA
聚合酶
Ⅰ
的
3'--5'
核酸外切酶的活性可將暴露出的第一鏈
cDNA
的
3'-端部分消化掉,形成平端或差不多的平端優(yōu)點(diǎn):a)合成cDNA的效率高
b)直接利用第一鏈的反應(yīng)產(chǎn)物,不需純化
c)避免使用S1核酸酶來(lái)切割雙鏈cDNA2022/11/1724一、獲取外源目的基因片段4.1合成cDNA第二鏈得雙鏈DNA一、獲取外源目的基因片段4.1合成cDNA第二鏈得雙鏈DNA2022/11/1725一、獲取外源目的基因片段4.1合成cDNA第二鏈得雙鏈DNA一、獲取外源目的基因片段4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增
4.2.1模板DNA的變性向離心管加入DNA模板、引物、耐熱的DNA聚合酶、PCR緩沖液(500mm01/LKCl;100mmol/LTris一HCl(pH8.4),150mmol/LMgCl2,lmg/m1明膠)、5mmo1/LdNTP貯備液,然后加熱至93℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備2022/11/1726一、獲取外源目的基因片段4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行一、獲取外源目的基因片段4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增
4.2.2模板DNA與引物的退火(復(fù)性)模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;2022/11/1727一、獲取外源目的基因片段4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行一、獲取外源目的基因片段4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增
4.2.3引物的延伸DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈,重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬(wàn)倍。2022/11/1728一、獲取外源目的基因片段4.2將DNA雙鏈通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行一、獲取外源目的基因片段5.目的基因回收純化及DNA測(cè)序糾錯(cuò)
5.1將目的基因進(jìn)行回收純化
5.2對(duì)目的基因進(jìn)行測(cè)序
5.3DNA序列糾錯(cuò)2022/11/1729一、獲取外源目的基因片段5.目的基因回收純化及DNA測(cè)序糾錯(cuò)一、獲取外源目的基因片段5.1將目的基因進(jìn)行回收純化1)在PCR試管中加入凝膠緩沖液進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳電泳到適當(dāng)位置后在目的DNA條帶的前端挖一長(zhǎng)方形槽,向槽中加入融化的低熔點(diǎn)膠,待凝固后進(jìn)行電泳。2)當(dāng)DNA進(jìn)入低熔點(diǎn)膠中心時(shí)停止電泳。紫外燈下切下目的條帶的低熔點(diǎn)膠。3)將切下的膠放到離心管中,加入200μl的TE緩沖液,65℃溫浴3分鐘以融化低熔點(diǎn)膠。4)然后分別用酚/氯仿,氯仿抽提一次。取上清,加入2倍體積的無(wú)水乙醇,-20℃沉淀DNA2h以上,12000rpm離心15min,棄上清,用70%乙醇洗滌,吹干后溶于10μl無(wú)菌水中。注意事項(xiàng):在紫外燈下切出含有目的DNA片段的瓊脂糖凝膠時(shí)應(yīng)注意要快速操作,以免損傷DNA。2022/11/1730一、獲取外源目的基因片段5.1將目的基因進(jìn)行回收純化20一、獲取外源目的基因片段5.2對(duì)目的基因進(jìn)行測(cè)序利用DNA聚合酶,以待測(cè)單鏈DNA為模板,以dNTP為底物,設(shè)立四種相互獨(dú)立的測(cè)序反應(yīng)體系,在每個(gè)反應(yīng)體系中加入不同的ddNTP作為鏈延伸終止劑。在測(cè)序引物引導(dǎo)下,按照堿基配對(duì)原則,每個(gè)反應(yīng)體系中合成一系列長(zhǎng)短不一的引物延伸鏈,通過(guò)高分辨率的變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,放射自顯影檢測(cè)后,從凝膠底部到頂部按5’至3’方向讀出新合成鏈序列,由此推知待測(cè)模板鏈的序列。2022/11/1731一、獲取外源目的基因片段5.2對(duì)目的基因進(jìn)行測(cè)序2022一、獲取外源目的基因片段5.2對(duì)目的基因進(jìn)行測(cè)序2022/11/1732一、獲取外源目的基因片段5.2對(duì)目的基因進(jìn)行測(cè)序2022一、獲取外源目的基因片段5.3DNA序列糾錯(cuò)1、將待突變基因克隆到突變載體上;2、制備含突變基因的單鏈模板;3、人工合成一段改變了堿基順序的寡核苷酸片段,以此作為引物,在體外合成互補(bǔ)鏈,獲得含有錯(cuò)配堿基的完整雙鏈M13DNA4、轉(zhuǎn)化和初步篩選異源雙鏈DNA分子轉(zhuǎn)化大腸桿菌后,產(chǎn)生野生型、突變型的同源雙鏈DNA分子。5、用誘變的寡核苷酸引物作為探針,通過(guò)雜交即可鑒定出突變體2022/11/1733一、獲取外源目的基因片段5.3DNA序列糾錯(cuò)2022/1一、獲取外源目的基因片段6、目的基因通過(guò)細(xì)胞克隆擴(kuò)增6.1目的基因與運(yùn)載體結(jié)合6.2將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞并使之?dāng)U增6.3篩選獲得了重組DNA分子的受體細(xì)胞克隆2022/11/1734一、獲取外源目的基因片段6、目的基因通過(guò)細(xì)胞克隆擴(kuò)增2022一、獲取外源目的基因片段6.1目的基因與運(yùn)載體結(jié)合用與提取目的基因相同的限制酶切割質(zhì)粒使之出現(xiàn)一個(gè)切口;將目的基因插入切口處,讓目的基因的黏性末端與切口上的黏性末端互補(bǔ)配對(duì);在連接酶的作用下連接形成重組DNA分子。2022/11/1735一、獲取外源目的基因片段2022/11/1035一、獲取外源目的基因片段6.2將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞并使之?dāng)U增要讓目的基因表達(dá),必須將它導(dǎo)入受體細(xì)胞并進(jìn)行擴(kuò)增。為獲得目的基因的表達(dá)產(chǎn)物時(shí),通常以大腸桿菌等無(wú)害易得的細(xì)菌為受體。注意:為改進(jìn)某種生物時(shí),將欲改進(jìn)的生物細(xì)胞為受體。為使重組的DNA分子更容易進(jìn)入受體細(xì)胞,通常還要用一些物質(zhì)對(duì)受體細(xì)胞進(jìn)行處理,使受體細(xì)胞具有更大的通透性,例如改變PH值,加入氯化鈣等。2022/11/1736一、獲取外源目的基因片段6.2將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞并使之一、獲取外源目的基因片段6.3篩選獲得重組DNA分子的受體細(xì)胞克隆前幾步的處理十分繁鎖,為保證目的基因得到有效利用,通常用大量的受體細(xì)胞來(lái)接受不多的目的基因。這樣,處理的受體細(xì)胞中真正攝入了目的基因的很少,必須將它從中檢測(cè)出來(lái)。細(xì)菌的檢測(cè),將每個(gè)受體細(xì)胞單獨(dú)培養(yǎng)形成菌落,檢測(cè)菌落中是否有目的基因的表達(dá)產(chǎn)物。淘汰無(wú)表達(dá)產(chǎn)物的菌落,保留有表達(dá)產(chǎn)物的進(jìn)一步培養(yǎng)、研究。多細(xì)胞生物的檢測(cè),將每個(gè)受體細(xì)胞單獨(dú)培養(yǎng)并誘導(dǎo)發(fā)育成完整個(gè)體,檢測(cè)這些個(gè)體是否攝入目的基因,攝入的基因是否表達(dá)(是否表現(xiàn)出相應(yīng)的性狀)。2022/11/1737一、獲取外源目的基因片段6.3篩選獲得重組DNA分子的受體一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目的基因獲取7.1內(nèi)容物釋放將培養(yǎng)物加入試管,加入EDTA及去污劑(SDS),用堿處理細(xì)菌,使細(xì)菌的細(xì)胞壁破裂,釋放出細(xì)胞內(nèi)容物(在強(qiáng)堿環(huán)境下,宿主菌的線(xiàn)性雙鏈DNA片段中的氫鍵斷裂,雙鏈解離變性,而質(zhì)粒DNA共價(jià)閉合環(huán)狀的雙鏈并不完全分離)。