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生物化學(xué)緒論生物化學(xué)的涵義及內(nèi)容生物化學(xué)學(xué)科的發(fā)展史生物化學(xué)在生物科學(xué)中地位及作用生物化學(xué)的學(xué)習(xí)方法一、生物化學(xué)的涵義及內(nèi)容1.化學(xué)的概念(共性和個性)化學(xué)學(xué)科的共性都是研究:物質(zhì)的本質(zhì),包括:物質(zhì)的組成、結(jié)構(gòu)和性質(zhì);根據(jù)研究的方法和角度不同,可劃分成各種不同的化學(xué):如:無機化學(xué)、有機化學(xué)、物理化學(xué)我們由此可以引出生物化學(xué)的概念。2.生物化學(xué)的涵義生物化學(xué)是關(guān)于生命的化學(xué),是研究生物體的化學(xué)組成,生物物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能,生命過程中物質(zhì)與能量變化的規(guī)律,以及一切生命現(xiàn)象的物質(zhì)基礎(chǔ)的科學(xué)。生物化學(xué)的定義中包含了幾層意思:1)生物體的化學(xué)組成:生物體的四大類基本物質(zhì)(糖、蛋白質(zhì)、核酸、脂類),三大活性物質(zhì),以及各種有機小分子等等。2)結(jié)構(gòu)與功能:生物分子的結(jié)構(gòu)、功能,結(jié)構(gòu)與功能的內(nèi)在關(guān)系。3)物質(zhì)和能量的轉(zhuǎn)化:生物體內(nèi)大分子、小分子之間的相互轉(zhuǎn)化,以及伴隨的能量變化。4)一切生命現(xiàn)象的新陳代謝,包括:生長、分化、運動、思維等;和自我復(fù)制如:繁殖、遺傳等。3.生物化學(xué)的內(nèi)容1)生物體的化學(xué)組成
四類基本生物大分子:糖由單糖組成脂類由甘油、脂肪酸、磷酸、含氮堿等組成蛋白質(zhì)由氨基酸(20種)組成核酸由核苷酸組成,而核苷酸又由堿基、戊糖、磷酸組成研究生物大分子及其構(gòu)成它們的前體小分子物質(zhì)的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、功能,以及結(jié)構(gòu)與性質(zhì)、功能之間的內(nèi)在聯(lián)系。
三大活性物質(zhì):酶、維生素、激素。它們的結(jié)構(gòu)、特性、作用方式和機理。由于這部分內(nèi)容研究的是生物分子的靜態(tài)特征,被稱為靜態(tài)生化。2)新陳代謝的研究事實上,生物分子在生物體內(nèi)并不是靜態(tài)的,而是在時時刻刻的發(fā)生變化,包括:
生物大分子小分子
小分子小分子體外物質(zhì)體內(nèi)物質(zhì)從一種生物分子轉(zhuǎn)化為另一種生物分子所經(jīng)歷的化學(xué)反應(yīng)過程稱為代謝途徑,這其中又伴隨著能量的變化(放能和需能)。生物體內(nèi)各種不同的代謝途徑構(gòu)成復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò),各種生物分子通過這張代謝網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行相互轉(zhuǎn)化。這部分內(nèi)容反映生物體內(nèi)物質(zhì)能量轉(zhuǎn)化的動態(tài)過程,被稱為動態(tài)生化。降解合成轉(zhuǎn)化運輸分泌二、生物化學(xué)的發(fā)展簡史1.史前期
公元前22世紀(jì)用谷物釀酒公元前12世紀(jì)學(xué)會制醬公元前7世紀(jì)用車前子、杏仁治療腳氣病,用豬肝治療夜盲癥等人們依靠經(jīng)驗自發(fā)的利用生物化學(xué)規(guī)律,而對本質(zhì)沒有認(rèn)識。2.18世紀(jì)(啟蒙期)法國化學(xué)家拉瓦錫(Lavoisier)研究燃燒和呼吸,被認(rèn)為是現(xiàn)代生物化學(xué)研究的開端。拉瓦錫通過研究指出呼吸是不發(fā)光的燃燒,其本質(zhì)是氧化作用。瑞典化學(xué)家舍勒(Scheele)分離并研究了酒石酸、檸檬酸、蘋果酸、尿酸、乳酸、甘油等有機物。
