網(wǎng)絡(luò)生物醫(yī)學(xué)資源的利用(大內(nèi)科)3月20日 最新 (1)課件

網(wǎng)絡(luò)生物醫(yī)學(xué)資源的利用福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院內(nèi)分泌科黃惠斌2014年3月20日網(wǎng)絡(luò)生物醫(yī)學(xué)資源的特點(diǎn)信息源豐富；研發(fā)者、資助者目的不同；組織形式多樣化；更新速度快；檢索方式靈活、獲取方便；動(dòng)態(tài)變化，管理困難；規(guī)范化程度不高。獲取便捷信息量爆炸性增長海量信息魚龍混雜良莠不齊無所適從

網(wǎng)絡(luò)生物醫(yī)學(xué)信息評價(jià)準(zhǔn)確性(accuracy)權(quán)威性(authority)客觀性(objectivity)時(shí)效性(currency)完整性(coverage)信息的發(fā)布者及數(shù)據(jù)的提供者（一）循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫臨床（1）CochraneLibrary

是Cochrane協(xié)作網(wǎng)管理、維護(hù)的提供最佳臨床證據(jù)的系統(tǒng)評價(jià)數(shù)據(jù)庫，幫助醫(yī)生做出最佳臨床決策。/view/0/index.html（2）SUMsearch（http:）數(shù)據(jù)來源于NLM、DARE和NationalGuidelineClearinghouse三個(gè)網(wǎng)站。不僅有系統(tǒng)評述，而且有登記注冊或正在進(jìn)行臨床研究。收錄ACPJournalClub和Evidence-BasedMedicine這兩種雜志的光盤。光盤中的這兩種雜志是對150種醫(yī)學(xué)雜志進(jìn)行系統(tǒng)檢索，并對其中臨床研究論文方法學(xué)的可靠性及與臨床的相關(guān)性進(jìn)行了鑒別。由于在治療方面只收集隨機(jī)對照文獻(xiàn)并且其中80%進(jìn)行了隨訪的研究，診斷方面只收集與金標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行盲法比較的研究，因此評價(jià)性的文章質(zhì)量高。（3）BestEvidence(5）NationalGuidelineClearinghouse美國國立指南庫（二）權(quán)威醫(yī)學(xué)網(wǎng)站

綜合醫(yī)學(xué)網(wǎng)站專業(yè)醫(yī)學(xué)網(wǎng)站臨床行業(yè)的現(xiàn)狀、動(dòng)態(tài)、進(jìn)展、診療知識(shí)、病例分析、臨床實(shí)踐、臨床技巧、繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育、患者教育、醫(yī)學(xué)會(huì)議及新聞等（2）FoodandDrugAdministration（FDA）（1）NewPrescriptionDrugApprovals報(bào)告新批準(zhǔn)處方藥物（2）PrescriptionDrugInformation報(bào)告處方藥物信息（3）MajorDrugInformationPages報(bào)告一些主要大類藥物信息（4）ConsumerDrugInformation針對消費(fèi)者報(bào)告藥物信息（5）Over-the-CounterDrugInformation報(bào)告OTC藥物信息（6）DrugSafety&SideEffects報(bào)告藥物安全及副作用信息（7）PublicHealthAlerts&WarningLetters公共衛(wèi)生警報(bào)（8）Reports&PublicationsFirstDataDrugDatabases報(bào)告及出版物（9）SpecialProjects&Programs專門研究課題及項(xiàng)目