2022/11/1738一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目的基因獲取7.2加酸、離心然后加入高濃度酸性鹽,PH恢復(fù)至中性(變性的染色體DNA與變性的蛋白質(zhì)以及細(xì)胞碎片凝聚成網(wǎng)絡(luò)狀大分子不溶性沉淀物,而質(zhì)粒DNA又恢復(fù)天然構(gòu)型,能溶解在上清液中),通過(guò)離心把染色體DNA,蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起除去。2022/11/1739一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目的基因獲取7.3切割、電泳利用限制性?xún)?nèi)切酶特異的識(shí)別DNA特異的核苷酸序列,并切割DNA,產(chǎn)生一定長(zhǎng)度的DNA片段,通過(guò)電泳對(duì)酶切前后產(chǎn)物分析可以鑒別目的基因2022/11/1740一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目的基因獲取7.4回收純化、測(cè)序?qū)δ康幕蜻M(jìn)行回收純化,再測(cè)序2022/11/1741一、獲取外源目的基因片段7、目的基因回收及DNA測(cè)序,最終目二.表達(dá)載體的構(gòu)建pET28a(含有T7噬菌體啟動(dòng)子、乳糖操縱子、核糖體結(jié)合位點(diǎn)、His6標(biāo)簽序列、凝血酶切割位點(diǎn)、多克隆位點(diǎn)、T7噬菌體終止子、乳糖阻遏序列、pBR322復(fù)制子ori、fl噬菌體復(fù)制子、卡那霉素篩選標(biāo)記序列等。)2022/11/1742二.表達(dá)載體的構(gòu)建pET28a(含有T7噬菌體啟動(dòng)子、乳糖操二.表達(dá)載體的構(gòu)建2022/11/1743二.表達(dá)載體的構(gòu)建2022/11/1043原因:1.T7噬菌體啟動(dòng)子、核糖體結(jié)合位點(diǎn)等引導(dǎo)目的基因高效轉(zhuǎn)錄和翻譯。2.乳糖操縱子和乳糖阻遏序列存在的意義主要在于,當(dāng)目的蛋白對(duì)大腸桿菌有毒性的時(shí)候,可以通過(guò)添加阻遏物,控制目的蛋白以較低水平表達(dá)。3.His6標(biāo)簽序列、凝血酶切割位點(diǎn)存在的意義主要在于方便利用針對(duì)His6的整合層析分離純化蛋白、然后利用凝血酶去除切割標(biāo)簽蛋白。4.卡那霉素抗性基因編碼的氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶,對(duì)卡那霉素進(jìn)行修飾,阻斷其與核糖體結(jié)合作用。二.表達(dá)載體的構(gòu)建2022/11/1744原因:二.表達(dá)載體的構(gòu)建2022/11/1044三.重組目的DNA片段和表達(dá)載體用T7噬菌體DNA連接酶將質(zhì)粒載體pET28a經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ酶切的片段與目的基因經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ酶切的片段連接起來(lái),構(gòu)成重組DNA分子。使用雙酶切:DNA分子重組時(shí)為了保證目的片段以正確的方向連接進(jìn)入載體,往往盡可能選擇兩種具有不同黏性末端的酶分別酶切目的DNA分子和載體,這種雙酶切雖然使載體和目的DNA都產(chǎn)生兩種不同的黏性末端,但是連接酶會(huì)選擇把相同的黏性末端連接起來(lái),從而保證目的基因只以一個(gè)方向連接入載體。2022/11/1745三.重組目的DNA片段和表達(dá)載體用T7噬菌體DNA連接酶將質(zhì)四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞1、選擇大腸桿菌2、培養(yǎng)大腸桿菌2022/11/1746四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞1、選擇大腸桿菌2022/11/104四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞1、選擇大腸桿菌原因:1)繁殖迅速、培養(yǎng)簡(jiǎn)單、操作方便、遺傳穩(wěn)定2)基因克隆及表達(dá)系統(tǒng)成熟完善3)全基因組測(cè)序完成,共有4405個(gè)開(kāi)放性閱讀框架4)被美國(guó)FDA批準(zhǔn)為安全的基因工程受體生物2022/11/1747四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞1、選擇大腸桿菌原因:2022/11/四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞開(kāi)放閱讀框(ORF)是生物個(gè)體的基因組中,可能是蛋白質(zhì)編碼序列的部分?;蛑械腛RF包含并位于開(kāi)始編碼與終止編碼之間。由于一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時(shí)存在許多不同的開(kāi)放閱讀框架。開(kāi)放閱讀框包含一段可以編碼蛋白的堿基序列,不能被終止子打斷。2022/11/1748四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞開(kāi)放閱讀框(ORF)是生物個(gè)體的2、大腸桿菌的培養(yǎng)(1)LB(Luria-Bertain)液體培養(yǎng)基配制精解蛋白胨(bacto-tryptone)1.0%酵母浸出粉(bacto-extract)0.5%氯化鈉1.0%攪拌使之完全溶解,用5molNaOH(about0.2ml/1000ml培養(yǎng)基)調(diào)pH至7.0,如用進(jìn)口試劑可不必調(diào),高壓滅菌20min(120℃0.1Mpa)
四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞2022/11/17492、大腸桿菌的培養(yǎng)四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞2022/11/10四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞(2)牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基組成成分:牛肉膏3g,蛋白胨10g,Nacl5g,瓊脂15~20g,水1000mL,PH7.4~7.6。具體配置步驟:1.稱(chēng)藥品按實(shí)際用量計(jì)算后,按配方稱(chēng)取各種藥品放入大燒杯中.牛肉膏可放在小燒杯或表面皿中稱(chēng)量,用熱水溶解后倒入大燒杯;也可放在稱(chēng)量紙上稱(chēng)量,隨后放入熱水中,牛肉膏使與稱(chēng)量紙分離,立即取出紙片.蛋白胨極易吸潮,故稱(chēng)量時(shí)要迅速。2022/11/1750四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞(2)牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基2022/1四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:2.加熱溶解在燒杯中加入少于所需要的水量,然后放在石棉網(wǎng)上,小火加熱,并用玻棒攪拌,待藥品完全溶解后再補(bǔ)充水分至所需量.若配制固體培養(yǎng)基,則將稱(chēng)好的瓊脂放入己溶解的藥品中,再加熱融化,此過(guò)程中,需不斷攪拌,以防瓊脂糊底或溢出,最后補(bǔ)足所失的水分。
