課件-53蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)_第1頁
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文檔簡介

蛋白質(zhì)的三有原子的空間排列。第一個蛋白質(zhì)的三結(jié)構(gòu)于1958年用X-射線衍射法(X-rayCrystallography)測定。這種方法目前仍然是獲取蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的主要方法。PDB數(shù)據(jù)庫磁法(NuclearMagneticResonance,NMR。無法結(jié)晶的蛋白質(zhì),可以利用核磁法在液體環(huán)境中進行結(jié)構(gòu)測定。但是核磁法只能用于質(zhì)量小于70千的分子,大約對Mcoscoy1PDB如圖1所示,從PDB首頁的搜索條里,可以通過搜索PDBID、分子名稱、作者等db_earch.fata輸入序列相似的蛋白質(zhì)。點擊“108PDBEntities”。2.高級搜索工具BLASTdUTPasePDBID2HQU(圖。這個結(jié)構(gòu)所對應(yīng)的序列與輸入序列中黃色片段之間的一致度是100%。輸入的序列中藍結(jié)構(gòu)里不會有這一段。此外,成熟肽段N端的一小部分,由于實驗技術(shù)等原因,也沒有被解析出來,這在PDB結(jié)構(gòu)中是很常見的。有時,在序列中間也會有未解析出的斷口。甚至復(fù)習(xí):PDB文件是通過記錄蛋白質(zhì)中每一個氨基酸上的每一個原子的三維坐標(biāo)來們連上化學(xué)鍵

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