美國食品與藥物管理局提供多種與藥物監(jiān)控有關(guān)的信息（3）CentersforDiseaseControlandPreventionCDC最早的職責(zé)只是研究對美國某個(gè)地區(qū)的一種單一疾病的控制方法，漸漸地，其管轄范圍不斷擴(kuò)大，除傳染性疾病以外，還負(fù)責(zé)很多慢性病、職業(yè)性身體失調(diào)及諸如暴力和事故等社會(huì)疾病。常發(fā)布一些權(quán)威的糖尿病、肥胖等數(shù)據(jù)。美國疾病控制與防治中/（4）NationalCenterLibraryofMedicine（NLM）大眾和醫(yī)務(wù)人員提供醫(yī)藥衛(wèi)生知識(shí)和信息的事實(shí)型數(shù)據(jù)庫，有衛(wèi)生專題、藥物信息、醫(yī)學(xué)百科全書、醫(yī)學(xué)詞典、新聞、醫(yī)生和醫(yī)院名錄等。每個(gè)專題提供的具體內(nèi)容包括：疾病定義、病因、危險(xiǎn)因素、癥狀與診斷、治療與研究等信息。HumanGenomeResources（人類基因組資源）：匯集生物信息學(xué)資源的鏈接，包括基因知識(shí)、序列數(shù)據(jù)庫、基因圖譜、細(xì)胞遺傳學(xué)和比較基因?qū)W等信息。

EnvironmentalHealth&Toxicology（環(huán)境衛(wèi)生與毒理學(xué)）將14個(gè)數(shù)據(jù)庫整合為一個(gè)檢索平臺(tái)TOXNET（ToxicologyDataNetwork），是進(jìn)行環(huán)境衛(wèi)生與毒理學(xué)研究的重要參考資料。PubMedCentral（PMC）提供270多種期刊一定時(shí)間段的免費(fèi)期刊全文，是PubMed中免費(fèi)期刊全文的來源。美國國立醫(yī)學(xué)圖書館,/hinfo.html)（5）MDLinx是由內(nèi)科醫(yī)師自發(fā)組織創(chuàng)建，其目的是為內(nèi)科臨床提供最集中的信息資源，主要包括各種內(nèi)科疾病的診斷、治療等信息。其主要欄目包括：

TopInternalMedicineArticles每日提供最新醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，這些文獻(xiàn)多選自世界著名醫(yī)學(xué)雜志。該網(wǎng)站將所有信息分為變態(tài)反應(yīng)/免疫學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)/遺傳學(xué)、心臟病學(xué)、臨床藥理學(xué)、急救醫(yī)學(xué)、內(nèi)分泌/糖尿病等27個(gè)大類。最受歡迎的服務(wù)是將每日的最新醫(yī)學(xué)信息以E-mail的方式免費(fèi)發(fā)送戶。

2ResourceDirectories這是一個(gè)導(dǎo)航系統(tǒng)，提供14種疾病相關(guān)資源的鏈接。如點(diǎn)擊“Diabetes”，可鏈接到美國糖尿病協(xié)會(huì)、美國疾病預(yù)防與控制中心、美國國立衛(wèi)生研究院糖尿病、消化病、腎病研究所等10個(gè)糖尿病的相關(guān)網(wǎng)站。MDLinx（）（6）AmericanCollegeofPhysician-American

SocietyofInternalMedicine（APC）美國內(nèi)科醫(yī)師學(xué)會(huì)——美國內(nèi)科學(xué)會(huì)（）專業(yè)醫(yī)學(xué)網(wǎng)站C（癌癥網(wǎng)）C（

或http://www.nci.nih.美國糖尿病學(xué)會(huì)/時(shí)效性翻譯好成果大部分在外刊發(fā)表（三）重要的醫(yī)學(xué)搜索引擎臨床行業(yè)的現(xiàn)狀、動(dòng)態(tài)、進(jìn)展、診療知識(shí)、病例分析、臨床實(shí)踐、臨床技巧、繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育、患者教育、醫(yī)學(xué)會(huì)議及新聞等(2)Medscape(醫(yī)景)美國公司Medscape公司1994年研制,1995年6月投入使用,由功能強(qiáng)大的通用搜索引擎AltaVista支持,可檢索圖像、聲頻、視頻資料，至今共收藏了近20個(gè)臨床學(xué)科25000多篇全文文獻(xiàn)，擁有會(huì)員50多萬人，臨床醫(yī)生12萬人。是Web上最大的免費(fèi)提供臨床醫(yī)學(xué)全文文獻(xiàn)和繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育資源的網(wǎng)點(diǎn)。/（3）Medicalworldsearch(醫(yī)學(xué)世界檢索)