3.調(diào)pH檢測(cè)培養(yǎng)基的pH,若pH偏酸,可滴加lmol/LNaOH,邊加邊攪拌,并隨時(shí)用pH試紙檢測(cè),直至達(dá)到所需pH范圍.若偏堿,則用lmol/LHCl進(jìn)行調(diào)節(jié).pH的調(diào)節(jié)通常放在加瓊脂之前.應(yīng)注意pH值不要調(diào)過(guò)頭,以免回調(diào)而影響培養(yǎng)基內(nèi)各離子的濃度。2022/11/1751四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:2022/11/105四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:4.過(guò)濾液體培養(yǎng)基可用濾紙過(guò)濾,固體培養(yǎng)基可用4層紗布趁熱過(guò)濾,以利培養(yǎng)的觀察.但是供一般使用的培養(yǎng)基,這步可省略。5.分裝按實(shí)驗(yàn)要求,可將配制的培養(yǎng)基分裝入試管或三角瓶?jī)?nèi).分裝時(shí)可用漏斗以免使培養(yǎng)基沾在管口或瓶口上而造成污染.分裝量:固體培養(yǎng)基約為試管高度的l/5,滅菌后制成斜面.分裝入三角瓶?jī)?nèi)以不超過(guò)其容積的一半為宜.半固體培養(yǎng)基以試管高度的1/3為宜,滅菌后垂直待凝。2022/11/1752四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:2022/11/105四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:6.加棉塞試管口和三角瓶口塞上用普通棉花(非脫脂棉)制作的棉塞.棉塞的形狀,大小和松緊度要合適,四周緊貼管壁,不留縫隙,才能起到防止雜菌侵入和有利通氣的作用.要使棉塞總長(zhǎng)約3/5塞入試管口或瓶口內(nèi),以防棉塞脫落.有些微生物需要更好的通氣,則可用8層紗布制成通氣塞.有時(shí)也可用試管帽或塑料塞代替棉塞。
7.包扎加塞后,將三角瓶的棉塞外包一層牛皮紙或雙層報(bào)紙,以防滅菌時(shí)冷凝水沾濕棉塞.若培養(yǎng)基分裝于試管中,則應(yīng)以5支或7支在一起,再于棉塞外包一層牛皮紙,用繩扎好.然后用記號(hào)筆注明,培養(yǎng)基名稱(chēng),組別,日期。
2022/11/1753四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:2022/11/105四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:8.滅菌將上述培養(yǎng)基于121.3℃濕熱滅菌20min.如因特殊情況不能及時(shí)滅菌,則應(yīng)故人冰箱內(nèi)暫存。
9.無(wú)菌檢查將滅菌的培養(yǎng)基放入37℃溫箱中培養(yǎng)24~48h,無(wú)菌生長(zhǎng)即可使用,或貯存于冰箱或清潔的櫥內(nèi),備用。
2022/11/1754四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞具體配置步驟:2022/11/105四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞大腸桿菌培養(yǎng):采用劃痕接種法。用接種環(huán)從菌種中沾取少量菌液,劃線(xiàn)。37攝氏度,恒溫培養(yǎng)48到72小時(shí),因?yàn)榻臃N時(shí)和具體培養(yǎng)條件的不同,其生長(zhǎng)一般都在2天外才能長(zhǎng)出明顯的菌落。菌落特征:乳白色,圓形,菌落邊緣整齊,表面光滑,表面和背面顏色一致。2022/11/1755四、選擇與獲取表達(dá)細(xì)胞大腸桿菌培養(yǎng):2022/11/1055五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞氯化鈣轉(zhuǎn)化法
對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的大腸桿菌經(jīng)冰浴的氯化鈣低滲溶液處理,其細(xì)胞膜通透性增加,成為感受態(tài)細(xì)胞(感受態(tài)是指受體細(xì)胞處于容易吸收外源DNA的一種生理狀態(tài)),加入重組質(zhì)粒,重組質(zhì)粒與鈣離子形成復(fù)合物并粘附于細(xì)菌細(xì)胞膜表面,經(jīng)42℃熱休克處理,細(xì)胞膜通透性增加,重組質(zhì)粒DNA進(jìn)入感受態(tài)細(xì)胞(導(dǎo)入重組體)。細(xì)菌在不含抗生素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)一定時(shí)間,使含有重組質(zhì)粒的細(xì)胞復(fù)原并表達(dá)抗生素抗性基因,涂布于含有抗生素的培養(yǎng)板上,生長(zhǎng)得到轉(zhuǎn)化子。2022/11/1756五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞氯化鈣轉(zhuǎn)化法2022/11/105氯化鈣法轉(zhuǎn)化的原理機(jī)制:在0℃的CaCl2低滲溶液中,細(xì)菌細(xì)胞發(fā)生膨脹,Ca2+
使細(xì)胞膜磷脂層形成液晶結(jié)構(gòu),促使細(xì)胞外膜與內(nèi)膜間隙中部分核酸酶解離,誘導(dǎo)形成感受態(tài)。此外,Ca2+能與加入的DNA分子結(jié)合,形成抗脫氧核糖核酸酶的羥基-磷酸鈣復(fù)合物,黏附在胞膜的外表面;42℃熱激處理,細(xì)胞膜的液晶結(jié)構(gòu)發(fā)生擾動(dòng),出現(xiàn)間隙。五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1757氯化鈣法轉(zhuǎn)化的原理機(jī)制:五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/氯化鈣轉(zhuǎn)化法要點(diǎn):1.氯化鈣(二價(jià)鈣離子)的作用:提高細(xì)胞壁(膜)的通透性;2.熱激后迅速轉(zhuǎn)移到冰上:促使質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)移進(jìn)入胞內(nèi);3.這種轉(zhuǎn)化方法適用于雙鏈環(huán)狀DNA(質(zhì)粒),線(xiàn)型DNA不能采用此法。(在自然界自然發(fā)生的轉(zhuǎn)化過(guò)程中,進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞中的為單鏈DNA。)五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1758氯化鈣轉(zhuǎn)化法要點(diǎn):五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒DNA、重組質(zhì)粒DNA、大腸桿菌JM109、離心機(jī)、0.1mol/LCaCl2
、LB培養(yǎng)基、微量移液器、微量離心管、抗生素、20mmol/LMgSO4、微孔濾膜及濾器、培養(yǎng)皿、三角瓶、恒溫水浴箱、恒溫?fù)u床、超凈工作臺(tái)、玻璃涂布棒、95%乙醇實(shí)驗(yàn)材料:五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1759標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒DNA、重組質(zhì)粒DNA、大腸桿菌JM109、離心機(jī)、注意事項(xiàng):①質(zhì)粒的質(zhì)量和濃度。用于轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒DNA應(yīng)主要是超螺旋DNA。轉(zhuǎn)化效率與外源DNA的濃度在一定范圍內(nèi)成正比,但當(dāng)加入的外源DNA的量過(guò)多或體積過(guò)大時(shí),轉(zhuǎn)化效率就會(huì)降低。②試劑的質(zhì)量。所用試劑均需要最高純度的,并用超純水新鮮配制,滅菌備用。③防止雜菌和雜DNA的污染。