3.19世紀(jì)(發(fā)展期)自然科學(xué)取得了重大發(fā)展,物理學(xué)、化學(xué)的發(fā)展極大地推動生物化學(xué)的發(fā)展。當(dāng)時的研究中心在德國。德國化學(xué)家李比希(Liebig)是生理化學(xué)和碳水化合物化學(xué)的創(chuàng)始人之一,研究了大量的有機分子和生物組織提取物,并首次提出了“新陳代謝”這個學(xué)術(shù)名詞。1877年,德國醫(yī)生霍佩-賽勒(Hoppe-Seyler)首次提出“Biochemie”這個名詞,譯為英文是“Biochemistry”,漢譯為生物化學(xué),并創(chuàng)辦了生理化學(xué)雜志,將生理化學(xué)(生物化學(xué))建成一門獨立的學(xué)科,首次從生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)中分離出來。他還首創(chuàng)了“蛋白質(zhì)”一詞,并得到了血紅蛋白結(jié)晶。1903年生物化學(xué)學(xué)科正式成立4.20世紀(jì)上半葉進(jìn)入20世紀(jì)后,生物化學(xué)研究得到了迅速的發(fā)展,德、美、英、法都建立了生化學(xué)術(shù)中心。20世紀(jì)上半葉在蛋白質(zhì)、酶、維生素、激素和物質(zhì)代謝及生物氧化方面都有很大的進(jìn)展。霍普金斯(Hopkins),劍橋大學(xué)生物化學(xué)教授,先后發(fā)現(xiàn)了維生素、色氨酸和谷胱甘肽,創(chuàng)建了劍橋普通生物化學(xué)學(xué)派和中心。1926年,美國的色姆納(Sumner)得到了脲酶結(jié)晶,證明了酶的本質(zhì)是蛋白質(zhì)。1937年,英國生物化學(xué)家克雷布斯(Krebs)發(fā)現(xiàn)并闡明了三羧酸循環(huán)。此外,脂肪酸氧化降解途徑、糖酵解途徑等基本生物化學(xué)途徑也都在20世紀(jì)30年代前后陸續(xù)闡明。英國生物化學(xué)家桑格(Sanger)經(jīng)過10年研究,發(fā)明了測定蛋白質(zhì)分子中氨基酸序列的方法,并于1955年確定了牛胰島素的一級結(jié)構(gòu),這是第一個被闡明結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),開創(chuàng)了蛋白質(zhì)序列分析的先河。1960年,雅各布(Jacob)和莫諾(Monod)提出了在原核生物中普遍存在的基因調(diào)控的操縱子結(jié)構(gòu)模型。1965年,美國生物化學(xué)家尼倫伯格(Nirenberg)破譯出三聯(lián)體遺傳密碼。霍利(Holly)闡明了酵母丙氨酸t(yī)RNA的核苷酸排列順序,后來又證明了所有的tRNA都有著相似的結(jié)構(gòu)。60年代末,DNA限制性內(nèi)切酶和DNA連接酶被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),為研究核酸分子的結(jié)構(gòu)和功能找到了自由切割和重組的工具,為70年代初重組DNA技術(shù)(基因工程)的出現(xiàn)奠定了基礎(chǔ)。1977年,桑格設(shè)計出一種測定DNA分子中核苷酸序列的方法,并測定了由5375個核苷酸組成的ΦΧ174DNA的一級結(jié)構(gòu)。這種DNA序列分析法至今仍被廣泛的使用。進(jìn)入80年代以來,各國政府對生物技術(shù)倍加重視,分子生物學(xué)研究成了最受青睞的學(xué)術(shù)領(lǐng)域之一。包括基因工程、細(xì)胞工程、酶工程和發(fā)酵工程在內(nèi)的生物工程得到了前所未有的發(fā)展,并已經(jīng)在農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥、輕工等行業(yè)得到廣泛的應(yīng)用。1984年,科勒(Kohler)和米爾斯坦(Milstein)等人由于發(fā)展了單克隆抗體技術(shù),完善了極微量蛋白質(zhì)的檢測技術(shù)而獲得了諾貝爾獎。1993年,美國科學(xué)家穆里斯(Mullis)由于發(fā)明了PCR(聚合酶鏈反應(yīng))儀而獲得諾貝爾獎。