這是由美國ThePolytechnicResearchInstitute1997年建立的一個(gè)醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎，收集了數(shù)以千計(jì)的醫(yī)學(xué)網(wǎng)點(diǎn)近10萬個(gè)Web頁面。它采用了NLM研制的一體化醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)可以使用醫(yī)學(xué)主題詞，包括各種同義詞進(jìn)行檢索，在檢索時(shí)可根據(jù)詞表擴(kuò)大或縮小檢索范圍，搜索的準(zhǔn)確性很高。同時(shí)還提供擴(kuò)展檢索、精細(xì)檢索功能，大小寫無差別，免費(fèi)全文檢索，結(jié)果進(jìn)行相關(guān)排序。/國內(nèi)的醫(yī)學(xué)搜索引擎？（一）醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫科研（1）pubmed/pubmed/PubMed概況美國國家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國生物技術(shù)信息中心(NCBI)下轄的一個(gè)數(shù)據(jù)庫，收錄了全世界70多個(gè)國家和地區(qū)1966年以來的4600余種生物醫(yī)學(xué)期刊具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn)，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。與Medline光盤數(shù)據(jù)庫的區(qū)別：檢索機(jī)制、檢索界面、檢索方法以及收錄文獻(xiàn)數(shù)量不同。PubMed數(shù)據(jù)來源：1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE2.InProcessCitations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。3.Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的電子文獻(xiàn)，每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。(2)EMBASE《荷蘭醫(yī)學(xué)文摘》數(shù)據(jù)庫

Embase《荷蘭醫(yī)學(xué)文摘》是世界上最有影響的醫(yī)學(xué)二次文獻(xiàn)之一；提供世界范圍內(nèi)的生物醫(yī)學(xué)和藥學(xué)文獻(xiàn)，已被認(rèn)為是關(guān)于人類醫(yī)學(xué)及相關(guān)學(xué)科文獻(xiàn)的一種重要的綜合性的索引，是醫(yī)學(xué)領(lǐng)域著名的數(shù)據(jù)庫之一。涵蓋內(nèi)容廣泛，既包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)，又包括與醫(yī)學(xué)相關(guān)的許多領(lǐng)域（生物醫(yī)學(xué)工程、衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)、醫(yī)學(xué)管理、法醫(yī)學(xué)等）。Embase收錄期刊達(dá)7000余種，其中屬于純醫(yī)學(xué)類的有3000種左右，這類期刊中的大部分論文都以文摘形式報(bào)道；屬于與醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科類的有2400余種，對這類期刊的論文只選有關(guān)文章做摘錄。

EMBASE（1974年推出）中九百多萬條生物醫(yī)學(xué)記錄與六百多萬條獨(dú)特的MDELINE記錄（1966年推出）兩者強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，形成全球最大最具權(quán)威性的生物醫(yī)學(xué)與藥理學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫?？赏綑z索超過一千五百萬條EMBASE+MEDLINE記錄，且結(jié)果無重復(fù)。/（3）中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

ChineseBioMedicalLiteratureDatabaseondisc收錄1978年以來

1600

多種中國生物醫(yī)學(xué)期刊，以及匯編、會(huì)議論文的文獻(xiàn)題錄，綜合性生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫：題錄和文摘混合型數(shù)據(jù)庫。收錄：《中文資料目錄：醫(yī)藥衛(wèi)生》、國外醫(yī)學(xué)各分冊、中文生物醫(yī)學(xué)期刊目次數(shù)據(jù)庫（CMCC)中收錄的所有文獻(xiàn)題錄學(xué)科范圍：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)及中藥學(xué)等生物醫(yī)學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。與萬方、維普、清華同方的區(qū)別（4）美國NIH替代醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫由美國國家衛(wèi)生研究院下屬的補(bǔ)充和替代醫(yī)學(xué)國家中心（NCCAM）創(chuàng)建，是較著名的替代醫(yī)學(xué)網(wǎng)站。其主頁主要包括以下欄目：