五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1760注意事項(xiàng):五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1060二價(jià)鈣離子對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響熱激溫度對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1761二價(jià)鈣離子對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響熱激溫度對(duì)轉(zhuǎn)化效率的影響五、重組D感受態(tài)細(xì)胞的制備:1、從新活化的E.coliDH5α平板上挑取一單菌落,接種于3~5mlLB液體培養(yǎng)中,37℃振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期(12h左右);2、將該菌懸液以1:100~1:50轉(zhuǎn)接于100mlLB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩擴(kuò)大培養(yǎng),當(dāng)培養(yǎng)液開(kāi)始出現(xiàn)混濁后,每隔20~30min測(cè)一次OD600,至OD600為0.3~0.5時(shí)停止培養(yǎng),并轉(zhuǎn)裝到1.5mL離心管中;3、培養(yǎng)物于冰上放置20min;4、0~4℃,4000g離心10min,棄去上清液,加入1mL冰冷的0.1mo1/LCaCl2溶液,小心懸浮細(xì)胞,冰浴20分鐘;五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/1762感受態(tài)細(xì)胞的制備:五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/5、0~4℃,4000g離心10min,倒凈上清培養(yǎng)液,再用1.0mL冰冷的0.1mo1/LCaCl2溶液輕輕懸浮細(xì)胞,冰浴20min;6、0~4℃,4000g離心10min,棄去上清液,加入100μL冰冷的0.1mo1/LCaCl2溶液,小心懸浮細(xì)胞,冰上放置片刻后,即制成了感受態(tài)細(xì)胞懸液;制備好的感受態(tài)細(xì)胞懸液可直接用于轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),如果在4℃放置12~24h,其轉(zhuǎn)化效率可以增高4~6倍;也可加入占總體積15%左右高壓滅菌過(guò)的甘油,混勻后分裝于1.5ml離心管中,置于-70℃條件下,可保存半年至一年。五、重組DNA導(dǎo)入表達(dá)細(xì)胞2022/11/17635、0~4℃,4000g離心10min,倒凈上清培養(yǎng)液,再六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定在重組DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)中,由于重組率很低,因此需要從這些細(xì)胞中篩選出期望重組子,將轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞涂布于特定的固體培養(yǎng)板,生長(zhǎng)出的單菌落或噬菌斑進(jìn)一步篩選和鑒定。2022/11/1764六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定在重組DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)中1、載體遺傳標(biāo)記法(抗生素抗性篩選法、營(yíng)養(yǎng)缺陷型篩選法、噬菌斑篩選法、互補(bǔ)篩選法)2、核酸分子雜交法菌落原位雜交:制備與目的基因某一區(qū)域同源的探針序列,根據(jù)核酸雜交原理,探針序列特異性的雜交目的基因,并通過(guò)放射性同位素或熒光基團(tuán)進(jìn)行定位檢測(cè)。六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定2022/11/17651、載體遺傳標(biāo)記法(抗生素抗性篩選法、營(yíng)養(yǎng)缺陷型篩選法3、目的基因表達(dá)產(chǎn)物測(cè)定法如果重組DNA的目的基因能在宿主細(xì)胞中編碼蛋白質(zhì),且宿主細(xì)胞本身不含該蛋白質(zhì),那么可以通過(guò)檢測(cè)蛋白質(zhì)的生物功能或結(jié)構(gòu)來(lái)篩選和鑒定重組子。六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定2022/11/17663、目的基因表達(dá)產(chǎn)物測(cè)定法六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定用熒光原位標(biāo)記篩選重組體1、制備核酸探針,通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢(xún)所需的寡核苷酸探針的資料,用DNA合成儀合成,然后用熒光素進(jìn)行標(biāo)記。2、將樣品進(jìn)行打碎、離心、清洗等步驟,使微生物細(xì)胞與雜質(zhì)進(jìn)行分離,同時(shí)增大細(xì)胞壁的通透性,保證探針?biāo)憷M(jìn)入與DNA雜交。3、配置雜交液,其中雜交液中的甲酰胺的濃度直接影響雜交的特異性,將雜交液與樣品之一雜交爐(避光、密封),雜交完成后用洗脫液(SET或SSC)將多余的探針除去。4、加少量的苯二胺-甘油溶液覆蓋樣品,防止熒光淬滅,再封片,用熒光顯微鏡觀察、照相進(jìn)行分析。六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定2022/11/1767用熒光原位標(biāo)記篩選重組體六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定2022熒光原位雜交技術(shù)熒光原位雜交是一種非放射性原位雜交方法,將熒光標(biāo)記的探針與待測(cè)序列進(jìn)行雜交,根據(jù)雜交信號(hào)的有無(wú)及類(lèi)型達(dá)到診斷的目的。原理:基于堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則,用熒光素標(biāo)記的已知外源DNA或RNA作探針,與載玻片上的組織切片等雜交,與待測(cè)核酸的靶序列專(zhuān)一性結(jié)合,通過(guò)檢測(cè)雜交位點(diǎn)熒光來(lái)顯示特定核苷酸序列的存在、數(shù)目和定位。六、重組體細(xì)胞的篩選純化鑒定2022/11/1768熒光原位雜交技術(shù)熒光原位雜交是一種非放射性原位雜交方法,將熒產(chǎn)物1.菌種RRhPIZpQE-40E.coliM15菌株七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1769產(chǎn)物1.菌種七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/10692.材料與試劑
DEAE-SepharoseFF(瓊脂糖快流速陰離子交換劑)為杭州爭(zhēng)光樹(shù)脂有限公司產(chǎn)品,SephadexG-25為Sigma公司產(chǎn)品,Superdex75為GE公司產(chǎn)品,溶菌酶、脫氧核糖核酸酶、胰蛋白酶和羧肽酶B均為Sigma公司產(chǎn)品,谷胱甘肽[氧化型(GSSG)和還原型(GSH)]為上海博奧生物科技有限公司產(chǎn)品,二硫蘇糖醇(DTY)為OrganicsInc產(chǎn)品,13-巰基乙醇和異丙基-13-D-巰基吡喃半乳糖苷(IPTG)為BB1分裝,胰蛋白胨、酵母粉(英國(guó)Oxiod公司),氨芐青霉素(美國(guó)Sigma公司),其余試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純產(chǎn)品。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/17702.材料與試劑七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/107培養(yǎng)基:(1)LB培養(yǎng)基(g/L):胰蛋白胨10.0,酵母提取物5.0,NaCl10.0,pH7.0;(2)發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖4,甘油15,酵母粉30,蛋白胨30,Na2HPO412,KH2PO46,NH4Cl1,NaCl2,MgSO40.48,pH7.0;(3)甘油補(bǔ)料培養(yǎng)基(g/L):甘油300,酵母汁150,MgSO410,pH7.0。所有培養(yǎng)基使用前均加入氨芐青霉素至終濃度50mg/L。