PCR法通過DNA變性、退火、延伸三個步驟的反復(fù)循環(huán),可以實現(xiàn)微量的目的基因在短時間內(nèi)擴增100萬倍以上。目前PCR已經(jīng)成為分子生物學(xué)研究人員不可缺少的工具。2000年,在許多國家分子生物學(xué)家的共同努力下,擬就了人類基因組草圖,宣告人類基因組計劃(HGP)的初步完成。總之,20世紀(jì)下半葉以來,生物化學(xué)和分子生物學(xué)的發(fā)展一日千里,進(jìn)入21世紀(jì)后,該學(xué)科必定會得到更大的發(fā)展,為人類創(chuàng)造財富和幸福。6.我國生物化學(xué)的發(fā)展情況我國生物化學(xué)家吳憲于本世紀(jì)20年代從美國回國后擔(dān)任了私立北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)教授,是我國生物化學(xué)研究的開端。在他的領(lǐng)導(dǎo)下完成了蛋白質(zhì)變性理論、血液的生化檢測研究、免疫化學(xué)研究、素食營養(yǎng)研究、內(nèi)分泌研究等等,在生化方面做出了重要貢獻(xiàn)。1965年,中科院上海生化所和北京大學(xué)合作,在世界上率先通過化學(xué)方法完成了具有完全生物活性的結(jié)晶牛胰島素的人工合成;1983年,他們采用有機合成和酶促合成相結(jié)合的方法,完成了酵母丙氨酸轉(zhuǎn)運核糖核酸的人工全合成。此外,我國在酶的作用機理、血紅蛋白變異、生物膜結(jié)構(gòu)功能等方面都做出了國際水平的研究成果。2000年,我國作為人類基因組計劃的參與國同美、英、法、日等國家共同發(fā)布了人類基因組的草圖。在21世紀(jì)這個生物化學(xué)和分子生物學(xué)大發(fā)展的新時期,我國必須加大發(fā)展步伐,才能與國際學(xué)術(shù)研究前沿接軌。三、本課程在生物科學(xué)中的地位及作用
生物化學(xué)是生物工程的重要理論基礎(chǔ),也是生物工程專業(yè)的重要專業(yè)基礎(chǔ)課。生化往往是闡明機理,選擇合理工藝途徑,提高產(chǎn)品質(zhì)量,探索新工藝,研制新產(chǎn)品的理論基礎(chǔ)。
氨基酸發(fā)酵是典型的新型發(fā)酵。以谷氨酸發(fā)酵為例:
-酮戊二酸谷氨酸在正常情況下,谷氨酸不會過量合成。通過育種手段篩選出E2活力弱而E1、
E3活力強的菌株,可以加強谷氨酸的合成。同時,選育出生物素缺陷型菌株,這種菌株由于細(xì)胞膜合成受抑制,谷氨酸一經(jīng)合成就滲透到細(xì)胞外,解除了終產(chǎn)物谷氨酸對其自身的合成酶系的阻遏作用,使細(xì)胞可以源源不斷的生產(chǎn)谷氨酸。E1E2…
……
…E32.菌種是發(fā)酵工業(yè)的基礎(chǔ)為了選育出優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)菌株,必須對微生物進(jìn)行改造,而這些都是建立在分子生物學(xué)(遺傳的分子基礎(chǔ))的基礎(chǔ)之上的。無論使用傳統(tǒng)的理化方法進(jìn)行誘變育種,還是通過基因工程的手段進(jìn)行育種,其操作的對象都是DNA分子,因此必須對這類生物大分子的性質(zhì)有所認(rèn)識。生化對農(nóng)業(yè)也有很大的實用意義研究植物的新陳代謝的各種過程,使我們有可能控制植物發(fā)育,應(yīng)用遺傳工程技術(shù)改良作物品種,實質(zhì)也是利用生化技術(shù)。生化乃預(yù)防醫(yī)學(xué)及治療醫(yī)學(xué)的重要基礎(chǔ)疾病的診斷愈來愈多地依賴于生化指標(biāo),此外從生化角度闡明藥理作用,有助于設(shè)計有效的藥物。4.生物化學(xué)在其它方面的應(yīng)用:生物化學(xué)的發(fā)展并非孤立:生物化學(xué)的發(fā)展和分析分離技術(shù)的發(fā)展密切相關(guān),在生化研究中,層析法、電泳法、光譜法、同位素示蹤法、超離心法等,幾乎都成為必不可少的基本方法,此外如核磁共振、X光衍射、中子衍射
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