HealthInformation包括針灸、關(guān)節(jié)炎、癌癥、抑郁癥、更年期等方面的中醫(yī)藥治療方面的信息，也提供麻黃、銀杏、人參等中草藥的信息。其中“HerbsataGlance”（中草藥一瞥）涉及各種中草藥的基本數(shù)據(jù)，包括中草藥或藥用植物的名稱、用途、潛在副作用等。

ClinicalTrials

臨床試驗(yàn)涉及各種新療法、治療程序或治療方法的安全性和有效性。具體包括：①關(guān)鍵詞按A-Z排列，可查詢疾病、中草藥或藥用植物和治療方法的臨床試驗(yàn)信息；②了解臨床試驗(yàn)、研究者及實(shí)驗(yàn)的結(jié)果的相關(guān)信息等。/（二）生物醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫科研是在生命科學(xué)的研究中，以儲(chǔ)存生物信息為目的而形成的數(shù)據(jù)庫。包括基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等生物信息。NCBIEntrez

，美國國家生物技術(shù)信息中心/EntrezNational

Center

for

Biotechnology

Information

Entrez是整合的訪問序列、定位、分類和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的搜索檢索系統(tǒng)，包括：（1）核酸序列數(shù)據(jù)庫包含GenBank、EBML、DDBJ三大國際核酸序列數(shù)據(jù)庫，基因組序列數(shù)據(jù)庫的序列數(shù)據(jù)以及美國商標(biāo)專利局和其他國家專利局的專利序列數(shù)據(jù)。（2）蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫包括從GenBank、EBML、DDBJ核酸序列編碼區(qū)翻譯而來的蛋白質(zhì)序列，以及PIR、PSD、SWISS-PROT、PDB、PRF等數(shù)據(jù)庫的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)。（3）全基因組數(shù)據(jù)庫包括各種基因組數(shù)據(jù)庫、完整的染色體、連續(xù)的序列圖譜以及集成的遺傳圖譜和物理圖譜。（4）大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫包括X線晶體衍射和磁共振測得的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫。（5）PopSet數(shù)據(jù)庫在各種人群、進(jìn)化及突變研究中產(chǎn)生的配對序列，及核酸和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)。（6）在線孟德爾人類遺傳學(xué)（OMIM）數(shù)據(jù)庫及人類疾病和遺傳疾病的目錄數(shù)據(jù)庫。（7）PubMed數(shù)據(jù)庫生物醫(yī)學(xué)相關(guān)綜合文獻(xiàn)信息，及與序列相關(guān)的文獻(xiàn)信息。NCBI的特色軟件（BLAST），序列相似搜索程序，可作為鑒別基因和遺傳特點(diǎn)的手段。15秒內(nèi)DNA數(shù)據(jù)庫全搜索（三）科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫科研學(xué)術(shù)文獻(xiàn)評價(jià)系統(tǒng)按期刊的編輯質(zhì)量、影響因子和專家評審意見為選刊依據(jù)，充分考慮期刊的學(xué)術(shù)價(jià)值，從44個(gè)國家（地區(qū)）約7萬種科技期刊中選出幾千種重要科技期刊作為統(tǒng)計(jì)源期刊。著者與著者、文獻(xiàn)與文獻(xiàn)之間引用和被引用關(guān)系，是國際上最具權(quán)威性的用于基礎(chǔ)研究和應(yīng)用基礎(chǔ)研究科研成果的評價(jià)體系。由ISI美國科學(xué)情報(bào)所編輯出版.