水平恒溫?fù)u床(德國(guó)Therma公司);BiostatB發(fā)酵系統(tǒng)(德國(guó)Braun公司);蛋白質(zhì)電泳凝膠自動(dòng)成像系統(tǒng)(英國(guó)Syngene公司)。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1771培養(yǎng)基:七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/10713.細(xì)菌培養(yǎng)和RRhPI的表達(dá)采用二級(jí)發(fā)酵的方式,用正交法優(yōu)化培養(yǎng)條件,并將優(yōu)化條件用于發(fā)酵罐進(jìn)行發(fā)酵,收獲濕菌體。RRhPIZpQE-40E.coliM15的發(fā)酵罐培養(yǎng):將lOlId經(jīng)過(guò)活化的RRhPI/pQE-40E.coliM15轉(zhuǎn)移至100ml培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)一段時(shí)間后,將其轉(zhuǎn)移至含有1.5L培養(yǎng)基的發(fā)酵罐中,培養(yǎng)一段時(shí)間(轉(zhuǎn)速為300r/min,通氣量為1:1.5-1:1.8),過(guò)程中加人一定量新鮮的培養(yǎng)基并用NaOH調(diào)節(jié)pH,之后加入IPTG并升溫誘導(dǎo)RRhPI的表達(dá),轉(zhuǎn)速隨即調(diào)為400-500r/min,增大通氣量至1:1.8-1:2.0,繼續(xù)培養(yǎng)一段時(shí)間后,收集菌體。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/17723.細(xì)菌培養(yǎng)和RRhPI的表達(dá)七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2024.包涵體的收集和洗滌將收集的濕菌體凍存于-2O℃,然后懸浮于緩沖液A(50mmol/Lrifs-HC1,0.5mmol/LEDTA,50mmol/LNaC1,5%甘油,0.1-0.5mmol/LDTY,pH7.9)(5-6ml/g濕菌)中,加入溶菌酶(5mg/g濕菌體),室溫或37℃振蕩2h。冰浴超聲10S×30次,其間每次間隔20S,功率為200W。10℃條件下1000g離心5min去除細(xì)胞碎片。上清液中的包涵體(Inclusionbody,IB)在4℃條件下27000g離心15min收集,然后用含2mol/L尿素的緩沖液A充分懸浮,室溫靜置30min后4℃條件下17000g離心15min,收集沉淀。沉淀再用含2%脫氧膽酸鈉的緩沖液A充分懸浮,4℃條件下17000g離心l5min,收集沉淀。最后沉淀用10mmol/Lrifs-HC1,pH7.3洗滌兩次(4℃,17000g離心15min)。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/17734.包涵體的收集和洗滌七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11注意事項(xiàng):細(xì)胞內(nèi)表達(dá)的最大問(wèn)題就是容易形成不溶性的包涵體,它的形成對(duì)表達(dá)產(chǎn)物的活性不利。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1774注意事項(xiàng):細(xì)胞內(nèi)表達(dá)的最大問(wèn)題就是容易形成不溶性的包涵體,它包涵體(inclusionbody)是細(xì)菌表達(dá)的蛋白質(zhì)在胞內(nèi)互相凝集而形成的無(wú)活性固體顆粒。具有很強(qiáng)的折光性。正常的大腸桿菌基因以重組方法使其在大腸桿菌內(nèi)表達(dá)也會(huì)形成包涵體。說(shuō)明不僅僅是外源蛋白才能形成包涵體,同時(shí)也發(fā)現(xiàn)有表達(dá)量較低的基因產(chǎn)物也是以不可溶形式存在的。包涵體的形成不僅僅與宿主細(xì)胞、表達(dá)基因有關(guān),還與培養(yǎng)外環(huán)境有關(guān)系。其形成的原因多數(shù)認(rèn)為:目的基因的過(guò)度表達(dá)使蛋白質(zhì)無(wú)足夠時(shí)間進(jìn)行肽鏈折疊,產(chǎn)生凝集。重組蛋白所處的環(huán)境條件對(duì)包涵體也有較大影響,如當(dāng)溫度超過(guò)某一種蛋白質(zhì)的變性溫度時(shí),隨著溫度的增加凝集量也增加。當(dāng)環(huán)境PH接近某一種蛋白的等電點(diǎn)時(shí),蛋白的凝集增加,包涵體的形成也增多,此外,離子組成和強(qiáng)度、輔助因子、氧化還原電位等均可影響包涵體的形成。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1775包涵體(inclusionbody)是細(xì)菌表達(dá)的蛋白質(zhì)在胞內(nèi)應(yīng)對(duì)方案:
改變發(fā)酵條件,如發(fā)酵溫度、培養(yǎng)的PH值等來(lái)減少重組蛋白的凝集,進(jìn)而有效控制包涵體的形成,給下游純化工作創(chuàng)造有利條件。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1776應(yīng)對(duì)方案:七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/10765.RRhPI的初步純化將收集的IB用含有0.1%-0.3%13-巰基乙醇的緩沖液B(30mmol/L
HC1,8mol/L尿素,pH8.0)溶解,上于已用緩沖液B平衡的DEAE-SepharoseFF柱,用合適的氯化鈉梯度洗脫,收集含RRhPI的洗脫液。6.RRhPI的重組復(fù)性將初步純化后的RRhPI通過(guò)SephadexG-25脫尿素,轉(zhuǎn)換緩沖液為不同pH的50mmol/LGly-NaOH重組液,或含有適量GSSG的Gly-NaOH緩沖液中,使蛋白終濃度為0.1-0.6mg/mL,收集趨于正確折疊的RRhPI單體組分,加人適量GSH和GSSG,4℃放置24h。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/17775.RRhPI的初步純化七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/17.酶切轉(zhuǎn)化向RRhPI復(fù)性液中加入一定量的胰蛋白酶和羧肽酶B,37℃酶切一段時(shí)間,然后用0.1mol/LZnC1終止反應(yīng)并沉淀生成的hI。8.hI的純化將hI粗品用30mmol/LTris2HCl,8mol/L尿素,pH8.0溶解,在Superdex75上進(jìn)行分離純化。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/17787.酶切轉(zhuǎn)化七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1078分離純化層析柱的平衡液和洗脫液均為0.2mol/L乙酸鈉二乙酸,pH4.0用0.1mol/LZnCl2沉淀的hI粗產(chǎn)品可通過(guò)Superdex75進(jìn)行純層析圖譜見(jiàn)圖1,hI主要集中在峰3。收集峰3進(jìn)行SDS2PAGE分析,結(jié)果顯示,見(jiàn)圖2,所得hI組份在SDS2PAGE分析中是均一的,只有一條蛋白帶。將峰3組分透析,濃縮并凍干,即可最終制得hI。圖1:Superdex75純化hI
圖2十二烷基磺酸鈉-聚丙稀酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1779分離純化層析柱的平衡液和洗脫液均為0.2mol/產(chǎn)物進(jìn)一步鑒定:(1)氨基酸組成測(cè)定取純化的胰島素,經(jīng)5.7mol/L鹽酸水解,用氨基酸自動(dòng)分析儀測(cè)定氨基酸組成。(2)與人胎盤(pán)細(xì)胞膜胰島素受體結(jié)合(3)胰島素的生物活力測(cè)定體內(nèi)活力用半定量小白鼠驚厥方法測(cè)定。七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1780產(chǎn)物進(jìn)一步鑒定:七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/10常見(jiàn)的保藏方法有以下幾種:(1)短期保存可以用瓊脂穿刺進(jìn)行(2)長(zhǎng)期保存大多采取低溫保存,用LB培養(yǎng)基培養(yǎng)過(guò)夜,離心后加一定的菌種保藏液(含甘油),在-20℃下保藏。(3)用液氮迅速冷卻,減壓升華去除水之后在-80℃下保存七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/11/1781常見(jiàn)的保藏方法有以下幾種:七、工程菌產(chǎn)物鑒定和保存2022/八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵培養(yǎng)流程的設(shè)計(jì)2022/11/1782八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵培養(yǎng)流程的設(shè)計(jì)2022/11/1082八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵培養(yǎng)流程的設(shè)計(jì)2022/11/1783八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵培養(yǎng)流程的設(shè)計(jì)2022/11/1083生產(chǎn)工藝流程功能間分布八、發(fā)酵培養(yǎng)2022/11/1784生產(chǎn)工藝流程功能間分布八、發(fā)酵培養(yǎng)2022/11/1084八、發(fā)酵培養(yǎng)生產(chǎn)工藝流程功能間分布2022/11/1785八、發(fā)酵培養(yǎng)生產(chǎn)工藝流程功能間分布2022/11/1085八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)搖瓶培養(yǎng)水平下,用優(yōu)化的發(fā)酵培養(yǎng)基和比濁法測(cè)RRhPI-pQE40E.coliM15的生長(zhǎng)曲線(xiàn)。2022/11/1786八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)2022/11/1086八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)用接種環(huán)挑取斜面保存的RRhPI-pQE40E.coliM15一環(huán)接種于3mlLB/AK培養(yǎng)基中,37℃,220r·min-1恒溫振蕩培養(yǎng)一段時(shí)間。取100μl菌液接種于5mlLB/AK培養(yǎng)基中,37℃,220r·min-1恒溫振蕩培養(yǎng)一段時(shí)間即可?;罨姆N子可在4℃下保存數(shù)周待用。2022/11/1787八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)2022/11/1087八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)將5ml活化種子轉(zhuǎn)接到50ml優(yōu)化后的發(fā)酵培養(yǎng)基中,恒溫振蕩培養(yǎng)一段時(shí)間。取50ml經(jīng)一級(jí)發(fā)酵擴(kuò)培后的菌液轉(zhuǎn)接到500ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,恒溫振蕩培養(yǎng)一段時(shí)間后加入IPTG誘導(dǎo)人胰島素原的表達(dá),繼續(xù)恒溫振蕩培養(yǎng)一段時(shí)間后結(jié)束發(fā)酵。3×103r·min-1離心15min,沉淀即得RRh2PI-pQE40E.coliM15濕菌體,于-20℃保存。2022/11/1788八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)2022/11/1088八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)采用正交法,結(jié)合搖瓶發(fā)酵工藝的前期研究,選取搖瓶培養(yǎng)條件中7個(gè)主要因素進(jìn)行兩水平正交優(yōu)化,7個(gè)因素為種子活化方式、搖床轉(zhuǎn)速(通風(fēng)量)、IPTG誘導(dǎo)溫度、接種量、IPTG添加量、誘導(dǎo)時(shí)間和補(bǔ)料方式。以每升培養(yǎng)基收獲濕菌體的量及發(fā)酵液的A600為目標(biāo)量考察條件優(yōu)化的效果。2022/11/1789八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)2022/11/1089八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)進(jìn)行8次實(shí)驗(yàn),對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析,優(yōu)化出最佳實(shí)驗(yàn)條件,并做3次水平重復(fù)試驗(yàn),分別測(cè)定每升培養(yǎng)基收獲濕菌體的量、發(fā)酵液的A600及每升培養(yǎng)基收獲包涵體的量。IPTG誘導(dǎo)基因工程大腸桿菌表達(dá)RRhPI。對(duì)誘導(dǎo)時(shí)間的影響進(jìn)一步做了分析,基因工程菌在三角搖瓶培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中期,加入0.5mmol·L-1IPTG進(jìn)行誘導(dǎo),每隔1h取樣,以SDS分析RRhPI的表達(dá)情況。2022/11/1790八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵試驗(yàn)2022/11/1090八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果在搖瓶培養(yǎng)水平下,采用優(yōu)化的發(fā)酵培養(yǎng)基發(fā)酵RRhPI-pQE40E.coliM15,培養(yǎng)4h后即進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,而且對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期可延至17h。2022/11/1791八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1091八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果采用優(yōu)化出的最佳實(shí)驗(yàn)條件做3次平行驗(yàn)證試驗(yàn)。結(jié)果見(jiàn)表。
2022/11/1792八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1092八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果綜合每升培養(yǎng)基所收獲濕菌體的量(wetweight/g·L-1)和發(fā)酵液的A600兩個(gè)指標(biāo),選取關(guān)鍵因素的最優(yōu)條件,結(jié)果表明搖床轉(zhuǎn)速(即通風(fēng)量)與補(bǔ)料方式對(duì)發(fā)酵結(jié)果影響最大,IPTG的誘導(dǎo)時(shí)間和添加量次之。