SCIE是湯姆森公司在原有的SCI文摘版源刊基礎(chǔ)上精選了另外的部分雜志所形成的網(wǎng)絡(luò)版。SCI和SCIE的區(qū)別：SCI和SCIE（SCIExpanded）分別是科學(xué)引文索引及科學(xué)引文索引擴(kuò)展版（即網(wǎng)絡(luò)版），前者收錄期刊3600多種，后者收錄期刊6000多種，學(xué)科覆蓋150多個(gè)領(lǐng)域。ScienceCitationIndex(SCI)//由中國科學(xué)院文獻(xiàn)情報(bào)中心編制收入我國數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)、天文學(xué)、地學(xué)、生物學(xué)、農(nóng)林科學(xué)、醫(yī)藥衛(wèi)生、工程技術(shù)、環(huán)境科學(xué)和管理科學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域.核心庫的來源期刊經(jīng)過嚴(yán)格評選,是各學(xué)科領(lǐng)域中具有權(quán)威性和代表性的核心期刊。擴(kuò)展庫的來源期刊經(jīng)過大范圍的遴選，是我國各學(xué)科領(lǐng)域優(yōu)秀的期刊。共1083種期刊，其中英文刊55種，中文刊1028種；核心庫期刊737種（以C為標(biāo)記）擴(kuò)展庫期刊346種(以E為表記)。被譽(yù)為中國的SCI中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫（CSCD）(ChineseScienceCitationDatabase)引文庫特點(diǎn)：精但不全（四）免費(fèi)全文的獲取科研Freemedicaljournals/收錄了1825種期刊，按照學(xué)科分73個(gè)類目，字順和語言進(jìn)行查找文獻(xiàn)。斯坦福大學(xué)/HighWire是全球第二大的提供免費(fèi)全文的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)出版商;于1995年由美國斯坦福大學(xué)圖書館創(chuàng)立。最初僅出版著名的周刊“JournalofBiologicalChemistry”，現(xiàn)提供1300余種期刊，涵蓋生物科學(xué)、人文、醫(yī)學(xué)、物理科學(xué)、社會(huì)科學(xué)等大類。標(biāo)為free的可免費(fèi)訪問全文?？茖W(xué)公共圖書館(PublicLibraryofScience，PLoS)/公共科學(xué)圖書館是一家由眾多諾貝爾獎(jiǎng)得主和慈善機(jī)構(gòu)支持的非贏利性學(xué)術(shù)組織，旨在推廣世界各地的科學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的最新研究成果。PLoS出版了8種生命科學(xué)與醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的開放獲取期刊，可以免費(fèi)獲取全文，比較具有影響力。生物醫(yī)學(xué)期刊中心/BioMedcenterBioMed

Central目前出版120種生物學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的期刊，出版社基于"開放地獲取研究成果可以使科學(xué)進(jìn)程更加快捷有效"的理念，堅(jiān)持在網(wǎng)站免費(fèi)為讀者提供信息服務(wù)，其出版的網(wǎng)絡(luò)版期刊可供世界各國的讀者免費(fèi)檢索、閱讀和下載全文。

收錄的期刊范圍涵蓋了生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的所有主要領(lǐng)域，包括血液病、心血管疾病、內(nèi)分泌失調(diào)、臨床病理學(xué)、基因組生物學(xué)、放射醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、免疫學(xué)、老年病學(xué)、眼科學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、關(guān)節(jié)炎的診斷與治療、藥理學(xué)、生理學(xué)、兒科學(xué)、外科學(xué)、泌尿?qū)W、婦科學(xué)等57個(gè)分支學(xué)科。出版基于學(xué)科權(quán)威推薦的生物學(xué)重點(diǎn)文獻(xiàn)。其他國內(nèi)圖書館館藏的文獻(xiàn)：機(jī)制與效率；海外朋友；作者。查新檢索舉例(MeSH）醫(yī)學(xué)主題詞表主題詞是描述主題事物或內(nèi)容的規(guī)范化詞匯，具有單一性，一個(gè)主題詞只能表達(dá)一個(gè)概念，一個(gè)概念只能