2022/11/1793八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1093八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果正交試驗(yàn)所得菌體經(jīng)溶菌酶或/聲破碎細(xì)胞后得到的包涵體SDS的結(jié)果見(jiàn)圖。2022/11/1794八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1094八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果RRhPI-pQE40E.coliM15表達(dá)的外源蛋白(His)6-Arg-Arg-人胰島素原以包涵體形式存在,其分子大小約為13kD,由圖可知,在哪種正交實(shí)驗(yàn)條件下包涵體的表達(dá)量較高。2022/11/1795八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1095八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果RRhPI-pQE40E.coliM15在搖瓶中培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中期,加入0.5mmol·L-1IPTG進(jìn)行誘導(dǎo),每隔1h取樣,以SDS分析RRhPI的表達(dá)情況(如圖)。2022/11/1796八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1096八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果結(jié)果RRhPI-pQE40E.coliM15在IPTG誘導(dǎo)4~5h時(shí),富含包涵體的濕菌體(約24kD)收率較高,相應(yīng)的目的蛋白表達(dá)量較高,繼續(xù)誘導(dǎo)并未使?jié)窬w表達(dá)量有所提高。因此,誘導(dǎo)3.5~4h既有利于富含包涵體的濕菌體及目的蛋白的表達(dá),又可縮短發(fā)酵時(shí)間,簡(jiǎn)化生產(chǎn)工藝。2022/11/1797八、發(fā)酵培養(yǎng)搖瓶發(fā)酵結(jié)果2022/11/1097八、發(fā)酵培養(yǎng)細(xì)胞的兩種破碎方法其一是溶菌酶/超聲破碎細(xì)胞。發(fā)酵所得RRhPI-pQE40E.coliM15濕菌體,懸浮于適量緩沖液A(50mmol·L-1Tris-HCl、0.5mmol·L-1EDTA、50mmol·L-1NaCl、5%甘油、0.1~0.5mmol·L-1DTT、pH7.90)中,加入溶菌酶(5mg·g-1濕菌體),室溫或37℃振蕩2h。在冰浴中超聲(10s×30),每次間隔20s,功率200W。2022/11/1798八、發(fā)酵培養(yǎng)細(xì)胞的兩種破碎方法2022/11/1098八、發(fā)酵培養(yǎng)細(xì)胞的兩種破碎方法其二是超聲破碎細(xì)胞。大腸桿菌濕菌體懸浮于適量的緩沖液A中,充分溶解,冰浴超聲(40s×10),每次間隔30s,功率200W。2022/11/1799八、發(fā)酵培養(yǎng)細(xì)胞的兩種破碎方法2022/11/1099八、發(fā)酵培養(yǎng)細(xì)胞的兩種破碎方法兩種破碎方法所得包涵體洗滌后作SDS。洗滌時(shí)均先后用含2mol·L-1尿素的緩沖液和含2%脫氧膽酸鈉(DOC)的緩沖液各洗滌1次,最后用10mmol·L-1Tris-HCl清洗兩次。2022/11/17100八、發(fā)酵培養(yǎng)細(xì)胞的兩種破碎方法2022/11/10100八、發(fā)酵培養(yǎng)包涵體的三種洗滌方法溶菌酶/超聲破碎細(xì)胞的裂解液于4℃、114×104r·min-1離心15min,收集沉淀。洗滌方法一是將此沉淀用2mol·L-1尿素的緩沖液充分溶解,離心收集沉淀;沉淀再用2%DOC的緩沖液洗滌,離心,所得沉淀用10mmol·L-1Tris-HCl清洗2次,即得包涵體,于-20℃保存。2022/11/17101八、發(fā)酵培養(yǎng)包涵體的三種洗滌方法2022/11/1010八、發(fā)酵培養(yǎng)包涵體的三種洗滌方法方法二則用緩沖液充分洗滌沉淀兩次,收集沉淀保存。方法三用2%DOC的緩沖液洗滌1次。再用10mmol·L-1Tris-HCl清洗兩次,離心收集沉淀保存。取上述不同方法洗滌的沉淀,用SDS檢測(cè)洗滌效果。2022/11/17102八、發(fā)酵培養(yǎng)包涵體的三種洗滌方法2022/11/10102八、發(fā)酵培養(yǎng)結(jié)果說(shuō)明“1.2.3”項(xiàng)中破碎方法一較好,即用溶菌酶和超聲破碎結(jié)合可徹底破碎細(xì)胞,并使表達(dá)產(chǎn)物包涵體充分溶出?!?.2.4”項(xiàng)中方法一的洗滌效果優(yōu)于方法二和三,即采用變性劑2mol·L-1尿素及離子型去污劑2%DOC洗滌的效果較好。2022/11/17103八、發(fā)酵培養(yǎng)結(jié)果說(shuō)明“1.2.3”項(xiàng)中破碎方法一較好,菌種活化與擴(kuò)大培養(yǎng)
將凍存的工程菌復(fù)蘇后接種于LB平板培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)24h,挑取單菌落接種于5mLLB液體培養(yǎng)基,37℃250r/min振蕩12h后,按1:100比例轉(zhuǎn)種于LB液體培養(yǎng)基中,繼續(xù)振蕩10h作為發(fā)酵種子液。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17104菌種活化與擴(kuò)大培養(yǎng)八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/10八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵罐發(fā)酵發(fā)酵罐的選取培養(yǎng)設(shè)備以及設(shè)備控制應(yīng)滿(mǎn)足獲得高濃度的受體細(xì)胞和高表達(dá)的基因表達(dá)產(chǎn)物。發(fā)酵罐的組成部分:發(fā)酵罐體、保證高傳質(zhì)作用的攪拌器、精細(xì)的溫度控制和滅菌系統(tǒng)、空氣無(wú)菌過(guò)濾裝置、殘留氣體處理裝置、參數(shù)測(cè)量與控制系統(tǒng)(如pH、O2、CO2等)、培養(yǎng)液配制及連續(xù)操作裝置等。
發(fā)酵步驟2022/11/17105八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵罐發(fā)酵發(fā)酵步驟2022/11/10105八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵罐發(fā)酵發(fā)酵步驟2022/11/17106八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵罐發(fā)酵發(fā)酵步驟2022/11/10106發(fā)酵罐發(fā)酵采用自控5L發(fā)酵罐進(jìn)行分批補(bǔ)料發(fā)酵試驗(yàn),初始工作體積為3.0L。設(shè)置指標(biāo)為:發(fā)酵溫度37℃,初始攪拌速度400r/min,初始通氣量1.5L/min,不斷提高攪拌轉(zhuǎn)速與通氣量最大分別至650r/min和3.5L/min以維持溶解氧始終在30%以上,pH值誘導(dǎo)前為7.2,誘導(dǎo)后為7.4。培養(yǎng)分分批培養(yǎng)和分批補(bǔ)料兩個(gè)階段,每隔1h取樣測(cè)定A650nm、細(xì)胞干重和葡萄糖濃度等參數(shù)。當(dāng)檢測(cè)到培養(yǎng)基中葡萄糖耗盡時(shí)開(kāi)始采用pH-stat反饋流加的方式補(bǔ)料,即當(dāng)發(fā)酵液的pH達(dá)到7.4時(shí)設(shè)定pH反饋,高于設(shè)定的pH即開(kāi)始補(bǔ)加發(fā)酵補(bǔ)料培養(yǎng)基,直至達(dá)到設(shè)定的pH時(shí)停止流加;補(bǔ)料總量為發(fā)酵液總體積的20%。誘導(dǎo)后培養(yǎng)5-7h,放罐,SDS檢測(cè)表達(dá)情況。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17107發(fā)酵罐發(fā)酵八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/10107高密度發(fā)酵補(bǔ)料控制工藝
以甘油作為限制性基質(zhì)進(jìn)行分批補(bǔ)料發(fā)酵,分別考察不同補(bǔ)料模式對(duì)工程菌生長(zhǎng)和重組蛋白表達(dá)的影響:(1)恒速補(bǔ)料法在開(kāi)始誘導(dǎo)后,分別依照恒定的速度(10,20,30,40mL/h)流加甘油補(bǔ)料培養(yǎng)基,通過(guò)流加氨水和稀鹽酸控制pH值。(2)分階段變速補(bǔ)料法在開(kāi)始誘導(dǎo)后,以20mL/h的初速度流加甘油補(bǔ)料培養(yǎng)基,并以5mL/h的增加速度,逐漸提高補(bǔ)料速度。(3)恒定pH反饋補(bǔ)料法在發(fā)酵的不同階段設(shè)定培養(yǎng)環(huán)境的pH(初始培養(yǎng)期以發(fā)酵培養(yǎng)基pH7.0為設(shè)定值,誘導(dǎo)期pH根據(jù)分批培養(yǎng)結(jié)果設(shè)定為其最佳值),用甘油補(bǔ)料培養(yǎng)基維持不同時(shí)期系統(tǒng)pH的相對(duì)恒定。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17108高密度發(fā)酵補(bǔ)料控制工藝八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/1高密度發(fā)酵影響條件1.培養(yǎng)基組成:(1)碳源大腸桿菌高密度高表達(dá)發(fā)酵控制中優(yōu)化碳源是關(guān)鍵因素。常用的碳源有糖類(lèi)、低碳醇、油脂和有機(jī)酸等。由于大腸桿菌利用葡萄糖生長(zhǎng)速度快,并且測(cè)定方便,葡萄糖是目前大腸桿菌發(fā)酵中最常用的碳源物質(zhì)。但葡萄糖添加過(guò)量時(shí)容易使大腸桿菌生長(zhǎng)速率過(guò)大,導(dǎo)致葡萄糖效應(yīng),產(chǎn)生乙酸等代謝副產(chǎn)物,不僅影響菌體的生長(zhǎng),而且不利于外源蛋白的表達(dá)。以甘油代替葡萄糖作為碳源可以有效減少抑制性代謝產(chǎn)物乙酸的積累,更有利于重組菌的高密度發(fā)酵。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17109高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件(2)無(wú)機(jī)鹽微生物要維持正常的生長(zhǎng)代謝,除需要碳源和氮源外還需要Ca2+、Mg2+、K+、Na+等必需離子,這些離子參與細(xì)胞的基礎(chǔ)代謝,調(diào)節(jié)酶系活性并維持細(xì)胞膜內(nèi)外滲透壓平衡。(3)微量元素微生物對(duì)Fe2+、Mn2+、Pb2+、Co2+、Ni2+、Zn2+微量元素需求量很少,但微量元素對(duì)微生物的生長(zhǎng)起很大的作用。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17110高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件2.誘導(dǎo)劑的選擇:目前最常用于誘導(dǎo)大腸桿菌表達(dá)異源蛋白的誘導(dǎo)劑是異丙基-β-D硫代半乳糖(ITPG)。盡管IPTG的誘導(dǎo)效果令人滿(mǎn)意,但是IPTG的缺點(diǎn)限制了它在大規(guī)模發(fā)酵生產(chǎn)中的應(yīng)用。一方面IPTG價(jià)格十分昂貴,尤其在大批量生產(chǎn)重組蛋白時(shí),IPTG的大量應(yīng)用會(huì)造成生產(chǎn)成本的增加;另一方面IPTG對(duì)人體具有毒性,會(huì)對(duì)發(fā)酵所得的生物產(chǎn)品帶來(lái)不利影響。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17111高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件采用乳糖作為誘導(dǎo)劑
目的產(chǎn)物占總蛋白量的15.7%,略低于IPTG的誘導(dǎo)效果,但成本僅為用IPTG誘導(dǎo)時(shí)的3%。盡管乳糖的誘導(dǎo)效果也不及IPTG,誘導(dǎo)過(guò)程也比IPTG復(fù)雜的多,但乳糖所具備的無(wú)毒與價(jià)廉的優(yōu)點(diǎn),對(duì)工業(yè)化發(fā)酵生產(chǎn)重組蛋白具有重要的意義。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17112高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件3.培養(yǎng)條件的選擇:(1)溶解氧大腸桿菌的各個(gè)生長(zhǎng)過(guò)程需要氧氣的參與,溶解氧濃度對(duì)菌體的生長(zhǎng)和產(chǎn)物的形成影響很大。尤其在高密度發(fā)酵中期,菌體呈指數(shù)擴(kuò)增,耗氧量極大,如果供氧不足會(huì)導(dǎo)致大量乙酸生成,蛋白合成受到抑制,菌體生長(zhǎng)速率下降,甚至發(fā)生自溶。(2)pH值發(fā)酵過(guò)程中培養(yǎng)液的pH值是微生物在一定環(huán)境條件下代謝活動(dòng)的綜合指標(biāo),是一項(xiàng)重要的發(fā)酵參數(shù)。在培養(yǎng)過(guò)程中保持pH的相對(duì)穩(wěn)定有利于大腸桿菌的生長(zhǎng)和重組蛋白的合成。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17113高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件(3)溫度溫度會(huì)影響各種酶的活性,是影響工程菌生長(zhǎng)代謝、重組產(chǎn)物形成和質(zhì)粒穩(wěn)定性的重要因素。對(duì)于大腸桿菌化學(xué)表達(dá)系統(tǒng),一般認(rèn)為在較高的溫度下進(jìn)行誘導(dǎo),因?yàn)檩^高的溫度有利于細(xì)菌的生長(zhǎng),可以獲得較高的生物量。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17114高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件4.補(bǔ)料方法的選擇:
工業(yè)上對(duì)微生物的培養(yǎng)主要有分批培養(yǎng)、連續(xù)培養(yǎng)以及改進(jìn)的分批補(bǔ)料培養(yǎng)等幾種方式,其中分批補(bǔ)料培養(yǎng)是獲得高濃度生物量最有效的方法。葡萄糖因價(jià)廉易得,容易利用且起效快,已廣泛用作重組度高密度發(fā)酵的補(bǔ)料基質(zhì)。但大腸桿菌在過(guò)量葡萄糖的條件下會(huì)發(fā)生“葡萄糖效應(yīng)”,積累大量乙酸,影響重組菌的生長(zhǎng)和外源蛋白的表達(dá)。因此合理添加碳源使葡萄糖效應(yīng)降到最低,是大腸桿菌高密度發(fā)酵成功的關(guān)鍵。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17115高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件(1)非反饋補(bǔ)料法非反饋補(bǔ)料法是目前常用的補(bǔ)料方法,按流加速度的不同,可分為恒速流加補(bǔ)料法、變速流加補(bǔ)料法和指數(shù)流加補(bǔ)料法。其中指數(shù)流加補(bǔ)料法是一種較為成熟的補(bǔ)料方法。指數(shù)流加補(bǔ)料法是根據(jù)在指數(shù)生長(zhǎng)期內(nèi)菌體數(shù)目呈指數(shù)增加,可以同時(shí)指數(shù)流加營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),保證菌體以恒定的比生長(zhǎng)速率生長(zhǎng)的一種補(bǔ)料方法。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/17116高密度發(fā)酵影響條件八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022/11/101高密度發(fā)酵影響條件(2)反饋補(bǔ)料法由于非反饋補(bǔ)料法的補(bǔ)料程序都是預(yù)先設(shè)定的,如果微生物的生長(zhǎng)方式與預(yù)想不一致時(shí),非反饋補(bǔ)料法不能對(duì)其進(jìn)行有效的調(diào)節(jié),容易使?fàn)I養(yǎng)物質(zhì)積累導(dǎo)致乙酸的生成。反饋補(bǔ)料法是指依據(jù)菌體代謝時(shí)會(huì)產(chǎn)生某種特殊物質(zhì)(如乙酸,二氧化碳等)使發(fā)酵中一些參數(shù)發(fā)生變化,可以根據(jù)參數(shù)的變化,判斷菌體代謝狀況進(jìn)行補(bǔ)料。由于反饋補(bǔ)料法能夠根據(jù)反饋的信息及時(shí)調(diào)整補(bǔ)料的速率和策略,從而能夠很好地控制系統(tǒng)的營(yíng)養(yǎng)濃度,防止?fàn)I養(yǎng)濃度過(guò)高,故被廣泛應(yīng)用于工程菌的高密度培養(yǎng)。八、發(fā)酵培養(yǎng)發(fā)酵步驟2022
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